HsaINT1047612 @ hg38
Intron Retention
Gene
ENSG00000160229 | ZNF66
Description
zinc finger protein 66 [Source:HGNC Symbol;Acc:HGNC:13135]
Coordinates
chr19:20776425-20792638:+
Coord C1 exon
chr19:20776425-20776450
Coord A exon
chr19:20776451-20792511
Coord C2 exon
chr19:20792512-20792638
Length
16061 bp
Sequences
Splice sites
5' ss Seq
ATGGTGAGA
5' ss Score
7.23
3' ss Seq
TGTGTGTGTATATTTTTCAGGGG
3' ss Score
9.8
Exon sequences
Seq C1 exon
CAGGACCCCCTGGAAGCCTAGAAATG
Seq A exon
GTGAGAGTGCCGGTCCAGCATCCCGAGAGAGGTGAAGTGTCTGTGGCGGGACTCAGGCCTCCCCTCAGTCAGCTCCACAATCTGCACCCCGAATTCTCCTTACCCAGCTCTGCCTCAGTCCCATTCAGCCATAAGATGGCGGCTACGCTGACAGCCTGGCCCCCGGGCGTCCTGTCGCTTCCCCGCGCAGTGACTGTGCCCCTGGCCTGGAGCGCTCTGTGGGCAGCTCTGCACCCGCAGTGCCGTGTCTCTCCCAGATTGTGCAGGGACCACCGGAGGGTCTTCAGGGGAGAATGCTGACTCGCGGTGCGGGTTCATGAATGGGAAGAGCTTTGGTCTGTGGGGTTCACAGTTTCTCTTTTCTGCTATTAAAATTGTATGGGGCCGGGCGCGGTCGTTCAAGCCTGTAATCCCCGCACGTTGGGAGGCCGAGGCGGGCGGATCACTTGAGGTCAGGAGTTGAAGACCAGACTGACCAAAATGGGGAAACCCCTTGTCTACTAAAAATACAAAAATTAGGTGGATATGTTGGCGAATGTCTGTAGTCCCAGCTTCTCGGGAGGCAGAAGTGAGAGAATCGCTTGAACCCGGGAGGCGGAGGTTGCAGTGAGCTGAAATCCTGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCGACAGAGCAAGACTCTTGTCTAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAATTATGGGAGTCACTGCAAAAATATCAAACAATTTAATCAAAGAGTGATTCAAGAATTGTAGAGCACCCAGCTATAGTTTGTAGTTTGTGGTCCATGGGAGAGGCTTGAAGAAAAGACATTTATAAAATGCATGATGAGGAAAACCAAATTCAATAATTTGTTAGGTTTAGTAATGTAGTTTCTTAATTTGTACAATCAAGGTGGAAATTTCCTGGTTATGTAATTAGAGCTTAATTGGCAGTTTATAGTTGCTGAAGCCTGAATTTTGTTTCCCCTAATGTAGTAATTTGCCAAAAAATGCACTTGAGCTTAGATTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTAGAAATAGAAATCCGGGGACTAGAGCCTCTTCAGTCTAATTGCCTGCCACTTAATTATTTTCACATCCCACAGGGGACTGACTTTCCCTGGCATTTTTCACATGTGTCCCAAGCAGGGCCTCAAGTGTCCCCCATGTTCCTCAATTAATTATTATTATTATTATTATTTTTTGAGACGGAGTCTTGCTCTGTCGCCAGGCTAGAGTGCAGTGTCAGATCTTGGCTCACTGCAACCTCCACCTCATGGGTTCAAGCGATTCTCCTGCTTCAGCCTCTCCAGTAGTTGGGACTACAGGCAAGCGCCACCACTCCCAGCTAGTTTTCATATTTTTAGTAGAGATGAGGTTTCACCATGTTTGCCAGGAATGCTAGTTACCAAGGAAAAATATAGGGAAAATCTCTCTTCCATTTTGGCTGTAGACAATGAATATATTTCCACAGGAAAATGTGGTAGATAATTGAGGAGTTACATGGATTCATCAACACATTAGTTCCTCTTTTTGCAGGGTAAATTTTTTCTATATCCTTTTATTTTGATTTCTGAGTTAAATGCTAAATTTTAAGTGATGAAACATGGTACCTTCTAGAAGTGTTCCCATATGACTAATTTTTTACTACATTATTTTATTTATTTACTTATTTTTTTGAAACAGAGTCTCACTCCGTCACCAGGTTGGAGTGCAGTGGCGTGATCTCGGCTCACGCAACCTCTGCCTCCCAGGTTCAAGCAGTTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGATTACAGGTGTGTGTCACCACGTCCAGCCAATTTTTTTGTGTTTTTAGTAGAGACAGGGTTTCACCATGTTGGCCAAAATGTTCTCAATCTTCTGACCTCGTGATCTACCCACCTTGGCCTTCCAAAGTGTTGGGATTAGAGGCGTGAGCCACAGTGCCCGGCCTACTGCATTATTTTTAAGATAAATAATAAAATAATACATACATTGTCTGAAAGAAGTAGATATATATGCTTTTCTTATAGGGGTATAAAATGCAAGCATCTTAGCCAGGTGCAGTGGCTCATGCCTGTAGTTTCAGCACTTTGGGAGGCCTAGACAGGTTGATTACTTGAGGTCAGGAATTTGAGACCAGCCTGCCCAACATGGTGAAACTCATCTCTACTAAAAATACAAAAGTTAGCCAGGTGTGGTGGCATATGCCTGTATTCCCAGCTACTTGGGAGGCTGAGGAACAAGAATGTCTTGAACCCGGGAGGTGGAGGTTGCAGTGAGCCGAGATCATGCCACTGAACTCCAGCCTGGGCCACAGAGTGAGACTTCGTCTCAAAAAAAAAAAAAAAAAAGTAAGAACCTTAAAATTTCCTTCCCTTATGTAAACACTGCGTTTGAGTAATTTCCCTGGATTTTTCAAACACATAGTTTCAAAAACTAAGTGAGTAATTCTGACATGGAAATTAAAGCTTGAACCTAGTGACTCCAAGCTAAGGCTAATAATTAAGCCTGCAACTGGATATTGAAGACTCAGTTAGTTTTTTCTGGGGAGCCTCCCGTGCAGGTGTCCAGCCTGCTCACCCCAGCCATAGAAGGAGCCTTTATCCTGAGAGAAGCTACAGAGCCCTGGAAAGCTGGGGTCCCACAGGCAGATGCAGTTGAGGTTAAGATGAAAGGAAACTGAGAGGGTCTTACTGATGATGCAGTCGTTATGTTTTGTGGCACTTTCTGTACTTTGTAAAATAAAAACATTAGATTTATGTAAAAAAAAAATGAATTCCAAAAAATTATTGCAACAGGAGAAAGTACCAACTAAATATAAGATCTTTATGGCTTGCAAAGATGTAGGCAGAAAAGGGCTTTCTTTTTTAGGGAGAGGTAAACAAGATAAGAAAGGAGGTGGGAGGTGAATGGCAAATGGAGAGTGAAAAAGTCAGATTTTAGATCAGAGGATGTCTTACCCTGAAATCAGCATGTTCTTAGGAGGAATGTAAAATGGGGTTGTATGTTGACTCAGACTGAGGGTAGCTCAAAGTTCAGGAGCCTGAGGGAGGGAAATAAACTTAAGAAAAGTATGATTAAGAAATATTTTATTTTAGTCCGGGCCCAGTGGCTCATGCCTGTGATCTCAACACTTTGGGAGTCTGAGGCAGTCGGATCACCTGAGGACAGGTGTTTGAGACCAGCCTGGCCAACATGATGAAATCCTGTCTCTACTAAAAATACAAAAATTACTGGAAGGCTGAGGTGGGCGGATCACCTGAGGTTGGGAGTTTAAGACCAGCCTGACCAACATGGAGAAATCCCATCACTACAAAAAAAAAAAAAAAATCAACAGGTGTGGTGGTGCATGCCTGTAATCCCATCTACTCGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCGCTTGAACTCGGGAGGTAAATGTTGTACTGAGCTGAGATTGCACCAGTGCACTCCAGCCTGGGCAACGAGAGTGAAACTCTGTCTCAAAAAAAAAAAAAAAACACCAAAACAACAAAAATTCGCCAGGTGTGGTGATGGGCACCTGTAATCCCAGCTACTTGGGAGGCTGAGGCAGGATAATTGCTTGAACCCAGGAGGTGGAGGTTGCTGTTAGCCAAGATCGCATCACTGCACTCCAGCCTGGGTGACAAAGTGAAGAAATTATTTTGAGCACTGAAGACAAATTCAGCTGTTTTTTTAATGAGAAAAAGGAGAAAATGTGCAGAGCGTGTGTCTGCCTGTGTGATAGGTAAGAAAAGAGAGCACTATCTTAGTCATAATGGGAAGAGTGTTTGTTTGCATAAATTGTTCCTGGAGCACACAAAGAATGGAGAATTTTATTAATCACAAACATTTTCCAGTATTATCTATGTGTTTCATCTTTCCCCATTTCTTTTCTTTGTTCTATGCATTTCTCCCATTTGGCTTTTCCTGGGCTGCGTCTCACATATTAAACTGGTAAACATAACTACAGTGTTTTGCTAAGTTCTGTGAGTAGCTCTACCAGATTATTAAAATTCAGAGAGGTTATGGGACTAACAAGTTTTTAAACAGTAGCTCAGAAGCATAGATGGGCCCATGGGGTTTTTGACTGGCATCTGCAGTGAGGACAGTGTTGTAGGACCAAGCCCTGAATCAGGGTCTGTGTTGACTCTGGGTGGTGTCAGAATTCAAATGTTAGACAATAAGTTGGTGTTGGAGAATTGTTTAATGTTCAGCTAACTCTACAGATTTGGTGCCAGAAAAAAGATATCACAGAGGCCTGGCCTGGAATAAAACTAGGTGTTTGGGAATGGGAGCTCTGCTTTCCCATACACAGGCTGTCACACTGCCCATTGTCCTGTGATTCAGGTCTTCTCCCAGGGTGACAGAGGACTGAAAACTTAGAGGACAGGAGCTCTGATTACAGACCCCCTTTTCCCACAGCTGCCACCACAAGATTCCCACCCACTCACAAACACACACACTAGACATTGACACGTCCACACTCCTCCCAGGACTAGGCACCACCCTCAGAAACTTCACCACAGCATTTTTGACCCTAGTGTTTCTTGCCAAGAACCCACAAGTCTCTGCAAGTCTCCTGGCATATCCCCATCCACAGATGCTAAATCTGCAGCAGCAACCAGTTTTCTCCACCAACCTACCATTTTGGATCAGCTGTTCATAATCTCATCTGCCTGCACACAGTAATAAATCAGAGTATGGCTGCATTGGGACCACTATCTGCAGCAAAAATCAGTCCTCTCACCTGCATTGCACTCTCTCCTGCCCAGGGATTTAATTTTTTATTTTAGCTTTTATTTTTGATTCGGGGTACACGTGGGTTTCTTTTACAGGTAAAATTATGTCATGGGGGTTTTGTGTGCAGATTATTTTGTTAACTTACGTACTAAGCATAGCACCAAACAGGTATGTTTTCTGATCCTCTGAGTTCTCCCACCCTCCACCCTCAACTAGGCCTCAGTGTCTGTTGTTCTCCTCTTTGTGTTCGTGTGTTCTTATTATTTAGCTCTTACTTATAAATGATAGTACATTCATTTGGTTTTCTGTTTCTGCATTATTTTATCTTTTTTTTTTTTGGAGACGGAGTTTTACTCTTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAATGGTGTGATGTAGGCTCACCTCAACTTCCACCTCCCGGTTCAAGTGATTCTCCTGCCTCAGCCTCATGAGTAGCTGGGATTACAGGTGCATTCCACCATGCCCAGCTAATTTTGTATTTTTAATAGAGATGGAGTTTCTCCATGTTGGGCAGGCTGGTCTCCAACTCCTAACCTCAAGTGATCAACCCACCTCGGCCTCCCAAAGCGCTGGGATTACAGGTGTGAGCACTGCGCCAGGCCTCTGCATTTGTTTTCTAAGAAAAATAGTGTCCAGCTTCATTGATGTTATTGCAAAGGACGTGATTTTTTTTTAATGGCCACAGAGTATTCCATGATGTTTACGTACCATATTTTGTTTTGACTAAATCTTTTATTTTATTTTATAGTTGGAGACAGAGTCTCACTTATTGCCCAGGCCAGAGTGCCATGGCGTGATATTGGCTTACTTTAACCTCAACCTCCCAGGCTAAAGCAATTCTCTCCTACCTCATCTTCCCAAGAAGCTAGGACTACACCTGGGCGTTACCACACCTGGCCAAATTTTCTTTTTGTATTTTCCGTGGAGACAGGATTTTGCCATGTTGCCCAGGCTGTTCTCAAACTTCTAAGTTCAGGCAGTTCACCTGCCTTGGCCTCCCAAAGTGCTGGAATTACAGGCATGGGCCACCGCTTCTGACCATACCATATTTTCTTTACCCAGTCTACCATTGATAGGCATTTAGGGCCTGTCCTTGTCTTTGCTATTGTGAATAGTGCTGCAGTGAACATGCATGTGGATGTGTCTTTATAATATAATAATTTATATTTCCTTGGGTATATACCCAATTTTGAGATTTCTGGGTCAAATGATAATTCTGTTATTAGTTCTGTGAGGAACCGCCACACTGCTTTTTACAATTGTTAAACTAATTTACACTCCCACCAGAAGAGTATAAGCATTCTGTTTTCTCTGCAACCTTGCCAGCATCTGTTATTTTTTGACTTTTTAAAAATAGCCATTCTGACTGGTGTGAGGTGGTATCTCATTGTGGTTTTTCTTTTAATTTCTCTAGTGATTAGTAATGAGCATTTTTTTCATATGCTTGTTAGCCACATGTATATCTTCTTTTGAAAAGAATCTGTGTTTTTGCCTACAATTTAATGAAGTTGTTTGGTTTTTTCTTTTAAACTTGTATAAGTTTTTAATAAATTCTGGATATTAGACCTTTGTCAGAGGCAAAGTTTGCAAATATTTTCTTTCATTCTGTAGGTTGTCTTTTTCCTCTGTTGATAGTTTCCTTTGCTGTGAAGAAGTTCCATTTGTCAATTTTTGCTTTTGTTGCAATTGCTTTTGGTAGCTTCATCATGAAGTCTTTGCCAGTTTCTGTGTCTAGAATGGTGTTTCTTAGGTTATCGTGCAGATTTTCTTATAATTTTAAGTTTACATTTAAGTGTTTAATTTATCTTGAGTTGATTTTTGTATATGGTGTAATGAAGGGATCTAGTTTCAGTCTTCTACATAGTGCTAGGTAGTTATTTTAGCACCATTTGTTAAATAGAGAATTCTTGCTGCATTCCTCTTGTCAGCTTTGTCAAAAATCTGATGGTTATAGGAGGGTGGCATTATTTCTGGGCTCTCTATTCTGTTGCATTGGTCTTGTGCACTCGTGGATTTTTTATAACATCTTTCTCTCTTCTCCTTTTTCCCCATAAACATTCTTTGAAGTGCATACAGTGTGAAAAATTCAGATGTCCAAGAGTTCAAAACTATTTAAAAAGTTCCAAAACAAATTTTGCTATTCTGTCTGTTCTTAAGGGATTTAGATTATATGTAGATATTTTTCTCTGCTTTTTTGAAATATATGTAAATCATATTAACAGCTAAATAAACCTTTTTCATTTTTTATGACTCCAGATTATCTTTATCTGGTACTTCAGATTTATTGCTTTGTTTTTGCTTCTGAAAAGTTTATTTTTTTCATTTTTAGTCCTTTAAGGTAGACACAGATTTGTTTAGTTAAAACTCATTTAAGAGCACACAGAAGCATAGCACAAAGATAAAATTAAATTTAGCAATACAGAATGATAAAGACTAAAAGATACTAAGTTTCTTTGACAGAAACCTGATTATCCAAGGTAATTATCCAATATTTGCAGGCTGAAGTACTAATACTGCAAATGCAAGAACAGTTCAATGCATGAACTCAACAGTGGAATCTGTAGTTGTACCTTGTTTTCTATTTATTACTTCAGAACAATTAGCATAGTTATGTTTAGTGTTTGTAGACAAACTGCATTCATATAAATTAAACAGTGTTTCCTCTTTTTTGAGACAGACTCTCACTCTGTTTCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCGTGATCTCAGCTGACTGCAACTGCTGCCTCCCAGATTCAAGTGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGATTACAAGTGCACACCACCATGCCTGGCTAAGTTTTTGTATTTTTAGTAAAGATAGGGTCTCACCATGTTGTCCAGCTTGATCTTGAACTCCTGACCTCAAGTGATCTACCCATCTCAGCCTCAAGTTGCTGGGATTACAGGGGTGAGCCATAAGCAGTATTTTCTACAATATTATGAATATAAAGCCACAATACTTACTTTGAATCACTTAAATGGTTATTTTAATATTGTAATTTATACTTTTGAAATATAAAGTGTTTTAACTGAAGTATAGTTACAGTTTTTAAAAATGGTACATATACTATGACGTTCATTAAAATTATTCATACTTAGATATTTATATCTAATAGCCAGAGAAAATTTACTACCAAATTATTACAGTAGATATTTGTCTGACATATTTATTACTTTATTCAATAGGAATAACAATGAGTAAACACAATTTAGGTATCTTTTATTTCACTAAATTGGTATGTTCCTATTACAGGACAGATAAAGACAGGTGATGTGGCCACCCCAACACCATAATACCTCTTCAGTTAGCTATGTTGCAAGTTCTAATATATTCCACTATACGAACACAATCAGATTCTATTTCTTCATCAAAAAGTGTTGTTTGAAGTTGTCAGATGTATTTCAATATAGAACCCCCATTCAATGGCTAGAAGATGAGACAGCAGCAGAGATGGAAAAGAAACTTTATAAAATTATTCTTTCTGAAAATCTGCACCCTCCTAATGCTCATGTTTCTCATGGTGAGAGTAGCTATACACTTTGAGTGTTTCGAGAGAAATTTATTTTAGGAGAATATTTTCTGGCTGACTTAACAATCTTATATCTAATCTGACCTTTTTCTTAAGATCTTTTTAACTTCCTTCTCTCAAAATTATCTTGCTCAGAGGGAGATCTGTTTTTCTCTCCAATGCTTTGTCTGTTTCAGAAGCCTTACTAGTATCCCGTGGTGTCTGAATGAGGTGGGTTGTCACAGTGAAAACTTCTGATGTTATCTCTATCTGGACTCATGTTGGAAATTCAATATTTTTTCCATGTCACCATTATAAGTAGAAAGTGAGGCTGAAACACTGCTCCCAGTTTCATTATTGTGAAGATATGATTCTACCCAGGAGGCCTGCAGGCTCTCCTCCTGCAGCTCAGGCCTCACTCTCTGTTGTGACATTAGAGTGTTGCTGTGGCAAATGTAGTTCACATAAAATGTGAGCTGTGCTCTGGGCTGTGCCTCAGTGGCAGATAGTAGAGGTCAAGAGAGGAGACCAGCAACCAGGGGAAAGCAAGCAGGAGTGCTGTAGCCCAGTGCCAGGGAGTACAGAGCCACTGCTCTAAAATGTAAATAGCCAAAGAGAGAATCCTATTCAACCATTTTTGTAGCAGAGTGAAAGCCTACCTTCAGCAGCCACTGGGCTTCAAGCTGCTAAACTACCTCCTGTTCTGAAGATGTGGAAAGTTTATTTGTCATTGGATATAAGCATTTAGCATACCCAGATGCCCTATTCCATCTCCAGGTGATTTTAGGATGAACTATGTGTGACATGGTGCTATAAATTCTTCTACTTGTGGACTAATTATGGTGACCATCTTTCCATCTTTGTATTCTGTTAAACATATTGACCATGATGTATGTCACTTTCAAGTTTAATTTTATAAGAAAGCCATTTTCTTTCTCTGGGGCTGAAGAAACCATTTTCTTTTTCTGGGGCTGGAGCTTCTCTGGGGCTGGAGAAAATTTTTCTTCTTTTTCTGTTTTTGTTTGTTTGTTTGTTTGTTTTTTGAGATAGAGGTCTCACTCTGTCACCAAGGCTGAGTGTAGTGGCATGATCTCAGCTCACTGCAACCTACAGCTCCCGGGTTCAAGTGACTCTCCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGATTACAGGCACCTGCCACTGTGCTGGGCTCATTTTCATGTTGTTAGTAAAGATGGGGTTTCACTGTGTTGGCTAAGCTGGTCTCAAACTCCTGACCTCAGTTGATCTGCCCACCTCAGCCTCCCAGAGTCCTAGTCCTGGGATTACAGGTGTGAGTCACTACTCCCAGCCCAATTTTTCTTTTAATTATTGTTTCCAAACACTGTCTAGAATTACCAGATGTGATATAAACACATAAGGTGCCAACCAGAATTTACTCTAGAGGGGACTTTCCCTCTCAGGCTTCCAGTCAACTTATACTTGTGCAGCAAAGTGCACGCTGTCCCCTAAATATGCAGGCAGAATTGTGTCTCTGCCTATTTGGTATCTAGAGTTCTCTACAATCACTTCTAGAGAGGCTAGATCAAATTTCTACAAACTTCACGGGCAGCAATCAATCATTTTACCTCTTTCACTGACTCTTGTATCTTCAGACTGAAACTGATTCAGAGAATATGGAGCCCAGAAACCCAATCAGAGTAACATGTGTGCATTGAGTAGACATAGAGACATGAGAATCTCCACTTTCTTCTTCCTCCTCTTGCCAAAATGCCCACAAACGTACAGGTAATACCTGCTGCTACTCCAGCCATTCAGGCCATAAATCTGCAGCTTCAAATTTTGAATCCAGGTCATGAGATTTGAGAAATAAAAAACTTTTATCTGAAAAATGCAAGTCCTTTTGGTTATCAAACTCAGAGAGACATTAAAATAAAAGTGCAGTTACATCTTTATCCTATTAACTATGTATTAATCTCTTGAAACTGTTCCCTATTGGCACAAGTAGCTATAAATGACACTAATAATGCCACATTGGACACTATATTTTTGTTTGTTTGTTTTTGAGATGGAGTTTCAATCTTGTTGCCCAGGCTGAGTGCAATGGCACAATCTTGGCTCCCTGCAACCTCTGCCTCCTGGGTTAAAGCAGTTCTTCTGTCTCAGCCTCCCCAGTAGCTGGGATTACAGACATATGCCACTATGACCAGCTAATTTTGTATTTTTAGTAGAGATGGGATTTCTCCATGTTGGTCAGGCTGGTCTTGAACTTCTGACCTCAAGTGATCTGCCCACCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCTTGAGCCACTGAGCCTGGCCTGGACACTATATTTTATACCCTAAACCATTATGATATATATCTAATTAATAATCAATGCTATTTCTGTAAATAAAAATTTCTGAAAAACAACTTTGTGTCAGCCCACTCTCTGTCCCTCTGTTGTTGTCTTTACAAATCCTCTTGTAATTGCTGCTAATTAAAGTGTAGATTCCAGGCAACTTGAATCTTTGCTCCCAGGTTATGATCCTTAAACTTGACCCAAATAAACTGTCTACTTATGTTCATGTTGTGTCAGCCTTTTTTAATATATATATAGACTTATCATTTAGAATGTGCTAGAGCAGCCTTCATGAGGGGATCTCTACTTAGATTGTATTCCACTTGCTGTAACATCAAAGGATGCAGAGCCAGGTTGATCCTACCTAGAATCTGCAATTAAGGTCTGGCCTCTGCCTGGGATTTACAAAAAAGCCTGGACTTTGGATAGAAAATGTACAGAAAACTAACAAAAGGCATTTTCTGCGTTGTGAGATGTCAACCTAAACATCTTACAGCCCCATTTTGGGAGTGTGGCTCTTTGAGATTTTTCACATCTTGTTCATTGACCTGCTACAGTGATGTGAGAGGCTCCAGGAGGAAATAGAATCTGATGGCAGAATTTGTAAGTGTAAATAAGCATCTTAGGCATGAGAGATCAAGGCCACAAAGTATCCAGAGCCATGATCACAATTATAATTACCTGTAAAGTGGAATACTGGAGAAGAGTTATTTTTGTTATTTCCTTTACCCATGAGCTAGCAAATCAGAATGGGTGTTCCAGGTTCTGGAGTTCCACCAGGGCAGTTCCATTTTCTATTTAGAATCAGCCTGAGTCTCTCCAGCCTGGTTGATCATTGGGCCATCAGCCCAGGGTCACTGGGAATTCCCTCAAAATCACCTAGGTGTCTTTGAGGTATTTGAGGATGTTCAGAGCAGAATTGTGTTAGACTGACAAGAGTGGTTAATTCTGCTTCTGTCTCAGTGTAAGAGAAATGAGTCATCCTGTGTTTTTTCATCCCCTCATACAAGAGGTATCTTTGGTTGCTACCCAGATGAGAGTTTCTCCAGTTTCCTGTTACTTGGATGATAAAGAAGGAGGAGATCTGGAGACTCAAACAGATAAACTAGTTGCTTCAATTTCATATAGCCATTAAAAAACCATGAAGCAGTCATGGTTCCTACAGTCCAGAAATGTTTAGTCTAGACTAGCAACTGGATAAATAATTATGCATCATATGGTTGGTACAATAAACACGTGTCCAAAATCTTGGGCTTTATTTAGTCTACTTTGTTTATATTGTGACTTCTGATGTCTACATCTCAAGGCATATTTATGAACAGAAGGATTATTATAATTTTTATTTTGAGACGGAGTCTGTGTCACCCAGGCTGGAGTACAGTGGTGTGATCTTGGCTCACTGCAACTTCTGCCACCCTGGTTCAAGTGATTCTCCTGCTTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGCATTACAGTTGCTGGCCACCATGCCCAGCCAATTTTTGCATTTTTAGTAGAGACAGGGTTTCACCATCTTGGTCAGACTGGTCTCAAACTCCTGATGTTGTGATCTACCCGCGTCATCCTCCTGAAGCGCTGGGATTACAGGTGTGAGCCACCACGCCTGGCCATATAATTTCTATTTCTTTTACCTTGCTAAGTGTACATATTTATTTTCTAATAAAATTACCCTAGAAAGGCTGGGCATGGTTGTTCATGCTTGTAATCTCAGCACTTTGGGGGTCTAAGGCAGGTGGATCACAAGGTCAGGAGTTTGAGACCAGCCTGACCAATGTGGTGAAACGCCGTCTCTACTAATAATACAAAAATTAGCTGGGCGTGGTGGCACACATCTGTAGTTTCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGTAGAAGAATCACTTGAACCCAGGAGGCAGAGCTTGTAGTGAGCTGAAATGGCACCACTGCACTCCAGCCTGTGCAATAGAGTGAGACTTCATCTATTTAAAAAAAAAAAAGTTACCCTAGAAAACCTTAAAGGATTTGTTTAAATTGCGTATTAGTATGTAGCATAAAGTTGACAGGGCAGTGGCTAGAAAATATTAAAATTACAGAAATTCTGGGATTTAAGTTTTTCTTTTAGGTAACCTTTGAAAAAAGAATACTGGTAGTACTGCAGTGGCATAGAGGGAAGAATTCTACATAGAGTCCCCACCCTGCCTCAGACCTGTTCAGATTCACCCTTTTTGGAGGCCTTATTTTGGTCTGACTATACCTTGGAGTCTTTCCTCAGAGAACTGATTAGAAGAGATCAGAGTTTTGGCTGGTGAATCCTGTTGCCTTTCTAGAGCTGGTGTTCACAATTTCTTGAAACCCAAAAACAGATAAATGGGATAAATAACGTATGTATTTTAGGGTCCTAGATTTTAAATGTTCTATTAAAACCAGTGTTTGCAGAGACATTATATTTAGACACTTGTTTTCTATTCCTGCAGATCCAGTAGTTGCTCCATAAGTCACAAAAAAGTAAATATAAAGAGAATAAAATTTTGTCTAAACTACATTAACCTCTTTCTTTCTGTATCTCTTTCATCTGTCTATATTTAGCTTTTATTCCTTATAATTTAAAAAAAATTGATGACAGAGGAACAGAAGAAGAAATAGAGATTCTGGGCCCTTTTTTGAAATCCTGGAAATTATTAAACCCTTAGTACCAGCTCCCAGGATGTTACGAGAATTAAATCACATAATGTGTTATGCCCAGCACAGTGCTCTGTATCATGCTCTTGAGCACACAGTATCTGTTTAATAAACATTGCATTAGTACATGTGTACATGTTGTTTTTAAAATACAGACTTATTCAGACATTGCTGCCTTCTGTTTCCTCTCCTTGTTTGTACCAGAAGTATTTGGTTGTGACAAGAGTGCTAAGTGTAAGGGATCCTGTGCTGTGCCTGCTTCTCTAACTAATGTAAATAATGCGCCAAGGGGGAGCAACATCAGCTTTGACAGGGGACTTGTTTAAAACACCCATGCATAGACCCTTTTCAAATCTGCAGAATTACATTACATAAAGTGGGGCCAAAATTACCAAGTGATTTATAAGCTTGTTAAAGCTTGAGAGGCAATGCTTAGCTTAGTGATTATCAGCCCAGGGTTCTCATTAGGATCACATGGCCAATTTGCAGAAATCTCTTGTGCCCTCCCCACAGGTTCTGTTTATTGTTCTGGGTGGAAGCATCCACGTTGTTTTAATGAAGGGCCTCATGTGACTCTAAGGTGAGGCCAGAATCAAGTATGAAGGCTTCAAAATACATTCATGAGAGTTAAATTCCACCTTTGCACTAAAGGGTGGTCACAGGGCCTATTCTATTTGGGTTTGGTAGGGACAGGTCAGTGTGGTGCATATTTCCATTACTGTGGCAGAAATTGCTGGTGTCTGTGGCAGGGGAGGGCACCTGAGGACAGGAAAGGAGAAACTTATATTTTCATCTTCATGGAGCAGCTCATTGCTCCTGAATCTCTTCTGTTTTAAAGGATAGAAATGGATGGATTTTTCTGTCTTTTTCTGCCAATTGATGCCATGCTAGCTGGTAAACATGTGGCACTGACACCTTTAAAGGCATATTCTCAAGATGCAGGGGTAATTTGTCCAGAGAATCTTCATCTGAGAAGGAATTCCAGAGAAGGAGGAGATCAGAAAGAGAAAAAAAAAGGGCTTCAGGTAAACATGCCTCAGCTGAAAAGCTATGTCCACTCTGCCTCCTGGAATGCCATGTATCTAGTACTTGAAAACTTTTACTTCTCTACTTGTGTTTTTCCTCCCTAAGGAGTTTGGTTTAAGTACTTCTTAAAATTCTTATGATAGTCAAACGTGTCTGAAAAGTATTTCTTCCCTGTATCCCAGAGCCTTCTCTTCATTCTCTACATCATAACTTCTTATACGCCATGCAGATTTATCAACAGGAATTTATGATCTGCAATATTAAAAATGTTCCGTTTGTGGCTGTTGAACATGGAAAGATGTGGATACTCAAGATTTCTATTGGGGAAAACTGTGGTCCTTAGTAAAGATGGAGAAAATATAATGTTGAGGCTCCATTCATGTGTTCCATTAGCTGTATGCTGAACAGGATTAAGGAATTGCTTATTTAGGTCGGGCGTGGTGGCTCATGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGTCAAGGCAGGCAGATCGCCTGAAGTCAGGAATTCGAGACCAACCTGGCCAACATGGTGGAACCCCGTCCCTACTAAAAATATAACAATTAGCCTGGCGTGATGGCAGGCACCTGTAATCCCAGCTACTTGGGAGGCTGAGGGAGGAGAACCACTTGAACCCAGGAGGCGGAGGTTGCAGTGAGCTGAGATCGTGCCATTGCACTCCAGCCTGGGGGACAAGAGTGAGACTTAATCTCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGAAAATTGCTCATTTAAATGTGATGGCATTTATTACCCAGAAATTCTGAAAAAAATTATTAGGAGATACCTGCTTTCTAGGGTGTTAATGAAGCCTGCTTAATATTACTACTAAAAATTACAGAACATAGGAGGTATCTGTATTTTGAGGTTTGCATAAAACTGATGATTCTTTTTGATTACATTCAGATTTTATTTGCTTTTTTTAAAAAGGAATATTTCAATAGTGATGCTGTATTCTTCTGTATGCATTAACACATCATAAAAATTTGTCCTAGTGCAGTTAATGGTTAATGATTCACTTGCTTAAATAGGTCTCTGACAGACTTTTTTTTACTATATAGCTAATTATTTTTCTCTTCATTATTAAGTTTCATTATGCAGCTGATGTGAACAAACAATCATTTAATCTGGCAGCTGTTCTTTTTTCTTTTTTTCTACATATTTTTCTTTGGAAAATTAAGGCTCTTATCTTTGTTTACAGGCCAGAAAAACTGGAAAAAACACAGGCTCTTCCACTTACTGGATGTTTGACAAAATATTCTTCTTGGGCCAAAAACATTGACATTATTGGTTAGCTTGCTAGAAATTCAAAAAATCAGACTTTATTCCAGATCTTCTGGAAAAAAACCCTGCATAACAAGGTCTTCAGCTTATTGTACATATTAAAACATGCCTTTTTCATCTGAAAAATATTCACAACTCATTCCATATGATGTAAATATAGCACTCAAAAATGTACATGTTTGTGTTCATGCCCTTAATTTTATAGTTTATTTTCTAGAAAAATATATGAACTGATGTTGTGGATCTTATGTTCCTTTATTTTCTCAGAGTTAGAGAATACTTTAGAGAATATTTCTGTGTTGAAAATTATTTTATAGGATAACTTTAGTCAGTCCTATAAGTCAGAACCAGTTATCTTTACTCTCTCATTTCACCTTAAGTCAAATTAAAAATTCCGCCCATAACCACTTGGTGAAAATGTGTGTGTGTATATTTTTCAG
Seq C2 exon
GGGCCATTGCAATTTAGAGATGTGGCCATAGAATTCTCTCTGGAGGAGTGGCATTGCCTGGACATGGCACAGCGGAATTTATATAGGGATGTGATGTTAGAGAACTACAGAAACCTGGTCTTTCTTG
VastDB Features
Vast-tools module Information
Secondary ID
ENSG00000160229:ENST00000344519:1
Average complexity
IR
Mappability confidence:
NA
Protein Impact
ORF disruption upon sequence inclusion (1st CDS intron)
No structure available
Features
Disorder rate (Iupred):
C1=0.000 A=NA C2=0.000
Domain overlap (PFAM):
C1:
NO
A:
NA
C2:
PF0135222=KRAB=WD(100=95.3),PF0090213=TatC=PU(13.3=30.2)
Main Inclusion Isoform:
NA
Other Inclusion Isoforms:
NA
Associated events
Conservation
Cow
(bosTau6)
No conservation detected
Chicken
(galGal3)
No conservation detected
Zebrafish
(danRer10)
No conservation detected
Fruitfly
(dm6)
No conservation detected
Primers PCR
Suggestions for RT-PCR validation
F:
No suggested primer sequences
R:
No suggested primer sequences
Band lengths:
Functional annotations
There are 0 annotated functions for this event
GENOMIC CONTEXT[edit]
INCLUSION PATTERN[edit]
SPECIAL DATASETS
- Autistic and control brains