RnoINT0077712 @ rn6
Intron Retention
Gene
ENSRNOG00000003841 | Kcnh1
Description
potassium voltage-gated channel subfamily H member 1 [Source:RGD Symbol;Acc:68398]
Coordinates
chr13:111159777-111228542:+
Coord C1 exon
chr13:111159777-111159973
Coord A exon
chr13:111159974-111227042
Coord C2 exon
chr13:111227043-111228542
Length
67069 bp
Sequences
Splice sites
5' ss Seq
AGGGTGAGC
5' ss Score
7.75
3' ss Seq
GCTGTCCTCTCTCCATCCAGATT
3' ss Score
10.64
Exon sequences
Seq C1 exon
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Seq A exon
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Seq C2 exon
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Vast-tools module Information
Secondary ID
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Protein Impact
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Features
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A:
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C2:
NO
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Other Inclusion Isoforms:
NA
Associated events
Conservation
Mouse
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Fruitfly
(dm6)
No conservation detected
Primers PCR
Suggestions for RT-PCR validation
F:
No suggested primer sequences
R:
No suggested primer sequences
Band lengths:
Functional annotations
There are 0 annotated functions for this event
GENOMIC CONTEXT[edit]
INCLUSION PATTERN[edit]