MmuINT0085599 @ mm9
Intron Retention
Gene
ENSMUSG00000062609 | Kcnj15
Description
potassium inwardly-rectifying channel, subfamily J, member 15 [Source:MGI Symbol;Acc:MGI:1310000]
Coordinates
chr16:95480460-95513515:+
Coord C1 exon
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Coord A exon
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Coord C2 exon
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Length
32854 bp
Sequences
Splice sites
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AGTGTACGT
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Seq C2 exon
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VastDB Features
Vast-tools module Information
Secondary ID
ENSMUSG00000062609-Kcnj15:NM_019664:3
Average complexity
IR-C
Mappability confidence:
NA
Protein Impact
No protein impact description available
No structure available
Features
Disorder rate (Iupred):
C1=NA A=NA C2=0.107
Domain overlap (PFAM):
C1:
NA
A:
NA
C2:
NO
Main Inclusion Isoform:
NA
Main Skipping Isoform:
NA
Other Inclusion Isoforms:
NA
Associated events
Conservation
Human
(hg38)
No conservation detected
Rat
(rn6)
No conservation detected
Chicken
(galGal4)
No conservation detected
Chicken
(galGal3)
No conservation detected
Zebrafish
(danRer10)
No conservation detected
Fruitfly
(dm6)
No conservation detected
Primers PCR
Suggestions for RT-PCR validation
F:
No suggested primer sequences
R:
No suggested primer sequences
Band lengths:
Functional annotations
There are 0 annotated functions for this event
GENOMIC CONTEXT[edit]
INCLUSION PATTERN[edit]
Other AS DBs: