HsaINT1007848 @ hg38
Intron Retention
Gene
ENSG00000169504 | CLIC4
Description
chloride intracellular channel 4 [Source:HGNC Symbol;Acc:HGNC:13518]
Coordinates
chr1:24827010-24840041:+
Coord C1 exon
chr1:24827010-24827116
Coord A exon
chr1:24827117-24839859
Coord C2 exon
chr1:24839860-24840041
Length
12743 bp
Sequences
Splice sites
5' ss Seq
AAGGTAAAA
5' ss Score
8.38
3' ss Seq
CTCTTTTTTTCCCCCCCAAGCAC
3' ss Score
6.21
Exon sequences
Seq C1 exon
GTACTTAAAGCTTTCACCAAAACACCCAGAATCAAATACTGCTGGAATGGACATCTTTGCCAAATTCTCTGCATATATCAAGAATTCAAGGCCAGAGGCTAATGAAG
Seq A exon
GTAAAAAACAAAAACTTGAATTAACATTGCAACAAAAAACCCCAAACAACAACAGGCTGTTATTATGACAGTGATTATAAATGAGTACTTTAGAGTCCAGCCATTCCCATAAGTAATAAAAACTGTCTTTCAGAGTTGGTCAGAAATTGGACAATAAACTGGAATAAGTCCCTATGTTGCTATTTTTCCATGTTTCTAGCTAGTAGCACAGTATATAGTAAGTGTGTGATAAAATGCTTCTTGAATGAAGTTTATTTCATCTTATTTTGAGAAGTTACTGTGAAGGGAGCTAGGCAAAGAATTAATGGTGCATCAGAAACAGTGGATTGTGTGGTTGTGGTGGTTTAGCATAGATTGGTTGAGCTTAATTTAAACTGTAACTAAATGTTTATTGTTGAGTGCCTGCAGCCTAGAGTCAGTCTGAGGTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGCTTTGTTTTGTTTTTGTTGTTGTTGTTTTTGCTAATTACCCTTGAGCAATGTTTGGAGTTGCTTTAAGAGGGTAATTAGACATACTATCCTTCCAAATTTCTCTGCATCTTCAAGCTGGAATTTCATTTTCAAGTCATGTTTTCGCGGTAAGAGTTGTTTAGGTAGTACAGATGCAATTTTCTTTTATTTATTAAAGGACACTATTTTTATTATTTTATTCACCAAATGAATGTATAGTGTAGGGAGGTCTCTTTGGAAGAGGTTCCATTCAGTGAACCTTGTCTTAACTACAGCATTTAGTAATTTCCTTTTCTCTTCGGGATGTTAAGCAGAGTTCTCTCTGGGGAAAACTGTGTAGCACACATTAGTGTTTATTTGAAAGTAACCCAATAACCAAAAATGCTAGCTTCTAAAAATATTTATCATAGTTCCAGATAGTTTCCTAGCTTGAGTGGGATTCTTTTGAGAAGAAGTTTATGTCAGCAAATGAACAAGAATACCAAAGGGGAAAATATCAGTGCTGGTTAAACAAGAATGAATATCTTTTTAAAAAGTGAAATACTTGCTAATTTCCTTATGTTATTTCAGTACTATTATTATAAAATGCTGCAATTTTAAAATTTAGTATTGGATTCCAATGTCTTTTGCTCTTGATTTTTGGAATAATACTTAACTACATGAAATGTTTTTCTACAGTGAAGGGAAAAAAGGGAAAAATGTTAGTGCTCAGGTCTGGCTTGTATCTGTTAATAATGTATTCCAGTAGCTGCCATGGTTTGGAAGCAATTTTCTTTAGTAATTGGCTTTTTTTTTTCCTGACTAATGTTTCTGTCTAAGCAATTTATACATTAAGCAAGTGGTTATGTTGGAGCCCCTCCTTTCCACAGACAGTGTCTTTTCTGTTCTGCGCTTCATGCGAGCTAACTGTTCTTTTCATAAAACTACCCTTTTATACTTAGATGCCCCTGCTGCATACTTCTTTGAACAATCTTAGTTACAGTTATGTTTTTATTTTTCCATGTGGTTTTTTGGGAGTTGGAGGGTGGTTAAATTTCTTCTGACACTTAGTGGGGAGGAGAAAGGAATAAAATGTGTTTGCTTCCCCTTTGAGGGATGAGGATGGGGCGGGGTGGGGGTGGGGCGGGAATAAAAAGGTTAGAAAGTGACTCATTTAAGTATAACTTTGTATTCTATTTTTTCCCTATCAATTTGTTATTATCTTAAGTAGCCACCTACTCTTCCTGTCCTCAGAATGCTGTAACCAATAAGAACAAACAACATAATATAATACATGGTACATAATCTAGAAGGCTTTATATTAAATTACCTGCTGGTAAATAAAAGTTCCAGTTGCCAAGCAACTTCTCTCCACAGGGACCTGTTGAGGCCATGACACTTTAGAAAACAATATTTCAAATCACTTTGGAGCTTAATGGGCCCTCCTTATGTATGTTTGCCGCAGGCCTCAGATCCATTTAGTGCAATCAAATGCCTTTAGTAGTCCTAGGAAATTAGTGATTCTCCTTTTTATTTCCCCCAACCCCCACCCAGATGCTGACAATTTACACAGAGATGAATTTGTCGTTTTACATGGTAAATCAGAGTAGACAAGTCTGATTAGTTTTACCACCTATTAAATATTTTCAAAATCCAATATGTTTGGACAATTTTAAGACCTTTTAGGACTTAATTCTAAGTAAGGGATTCAATGCCTGAATGCTACAGTTTTGGGCTAATGAAACTGAAATAGAAGGGCTAGTGGTTAGGTTGGGGTACAAAGTAAACAAGTAAAATGTGAAGAATAAAGGGAGAGACACTGATGATAGATAGATAACACATATATAATTCTTTTGATAACACGTTCAAGTTGATTGGGAGTAAAAGTTTATGTAACCATTTAGGCAGTCAAAGAGAAGCTCATGGGTAATTTCTTTTGTGGGGATGTATTAAGTATGACCTGTCCCCAGATCTCCTACTTTTTTTAAGTTCTGTGATGGCATTAATTTATGTAATTTGCTAAGGTCCCAACTGTGACTAGTCATTGATATTTATAATACTCAGTCATTGATATTTATAATACTCATAAAAGAGATGTGAACTTAGCATTGTTGAATGTACTCTGAGGCATATTTCATGATGTCCAAATTCCTATATTTAGATGGAGGCAAGGAATCTAGAGGTTCTGATTAGTTCCTTTTTATTCAGGATCCTCTCCTTTCTCCTCTCCCCACTACTCCTGCCTTTCTCTCTGGAAAAGTGTTGGAAGTCAGAGGATGGTTGTGCATTATTGTAGCAGTAAGCCTGCATTGTATATTGAATTATCTTTAAATACCCATTACCTCTTTCTATTTTCCACTGATGTGTAACTTAGCCTTAAAACTTGTTTGTATAAGGTTACCCTTTATTAAGACTGCGGTAGGTAGCTTGAAAATATGGTTTTATCCATGTCAGTGCTTACAATTTTTAGTCTTTGTTTTAGTCATTGTAAATTATCTTGTTTTTCAATAACCGAAGTGCTCTTATTACATTTAATGTTTTCTGCCTTGAATTTTACTCATTCAAATCATACAAATAACAGAGAATACATGATTGTTGAAAAAGTTAAAATAGTATAGAAATAAATTTAATAAAACTTAATTGCCCCTCTTTAATCACATTACATGACCTCTTCAACAATTTAGTGTTCTTTTTTCTATGTAATTTTGCAAACATTTCTGTAAGTACGTATTATGTGCATACATTATGCAGTTATACTTTTCACTTATATGGTAGAAATGCTTCTATATCAAAATATAGATCTACCTCAATTTTTAGAAATTCTGCTTTGTATTTTATAATATGGATTTTCATTTAACCATTTCCATGTTGATAGACATCTAGATTGTCTCAAGTTTTTTTTTTTTCTTCACTATAATAAACAATGCTGCTGGTGAATGTCCTTGAGCTAGATTCCAAATAGTTCAAAAAGTTTGTGCATTTTAAATTTTGCTCTATTTTGCTAAATTGTTCTCCAAAAGTCTATACCAGTTTATATTCCCACAAACATGAAAGTATTCATTACCCTACACTTAGGACCCTGGTGTGTGTTAATCTTTGTAATTTTGCTGTGTTCTCTTAGACAAGAAAGGGTGTTTTGACTTTCATAATTACTTTTAAACTGATTTTGTTGCTCTGTTGCACTTAAAAATTTTTTGAGAGCTTTATGAAATAGCTTCTTAGGGATACCAGCATTACTACATCGGGGTATTGGAGAATAATAGTGCTACTTATTAGCTATAAGACAGGGAGCTACTTTGTGATGGCTTGCTACTGCCTTCTAGTGGTTAATTTTGACATTTTCTTTATATTTACATACTCCTTTGTGATGATTGGTCTTGAAAACTGTATTGTGTTTATTGAATGATGCTGTTTAGTACTTTTTGATATTTCTGTTTGTGTTTGTTTTATTGGCCATACCTTATGTTGATACATATAATTGTATCAAACTAATTCATCATTCTTTGTTTTCATTAATATACCCTTGTTATGACATTCTTAACTATGAAAAATTACTAACACCGTAGTCAGGTATAGCAATTCGACTTCATCAGAAGTGCTTTGCTAAGTACAAAATTATAGAGAAAACAGTCATTGTAATGTTATGCTAGACTCTTAATTTTCTTTTGAAAAAAATTTATTTAAATGAGACAAGGTCTCACCACATTGCCCAGGCTGGTCTTGACCTCCTGGACTCAAGCAATCCACCCAGCTTGGCCTCCCAAAGTGCTGAGATTACAGGCGTGAACCACTGTGTCTTGCACTGACGAATACTATGTTATAAACCTTGTAAATTTAGGATATTTGATTTTTATATATATAATTCAGGAAAAACATTAATTTAGAGCAGGTCTAAGGTTAAACATTTGCTCAAAAACTTGTCAAAACACTCAAATAGCATTTGAGACAATAATTCAATGTTTGAATTCAGGCAACATTATCTTCCCCACAGACTGATTCCATTCATTGTAATCTGATCAAAGAACAAGTCCTTGTACTCTAATATGTTCTTGTTCTGCATTCACTACTTTTATTTTTTTGGTTTTTTGTTTGTTTTGTTTAAGAGTCTTGCTCTGTCACCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCACGATCTCGGCTCACTGCAACCTCCACCTCCCGGGTTCAAGTGATTCTCCTACCTCAGCCTCCTGCGTAGCTGGGACTACAGGCGTGCACCACCATGCCTGGCTAAGTTTTGTATTTTTAGTAGATACGAGGTCTCATCATGTTGGCCAGGCTGGTCTTGAACTGCTGACCTCAGGTGATCTACCTGCCTTGGCTTGCCAAAGTACTGAGATGACAGGTGTGAAGCACCATGCCCGGCCATGCATTCACTGCCTTTAATAAGAAGCATATTAACTCTTGTTTTACAACCTTGAGATTCTGCTCTCTCCTTTTCTCTTTTTTCCTCTTAAATATACCCATAGAAAGTGTTTCATCGTTTCCTGGAATTCTTACTGACCTAGCTGTTTCTCACATTGTATTCTCCTGTTAATTTATAAACTTTACATTTCAGCTAACTATATGCATTATTGCTGGCCTGAATATAATTAATAAAAATTTATGTTTATTATTTTATGTTTTTGATTTTTTATTTTTTTTATTTTTTATTTTTTTTTTCTTTTGAGCAGTAACGTTTTATTTTTTATTTTTTTATTTTTTATTTTTTTTATTTTTTATTTTTATTGATCATTCTTGGGTGTTTCTCGCAGAGGGGGATTTGGCAGGGTCATAGGACAATAGTGGAGGGAAGGTCAGCAGATAAACAAGTGAACAAAGGTCTCTGGTTTTCCTAGGCAGAGGACCCTGCTGCCTTCCGCAGTGTTTGTGTCCCTGGGTACTTAAGATTAGGGAGTGGTGATGACTCTTAACGAGCATGCTGCCTTCAAGCATCTGTTTAACAAAGCACATCTTGCACCGCCCTTAATCCATTTAACCCTGAGTGGACACAGCACATGTCTCAGAGAGCACAGGGTTGGGGATAAGGTCACAGATCAACAGGATCCCAAGGCAGAAGAATTTTTCTTAGTACAGAACAAAATGAAAAGTCTCCCATGTCTACTTCTATCCACACAGACCCAGCAACCATCCGATTTCTCAATTTTTTCCCCACCCTTCCCGCCTTTCTATTCCACAAAACCGCCATTGTCATCATGGCCCATCCCCAATGAGCCGCTGGGCACACCTCCCAGACGGGGTCGTGGCCGGGCAGAGGGGCTCCTCACTTCCCAGTAGGGGCGGCCCGGCAGAAGTGCCCCTCACCTCCCAGATGGGGCGGCTGGCCGGGCGGGGGGCTGACCCCCCCACCGCCCTCCCGGACGGGGCGGCTGGCCAGGCAGAGGGGCTCCTCACTTCCCAGTAGGGGCGGCCGGGCAGAGGCGCCCCTCACCTCCTGGATAGGGCGGCTGGCCGGGCGGGGGGCTGTTCCCCCCACCTCCCTCCCGGACGGGGCGGCTGGCCGGGCAGAGGGGTCCTCACTTCCCAGTAGGGGCGGCCGGGCAGAGGCGCCCCTCACCTCCCGGACGGGGCGGCTGGCCAGGCAGGGGGCTGATCCCCCCACCTCCCTCCCGGACGGGGCGGCTGGCCGGGCGGGGGGCTGACCCCCCCCACCTCCCTCCCGGACGGGGCGGCTGGCTGGGCAGAGGGGTCCTCACTTCCCAGTAGGGGCGGCCGGGCAGAGGCGCCCCTCACCTCCCGGACGGGGCGGCTGGCCAGGCAGGGGGCTGATCCCCCCACCTCCCTCCCGGACGGGGCGGCTGGCCGGGCAGGGGGCTGACCCCCCCACCTCCCTCCCGGACGGGGCGGCTGGCCGGGCAGGGGGCTGACCCCCCCTCCCCCCTCCCGGACGGGGCGGCTGGCCGGGCGGGGGGCTGACCCCCCCACCTCCCTCCCGGATGGGGCGGCTGGCCAGGCGGGGGGCTGACCCCCCCACCTCCCTCCTGGGCGGGGCGGCTGGCCGGGCAGAGGGGCTCCTCACTTCCCAGTAGGGGCGGCCGGGCAGAGGCGCCCCTCACCTCCCGGACGGGGCGGCTGGCCAGGCGGGGGGCTGACCCCCCACCTCCCTCCCGGACTGGGCGGCTGGCCGGGCGGGGGGTTGACCCCCCCACCTCCCTCCTGGACGGGGCGACTGGCCGGGCAGAGGGGCTCCTCACTTCCCAGTAGGGGCGGCCGGGCAGAGGAGCCCCTCACCTCCCGGCCGGGGCGGCTGGCCGACCCCCCCCCCCCCCCCCCGCCTCCCTCCCGGACGGGGCGGCTGGCCGGGCAGAGGGGCTCCTCACTTCCCAGTAGGGGCGGCCGGGCAGAGGAGCCCCTCACCTCCCGGACGGGGCGGCTGGCCGGGCAGGGGGCTGACCCCCCCCACCTCCCTCCCGGACGGGGTGGCTGCCGGGCGGAGACGCTCCTCACTTCCCAGACGGGGTGGTTGCCAGACGGAGGGGCTCCTCACTTCTCAGACGGGGCGGTTGCCAGGCAGAGGGTTTCCTCACTTCTCAGACGGAGCGGCCGGGCAGAGACACTCCTCACCTCCCAGACAGGGTTGCGGCCCAGCAGAGGCGCTCCTCACATCCCAGACAGGGCGGTGGGGCAGAGGTGCTCCCCACATCTCAGACGATGGGCGGCCGGGCAGAGACGCTCCTCACTTCCTAGATGGGATGGCGGCGGGGAAGAGGCGCTTCTCGCTTCCTAGATGGGATGGCGGCCGGGCAGAGACGCTCCTCACTTTCCACACTGGGCAGCCAGGCAGAGGGGCTCCTCACATCCCAGACGATGGGTGGCCAAGCAGAGACGCTCCTCACTTCCCAGACGGGGTGGCGGCCGGGCAGAGGCTGCAATCTCGGCTCTTTGGGAGGCCAAGGCAGGCGGCTGGGAGGTGGTTGTAGCGAGCCGAGATCACGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCACCATTGAGCACTGAGTGAACGAGACTCCATCTGCAATCCCGGCACCTCGGGAGGCCGAGGCTGGCGGATCACTCGCGGTTAGGAGCTGGAGACCAGCCCGGCCAACACAGCGAAACCCCATCTCCACCAAAAAAAAACGAAAACCAGTCAGGCGTGGCGGCGCGCGCCTGCAATCGCAGGCACTCGGCAGGCTGAGGCAGGAGAATCAGGCAGGGAGGTTGCAGTGAGCCGAGATGGCAGCAGTACCGTCCAGCTTTGGCTCGGCATGAGAGGGAGAGGGAGACGGGAGAGGGAGAGGGAGACGGGAGAGGGAGAGGGAGACGGGAGAGGGAGAGGGAGACGGGAGAGGGAGACGGGAGAGGGAGAGGGAGACGGGAGAGGGAGACGGGAGAGGGAGAGGGAGAGGGAGACGGGAGAGGGAGAGGGAGACGGGAGAGGGAGACGGGAGAGGGAGAGGGAGACGGGAGAGGGCGAGCAGTAACGTTTTATATTGATTTTTTATTTTTAAGTGGCTTGTTTCTCTTGTCACTTCTGTAGTTGAGCTCTGCTAATGTCTCAACTTTATTTTACTGGGTTCCAGTGCCCTCTGCTGGTTATGTTTCATCTAAGAAATAAGCTAACTTGATCATTGGCTATGGCTAGCATGATCCTTTAATAATAAAATGGGTAGATCTTTGACCTTGCCACTTATCACTTAGGTAGGTAACACATTCTAATTTGTTTGATATTTTCCTAAGTAAAAAATATTACCGGGTCAGGTGCGGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTGGGGAGGCCAAGGCAGGTGGATCGCTTGAAGCCAGGAGTTCGAGACCAGCCTGACCAACATGGCATAACCCCATCTCTACTAAAAATACAAAAATCAGCCAGGCGTGGTTGCTCACGCCTATAATCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCAGGAGAGTCACTTGAAACTGGGAGGCGGAGGTTGCAGCGAGCTGAGATTGCACCACTGCACTCCAGCCTGGGCGACAGAGTGTGAGAATCTGTCTATAAATAAATAAATAAATAAATTTTAAAAATGTAGAATTAAATACATAACAATAATAGCATATAGGACAGAAAGGAGGTTAATGGGGTTCTAAGGTCTTTGCATTATCCTGGAAGTGGCAACAGTTATAATTAAACTTTAATGAGTCAAGGAAACAAAGACTAGAAAAGGATGTATATTAAGCTAATAGAGGTGGAAATAGAGGAATAATTTTTAAAAATGTAATCCATAGGAAGGTAGGAGAGAAGAAAAGAACACAGAACAGGTGGACAAATAAGAAGTATATAGCAGATTTGAACCAGAGTTTTTAGTAATGACATTGAATATACATTATTTAAATATTCCAAATGAAAAAACAAAGTTTACCAACTGGATTAAAAACAATGTTGCTTATGTACAAGACTGTATCTATCTGTCTATCTATGAAACACACAAATACATACATGAAATGTGGATCCAGGAGAGCTAAAAATGAAATAGTATAAATACTAACCTAAAGAAAGTTGACAAAGCCACACTGACATTGGATGAAGTAGACTTTAAGGAAAGAAGCATTATGAGATAATGAAGCGTGTTCCAGACTGATTTAAAAAGGTTAATCAGGAAGATAAAATAATTCTAAACTTATCTTACCAAATAACTAACCTGAAAATATAAGCCAAACTGACAGAACTAAAAGAGACAGATCAATCCACAGTCATAGTGGGGGATCTTAACTTACCCCCTTAGTAACTGTTAGAATCAACCGCAAAAGGAAAAAAATGAGAAGATAAAATTGAACAATACAGTGAACAAATTTAATCTCATATATGTATATACATATCTCACTGTACTTCAGAATATACTTTTGTTTTTCAAATGCACATGGAACAAAATTGATGGTAAAGCTGGGCCATAAAACAAAGCTAAAAATTTTTCCAAAAAAATTGAAAACGAGGAATGTTTCTCAATCAAAGAAAATATGATAGATATCAATAACAAAAGTACAGCTAGAACGGGGCACAGTGGCTCATGCCTGTAATCCCAGCACTTAGGGAGGCTGAGGTGGGCAGATCACTTGAGCTCAGTAGTTCAAGACCAACTTTGGCAACATAGCTAAACCCTCTGTCTACAAAAAATACAAAAATTTGACAGGTGCAGTGGCATGTGCCTATAGTCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGTGGGAGGATCGCATGAGCCCAGGAGTTCGAGGTTGCAGTGAGCCGAGATCGTGCCATTGCACCCCAGCCTGGGTGATAGGAGTGAAACCTTGTCTCAAAAATGAAAAAAACAAAAGCTACAGCTAGAAAGTTTCTACATGTTTGAAAATTAATTAGTATATTTCTAAATAATCCACAGATTGAAAAAGAATAAAGTGATGAAAATACAGAATGTCTACATTTGTGAGATATGGCTAAAACTGTGCTTAGAGGGAATTTTTTAGTTCCAAAAGCCTATATTAGAAAAGAAGAGAGCTAAATATTGGTGAAGTAAAAGTTTAGAAATACTAAAGAGCAGAATATAAGGAAGTAGAAAACAAACATGACATTGAACAAGGAAGCTAAAAGCTGGTTCTTTGCAAAGTCTAACAAATAAAAAAAATGGATAAATCCTTGAAAAGAAAAATCAAGAAAAGTGAGAGAAGACAGCAAAAACCAATATTGGAAATAAAAAGGAGGATTGCTACAGATCTTACATTAAAATGATTTTTGGAGGATATTATGAAAAAATTTATGCTTATAATTTTGAAACTATTGGAGAAATTTACAGAAAGTACAGTGTAACAAAATTGACACAAGGAGGAATTAAAAATGTGAATATTCTTATATCATTTAAATTTCTTATAATTAAAAAGAAAACTCCAGATCCAGATGGCTTCACTGTTGAACTCTTCCAAGCATTTGAGGAAGAAGTAAGGTTATACTTTCATATACCTTTCCAGGGAACAGAAAAGAGGGAATGCTTTCTACCTTGCTTTTTGAGGGCAGGGAGCCTTGATACCAGAACCATACAAGAACATCAAAAGAAAGGACAATTTCAAGCCAATCTTTCTTTAATATAGATGCAAAAGTCTGAAATAAAATATACCAAATCCAGCAACATAACAAAAGGTAGTACAACCAAGTTGGGTTTCTCAGGAATGGAAGATTGTTTAAAAATTCAGAAATCTGGCCGGTTGCAGTGACTCACACCTGCAATCCCAGCACTTTGGGAGGACCAGGCAGGCGGATCACTTGAGGTCAGGAGTTCGAGATTAGCCTGGCTAACATGGTGAAACCCGGTCTTCTCCGCAGACTATTCCTCCTACCTATCCTTTAAATGATGTTCCTTAGGGCTTTCTCTAGGCCCTCTGCTTCTCCTTTACTCCATGGTTTCGGTGTTCATTTATGTTCTCATAACTTCTAAACACGTTGCTCCAGCTCAGTGCGTGACACTTGAAACCATATTTGTCTGTCTATTGGACATCTCTACTCACATGTCTTACAGGCACCTCAAACTCAGCATGAACTCATCTCCGTAGCCCCTAAATCGGTTTCTCCTTGGGAAGGTAAATGGCTCAGTAAATGACACCAGCATTCACCCTGGGAGTCTTTAGTTTGTTGACCAGCTTCTCTATACTACCCTCTGTCCCCAAGATCTAAACTCTCTGAGGATAGGAATGTATTAGGTTTTATTCAACAGTGAATTTAACAATCCTTAGAATAAGACTTGGCATGTAGGAGGGGCTCAATTATATTTTGTTGAATACATCTTCCCCCCTTTCTCCATATTCACTTTGGTTTCTGAACTCTGTTAGTTTTTATTTCCTAAAATCCGTTCATTCCTTTTTATGCCTATAGCCCCTTACCTAACTAAGACTACCATCTATTACCTGGACTACCATGAAGGGACCAAGGGCTGAGTGGGTGGCTGCAATTTGGAAGAAGAGGTTTGGGGTTAGGACATATGTACATTGCTGGTAAAATATCTAAGATGCAGGCCTTTACCTTTTTCCTTAAAGGACACAACTGAATTCAGACTTAAAACTACATGGTTTGCCACCTCATGATATTTAACTTTCTTTTATGGCCAGTTACCACAATCATCTGTGTAAGTTCATCTATTCTGAGAGTGAGGGGGAAGGTGGCTTTGGAAGGAAAGGATAAGAAAGGATAATAGAAGATCTGTCTGTTGTTATTCCATATTTTTAATGACATTCCTACCCCCTTTCTGCTGAGGGCCACTAACCTTGACTTTCCAGATATACAGTGGTGCTCTGTCCCACTTTAATGAATGCCATCAAAATATGGAATAACAACAGACAGATCTTCTATTATCCTTTCTTCTGAATCATGACAATCAGAATCATGACAATCTGAATCATGACAATCAGAGCATCTTAATCTATTTGGTTAAAGAGGCTCCCAGTTCAGTATTGTAAATTGAACTCCTTAATCTGACCTTTGTGTTTTTTGTATAAGATAGTGCTATTCTTGGCTTCCTGTGAATTATAAGACAGTTTTGAAAATCTCAGGTTTTCTGTTTGGATTGTTTGAATTGGTATTTCTTAACACATTTCTTACTGATAAATCAAAATATTCCTGGGGGAGCAGGAATTAAAAATGAGGGCAAAAATCTGCCTCTAAGATTTTTTTAATCCCTAGATTTGAATTAATATGCTTGCCTTTTCTCATCCATTTTTCCAGTTTAAATGTCAAATGTGTTGGACCATTTGTGTTCATGTGTGGGACATTTAGTTGTTAGCAAGTTTTTTTTGAGACAGAGTCTCGCTCTTTCGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTGCTATCTCGGCTCACTGCAAGCTCGGCCTCCCGGGTTCACGCCATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGACTACAGGCGCCCGCCACCACGCCCGGCTAATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGAGGTTTCACCGTGTTAGCCAGGATGGTCTCGATCTCCTGACCTCGTGATCTGCCTGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACCGCGCCCGGCCATTTGTTAGCAAGTTTTTACAAATACCACTGCCTGACATTATTATGCTTATTTATACTTTTACCTGAACAAACTTGTTTCATCCCCTGCCCCACCTAATTGAGCTCTAGGAGAGCAGGAGCCTTGTCTGTTTTGTTCTACAGTACCTTGTTTCAGAGTAAACATTTTTAAACAGTTATTGACTCAAAGAGTCTGCTTCTCCTTGGGGACTTGAGTGGTTTTCCTTCTTACAGTATTCTCATCTCTTTTTTTCCCCCCCAAG
Seq C2 exon
CACTGGAGAGGGGTCTCCTGAAAACCCTGCAGAAACTGGATGAATATCTGAATTCTCCTCTCCCTGATGAAATTGATGAAAATAGTATGGAGGACATAAAGTTTTCTACACGTAAATTTCTGGATGGCAATGAAATGACATTAGCTGATTGCAACCTGCTGCCCAAACTGCATATTGTCAAG
VastDB Features
Vast-tools module Information
Secondary ID
ENSG00000169504:ENST00000374379:4
Average complexity
IR
Mappability confidence:
NA
Protein Impact
ORF disruption upon sequence inclusion
No structure available
Features
Disorder rate (Iupred):
C1=0.054 A=NA C2=0.082
Domain overlap (PFAM):
C1:
PF134171=GST_N_3=PD(0.1=0.0),PF134101=GST_C_2=PU(7.6=18.9)
A:
NA
C2:
PF134101=GST_C_2=FE(65.2=100)
Main Inclusion Isoform:
NA
Other Inclusion Isoforms:
NA
Associated events
Conservation
Chicken
(galGal3)
No conservation detected
Fruitfly
(dm6)
No conservation detected
Primers PCR
Suggestions for RT-PCR validation
F:
No suggested primer sequences
R:
No suggested primer sequences
Band lengths:
Functional annotations
There are 0 annotated functions for this event
GENOMIC CONTEXT[edit]
INCLUSION PATTERN[edit]
SPECIAL DATASETS
- Autistic and control brains