BtaINT0017921 @ bosTau6
Intron Retention
Gene
ENSBTAG00000002392 | ANK2
Description
ankyrin 2, neuronal [Source:HGNC Symbol;Acc:HGNC:493]
Coordinates
chr6:13433477-13447928:-
Coord C1 exon
chr6:13447825-13447928
Coord A exon
chr6:13433702-13447824
Coord C2 exon
chr6:13433477-13433701
Length
14123 bp
Sequences
Splice sites
5' ss Seq
AGGGTGAGT
5' ss Score
9.25
3' ss Seq
CCTTCCATTTTAACTTTTAGTTT
3' ss Score
9.23
Exon sequences
Seq C1 exon
GTGACAACTCTAGCCAAGGAGGCAGAAAGGAATTCTTATCGTCTAAGCTGGGGCACTGAGAACTTGGACAACGTGGCTCTTTCTTCCAGCCCTATTCATTCAGG
Seq A exon
GTGAGTAAATCAATATTGTGTATCCAGATCAAGAGGTAAAAAGAGATGAGTGAAAATAACAGCTTTGTCCAGTAGCTTTAGCTGATGGCTAGCTTACAGGGGAAGTGACCTTTTTTAAAAAGGTCATGCTTTATCTGCTTTATCCGCCATGGAGTCTCTCCACACAAACAGACCAGCAAAAAGGGTTGAATTCCGCATAGAAGAACTGACCATTGTTTTAAAATAACGCATAGAACTGCGTCAAATAGCTTGTTAACTAACCAGAGTATACCTGTGGCCTCCTTATTGTTCATATTTTTGTCTTTAAGATACCTTGAAAAGAGGGGCAAGATCATTTGCTTTTGAAAGTTCTGCTTACTAAGATTGACTAGTTTAATAAATGCCTTTCCTTGCGTATTAATGCATCTAAAATAATGTTTACAGGAGTCTGAGTCATACAGATATACAGAGGAGTTCACATGGTGCTTGAAGTAAAAATATATTAAAAAGGGAGATTTGAGTGCAACCAGTTAGGTTCTCAATTATAGTTTTAAAGTCATTCAGGTAATATATATGCCACTACTTAAGAAATTCTGCCTATTTATATTAGCTTATTAAAAAGTAGGACTTTGAGTTAATGATTTTAAATATCCTTAAAGATGTTCTTAAGTTAGAAGAATTCAATTATTTGTAATATAAATTCCTTAAGGGGTTTTAAATTGTAATACTCTTTACAATTGGTCTTTTCCTTACATTTTAATGGTTTCAAGTTGTATAGTAATTCCATAATTATGAATAAACTTTAAAAATGTTTTTCTTTAATTACTTTTTAAACCCTGCTCATATTTTATCTAACTAAATGTAATATTTTGATTTAAATTATTATCCCAAACTCCTTATCCATTATCCACAGAATGATTTTGAGTGATGGATCCTTTATTGTTTTTATTATTCTAAAATATTCTCCTTTCAGGAAAGCATTCTAAGATACTGTAGTTTAAAATTTGGGACTTCTTAATCTGATCTTCTGTTAAAGGCTCTTAAAACTAGTTACATAGATATAAAATTAGTTACATAGATATTGAAAATAATCATAATACTCTTCTATGTTAAATAAGTAAAAGCTAGTTCTTAGTGCAAGTGTTATTCAGGGGAATAAAAACCAATTAAACCTCATTCAAATTTACTTATTTTAAGTATAAAATGAGATAATTAAAATCTGACAGCTATATGTGGTTCAAAAAGCATAACATCACATACTAAATTTTTCAACAACAATAATAAGAAAAAAACCTTGGGCCTAGAGTGTTGATGGATAATAGGTCAGAATTTAGAAACCATAATCTAGTATTTGAAGTCCATGTCCAGCCTACAAAGTGACAAGATTACTTTAAGCAAAATGTGACAGAGAAAATTTGTCTTATTGCAGACCAAGATTTTAAAGATCCTTATTTTTTTTTTACTATGAAACATGGTCACTGACTCTGATCCTCAACTCTGGCTGTACATGGAAATCACTTGGGAGCTTTAAAAATATTGATGCCCAGGCCCCAACTGAAACCAGTTCTATTACAGTCTCTGTTGCTGGGGCCTTGCCATTGGTATTTTCTACAAGCACCAGTTGTCAAATACATTTGTTTTATGTAGGCGATTAGAAAGGAACACCATTGCCTAATAAAGCTTCGACTATAAGTTTGACTTAGGTAATTAACATATGACTAGTTACCTCAAATATCTTTTTATCCTTTCCATTTACTTCAGTATTCTCTCTTCACACACTGTTGAATTCTGCAGCGCACCAAAGTTTGTGCCAGGCACTAAGGAAAACAGATGAGTAAGCCTTAGCCAGTACCTTTAAGAAGCTTGCTGAGGGTTGTTATTTGAATTTGGAAGACAGTCTACGAAAGAGCAATAACATGGGGGGAAGGCGCCAAGATGGCGGAGGAGTAGGACGGGGAAAACACTTTCTCCCCCACAAATTTATCAAAAGAGCATTTAAACGTCGAGTAAATTCCACAAAACAACTTCTGAATGCCGGCAGAGGACATCAGGCACCCAGAAAAGCAACCCAACTCCTCAAAAGGAGGTAGGAAAAAATATTAAAGACAATAAAAGAGACAAAAGAGGGAGGGACGGAGTTCCGTCCCGGGAAGGGAGTCTTAAAAAGAGAGAAGTTTCCAAACACCAGGAAACCTTCTCACTGCCGAATCCGTGCCGAGCTTTGGAAGCACAGAGGACAACATAACAGGGAGAAAAAATAAATAAACAATTAAAACTCGCAGATTGCGAGCCCTACGGTAACTCCTCCAGCAGAGAAGCAGCGCAGACGCCTGCATCCGCCATTAGCAAGCGGGGGCTGGGCAGGGAGGCGCGGCGCGGGCTGCATCGCTGAGAGTAAGAATCTGGCCTGAATACCCTGAGCACTATCTGAGCGAAATAATTTGGGCTAGCAAACCAGACTGTGGGATATCTACCATGCGAAAAGCCAGCCCTAACCTAAGACACCGCCAGCCCGCGCACGGAACAAAGGACTAAACAGAGGTAGCCGGCTGCAAACCTTCCCCCTCCGGTGACAGGCAGTTAGAGCCGGAAGGGGGCAATCGCAGCCCCAGAGAGACATTATCTATAAAACTGGCTTCTTTGCTAACTAAAACTTATTGGGGGTCTGGACGGTCAACATCTGCCTGAGAAGGTGCGCCGGTTTTACACCCAGATAACCAAGTGGCGGGGAGGCGATAAGTCGCAGCATTGGCGCTCACCAAACACCTCATCACCTGAGCTGCTCGGACCTGGGAAGAGCACAAAACGCAGCCCCAACTGAGTCTGCGCCTCTGAGGACTACCTGAGTGCCTGAACCTGAGCGGCTTGGACCTGGGAGGTGCATGCAACCCAGGCCCAGCCTCGGATTGTTCCCGGCGGAACAACCTAGAGCCTGAGCAGTGTGGGCAGGGAGGCTACACGCGCTGTGAGCGGGGGCAGACCCAGTGTGGCTGAGGCACTGCGAGCGCACGCCAGTGTCATTTGTTTGCAGCATCCCTCCCTCCCTCCCCATAGCGCGACTGAACAAAGAGAAGAAATACAGCTCCATCCACCAGAACACCGACACAAGCTTCCCTAACCAGGTAACCTTGACAAGCCACCTCTACATACCCACACACAGCGGGGAAACGCCACAATAAAGAGAACTCCACAAACTGCCAGAATACAGAAAGGACTCCCAAACTCAGCAATTTAAACAAGATGAAGAGACAGAGGAATACCCAGCAGATAAAGGAACAGGATAAATGCCCACCAAACCAAACAAAAGAGGAAGAGATAGGGAATCTACCTGATAAAGAATTCCAAATAATGATAGTGAAATTGATCCAAAATCTTGAAATTAAAATGGAATCACAGATAAATAGCCTGGAGACAAGGATTGAGAAGATGCAAGAAAGGTTTAATAAGGACCTAGAAGAAATAAAAAAGAGTCAATATGTAATGAATAAGGCAATAAATGAAATTAAAAACACTCTGGAGCCAACAAATAGTAGAATAACAGAGGCAGAAGATAGGATTAGTGAATTAGAAGATAGAATGGTAGAAATAAATGAATCAGAGAGGATAAAAGAAAAACGAATTAAAAGAAATGAGGACAATCTCAGAGACCTCCAGGACAATATTAAACGCTACAACATTCGAATCATAGGGGTTCCAGAAGAAGAAGACAAAAAGAAAGACCATGAGAAAATACTTGAGGAGATAATAGTTGAAAACTTCCCTAAAATGGGGAAGGAAATAATCACCCAAGTCCAAGAAACCCAGAGAGTCCCAAACAGGATAAACCCAAGGAGAAACACCCCAAGACACATATTAATCAAATTAACAAAGATCAAACACAAAGAACAAATATTAAAAGCAGCAAGGGAAAAACAACAAATAACACACAAGGGAATTCCCATAAGGATAACAGCTGATCTTTCAATAGAAACTCTTCAAGCCAGGAGGGAATGGCAAGACATACTTAAAATGATGAAAGAAAATAACCTACAGCCCAGATTATTGTACCCAGCAAGGATCTCATTCAAGTATGAAGGAGAAATCAAAAGCTTTTCAGACAAGAAAAAGCTGAGAGAATTCAACACCACCAAACCAGCTCTCCAACAAATACTAAAGGATATTCTCTAGACAGGAAACACAAAAACAGTGTATAAACTCGAACCCAAAACAATAAAGTAAATGGCAACGGGATCATACTTATCAGTAATTACCTTAAAAGTAAATGGGTTGAATGCCCCAACCAAAAGACAAAGACTGGCTGAATGGATACAAAAACAAGACCCCTACATATGTTGTCTACAAGAGACCCACCTCAAAACAGGGGACACATACAGACTGAAAGTGAAGGGCTGGAAAAAGATTTTCCATGCAAATTGGGACCAAAAGAAAGCAGGAGTCACAATACTCGTATCAGATAAAATAGACTTTAAAACAAAGGCTGTGAAAAGAGACAAAGAAGGTCACTACATAATGATCAAAGGATCAATCCAAGAAGAAGATATAACAATTATAAATACATATCCACCCAACATGGGAGCACCGCAGTATGTAAGACAAATCCTAACAAGTATGAAAGGAGAAATTAACAATAACACAATAATAGTGGGAGACTTTAATACCCCACTCACACTTATGGATAGATCAACTAAACAGAAAATTAACAAGGAAAAAAAAAAAAAAAAACAAAACATGTATCTATAAAGCTCACTAAAGCAAAGCACAGTAAAATGAGGTATGGCAATAAAAGGCGTTAAATTTATCAAAAAAAAAAAATAAAGTGCTGAAAAATTAAAGCTGTCAAAAAAAAAAAAATCCAATAGCAGCAAATATCTAGACAATTTATATAGAAAAAATGATTTTTAAAAGAAAACATTAACAAAGGAACAAAACCAAGTCAATGTCTAGTAATAAGTCTAATTAAAAATGCATTAGATTTGTATAGAAATATGTATAAAACCTTACTGTGGAATATAAATAAGGATCTGTAGATTCAGTGTGCTCATATACTGGAAAACCTGTTCTTACAAAGGTGAAAATCTCAAAAATTAATTGGCAAATTCAGTGTGTTTGAAATAAAATTCCCCACCATGTTTGAGGAGCTTAAAGATGAGCTTTAAAATGTTGTGTAAAAATAAACAGTCATGAAGGTACAAGAAAATTAGGAAGAATGTGAAGAATAAAAGAGGACATGTCTTTCTATATTTAAGCATTCCTTTTGGTATTAATGCAGCAAGAGAAGCATATGTCAATGGAACAGAATTAATAACCTAGAAAGAGAAATTCTCAAAAGAAGCTCTTGAAATATGACAAAGGGAGCATTAAAANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGAATAAGTACTCAATAGATTTTAGCCATTAGTATTTATACAATCCACACACACATCTTTAGCAAATTTCCAGTTAGTGAAACAAAAGTATTCCGGATTCTCTAAATGGGAATAACCAATGTGGTATAATTCATAATGGCAGTGTTTGACTTATTTTTTATCAGGTAATCTATCGTAAAGTTGTGTTTCTACCATAGTATTTGAATGAACACTGCAAAAGATGACTCCAGTGGAATGGATACTTACACTAAAAATTCAGTATTTCTGAACGTGATGGTATTTGAAAGCTACTGTGATATTAATATACATAGTATTCATAATGTATCATATAAAAATGACTTCTTATAATTTTATTCATTATATATCAGGTTCCTGAGTAATAGTTTTTATGTAATTTACAAGGAGCTGAGTTTATCTTAAAATAATTAGGTGAATTCTAAGTCACTTCAAAGCCTGCCCAAATTGTAAGAAAAAAAATAATTTTTGATAGAGGAGATAATAAAGTTAGCTTTTATATGCATATGTCACTAATTTTGTGGATAATGATCTATTAGATTAGATGAGATTTTAGATTAATGGAAGACACAACTTCTACCAATAAGCACCATTATTTTCTTTTATTTCTACTGTTTCCAATGACTAGTGTTCATCACAATAGGAGAATAGGTCACGGTGATTAAAAAATCTGTTCTGACCAATAAATACAGCCAGTATCTAGCAAAAGAAAGGCTGACTGTAATATTTTTGTTGTTGTTCTTAAAGAAGTTGCCTTACTGATTCACAGTGTGATTATTATTTCCAGTATCCTAACCGTGATCACATCCAGTGCAAGCTTTGACAAGAGCTTAAATTTTACATTTCTTCCCCATTTCATAAGTGCATAATGAATCAACAGATGTAAGCCACAAATTCCTATCAATAGCTAGTTTTGTGACTCATTTTAAGTATTATTTCAAAAGTCTTTAATGTTATAGTTTTTTAATGTCAGCCAAGTGCCAACAAATAAATGTCAGTTCATGACGTCGTATATAAGACATAGTAACTAGAAGTCAATAGGAAAGTAATCTTTTATAGGACTTCTTTTTCATGAAAACATGTTGAAGATGGTTTTGCTGTGAACCTAAAACTACTCTAAAAAATATAGTCTATTTTAAAAAAAATGTAAAGATGTTAGCCCAAATAGTGGAAGTTGATATTTGAAATTCATAGAAATTAAAGATGTTTTTCATTTGACGACATCAATATTTATCTAAGTACCTGTGGCAGTTAATTTAGTTGTTCATGTATTTCAAACACTTTTTTTTTTTAATGGTGCATGAAGGTAAATTCTTTGGGGTGAAGAAAATTGTTTCATAAGTAGTGAAACAACTGTTTCGTCAAGTTAGGTTTCTGGTCCAGAGTATACACTTATCTGTAAATCATCAGGTGCCGAAAACCCAAGTGGACTCTCTGAAAAGGTACGGAGCGTTTTGAGGAAGAGCAGCCTCAAGTAGAAGAGGAATGAACGACAGGACTTAGAGCGAGGTCAAACAGTGTGACCAGTGAGGAAGACAGGGAATGGAAGTCTTGGAAAAGCACCAAGACTTCGTTCACATAGTTTTTGTTACCTATAGTAGGTAATTAGTGTTACCTACTCTGCCTTATAGTTTATGCTGCTGTTTGTCATTGGAGCCAATTTTTAAATTGCGCCTTTTCTGTTTGCATTTCTTATGTAGCAGCCCAAAGGGCATTACCACTATTTTGAAAATACTAAAAGTGTGAGTGAAAAGCTATGGAGGCAAAACTATGTCTATCAAATGAAAGACTTTTTATCTTTCATTAAACTGCCCCTTGATGTTGTGTAGCTTCTTGGATATTTAGACTTTGAGTACCCACATACGCCAGTGTTGAATAAGGCCACAAATCCCTCTCCATTGGTTTTATATCCCAGTTCCCTAACCTGGGAGTTACTCCATAGCCCCCATATCTGGGTCTTCTCTCAGCCTTTTCAGAGAGCTGTATCTCATTTGTATTTCCATCCTTTTTTTTTTTTTTTCAGTGAATACGGTATTGGTATATAAATATTTCATTTGAAAGTCACTTCTGATTTCCTTCTTTATATTTCACTTGACCCATTCCTTCTCTGTGCTAAAGTATCTATTCTGTTGCAGCCGCACCTCTCCATGTCTTGATCGTGACAACAGCAGGTGAACTTCCGCATAATTCCTTCTCTGAACATGTTGCCTCCCCTCTTCCCCTTTCTCCACGTCCTTCTCCCTGTACCTTGCCTCGGGATGCTTTAGTGTGACCATACCTAGCCAGAGAGAGCAAGAGAGGGAGCACATGAGGGAGAATGATTTATTGCCTCCACGTCATGACCATTACTGAACTCCCCATTATGGTACAGGGAAAGCGGGTATTTGTTATTTTGTTGGAAATAAGTGGGGGTATGCTAAAATGAATGTAGACCTCATGGCCGTCTTCATCATAAGTCTCCGTGTCTCTGCTTCATTTGAGAGAAAAAGGGCTACATAGAGCTGAAAGATGTTATTCCCAGCAATTATGCAAATTGGTTAAGCTATTTTCAAGTTATAGTAAAGGTTATGATTTTAAGTGTCACTTAGCAGTTTTTTAAAGCTATAGTCTAGGGGAACCAAAGGCTGAAAGTTTATTAATAGTGCACTTGCTTGCTAGTAGTGCTTTAAGTGCAACTTTTGATATTTTGGAAATTGTACTATAGAATGATTCCAGTGTTCTAAAAATATCTATGATTCTATGTTATTTTGATTCTATGTTATTTTGATAAAGTTATTTTTAAAAGTTCTTATCAGACTACTGGTTATAGTATTTTTATTATATAGTCATCCATCAAGATCAGGATACTGAAGATTGTCTACAATCAGGCAATTTTCAATTTTTACACATTTATATCCATTTTTTTACTTTTTCTGCAATACCCACTAAATATTTTGTGTCTATACATGAACATAGTGATAAATACATTTTTGGTGATGTTAACAGGTTTGAGGCATTTTATTTCAAAGCTGTTTTTCATCAGTTTTTCAGTTGATGGAATTTGGAAGATTGGGAAGAAATTAAGAAAATTATAGAGGACAGGGAGCTCACGGTATGGTTTTGTCACAGTTACCCAGAAATCAGATTTAATTTAAGGCCCTCTTGCTATGTATGTGTAGATCACTGAAGCACCCTGATGACAGATTTTTTTTCCTATTTTCACTCAGTAACTAACTCTGAATGCTGCAATCTCCCCCCCATCCTTACCCCCATGATCCTGGATGAATTAAACGTAAACCTAAGGATTCATAACTTTTGGGGTGGAGGATATAGTCCTCAAAAGACCAGAATCACTGTTTTCTGCTGCCTCCTCTGAAGCATGTATCTGTCTAGCTAATCAACTACAAATTCCTAGGCAAGTCATCTGCATAATAATGGTGGATTGCTTTTGCTTTTATTCCTTTTAAATTGTGATAACACTATATCTCACAATTTAGAAAACTTCAATAAGGATTTCTACTTTGCATGACTGCTGAATTTCCTTTGAAGAGTAAGATAAACAATTAAAACCAAGTATGTTATGTGATGTTTTTTTGTCTGTACAGTCTGAAGTCAATGTTCAGTGGAGTATGTGTATACATTTTCTGCAAAACTACTCCTGATTGTTTTAGCCATACAGCAAAAATAGTATATATTTCGTGGAGGAATAGCAGTTTGTTTTTCAAATAGAAATGCTTCCAGAACTTCTGAAATGGAACATTCCAGTAGGTTGCCTAACCTAGTTAGAATTTTAATACCAGAATGCCACATTAGAGTTTGAGTTTAATCAAAGTCTCTCATTTTGGGGATGAGAAAACTGAAACCTAAAGATGTTAAATGCCTTGCCCGAGGTTAGAGCAGTAATTCAACACAGGGTTAGATCTCATGATAGATCCAAGCTGGAGCCAGGAAAGAATGTAAAACTTGTTGAATTATCTTGTGCTCTGTAATAATAGTGTTTTTTACCTCTTCTTTAGTATAGTTCATAAACTAATCAAAACTCCGTATTAAACTACTTTAGCAAAGTTCTAGGTTCATTGTAGATATTTAATAAATGTTAGTTACTCTGTTTAATTTTTAATATGCTAATTTTAAGACATTCAAAATATATAAAATTATATGCATTTATTGAATTCTATCTGCTTGACCCACAATGATTTAATTCTTGCTCTACCCTTAAGTGGTGATAGGATTATCCCCCATTGACAAATGAGGCTTCAGTCACAGCTCACAAACAGTGAAACTGAACTTCAATCCATTTATCAATACATTTTACTTTAGTTCTTTTCATCTCCCAATGTTAGGGTTAGGGTTATCTTGTCCCATTTTTAATCTCCTGAAAATATGAGAAAATCAAATTTACTTAATCAAATCTGGTATGTGAACTAATTTCTCTCATGATTCACCCTAACCTTTCACTTTTTCCTGTGATACAAAAAAAAAATAATGATCTCTTACAATCTGCTTTTTGAAATTGTTATACATCACAAAATAACTATCCACTAATCTGTTACCTAAGCTTCGCTGGTGGCTCAGTGGTTAACAACCCGCCTGCCAATACAGGTGATGTGGGTTCGATCCCTGGGTTGGGAAGGTCCCCTGGAGAAGGAAACGGCAACCCACTCCAGTGGGAAATCCCATGGACAGAAAGGAGCGTGGCACACAGAGTTGGACATAACTGAATGACTCACACACACATCCAGGTAGTAACACCTTTGGATATCCTGGTATTTTTGATGACAATATTCAAATGCTAAGCCAATTTTATATTATAAACTATTAGGATTAACTGATTAGCATGTTGACTTTTATCAAAAGACTTCTCATCAGTACCTAGAAAAAAAAGTTGCTAATTATTTCTCTTATTTCTTTTAGGGAAAAGACTTTTACAAAGAATTAAACTTTAATGAGTCTTTTCCTACCAAGAATTAAACAACTTTCTACTTTAGCCTTCTTTTCAATTAGAAATAAATATATACAGCTTCTCACAACTTACCCTTTTCACTCTTCCATCATTCACTGTTAAGCAGCATCTATTTGAGTCTGATTTGCTTAGAGTATTTTCTAACTAAATTTGTAAACATTTTTATTCATTTTGACTATCAATATTTAGCTCTTTCATGACTTCCCATCCTTTTGTTTCTTTCTTGATATCCTTCTGATTTACTTTCTTCTCTGCCTGCCTGCCCCTCTCTTCCTTCATCTCTCTCTCCCTCTCTCGTCTAATAATTCCCTCAGTAGAGCTTGTTGTTTTTTATTAGGCTAGTGCACTTCCTTTAGTTATTTCATAAAGACACAAAAGCTTGTTTTTGTTGGAAGTTTTCTCTGAATTAGACACATTGCCACTTTAATTTTTCAAATTTGCTTGCTGTTCTGGTGCGATACTTAAATATAATTTTCTAGATCTATGATGACACCAAGACATATATAGTTAAATTTATCTACTGCAGCTCCAGTCTTTAAGTCCTTTTACTTCCCAGTCTTTGGTCTTTCTTCATACAGTTTTCACTTCTAACAAAATCATTACTTTGGTGTATCCAAACTCTTGGCTTTTTGCTTACTTTCATTTTCTACTAATCCTCTATCAAGGTAATTGAATATATTCACTCTCTCATTTTCAAGCAGGGAAATGCCTGTAGAGGAATATTTAATATTGAAGGCAGTCCTTCTCAACTAAAGCTATTTTATGAACTGAAATGTCTGAGTGTAGTAATTTGAGTGAGGTCTGACTGGATTGGTTGTCCAGGAATCAAAGAATTAAATAACCTTCTACTTTAGCCTTCTTCTCAATTAGAAACAAATATATACAGCTTCTCACAACTTACCCTTTTCACTCTTCCATTCATTCACTATTAAGCAGTTACTTATTAACTGCCTACTGTGTGCCCCATTCACATAGCACTAGGCACTTGGGACACAGGAAGAAATACGGAGCACAAGGTCACTGCCATTGTGACACTGATATGGACCTGAGTGTGGTCTAGTTCCTTCCTCCTTGACCAGGAGAGTAAGCGATTCCGAGGAAGTGAAATCGTCATGTGACATTTGGGGCTTAGACTGTGAGCATCCTCGGCAGCAATGGAAGACATCTGGGCTATGTCTTTACTTTCTGTATCCTTGCTAAGTTCCTAGCAGCATGGAAATTATGGGGTAAAGGAGAACAAAAGAGAATTTTAAAAGAAAGTCAGTAACATAGAAATCAGAGAAAGTAATCAAACATGTAGGTGCTTAGACATTGTTACAGCCAAGTATATAGCTACTTCAGTTTACTCCTTACAGAATGCACCACTAGAAGATATTCTAAATGGAATATATAGGCTGTAAACCATTACTGGAATAAATATAGTGAAAATATAATAGCATGTACCATGAATGGGGAAACACCCTGGATGCTTTCAAAAAATAGATAGTATTGGATATTGATGATATTAATCAGATGTATTATAATAATTCCTTACTTTTTTGAGTCCCTATTCTTCAGCAATGGTGCTAGTAATCAAAAGATGAAAAAGAAATCAAAGAAAGTAGAGAAAGTCAGAAATACAGCATTGAGTTTGAAATAGCACCTGTTGAAACTTCAGTCATTTTTTTCTAGTTTTTATAAAAATCAACATAAATATCATGCTGCTGTTGCGGCTAAGTCGCTTCAGTCGTGTCCCACTCTTTGTGACCCTAGAGACGGCAGCCCACCAGGCTCCCCTGTCCCTGGGATATCATAGTCAAATGAAATTAATAAAATGGGAAAGAAACCTTTATAGTCATCTAGACGTTTTACCAGTTCTTTCATTCTTTTTGAGCAATAGTGCATTTTAAAAAGCAAATAGGAAATAATTTAAGAATTCCTGCTTAAACACTAGTAATACGAAAAGCAGCCAACATTTTCTCGCTGTATTTTGATAAAGACCAGAAACATCCACACTTCAGAACTGACCTGCTGCTTATACTCCCCAGTGTGTGCCCCGTACTAAAAGCTGAGAGGATGGGGTTTAAACCGGTAGGTCTAGACTGGCTCCTGCATGGGGAAAGAAGTGTGAGACCTCCTCTCCTGGTCTCATTCTGCGTGACCTGCTTCAGATAGGCACTCTGGGCTCCTTCACAGACGTCTGTATTACTAGCAGCAGGGTTCTGTTCAATAGCATGCTTAATGAGGTCTGTGTTCTGCTATGAAGAGGATGCTAAGGTATTTTTCCTTCACTTATTTAAAAATAACACAAATATATTGTGTTTCTATCCCATAACTTACTTTAATGAAATACCTTTCAAATGTTTTACATGTTTGTCATGGATGTAATATCTGAGTGTGATGAATCTGGTATAGTTCTGTGCTGGTTAAGCTATCAGTAGATCTTACGACACCTGTGTGTTGCTTTCCTCTTTCTGTTTTGGTATAAAATTCTTGCAAATGCAAGGAGAATTGGGAAAGACAGTAGGGTGTGCACATTATTTGTGTGTGTCTTTGTGTATATGTACACGACCATCAGATTGCCTGGTTTAATTTTTCCTCCTTGACAAAGTAAGTGCCTCCCAGACTTTGAGTTTTACACTAACCTAGTGAGACAAACTCACACTAAGCTGCAGAAACATCCTGAAGGAACCAACTTCAGAGTTGAGACAAACCCTTTCTCTTGGTACAGTTAAAAAAGTAAACAAGCCAAATCACCTTGGATCATTACTCCCTTATTCATGAACAATTAGGTTGGCAAAAAAGAAGCAAAAGAAGAGATGCCTTTACATTTCTGAATTACTAGCTGTGATTTTCCATGTTTAATTTATTATAATTTGGGGAAAATCACGATGCCCAGATGTCTTCCATTAGCATGAGCCCAGGATTTCCCCCTCAAAACCCAGAGCAGAGGGGATTGATAATCTTGTTTTCTTTCTCTCCTATCAATTAAAATGGTATAGAAGAGATATTTCTACTTAAGAAGTGAAAAAGCACCTTTGAATCGGTAAATGGGCTCTTTCCAAAGCATTTGATTTAAAAAAAAAAAGCATTTGATTATTTTGGTTTTCCTCTTTTTTAGAATGTAATCAGTTAAAAACCTGCATCCTGGGTATGACAGTGTTGGAGCAGGATGCATGTACATGGGTTTGGTCTTGAGAGAAAGCCTTTGAATTTTTTTTAAGTTGTAGAATTATGCTGAAATGATCTGGACATGATGTAATTTTTAAAAGTCAAGTTGAGTTAACTTAGAAAAGCTACAATTTAGTCTTTCCTCTCTGCTCTATCTTTATATTATTTCAAACTATGGATTTTTCAGGACGCATATAGCAGGAAGCAAATGCCTCTGCATTTATAACAAAAGGAGACTCATATTCTTTATGTAATTTCATTCCACTTTCTAAGTCAATTGGATGTATGTTTAATTTACAAGTTCATGTTTAATATCACCATTGTCAAATTAGGAGCAGAACTGTTCTTTAGTAACAGATCAAAAAATACAAAAATTAAAACAGCAACCAAACTGAAATAAAGGCACTGGTATAAAGTAAAATTACTTTTTAAGGGCATGTTTTTGGCCACTATGCATATAAATAAAAAATGTTTTAAGAACAGAGCGTTATGGGAAAAAAAGCTAACTTGACAAAGCTTGTTTATCTGCCTTCGATATTTCAAAACACCATCTAACCTTCCATTTTAACTTTTAG
Seq C2 exon
TTTCCTGGTTAGTTTTATGGTGGATGCCCGAGGTGGTGCTATGCGAGGATGCAGACACAACGGGCTCCGCATCATTATTCCGCCCCGGAAATGTACCGCCCCAACACGAGTCACCTGCCGACTGGTCAAACGCCATAGACTGGCGACAATGCCTCCAATGGTGGAAGGAGAGGGCCTGGCCAGTCGCCTGATTGAAGTTGGACCTTCTGGTGCTCAGTTCCTTGG
VastDB Features
Vast-tools module Information
Secondary ID
ENSBTAG00000002392:ENSBTAT00000003097:37
Average complexity
IR
Mappability confidence:
NA
Protein Impact
ORF disruption upon sequence inclusion
No structure available
Features
Disorder rate (Iupred):
C1=0.098 A=NA C2=0.002
Domain overlap (PFAM):
C1:
PF0079115=ZU5=PU(1.0=2.9)
A:
NA
C2:
PF0079115=ZU5=FE(89.3=100),PF0079115=ZU5=PU(0.1=0.0)
Main Inclusion Isoform:
NA
Other Inclusion Isoforms:
NA
Associated events
Conservation
Zebrafish
(danRer10)
No conservation detected
Fruitfly
(dm6)
No conservation detected
Primers PCR
Suggestions for RT-PCR validation
F:
No suggested primer sequences
R:
No suggested primer sequences
Band lengths:
Functional annotations
There are 0 annotated functions for this event
GENOMIC CONTEXT[edit]
INCLUSION PATTERN[edit]