RnoINT0168829 @ rn6
Intron Retention
Gene
ENSRNOG00000005624 | Zfx
Description
zinc finger protein X-linked [Source:RGD Symbol;Acc:1562664]
Coordinates
chrX:63182296-63195572:-
Coord C1 exon
chrX:63195505-63195572
Coord A exon
chrX:63182386-63195504
Coord C2 exon
chrX:63182296-63182385
Length
13119 bp
Sequences
Splice sites
5' ss Seq
CAGGTCTGT
5' ss Score
6.84
3' ss Seq
ACTGGTGTCTCTTGATTTAGGTG
3' ss Score
9.99
Exon sequences
Seq C1 exon
GTGCGTATAACTGTGCCCAGCTAACCTTGTAAGATGAATTGGGGAGCATTCCCTCTTTTTTGAAACAG
Seq A exon
GTCTGTTGCATAGAGGTATCTGATCACTGAAAGGTAGACAGACTCCATTTGTAAAACTGTACTTGGTTTCTTCTTTTTTTGTAGATTGTGGATTTGAATTACTAATAGCCCCCTTTCTCCTGTGGTTATATCCATTTTGCTTTTGAGGTTTTTTTTTTGGGGGGGGATAATTTATACAAAATAAAGTATAAATTTTCAAATATTATGATATAATACAGTTTCCTTGATGATTAAAAAATTAACTTTAATTTCCATTTTTATTATGCATTGTCAATAACTAGCCTGTGCTAATCAGATTTTTCAAACTGTTCATTTTACGGATGTTTTGTGTTTCTATTCTTGGCACTATTATTCCTTTCTATTTTGTTTCTGTATGATTTGACATTTAAAAAGAGCTAAGTTGGAGGCTGCTTACTAGTACTTAACCGATTTTTAAACTACATGGATTGAAATTTGGAATTTTTCCTCTGATAACTGGATCTTATGATTTTGATACTTTATTTTTATTATTAAGTGGTTCTGAATGCATTGTGCTTTTCATAATTTTTCTGTTAAAGACAGGGTCTCATGTAGCACTAGCTGGCCTCAAACTCACTGCTAGCCATAATTCTTGATCCTTTTGCCTCTGTCTCCCATGTGCTGGGTTTACAGACATGTACACTGTGCCTGTGTTCTGACTTTTCTTTTCCAACTTTATTGTATCATGGTTGGAGAACATTGACTACTAAACAAAACTCAGTTGTAGTTATACCAACAGCAAGCAACTTGAAAATCAAATTTAGGAACAAGGATAATTTATAATAAGATCAAACAGCATATATTTTAGTAAATCCAAAACATACTGTAACTTTTATTTTGGTTTTTGCTTTGTTTTGGTTTGTTTTTCCAAGACAGAGTTTTTCTGTGTATCCCTGGCTATCTTGGAACTTGCTCTGTAGAACAGACTGGCCTTGAACATTTATCCCGCCTCCCAAGTCCTGGGATAAAAGGCAAGCTCCACTGCACTTGGCCTTCTTCCCGTTTTGAATGATTAGTCTTAACCATTGTCTGGCTCCTTCCTTTAACACTGTGGTGATTATGTTGTGTTAATGTCTCTCTGTATGTGGAGATAGAGTCCCACTAGGTAGCTCTGGCTGTCCTGCAACTCACTGTGCAGACCAGGCTGGCTTTGAACTGAGAAATCACCTGCCTCTTCCTACCCAGTGCTGAGGTTAAAGGCGTGCACCATCAAGCACAGCACTATTATTCTTTTTACATGATGGGTCTTATTTACAAATATTTGACTTGAAGTTCAAAATAGCCAAGTTTCTATTTTGGTTAAATTGCTTCATGGTTTTGTTTTAAATGGGGAATTTTATTTGATAAAGCTTTGTGTTCTGGCATAGTTTATTCCAGTTTGGAAAAAATGTGATTTTTTTTATTTGAATTTTAGATTTATTTATTTTATGTATGTGAGTACACTGTGGCTGTCTTCAGACACACCAGAAGAGGGTATCGGATTCCTTTACAGATGGTCATGAGCCACCATGTGGTTGCTGGGAATTGAACTCAGGACCTCTGGAAGAGCAGTCAGTGCTCTTAACCACTGAGCCACCTCTCCAGCCTGTGATTTTTTTTGAAAGGGTTATATCTAACAATTTTGTTTTTTTAAAAATTTTGTCGTAATTAGATTAATTTTTCCTTCCTCTTCCTCCTTTCTTTTTTCCCCAATATTAGGGATTGAGTATTAGGTACTAGGGTCCTACACATGATAGGCAAGCACATTACCATAGAGCTGCCCCTCTGTGTATAACAAAGTGCTGGTAATTTACATGTTCCTCATTGATTTACAGTTTTCTTAGAAGTTTTCCCCCCTTTTTTGTATCAGTTCTCCATATTTCAATTATATTTTTTATATCTTATTTAATTATATTTTTATGTTAGTAGTTATTGTCTTCATACTTCTTAGGGAAAAAAACCCTTAGATAATTCCCTCCTTAAAATAGTTGATTAGTTTAAAAGCACTTGTTGATAGTCAGCTTGGAGTATGTTTATTGCTGGTCTTGTATGCCAAATCCAGCCCGTTCTTTTGTTTGATGACTCAAGGATTTATTAAATTATATATGCAAAGCCTATTGCTATTAATACAACATCAGTATAGAAACACACTCTACAGTTCTGCAACTGCCAATTAGAAAATGTTGTTCTAGTTATACAAAGGCCCAATATTATATTCTTACCAATGTTTATGATGCATGGAGACCATTACTGGTGTTAGTATAATGTATTTAGGAATAGCAGTAATAGAAATCTTATGTTTATGTAGGTTAGGAATAGCGTGGAGTCACTATTAGTTACTTTTATTTAGTATTAGTGGGTAGGACGGTGATATTAACAGTGTTTATAGTTAGTTTGACACGATGGCACATGACTTTAACCTTAGCACTAGAGAGGCAGAAGCAGGTAGATCTCTAGTTCAAGGCCAATCTGGTCTATATAGTAGTTCTAGAACAATTAGGACCAATAGAGATATTGTTTCTCAAAAATTCAATTAAAAATAATAGATAGAAACATAAATGAATGTTCATAGTTTATATTTGTGATATCTGGTGTAGAACCCAGTTTCAAACAAGCCAGGCAATCACTCTACCACTGAACTATACCCCTAACTCTTCATAGTTATAAATATCTTGAATGTTTTAAAAATATCTTGAATGTTTTAAAAAGTACAAAGTGATAATATATGAATTTAAAAACTAGTTACCAGACAATTAAGAAAAGAATTAGTTTGAATAAAGTAATTGAAAGTTAGACCACATTAAACTAAAGGTGTAGGGCAATTACAGTAGTTAGCACTTGTAATTTCAGTACACAGGAAGCCAAGACAGGAGGATTGCTGTTAGTTCAAGGGCAGCTTAGGCTTTTGAATTGTTAGACCCTATTTCAAAAAGTCAAAACCCAGCAGTGGTAAATGACTTGTCTGGTGAGGGTGGCTGCTGCTAGGCTAGACTACCTGGGTTCAGTTCCTGGAGATCACATGGTACAAATAGAGGGTTAACTCATAGGCTGTGCTCTGACTTTCACAAGAATGTGGGTCTTGAATGCACACTCACATGCATGTACTCATAAACACTAAATAAATAATTGTAATGAAAAATTTAAAAAACAAAACCAACAAACAACTCAAAGTCCTTTTAAGTTTTAATGTATTAGAAAGAGTTTTGTTTTGAGAAAGAGGTCCTGGCTGTCCTTGAACTCTCTCTGTAGACCAAACTCACAGAGATCCTCCTACGTCTGCCTCTCTAGTGGTAAGTTTAAAGGCATGTACTATCACCCAGCTTAAGTTGTTATTGTTGGTTTCTTTCTGTTTGTTTTTTCGAGACAGTTTCTTTGTATAGCCCTTACTGTCCAAGTTGGCTTCAAACTCACAGAGCTCTGCCTGCCTCTTCCTCCTCGTTGGGATTAAAGACAGTTTACACCACTACTAGGCTTTTTTTTTTTTTAAATGCCAGGGTATATGTCACTCATTGAGAAAAAGAAGAGAAAAAAAAAACATATCGAGAAAGGGAATCCATAAGAAAGGTACCCAACAACTACTAAAATGACTAGGCCAGAGATAAATTAAATACTTAGTTTGGGAAGCTCGATTGGCAGAAATTATAGGAACAAAACAAATGTGTAAGGGAACCCTTTTTAAATAACACAAGGGGTTGGGGATTTAGCTCAGTGGTAGAGCAGCAAGGCCCTGGGTTCCGTCCTCAGCTCCAAAAAAAAAACAAAAAAAACAAAAAAACCAAAAAACAAAAAAAGAGAAAACCAAATATTTCTTTACCCTGCATTGTATTTGATGGAAATCGACTTCTTAAAAATTTCACCTGTAATGGTTGTATTTTGCATATTCTTGTCTAATGTAATGTAAATTAATCTCCACTCTATATTATGTTTACATACTGTCTTTATCCTAGTTTTACACACTCCACTCTAGTACACCTACAGCTAAAAACAGGATACATTCAGGAGACATGTGAGTAGGATTTCTGTTGAAAATTCCAGCAAAAGTTACAAAGCAACTTATAATTAGTCACTATGAAGTCAAAAAGGGGGAAACAAAGAGTCGTTATATTCATCCCATCATGATAAACAGTAGAATGTTATGGTAAGTGGATTGGTCAACTACTGCATGCCTTTAAAGGGTAATGCTTTTATAAAGGGGGCTCTATTGCTCTACATATGTGAAAACAAGTGCCAAGCCTGTACTGTTCCTACCATCAGGCTAATCTTAAAAGCATTTAACATAGTGTGCTATTGTTAGCTTACAAATATAGCTAAATTCAGAGGATATTTTTGGCAGTTCTTAATCTGAGCAGGAATAGGGGCTTTGGAAAAATAAGGGTTTTAGGTTTTTCGTTTTAGGGCCAATTTTTAATAGATTGTGAAAGTTCAGGCTCTTTAAGCAAACAGAACCTTGCAATTACCAATTGGCACAGGATGATTTTATGGAAAAGCTAGTCTGTAACAAAAACTTGGACTTAATTCGTGAGTGAAGCGTGCAAAGGTTCCAAGTGGGGCAGGGCAAGGAAGGAGGACAAGGTTCTTCCATTCACAACTGCAGGCATTTTCTCTTCCCTTTGACAGAGGAGGTGAACAGGATTGTTTGAAAGTAAAGTAATCTGGTATAATCTGTTCTAATGGACTAGGGTTTGAATTGATTGGTTACTTATGTCTAAGAATATTTGTTCTGTTAAGTGTTGTTTATAATGTGTTACTAGTGATTCATTTTTTAAAAATTTTTGTCTCATGGATATTTTGTTTTATTTACACATTTCCAGGCTATTTTCTATGGTACGTTAAAAATCATGACTTTAAATTTAACGTAGAATAAATATCAAATACCTTTGCTCTTTTTTCCTCCAAAATCATGTTGAGGAAAAGAAGTAAAAATCCAGAGCCGAGGAACCTTGAAACATACTTTTCATAAGAATACTTTGTCCTTGTATAAATCAATTTAGAATCTGTCAGGGGAAAAAAACAAGAGAGTTAGTGAATCTGTGGTCATATACCAGAAACTGGCATCCTATAAATACACTAATGTCCAAAGCAAAAAGGTCCTAGGAGAAAGAACAAAGTCATGGCCATAGTCAAGTGATTAAAGCTGAGCCAGTTCTCTGTCCATGTAGGTAGGTCTACCTCTGGTGGTCTTGCAGCAGGAAGTGCATTAAGTTAGCTGAGTTATACATGGATTTATAAAATGGGTGCCCTGGCAAGAAAAGTTGGGGAGTGTTTGTTTAATTTTGTGATACTGTAGATTGAATGTAAGATCTTCTGCATGCTAGTCGAAGTACTCCACTTCTAAGCTATTTTCCAAGACCTCTTTTTATTTTGTTTTATTTCATCTTGGTTTTTTTTTCCAGGTAGTGTTTTCCTGTGTAGCCCAGGCTGTCCTGGAACTCACTCTGTAGACCAGGCTAGCCTCAAACTCACAGAGATCCATTTGACTCTGCCTCCTGGGTGCTGGGATTAAAGATGTGCATCACCCTCTTCGTGTTTTCATTTTTTGAGGCTGGATTTGCTTTGTAGTGTAGTCAGGCCTCAATGTCCCAAGTAGGTAGGATTAGGCTTGTGGCACCAGACCTAGCTAAGGGATAGTGTTTTAATTGGCTTATAGTAATTCTACAGGCTATGAGACTTGGCCTGGAAAGTGTAATACTTTTCTACCATTAAAGGAAAGCCTGACTGATTATATATTTTGTCTTCTGTACGCATATAAAGGATGCTTGTGACTGGTAGAATACAACTTCACTCCTTGGCAAAGCAGAGATTTTTCACTGGGACTGAGGAAAGTTTCCCAGTTGTCAGTGTAACTAATTTAGCAACTTGTCTGTAAATGTGGACAACCAAAAGGAACAATGCTTTTGAGGAAAAGCAGCAGTTTAGAAGAGGCATCCAAAGCATCCAACTGAGAAATGAAACACTAGGGAAGACAGTGTAATGTTTGCTATAGGATAACCATTGGGATTTCAGAAGTGTCTGGGAAAACATTTTCGTCCACCACATAATTGAAAGATGGCTATGGAAAAACCCTCAGTTATTTAGGAACCAAAACAGGATCTCTCGCTGGGTGTGATGTCCTGTGCCTTTAATGTAGGTGGATCTCTAGTTCGAGGACAGTCAGAGAGCATAATAGAGAGAGACCTCGTCTCCAAAACAAAAGAAAAGATCTGGTTTGTGATGATCAAGTTAGCCAGTATAGAAGTTAGTAGAAAGGTAAATAGAATAAGAGGGAAGTCGGGTTGGAGAGATAGCTCAATGGTTAAGAACACATATGACTGACAGGACTGGAATTGAGTTCCCACGTTAGGCAGATCATTACCACCTGTAAGTTCAGCTCCAGAAGATCTCACAGCTGGCCTCAGTGGGTATCTGCACTCATGTGCTCATACCTACATATGTAAATACATAATTAAAAGCAAGTAAGAGGAAAGTTACTGATAATAGAGGACAGATTTAGGAGTACTTACCCTGTAATAGAAATTCTAATGAGTGATAGAGAAGCCAGCAGAGTGCACTTAGGAGTTTGAGGCAGGGGGCTGGGGATTTAGCTCAGTGGTAGAGCGCTTACCTAGGAAGCGCAAGGCCCTGGGTTCGGTCCCCAGCTCCGGAAAAAAAAGAACCAAAAAAAAAAAAAAGAGTTTGAGGCAGGAGAATTGTCACCAGTTTGAGGCCAGCCTGGCCTGTATGAGTTACAAGCCAGCCCTGTCTCAAAGCCAAAAAAAGATGAACTACAGAAAATAGAAGGAGCTGGAGTCTAAGCACTTAACCGTTCATGGACTAGGTCTAGCTAGAATCAGTTTAGTTTTGAAAAAATAAAGTACATTAGGAATATCTGTGTCTGGAGGTAAGAAAATCCCTAAGTTGAAAGAACTTAGCTGGACCTTATGACATGGATATGTGTCTTAGGTTTTACTGCTGTGAACAGACACCATGAGCAAGGCAACTCTTATAAGGACAACATTTAACTGGGGCTGGCTTACAGGTTCAGAGGTTCAGTCCATTATCATCAAGGTGGGAACATGGCAGCATCCAGGCAGGCACAGAGCAGGAAGAGCTGAGAGTTCTACAGCTTCATCTGAGGGCTGCTAGTAGAAGACTGGCTTCCAGGCATCTAGGATGAGTCTTAAAGCCTACACCCACAGTGACACACCTACTCCAATAGGGCTGCACCTTCTAATAGTGCCACTCCCTGGGCCAAGCATATACAAACCATCACGATACATAATCCCAGCAACTAGGAAGACTGAGAGGCAAGAGGATAGAAAGTTAAAGGCCTGCTTGGCATGATAGGGTACGTTAAAGGCCAGTTTGAACAACTTAGTGAAATTGCTTCAAAAGTGAAAGAATGACTGAGATTCAATCAGTGGTAGATAGAACATATTTGCTCTCTGTTGAAGGCCCTTGAAGTTTCTTGTGCCAAAAATCCTCCAAGAAAATGTTCATTGTTTAAGCAAAATTTGATTGAAGGGCCGACTAAGTGTACATATGATTTGAAAAGTGCTTGTTAGAGTGATCACAATGAAAACAAATACAAAACTAATGACAACTGACAGTAAAAACTGATGATTACTGGTGAGTAAAAACTCAGTGAGAGCAGTGAAAATAAATTAAAAACGGACACAGTTTTAATCTCAGCACTCAGGAGGCAGAGGCAGGCGAGTTTGAGGCCAGCCTGGTCTACAGAGTTCCAGGACAACCAGGGCTATATATAGTTCACTGTCTTAAAAAATAAAAAGAATAGCTGACTTGAAGGGTTAACCTAATAGAAGTGAGAATACTTGGAGAAATGATGGCTAGCATTGAACAGCACGGCAACATTTGGGAACAAAGTCTAACTAAAGAGGGATATTAATTATTATTAATTAATAATGTTAATTACATTTTAATAGCTGCAAATTTTCACCAGTTTCAATTTCTGAAAAAAATTCTAGATAGGTTTGCTCTTCATGAAGTTTGAAACATTTCCTCTAACATATATAATACAATTTAGTTCTCAGGGTGTGGCAGGGAAAAGACTGGTCAGCCATAATATTTTATTACATCAAGGTTTTTGGAGGACCACAAGCAAAAAGTGATTTTGCATATTAGTAATGTGAATATTTAAGAATCCTGTTAATTTGTCCAAGAGTAGACAGGGAGGTGTGTAGGTATACGAAAATAGAACACAGCCATGTGTTTGAGTCTAGCCTGGACTGTATTGCAAGACCCTGTCTTTCTCTCTTTCCAGGGAGAAAATTAAAGAAATATAAAATAAGTAAATTATCTCACATTCCTAATCTAAGAGATGGTACCAGTGCATTTCCTATTGACTTAGTGGGGGTATTTATGTTGCTGTGTTTTAAAGGTTGGAAGAAAAGAAGTTTGGGTTTGATATTCAATATTTCCCTTAATACTTAATTTTTCCATTCTGAATTGTTTCAGAATCATGACTTTTGTATTGGGAGGGGATATTTTTCCAAATTGGGTTGACAGTCTCAGAGGTGTTTCAGAAAAGCAGTAGCAGTGATACTTTTCCTCTGTATTTCATTGTGGTGCTCTGATGCATTCTGTTTGCCTAGTTTTTTTGGGGGGGGGTGTTGGTTCCTGCTCCCCAGTGCACACACTTCTGTGTCATTGTTGGCCTGGCCCTTTTCTTGATCACATTTTCTAAGTAGTTTCCATTCTAACAGCACAGTTTCCTTGTTATTGTCAGAGGGAATTAACAAGTCTAACCTCAGAAGGGTTACAAAGCCCTAGGTATATATATTCTTTCTACTCGTAAGTACAAATTTTGTTTTTTCCAAACTTGATTGAGCTTTGTAATGACTTCTTCCATGTTTGCTAGAATATGTTAGATTATGATAAGAAGATGAAAATAACAACAGATAATTCTGTCATGGCATATTGGGTTCATATTGTAGAGCCTCTGAGTGTTGGAGAGCTGCTGAAGTATTCTGACCCCAGGGGAGTGCCCTGATCAAAGCAGTGGTTGGAGGATTAGTTTCCCACAGATATACATAGCTGTAATACCTCAGACCTTGGCACTAACTCTTGTTCAGGGTTCCTAGTCATTTGTTATGGGAGTGGCAAAAAGAGCAAGGCCACTTAAGAGGCTATTTTCATGCCTCAGGGATCAGGAAGTTTAAAGGACAATAAGACTGGAGATAATAAAGGACTGAGATGGATTAACTGCTGAGGAGTCCTGTGGAGAAGTAGTTGACAAGATATGAGTATGAGTGGGGAAGAAGGAAGAGAGGAGAGTGGCCAAAAGAGTCCTAAGTCTGTCGGAAGCATAGCATGGTGCTCTGAGCATGTAGATTTTGGTGGTCTGTACCAGGGGAGTAGAGAGAAAACAGTAAGAGGAAGGAGTAAGTGTACCACACTGAGGTCTGGCTCTGTTGTAATGTGAGGGGAATCAGGGTAGCTACTGTACCGAGAAGGGGGAAGGGAGCTAAGGTGGCACTTTGAAAAAATAGGCTGCAATGAACTTCAGAATCAGTGGAATTGCTTATCTGTCAGAGTGTCGTAGAAAAGCCAAGGAAGATTAGAGCTGAGTTAAGTAGTTGCTTTACAGGTTGAGGAGTTTTAGAATTGATGGGAATTAGTCTTATATAGAGAGACTTGGCAGATGTACCTTAATGCATGTATCCCTTTTTTAAATCTTAGTTGGCTTAATTTCACCTAACATTTTATTATGCTTAGAAGGTTAACATACATTTATCACTTTGCAGTTGCATTTTTTTTTAGAAAGCAAAAAGAATTATACCCAAAGGTGACTTTAAGGTGTATGTAGTAGTGACAGCTTAGAACATATACACCTTGATTTTCATGGTTAAACCATTTTTTGTTTATTAATCTAGCCATCATTTGTTTTCATTTCAAATAGTTCTTACCACAAACATAGCTATTTCTTGAAAATGATAGAACCATTTATTATGTACGTTTTGGGTTTCTCATGATATTTATGTGGAATTTAACATATAAAAATAAGATATATAGGGGCCAGATTCTTGGTAAGATGACTCTTTGCATAAGCATGAGGACCTGAATTTGGATTCTCAACACTGCCATAAAATCTGGTATGAGGTGGTGACAGACCCGGCACTGGACTTCATTATTAGCCAGCCAGCCTAGCCAAGCCAGGAAAGGTTCAGTAAGAAACCTTGCCTCAAAAAATAAGGTCGGGGTTGGGGATTTGGCTCAGTGGCAGAGTGCTTGCCTAGGAAGCACAAGGCCCTGGGTTCGGTCCCCAGCTCCGAAAAAAAGAACCAAAAAAAAAAAAATAAGGTGATGTATGGGTCCTAGAATCATATCTTAACAGTTCTGTGTATAACCTGAAGTAACCATAGAAGCCAAGGTAGTAGACAACTGATGGGAAATTGGAAACTTTAGCTGCACATGGGGGAAGAGGGGGCTGGGGGTAAATACAGAAAGGATATTTGTAAAAGCCTTGGGGAAACCTAAAGAATTTAGAAAACAAAAGCAAGGTGGAGAGTAATCAAGAAAGACTATGGAGATGACCTCTGTATGCATACCAAAGCCCACCTACGTATATGACCATGCATGAATTCAGTACCTACAAGTACAATTCAATACATTAAGCTAGACATAAAATAGCCATGGTTAAAAAGGATACTAAGAAAGAAAACATGCTGTGGAAGTTCTGGTAGGGAGGGTACATTTCTAGTATATTATGTATTTGTTGGAGTTGTAGGGGAGAACATTTGCAAGGAAAGAGGTCTACAGAGGTTAGGTCTGTGTTTTTGTTTGTTTGTTTGTTTGTTTGTTTTTCTAACAGTCTTCCTGTATAGCCAGGTTAGTTTAGACTTTGGCAATCCTCCTGTCTGTCTCTGAGTACTAGAATTACCGAGGGGCCCTAGTGTACTGGGGAAGGGATGTTCTGGCATTTTTATTTTTTGGAGAGTGTATGCATGTGTGAGAGGTACTTGGGATAAAGTTGGGAGAGCCAGTGATGGAAAGGTAATTTGGAGTTAGCATTTAAGATAGTATGGGCTTGAATCTTCTTTGAGTAGAGAAACGATGCTTTAGAGAAATTACATTTGTGTTAAAATTTTCACAAGCATATAGTATTTACTAATAAAGAATTAAAAGCCAGGGCTGGAGAGATGGTTCAGTGGTTAAGAGCACTGACTGCTCCTCCAGAGGTCCTGAGTTCAAGCCCCAGCAACCACATGGTGGCTCACAACCATCTGTAATGGGATCTGATACCCTCTTCTGGTGTGTCTGAAGACAGCTACAATGTACTCATATAAATAAAGTAAATAAATGCTTCTTTAAAAAAATTACAAGCCAAAGAAAGATGTGTCTAATAGTTCCATTTAGTTTGGATTAGAAAGTAGAGACTAGGAAACCAATGAGGAAGTTTCTGCAGTATTTAGAACATGGGCAAATAAAATCTGTGATGTCTGATCTTTTGAAATAGTAATCAAGTAATATTAGTTGATATGTTAAGGGTTGGTTTGTTTTTGGCTAAAGTAGAAAAAGGAGAATTAAGGTCATTGGGATGTCTTATAAGATCCCAAGGGAGTAGGATAAAGTGGGTCCTTAGGAAGTTCTGTATTCAGGATCCAAAAATCTGTTGGTAAGCCACCTCTTCCTGCTTTATCTATTTTCTCAGGACATTAAATTGATTGTTTTTGTTTGTTTGTAAACTTTATTTTACTGGTCTAAGCCAGAGTGGGAAAATGACCTTCCTCAGTTCCGTGTTAGCGGCCTAGACTGAGAGATGCAGGCGGGCAGAGAGTGGAAGAAAGGGCTACATGAAAGGAGCAGATAACTGATTTCTGCTCACAGTTTTAGGTTTTTGGGGGTAGAAATTTTATTTTATTGGGCTAAAGTGGACTTAACTGTTTTTTTAAACCATTTCATAGCTAGTGCTAATCACTTTTGGCCAAAATAGTTAAATACACTGTGAAAATTGTATGTGCATAAATCAGGAGGTTAAGAAAGGTGCTTCTACAGTTGTGTTTACTATAATTATGTACTTTGTGATTCTATGATTATTCAATATAGTGTTTGAAACACTGCATAAGTTTAGAGAAGTAATGAAAAAACTTTTGTGCAGAAATTTTCCATGACAGAATGCATTTAGTTGAACCTTTAAAAAGTCAGTTGCTGCTGAGCAGTGGTCACTTATCCCTTTAATCTCAGCACTAGAAAGGTAGAGCAAGTGGATCTCTGAGTTCAAGGCTGGCCTGATCTACAGAGTGCGTTCCAGGATAACCAGAGCTACATAAATAACAACAACAACGAAACAAAAAAGTAGTTAAGTAATCCTGTGAGAGGATGATGTCACTTAGTCAGATGATAGTGCTAGGGTTCTGAAAATACTCTTTATCTTGGTTCTAGGTGGTGCTAAAGGCTTTGGGGGAAGGGGAGGGAAACACATAAAATCCTGTTAAGTAGCCCAGTTTGGCCTTGGATATTTAGGAATCCTCCTGAATTCTGGGATGAAGGTTTTCCGTATATGTGAACATTTACCAATATGTGTTTATTTAGATCTGGAGCAGTGACTCAGTAAAGATTATTGATTATTTTTTCTTTTTTTTTTTTTTTCGGAGCTGGGGACCGAACCCAGGGCCTTGCGCTTCCTAGGTACCACTGAGCTAAATCCCCAGCCCCGATTATTTTTTCAAGACAGGGTTTCTTTAATTAGCCCTGACTATCTTAGAACTCAACTTTGTAGACCAGGCTGGCCTCGAATGCAGAAATCTGCCTACCTCTGCCTGCAGAGCACTAGGTTTAAAGTACCATCACTATCTAGCCCTGAATTTATTTTTTATTTTATTTATTTAAGATAGGGCCTCACTGGACATGGTCTTATCATATAGCTGAGACTGATTTGGAACCCTCTGTGTAGCCCATATTGGTCTTGAACTTGTGAGTCTCCTGCCTCGCCTCCTGAATACCATGATTATAGGTGTGTACTTGGCATGTGTCTCAATTTATAATGAGCCTGGATAAAGGTGACCCTCTAGATTTATATGTTTATGTCAGATGTTCATCTGTTGTATAACTTGAGTCCTTCAGAAATGAAAATGTGACATTAAAAAAGGATACTAAAATTAATACTGGTGTCTCTTGATTTAG
Seq C2 exon
GTGTTCTGGCTGATGAGAATTTAAAGGCCATGGATGAAGATGGACTTGAATTACAACCACAAGCACCAAACTCATTTTTTGATGCAACAG
VastDB Features
Vast-tools module Information
Secondary ID
ENSRNOG00000005624:ENSRNOT00000065194:2
Average complexity
IR
Mappability confidence:
NA
Protein Impact
5' UTR
No structure available
Features
Disorder rate (Iupred):
C1=NA A=NA C2=0.964
Domain overlap (PFAM):
C1:
NA
A:
NA
C2:
NO
Main Inclusion Isoform:
NA
Main Skipping Isoform:
NA
Other Inclusion Isoforms:
NA
Other Skipping Isoforms:
Associated events
Conservation
Mouse
(mm9)
No conservation detected
Chicken
(galGal4)
No conservation detected
Chicken
(galGal3)
No conservation detected
Zebrafish
(danRer10)
No conservation detected
Fruitfly
(dm6)
No conservation detected
Primers PCR
Suggestions for RT-PCR validation
F:
No suggested primer sequences
R:
No suggested primer sequences
Band lengths:
Functional annotations
There are 0 annotated functions for this event
GENOMIC CONTEXT[edit]
INCLUSION PATTERN[edit]