RnoINT0076332 @ rn6
Intron Retention
Gene
ENSRNOG00000001224 | Itgb2
Description
integrin subunit beta 2 [Source:RGD Symbol;Acc:1305581]
Coordinates
chr20:11800072-11815647:-
Coord C1 exon
chr20:11815558-11815647
Coord A exon
chr20:11800293-11815557
Coord C2 exon
chr20:11800072-11800292
Length
15265 bp
Sequences
Splice sites
5' ss Seq
GGGGTAAGT
5' ss Score
9.65
3' ss Seq
CTGACTGCCTGTTCTTCCAGGTA
3' ss Score
10.94
Exon sequences
Seq C1 exon
CACCACCACAGAGCCAGCTGGTGAGAAGCAGGCAGAGACATCTCCAGTCAGTCAGATTCACGGATTGGAGGCTTCCTGGGACCAAGAGGG
Seq A exon
GTAAGTGCAGGACTCCTGTGTTCAGGTAGCTCTTTTGGGAAACACCTCAGAGGTGGGCTCTTCCCATGGGATTTCTCTTTATGTCCTCAGCCCTATGGGCGGGCTCTGGTGGCCTTTCCATGTCCCTCACCCAGCCTATCTGTCAAAAAACGGTCTTGGGACCTTTTACATGTGGCTTCCAGTTATTCAGGCCCTCCTGACTGATGTCTATGGATGGGAGAGGTATGGTACCACAGTTGGGCAGAGTCTCAGGAATTCTGGGAACTTCCGTAACTAAATGCGGGTAGGCAGGCAGAGAACAGTGTTGATCCTCTCTCTGTGATAGTCATGAATGCCTGGGGCTGAGGAAGGTCAGTTATGGTGGGGTTGACAAGCTGCTCTTTCTGTGATAGTCGTGGATGCCTTGGGGCTGAGAAAGGTCAGCTATGACTGGGGATGACAAGCTGCTCTCTCTGCGATAGTCGTGGATGCCTAGGGCTGAGGAAGTTATGACAGGGAGGATGGCTGGGACATGCTGTGGGAGTGAAGGGGTCATATCCTGTCACCCCTCTACTACAAATGGAAGTAGACACTTGTGGTCATGGAGGTGGACGTCAGACTGAAAGTAAGGAGCAAGAGAAGGAGCTGCTGAAATGGCCACTGTCGCCCATCTGTCTTATAATGGGGGAACTTCTCAGCCTGCCTTGCAAGCCTCTGGGACCGAGGCTACAAAATGCCCAGCCTAGCCCACAGCATAGCAAACGATAGGGAAGTTCTCTTCCCAAGAATCCCACATACAGTAGTGGCCAGGCCTGGGGCCAGCAACCACAGGGCCACATCCCAGATAGAGGGAGGAGGGATGCCTATGAGACCAGCCTGCAGGAGGCTATATAGCTGCAGAGGGGGTGGCTGACTGGCTCTGTGAGGTGGGCTCCATGAGGTCAAGTCTCAGGTGACAGACACCAGTTCCACATCCAGCAGCGAATCAGTGGATAAAAGATTACTGGCATCTGCCCTAAGGGAGGGACCTCTGCCAAAGCGGGAGTAAAATGAGCAGGAGTAACTAACTCCTGAGGGTTAGTTAGGGCTGGAAAGGCCCAAGTTTTCTATCTCCACCTCTCTCCACTAGTTCTGTTTTTCTCGGTTGACATATTCGGACATGGTCTTGGGGAAGGCGTGCCATCACAATGATTCGAACTGTGTCCACTGTGATTGTGGGGGTGGGGGAACCACACACTCACCCTTAACAGGAAGCTCTGCGTGTGGGGATATCTTTGATACACAGCTTGGGAGGAAGCATTCTGCTCTATGTGTAAGAAAGGGCGTGAGCTGGGGAGGCTGCTGAACTCTGAGGATGGGCTAGTGACAGGCTCTGCAAACTCCAATCCTCTACAGTCAGCAATGACTCAAAACTTACCCCCGTGAGGACGGAGTGGTGGAGACAAACTGAGGTTCCCGCTAACTCCACTTCCGTCACTCAGGTACAGGCGGCTTTCTGCAGGTGGCAGGGCTGGGGGCTCATGGAGTGTTGAGTTTGTGTGTGTGCGTGTTTGTGTGTGTTGTGCCGTGTGTCTTGTTTGTGTTGTGTTTGTGTGCGTGTGTGTTGTGTGTGTGTTGGTGTGTTGCTGTCGTCCTGTGTTGTGTGGTGTGTCCTGTGTATGGTGTGTGTGTTGTGTGTGTTGTGTGCTGTGGTCGTGGTGTCTGTGTTTGTGGTGTTTGTGTGTCTGTCGTGTTGTGTGGGTGTGTGTGTGTGATGTGGTTGTGTTGTAGTTAATACCACGAGAACAGTGGCCCTGTGAGGACGGAGGAGCGAGAGTTCTGGAGACAGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCGGGTGTAATGTGCTTGCTGTGTGTGTTTGTTGGTGGTGTAGGTGTTTGTGCCCTTCTGTTCACATCTCTCCCCTTTTGGGCCTGAGTCACCGTCCTGCCTGAAGCTGTGTCAACTGAGGCTTCCAAGTGTACTCTGTCACCAGAGATTACATACAGTTCACGCTTGGGGGTGGGGGGAGGGGTGGACCAACTCAGGGCATCCTCTGCCTGGCTGTTGGACATCTCTGGGGGATGTTCAGGAGATACCCCCAGGCAGCCAACCCAGTACTGGCTGTGTCCAGACTTCCTTCTCCTTTGCATACATGGGATGTCAAAGGGAAGTGCTAATTTCCTCCCAGACCCACCACCACCACCACCACCACCACCACCACCCCAAACCCAGACACCTGCATGCCTGAGTGAATCCCAGGCCCTGGGGAGCAGCAGTCTCTGGGACATTTTTGTAGTGGAAGGCAGTAGCCAGGCTGAGACAGGTGACCCAGAAACGCCAAGTGACTAGAGCCCTATGGCCGCCGAGTCCTGCTGTCTCCCTAAAGCAGATAGCTAGCTACCTGAGGTCCAGACTGTTGCAGGTTCTTTGGTCCACACTGTGAAACCCAAGATTGCATTAGTGACCAAAGGGGAAAAAAGGGTTTCTACTTGTGGTGTGACCCCCTTAGCAAACACCATTAATCCCTCTGGCTGGAATACACACACACACACACACACACACACACACACACACACTCTTAATACACACCTTTACTCCCAATGAAGGTAAAGTTTGTGGAAAAAAAGTAGTCATGTTTGAAAGTGATGTCTGAGTGAGTGGCAGACAAAGGGACGAATCAGAGAAAGATTTGACCGAATAGAATATGCCCAACTCTCACTAGAAGAGAGAAGAAAGAGAAGCTACTTGAGAGAGACAGAGAAAGAGACAGAGAGAGAGACAGAGGGAGACAGAGAGAGAGACAGAGAGACAGAGAGAGACAGACAGAGAAACAGAGACAGACAGAGAGACAGAGACAGAGACAGACAGAGAGACAGAGACAGAGAGATACAGAGACAGACAGAGAGACAGAGACAGAGAGAGACAGAGAGACAGAGAGAGACAGAGAGACAGAGAGAAGGAAGAAGAGGAGGAGGAGGAGGAGAAGGGAGAAGGCAGTTTTTATTGGGAGAGTTGTACAGAGACAGTTTGCAGAGAGAGAATAAGCTAGACGCAGATGAAGACAGAATGAGCCAGAGAAGGAGAAGGAGCTAGAAGATCAGACGGGATTGCTAGAGTTAGTTTGAGGCCAAACAGAGCAATCCAGAAGAAAACGAGAGAAGTCAGGTTGAATCAGTCAGCTTGGAGAGGAGTTTGGGCCAGAACAGCTGAGTTGAATCTCCCAGCTAAAATTCAGAAAGAACTAGGGAGAGGTGAGCCTATTCCATAGCAAGTCTCAGAGGCTGAAAACATCGTAGGCCTAGATTAGACTGTATGAAGGCTAGAAAGGCTAAACGTTTCCAGACTAGGCCTGGGTTAGCAGGCATCAGGCAAAAAACAAAAAAGTTATATTTATACCAGGCCTTGCCTCTGCATGTGGATCTTCAATCTGGTTGGTCTGATAGGATTTGCTTAAACCCTTAGGAGGAGTCCTTTGATTAGGACCTTCTCCTACAGCAGAGCAACCCTGTGGCACAGCCAGAGTCGTCCTCATAAAGCTGGGGTCAGGTCACCCTTGTCACACAGCAAGTGGTTCCTTGGCAAAGAGTTGGATGATTTGTAGAGGTCAGATCAAGTCCTGGATCGTGCAGGGCGTGTGCCCTGACAGCCCTTGGAAAAGACAGCATCTGGGCTACTCAACCCTCTGGCATCAAGGCAGCCAACACTGGAGTAAGGAGCCAAGAGGTGATAGACAAGAGACTGGCACATTGGCTGCCTCAGAAACAAACTGAGCAGGAAGCCATGCCTCAGCCTCGCCATGCTATTTTACGGCATCACCCCAGCAGCTCCCTGAAAGCTGGGTCTAGAGGACTCAGGGTTCTCCGCAGAAACAAATCAAGATGAGGCAGGCCCTTCAACTGATAGGACGAGGCCCGCTGCACTATGGGGTAAATTCTACTTGGTTGAGTTTTTGACACAGATGTTAATCTTGGAAAACGCCTGCCCAGTAATGCCCAGTCCCATATTAGAACCAGTGTTGGGGCCCTGTGGCTCAGCCACATAGACACACAGGGCCACCTACGCAGGATCCTGTGCCTCCATTGAGAGAAGAGGAACCAGAGCAGCCTGTCTGTGGCCCCTGTGCAGCTGGGTCTAGGTCTAGGAGTATCAGCTCTGGGGTGGAGCCGATGTGCACATCACTTGCAGCTGTGCCTGGCTGTGGGGCCTAGGTGACAGGCTGAGCCTCTGGGAGCAAACCCACAGGCTAAGGCCAGGCATAGGTTCCTAGAGACACAGGCTAGCCCACCTGCCAGTTGGGAGACCGTGAGTGATAGGATCTCCATTCCTATTTCTGAAGGACAACTGTCCGCTTCCAGAAGCTGGCCCTGACCCTGGTGGACCTTCCATAACAGGGTCCCTACCAGTGACTCATTGCAACAGATTATGATCTGTGAGCAAGACATATGAACATGGGAGTGCTAGGCCTCTGGGATGCTTGGATCCAGCCATTGAGAGATGTAGGGACTTCGAGGCCCCAATGCTGCTGCTTTTGGAAGCTTCTAGGGACAGAAACCTCTTATCTAAGCAGTGCCCAGGGATCTCCCTGAGCTCTGGGGTCTAAGGTGCTCATGATCAGCCCCAGGGGAAGCCATCGACTGTGTCCTAGAGTGCCATTTGGACCAGGTGGGAGATTTGGAACATTCAGAAACTCGGTGGAGGTTGTGGGCCAGGCCAGGGGAAAGGTACAGGAAAATGAAGTCTATGAGTCTCCAAGAGTAGCCTGGATACCCCGGTTCATGTCCCAGAAGAGATCAGCAAGCACTTGCAGTTAGAAAGCAAAGGACTGACGAGCAGGTTCCCACAGCAGTGTGAAGTCACCGTTGTTACTATTCCCGAAGTCATGATGGGACCCTCCTCAGGGACGTTAGGAGTGGGGACAGAAACACCAACAGTGTTTGGGCCCTTGAGAAGCTGGTTCCCCCAGTGTGTCCACCAGAGCTTTTAAGATGGTTCTGTGCGGGGCTGGGGATTTAGCTCAGTGGTAGAGCGCTTCCTTAGGAAGCGCAAGGCCCTGGGTTCGGTCCCCAGCTCCGAAAAAAAAAAGACCCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGACAGACTGTGGAGGAGCCTGAAGACACAGGGAGGATGCTACCCACAAGACCTGGCACATTTAGACCCATGGCTCTGTAACTGTCTTCAGACACACCAGAAGAGGGCATCAGATCCCATTACAGATGGTTGTGAGCCACCATGTGGTTACTGGGATTTGAACTCAGGACCTCTGGAAGAGCAGACAGTGCTCTTAACTGCTCAGCCATCTCCCCAGTCCAGCTTTCCCTTTTCCCCTTACGTTTGCTCTCAGGGTGAGGATGAGTTTCTCCAGCAGCTGTCCATCCCAGCCGCCCCTCCAGGTTCCACAGGGTGGGCAATGCCAATGTTAAAATGCCTAAGCCATGGGGCTGGGGATTTAGCTCAGTGGTAGAGCGCTTACCTAGGAAGCGCAAGGCCCTGGGTTCGGTCCCCAGCTCCGAAAAAAAAGAACCAAAAAAAAAAAAAATGCCTAAGCCACCTTCCATTTAAAAGCTACTCCAGAGATGCTGGTATTTTGAGGGGTGTTCCGTGCCCCTCAGCCTCTGCGTTCTGCCTGTTGAATGACCATGCTTCTCTGAGTTCACAGTCCAGGCTTCTCTGAGAGGCTCACTGATTATCACTAACTTCTCAGATTCTTTTAGAGAGGAAGCTTACCATTTGCTGTTTACTCTGGAGTTAATGGTTGTCTCTATGTGATTTATTATGCATGGGATTGTTTCTTTTGACAATGTCTTCTGGGTTGTTTTCCTTTAGTTTTTGTACACGCATTTCCTGGCCGTAAGGCATACAGCCTTGAATTATCTTTTTTCCATTGTTTCTTTAGTGGGTTCTGTTGGAGACAGGGTTTTAATGTAGCCCAGGTTGGCCTCAAACTCTTTGAAAAGTGGCCTTGAACTTCTGGTTCCCGTGTCTCTATCTCTGCTTGATTTTCTAAAGCAGACTTGTACAGAATCCTCTTCACTCTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTATTTGTGTGTGTGTGCATTTGTGTGTGTATTTGTTTGTGTGTGTGCATTTGTGTGTGTATTTGTTTGTGTGTGTGTATTTGTGTGTATTTATGTGTGTGTGTTTGTGTGTGTGTATTTGTGTATGTGTATTTGTGTGTATGTGTTTGTGTGTGAATTTGTGTGTGTGTATTTGTGTATGTATATTTGTGTGTGTGGTATGTGTGTATTTGTGTATATGTATGGTGTGTGTGTATTTGTGTGTGTGTAATTGTGTGTGTGGTGTGTGTGTGTGTATTTGTGTGTGTGATATGTGTGTGTATTTGTGTGTGTGTGATGTGTGTGCATGTATTTGTGTGTATGTGTATTTGTGTGTGTGTGTTTGTGTGTGTGTGTGTTTGTTTGTGTGTGTGTATGAAAGACCCTCAGATAGAGGAGACTCTTGCTCCAATCCTGAGGACACCCACCACCCACAAACACACGGGACTCAGTCTTGATGTACAAACAAGAGGTTTACTTGGGATACCAGTGCACTGGGGCTTGACACGGTCCTCACGCAGGAGGGATATGAAGAGCCTGGGACAGCAGGAACATACAGTCTATATAGTCACCACAAGGTCACACAGCTTCATTAGCTCAGCTACTTCGGTGGATTAGGTTAGAATGATGAGAATTTCTACCTGCTACAAAATCCAAGTTGTTCTCGATCGCTGTTTTTGTGTGTAGGTTTAATTGCATTTATGTGCTGTGCGTCTATGTTTAGTTGTGCCATGTTTGCCATGAGAGTTCTATCCGATGATTATCCTCCTGTTGAACCCACAGTGAGTGCTTGTGTCCTTGATTTTTGTGTCGATAATTGCAGTGTGTTATGTCACATGTGCTCATCGTGTTATTAGTTTTGTATGTTGTAATGTACCTGTACCTGCTGTGGTCTTTGTATGTGCTCGTCTTGGCTGTACCTGGAGCTTTGGTTTGTGGGTGTGTATATGTGTGTGTATTTCTTTGGTGGTTCAGGTGGAAGCCAGAAGACGCAGCTGTCATCTACACTCAGGAATATGCCCCTCTCCTTGAAACAGAGGTCTCTCATTAGAGCCTGGAGCTCACCATCACGTAGCCACTACTCGCAGCCCACCACTAGAGCCATGAGCAGATCTTCTTTCCTCTCCTCTCCTCTCCTCTCATCTCCTCTCCTCTCCTCTCCTTCTCCTCTCCTCTCCTCTCCTCTCCTCTCCTCCACCTCCCTCCTCTCCCTCCTTGCCTCCCTCCCATTCCTCGCTCTCACCCTCCTCTAGTACCCCTCTCCTCTTCCTCCCCCCTCTCTCCTTCCTTCTTTGTTTTATTCCTTTCATTTTAAAAAAAACATGTGGATCTGGGGTTGAAATCTGGGTCTTATACAGGCGCTTTCCAACATTCTCCTCCAACCACTCTACCCCTTCTTACGTGACATGGCAACAGCGCCAGAGCCCCTGGCTGGGTCACATTAGATCACATAGACGGCCTCGTCTGTATTGACAACATCGGTAAGCCCNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTGGTGTGTTGTTTGTTATTGGTGTGTTGTGCATTGTGTGTGTTTTGTTGTTGTGTGTGGCTTTGTGTGTGTATTTGTTTGTTGTGTGGTATTTGTGTGACTTTATGTGTGGTGTTTGGTGTGTGATATTGCTGTATTGTATTGGGTGTATGTGTTTGTGTGTGAATTGGTGTGGTTATTTGTGTGTATTTTGGTGTGTGGTATGTGTGTATTTGTGTATATGTATGGTGTGTGTGTATTTGTGTGTGTTGTATTGTGATGTGTGGTTGTGTGCTGGTGTTTTGTGTGAAGCTGTGATATGTGTGTGTTTTGTGTGGTCGTGAATGTGTGCCATGTATTTGGTGTGTATGTGTAATTGTTGTGGTTGTTTGTGTGTGTGTGTGTTGTTTGTGTGTGTGTATGAAAGACCTAGATAGAGGAGACTCTTGCATCCAATCTGAGGACACCCACCACCCCACAAAAAACGGGACCTCGCTTGATGCTAGCAAACAAGAAGGTTTACTTGGGTATCCAGTGCACTGGGGCTTGACACCAGGTCCTCACGCAGGAAGGGATATGAAAGTGCCTGGGGAAAGCAGGAATCATCAGTCTATATAGTACACAAGGTCACAAGCTTCATTAGCTAGCTACTTCCGGTGGCAAGGATATCTGATAGGATGTAGATGATTTCTAACACAGGAAGTCCTGACTAGGTAGAGTTTCTCATCCTGGAGTTCTGGGACAAGGCCTCATGACCCTATCAGGCGCCGCTATTCCATGTACCAGAGGATCGTCCTTGACTTGCAAATGTTTTTCCCAGGACAAAGGCCACAGCTATATCATCCTGTCTCTTGGTGCCCGGGGTAGCTTCCTGGAGAAGTGGGTGGCACTGTGCTTCCCTGTATTTCCCTGGTCTCATGTCTAGGGGCTAAGCAGAGGGCAACTTAAAATTTTTCATTTTAAGAAATGGCTGCACTGGGGTTGGGGATTTAGCTCCGTGGGGTACAAGTGCAAGGCCCTGGGTTCGGTCCCCAGCTCCGAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGAAATGGCTGCACAATAATCCAAGCTGGGGATCTTTCAATATATTTTGTGCATATGTTCTATTTGTGTGGTATGTGTGGTGTCCCTCTCTCCTCTCTTCTTTGTTTTTTTCCTTTTCATTTTAAAAAAAACATGTGATCTGGGGTTGAAATCTGGGTCCTTATACAAGCGCTTTCCCAACATTCTCTCTCCCAACCACTCTACCCCTTCTTACGTGACCATGGCAACAGCGCCAGAGCCCTGGCTGGGTCACATTAGATCACATTAGACGGCCTCTCTTGTATTGACACATCGGTAAGGATGCTTTGAATTTTCCTAAAACTTGGGACTTTTTACTGCATTGGTTTTCTATCCATTTTAATTAAGTGAGCAATTAACATATTTATTTATTTATTTATTTATTTATTTATTTATTTATTTATTATTTGAGAAAAGGTCTCACTTTCTAGTTATGGCTGTCCTGGAAGTCACTATGTAGACCAGGCTGGCCTTGAACTCACAGAGATCCACTTGCCTCTGCCTCCCAAATGGCTGGCATTAAAAGGCTCGTCCCACTACGTCCAGTTTATTGCAGTGTTTTTAAATTGCTTCAGAAAGGAGTCTCATTTGACCCCATTTGGTCAGTAGCTGCAGCCCCCGGTATTTCTGGACTCCACTAATCTGTAAGCACCACTGCGACCGACCGTGTCTCTCGGTCACTTGTAAAGCTTCCTTTGCAAGCTCGAAGGGCTTTCTGAGTCCCTTGATCAGAATCCTTCCTAAACAGTGCTCCCTCTAACCCTTCTGTCTCTTTTGTTCCAAGTCTGCCTGGAGCTCTAAGAACCCAGCTAGTCCATCTGTTCCCATAGGCCCCAAGTCCTAATTAGCTTTGTCAGTTTTACACAGCATTAAGTCAACTGAGGAACTTTCTGGATCAGACTGGTGGGTATGCCTGTGGGGAAATGTCTTGGTGATTAATGGATGTAGGCGGGCCCCGCCCAGCCCCGCCCCGCCCCCGCCCCCCCCCCCGCCCCCCCATGGATCACCAGTCTCTGGGCAGATGGTCTCGGGCTATGTAGAAAGCTAGCTAAGTGTAAACCTGTGGGAGGGTGAGCCATAAAGTGGGGCTCCTCCATCCTGCCCCCGACTTCCCTCAGTGATGACTGTGGGCCGTAAGCTGAAATAACCTTTCTTCCCCTAACTTGCTTGTGGTCAAAGTGTTTTATCACAGCAACAAAAAAGGGAACTGGAACCAACCTTGTCCCTGCGTCTGCCCGGAGCTCTGAGTCCTAGAGCTAGTATTCTGGAACCACCTGCTCCCTCTGTTCCTTATCCCTTGTCCTCTGCCCAGGGCGGCTTGATCCCCGCATAGAGTTCCAATACCCTAGAGCCCATCTGCCCCTGGTTCTTTCGTGAATGTGTAAAGGCAGAAGTGACTCCATCTTGATACTGGGCTTTGGTGAAAAATGTTCAGGTCTAGGCTGTGATGCCTTGTGACTACCACAGGCCTTTACTTTTGCTCTCCTGAGGCAAGGGTGGCCCTAGGACTCCATCTATTCTCCCCCAGACTACCCTGGGGTTGGGCCAGTCTTCGCCTGTGCCATCCCCTGTGTTTGTTCTTAGTCAGGCGCCTCATGTACTCTGACTGGGGACAGGAAGCCACCCACCACCAGCTTTTGCTAGACTCACTCTGCCTCTGCTGACTTTCTTATATCACCATCTGCTTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGGAGAGAAGGTTTCATGCACCTCCAGCCGGCTTTGAACTCAAAATGTAGCCGAGGGTGCCTTTGAACTCCTGATCCCAAGTGCTAGGATGACAGTTGTAGGTCACCGCATCCTGCCCGAATTACCTTTTGACTCTCGTTTCCTCTTTGGCCATGTGTATTTCCTTCTTCGTGGGGACATGTTAGGATGTGGATCCTCTCCCATCACAGAACCCAGGCCTCAGGGAAGGACAACCCAGGCCTCACAAGGTTAGGGCTCTGCTGACCTTCACCACTTCCTGAGTTGCACCAGCGCTCGCTGAGCAGATGGTAGAGATCAAAGGTGGCTCTGGGGGCACCGTTCTGACAGCTACCGGGACAGGGTTTCTCAGGAGGCCTCTGTATAAAGTTGCTCCTCATGACTTGGTGAGGGTACCTGCCTGAAGAACCAAGGTGCCCCAGTGAAGTCGGGGAGCTAGAGGGGCCATGGCAGAGGTGCTAGGTAGCCAGGAGGATGTCTGCCGGCTCGGGCATTTTTACTTACCGTTACCCTCCTGTCTACACTAGTGGTTCAGTTAGTCCCAGGAGCTACTGTGACCAGACAACCATTTGCTGCCTGTTAGTTGGAGAGGAGGGAGCAGCAGTAAAAGTATCATACGCTGAAACTCAATTCTGTCCTTTGGAGCGCAGGTTTCAGGTGCCCTGGGCCAGCAGACCGTTCTTCAGTGATCAGGTCCTAAGAGGGAGGGGTTGGGAGATGAGAACATAAAGAAGACAGGAAATCTGAGGTCAAGAGGTCATGTGCAAGCCGATGGTTGATGCCAAGCAAGTTTATTAAGAGGTAGACCAGCTGGCCGGTGGAGGTGAACACCTTTAATCCCAGCACCCTGGAGGCAGAGGCAGGCGGATCTCTGAGTTCGAGGCCAGCCTGGTCTACAAAAGGAAGAAGGAGGGGGCTGGAGAGATGGCTTAAGTGGTTAAGAGCACTGACTGCTCTTCCAGAGTTCCTGAGTTCAATTCCCGGCAACCACATGGTGGCTCACAACCATCTGTAATGAGATCTGATGCCTTTTTCTGGTGTGTCTGAAGACAGCCACAGTGTAATCATATACATAAAATAAATAAATAAAGGAAAAACTATCATATGATGCGACTAAGCTGTGAGAAGCTAATCAATGTTGTGCCGGGGAAGATGGGATATCTCAAGGACATCAGAGACAGCACACAGCGGACCTTGCTACTGGTAACCATAGCTCCTTAAAGTGACAAGATCTGAGTCCCTAGGATGAAGCCGGAGCTCCCCAAGACCCCCAGACCACTGCCAGCCTTGATAAGCATATTCCAGGTTTTAGACAGGAGACTATGCTTTTTCTCCATACACCAGGGCTTCAGGGAAAGCCACAGACTGCCCTAACCCTCAACACTCATGATCTGGTCCAATTACATGAAGGAAACTGAGGCAGAGAGAACTAGACAGGCTTTGCTCTTTCAGAGTTCTGTGGTGCTGGTTTTGCTCAAGGCCCCAGAACTGGCCAGGTAGGTCTTTCTCTATGTTGATTCCCACAGAGACAGGAGCTGGCTGCCAAGAAGGGACTCAGTCCTAGACTCTTTTTAGCTCCTGGACCTTGGCCTTCATCCATCCACCTGCAAACTCAGGACACTGTCATTGCCTGGGGTCCTCTGAGGGACACAGTGGGCCCTCTCTGAGCTGGCTCTCTCCTACATCCTGGACAAGGAGCTGGAGGTGGCTACCCTGGCCACCACCCATTTCCTATGTTTTAAGGTCAGGAAAGTGTGATCTGTGGGTTAGTCTTGTAACCAAGGAACTCCAGTGTGTGTGTGTGTGTGTNNNTGTGTGTGTGTGTACATGTACATGCACATGTGTGCGCTTATATGGTTGTGTGCATAGGTATAATATTATACCCAGCCCTATATCCTGATGCTGCTTGGAGCTTCCGTTTCCCCACTTGGAGAACTAAGTTTGAATACTGACTTTCATGGCTGTTTGGAGGTTGGGGCCCTCTCCCAGAAGTGCCATGCTTGTGATCTGGAAGAGCTCTTCCCATTCACAACAACCGCAGCCACCTCAGAAAGGGAGCCGTTCCGGACGCTGACTGGATTTGCAGTACCAGCACACAGATCTCAGGGACGTGTGCCAGGGCCCCAGGTCAGCCAAGCCAGTTGGTGGACACGTATGTGTCACCCCTACCAGTGTGACAAAGAGCTCTTGGGTGAGGGCACAGAAGTAGGACCATGTACAGCTTCCTTAGCTTGTGCTGGGTGCCCTGGGACAGGAAAACACAGAAACATTCAGAGTTAGGATGGGCTCCAGTGGCCCAAAGTCCCCGACCCTGCCTTGCTAGATAGTCTGCAAAATTCAGAAGGTACTGATTTTCCTTAAGTAGGGAGGAGGAGTGGTCTTCATTTAAAACCTCTGGGCCCTTGATGAGCATGGACGGACATGGTGCGTATGCCTCTAATATCAGTGCTCCAGAGGCAGAGGCAAGCGGAGCTCAGTAAATTTGAGGCCAGCCTGGCCTACAGAGCAAGTTCCAGGACAGTGAGGGCTACACTTTTTGTCTCAAAAAGCCAAAATACAAAAAATAAAAATAAAAAACAATAAAAACTCTGGGCTCAGGAGGTTATCTTTCTGAGGTCACAGGCCACTTTTAGAAGGGTCAGAAATGGGGCTACATGGGGTCTGTACCCACAGGCTGGGGTGGCCCTAGACAGTGTCATACCTGCCACAGAGCCTCAGTGTGGATGTTGGGCTTCAGGAAGCAAAGATGGTGTTAGGGGCCACCAGCTGTGCCCAGTGCTCCGAGGCCACAACATGGCACTAAGAGCCATCCTCAAAGCAGTGGCCTGACAACGCTGCCACCATCTTCCTTCAGCATATTTGGTAGCTCAGCCTTCCCCTGTAGAGGAGCTGGTCAGGACGACATGGGGAAATATGTTTGATTTTGTTTCTGTCCACATGGCCCCTGGTGCTGGCAACTCTTCCTGCCTACCACAGTTTCTCATGTTTTAGGAAGTCGGACCCAGGGGCCACCCCACCCAGAACATTCTAGGCCTCTGTGGGAGGAGTCCTGGACACTCTGGCTACTTCTGGGGAAGGAGGGTGGCAGTAAGGATCTGGGAGAATCCATACTTGCCAGCTGTAAGGAAGGAAGTCACAACCCAGGCCTCTCAGCACGCCCAGCCCCAGCTGGCCCCCAGCCCCAACTTCCCACAATTTCAAGATCATCAATGCCATTGACTGTTAGCAAGGCAGGGTGCAGTGGTTATGGAAACATGCCAGCAGGTGGCCAGCAGTAGGGTAGGCAAGGCTTTGAGTGAACTCTGGGAAGCCTACTGTCCCCTGTCTGGGACAGGAACGCCAATATTGCCCCCAGCAGTAGCTCCTCCAGGGCAAAAATAAAATCAGTGCTTCAAAGAGTACCGAGATAACCAGAGACAGGCAGTCTCTGTGAGCCAGCTCAGTCCTGCCCACAAGAACTCCAAGGTCACGGCTCTGCCTGGCCCCAGTTCTGCTGTCCGGGTCAACCAGGTCTGTGGTCCAAGCTCACTATGGACTTTGGGCGTACAGATGCATAGCTCTGGGCAGTGTGGGCCGCTGCATCTGTGGGATGGAGATGAGTCTGCCTGTGTGACATGCATGTCTGTCTGTCTGTCTATATATCTATCTATGTATCTATCTATGTATCTATGTATCTATCTATCTATCTCTGTCTATCTATGTATCTATGTATCTATCTATCTCTGTCTGTCTATGTATCTATGTGTCTATCTATCTATGTATCTATGTATCTATCTATGTATCTATGTATCTCTGTATCTATCTATGTATCTATGTATTTATGATTCTATCTATGTATGTATCTATCTATCTATCTCTATTGCTAGCTAGCTCTATCTCTATATCTATCATATCTGTCTATATCTAGATATGTATCTCTGTATCTATCTATGTATCTATGTATTTATGTATCTATCTATCTATGTATCTATCTATCTCTATTGCTAGCTAGCTCTATCTCTATATCTATCATATCTGTCTATATCTATATATTTCTTTTTTTAAGATTTTTTTTTATTAGTATTAAGTACACTGCCAGCTGGTCTTCAGACACCAGAAGAGGGCATCAGGATCCCATTACAGATGGTTGGTGAGCCACCATGGTGGTTGCTGGGAATTGAACTCAGGGATCTCTGGAAGGCAGTCAGGTGCTCTTACCTCTGAGCCATCTCTCCAGCCCTATATATTTCTATATTTATCTACCTCTCTCTCTCCCTCTCTCCCCCTCCCCCTCCCCTCCCCCTCCCTCTCCCCCTTTCTCCTTCTCCCTTACCCTCTCCCTCTCTCTGAATGTGTAAGTGCATGCTTGTGGTATCCCCACAGAGGCTGACTGCCTGTTCTTCCAG
Seq C2 exon
GTACTTGACCACCTGAGCCAGCCCCCCCACATCCCTCCCTGAGGTAGCTGAGTGACATCTGTGCTGGCCCTCTCTGATCCTCGTACCCTGTGGCAGCAAGCCTGCAAGGAGGAACTCCTTGGGTGATCAGCCTGGAGTCATCTGGCCCTTCTCTCCACAGGACATGCTGGGCCCACACACACTGCTACTCATCCTAGCTGGACTACTCTTCCTGGGATCTG
VastDB Features
Vast-tools module Information
Secondary ID
ENSRNOG00000001224:ENSRNOT00000001639:1
Average complexity
IR
Mappability confidence:
NA
Protein Impact
5' UTR
No structure available
Features
Disorder rate (Iupred):
C1=NA A=NA C2=0.000
Domain overlap (PFAM):
C1:
NA
A:
NA
C2:
NO
Main Inclusion Isoform:
NA
Main Skipping Isoform:
NA
Other Inclusion Isoforms:
NA
Associated events
Conservation
Mouse
(mm9)
No conservation detected
Chicken
(galGal4)
No conservation detected
Chicken
(galGal3)
No conservation detected
Zebrafish
(danRer10)
No conservation detected
Fruitfly
(dm6)
No conservation detected
Primers PCR
Suggestions for RT-PCR validation
F:
No suggested primer sequences
R:
No suggested primer sequences
Band lengths:
Functional annotations
There are 0 annotated functions for this event
GENOMIC CONTEXT[edit]
INCLUSION PATTERN[edit]