BtaINT0122375 @ bosTau6
Intron Retention
Gene
ENSBTAG00000020984 | RAPGEF4
Description
Rap guanine nucleotide exchange factor (GEF) 4 [Source:HGNC Symbol;Acc:HGNC:16626]
Coordinates
chr2:23683382-23699744:-
Coord C1 exon
chr2:23699666-23699744
Coord A exon
chr2:23683533-23699665
Coord C2 exon
chr2:23683382-23683532
Length
16133 bp
Sequences
Splice sites
5' ss Seq
CCAATATCC
5' ss Score
-12.74
3' ss Seq
CTTCCTTGACTCCTTGGTACTTA
3' ss Score
-4.41
Exon sequences
Seq C1 exon
ATTCTGTTTTAAATGACTTTGTTATGATGCACTGTGTTTTTATGCCAAATACCCAGCTTTGCCCAGCTCTGGTGGCCCA
Seq A exon
ATATCCTTTTGTTGTGAAAACTCTATTCCCTTGACGACACCCCCCATGTCTAAGGCCATTATTTCCTCCCATGCTCTCAAGGTAAGTCATGACTGGGGCAGAATTATGCTTTCTGCCCTTGTCAAACTCTGAAACATCAGCAGTTTCCCTGTTTCACCACCCCCTACACACACAGATTTCTGATCTCTCCTTGGCATGGTTTTCATGCGCCGTGTTTTAAGGATTTTCTCCTTATCACCTGTGTAGAGAAACATGAGCCAATTTACCTAAGGAAGGTGATGCTGATGAGAAATATACATGCCTGGGAAGTAGACTACAGAAGGTGATGGTGGAAAATATTATTAGGGAGTATTATTAGGGATCGCGTCCTAGGCTTGGAGACAGACTCTGCACCTCTGTCAGGATGCCTGGCAGGATGGACTGTAATCTGTTCGTGTCCCTCTAAGCTGTAGTTTAATCAGACCACGGACCTGCTGAGATATATACAGGATATAATTGTGGGGCCACTTTTCTTTCACATTCATCATAGTCAACCCTATCCTCTAGATACTGGTATTTATCCCTTTGTGGCTGTTTTTATTATTATCCCATCGACTTATGTCAAGGACACAAAACTTGAAATTCTAATGGCGTTTCCTCTAGGTAACTTGACCCTGAGCTTATTTGGGGGGCAGCGTTTCAGTGGTCTCTTGAGTTGACCAGCTGGTGCACAGTGTCTGGCAGAGGGAACATTCAGAAGACAGAAGCTGAATAAAAGAAGTGAATATTGTTAATGAGTGGAACCCTCAACTTTGGGGGAATGTGAAAGTATATTTTCCAATTCTGCTTTATTTTTAAAGCAGCAAAAATGCAGGCCCCCAAACACTTTGGCCTTTTTGAGCAGCTAAATATATGGAAGGAGAATAACTTTCTTTTTTTTCTAAGCAATCCAATCAATGTTGGCATGTTTTCCTTTTTCAGAATTATAATTGCCCTACCTGATTCTCATTTCCTTGTTCATAATTCTTTTTGAAGTCAACAGAAGGTGTAAGAATAGGAGATTGGAGTTGAATATGCTATTCAGAGAATGCTGCAAGAGTGAGATTTGGGTGTTTATTTGCCTGGAAACTATCTTTCCAAGTAATGACAGTTTAATGAGACTTAAATATATTATATATTCTTTCTGGCTCATATTCAGTTTTTCTCAAGTAAAATTAACACATTCAGGATCTCTCTGTGCTCTTTTACCTCCATGCATGGTAATCATTATTAGACCTTTGAGATTTTTGGAAGGAAAAATGAAAACCACCATTGAGTGTAGACTTTTTTCTCCCCAACAGTTAGCATGTTGATAAGCTTAAGGCAAACGAAACCAAACGAAAGGTGAGGGAAGGTCATGGGCCAAGTTATATCATCTTGACAGCTCAGAGCCCCAAATACTAAGCTGATAGTCTTTTTGCAGATTTTTATTTCTTCACTTGTTAGTTTGTTCTCCTTCAGAATTGATTGAGAACATTCACAGTGTTGACCTCTGTATTGAAAGTAGAAGATCCCAGAGGGAAAGTTTGCGCCATGCCTCGGTGTAGAGGTGGGGGGTAATGACGTGGAGGGGAGGCGAAGGCAGGAGAAGTGGACAGTAGGGTCAAGGGAGGCCTGTGGTGTCCAGTCCTAACTTTTCTCAGAGATGGAGGCAGTCAGGATGGTTGGGTACCATCCACACTACCTAAGTCCTCAGGCCACCCCCCTCACACCCTGCCCCATGAGAACTCAGATTCTCTTAACCGTTCTGTTTTGAAACAACCCTTTACATGCCAGGCACCACTGACCCATATTATACCTCTTTATCCATATAGGAGTTTATTGGGTTAGTGTCAGTTTTATTTAAAAGTGAGAATTCTGAGCCTCAAAAACAAACATGTCTAAGGCAAGTGGCAGAACTAGGATTTATCCAGGTGTTAGGATTCCAAGCCTGGGGTGTGGCACTTTTTTCCTTCACAACTTACTCTTTCAGAAGCTTATCCTTTAGAGTTTCGAAACATTTCTTGGAAATTTATTGCATGATACATGTTTATTTGTGCTTCAGTTGGCTAAAATAAAAGTGGGCCTGATTTGTTGAAACCAAATAAAGTGTCTGATAGAACTTTTTTTGTTTTATAGTGATGGATATGTTCTGTATCTGTGCAGCCCAGTAGCCACTAGCCTTGAAATTGGGTTCTATGACTGAGGAACTGTATTGTTAATTTTATTTAATTTCAGTTAATTTAAATGTAAATAGCCACATGTAACTAGCGGCGGCTATATAGGACAGCTTAAGTCCAGTCCTTCAATTCAGTTCAGTTCAGTTGCTCAGTCGTGTCCGACTCTTTGCGACCCCATGAATTACAGCACGCCAGGCCTCCCTGTCCATCACCAACTCCCAGAGTTCACTCAGACTCACGTCCATCGAGTCAGTGATACCATCCAGCCATCTCATCCTCTGTCGTCCCCTTCTCCTTCTGCCCCCAATCCCTCCCAGCATCAGGGTCTTTTCCAATGAGTCAACTTTTTGCATGAGGTGGCCAAAGTACTGGAGTTTCAGCTTATAGATACTGGGAATAAAACAAGAATTACTGTCCTGTAATGCCTGCAAGGCCAGGAAGACATCCTGCTGCAGGCAAGCAAATGGAAAGGGCTGTAACTTTGAAGGTCATGTGTGTGTAAGTGTGTTTAAACCATGCTAAGGACTCAATTTCTAGTGTGTTTGGCTCCAGAGAGATGCTATATAGCTTCCTTACATAAGCTTCTTTTTCAATCATAAGTAGCATTAACAAACCGTAACTGACTTAAGCAATAAGGGAATTCATCAAAAGGATGGGGTAACTCAGAGAATGGAAGGAATCCTTAGAGCCCAGGCCTTAGAAAGGAACCTTGGGGGCAGCAACGAAGGAACAGCTGCTAGACTAAAGTGAAAGTGAAAGTTGCTCAGTCAAGTCCGACTCTTTGCGACCCCATGGACAGAGGAATCTGGTGGGCTAAAGTCCGTGGAATTCTCCAGGCAAGAATACTGAAGTGGGTAGCTGTTCTCTCCTCTGGGGGATCTTCCCAACCCAGGGATTGAACCCAAGTCTCACACATTACAGGTGGATGCTTTACCAGTTGAGCTACCAGGGAAGCCCAACAATACTGGAGTGAGTAGCCTATCCCTTCTCTAGGGGATCTTCCCGACCCAGGAGTCAAACGGGGTCTCCTGCACTGCAGGTGGATTCTTACCAGCTGAGCTTCCTGGGCCCTTGCCTCATTCCCACATCCCTGGGAGTAGCCCGGGTGACTGGTGACGTCTTGGTCAAAGGAAGGCAAAGCACTTTACTGAATAGTTTTTCAGAGACTGCCTATAAAGAAAAATGGAGAAAGTGGAGAAATAGAAGATGAACAGTCAGGAAAAAAAAAAAAAACAACACATAAACTGTTTAGCATCATGTCCTCATGTGACAGGGAGCTAGAATGTAAAACTGAACAAGTAGGCTAATACCCATGTTGTTATGGGATTTAGGGATAGTAAAATACTTAACTGCGTTCCATTAAAGCACTTAAATTAAGTGCGTTGATTTGGCTGTGTGTTTTTAAAGTACTTATTAATATATGTGACTTTTCATAGCAGCCCTATGAAGAAGTCAGTATTTTCACTGCTCTTTTTCCAAATCAATAAACTAGGATAATGAAAAATTATGATTTGCTCAGAGAAAGGTAATTACTAGTACAGAAAAGACTTGAGCTCTGAGCCACTGGCGTCTGTTCTGTCCTTAATCCACATTGTGCGTCTCCTCCAATTTTGCTTTTAGCATAGGAGACGATGGTAGAACTCTGTTTAACATTAATATTTCAGGCCTTTTATGTGCTAATGAGAGAGACTCTATTCATTAGATATGCTTGGGACATGATTTGGCCTGATGAATACAAGTGCTTTATAATGAGTTTCTTAAATTATATTTGTTCAATTTCTGTACTTTTCATCTCTAGTTTCTTTAATCTTTTAAAAATCTGCACTTAAAATACAGTTCAATTTTCTGTTCGTCTTTAAAAAGAAAATTAACCCCTGCCCTTTATAACCTTACCAGGTATTACTGTGGTTAACATTTTGATATGTAGCCTTTCAGTCTTTTTCCTATACATTTAGATATATGCTTTGAAACATAAGGATGGGTCATACTCTAAATAATTATGTATGTTTTGTTACTAAACAAACAGAGCCATTTTTCTGCCATTAATTTTTTCATATCATTTCTCTGAATATAGATGGCTTGGTCATCGTTAAAAATAGAACATTCTCACTGTGAAAAATTCAATTTACAGAAAAAGAGAACAAAGTTCACCTGATATCTCACCGTTGAATTATGAAAAATCTTTCAGAACTTATATACATGTATAATCTTATGTATGTGAGATCATGTTATACATGCTTTGTGAAAATATGTGTTCTTTCATCTATCAGTATATGCTGTAGATCTTTTGAAATCAATATATGCAAATAAAACGCCATCATTTTGTTCAGATAATTCCACAAATGCTTACTGAACACTAAGTCTTAGCTAAAACTGCCTTATATGGAGTAAATACAATAGGTTTCCTTATTGAAAAGGCAGGGTATCCATCTCTTATTTCTTTGTGAATATGATCTGGGGATGTTCTCTTTATAAGCTGACTTGGATTCTCTAAGAGGAACACTAACCAAAATTTGTAAACCAAGATTTACAAAAGGGTATCAGATTCTTAAAGCCATGTTTTTAGGGATATTCTTTGCATTTCTAAGGAAAATTGTCAGCTTCAATTCTGTTGAAGCCAAATTTTATCATTCTAGTCCCTTACTTGGTTTCTGAAAAAATGTTTGATCTCTGTGTCACTATGAGAGCAATTTAGTCCTGCAGATATACAATTTGAGAATTTATTTCAAATAAGAAGGCGTAGTTTGGTGATGCTATGAACATAGTATCCTCTTTCAAAGAAAATGACTATATTATCAGATGTTCTACAAAATATTTTATATGTATCTTTCTCAGCCTCATATTAACACTGGGAGATGTGTACTCTTTTTGCATTAAGGAAGTGAGACTGAGCAGATGAATAATGTGCTCCAAGTTACCTACTAGTAAGGGTTGTAGATCATGACAGACTGTGCAAAACTCTGAGAGAGATGGGAATACCAGACCATCTTACCCGTCTCCTGAGAAACCCATATGCGCATCAAGAAGCAACAGTTAGAACCCTGTATGGAACAACTGACTGGTTCATGGTCAGGAAGGAAGTACAACAGGGCTCTCTGCTGTTACCCTTTTGGTTTAAAGTGTATGCTGAGCACACCATGAGAAATGCCGGGCTGGATGAAGTATAAGCCGGAATCAAGATTGGCAGGAGAAACATCAACAACCTCAGATATGTGGATGACACCACTCTAATGACAGAAAGTGTAGAGGAACTAAAGAGTCTTTTGATGAGGGTGAAGGAGGAGAGTGAAAGAGCCGGCTTAAGACTAAAAAAAAAAACCAAAAAACTAGGATCATGGCATCCAGCCCTATTACTGCATGGCAAATAGAAGGGGTAAGGTGGAAGCAGTGGTAGATTTCCTCTTCTCAGGCTCCAAAATCACTGCGAATGGTGACTGCAACCATGAAATCAAAAGACAATTGCTTCTTGGCAAGAAAGCAATGACAAATCTAGACAGTGTGTTGAAAGGCAGAGACATCACTCTGCCGACAAAGGTCCATATAGTCAAGGCTATGGTCTTCCCAGTGGTTGCTTACGATTGTGAGAGCTGGACTATAAAGAAGGCAGGACACCAAAGAATTCATGCCTTCAAACTGTGGTGCTGGAGAAGACTCCTGAAAGTCCCTTAAGACAGCAAGGAGATCAAACCAGTCAATCTTAAGGGAAATCAACCCTGAATACTCCCTGGAAGGACTGATGCTGAAGTTGAAACTCCAGTATTTTGGTCATCTGACCTGAACAGATGACTCAACGGAAAAGTCCCTCTTGCTGGGAAAGATGGAGGGCAGAAGGAGAAGAGGGCGTCAGAGGATGAGAGGGCTGGACAGCATCACTGATGCAACGAACATGAACTTGGGCAAACTCCAGGAGATGATGAGGGACAGGGAGGCCTGGCATGCTGCAGTCCATGGGGTTGCAAAGAGTAGGATACGACTGGGTGACTGAACACCAACAAAAAACAAGGGTTGGGACAGTATTTGAACCTAAGCAATGTGTTGCGTTAGACCAAGTCCTAGCTGCTCTGCTATGAGTACAAGCCCCTGCCTAAAACTAAAAATAGCCAAGAACTAAAGACTTGTAGAAACAGAGAATTCTGAAAATCAGTGAGAAAAAAAAAAAATTCTGAGCAAGAAAATAAGAAGTAGGAAGAGCTTCTGTGAGCTCCAAGTTAACAGGTACACACAAACAGAGATCAACCCAGGAATGCCAGGTCTTGTGAAGAATTCCAAAACCATCCATTTCCAGACTCTGAATTATTTCCAGAGGTAGAGCAGTAATAATATTGATGATCAGTAACCTTTAACTGAGCAGCTGGTATGTCTGAGATATATTCTGCATGGTTCACCAGTATTGCCTCATCTCCTCCTCGACAGCTATCCTAGGAAGTTTACTGATGGAGAGACTGGTCTCACAGAAAAGTGGGGAAGCCACAAGATGAACCCAGGTGGTCTAATTCCAGAACCTGAGTTCCCAAGCACACGTTGCATCAAGGAAGGAACAGACTTAGTGCTCAGGATGGGGGAGGGGAGGCGCTTCAAAAGGCAAGCTGGGTAGTAAAGAGGCCCATAATACAGTGGGAAGAACAAGAGCTCTGAAGTCAGGAGACCCGTGTTTAAAACCTACATCCTTTAAGCTATATGCCTTGCAATTATCTTTAACCTCTCTGAACCCTGCCTGTATAATAGGGGTAATTACACCTGCCCTACCCTCCTCACCAGGTTGTTGTGAAGATCAAATAAGGCTATGTGTGTGAAAGTACATGATAAACCTTAAAGCCCCTTATAAATATTGCCCCTCTATAAACAAATGATTGTACACCACGAGACGGACATAGCATAAGGTAAAGAATATAGTAAAGCTTTGTTGAGTCAGTGGGCAGATGACCCCCAAAGTTTGTTTTCAGCTTCAAGCAGAGATCTTGCATGCAAAGCAGGGTTTTAAAAAACAACAACATTGAAGAGTATCAGTTTGAATGTTGATAAGTGTTTTATAAATAGCTGCATAATTAGCATGTACTTACTGCAAAAAGTATACATAATATTTTATTCCCTGTTGTAGGCTGTAATGAATCTGCTGCCTCTACATCCTAGGAGGTTTTCACTTACTTTCCCCATGATAATTTTAATACGTGGAACCATTATTAGCTGAATTAAGAATAAGTAAATGAGCAGTAAAAAAAAAAAAATACAGAAAAATTACAGGTGCCTGTGGTGAGTAAGATAATAACTAGGTAAAAATATATGAAATAATTATAGTGTTTGAACAGCAGAGCCGGCATGAGGAAAATGACTCAATGGAATATTAAACCTGCTGTTGGCGGGGTAGAAAGGCTCTGTGGCCTTCACCTCTTCTGAGTCCCAGCCCAAATACCTCGCTGAAAACAGATCCAGTTTGTCCTCATTCATGATTTTGTGATGTCAAAGGAGTTGGTCTGATTCAATGAAGATTTAGTCATTCTAAAAGCCTGTGGGCCTGTAGACTAAGTACCCAATAACTGAAATATTCTATTTTAAAAATATACCAGAAGTTGGTATTTGTTGTAGACCTAACCTGGTGACATTGAATATGAAGTTATTTAGAATATATCTATGATTTGTATTGAATATCTCAACAAAATGGAATTAAAGGTAATTTAGATAGTTCTAAAGAGCTTCCCTTTAAAGAGCTTCCCCTGTGGCTCAGCTGGTAAAGAATCTGCCTGCAGTGCAGGATACCTGGGTTCAATTCCTGGGTTGGGAAGATCCCCTGGAGAAGGTATTCTGGCCTGGAGAATTCCATGAACTGTATAGTCCATGGGGTCGCAAAGAATCAGACACAACTGAGCGACTTTCACTTTAAAGAGCTGTGGATTGGGGTTAGGGGGGAGAAGTATAAGAAAATACTATTATATGTAGCACTCCAAACAGTGTCATTGAATAGTTTAAGGTAAACATTCAAGGCTTTTTATGTTTCATGTGCCCAATCCTTTATTAGGAAATGCAGAGATTCACGAAGAGTTTAAGACATGGTTCCTGCTCTTAAGGATTCCATTTTTTGTATTTTTCACTTTTTTCTTCTTGAAGAATAGTTAATTAAAGTATTGTTTTAGTTTCAAGTGTAGAGCAAAGTGATTCATATATATATATATATATATATATATATACACACACACACACACATATATACAGGCTTCCCTGGTAGTTCAGCTGGTAATGAATCTGCCTGCAGTGCAAGAGACTGCTACTCAATTCCTGGGTCAGGAAGATCCCCTGGAGAAGGGATAGGCTACCCACTCCATTATTCTTGGGCTTCCCTGGTGGCTCAGATGGTAAAGAATACGGGTTCAATGTGGCATGGCAGAACTCCATGGGCAGAGGAGCCTGATGGGCTACAGTCCATAGAATCACAGAGTCAGACATGACTGAAGTGACTAAGCACAGCATGTTATATATATATATATACTTTTTCATATACTTTTCCATTATAGGTTATTAATAGATGTTGAATATGCTTCCCTGTGTTACATGCTGCTGCTGCTAAGTCGCTTCAGTCGTGTCCGACTCTGTGCGACCCCATAGACGGCAGCCCACCAGGCTCCCCCGTCCCTGGGATTCTCCAGGCAATAACACTGGAGTGGGTTGCCATTTCCTTCTCCGAGGCATGAAAGTGAAAAGTGAAAGTGAAGTCACTCAGTCATGTCCGACTCCTAGCCACCCCATGGACTGCAGCCCACCAGGCTCCTCCGTCCATGGGATTTTCCAGGCAAGAGTGCTGGAGTGGGGTGCCATTGCCTTCTCCACTGTGCTACATAGTAGGTCTTATTTATTATATATGTATATATATCTATCTATATATATATGTTGGGCTTTACCATCTGAGCCACCAGGTCTTATTTATGTTATATATATATATATATTATATTATATATATATGTTGGGCTTTACCATCTGAGCCACCAGGGAATATGTTGGGCTTCCCTGGTGGCTCAGATGGTAAAGAATCTGTCTGCAATGTGGGAGACCGCAGTTTGATCCCTGGGTCAGGAAGGTCCCCTTGAGAAGGAATGGCAACCCACTCCAGGATTCTTGCCTGGAGAATTCCATGGACAGAGGAGCCTGGTGAACTACAGTCCATGGGGTCACAGAGAGTCGGACACGACTCAGCAACCAAAACACACACACACACACACACACACATATATTAATCCCAAACTCCTAATTTATCTCTCCCCATTCCTCTATCCCCTTTGGTAACCATAAGATTGTTTGCTATTTCTGTGGGTCTGTTTCAATTTTGTATGTAAATCATTTGTATCATGTTTTTTTTTTTTAGATTCCACATGTAAGTGATATATTTGTCTTCCTCTGTCTGACTTACTTCACTTAATATAATAATCTGTAGGTCCATCGTGTTGCTGAAGGATTCTGATTTAATGCTCTTGGAGGTGAAAGGTCTTATTACCATAATGAGAAACCTCAAGTTAGGATCTGAATCATCAGTAATTTTAACACTGCTTTCTAAAGCAACAGGCATTGGACAAGAGAAGTGGTTAAAACTATAGCAGAGAGGGTCTAGTTTAGACCCTAGGGATCCTGCCTTCTTGGCTCTCAGATCGCAAAGGCTGCAACCATTAAATCTTAATCTTCTATATGTGCTTTGTCTTCTTTGAGGGCTTTGGGGGATAGGTTCTATATCTCAGATGGGTTTTTCCATTATCCAACAAAATGCTAAGTCACCTAATTCTGCTGCATAATGTATGTTTGGATAAAGAAACAATAATATTAGACACACAATAACATAGAGAAGTCAACAGAGTACTGGAAAGGGAGGTAAGAGAATTGAGTTCTAGTTCTAAGAATTCCATTGATAAATTTCAGAAAAATCACTTTACCTCACTCTACATGTTTCTTTGCCTCTAAAATGGTGGAGTTGCAACATCACTCATTATCAGAGAAATGCAAATCAAAACCACAATGAGGTACCATTTCACGCCAGTCAGAATGGCTGCTATCCAAAAGTCTACAAACAATAAATGCTGGAGAGGGTGTGGAGAAAAGGGAACCCTCTTACACTGTTGGTGGGAATGCAAACTAGTACAGCCACTATGCAGAACAGTGTGGAGATTCCTTAAAAAACTGGAAATAGAACTGCCTTATGATCCAGCAATCCCACTGCTGGGCATACACACTGAGGAAACCAGAAGGGAAAGAGACACGTGTACCCCAGTGTTCATCGCAGCACTGTTTATAATAGCCAGGACATGGAAGTAACCTAGATGTCCATCAGCAGACGAATGGATAAGAAAGCCGTGGTACATATACACAATGGAGTATTACTCAGCCATTAAAAAGAATACATTTGAATCAGTTCTAATGAGGTGGATGAAACTGGAGCCTATTATACAGAATGAAGTAAGCCAGAAAGAAAAGCACCAATACAGTATACTAATGCATATATATGGAATTTAGAAAGATGGAAACGATAACCCTGTATGCGAGACAGCAAAAGAGACACAGATGTATAGAACAGTTTTTTGGACTCTGGGAGAGGCAAGGGTGGGATGATTTTGGAGAATGGCATTGAAACATGTATAATATCATATGTGAAATGAATCACCAGTCCAGGTTCGATGCATGATACAGGATGCTTGGGGCTGGTGCAATGGGATGACCCAGAGGGATGGTATAGGGAGGGAGGAGGGAGGGGAGAGGGGGGTTCGGGATGGGGAACACATGTACACCCATGGCTGATTCATGTTGATGTATGGAAAAACCAATACAATACTGTAAAGTAATTAGCCTCCAATTACAATAAATAAATTTATATTTAAAAATGATAAAATGATAGAGTTAAAGGAGAAAAAAATCAAAGGACTTTTACAACTCAGATTCTTTGATTCTGTGAATCATCTGAAATCACCTTAGTATATGAGGTGGCCAATTTGACTATTCTGGCTTTTTCTTAATTGTGTTGAAAATAACAATTCAAGGAATAATTCCAGAATCTCTTACAGACTTTAACCTAGCACTTTATGAGGTACGAGAATCAGATACCAGAACCATATTATCTTTCTGTGACTCTTTTCCCCATGAATTCGAGTAGCCATATTGCTTCTTAACAGAACCCAGCTGTCATGATATTATGAGCCATGACCTTATTCTTATTCTATACATGTATTTCTTGATAATAAATCATTAGATTATCATATATTTTATATTCTTTACTAATCCACTGTTAGCATCACTATGAACAAAGCTAGTGGAGGTGATGGAATTCCAGTTGAGACATTTCAAATCCTGAAAGATGATGCTGTGAAAGTGCTAGACTCAATATGCGAGCAAATTTGGAAAACTCAGCAGTGGCCACAGGACTGGAAAAGGTCAGTTTTCATTCCAATCCCAAAGAAAGGCAATGCCAAAGAATGCTCAAACTACCGCACAATTGCACTCATCTCACATGCTAGGAAAGCAATGCTCAAAGTTCTCCAAGCCAGGCTTCAGCAATATGTGAACTGTAAACTTCCTGATGTTCAAGCTCGTTTTAGAAAAGGCAGAGGAACCAGAGATCAAATTGCCAACATCCGCTGGATCATGGATAAAGCAAGAGAGTTCCAGAAAAACATCTATTTCTGCTTTATTGACTATGCCAAAGCCTTTGACTGTGTGGATCACAATAAACTGTGGAAAATTCTGAAAGAGATGGGAATACCAGCCCACCTGACCTGCCTCTTGAGAAATTTGTATGCAGGTCAGGAAGCAACAGTTAGAACTGGACATGGAACAACAGACTGGTTCCAAATAGGAAAAGGAGTACGTCAAGGCTGTATATTGTCACCCTGCTTATTTAACTTCTATGCAGAGTACATCATGAGAAACGCTGGACTGGAAGAAGCACAAGCTGGAATCAAAATTGCCGGGAGAAATATCAATAACCTCAGATATGCAGATGACACCACCCTTATGGCAGAAAGTGAAGAGGAACTCAAAAGCCTCTTGATGAAAGTGAAAGTGGAGAGGGAAAAAGTTGGCTTAAAGCTCAACATTCAGAAAACGAAGATCATGGCATCTGGTCCCATCACTTCATGGGAAATAGATGGGGAAACAGTGGAAACAGTGTCAGACTTTATTTTTCTGGGCTCCAAAATCACTGCAGGTGGTGACTGCAGCCATGAAATTAAAAGACGCTTACTCCTTGGAAGGAAAGTTATGACCAACCTAGATAGCATATTGAAAAGCAGAGACATTTCTTTGCCAACAAAGGTCCGTCTAGTCAAGTCTATGGTTTTTCCTGTGGTCGTGTATGGATGTGAGAGTTGGACTGTGAAGAAGGCTGAGCACCGAAGAATTGATGCTTTTGAACTGTGGTGTTGGAGAAGACTCTTGAGAGTCCCTTGGACTGCAAGGAGATCCAACCAGTCCATTCTGAAGGAGATCAGCCCTGGGATTTCTTTGGAAGGAATGATGCTAAAGCTGAAACTCCAGTACTTTGGCCACCTCATGCGAAGAGTTGCCTCATTGGAAAAGACTCTGATGCTGGGAGGCATTGGGGGCAGGAGAAGAAGGGGACAACAGAGGATGAGATAGCTGGATGGCATCACTGATTCGATGGACGTGAGTCTGAGTGAACTCTGGGAGTTGGTGATGGACAGGGAGGCCTGGCGTGCTGCGATTCATGGAGACGCAAAGAGTCAGACACGACTGAGTGACTGAACTGAACTGAACTTAATCCCTCTTGAAATAGACATTAACTAAGTATGTATCTTCAGTAGTGTCCTTCATATGTTAAAAATGTGTGTGGTATGCATTAATAATCCTTTTAAGCTACTATTTGTGCTGGAGAAGACTCAGATTTTTATTCTACATTGGACTTTCTCCATCAAATGGTTAACACATTATAACTCCAACTTTAGCCACAAAAATAATGGTTTCTGGACCCTTTCAGATGTATGTGAATTTATGAACATATTATTTGAAATGTTACTCGTTAGGGTGCATTTCTGACATCATATTGAGACAAGGGCCCTGGTGAGATGTTCTTTATTCTTCTGATTACTGTCTGAAGGGAATATAGTTTTTTCTCTCTCCACTTGTTTTTTGTAGGAGTTAAATAAAATCTAAAAATCACATTAATGTTCTAAACATCTGGATAGATTGTTATGGGGATAAACAGAAGCCCTAGTACCTCACCTGTAACCATCTAATCAATTACATGTAAAGTCCTGTCTGTGTCCCCTGAGAATCTGGTTCAGCAGACTGTTGATGAATAGAAGGGTATGTTGTCTGTGGAGGGGCCGAATCCTTGAGCACATACTTGGATTCAGCTATGAAAGTGCTATTAACTCCCATCCCATCTTAGTTAAATATATACCTGAAAGAGGAAAGGTAAGACTTGGTGAAACAAATCAGTGCTTCCTTTTGTTTATTTCCAGAGGCAAACATATGTAACTTTCACAAGAAAAAAGGGAAAGCCTCTTCCTGGTCCCACTGGATTCAGTCAATTCTAGCTCCAGGAGGCTATGGAGTATACGTGAAGAGAGGCAGGCAGTCAGCCCTTGGTTTCAGGATTGGATCGGCTGAGTCATCTCTAGAAACCTAGGAGCTTCAACAAAAAATTAAGGAAGGGAGAGAGAAGGAAAAGAGAGAGGAGGAGAAATCTCTCCTGTTAGGATTTTTGCTTCCCAGATGCAATTACTCCTAATAATTTCATGAACCTGAGCACTAGTGTGGAGTCACTAGAGCCACTGTTTGGGCCATGAGGGTGGTGATAATGGAAAGAGCCCCTGTCTGGATTTGTAAGCCCTGCCATTTACTCACTGAGCAACCTTGGGCAGAAGTCCTCTCTGACCCTCAGTCTCCTCATCTGTAAATATTTACCCTTCCGGTTTGTGGAGAGCATTACATGACCATGTAAGCACACAACATATTTCTTATAAACTGTAATGCTCTACACACATTTGCGGTGTTAAACATGTTAATCCTTCCAGTTGTGTTCTTCTATCTTTTACTGTAGACAAAAGACAGATTTCCCCAGCAAGAGAGAAGACAAGAAGAATCTTTGCCTGACCCACAGAGACAATGACAATTTAGGCATTCTACACTAAAGCCCTCTAGGTTAGCCACAGGTGTGCAGCTGATGTTTCTGGATCCAGTACACAGGGGTTTGTGTTGCTTTCTTGATCCAAGTCAAGGTAACCTAGAAAGTTAGAATTATATCATCTTGCTATCATTTTGGTATTTCAAACATTTCAGCCTCATACAAGTAGAAAAGAGTCTGTCTCTCTCTCTCACTGATTTGTAGATGAACGAATACATGGTTTTCAATCAGCCAATTACCCATTTGGTACCCACCACGTGCCTGACTATACTGCAAGGTACTCTAAAAAGTCTTAGTAATGGCCAGCATTAAAATTCTTTGGAAAGAAAAACTGAGTTATGTGTGCCTACAAGCAAGAGATCAAAGGGTTAATCAGAAACGAAACAATTTTCACATAAAGTGATCTTTCTTCCCTGTTTTATTGTAAGCTCAAAGAGAATTGTAGCAATACAGGTTGAGCAATTTTCTTTTTTTGTGAATCCCGTGCTCAATTTATGAAAGCCATTTTGCAAGCCATTTACATGCAGTAAACCTTTGCTTTAAGATTCTGTCATTTACCTTGATCATTATTTATAGTCCCTTTAGAAAAGGCCCTTGACTGGTTTAGCTCCCAAGTATAGCACTGCCACGGGACAGTTTTCTTTTAAGTCATGGTTGTAAGCTAGGACATGCTCAGTCTTGTAGCCAGGTATGAGGCATGGCGATATTGTGTAATGGGGACTAAGCTAGTTGGAATGAGGAGTCTTGGATTTAAAACCAGTCTTGGACTTAAAACTCACAATGTAATCTTGGTCGTTTACACTCCTTTACTGTCAAGTTTGCTAACTTGTAGAAAAAGCACAATGTCTTTCATCACAAGACTATAAAGTAGGGCTTAACTGAGGTACTCTGTGTGCAAGTGTCAGTTAAAAAGAGGAGATTGTTTTATGAATTAATTGTCTATAATATGAACTACTATAAATCACTGAAAAGGGAATGGTATGTCTAATCTAAACTCTTTCTGGATCACATATTCTGTTCTCTCTACTGTAATCCACAGAAGAATGTAAACAGAGCAGGGACCTTCACAAGACACAGAGAGTAGACATTCTATCAATATCTGTTGTATTAATGGGTAAAATTTCCATGTAAGCCTCAGTATGCTGGGCATGGTTTAGAATATAAGAAGAATAATGTATTAACCTAGCCTCAAAGAGTTTATAGTTAAGATGACTAGCCATTCATGCATGAAAAGCCAATGTGAATTAAATTATGGCTCTAAACAAGAGAAGAAAGCATGCATAAAAAGTGTGTCTGAGTCCCTCACCGGAAGATGGATATAGCAGGAAAGTTTCCTCATCTCAACCCTCAGTGAGTTTATCTATCTTCAGCCTCACTTCCTTCCCATGTACTTTTTATATCAGTCACAGTTCCAGGACCAGATACCCACTTGTAAGGGTTTGACTGAAGTGCATATAATATAGAGATGTGTCCAGAATTGTGGGAGCCAAAGAGAGTTGGTGAGGCCCAACGGCAGGAAGCGTTACCACCCACAGAGGTGAAGGCAGTGCAAGGGGCAGGTACGGAGTGTGATGGGAGCCAAAGCTAGGCGCAACGAGAATCTTTATCAACACACAAGTCCAGTAGAGCCGTGCACGTCTAACTCTTTGGGCTACTATCAAGGCAAAGTCTGCTGGGTTTGTATGCATTTGGTCCAGAACTTTTAGGCAGGTGGGGCTTTTCTTGAGGGCCTAAGGAAGAAATTCCATCAGTCCAAAAGGCCTTCCTGGAGCTGGGATCTGTCATTCTACCTTTGCTTGTAGCACAGTGAAATGGCTAAATGTTCTTCCTTGACTCCTTGGTAC
Seq C2 exon
TTACCATGCACAGCCTTCGCAAGGTACAGAACAAGAGAAAATGGATTATGCCCTCAACAACAAGAGGCGAGTCATCCGCCTGGTTTTGCAGTGGGCTGCCATGTATGGAGACATCCTACAAGAGGATGACGTGGCCATGGCTTTCCTGGAG
VastDB Features
Vast-tools module Information
Secondary ID
ENSBTAG00000020984:ENSBTAT00000061074:17
Average complexity
IR
Mappability confidence:
NA
Protein Impact
ORF disruption upon sequence inclusion
No structure available
Features
Disorder rate (Iupred):
C1=0.000 A=NA C2=0.196
Domain overlap (PFAM):
C1:
PF0061815=RasGEF_N=FE(24.3=100)
A:
NA
C2:
PF0061815=RasGEF_N=FE(46.7=100)
Main Inclusion Isoform:
NA
Other Inclusion Isoforms:
NA
Other Skipping Isoforms:
NA
Associated events
Conservation
Chicken
(galGal4)
No conservation detected
Chicken
(galGal3)
No conservation detected
Fruitfly
(dm6)
No conservation detected
Primers PCR
Suggestions for RT-PCR validation
F:
No suggested primer sequences
R:
No suggested primer sequences
Band lengths:
Functional annotations
There are 0 annotated functions for this event
GENOMIC CONTEXT[edit]
INCLUSION PATTERN[edit]