MmuINT0178830 @ mm9

Intron Retention

Gene

ENSMUSG00000063108 | Zfp26

Description

zinc finger protein 26 [Source:MGI Symbol;Acc:MGI:99173]

Coordinates

chr9:20232762-20244048:-

Coord C1 exon

chr9:20243966-20244048

Coord A exon

chr9:20243105-20243965

Coord C2 exon

chr9:20232762-20243104

Length

861 bp

Sequences

Splice sites

5' ss Seq

CTGGTAAGT

5' ss Score

10.65

3' ss Seq

TTTTTACCCTTTATCAATAGGGA

3' ss Score

8.83

Exon sequences

Seq C1 exon

AATGGGAAATGCACCTTAAGACAAAAAGGACAGCACTTCAGCAGGATAGATTTTGGTCAGATATGTCAAATGGGATGCAACTG

Seq A exon

GTAAGTCTCATAAATGTACTTTTATGTTTATGGGTGCTTTGCCCACACATACATCTGTGCACCATGTGCAGTGTGCGTGCCCTTGGAGAACAGACAGTGGCATCTGATTCTTTGGGACAGGAGTTGCAGACAATTGTGAGCTGCAGTGTGGGTGCTTGGGAACGAACCTGGATCCTTTGGAAGAGCAGCAAATGCTTTTAACCCCGAAACCATCTCTCCAGCACCAGGATATTTCTTTTTAAAGAAATATTTTTATTTGAGGATATCTCTTATTTTGATAATAATCAACTCCCACTTCTCCTAACTCCTCCAAGATCTCGCCCTCCCCCCCCCCACCCCCCCAACGCTACATCCTTTTTTAGAATCAATTTGAATTTGTGCTAGCCAAATCATTTCTTGGTGTATGTAGGGCCATCCACTGGAATGACCTACTAGGAGCCACACTCCTGAACTCAGAAATCATCAGTTGTCTGTAGTTTCTCAGTCAGGGGTTGGGGCAACAAGATCCTAATGTCTAAGGTCAGGGAAAATTTAATAATAAAAATAATTTAATTTAATAATAAAAACAGATCCAAATGAAAGATGTGAGACAATTAGCTGTCAACAGGCATGGAACTCTTTAATCTTTCCTTTTTCCATTACTCCTTTTTTTTATTCAGAGAGAGCACACTACCACTCAAGGTAGCCTTCTCTTGTGACACTTGCTTCAGCTTCCAGAATGCTGGGACAGTAGTAAGTCAGGATACTCAGCATAAAGTGATGCCCCGAATGCATTGTGAGGTTTAGAGCATCCGAATTCCACAGTTTTATCTTTCTGTACAAGCCTGACCTTCTAATCATCTTTTTACCCTTTATCAATAG

Seq C2 exon

GGAAGAGAGCACAGTGGAGGGGAACCTGGTGACCCTGTTCAAGTTGGAGCAGTTTTTAGTGAAGATTCATGCCCTCAAACTCACAGTAGTACTTCAAATACAGGGAACACTTTTGCGTGTAACTTAGATGGAAAAGACTTTCAGCCACTCCTTAAAGAAACTTCTACTGAAGAGAACATTGTCCAGTTGAACCAGTGTGTAAAACCTTTGATTTTCACTCCAGATGTTTCCCAGAAAAAGTGCACTCCGGAAAAATCTGTTGAATGCAGTGACTGTGGGGAAACTTTCGTTAATCAGCTAGAACTTCAGACACATAGTTCTTCTCATCGTGAAAAGAATATCCACAAATCAGAGGAGTGTGGACAAGCTTCTACTCATCCTATAAGCCATGGTGGGCATGTGATTCCCACTGAAAAAAAATACTATGAATGTAAGAAATGTGAAAAATTTTTTACACATCCTGTGTACCTTAATATCCATATGCAAAGCCACACTGTGGAGAAACCCTATGACTGTAAGGAATGTGGGAAAGCCTTCACTGAGCGCTCAAGCTTAATTGTGCATCTACGACAACACACTCGAGAGAAGTCTTACGAGTGTAAGGAATGTGGGAAAACCTTTATTCAACCCTCACGTCTTACAGAGCATATGAGAAGTCATACGGGAGAGAAGCCGTATCAGTGTGACCAGTGTGGGAATGCCTTTGCGTCTTCCTCTTACCTTACTACACACTTGAGAACTCATACTGGAGAGAAGCCCTTTGAGTGTAACATATGTGGGAAGGCATTCACACGTTCCTCTTACCTGCTAGGTCACATACGAACTCATACAGGTGAAAAGCCCTATGAATGTAAAGTATGTGGGAAAGCGTTCAGTGGCCGTTCTTGGCTAACCATACACTTACGGAAACATACTGGAGAGAGGCCCTATCCATGTACAGAATGTGAGAAAGCCTTCACCAGCTTCGCTCAGCTAACTGAACATATAAAAACTCACACTGGTGAGAAGCCCTTCCGGTGTAAAGTATGTGCAAGGACTTTTAGAAATTCCTCATGCCTTAAGACTCACTTTCGAATTCACACTGGAATAAAACCATACAAATGTAATTACTGTGGGAAAGCCTTCACTGCACGCTCAGGCCTTACTAAGCATGTACTAATTCACAATGGTGAGAAGCCCTATGAGTGTAAGGAGTGTGGGAAAGCCTTCAGTACATCTTCCGGCCTTGTTGAACATATAAGAATTCATACAGGAGAGAAGCCCTTTGAATGTTACCAGTGTGGGAAAGCCTTGGCTCATTCCTCATCCCTTGTTGGACATTTAAGAACTCACACTGGAGAGAAACCCTTTGAGTGTAATCAGTGTGACAAAACATTTACACGATCTTCTTATCTTCGTATTCATATGCGAACTCACACCGGAGAGAAACCATATGAATGTAAAGAGTGTGGGAAAACTTTCCCTGAGCGCTCATGCCTTACTAAACACATAAGGACACACACTGGTGAAAGGCCCTATGAATGTAAGGAGTGTGGCAAAGGCTTTATTAGCTTTGCTCAGCTTACTGTACACATAAAAACTCATAGTTCTGAGAGACCCTTTCAGTGTAAGGTATGCACAAAATCTTTTAGAAACTCTTCATCCCTTGAGACCCACTTCCGAATTCACACTGGAGTAAAACCCTATAAATGCAGTTACTGTGGGAAAGCCTTCACTGCTCGCTCAGGCCTTACCATCCATTTACGCAATCACACTGGGGAGAAATCCTATGCATGCCAAGAGTGTGGAAAAGCCTTTAGCACTTCCTCAGGCCTTATTGCACATATAAGAAGTCACAAAGGAGAGAAACCCTTTGAATGTGACCACTGTGGGAAAGCCTTTGCTTCTTCATCTTATCTTAATGTGCATTTGAAAATTCACACTGGAGAAAAACCCTTTCAGTGTACAGTATGTGGGAAAACATTTACGTGTTCTTCTTACCTTCCAGTTCACATGCGAACTCACACTGGAGAGAAGCCTTTTCAGTGTATAATATGTGGAAAGTCATTTTTGTGGTCCTCGTACCTTAGAGTTCACATGCGAATTCACACTGGAGAGAAACCCTATGTATGTCAGTACTGTGGAAAAGCTTTTACAGAGCACTCAGGCCTTAATAAACATTTACGGAAACACACAGGAGAGAAACCATATGAATATAAGGAATGTGGGGAAAACTTCACTACTTCTGCTGATGCTAATGAACATGAAACTCCCCACTGGGGGGAGAACCTTTGAATGTAAGGGATTCAGAAAATTGATAGCCCTTGATCCATCATTTGCAATCAAAATTTATAGTCTATACAAGTCTTATTGATAAGCAACGTATAAAAAACATTCGGTTGCTATGTGCTGTAAAAACAACTCATTCTGAGGATGCTCTGAGTTTAAGGATTGTGGGAGAAATCAAAATTTCATGATATATGTATGAACTGAAGGTTTGTAATATAGGGAACGAAAACCTTTAGTGTTTCTATGAGTGTTGATGCAAGACATGTAGAAATGTTTCTATGTTCACGTGTGGTCTCACAGTTGAGAAATGTCTTTCTGAAGTTTGGGAAGTAACTTTACATTTGAACACAAGCTACATGCGTGTAAGAGGGGATTTGCTTCAGTGTCTTGGATGGCAACACTTGGCTTTCTTGGGTGCTTCTCTATGAACTTTGAATATTTCTCCATTTGTGTATTTTTATGACCTCAATTCCATTGTTAGTTTTCCTTTTTAAAATATTCCTGTTTGATGTGATTGAAACTTGTTTTTATCTAGTATCTGTTATATGTCCCATGTTGGCATTGTGAACTAATGACACAAACTCCCATCTCCTCACTACTTGTTAGTTTATTTGTTGTTGTTTTTTTCCCCTCTTTTCTTTGGAGACAGTCTCACTTTCTGGCCTAGTATAACATGAAAGTTATGTAGCCTAGACTGGTCCCTAGCTCATGGCAGTCTAGACCCAGCCTTCTGAGTGCATAGATTACAGGTGCAAGCCACCATACCTGGCTCTTTCTACTGTTTTAAGTATAAACTTCACTAGCACTGAAAAAACCATCATGTTTTACAATTGTGTTCAGGTTCTTAACACAAGTAGGTTTGGATCTGACCAATACAATCCCTTACTCTGAGTTCTAAGTCTTTGGTAGCCATTCCATTCTCTGCTTGGAGTTCAGCTTTTCTTTAGGCTTTGCTTCTTAGATCATGTAGTATCTGTATTAACTCTACTTAGCTTTTTTATTTTTGTGACAGGGTCTTGCTGTAGCTCAAACTGACCTCAAACTCGCAAACCTTTTTGCCTCAGACTTACTGCTAGAGTTATAGGCATGTGCCTTCATGCCTAGCTGGCGTATATCAATCTACATAATGTTCTCAAGGTGGAACTGTGTTATGGTCAGTTATTTTAAGACATCTAATTATCCTTTGGCCTCTATGGATAGTTAGTTTCTATACCTTGTTTGTTAGTATTGCTACATAGCGAGTGTAGCTATCTCTTTAAAGTCATGACCTTATGTTCTCAGATACAATCCCAAAAGTGACTTTGTTACTGTAATGACAGATATTGTCAGTGTGTATGTAACAACTGCCAATTTATATTCCCAGTGATGTACCTAGTCTCTTTATTGCTTATCTTCTTACTTTTTCCTTCCTGTATTCCATTTAAAAATGTGAGATGGTATCTTCAGTTTTGATTTGCATTTTTCTAGTACGCCGTTTGTATATCTCTGCTAAAATACTGATTTCAGTAATTTATCAATTTTTAAATCAAGATCTGTGTATTTTGCTGTGAAGTTACCTGAGTTACTATGTTTTAGACATAGACCCATTGTAATATATATGGTTTACAGATTGTTTTTTTGGCTGTGTACATGCTTTTTCAGTTTTTTTTTATTGCTATGCAGAATCTTTAGTTTGATATGGCCTTAATTCTTTATTTTTGCTTTTAATGCCCATAATTTTCATGTCAGCTCTAAAATTCTTTGCTGGTGTGTCTGGAAGCATTCTTGGAGTTTTATTATGTTACAGTTTTAAATTTTACTTTCAGGGTTTTGTTTGTTTGTGGTAACCTAACTATGTAATCCATGATAGCATAGAGCAGGCTGGCCTTAAACTTGGAGCAGTATTTCTTCCCCAGGCCTTTTGAGTGCTGAGATTTTGGGTTTGAGCCAGCCTATCCAACTTAACTATATTTCTTTTACTATTATTTGATTTCCTTTTCTTTTTTAACCCCCCTAAGCTTATATACGTGCATACTGTTTTTGTTTTAGTTACTGTTACTGTTTCTGTTTTGGTGCTAGGAATTGAATTTGTGGCCTCAAGGATGCTAGGCAGGTGCTTTACCATCAAGCTATAGTTCTAACTTCATTGTTGAAATTATGTGGACCACATAAAGGGCTTTTATTGTTTCATTTGTTTGTTTTTTGGATAATATCTTTATAATCTGGCTGGCCTAGAACGTGCTATGTAGAACCCGGAACTCACAGAGATCTACCTGTCTGCCTCCCAGAGTGCTGGAATTAAAGTTATGTGTTCCTATGCCTGCCATTGACTATATGCTTATTTGTAAACAATTTATTTATGTTTTTGTATCAGTGTTATACTGTTTGATTTCTGCCTATATACTGGTTTTGTTTTTGCTGTTCTTTCTTAAGACAAGGTTTACTGGAGCTTAGACTGCCTTTGAGATTAACTAAATGATCAAGAATGACCTAATGACCTTGGACTTTTGATCTTCTTGCCTTTATCTCCTAGTATGATTCTAGGCATGTACCACCATACTTTGCACGCTCAGTGCTTATCAAACTTCATACTAAGTGGACATCTCTAGCCCTGTAATACATTGTTAAGCCTAGAATTTTTGTTTTTATTTAGGTCCTTTTGGGCTTAACTGAAAGGTTTTGGTTTCTTATGACTTTGTTTTTTTTTTTTTTTTTAAGCCTGTGGGGGAAAATGCCTTTAGAATTGTTAATGC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VastDB Features

Vast-tools module Information

Secondary ID

ENSMUSG00000063108-Zfp26:NM_011753:9

Average complexity

IR-S

Mappability confidence:

NA

Protein Impact

Alternative protein isoforms

No structure available

Features

Disorder rate (Iupred):

C1=0.119 A=NA C2=0.094

Domain overlap (PFAM):

C1:

PF138701=DUF4201=PD(24.1=50.0),PF0059814=Flu_M1=FE(35.5=100)

A:

NA

C2:

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Main Inclusion Isoform:

NA

Main Skipping Isoform:

ENSMUSP00000124075