Special

HsaINT1042700 @ hg38

Intron Retention

Gene
Description
sperm associated antigen 1 [Source:HGNC Symbol;Acc:HGNC:11212]
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Seq C2 exon
AGCCCGCGGAGCCGGCGGGAGCCGCGCGCGCCGCCCAGCCGTGCGTCATGGGCAACATCCAGAAGAAGCTGACTGGCAAAGCCGAAGGCGGCAAGCGGCCGGCAAGGGGCGCGCCGCAGCGGGGCCAGACCCCGGAGGCCGGCGCGGACAAGCGGAGCCCACGGCGGGCCTCTGCGGCGGCGGCGGCGGGCGGCGGCGCCACCGGGCATCCGGGCGGCGGGCAGGGCGCGGAGAACCCTGCCGGCCTGAAGAGCCAGGGCAACGAGCTGTTCCGAAGCGGGCAGTTCGCCGAGGCGGCCGGCAAGTACTCGGCGGCAATCGCGCTCCTGGAGCCAGCAG
VastDB Features
Vast-tools module Information
Secondary ID
ENSG00000104450:ENST00000388798:10
Average complexity
IR
Mappability confidence:
NA
Protein Impact

ORF disruption upon sequence inclusion

No structure available
Features
Disorder rate (Iupred):
  C1=0.876 A=NA C2=0.781
Domain overlap (PFAM):

C1:
NO
A:
NA
C2:
PF134141=TPR_11=PU(47.4=31.6)


Main Inclusion Isoform:


Main Skipping Isoform:


Other Inclusion Isoforms:


Other Skipping Isoforms:
Associated events
Conservation
Primers PCR
Suggestions for RT-PCR validation
F:
No suggested primer sequences
R:
No suggested primer sequences
Band lengths:
Functional annotations
There are 0 annotated functions for this event


GENOMIC CONTEXT[edit]

INCLUSION PATTERN[edit]


SPECIAL DATASETS

  • Autistic and control brains