Special

RnoINT0147559 @ rn6

Intron Retention

Gene
Description
transport and golgi organization 2 homolog [Source:RGD Symbol;Acc:1310348]
Coordinates
chr11:86797561-86815806:+
Coord C1 exon
chr11:86797561-86797653
Coord A exon
chr11:86797654-86815712
Coord C2 exon
chr11:86815713-86815806
Length
18059 bp
Sequences
Splice sites
5' ss Seq
CAGGTTGGT
5' ss Score
8.08
3' ss Seq
TTGTTCTCCTTTTCCCACAGACC
3' ss Score
12.63
Exon sequences
Seq C1 exon
GTGAGCGGCGGGTGGCTGGGGCTAGCAGTCTGCGCTCCTGGCGGGGCTGACCCACGGTCGGGCTCCGGGCTCTTGGAACGCGGTCTGGACCAG
Seq A exon
GTTGGTCGAGGTCGAGGCGGTTCTCACCTTCTCGTCCTAACTCAGTTTTCCCTTTCCAAGGCTCGGGACTCTAGTCCGACAGACCAGCCTGTCTCTGACAATTGAAAGCAACCCACACGGTACTGGAAGATGTTTCTGCTTATCCCTGTCAGGATTGGGTGCAGGGAGGGGGTCACGACAGCATGGGCAGACTTGCTGTGTAAGAGGCTAGATTGACGGGACAGAGCCGCATGGTTGTTGCAGGGTGGAGGGATGCAGTCTCCAGCGTCAGGGATTAGTCTGGAGCCTAGTCATGTCACCACTCTCACTCCGAAACCTCTTATGCTGCGGCCTCAGGCTTCACAGTATGTCAGAGTAAACAGCAAGTGCTGGGTCATTCCTATGACTGATATGGGGTTTACTGGGCTGGCGTGGTGAGTCCTTGCTCAGAACGGGAGGAGGACATTGCGTGGAGGCAGCATCCAGGCCAGGCCTGGCCCTACTCTAGGCCCATTGGAAGCGGAGGTTTTGCTTGTTTTCCTCTTGGACAGTGGGCAAGGAGGACCTGGTGTTGAGACCCCATCCATCGACCCTCAGCGTCGTCCCTGTATTTCATTCTGCCTGATAGGTCACATCTTTAGAGTTAACCTTATGCCCTTGCACAAGTCCCTGATCCTCACTGACCCCTCCCACCCCCGCCCCAGTGCCCTTCCCCCAGTGAAGCGTCTTGTTCAGCAGACCTGTCTGCTGCCTGGGCCTGCTGACCACTGATTTGCCACTACTAGGCCCAGCCATCTTCTATGGGGTAGATGTGACAGCTTTAAGGGTCAGGTGAATGACTCCTTATCTAGACAACTTTTTAAGGAAGTAGTCATTGGTCCAACCTTGAAGATAGAAAACTCTAGCTAAGGAGTCAAGTGTTCCCAAGGCTGCTCCAGGCCAGGGTGGTTGGCTTCCAGGCTTCTGCTCCCCCCACCCCAACCCCAGACCTCCTGGATCATGTGATCTGCTGCAGAGGGTGACTGTTCCCAGATAAAACAGAGACTCTGCCCCTCCACCAGATTCCTGGTGTTGCTACAGGGATGTGGGGTGCTGTGGTGCTCACATATGCCACCTCTTCAGGTTCCCTCACTGTGGTCCCCAACCTCACTTTCATTTATTTTCTTAAGTTTTGAGGGGCACGTGGCAAAGACACAGTTCCCAGCCGTCACCCTCAGCAGCCTGAGAATGTCCCCTAGTTTTAAGGACCTAACCTCAGATCACACCAGGGTTTGATGGTGAAAAGAACTCCGGGCTAGCCAGTTTATGAGCAGAGTTGGAGACTGTGTTAAAGATAATTTCCATAGAGGCTTAAGTATGAAGATCAGGTGCAAAAGAGGTGCTCAGAAAAAGTAAAACACGCCCCAGAGCTTAGGCTCGGAACCTCTCCGAAGCAGCTCTTTGAGTGAGGTCTAGAAGTTCTGTCTTATCACTTGCATGGGTTTCCGTGGCTCCTAAGTAGGTTGTAAGTCAAAAGTTAAGCCCTCAGGGGATAGAGGAAGGTAGGATATCTGCTGTAAACAGTTTTGTTTGAGGTTTTCTGACTTTGTCTGGGTAAAGAGATAAAGCCATACCCAAGGTCAGATGCATTTTTTCATGCCTTAAGCGTGAGTCATTGCTATCTTAACATAATCTATCTGTAAATGAGGTGGGGCCTGGAGGCTCACTTTTAATTCCAGCACTTGGGGTGCAGAGGCAGGCAGGACTCTGTGAGCTTAGTCGGGGCCACACAGTGAAAACCTGTCTATAAGTAAATGAATGAATGAATGAATGAATGAATGAGAGCATCTGTATATGAGAAGCATGGTAAGTACCAGCAGCCAGCAGTGTTCGCTGTGCTGGACTGTTTGCTTTTCAGTTGGCAAAGGCATTGACCGAGGTCCAGGATGAGGTCCTGCTCTGGTTTCACATCGCTTCACCATTGGGCTGTGTCTCTCCACTCTGCCTCACCTAGATGCAGGCCTCAGTCTGATCACCTTCTTGCTCTCATGTGTGGTACCCATAGCCTTTCCTTGGATGTGGGTGACCACCTGTACAAAGTGCAGGATGGGAAGGCTTGGAAGAGCTTCAGGATCAGCCAAGCTTGTTGCTGACACTCTGTGGGGAAGAACCAGAGTCCATCTTTTGGTGAAAAGATACTGTTATAAGTATTATAAGTATTATAAGTCAGCTTATAACAGTAGTGACTGTGAGTCTGGCATACATTGGTTCAGACCACAGAACTGGCTTGGTAAAGGGCTCCAGACAACAAGGTCACCTCAAACCTAGTTGATTTTTGAGATAACCTATACGACTTCCACCTCTTCTCACCTCAACTATTCATTGTTCCTTGTGGCAGGGTTTACAATGTAGTCTTGACTAGCCTGGAACTTGCTATGTTGCCCAGGCTGGCCTTGAACTCACAGGAGTCTTATTTCTCAGCCTGGGGGGGGGGGCTGTCAACTTTATTGTGTGTGTTTGTGCGTGTTCGTGTGCGTGTGCGTGTGTGCATGTGCATGCCTTGCTATGTCATCCAGGCTGACATGTGAATCAGCTATCCTCCTGTCTCTGCCTCCTAGGTGTGAGGATCACAGGTATTCGTGCTATACCCTGCTTTCTTTTGAGATTTCAAAAACCATATATACAAACTTAAAAACTCCATGTCCCAGCACCTACTCCCATGGTACACTGCTGACACTTGTGCCTACTGGCAAGGTGTCTCAGTGCTTGTCTCTATCCCCTCTGGGGAAGCTGTGAGCTAGAGATGGCTCTGTAGTTAAGAGCACTCGTTCTGGGGCTGGGGATTTAGCTCAGTGGTAGAGCGCTTACCTAGGAAGCACAAGGCCCTGGGTTCAGTCCCCAGCTCCAAAAAAAGGAACCAAAAAAAAAAAAAAAGAGCACTCGTTCTTGTACAGACTCTGGGTTTGGCTCCTAGCACCCAGATAGCAGCTTACAGCTCCAGTTCCAGGAAACCTGACATCCCCTTTGACCTCTGCAGGTGCCAGGCATGCACACGGGACGCAGAGACATACATGTAAGCTAAGTACTCATATGCAGAGATTAATTTTTTTTTTTTAAAGAAGAGGGCAGGGCTTGGGGATTTAGCTCAGTGGTAGAGCGCTTGCCTAGGAACCGCAAAGCCCTGGGTTCGGTCCCCAGCTCCGAAAAAAAAAAAACCCAAAAAAAATAAAATAAAAATAAAAATAAAAGAAGAGGGCATCAGATCCCATTACGAATGGTTGCAAACCATCGTATGGTTGCTGGGATTTGAGCTCAGGACCTCTGGAAGAGCAGTTTTAACCAGCGAGCCATTTCTCTCCAGCCCCCTTCTTTCTTTCTTTCTTTCTTTCTTTCTTTCTTTCTTTCTTTCTGGTTCTTTTTTTTTCGGAGCTGGGGACCGAACCCAGGGCCTTGTGCTTCCTAGGCAAGCGCTCTACCACTGAGCTAAATCCCCAACCCCTATTTTTTTTTTTTTAAAGAAAAATGTCATATTTTGTCTGGGCATGCTGGCACACCTTTAATCCCTGTACCTGGAAAACAGGTGGTCAGATCTCTTAAGAATTTGAGGCCAGCCTGGTCTATGTAGTGAGTTATCAGCCAGGGCTCCTGTTTCCAAAAAAAAGAAACAAACAAAAACAAACTAAACAATATCCTATTTATGTATTTATTATTTAATGCAAATGAGGTGATAGGAACCACCTGAAGGCCAGGCCTGTCCCTCCTGTGGGAGGCAAGGAAAAGACTGGCTGCCCTGCATCCACAGCTTTCTGCCAAACCCATAGTACGTTTGCTCTGTGCTGTTCCTTTGAACTGTGAGAAGACAATGACACCCTGATGTGAGGTGGAATTAACGTCTTGAGAATATTGGGGAGATCTGAGGAGAAGGTATGGCAGGAGACAGTTTGTCACGGTGGACTGCTGTGTAATAGCTGGGTTGAGCAGCACTGGCTTACAGAGCTCTGGCTGCCAAGATGGGAGGGGATGAGGAGGCTGCAGCTGATTGGTCGATTTCTCAGCCAAGGTCTCAGGAATGGCGACACTGTGTTCCATGTGTTTACCTCTTCTGCTGGCAGCTCCCTGGAGCCCAGATCACAGCCCATCACATCACAAGTTTCTGTCTGTCTTGTCCAGTCCAGAAGAACAGCTTCACCCCCAGTGATTTGACTGCGGGACCTAGTCACTGACCATCTTTTTCACACTGATGTTTCACTCCTTGTCGTTAAAATTGTCAGCTGTTGTCAGGCGGTCCTCATGCTCTGCCCTGCACCCCCCATGTTCTGTGCTAGGACATCGGCTCATTCTTACTTTCTGTCTCTTTGCATATATCAGCATGGGAAGAGAACAAGATGTATGAGCTTCCTTCTAGGTCTCTTTGGAGGTAGGCAGGTTTCTTCTTTGTCTTGAAACATGCCAACTGCAGGTATACAGGTTTTCAGCCTCTCACTTGATGGATTCTACCAGGAAGCCCATCCATTCACAGGCAGAGGCAGAAGCCATTGTTGGCACCCAGCATCTGCTTCTTGTCCCTGAGACCAGACGGTTCTGTCTGCCTTCTGATTCCATGGACAGATCTTGCTTATATGTAGTGTGTAATGGCTATTCCTGGTTGTCAACCTGACTATATCTGGAATGAACTTCAATCCAGAATTGGAGGGCTCACCTAGGATCCAGATCTTGAGGCTGGAAGACACAAGTTTCTGACCTGGATCTTAGCATGGAGATCTTGAGGCATAGTGGCCATGGAAAGCTTAGGCCCAGGCAAGGTAGCATACACCTTTAACTCCAGGAGACTGAAGCAAGGAGATCTCTGAGTTCAAGGTCAGCCTGGGACAAAACAAGTCCCAGATCCAGGTATGGTGGTGCAGACCTTTAATCTGAGTCATACCTTCTGCTGGAGACGTGTATAAGGACATTGGAAGAAGGAAGATTTACACTTCTTCACCTGCTTGCACTTATGTGCCAGCACATCTGTTGGAACCTACTTCTACAGGAGACCAGCTGACACAACTAGTCTCGTGGCACTGAGCAACTACTAGGTTCTTGGACTTCCCATTCACAGCTGCCCATTGTTGGGGTAGCTGGACTACAGACTGTAAGTCATCACAACAAATTCCCTTAATATAGAGAGACATTCCATAAGATCTATGACTATAGAGAACCCTGACTAATACATGAGACACTACAAAAGGTAATGATGTTTGCTCTCCTGGCTGCTACCTACCTGATGCTACTTCAGGGGCTTGTTGTTATTTGCCGTTGTGTGCTGCTCCAGGGCTGGGGCAGCACCATTGGAAGGATGCAATTTGGCTTTGAGCTATGAGGGCATCAGGTATAAGTATTCAAGTGCTTGTAAACCACTGGAGGCATGTATGAAACTGTGGGCTGCATCCCCAGCACCACATGAACATAAGGCGTTAACCAGGTTCAGTTCCCAGCACCTACATGATAGCTCGCAGCTATCTGTAGACATGCATGATGTACACAGACACATATGCAGACACTTATACACACAAAATAAATAAATTAAAAAACTAAAGACCTAAATTAATAGTGAAAAGCAGTAAGAGAAGGTTTATCCATTGTGGCCACACTGGGAAGGACAGATTGAATAACATGCCCACCCACCCCCCCATGCTTACCCATAAGGCCTGTTTAGTCAGGTGCTCTGAGATAGATGTCGGGTGATCGTGTCCTCTAAAGCAATGGCAGGGGAGGCTGCAATATTATGGAGGTGTCCTTGTGTTTGTAGTCTTTAGAGAAGGACCTCTGAACTTAGCAGATCAGTGAAGGCATAAGGTCATAATTTAGAAAACTAATCCTAGTGTTCGCTAGCCTCGTGGGCTACATGCCCATGGCTTAACAGTTTTGGGAAGGTGCTGGATAGCCTGTAAAACCCGGCCGATCCCCTCCCCAGGGGCAGCTTCTCAGGTCTAACATTTGCTGCAGGGTCCCTAACAATGAGGGTACAGTTTAAATAGAAGGAAGTGTCACTAAGCAGTTCTGCAAGGACACTTGGTCTTTCCTGTGAGGTCATCCGACACGGTGACTGTTTCTCTAGGTTGTCCCTGGACTTTAGCCTTTTCTCCCAGCTGGAGATCCCTGGGAGAATTCAGTTCCTCAGGTGCCTTGTTTTTGACGGTTGAGAGAGTCAGACTCGGGGCACAAATGTTTAATTAATTAATGTGTCCTCATTTCTCCCAGACAGGCCAGTTATGGTGCAGCATTGATGATACAGCTAAGCTTCTAGAAGATAACACGTTTTGTTTTGGTTTTTTTTTTTTTTTTGAGTTAAGATCTGTATTCCAGGATGGCCTTAAACTGAAGAATGGCTGAAGATAACCTTGAACTTCTGATCTTCCTGTCTATGTCCTAAGTGACAGAGCTCTATATATGCACTGCCATGCTAGTACGGAACAACAACTCTGTTATTTTAGTTTTTCAGTGCCAAAGCAGCCTGACTTTATAAACAAAACATTTCATTCTTTCTTTCCTTTTTTCCCCCTTTCTTTGTTCCTTTTTTTTCTTATAGATTTTTGGTATTGAACATACACAAGGTGTGGTGCCCACACTGGCAAACCTCTGTCTTCCACTGCCAGAAGATGGCAGTGTCAGGAGCATTCAGCTCTTGTAATAACTTGCTCGTTCTAAAGCCCACAGGCCCCCCTTAGTCCTTTCCAAGGCCAGCACAGTCATTTACCTGCCTCTAGACCTACATCCTTTTTTTTTCTTTTATTTTTATATGTATGGGTGTTTTGTCTGCATGTATGTCCGTGTGCCACATGCATGTACGTGCTCTCAAACACTAGACACCCCTGTTGCATACAGTCTGAGCTGCCATGTGAGTCCCGGGACTCAAAAACCCAGGTCCTCTGGAAGACCAGCCAGTGCCTTTAACCACTGAGCCATCTCTCCAGCCCCCAGACCCAAACTTTTAGCAGTCCCAGGACCTCTCATCATCATTGCCCCGTGGGCATCTATGAATAGCCAGGAAAGAAACCAGCTCTCCAGACACTGGAGCAGAAACTGGGGTGAAGGTTAAGTGCTGCACCATTGGAGCCTGGGGTTGCTGCCAGGCCCGAGGGTTTGGGAGTGCTAACATAGGACTGGCTGGATGGCACAGATGCTCTTCTGCTTGCATCATTCAGACAGACAAGGCTGGTCGCACTTTGGGCTCGGAAGGGACTTATTTAAAAAGACAAGAGATACAAAACACACACAGTAAAGGTGGGGAATTTTAGCCAGGTGTGGCATATTCCTGTGATCTCAAGACTCAAGAGGTAAACGCAGGAGGAAAAGGAGTCCCAAATCAGTCTTGGCTATATAGTGAGTTCAAAGCTATTGCAGCCTAAAATTCAGGTCATGGTAAGGAGCTGACATGAGACCAGCCTTGTAATAGAGCAGGAGATGGGGAGGCTGTGTAGCCAAGGACAGCTCAGAGAAAGTTAGGGTTGGAAGTCTTGACTGTCACAGGACACTGAGACCTTCCTTTGTCATCTCGTCTGCATAGAAGGACCTTGGCTGTTCTCAGACATGGACAGAGCTGTATAGTGTAGATATTTATCCATTCATTGTGTATTGACCAGCCCCCTGTATGTCCTAGCAAGTAGGACATACTTCAGAGTATACACCAGGACCCTGGTCAGGGAGGAATTCCATGAAGGCTGTGGGGCAGGGTGGGGATTATGTGCCCTTTACAGATTGGAGAATCTTTGACCACTTTTCCTCCAGGATTTGCTTAGGCATTCTGATTTTCTGTAAACACTCTAAGAATGAAGCCAATGCTAAGTAAGTGTGGAACTGACTGTACTTTGTGTACTCAGTGTTTATAGTTCAAATCTAATCTGTCTTCTGGTAGGCTCATGTTTTCCTTGTTCCCTAACAGGTACCACAGTTTTGGGAGGCTGTGGAACCTCTAGGAAGTGGGTGGGGCCTAGTTGCTGAAAATGGGCATGGTGGGCTCACAACTTTAATCTCAGCCCTTGGGAGGCAAAGGCAAGTAGTGTCTTTATGAGTTCGAGGCTAGCATGGTCTCATTTGTGGGTTTCATGGTTGAGGTCCCCATCTCAAAAAAACAAAGCAACACAAACAACTAAAAATAAAAATGAAGTAGGTCACAGGGCATTATACCCAAGTGAATCACACCCGGCCCTAGTTCAACCACTGTGTGGTTCTTGGTTCTCCATGGCATGAGGAGCCTCTGCCACAGACTAAGTCATGGCCTCTACTACACCCCGCCTACTATGATGGTCAAACTGTGAGCCAAAATCTTTCTTCCTCAAGTTTCTCTCAGATGTTTTCACAGTGAAATAAAAGGCACTAATGTAGAAATCTGGCCATAAAAGGTGCATTCTTCGTTTTATAACTAACTAAATCTGACCATGGAGTTTTTAAACTTTTAGACCTGTTCTACAAGGTGAATCTACAAGTTTGGAGATGTGGGCTAGAGAAGCCCCAGAATGTTCTAAGCTTTGTTGAATGGCTCTGGTATAATTGAATGAGCAGGATGCAGCTAGAAATACAGGTGGTAAAGACTGTGCCCTGAGTTTTTAGATGGGTGGAGGCCATATTGAAAGGTGAGCCGGAGACTGGAGAGATGGCTCAGAGGTTAAGAGCACCACCTGCTCTTCCAGAGGTCCTGAGTTCAAATCCCAGCAACCACATGGTGGCTCACAACCATCTGTGATGAGATCTGATGCCCTCTTCTGGTGTGTCTGAAGACAGCTACAGTGTACTTATATATAATAAATAAATCTTAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGAAAGAAAAGAAAGGTGAGCCAGCACTGATCTGTGAGATTAGGGGCAAAAGAACAGAAAGATATGAAAAATCATGTAGTTTGGCCAGGAAGGGAGCACGAGTGTATGTTAAAGTGTATGGGGAGCTAACGTGGCCAGAATCGTTAGGGGAACCTTGGGAGGCAGAGGCAGCTGGATCCCTTGAGCCTGGTCTACAGAGTGAGTAACGGAACAGCCAGAGCTACACAGAGAAACCGGGTATCAAAAGAAGAAAAAAACCAAGCAACAAAAACCAGCTACATGTTTAGTACTGTGCCAAAAGCTCCAAGGTAGAACACTGAAGACTCACCTCACAACTGAGTGTGAGCCCCGCTTAAAGAGAGATGTCAGTGTGGATAAGGTTCTGACCTACGAAAACAGATGGCTGGTTTAGGTATGGCTAAGGGATCTGTGTTGTATAGCCGTTCCACCCACGTCAAACCCGGTGCTCTAGAAAACAAAGCGCCAGACTTAACAACAGATCAGTTAGCTCAGGGGATCTCTTGAAGTCACTACAGTGTTGCAGTATGGACTTTTAAAATGTGGAACCAGTATGCAGTGTTTTGCATCCAGGGAGTTGTGAATCTTCTCTGACCATGAGTGTCTGAGTTAGGGTTACTATGGCTGTTACAAAAGAAACACCAGGACTGGAAGCGAACTAAGGAGGAAAAGGTTCCTTTGGCTTACACTTCCACATCCATAGTCCATCACTGAACCAAGTCAGTAGAGGAACTCAAACAGGGCAGGAGCCTGGAGCAGGAGCTGATACAGAGGCCATGGAGGGGTGCTGCTGACTGGCTTGCCCCCCATAGCTCGCTCAGCTTGTTTACTTAACAAAACTTAGGAGCACCAGCCCAGCCATGGCACTGCCCATAATGGGCTGGGCCTCCCCCATCAGTCACTAATTAAGAAAATGCCTCACAGGCTTGCATACAGCCTGGTATGTGGAAACATTTTCTCACTTGGGGTTCCCTCCTCTCAGATGACTCTAGCTTGTGCTAAGCGGACACAAAATTAGCTATCACAGTGGGTGTACTCTTCATTTCTGAGAGTGTGTTTGGCCTTTTGTTATTTTCCATATTTTCAGAGGGTCTGTTTTCAATTAGAATTTGTTATGGCTCCTGGCTGGTCAGGGGCTGCTTAGGAAAGCAGGGGATCGCAGGGCTTCTGTTAGTGTTCTCTAGTCACAATGGTGTGCCCATCTCCCGAGCCCCAAAAGACCCAAGGAGCCGATTCTGAGACAATCACACTGGGTCTTTATTCAAGCTCCAGCTGGGCTCATCACTATTACTGATGCAGCGGATAGGGAGGGTGAAGCCCCAAGCCCAGTTCCAAGCAAGCAAACAAGCAAGGGGGCTTCTAGCTTGGCATGAATCTGATTGGGGGGCTGTTGTGGAATCCTCTGCCCTTTAAAATGACTGGCTGGTGCTAGGAGCCAAACCATCAACTTTCATAAGTAAATATCTTTAGTTACAACTGTATCGTCTGCGTTCCTCCTGATTGGTGGTTGTTAAGGAGTTACTTGGAAACCAGTGCTAAGCGCAGGTTCGGTGGTTAACTTGAGTTCAACCTTAGGTCAGGTTTTCTAAGATGGAGCCTGAATCCAAGAGGGAGTTGGTCTGGTCTCTCAACAGAAGTTACAGAATGTAACAATGTATTCCCATGCATAGTAAGGGAGTTTATTGGAATGGCTTATAGACTGCAGTCCTGCTAACCCAACAATGGTCAGCTGTGAATGGGAAGTCTAGTAGTGGCTCAGTCCCACGACAGTAGGTGCCTCATCTGGTCTTCTGTATAAGTTGGAATCCCAAAGAAAGTTCCAAGGCTGGCAAGTATGTGCAAGCAGGCAAAGAAGAATGAACGCTTCCTTTTTCCACTGTCCTTATGTAGGTCTCCAGCAGAAGGTGTGGCCCAGATTAAAAGTGCACACCACCACGCCTGAATTTGGAACTTGTTCTGTCCCAGACTGGCCTTGAACTCAGATCTGCTTGCTTCTGTCTCCTGGCATTAAAGGCATGCACTACCTTGCCTGGGCCTAAGTTTTTCATGGCCACTACACTTCAAGATCTGGATCAAAAGTGTGTGTCATCGCATGTCAAGATCCAGGTCAGAAGCCTGTGTCTTCTTCCAGCCTCAAGATCTGATTACTGGCATGCCCTCCATTTCTGGATTGCAGTTCATTCCAGATGTAGTCAGGTTGACAACCAGGAACACCTGTCCCAGCTTCTCACTGTTAATTCGTGCATTTGACTGTTTCGCTTGCATGAACAAGTGTGCAATGTGTGCATTGCCTACAGAAGATAGAGGGGTGTCAGACTCCTAGAGTTATGGGCAGTCGGACGCCATTATTTGGGTCCTGAGAACTGAACCCAGGTCCTCTACAAGAGTTGTGCGTGCCCTTAAGCACTAAGTCATTTTTTCAGCCCTTGCTGTTTGCTTTTTGATAAAGCATTTGGTAGCCACTATACCCAAGATCGAAGGGAATCGGGAGGCTGCGTTTTTCAGGCTAGCAGCAGAACTTGTCACTGTCCACGTGGTGCAGGTTTCACAGGCTCACGGGATGGATGAATTATAGGGACATGGAGGCTTACTCCTAGAGCAGTGGTACTCACCCTTCCCGATGCTGCAACCCTTTAATACAGTTCTTCATGTGCTGGCCCCCAATGATAAAATTATGTTTTTGCTGTTTCATAACTGTAATTTTGTTACTTGTGAACCATAATGTGAATATCTGATATGTGAATGGAATATAAAAAATATAAAGGAAACACTACTGGTCCTGGGTTTTAGGTTTTGGCATCAGATGAATGAAAAAAAAGGAAATAAAAAAAGGAAAAAAAACGTGAGCGCTCCTAAGTCTGATGGAGGAGAAGGTTCATTATAGATGTGGGCGATCATAGCCAGAGGTGGGGACATCTGGGAGATGTGTGGTCTGTGGGGAGCGAGCAGGAGGGGAAGGGAGCTGGGACAGAGGGTAACCAGCTGGGCAGCCATAAGGCCAAAGGTACAGAGAGAATGGGTAACCAAAATGGTTGGATTATATGGGGAAGAGCAGCCCAGACCCCTAGGCTGGAGAGCTAGAAGTATGCCAGTCTAGAGGGCCCTGTAATGTATTGCCAGAGAAATGTTAGAGATCTCCCAAAACCAGACAGGAGTGGATCCGATGCAATCACAGTAGGGCCTTTTTATTGGAGCTGGCTTGGGCCCCTCAGCGTACCGCCATCATGCAGGACGGTCTTGGTGATGAGGAGTCCCGAATATCTATGGGGCAAGGCTTTATTTATAGTAAGCAGCAAGGGAGGGGAGGACAAAGGACTAAGTATGCAAGCATCTAACTGGAAAGCCACCATGGCCTTAGCATCATTGGCAGTGCTGGAAATCAAATCGTAAACTTAATTTCTATCTCCCTCTGCCTTGGTGGTCATTAGGCAGGGGGTGGGCTTGTATCTCGGGGATGCAGATCTGTTGGGGTAATAACCTGGAGATGGTGGTCTTGTGGGGAGTGTAACCTGGAGACCCAGGTCCTGTTGTGGTTGAGCATAGAGACTGGAGCTAGGCTTAGGTTTTGTTGTGGGGTAAGTTGTAAATTAATCTTAGGTACTAACCTGTTAGTTTACCTGAGTTCAAATTTAGGTCAGGTTCTCTAAAACACAGTATGAATTTAAAAGATTTGGCCTCTCAGTAACAGGTAGTGACTGAGGGATACTGGGGGACCTGGTGGTCAGTGTCTTTTATCTGTTAAATAGGCATCTCAGCCATTTGACCCAGGCTTGAAACCTAACAACATACAGAGTATCTGATGATATTAGACGCCCAGTGATTAGACCCAAGGGTTGAGAAACACGGTCCTAGATGGTTTTTGTTCGTTTGTTTTTGTTTGTTGTTTTTGTTTTGTTTTGTTTTTTTAAAGGAAAGTCTTCTAGGCCAGGCAGTGTGAGGCAGGGTTAGTTTTCCTGAGGAGATTCCCCCAAGTGCTTGCTCTATGAAGCTGTAGGGATGAAGAGTAGGTTATGACAGACCCCCGAATGCTGGGGCTGCCAGGAATGTGAAATGTTCACTGAGCAGACCCTGGAAGCGATGATGGGGCCCATATCACACTCTGAGGCCTACACGTCAGCTGGGAACCACAGAGTTAAATGTTTTCCCTACTGAGTTTCTGTCTTACTTTGATCTGATCTTTCCTTACTGTGTAGGATGGGTGTGTTGAGTCTGGGACTGACCAATTCGTCAGCCCGAGGTCAGGTACAGGCTCCATCAGCAGCGTTCTGGCCCTGTGGGATATCTTGGTAGAGCAAAGGAGTGGATTGGGCTGCAGAAGTGGCCGAACCAGAGCCCATTGATGGGCCCTAAGGCTCAGCCTAGTAATTTCCTCAGTCCTGAGGAATGCAGTGAATCTAACAGCTCACAGATGCTTACAGAAGGGGAGGGCTAAGGTGTGTCATCAGGAAGCAGGGGCCATTGCATGGCCTCACGCCAGGGTACTCCCCTCTTGAGTCACTGTGTGCTGACTTCTTGCAGGGCCACAGTTCAGATGTTGGTGAAGAAACCCAAGACCACCTTCACTCACTCAGCTGACCCGATAGGACTCAGAGAACTCCAAAGGTCCTTGCATTCCTGTTTATAGTTTATAACATCGAACGGGTATAGATTAAAATCAGCAATAGAAAAGGACAGAGCACAGAGTTAGGCAAGACCAGGCCAACTCTCAGTGGAGCTGGGTGCCCTGCTCAGTTCTCAGCAGTGTGTCTGAACAACACACGTGGAATTTGCTAGCCAGAGAGCTTGCTGACCTGGGTATCCATGGTTTTACTGCGACTCGATTATGTGGAATTGGCAGGTTTCTGGCCTATGTGGCCGACTTTTTGTAGTTTCCAGCTGATAGCTCCATGCCCCAAGGCCACTGTCACCAGTCGTAGAGCCTCTCTGGCATTGCCCAAGGCTTTGTGTTAGTGAGGACTCTTTCCCCCAAAAAAGATACTCCAAGGAGACTATTGGAGTATACAGGATGTGGGTAGCCAAGGTCTCAAGCCTGCACTAAGCCTGCACTGTACATACCTTGGGTGCCAGCCCACTGAGCAGAGAGGGTGTGCTTGTGTGGGTGGAGATCACTCCCAGGAAATGGGGTGCTCAATTTTCCTAGATGGGCTAAGGACATAGTGCGAGCCCTCTGTCCACTGACAAGTGGGCGGGAGGTGTGGGTGCTCTGGGCTTTTTCTGCACTTGTCACCTCAAGACCCTTTCAGCATCGTCCCTAGTCCCTGGGCTACAATCTACTGTCACAGCCTCAGGATGGTGCTTTCAGAGAGGTACCCTCAGGATGGAGGCCCCTGTGCTCAGCAGGAGGCCATGCTCTCCTCCACTTCTACAGATGCCCAGAGGATCTTTGGTTCTGTTTTCCATTTTATTGTATGCGTATAGGTGTTTTTTCTACATGTATGCCTATGTAACACATGTGTACAGTGACCAGGGAGCCCAGAAAAGGCACCGGACCCCCGGAAACTGGAGTTACAGATAGTTGTGAGCCACCTTGTACATGCAGAGAAATGAGCCCGGGTCCTCTGAAGAGCAGCCAGTGCTCTTAACTGCTGATCTATTTCTCCAGCTCTTCCTTGGAGTTCTATTTTTAAATCTCTCTCCATTGAGACTGACTAATCTGGCCTCGAGCAATTCTAAATCCTGTATGACCCTGGTCACTCTGGCTTTTTTGGACTGCCAAGAACAGAAATTCTACTGAACTCACTAGCTAATGAGCCCAGGAATGGCAAGGTAGAATTATCGTGAGGAAAGCCAGGCATATCTCTCCCCAGGTCTCTTAAGGACCCCTTGTAGTACATGTGGTCTGTTGTGGTTCCGTGGGCTCTGCTGGTCCAAGAACATGGGAAGCATCTGATGTGCTCAGGGTGTTGACCCCGTGAGGCGGTTCTGACTGTCTACACACCTAATGTCTCTGTACGCAGTGTATGATCAGAATGGACTCAGGGTTTGCTCTAGGCACAGGTGAACAGGAGCTAGAAAAGGACTAAAGAAGCAGCCTGTCAGAGGGGGCCTCACCGTGCCCTGAAAAGAACATCAGATCCATGGGCACTGGGCTGGGGACACCTGGCATTCACAGCGGCTTGCCAGCAGCTTCCTGGGGGAGACATCTGGGGTTAGATTAAGGCAGGATGTGTTATGGGAGAGGTATATCCGGAAAGGTATGAGGAGTAATTTGCTGGCCAGAGACAGCAGAGGGGCTGTGGGGCATCGGGCCTGGCTTGAGTGGGGGGTGAGGGATTGGAGAGAAAGGCAGTTCCTGATGGTCCCCTCCCAGGGGCTGGCTTTCCTCTGGTCCTTCTCTCCCAATAACTGCGTCTTCATCGAGGCTGCAGCCCTGAGCTCTAACAGCACCTCCAACTCCAGGCTGCCTGGAGACACATCGATGGCCTTCCTGTGGACCATGGAGCCCTCCCCATCTCTCCAACCTAGAGGGCTGGTCTGCTGCCCTCCTGGGCCAGGTTCTGCAACTGAACTGGAGAAACCCTTGATCTGGCTATGTCTGCTGACAGCTGCCTCTGCCAGGGGCCCCGCCCAGTAGCCTAGGGAGGACCAAAGGAGTCTAAGGTCCATAGTGATGGCCTCCTCCCTAACATCAGCAGCTGGTAGAAGGGGCAGGTATGTCCGAGGCCCAGCACGAAGTCAGTTCTTTGCACTGGTTCTTTGCACTGCCTCTGGGTAACTGCTGGGCTGTCTCATTAGCTATGTCCTCTGGTCTTGAATTTATCACTGCTCTGTCACACACAGACATACATACACATATATATATACACATACTCATATACATACTCTTACTCATATACACACACACATATACACACACACTATATACATTCTCTCTCTCTCTCTCTCACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACTCCCCATACTTCCCATAGTGCTGTCGGGCTTTGTAGCCCCTCTGGCTGTTGTTTTTCAAAGAACTTTGTAAAGGTTCCTTTTTGTACTTTGACACCTGGTTCTCTCTCTTACTTTTTCTATCCCATAGCTGTTTTCCTGTCTGCTTTTGTTTCTCTGGTCTGTGATATGCATGTCAATCTTTCTTAATTGCCAAGGTCACTGAATTTTAGGGTCCTTTACCCCACAGTGTGGCTCTGTCCCTGTTTAAATGGAATGCTAGGTATACCACAATTTCTCTTAGAGCGCCCCCATTTTATTTTATCTTATTTTTAATTTTTTATATATGAATGTGTTGCCTGCATGTATGTGCGTACACCATGTGTGTGCCTGGTACCCACGGAGGCTAGAATAGAGCCTCTGAGACTGGAGTTACAGATGGTTGTGAGCTGTTGTGTGGGTGCTGGGAATTGAACTGGGTCCTGTGGAAGGGCAGCCAGTTTTCTCAGTGGCTAAGCCATCACCCAGCCTCTCCCTTTTTATTTTTTAAATATTATGTATGATTCTTGTTGTGTGTAGGTGTGGGCATACACGCCACAGCATACTTGGGGAGGTCAGACGACAACTTTGTAGAGTCAGTTCTTTCCTGTTATGTGTGAGTTCCTGGAGTTGAGCTCAAGCCCTCCCACCATACCGTGCTTTCCTTTTTTATTCATACACAGTATCCCGCAAGCTTCTAAAGATAGCTGTGGGTATAGTCCTCCCTTACCCTGTGAGCATTTGTCTCAGCCTTCTACATGGCTTTGTCTTTATGCCTCTCTGGAAGTTGCTAGAATCTAAGCCCCGGTTTGCCATATACCCTGGGACAGTCTTGGCATTGTCCCAGAAAGCTGAGCCTGCCTGCTTCCCCAGGGCTCTAAGGCAAGATGTAGCCATGACAGGCTATGTCCCAAGCCCCTCTACACTGTGGTGCAGCATTACTCTGGTAGCAGTCTGCAGACTCTTCATTTCACAGACCCAAGATCAGAGCAGCCAGTGTCTGCCACAGTGATGCCCCTGATGTCCCTGGAGCTTCAAAGGCTGTCATAGCTGCTCTTAGAATTCCCGAAGGCACGAATGACGCTGTCCCTAGGCCTGCAATTCTGCGGTTTCTGCTAGTGTGCCCCAGCGAGGCTTTGAAGGCCCTCATCTAAGGTGACGCCCTGTATGGCTGCACGGAGACTGGAGCTAGGAGTGCCCTAAACTGAAGAGACTAGGCTGGGTTCTGGGTGCATTATGCTAGCCTCTTACAAGGAGGGCCATCAAGGGCCTGACCCACAGACCCATCTTACACGTGTGTTGCCTCTTGGGAGGCACCAGAGTCAGGTGGTCTTGGCATGCTTACCACCTAGGACCAGGGTTTGTGCAGTGACACAAACCCTCCAGTCCTGAGAGCGAGCACAGCCTGACCTACCCCAGGGCCTCCAAAGATAGGACACCAGTGACCCTGACCTCCAAGGCATCTTCCATTTGTGATGTGTGGTCTCCTCTGGATATACACGTACTCACAGAGACAAATGCACACAGACACAGATACAGGTACACACCTGCAAAGTGACACACGCACTCCTGCTCAGGCACGCCAGCAAACTCACGTCTACCCGTCCAATCACTGCTTGGCTCCCTCAACACTGGAACGGTTTCTTGGCTGCCCCAGGTGTCAGCTGCAGGCCTTAGCTCTCGTGTATGTTTCAGGGCTCTGCGAGTCTCCTTTCCAGAGTCGTTGCACAGAGATTAGCTCTGATCTCAGGATTAGAAAGTAGAGGAATGCTTTCTGGGCCCCAGGGGCTCTGCAGCATGGGGTCCTTGCCCCAAGGGGCTGTGTACTTAGTCCATGTTTACTTAGCACCCAGGTGTGCACACGCCTGGCACTAGTTTCTGCGTACTAATGTGCGTATGCAGAGCCATTAGGTCCTTTGGGTGGGCGTGTGCTAGGTCACAGATCATGCTAGGTGAGCGGGCCCGATGCCTGGCCTTGGGGACCGTGGGCTAGGATGGAGTCTCCCTCTGTGGCTCATGGGCAGGACTTGGTGCTACTGCTGGGAAGAGGACTTGCTACCCTTTCACCCCAGCTTCACATGTGGCTCCTATTGCGGCCGCTGCTCCTTCCAGCACCCGCTTTACCACCGCCGTGTAGTGCGTCCAGGGTAAGGGAGTGTCATGGTGGTGGACTTAAAAGCTGATGCCGAGGGGCCCAGGTGAAGGGAGATGTCCGTTATGTTCCCAAGCTTCCAGTGCTCACCAGTGGAGCCCCACCCACTGACGGAGATGTCAGAAAGGCCCTCTGACACTGCTGTTCTTAGCTCATTGTTCTCCTTTTCCCACAG
Seq C2 exon
ACCTCGTGACCGTGCGAGCAAAGCCACCCCTGCAACCCATGTGCATCATCTTCTTTAAGTTCGATCCTCGTCCCGTTTCCAAAAATGCGTACAG
VastDB Features
Vast-tools module Information
Secondary ID
ENSRNOG00000030245:ENSRNOT00000046594:1
Average complexity
IR
Mappability confidence:
NA
Protein Impact

5' UTR

No structure available
Features
Disorder rate (Iupred):
  C1=NA A=NA C2=0.000
Domain overlap (PFAM):

C1:
NA
A:
NA
C2:
PF057427=NRDE=PU(6.6=94.7)


Main Inclusion Isoform:
NA


Main Skipping Isoform:
NA


Other Inclusion Isoforms:
NA


Other Skipping Isoforms:
Conservation
Mouse
(mm9)
No conservation detected
Cow
(bosTau6)
No conservation detected
Chicken
(galGal4)
No conservation detected
Chicken
(galGal3)
No conservation detected
Zebrafish
(danRer10)
No conservation detected
Fruitfly
(dm6)
No conservation detected
Primers PCR
Suggestions for RT-PCR validation
F:
No suggested primer sequences
R:
No suggested primer sequences
Band lengths:
Functional annotations
There are 0 annotated functions for this event


GENOMIC CONTEXT[edit]

INCLUSION PATTERN[edit]