RnoINT0083287 @ rn6
Intron Retention
Gene
ENSRNOG00000027623 | LOC680039
Description
hypothetical protein LOC680039 [Source:RGD Symbol;Acc:1596848]
Coordinates
chr14:79295910-79306938:+
Coord C1 exon
chr14:79295910-79296044
Coord A exon
chr14:79296045-79306871
Coord C2 exon
chr14:79306872-79306938
Length
10827 bp
Sequences
Splice sites
5' ss Seq
GAAGTAAGT
5' ss Score
9.82
3' ss Seq
CTGTCTTCTGTCTCACACAGAGC
3' ss Score
10.45
Exon sequences
Seq C1 exon
GAGAATGACATCTTGGGCTGGGAGAAAGGAGCTTATAAGAAATGGGGAAGGAGTAAGAAAAAGTGTTCTGATCTAACGCTGGAAGAGATGAAAAAGCAGGCTGCTGTCCAGTGTCTGCGCTCTGCTTCTGATGAA
Seq A exon
GTAAGTTCCTGTTTTCTAATGCTTAGGGGAGTGCGGTATGCTTAGAAGTTTACACATGCAACAACTTGACAAAAAGAACCTAGAAATAAGCTACTCATCTTACCATAGAGAGGCTAACTTTTTTTTTTAATTTATGTATATGAGTACACTGTAGCTGTCTTCAGACACACCAGAAGAGGACATCAGATCCCATTACAGATGGTTGTGAGCCACCATGTGGTTGCTGGGAATTGAACTCTGGACCTCTGGGAGAGCAGTCAGTGCTCTTAATCGCTGAGCCATCTCCCCAGCCCTGAGGCTAACATTTTTACTTTATAAATTCTTTCATATCTTGAATTTTATTGTTTGTTTTTGTTCTTTTCATTTTGAGACAGGGTTCTACTCTGTATCCCTGGCTGGCCTGGAATTCAATGTGTAGTCCAAGCTGGCCTCAGGCTCACAGAGATCTTGCCTGCCTCTGCTTCCTGAGTGCTAAAATTAAAGGCATGCCCACCATGCATGGCCTTACATTTTGTCTTGTAAAATATATTTGTAGGCTGCTGGTGGTACACGCCTTTAATCTCAGCACTTGGGAAGTAGAGGCAGATGGAACTCTGAATTCAAGGCCAGCCTGGTCTACAGAATGGGTTCCAGGACAGCCTGGGCTACCTAGAGAAACCCTGTCTCAACAAAAAAAAAAAAGAAGAACAACAAAATCCAAATATATATAAATATTTTTGTATCTGGTCGTACAGTTAGTGAGGCAGCATTGTTTTACACTCAGGTCTTTGAATGTGCTCACTGAGAGCTCTGCTACAGAGCTGTATATCCCAGCTCTGTGTCTTTCAAGAAGAAAAACAAACCAACCAACCATTATGTCATCCTGTTGGATTTCATCAAATAATATTGCACTAGTATTGTCACACAAGTCACTGCTCGGTAGCTGACTTAGACCTGATTTTCACTGTGCTGTCTGGATCCTGTGTGTGGTGCCTTTGTTGTACATTTGCTTCTTTTGGATACATTCCTAGAAGTGGGCTAGAACTTCTTATGCCCTGAGTACCATATTTGTTTATAACTCAGATTTGTGTTTTGTTTTTGTTATTTTTAGAAAATGAGCTTAGTTTATTTTTAAAAGATCTTTATATAAAATACATTCTGCTAAATTTGCTCTAGAATGTGATTGTCTGTTTAAACAAATACTATCAATTCATATTTTGTCACCCACTCTTAAGATTAAATCTTTGAAATCTAAGTACTCAATGGTTTTGTGATGAGATGGTGCAGTTTAAATGCTGTCACAGTGGAAGGCTGAACTGAGAGGGCTCCAACCTCCACTCTCTTCCTAAACCAAGGTGTCCCACCTGTGCTGGGTTAATGCTGTGCCTGGCAGTTTGCTTCATCTGATGACCTGTGTAGTTTACTCATCTGGCTGTATCTGCTGCACGTGCCTTACTTGCTCCATGTTAGTCCTTGTCCTAGTCCCTGTCCTGTCCTCTTATGCCCATCTCCCACAGTGTTCTCAGACAATTCACAATTGTCTATAAAAACCTGCTTTCCTGCCTGGGTATCTGATTATTCCTGGATGTCAACCTGACTACATCTGGAATGAACTGTAGCCCAGAATTGGAGGGCACGCCTAGGATCCAGATCTTGAGGCTGGAAGACGCAAGTTTCTGACCATGGAGATCTGAGGCATAGTGGCCATGAAAAGCTTAGGCCCAGGCAAGGTAGTACAAGCCTTTAACCCCAGGAGACTAAGGCAGGGAGTTCAAGGTCAGCCTGGGACAAAACAAGTCCCAGATCCAGGCGTGGAGGTACACCTTTAATCTGGGACACACCTTTTTCTGGAGGCCTACATGAGGACATTGGAAAAAGGAAGATTTCCCTCTTCTCCTGCTTGCACTTACTTGCCAGCACATCTGTTGAAACCTACTTCTTCAGGATTCCGGCTAATAGGAAGAGCAGGTGAAACAGCTGGCCTAAAGGACTGAGCAACCACTAGATTCTTAGCTTCCCATTCACAGCTGCCCATTGTTGGGTTAGTTGGACTATAGACTGTAAGACTGTAAGTCATCACAATAAATTCCCTCAATCTAGAGAGACATTCCATAAGTTCTGTGACTCTAGAGAACCCTGACTAATACAGTGTCCTTCACATCACCCTGGTCACAACTGCTAACCCTCGATTTCCATTGTTAAGTTGACTGTGCTGTCTGGATGTTAGGATGGGGTTTCTGCTTTCTTCTCTCTAAGAACCCCTCCATAATGGGAATCCTTCCCAGCTCTTTCTCTCTTCCTCCCTTGGACTTTTAGAACTGTAAGCTGCCTGAAGTCAGATGCCACATCCTCTGGGGGCAGTGCTGTGGACAGTGCTGGTCTCTCTCTCTCCCCTGAAGTCAGGACACTGCAGAATCCAGTAGCCCTGGCTTTAGGGAGGAAGTGTTTGTTTTGGTTCAGGATTTGGGGATTACAGTATATCATGGTGGCAAAGGCATGGTGCGGAGCAGATTGTGGGGCCAGGAGAACTTGAGACTTGGTTTGTTAGCTTTTGGAGGATTAGGAGGCAAAAGTTTGGCCAGACTAGAAGTCTTCAAAAGCCTGCTCATTGGCTCCATGTTCCAAAGTCTGCATAACGTTGTTAAATGGCACTGCAAGCCGGGGGATGTCATCATACCCATGAGCCCCTGAGGTATCTTCCAGATCCAGACCATAATATATGGTTCCATCATAGCTACCTACCATTGCATTCAAAGCTAGAACATCCTTCATCTAGTTTTTTTTTTTTCTTTCTTTTTTTTTTCGGAGCTGGGGACCGAACCCAGGGCCTTGCGCTTCCTAGGCAAGCGCTCTACCACTGAGCTAAATCCCCAACTCCCCTTCATCTAATTTTTAAAAAAAATAGAATATCTATAGGGATGAGATACAGGAATATCTCACTGAAGCTGTGGGCTGGAAGGTGACCCTGAACTAAGAACTGTGAACAGCAGATAAAGCTATTGTCCCTGATAACCTAAAGCCTCCCACTGCCCTTTTCCCTACTTGGGGGCTGTGATGGTTTGTATATGTTCAGCCCAGGGAGTGGCACTCTTGTGGCCCTATTGGAATAAATATGTCACTGTGGGTGTGGGCTATAAGACCTGCACCCTAGCTGCCTGGGAATTAGTATTCCACTAGCAGCCTTCAGATGAACTCTCAGCTCTGCCTGCACCATGCCTGCCTGGACTCTGCCATGCTCCTGCCTTGATGATAATGAGCTGAATCTCTCAACCTGTAAGCCAGCCCCCCAATTAAATGTTGTTTGTCCTTATAAGAGTTGTCTTGGTCATGGTGTCTGTTCACAGTAGTAAAACCCCTACTGAGACAGGGGCTGTTCCACTCTTTGTGAATTCCAGTTCTGCCATAGCATACATGTGGTGAAAGTGGCCATTCTAGCTGCAGCTCATCCTAACTTCTGGAGTATTCAATGTGTGTGTGTCCATCCCTATTGTGAGGAAGTGTGGTAGATAGACAGCAGAGAAAGATGGTGTGATTAGACAGTCACAGGTGTGGATTGATAAAGTGACAAGAGTGTGAACTCACTGTCTGGGTACTATTTTCACATTATTAGAGGCAAGACAACAACCATTCCAGCAGAGAACACTCATTGCTGTGGTGTTGTTCCAGCCAACACTGTCAGGGAGCCTGGCCTTCTTTTCCTGGGTGCACAGTTGGAACTGATATATGGATGGTCTAAGTGTCTTTAGTTTTCTTCTGAGAACCTCTGAAGTATTGGAGGGTTTGGAGAACAGGATAATAGAGCATGGCTTAAATGCTTGTAGCTTCTGGCTCGGACTGGACAGTGACCTGACTACTGGGCAAAGTGCAGACGGGGTACACCTGGGGAGGAGTGTGGGCGGGGTCGTGGATGGTTGGAGACATCGCATACCTTGAGGCCGTCTGAGAAAACAAAGCACAGCAGCAGCTGTCGTAGTGGCCCTGTGGCAGAGGACCCGGTTGGGCCCTGCACTGAAGACAGAGCTGGCCAGAATGTATGAGGGTAAAAAGGGAAAACAGTCCAGGAAGAAGACAAAAGGTCTGTGGTCTGAGTATTGCAGGGATGGAGTTTCCTGTGTCCGGGGAAAGGAGCCACAGGAAGGCACCCATCTGGTGGAGGAGTGTAGGCACCTCCTGGGAACCCGAGGGCAGGCGGCTGCACTTGCAGGTTCACTTGGCTGAGCGGCTCAGATAGTGGAATGCTTGCTTTCATGCTGCATATGGAACCTGGAGCTTCTCCCTCCAGGAAAGGTGAAAAATTGAGGTTTTTGCAGAAATTTCTGATCTCAAATATTAAAAAGCTGGGACCTGAGGAAAGAAAGTGGGAGCTGTGGTTCTAAAACCCTGAAAGTTCAGTAGCGAAGGACATGGAACGGGTCTGTGCAGGGAGCAGGGTGAGGGGCAGTTCCACAGCACTTACAGAGCTGGAGCCCCTTGCCCTCTCTCCTTTCCACGCTTACCTTCCTCACTTAGGATTACATGTTCTTCAGTCTCTTGTAAATGGCAGCAGACTACTTGTTTGCAACTGTTTTTCAACTTTAAGTTTTTGTTTATAGTCAGTCTTTTTTTTATTCTTAAAGAGTTATTAGTAATTAATAGCTTTGAGATATTCTCTTACTAATTGTGATGGTTTGCATATGCTTGGCCCAGGGAGTGGCACTGTTAGGAGGTGTGGCCCTGCTGGAGTAGGTGTGTCACTGTGGGTGTGGGCTTTAAGACCTTCATCCTAGCTGCCTGGAAGCCAGTCTTCTAGCAGCCTTCAGATGAAAATGTAGAACTCTCAGCTCCTCCTGCACCATGCCTGCCTGGACGCTGCCATGCTCCTGCCTTGATGATAATGGACTGAACCTCTGAACCTGTAAGCCAGCCCCAATTAAATGTTGTCCTTGTAACAGACACCTTGGCCATGGTGTCTGTTCACAGTAGTAAAACTCTAAGACATTATTGAATTTTTCAACCTTTCCTATCACTGTGTTCCTCTCTTCACATATATTCTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTATGTATGTATGTATGTTGTTAAGATAATATCTTAATATATAGCTAGGTCTGGCTGTCCTGGAACTCACGGAAGCCCATCTGTTTTTGTCTCAGAAGTGCTGGGATTGAAGGTATGTTCCACACGCTAATAGGCTCTTGTATATTCTTTGCAGTACCTTTTCTAGTCTGTGCTGAACCATTAGCTAGACTGAAGTCTTAGACTCTGGTATTGACAAACTATGAACATGGCCAGGTGGAAATGTAAACTTTCTCTGTACAACAATTATCATTCATATTAGTGACCTTCCCTAGTCATACTTCATAAATGAAAATGTCTCCTCCAGCCAGGCATGGTGGGTCATATCTGTAACCACAGCATTTGATATGCTGGGACTGGAGGCTGGTAAGTCTAAGGTCAGCCTGGACTACACAGTAAGATCTGCCTCAAAAATAAATTAATTGGAGGTTGGAGATTTAGCTCAATGGTAGAGTTCCTGCCTAGCAAGCACAAGGCCCTGGGTTCAGTCCTCAGCTCCGGAAAAAAAAATTAATTAGTAAATAAGCAAGGTTTATGGTTTTTGTTTTGTTTTTTAGAAAATATCTCATTTTCTAGACCAGAATGCCCTCAAACTGGGCATCCTCTTATGCCATCTTGGTGGCTGGCATCTCAAACCTATGTCACTATGCTTGGCTGATGGCATTATTTTATCATCACTTTAGCAGATGTTGGTAACTTTTTAAGGATGTAGGGAAGGCAGTGCTGACCTGGGACCTGAGGCCCACATGCCTAGGCAGGTATTCCACACTAAGCTGTGTGCTTCCCCAGATCGAACCTCTCCTCTTGACGTGTGCACCACCCAGCAGTGTGCAGTCCTCCCTGCGTATGGCACCCGCTCACTCAGCAGATGCCTCTCCTACTCTGTATTAAAGCGCAGATGATGTTAGGAGCAGGAAGCACTCTGGAGGTCCTCCTGTGTTCATGATGGGACTATCAGTCCTCAATGGGGCCTTAGAGCAAAGAGACTTTCAGTTTGGATTTTAAATTCTTGTTCTGCTTCTTGGCGCTGAAGGCAAGAGTCTGTGAGTTGGCTCTGTGTGCTCCATCTTCTCAGTCGGTAGTCTTCTGTTTACTAGCTTAGCACTGACAGTTCCAAATTTTGTAAGGGTTTTCAAACCTTCAGCAATAAAAGTCTGAAGCTGGTCCTTGGCTCACTTGTGTGCTGTCACTAGTAGCCATTCTTCCTCCACCTTGCCTTGCTTTCTTTTCATTCCCCTTCCAGCTCTGCTGTAGAAATTACAGATGCTAATCCATAAAACTAGAAGAGCCCTGTGTAGTGTGGGACTAAAATGACTGTATTTGATTTCAACTCTGTAGGTTAGTAGTTTTGCTGATCTTGTTTGTGGTGTCATGCAGCTACAACAGGGTAGGACTGGTTCCTGTCCTCATAGGACTGGAGCTTTAGCAGGCGTGGGCTCTGGAGCGAGGAGTAGGTATTCTACAAGTACATGTGCCCCCATTACTAGTGTATTTTCATCAGGGCGTTGGAGAGCTAAGGAGCAAGTGCTGCCCAACATGATTCACTTATAGTACTGGAGTAAGGGACTATCCTCCAGCACTCATGTTCTGGAGAAACTGAACAGGCTGGACTGTGAGATATTGGGCTCCATTGAGAGAAAGCATGAGACTCTCTGCCCCTTGTTGGTGCCTGCTGACCAGATACTGAAGGGTGATCCAGCAGCAGAAAAACAGAGCAAATAAAAGACACAGTGATCTCTTACATTCTAAGCATGATAGTAAATATGAAACAAACTTAATGAAAGGCTTAGAGTATGCAACTGCAGCACTAAGGACAGAGGAACAGAGATGAGGGACCAACCAGCACAGGAAGTCCAATAATCAGCTACTACAATTAGTTTCCAGATGTGGAAACCTAGGCTGGGGTAGTGGCTTATGTGGGGCCATGTAGTTTACCATAGCTTTAGACCCCAAATCTCTTAGTTATCTCTTTGTGCCATGTTCAGGTGTAAATTAAGACTGTGCTTTCGGGCTGGAGAGATGGCTCAGCGGTTAAGAGCACCCGACTGCTCTTCCAGAGGTCATGAGTTCAATTCCCAGCAACCACATGGTGGCTCACAACCATCTGTAAAGAGATCTGATGCCCTCTTCTGGTGTATCTGAAGACAGCTACAGTGTACTTATATATAATAAATAAATAAATCTTTAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGACTGTGCTTTCAGCCTGGCAGTGGTGGTGTCCACCTTTAATCCCAGCACTTGGGACGCAGAGGCAAGCAGATCTCAATTTGAGGCCAGCCTGGACTACAGATTGAGTTCCAGGATAGCCCAGGCTACATAGAGAAAATACTGTCTCGAAAAATGAAGCAAAACAAAAAAGAATGTGCTTTCAGACTGGGTGCTCTCCAGTACGGCTTAGAGTTACCCATCTCATACTTGGAGACTATCCAGTAAAATGAGTTCTCCATGAAAGAACAACTTAAGATGTTTAATGCAACATGAAGTCTTTGGGTATTGAGAAGGCAGACAATAAGGAGACCAGGCCAGTGATCTCTTTCTGACACAGCTTTAAATTGAGAAACACAGGAAACCTGGAGAGAGTTGGGAGATGTCTGAGAATTCTGAGGAGTAAGAAGAAAGGAATAAAGGAAAAACTCCTAGAAATAGAAGTTATGGCAGCTGTAAGCCATGATCAGACTCAGTTTACATCATCAAGTAACAGGCCAACCTTGTCATACAGCCACCCACAGAGAAGGCCAAAGAGGCCACAGAGAGCAGTCCCCAGGTCCTTTGTCTGCTAGAGGCAGTCTTGGTGTTGAGCAGGCTAACACTGAGTGAGAGTGCTCCAACTTAGCCTTTCAGGTCTGGCTCCAAATCCAGGTCCTCAGACACTGAGGGCAGTTTTGAAGGAGTGAACATACAAAATTTAGAAATGACACTGGTCTTAAGTGACCTGGGTGACAATAAGCTCTGTCTGACAGGTGCATTATCTGTGTGAGCTAGGTGAGCTTTGGGAGAGAACTGGAGAAATAGGCATGTCAATGTGTGTGGCAGGGCAGGAATTCAGGGTCAGGTGTGGAGATTCCAAACCAAATTCCTACCACCTAACTCTGTTCACAGAGAAGAGACAGTACCGTGTGACTTCCAGGAGGACAGGTCCTTGTTTTCCACGTGACCTGCCTGGCATGTGGTCTCTCTGTACAGCTTGTACACTGGGTAGGAGTTGATGGTTGTCGAGTGAGTGTCGAGCCTTGCTTGCAGGGGCTGCCTTCTAAGTAGCTCCTGGAACATGCCCATCCTGCTCATGGCTCCACTGCGCATGTTACAGTGCTCTTGCTCCATAGAGCACTTCCCAAATGTTTGACATTTGATGATTGAGTTTGGTCACAGTGAGGAGAGGCCAGGCAGGGTACCTCAGCAGAGCCACAGGATCTTGTCTCCACAGGTGCTCCTGTGGGGTTTCCAGAACATAGGTACACATGAACCTTTGCTCCTCCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGGTTCTTTTTTTGGAGCTGGGGACCGAACCCAGGGCCTTGCGCTTCCTAGGTAAGCCTCTACCACTGAGCTAAATCCCCAGCCCCCCTTTGCTCCTCCTTAAGACGCTTTTAGATGAGTATTTTCCAGCAGTCCTATGGATATGATAGGCTACCACAATATAATTACTAAGATTTTTAATATCATTGTATCATAGGTAGAAATGGAAATGAAATTTCTTAGTAACAGTTTTAAATGAACTCTTTGGAACTTGCCCAGCATACGATAGTACCATGGATGACTTTGTACTTCTCAGTTTGCTATTAGGATACCATGGTGACCTAATGATTATTAGAAATAATAAGGAGAGTAGGTTCAGTCTCTAGTACTGCTTTTAAAAATGTTCATGGTTTTGGTGGTATGTATCTCTGTATATATGTGTGCATTCACATGTTTAGGTAAAAAAAAACACATTAACTAAGGAAAGAAACCAGAAACCTGGCCTGTAAAGCTTGCTTTATACACAGGAAGGAGTAAGGCACTGTTTCTTATACTGCTTATATTTGAAAACAGGTATTTTTATATATAAAGATATATACTCTGTCTATGAATGAATGATAGTATACTATGGATTGTTTGTCTATATATATTGCTTTCATGTGTAACTAATTGTGTGTCTATAGTTTATAGTAACTAAAAGATAATGTGAGTGTTCTGCTCACAGGTTGTCATGGTCATTCTGCAGGCCTGGTAGCCTATTTTAGAGGTTGAATGGAGTTTGGTAAGCAGTCCCCAGAGGTTCCATGTTCTGCACTGGAGATAGCCCCAGGTTTGCAAGGAGTGACATAGGCTTGCTGTACAGGACAGTATGCGGCGTGTCAGCTGACACCGTGTTAGTTTCAGTATCCTGGAGAAAGGGACTATACTTGCGGGCCTCATCACACCTTGACCATGATGGTAAGCAGTCCTTAGTGATGAGATTGTGTAGTCTTCCACTGTTGAACGTATTGTCTGCCTGCTTTTTAGAGCTGTAAGTAAGAGGCAGCTGTCCTCTGACCTATTTTCTCTTCCTCCTCTTAAAGACTGGGATATTCTGCAGATAGAAAGTAACTGTGGGTATTTACAGTTCACCTTCCTAACTGAAATCTGTTTCTTGAAGCCAAAACCCTGTAAAGGGGGCTTTTTTTTTTTTTTTAAAGAATATCTGCTATACTTTGCTGAGTCATTTTGAGTTCGGCAAATGGATAAAGTTTATTTTTAGCCGTTGGAAGCGCAGAGCAGAGGCACAGGAACTTGGGTGGCACTTCTGTGTGCATCTGGCCAGCTGTGTCCTTTCAAAGAGACAAAATCCAACTCAGATATAGCTTGTCCCTGAGTAAATTCAAAGTTTCTAAGGAACAGTGTAACTCTTCTGTCTATTGTATAATAGTTTTCTACTTTCTTTTAAAAAAATGAGGATTTAGAATGAGTGAAAGATATGTACTTGTGCTATTTCCAGTGTACATTTTCTTTGAAACTTAACTCATTTTATCCTTAGTACCAGATCCTTTCATGCCCTCTTGGTATGCACATGCCTGTGGACTGTATTCTTTCCTAGTACACTTGTTGGTCTTGGGCATTGAACTCTGATTGTCTGCTTGGTGGCCAGTGTCTTTACCACCAGCTGAACCACCTCATTGGCCCCTTGCGTTTCTTTATAGAAGTGTGGTTGTGTCTGTCTCTTAAAATAACCTACAGCGTCCATGTGTGCTTTCAGCATTGACCTGTTATCTATGGCTCTTTCTGTTGGAGTTGTGAGAGTTCTCATTAGAAGACAAGGAAGGGAAGGGAGGAGCACCTGCTTTGTTTTCTTTAGGCTGTAATCTTCAAGAGGACTAAGGTTCTGTAACCCCTGTGTCAATTTGTATAAAACCATGATTATAAAGAATCTTGAGGTTGTTTTGGGGTGACTAACTTTTGACTGATGATGGACACTTAGATCTTGGACTGCTTTATTGAGCAAGACAGAAGCCTCTCTTGGAGACACATTCACATTGCCACAATTTATCAGTAAGTCCCACTTAGTGTCCTTCATTAGTAAGATGCTTACGCTAGGTTGGCTTTACATGTTTTTAAGTTTGACTGTTTTTAAACTTTGGGATTCATTTAAGAATTGATAATGTATTCCTTTAAGACCCGTGGTCGTCAGTAGTGACATAAAATACTGTCTCCTGCACCTGGCAGTAAGCTGACTGTCTTCTGTCTCACACAG
Seq C2 exon
AGCTCTGGAATCGAGACTTTAGTAGAGGAGCTCTGCTGCAGACTGAAAGACCTACAGAGTGAGCAAG
VastDB Features
Vast-tools module Information
Secondary ID
ENSRNOG00000027623:ENSRNOT00000029191:3
Average complexity
IR
Mappability confidence:
NA
Protein Impact
ORF disruption upon sequence inclusion
No structure available
Features
Disorder rate (Iupred):
C1=0.000 A=NA C2=0.000
Domain overlap (PFAM):
C1:
PF153761=DUF4603=FE(3.5=100),PF144001=Transglut_i_TM=FE(47.8=100)
A:
NA
C2:
PF153761=DUF4603=FE(1.8=100),PF144001=Transglut_i_TM=FE(23.9=100)
Main Inclusion Isoform:
NA
Other Inclusion Isoforms:
NA
Other Skipping Isoforms:
NA
Associated events
Conservation
Fruitfly
(dm6)
No conservation detected
Primers PCR
Suggestions for RT-PCR validation
F:
No suggested primer sequences
R:
No suggested primer sequences
Band lengths:
Functional annotations
There are 0 annotated functions for this event
GENOMIC CONTEXT[edit]
INCLUSION PATTERN[edit]