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Seq C2 exon
GACCTGATCTCTGCAAAACAAACCCATGCCTCAACGGAGGCACCTGTTATCCTACCGAGACTTCCTATGTGTGCACCTGTGCACCTGGATACAGCGGAGACCAGTGTGAACTTG
VastDB Features
Vast-tools module Information
Secondary ID
ENSMUSG00000021614-Vcan:NM_001134474:7
Average complexity
IR-C
Mappability confidence:
NA
Protein Impact
No protein impact description available
No structure available
Features
Disorder rate (Iupred):
C1=0.862 A=NA C2=0.000
Domain overlap (PFAM):
C1:
NO
A:
NA
C2:
PF0000822=EGF=WD(100=79.5)
Main Inclusion Isoform:
NA
Other Skipping Isoforms:
NA
Associated events
Conservation
Rat
(rn6)
No conservation detected
Zebrafish
(danRer10)
No conservation detected
Fruitfly
(dm6)
No conservation detected
Primers PCR
Suggestions for RT-PCR validation
F:
No suggested primer sequences
R:
No suggested primer sequences
Band lengths:
Functional annotations
There are 0 annotated functions for this event
GENOMIC CONTEXT[edit]
INCLUSION PATTERN[edit]
Other AS DBs: