BtaINT0061015 @ bosTau6
Intron Retention
Gene
ENSBTAG00000002278 | FBN1
Description
Bos taurus fibrillin 1 (FBN1), mRNA. [Source:RefSeq mRNA;Acc:NM_174053]
Coordinates
chr10:61913807-61926410:+
Coord C1 exon
chr10:61913807-61913905
Coord A exon
chr10:61913906-61926314
Coord C2 exon
chr10:61926315-61926410
Length
12409 bp
Sequences
Splice sites
5' ss Seq
CCAGTGAGT
5' ss Score
8.28
3' ss Seq
TTTTTTTCTTTCTTTTCAAGTCC
3' ss Score
9.4
Exon sequences
Seq C1 exon
CCATTTGCCGGCATTCCTGTGGGGATGGATTTTGTTCGAGGCCAAATATGTGCACTTGCCCATCTGGTCAGATAGCTCCTTCCTGTGGCTCCAGATCCA
Seq A exon
GTGAGTATAACATGTCATTATATATAATATTATTTTATGTGGTTATGCCCTATTTTCTCCTAAATTTGCTTTTGGCTTTTCTCTTGCCTGCAATACATTTTTTTTTTTTTTTTCACTAGAACATCTGCCTTCTCTGCTCTGCCCAAAATACTTGGAATGGCTCTCCTCAGTCTGGCCTCCCATTTCCCTTCTTCACTTTTTATAGGGAAATTACCTGTGGGACATAGTTACTATGAATAATATAAAGATTGTGGCATCCTTCTGTGTAGGTGTCATCTTATTTATCTTTGTATCTCCAGTGTAAATACCATAAAAGATACTCAATGACATGATCATTTAATGAACATTTTTGACTCAAGGAAACTAGGCATTCTTCCTTGTGGTACTGAAGTAGGAATCTGATTAAACACTTTTTACAACTTGAGACCCCTGCCTTTTGCAAGAGGACAATATTAGGAGTCATCATGGCAGTTTACTGGGGATGATTTATCATGAAGCACAAACATATTTTGCCTTTTAGAATTTTACCACTTTGTTCATTCCATGATGCCAAGGAAATATCCACAGTTCATTATTCAGAGACTTTGCTGGCATATTCTGTTGTTTTTGTTTTTAACATGGGTGCTCAGCAGTGAATTAGGGGAAATGTGGGGGTTGGGAAGGAGGTGAGTCATTAGTTGTTAAAAAATGAAGTTCAATATAAACAGCCCCTCAACATCTTGACCATTACCAAGGCAAAAATCTTAGGTTCCTTTTCCACTTCCAATTTCTTCCCTTACAGCATATTCTGGTTTTGACATGGTTTTGAGAGTATTATGGAATATTGGGAGCTTCCCAGGTGGTGCTAGTGACAAAGAACCCACCTGCCAATGCAGGAGATGTAAGAGATGCAGGTTCGATCCCTGGGTTGGGAAGATCCCCTGGAGAAGGGCATGGCAACCCACTCCAGTATTCTTGCCTGGAGAATCTCATGGACAGAGGAGCTTGATGAGCTATAGTCCATAGGGTCGCAGAGTCAGACACAGCTGAAGCAACGTAGCATGCATGCATGCATTGTGGAATAAGTACATTCTTTTTTGTTGATTGCTAGTAGAGACTTGAGCATGATCAAGATCCTATTACCTATTAAGTTTAACTTTGGTTCTCATTTAACTGTGGTTCTCATGAACCAACTAACAGAATGGGGCCAATAGTGCAGGGCAGCAGACCTTCTTGGTGCCCACTCACATACCTTGGCATTCATGGGTTACACAAACAATTCTGCCTTTAGAGCTCTGTAACATTTTTCTGGCCAGGGAGCATGCATGGCAAGCTGGAAAGGCTGAGGGGATTAATTAGAAGCACCTTTTAACCAGTGACAAATGGAAAGTGTTGGATTAATGCCCGTACTTCCTTGCCTCTCATTTTGCTTAACTATGAGGTGTGTTATGCACTGTCTTCTAAAGTTCCCTAGTGGAGCCCGAGCTGCCCATGTAGGAACAGGCTTGAGAATGTACTTCATTGGTTTCCTTCTGTTACCTGTCTCACTTTCCCAGTCTCTATACCAGTGTTTCCTGAAATTACTTCTAAAAGAAACCACTGACATTTGAGTTATTGTCTCAGAATTTGCTTCTGGTGGAAACCAAATGGAGACAGATGAGGACTAAATACAGACAGTTGTAGGTTGGGATAGAAATTCTCCTGTGGGCTGGGGCTCATTTGCTTATTGCAATGAGTATAGCATGTTCTACTTTTTTTTTTTTTTGCTGTTTTTTTAACTTTGTATTTTGTATTGAGGTATAGCTGATTAATAATGTTGTGAGAGTTTCAGGTGAACAACAAAGGGTAGAATGTTCTTTCTTGATCTCATCTTGGTTTTGAATGTATGTTCTCCAAGCAACAAGAGGTTAATCCCATATATCAGGAGCACTTGAGCTGGAGGAGTAGCAGGAGGCAGAGTGCTCAGTTGGCAGCACTTTGGGGAACATGCTGGATGTCTCCACCTCTATCAGGATGATGACCTCCAGGTTGCCTCTGAGGAGTGAGAGCCTTGGGTGGGGAAGGAGACTACATAGCAAGTTGGGAGTAGAACCATCCCTCAGATTGGTCCTTCAACCAGCCACTAATACACCACTCCATAAGGGGGAGAAAGTATAGTCAGGTGGCAAACTGGATATCCAGCTGGAAAGGTCTTCAATGATAGTGTGAGCTGCTAATGATTTAATCAAGTAAAAATCACGAGATGTGAAGAAAAGAGGTTAATAAGATCAGAGGGAAAAGCTGTGGTTCTAGTACATTTCGAGCTAGTAGCGCGGTGGGAGGAGTGCAATGGTAAGGTCCTGTGGGCCAGATTAGGGTAGAGGCTGAAGTCCAAGGCTTGTGCATGCTAATCTTTGAGGAGGTTTGGGTCTGTTTGTGGTGCTTGTCCACTGGACAAAATCCAGTGGAGAGTGAAGTGAGGGGGAGGACACGGTTTCATGAGGGTTTTTGAGGCATTTGGAGCCTTTAAAATCATTGGCTTGGACTCTACCTGAACTAATAATGTCCAGACAGCTTGCACAACTAAAGCTGGCAGAATGTTTTATTAATAAGTTAAGGGTAGCTGAGGAATGATCAGAATTCATTTCTGATCTTTTAAAATGATGTTCTAGGAAACAGCTCTGCCATCCTGTAGAACTTCCTGCCCATGGTGTGGTAGACAAATGTGGGTAGGTCACTTTGCTAACTCCCCTGGTAATAGAAAGATAATCTAACTCAGTGAAATGTTTGCATTCACAACTTGTGGTTCTGGTAAGAAGGAGTAAATTTAGGTCATTTTACCAATATTTCCTCTGAGAAACTGTATACTTGTTATGTGATGGAGTCAAGGAGGTCCAGGTGAGTTGTAGGACCTGGGAGGCTTTAGCCTTCTTATTTGAAAATATAAAGAATGAAAGGAAGGTTTTTCTTTCAGGTTGTTTCCAACTTGTGTCCTGTGACTGTTAAAATAGGAAATGATCTCTTAGTGACCTGAATGAGAGATTGCATTTCCAGAAAGTCCAAACTGCCAGCCAGCAATTCCTTTGGACACCAGGAAGTCATGGCTTCCGTTAACCTATTGGGAGTCTTGCCACCAGTTGTTGAGGCACCAGGGCAAAAAGAGGATTGGCTAGACAGGCTCAGAACAGTGGGTTTTCTGGACTTTAATTCTAGGTATATTAGGACTGCTCTCTACTCTCTCAGTCTCTGAGGCCAGAGATGGATCCTGAGCAATTCTAATTCTCATAAAGACCTGTCATGGGTGATTCATGAATTTTCTCACACTCTCCTTAAATATATATAAGTACAATAGATAAGTAAAATAGATAAAGTATATAAAATAGATATCTAAAATAAATAATATAGATATATAAATATAATAATTATCTTTTTAAATAGTATACAGTATATTATTATAAAAGGTGTTCCCTAAATTTCATATTTTAGAATTTTGAGTTGAGTTTATGCTCATTCTATTTTATTCTTTATGCTTCTTAAAAGGATTAAAAAAATTAAACTTACTAGTTTGAGTTAATGGTAGATTCACATTCAATTGTAAGACGTACTTCGTAGCCATCCTGGGTGTCTTTTACCCAGTTTTCCTCATGTTAATGTCTTGTGATACTATAATACAATCAAGTTATTGACATAGATACAGTCAAGCTACAGAATGTTGCCATCACCACCAGGATTCTTCATGTTTCTCTCATTATCCGTTTCCTCCTACATCCTCCTTAACCCTGGCAACCACTAATCTGTTCTCCGTTTCTATAATTTTGTCATTTCAAGAATGTTATATAGATGGAATCACATAGTATATAACCTTTGGGAATTGTCTTTTTTCACTCAGCATAATTCTCTGGGAATTCATCCTTTTGTGGTTGTTTTGTGTATCAGTACTTTGTTCCCTTTTATTGATGAATTTACATGCTATGAATGTAAGGTTTGTATAGCCATTCACCCATCAAAAGATATCTGGGTTACTTCTAGTTTTTGGTTATTCAAACAAAGCTGCTATGAACATTTATGTACAGGTTTTTGTGTGAATGTAAGTCTATTTCTTTGGGATAAATGCCCAGAAATGCAATTGCTGGGTTATATGGTAGTTATATATTTAGCTTTTCTAGAAACAGCCAGCTGTTTTTGGAGTGGCTGTACCATTTTACATTCTCACCAGCAATGTATGAATGACCCAGTTTCTTTGCATTATCACCAGCTATCAGGGTTGCTGCTGTTTTCAATTCTAGCTGTTCTGATGGGTATGTGGTAATTACATCACTGTAATTTTAATTTGCATTTTTTCCTACTGGCTTCTAATGTTTATTATTTTTTTCCTGTGCTTATTTGTCACCTGCATATATCTTCTTGAGTGAACTGTTGTCTCTTCACGTCTTTTGCCTTGATTCTAATTGGATTCTTTTCTAATTTAGTGTTTTGAGAGTTCTATGTGTACTTTAAATCCTAGCCCTTAATCAGCTATGTAATTTGCAGACGTTTTCTCTCACTCTATAGCTTCCTCTTCATCTTCTAACAGAGCAAAAGTTTTAAAATATGTTTGAGTCCAATTTATCAATTTTTTCTTTAATGGAAAATAATTGTGCTTTTGATCTCAAGTCTAGGAACTCTTTGCTGAGCCATAGATCCTGAAGATTTTCTCTAGTTTTTTTTTTTTTTTTTTTCTAAATGTTACATTTACATTGAGGTCTAGGTGTAGTTGATACCTGTGAATGTCTGATTCCTCCAGCCCACTTATTGGGTTGGCCAAAAAGTTCATTTGGGTTTTTCCATAGGATGTTTTTGGCCAACCTAATATTTCCAAAAAGGCTGTCCTTCATCAGTAGAATTACTTTTTAAGTTTTATCCAAAAAATCAGTTGGGTATATTTGTATACATCTACTTTTGGTGTCTCTATTTTATTCCATTGATCTGTCTGTCCTTTCTCCAGTATCGTACAGTCTTGATTACTGCAGCTTATGGTAAGTTTTCAAAACTGAGTAGACTAATTCCTCCCACTTAATTATTCTTTTTCAAAATTGTTATTCTAGTTCCTTTGCTTTTCCATATAAATTTTAGATTCATCTTGTCTGTATATACAGAAAATATTCTCTAGGAATTCGATAGAACTGGTTTAAATCTGTATGTCAGTTTGGAGAGGATTGACATCTTTACTGTTTGGAACCACTTTTAGTTTGGGTAAGATTTTATCATTTTTAATTCATTTCAGTTTACTTAGAATTTGGGGTACTTGTACTCCCAACCCGAATCCAAGCTTAAAGGATGTAAGAAGCCCAGGGGAACAATTGTAGAGCAGTGGGTTAGCAAGTTTGAGCAAGTATGGTGCAACCATTGCTGAAAGTTTAAGTATGAGCATACTCAGAGGATGGGAAGGTAGCATTGTAGCTGGTCTGGAAGAAGTGACCTTGGAAAGGTTTTTCAGGAAAGCGTGGGTTTTATGTGAACAGAGAGAAGAAGCTTGGGTGGAATCTGCTCAGATTTGTCCGTAGAAACAATTGAACTCTTTGCTTTCTAGTTAACTGTCTATGGAAGTGCCTTCATCACTGCTATCATATAACTTGTCTTTCTTTGTATCTTTTTCAGCTCTGCTAGGTTTTTTGTTTTGTTTTGACATACCTTAGTGAAGTTGCTCTACTAATTGGTGTGTCTTTAGGCACCACAGACTATATGCACTTAAAATGTCATTGCTTCTCCCAGTGAAAATCATTTTTGTCCTGCAGTGGTTCTGGCTGCCCCTATGGACTGTTTTCTCAGGTTTCGAGTCCAGAAGTTAGTCTGGCTGTTTGTCTTGTACTTTTCCAAGGGCTTAAATTAAAATCATATGTTACCATACAGATGCTTATTTGCAAATGGCTCCCAGTGTTCTTTCTGCCCCTTGTGCCTGCCAAGATAATGGAAGAATTTTAGGATCATTCCCAACCTAATGCATCCCAAAGAAAACCATTACCTGAGGTGTGTAGACCTAGCCCTGCATCTCTGCTGTTCCAGTAGTATGTTCACTTGGCTCTCTTTGGGCTGATTGTTCTTAAGAATTAACTTGTGCTGGGCTATAATCTAAAGAAAGTTTCTTCTGCTCTTTCCGATGCCTGGCAAATGGAGGGCATTCCGTAAATATTTGTTGAATGACTGAAATGACTGACCTCTACTGGAACATATAAAATTCGTTTGGGACTCTCTATGGATAAGGGTTAATGGCAACATTTTCGTTAGTTCTAGGATGTTGAACCTTATTGGAAACGCTTTGAGGCTTTCCACCCATCTTGGAGGAGAAGTTCTTCTTGGAGCTATATGTATGTGGCAGCCACAGACCTGTGCACAGGCATTGGAACTCCCCTAGTACTTTTAGTTTCTGGTAAAGTCTTAACGCTGATTGAGTTTAAGAATATATTCTAACTTGAGGTGTTTAGAGCATCCTATGAGTTCAAATGGAGCCCTTATTTTTCATTTGGCTTTTTCTAGAGAAATAGAACTTGGTCTCCTAATTGCCACATATCTGGAATTTTTTGTCACCTTAGAGTAAATTTAGAATTTGCATCAATGGCAGGACTCAATCACAAATAAAACCAGTTTGTATACTCTCTAAACTATAGTGAAACTTTTTATCTTGTTCCTTTATTTCCCACAGAAATCCTGAATGAGTGCTCCTTCCATTAAGGAAATACTTTTTCTCCTAAAGGTCTAAGACTCACAAAGACTGCAAATTTGGTAAACATGTTTGTGGCAAAGCAGGTGAATAAAATCCTATTATCAATGGACATGAATTTGAGCAAACTCCAAGAGATAGTGGAGGGCAGGGGAGCCTGACGTGCTTACTACAGTCCAGGGGGTCGCCAAGAATAAGATACGACTTAGCACCTGAGCAACAACAGCAGTCGGTTGCTGAGCCTGCTCCTCTGGCCTAAGGATACATGGTTCACTGGTCTATTTGGGCCGATGGACTAACCGTGCCTTATTGTTTCCCAAGTCTGATCAAGGGCTTTTATTTTTTAAAGGAGAAAGAATATTTTATGCTGGAAAAAGTTTACCTGAAAGATAGGGTAGAAAAAACATATAAGAACGTATCAGGGAGGTTTTTATTATATTCCATTTAAATATAAACTTATCATTCTTTCCAGAAAGAAGAACTCATTCTGTTTTTCAATTTAAAAACTCATGTAAAGTCACTGTTTAAACTACTGTTCGCTTTTTTATCTCAAAGTAGCTAAATGGCTTTGTTGCTCATGTGGGAATGGAAATTAGCTCTTGGCATGAACCACTTTAATTGAAATCAGTTTGTGGGTTGAGTTCCTTTGCTGCTTGACAGATGACATCATTTCCTGTGCTTTTCCCAATCCTCACTGTTTTGCTAAGATAGGATGAAGCTAAGTTTAACTTCAGATTTGAAAGCAACTTACACCTTTTCCTGACCTACTTAGAATATTATCCAAGTTTTTCACCAAATCATTTCTTTTGTATACTTGTAAATAGTTTTTTAGTTTGAAAACACATTTTGGCCAAGACATTTTAATAGAACTGTAGGAGCCTAAAATAACTGTTTTAATCAGTTTCCTGGGTTGGTTGATTTCTATAACAATGTTCTGACAGAGAAGTTATTTCTGCTTTTATATATGGGGAAACAAAGATAAAAATATTTTTAATAGCAACCCACTCAGAGCTATGTAAGTGCTTAGGACGCAATGGGCAACTTCACAGTCTCTTGTTTGAGTATAGCTTGTGGTGTCGTTATCATGAAGCACAAGTTAAATAAACAGAAATTAATTTGGCAGAGTTTTATATAGCACCTACAAGCAGGCAGGGAATGCTCTGAGCACTTATGGAGATATAATTAATTATCATGATGCTTCCCCCTCCCCACCCTGTGATGCTTGATGTTTTTAAACAAATGGGCTACAGATAGGAGAAATAACTTAAAAATAGGTTTGTTATAGAACATACCTTTCTGAAGAGAAGTATAAAGTACTCTGGAGTCAGAAGAAAGAGAGTTCATATCTAGTGGGGAAGGGAAGAGAAAATAGAAGTCAGGAAAGATCAAAGGAAAGAAGAGACATTTGCCATGGACCTTGGAGACAGGATTTCAGGATTTGGTAAGAACATTGTGTAAGTTGTATGTTGGAGGTTGAGAGTTCAGGGCAAAGACAAAAAGATGGATGAAAGAGGAGATTCCATGAAGAGACTAGCACGTAGTACCAGGTATTGGGTACAGCGCTTTGTAGGTACTCCGAAATATTTGTTGAGTGAATGAATGACTGATAAAGAAGCCTGTGAAAAAATTGTTGTTGTTATTGTTCAGTTGTCCAGTCATGTCTGACTTTTTGCAACATCATGGAAAGCAGCTTGCCAGGCCTCCCTGTCCCTCACCATTTCCTGGAGTTTGCCCAAGTTCATTTTCTTTGCGTCAGTGATGCCATCCAGCCATCTCATCATCTGATGCCCTCTTTTCTTTCTCTCCTCAATCATTCCCAGCATCAGGGACTTTTCCAATGAGTTGTCTGTTCACATCAGATGACCAAATACTGGAGCTTCAGCTTCAACATTAGTCCTTCCAGTGAATATTCAGGGTTGATCTCTCTTAAGATTGACTGGTTTGATATCCTTGCTGTCTGTGGGACTTTCAGGAGTCCTCCAGCATTGCAGTTCGAAGGCATCAATTCTTTGGTGTTCTGCCTTCTTTATGGTCCAGCTCTCATAACAGTACATGACCACTGGGAAGACCTTGACTATATGGACCTTTGTTGGCAAAGTAATGTCTCTGCTTTTCAGCACACTGTCTAGGTTTGTCATCGTTTTCCTGCCAAAAGCAATCATCCTGATTTCACTGCTGCAGTAACCGTCCGCAGTGATTTTGGAGGGCAAGAAGAGAAAATCTGTCACTCCTTCCACCTTTTCCCCTTCTATTTGTCATGCAGTAAGGGGGCCGAAGAATTGATGCTTTTGAACTGTGGTGTTGGAGAAGACTCTTGAGAGTCCCTTGGGTTGCAAAGAGATCCAACCAGTCCATTCTAGAGGAGATCAGTCCTGGGTGTTCTTTGGAAGGACTGATGCTAAAGCTGAAACTCCAATACTTTGGCCACCTCATGTGAAGAGTTGACTCATTGGAAAAGACTCTGATGCTGGGAGGGACTAGGGGCAGGAGGAGAAGGGGATGACAGAGGATGAGATGGCTGGATGGCATCACTGACTCGATGGACATGAGTTTGGGTGAACTCCTGAAGTTGGTGATGGACAGGGAGGCCTGGCATGCTGCAATTCATGGGGTCGCAGAGTCAGACATGACTAAGCGACTGAACTGAACTGAACTGAACTGAAGGGGGCCAGATGCCATGATCTTAGTTTTTTTACTATTTAGTCTTAAGCTGGCTCTTTCACTCTCCTCCTTCACCCTCATCAAGAGGCTCTTTAGTTCCTATTCACTTTCTGCCATTAAAGTGGCATCATCCTCATATCTGAGGTTGTTATTTCTCCCACCTATCTTGATTCCATCTTGTAACTCATCCAGTCTAGTATTTCTTATGATGTGCTCAGCGTATAGGTTAAACAAACAGGGTGACAACAGACAGCTCTGTCACACTTCTTTCTTGATCTTGAACCAGTCAGTTGTTCTATGTGAATGTGAAGTCGCTCAGTCGTGTCCGACTCTTTGCGACCCCATGGACTGTAGCCTACCAGGCTCCTTTGTCCATGGGATTTTCCAGGCAATAGTACTGGAGTGGATTGCCATTTCCTTTTCCAGGGCATCTTCCTGACCCAGGGATCGAACCCAGGTCTCCCACATTGTAGACAGAGGCTTTACCATCTGAGCCACCGGGAAGTCCCAGTTGTTCTTTACAGGGTGCTAATTGTTGCTTCTTGACCCACATACAGGTTTCGCAGGAGACAGGTAGGTGATCTGGTATTCCCATCTCTCTAAGAGCTTTCCACAGTTTGTCATGATCCACACAATCAAAGGCTTTAGCATAGTCAATGAAACAGAGATAGATGTTTTTCTGAAATCCCCTTGCTTTCTCTATAATCCAGCGAATGTTGGCAATTTGATCTCTAATTCCTCTTCCTTTCCTAAACCCAGCTTGGACTTTTGGAAGTTCTTGGTTTGCATCATGCTGAAGCCTAGCATGCTAGATTTTAAGCATGACCTTTCTAGCATGGAGATGAGTACAACTGTCTGGTGGTTAGCACATTCTTTGGTACTACCCTTCTTGGGCATTGGGATGAGGGTTGACCTTTTCCAGTCCTGTGGCCACTGCTGGGTCTTCCAGATTTGCTGACATAATGAATGCAAAACCTTGATGACATCATCATTTAGAGATTTGAATAGTTCTGCTGGAATTTCATCACATCCATTAGCTTTATTAACAGCAGTGCTTCCTAAGGTCCACTTGACTTTGCATTCCAGAATATCTGACTCTGCATGACTAACCTCACTGTCGTAGTAATCTGGTTCATTAAGATCTTTTTTTAATATAGTTCTTCCTTGTATTGTTTCCATCTCTTCTTGATCTCTTCAGCATCTACTAGGTCTCTACCATTTTTATCCTTTATTGTGCCCATCTTTGGGTGGGATGGTCCCTTGGTGTTTCCAATTTTCCTGAAGAGATCTCTAGTCTTTCCGCTTTAGCCGTTTTCTTCTATTATTAAGGCATTTTTCACTGCAGAAGGCCTTCTTGTCTCTTCTAGCTGTTTTTTTGGAACTCTGCGTTTAATTGGAACATATTAGGGGTAGGCACCACTTCCTTGGTGGCTCAGAGGTTAAAGTGTCTGCCTGCAATGCAGGCGACCTGGGTTTGATCCCTGGGTTGGGAAGATCCCCTGGAGAAGGAAATGCAACCCACTTCAGTATTCTTGCCTGGAGAATCCCATGGATAGAGGAGCCTGGTGGGCTACAGTCCATGGGGTCACAAAGAGTCAGACACAACTGAGTGATTTCACTTCACTTAACTTCTTCAGGGGTAGGCAAAGGAGCCCTGAAAGACCCATACGACCATCCAGAAGAGGGCCTTAAATGCTGAGATGGAGGGGGTTCTTGGTACAGTAGAGATGGGCGCCTTTGATGGTGTTTTAGGATGTACATGACATGTTGTTGAAAAGGTGCATCACTCTCAACTTACCTCTTTGGTACTCCGTGAGGGCATAGGGTGTATTGGGTTCTGGCACCTTCCTTTTCCTGTGTGGTGCTGAGAGCTGTGTAGCTCTTTATAAAAATAGCCCTTTCTCCTGAAATCAGCAGCCTCTTTGTGATACTGAACTGAGCATCCTAGCAGAGTGTACTGAAGAAGCAGCCTGCTGGGAGGAGCCTCCTCTCTGCTCCTGGGAGAAGATGGAGGCCCAGTGCTCCACAAAGCCTAAGCATAAGAGCAAGCCTAAGCAGCTGATTTCTGCTCTTACACAGAAAAAGGGGTTCTCTTCTCTTTACGTGAAATTATTGAGGCTTTTTCTCCAGGAATTTACTCCCACAGGACAGAGTAAGCCAAATTTCCAGGCCCAATCCTGGCCTCCTTGTATAGGGATGTGTCAACAATGATGAATGATTAATTCAATCAAGCCTTTAGTCTTCTCCAAGGAGGGTAGTTGATTATTTCTAGAGGACTAAGGAACAGCCTGGGATTTGGAAAGTGTTTGAATTACTGAAACAGGGACAGCCTCGGCACTGAAGGAGTCAAGGGCATATGCTGTGCTGTCATTGTCTGTCCCGGGCGTCTTTCCCTCTGGCCAACTCTAGCATCTCATGTCTCAGTCAAAGTCAGCCTGCTGCCTGGGGTCTTCCTGCCTTGGGTGTTGAAGCGCTCACACTTCTGTAAGTGACAATGTGATACAGAGTGGATTTACGACACTGCAGGTCTTAGGTGGTTTAAGGTGACAGTTTAAACAAGGTGCTCTTTCTGAGCCAAGTCCAGCTATCTTCATTATCATGCAGTCTTGTTATTAAGTGCCCTTATAGGTCTTTTTTCCCTTCTTTCTGCTGCCTCCTAAATTTCTTTTAACATCTTTCTTGGAAATTGTCACTCTGAATGTCTTCTGTCCACCCACCTGGGACTCTGCAACTTTTAACAAGAAAAATATTGCTATTGTAATCTTGCCTTGTCTGGTGCCTCAAGGTGCTATTTTCTTGGTGTAAATTACAGAAATGACATTGAATGGTAAGTTCTGCTAAATTAGGGAAGTCATTGAGCATTCTTAAAGTCAGTATGAAAGATACAGTTACATTGAACTGTAAATGATTTTATGCACACAAAATATGACATGTTTAGCATTGTCAATTAGGTTATTTCTGCATAAATCTATGATTATTGATAAACCATTTTATTTTCTCTTCAGATCACTACAAATCAACTTCTGTGAACTGTTGAGATCTATGTACTTAAGTTGCAGAAATAAATCAGTGCTTTTTTTCTTTCTTTTCAAG
Seq C2 exon
TCCAACATTGTAACATTCGCTGCATGAATGGAGGTAGCTGCAGTGATGATCATTGTCTGTGCCAGAAAGGATACATAGGGACTCACTGTGGACAAC
VastDB Features
Vast-tools module Information
Secondary ID
ENSBTAG00000002278:ENSBTAT00000002944:3
Average complexity
IR
Mappability confidence:
NA
Protein Impact
ORF disruption upon sequence inclusion
No structure available
Features
Disorder rate (Iupred):
C1=0.000 A=NA C2=0.000
Domain overlap (PFAM):
C1:
NO
A:
NA
C2:
NO
Main Inclusion Isoform:
NA
Other Inclusion Isoforms:
NA
Other Skipping Isoforms:
NA
Associated events
Conservation
Fruitfly
(dm6)
No conservation detected
Primers PCR
Suggestions for RT-PCR validation
F:
No suggested primer sequences
R:
No suggested primer sequences
Band lengths:
Functional annotations
There are 0 annotated functions for this event
GENOMIC CONTEXT[edit]
INCLUSION PATTERN[edit]
SPECIAL DATASETS
- Pre-implantation embryo development