DreINT0000378 @ danRer10
Intron Retention
Gene
ENSDARG00000103108 | ACVR2B (2 of 2)
Description
activin A receptor, type IIB [Source:HGNC Symbol;Acc:HGNC:174]
Coordinates
chr2:52225340-52238670:+
Coord C1 exon
chr2:52225340-52225760
Coord A exon
chr2:52225761-52238462
Coord C2 exon
chr2:52238463-52238670
Length
12702 bp
Sequences
Splice sites
5' ss Seq
CAGGTAAGA
5' ss Score
10.77
3' ss Seq
TCTCTGTCTTCCTCTTTCAGGAG
3' ss Score
13.35
Exon sequences
Seq C1 exon
AGGAGCCATTTTGGACGCCGTTCAGCTTTTTCGCATGTCAGTCCCTCCTGCCCCTCCAACTGCCCCGGCAGAGGGGGAGAAACAGCACTCGCACTCTCACACACGCACACGGGGGCTGAATCTTTTTTACTCCCTAGCGTCCGGAAGACGGCTTCTCCATGCTGCAGAATGAGCCAGTGGATGTTCGCAGCTTCAGGGAATGTGTTTGTGATTATCCGGAGGAAATATTGTGTTGTTGTGAAGCGGAGCTCGTGTTATTATTGTAGCGGCTGAAGAATCGCGCGCACGGGCCCTCCGCGTTCATGTGTTTCATTTCTTTTCATTCTTAAATGCTTTCACGGCATAAAGACGCACATTGGCACCCTCGAAGGAAGGAATATGTTTGTTCCCTGGCTGGCTTTTGCACTCGTTTGGTGCACAG
Seq A exon
GTAAGAAATACGGAGATTTGCTTCATTTATTTAATCAAAACGGTAACGTTAGTATATAAGCGTAGTATGTTTGGGGTGTGTTCCTAAATCTAACTTGCTGACTATCTAGAACGCGTTCTAGTTCGCACGTGAAGCCAAGAATGAGCCCTAGGTAGAAAGCGCACTAGGTATTGAGACACAGCCTAGTGTTACCAAACCATTCCAGCGAGTGTTTGTTTGGCTTCAATGTAACGTTATTTTGCTTTTCGTACATATTAGTTTAGTGTTTTGTTCGGTATTTCTTTATATATGTTTGTTTAACGTGATTAAAATAGGTTTGTGGGGTTGTTTAAATGCATTTTATGTACAAAGAAAAGTAAAACAGCTGGTGGTTTGATCAAACAATTGATCTCCACACAACAACTTGCATTTTCACCTCGTGTTTTGTTTGGCTCACTAGCTTGGTTTGCGTTTCAGGGCTTTTATAGGTTTATGAGACGTGTTACATGTAAAAACATTTCATTATGTACACACTGACTAGGTTTGTTTTCTATATTGTCATTGTGTTCAGTCCTAGTGCATTTGTGGACACACATTTTAATTTCCTTCTCATTTAGCGAACTTACAAAATTAATCGACTAATATTTGTAATATTGAGAGCATTTAATTTGGTTTAAGCTGTCATGACAGGTTAAGTGTTTGTTTAAAGCCATGTTGTGTACAAAGAAAAATGTAAAAGCTGGTGGTTTGATCAAACAATTGATACTCGCACAACAACTTGCATTTTCACCTCGTGTTTTCGTGTAGTGTTTGGTTTATTAGCTTGGTTTGCTTTTCTGTGAAGGCGACGTTTTATATGTAAAAAAAGCCCATACTTAGTCTTATTAGGTGTTCACTGAATGGGTTTGTTGATTTCTGTATTGTTAAAGTGTTTGGTCCAGTGCATTTGGACAAACATTTTCATGTTTTCTATTTTAGTTGTCATACAAAACAAATTATCCTATATTTGTAATATTTAAAGTATTTTATTTGGTTTAAGCTGTCATGACAGGTTAAGTGTTTATTCAAAATAAACAAAATTTGTTTAATGTTAAGTTGTTTTGTTGTTCGTAGTTATTAGTTTAGAGTTTTTGGAGGGTATTTCTTTATTTGGGTTTGTTTAAAGCCATTTTGTGTACAAAGAAAAATGTAAAAGCTGGTGGTTTGATCAAACAATTGATACTCGCACAACAACTTGCAATTTCACCTCGTGTTTTCGTCTATTGTTTGGTTTATTAGCTTGGTTTGCTTTTCAGTGAAGGTTTATAAGACGTTTTATATGTAAAAAAAAAAGCACATAGTCTTATTAGGTGTTCACTGAATGGGTTTGTTGATTTCTGTATTGTTTAAGTGTTCAGTACTAGTGCATTTGGACAAACATTTTCATATTTTCAATTTTAGTTGTCATAGAAAACGAACCATCCAATATTTGTCATATTCAACGCATTTTATTTGGTTTAAGCTGTTATGACAGGTTAGGTGTTTATTCAAAATAAACCAAATTTGTATAATGTTACGTTATTTTGTTGTTCTTGGTTATTAGTTTGGTGTTTTGGGGGGTATTTCTTTATTTGGGTTTGTTTAAGGCATTTTAAAGATGTTTGTGGGTTTGTTTAAAGCCGTTTTATGTACAAAGAAATATGTAAAAGCTGGTGGTTTGATCAAACAATTGATACTCACACAACAACTTGCCATTTCACCTCATGTTTAAGTGTATTGTTTGGTTAATAAGCTTGGTTTACTTTAAAGTGAATATTTAATCTTATTAAATATTCACTGACTGGGTTTGATTTCTGTATTGTTAAAGTGTTTGGTCCTAGTGCATTTGGACAACATTTTCATTTTTCTATTTTAGTTGTCTTACAAAACGAACCATCCAATATTTGTAACATTTAAAGCGTTTTATTCAAAATAAACAAAATTTGTTCAATGTAACGTTATTTTGTTGTTCATAGCTGTTAGTTTAGTGTTTTTGTGGAGGGGGGTTCTTTATTTAGGTTTGTTTTAGGCAATTTAAAGATGTTTGTGAGGTTGTTTAAAGCCATTATGCGTACAAAGAAAAGTAAAACAGCTTGTGGTTAGATCTCCACAACTTGCAACTTTACCTCTGTGTTTTCGATTGTTATTTGATTTACTAGCTTGGTTTGCATTTCAGTGAAGGTTTATAAGATGTTTTATATGTAAACATTGTTGGTATTGTTAATATGTTAAGTCTTTTTTTATATATATCTTTTAGCGGAATTAAAAATCGAACCAACCAATATTTAAAGCATTTTATTTTATTTAAGCTGTCATGACAGGTTAAGTGTTTATTCAAAATCTGTTCAATGTAATATTATGTTGTTTGTAGAGATTAATTTAGTGTTGGTAGGGTATTTCTTTATATAAATGTGTTAAATGTTTATAAAGACTTTATATGCGTTTGTTTAAAGATGTTTGTGAGGTTGTTTAAAGCCATTATGTGTACAAAGAAAAGTAAAACAGCTTGTGGTTAGATCTCCACAACTTGCAACTTTACCTCTGTGTTTTCGATTGTTATTTGATTTACTAGCTTGGTTTGCATTTCAGTGAAGGTTTATAAGATGTTTTATATGTAAACATTGTTGGTATTGTTAATATGTTAAGTCTTTTTTTATATATATCTTTTAGCGGAATTAAAAATCGAACCAACCAATATTTAAAGCATTTTATTTTATTTAAGCTGTCATGACAGGTTAAGTGTTTATTCAAAATCTGTTCAATGTAATATTATGTTGTTTGTAGAGATTAATTTAGTGTTGGTAGGGTATTTCTTTATATAAATGTGTTAAATGTTTATAAAGACTTTATATGCGTTTGTTTAAAGATGTTTGTGAGGTTGTTTAAAGCCATTATGTGTACAAAGAAAAGTAAAACAGCTTGTGGTTAGATCTCCACAACTTGCAACTTTACCTCTGTGTTTTCGATTGTTATTTGGTTTACTAGCTTGGTTTGCATTTCAGTGAAGGTTTATAAGATGTTTTATATGTAAACATTGTTGGTATTGTTAATATGTTTAGTCTTTTTTTTTATATATCTTTTAGCGGAATTAAAAATCGAACCAACCAATATTTAAAGCATTTTATTTTATTTAAGCTGTCATGACAGGTTAAGTGTTTATTCAAAATCTGTTCAATGTAATATTATGTTGTTTGTAGAGATTAATTTAGTGTTGGTAGGGTATTTCTTTATATAAATGTGTTAAATGTTTATAAAGACTTTATATGCGTTTGTTTAAAGACGTTTGTAAGGTTGGTTAAAGCTATTATGTGTACAAAGAAAAGTAAAACATCTGGTGGTTTGATCAAACATTTGATCTCCTCACAACAACTTGCATTTCCACCTCATGTTTTCGTGTGTTGTTTGCTTATAGTGAAGGTTTACAAGATGTTTTATATGTAAAAAAACAAACAAATATTTAATCTTATTAGGTATGCATTGACTGGGTTTGTTGATTTCTATATTGTCTAAATGCATGTGTGGACAAACATTGCACACATTTTTTTTAAAGGGCCATGAAACCCCCTTGTTTCAGCAGGGTGTTTTTCACACCTCTACTTTGGAAAAAGTCTGAAAAGTGGGCGTGTCCAGCTTTGTTTAGGGGGGAGTGTCGGAGGAACTAAAGTGGGATGGTGTGGGAGTGTCTATTTGGACGCGCTGAGTTTCAGAGTCAAAACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACAGGAAAGAAAGTGACTGTGTTTACATGGACATCTGTAGTCTAATTATTTGCCAAATTATTAAATGTTGGACTTTAACTGCAGTTTGGCTCTTTCATTCAGGAAATTCATTCATGTCCCTCGAGACAAAGGAGATATTTGATTCGAGGAACTGCTCTTAGCGTGTATTTTTCATGCAATGTTTGATACCGCACGGCGAATGAGAGAAAAAAAACTCTGCATTTCCAGGAAACTTAGATGCACACGGCAGGTAGCGTCAGAAAGCCGCGTGTGTTATTCCGGTCACAAAATGCGGTGAAAATCCTACACGAGGTTAAAGTTTGGTTGTAGTTCTAACACGTTTACACTCGGTGCAATAGTTTGTTCGATACGAACAAACTGAATAAACAAAGAGCGCTGGTCGCTCACTTACCAAATCTGTAGAGACAGGACAATCACCAGCAACTAGAGTCGGATCTCAGCGTTTGCAGATGAGAACAGCTCTCAGGTAAACAATGTTCCTCCTTAGACACATAAGTTATTGTTGTCGAGCGTCGCGTGCACTGTTAATCCACGTGTGACTCTGGCTGCGCTCTCACAGGGACAAAATGAAATCAAAACTTAATTGCAGCAAACTATAAAAGCAACACTTCACGCTTGTTTTGCCAACACAACGTGGCGTCTCTGTCGTCTAAACACTGTGACAGTAATGAATATTAATGAAGTTGCACAATAGAGCGCGCTGATTGGTTTGAACCAAGCCTTACTCATGCATTAAAGCATCACACTGTAAGACGTAATAAGACACACTCTGGCACAGACGTCCAGTCTGCACGCTGGAATACAATGCTATTATATTATGGCCGTGACGCAGCTTCAAAAATTTGTTTCAAACCAGAAGTACGAATTTGCTTGTAATAACACAAAAACAACCGATTTACACTTTTTAGTGAAATATAGGTGTCCTAATAGTGTTTTTAGCAGTGTGGGACACATTTACGACTGTCAACAGTTCAAAAAATGTGTTTTGGTGTTTCGAGACCCTTTAATCATTTTGCGGACCTACAAAACTAGCCAACCAATATTTATAACATTTAAAGCATTTAATTTGTAATAAGTTGTCCTGACAGGTTAAATGTTTGTTCAGAACAATCAGAAAATAAAACCCAATATGTTCTAATATTATTGTCCTATGTCAGTGGTGACCAAATAAAAACAGTTCAATTATGATGAACATTGTGTTTAACTGTGGCACAAAGACATCAATAAAACGATGAAGACGAATAGAATGACTTGACCACTGAGGTTTTATCCTAGGCCGCTGATCATGAATTTGTTTTGTAAAATTAAGTAAGTCATCTAATGTTAATCTGCTTTGACACAATCTACTTTAGAGCTGCACAATATATCATTTCAGCATCGATATTGCAATGTGTGCATTCGCAATAATCATCGCAGCATCTGCAATGTGGAATTGGGATTACTATAGTTGATCAGCAATGAGGAATGTGCAGTGTTTACATTTTACATTTACATTTGATTATTCAGTAATAGAAGCAGGATAAAATAGCGATATGCATGAGACGGCGATTTTCGCAATGGCGGATTGAACTTATCAATGTTGCAAATTTAAGAAACATATGTGCTGTTAATGAAAGAAATACATCTCATAATATTTTAATGCAATTTTTCCTCTTCATTTACAAATATGATCTGTTGTGAAGGGTTTTCTTGTAATGTATATCACTGATATCGTGATCTATCATTATCAGGAGCAAAATATAATAATATTGTATCGTATTACTGTGCCTGAATATATGACTAATTCACATTTACCTTTGCTCGATCTTATTTGATTTTATTCTTGATTCGATCCTCTACAAGATCATTCCAGTTAAAGTCAATGATTCTATTCCAAATAGAGCTCGGCAAGTCATCTGCCAAAATTGTAGTCATTTTGCAATATAAATTGCAGCAAAATAAAATATCGCAATGTCAGATTTTTCCAATATCGTGCAGTCCTAATCTACATTGTAAAAAGTAGAAAGAAAGTGTAAAAAGAATTGAATATGAATATACTGCTATGGGGAAAAACATCTCTGCATGTCCTGGAATTACTATAGCAAGTGTTTGAATTCAGTTTTAATATTTGTTAATTTTGGTCTGATATTATTTATTTCGAACAAAAAATATTGTCATTTACAGTTTTTTGTTGTTGTTGAAATGAATAATAACTGGTCAAAATAACAAATGTTTTAATATTTCGTGGTTGAAAAACACTGGACATGCACTTGCAACAAAGAGATCATCAGTCGTATAGATAATCAATAGACTGTCTACACTGTTTTTATTTAGTAGAATATTTATATATAATATATTTATTTCACCTAAACGTTCAAGCTGTTAAACAGCATTTGATAATCTTCTAATTTCAAATTAAATGCAATGAATTCCCAAATAAAAAAACAAGTTTACAAAATATAGTTAATAAGTCATTTTTGTGATTATTTTAATATTAATAAAAAAAAAACATTTAAATAAATTTAATTCAGGGCAACATGGTGACGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAATTTAAATAGCTTATTATTATATTACTTTATATATAATCTTTTTATTCCACTTAACTAAAAGCTATAATATCTGTCTGTCTGTCCATCCGCCCGTTCGAAAATCTGCTTTAACTAGCGATGCTCCTATCAGGATTTTTGCAGCCGATACTAAGTACCGATTCGTTTTTATGGTGATCGGCCGATACAAAATACTGATTCTAATGCTTCAAGCTTTATAATGCCTATAAAGCACATTTTCACTCTAAAGCCTGGTTTATACTTCTGCGTCAAGTGATCGGCGTGACCCACGACCCATGCAACGCACATAGCTGTGCATTAATACTTCTACGCGCTGTTTTTGTTAGTCTGCAATAAAACTTCCGAAACACTAGTTGGCAGTGAGGTGTTTATGTTCCTCTGTGTCAAGTTTCTTCGCTGGCGTTTTGTTTTTCTGAATGCTTCCTAAATGTACAAGTGGTTCAAACTCGCTCATTTTGAGGCAGGAACCGGTGGACGTGCAACAACTTTACCCATGAGGTAAACACAAAACAAAACTTTCCATCAGGAGTTCCTTCACGGGACTCCACACTTGTAAACAATCGCTCCATCGGGCTCACGCGGCTCTTGTTCCTGCCCACACTCGTTAGCGATACCAATCACAGAGCTTGCGCTACCAGTCGTTGCGATGTGTAGTTACATTTTTGAGAGGTACACGTCAGCGGCGCCAACAGAGTTGTCTTATAACTATTTAGTGTGGACTTGTAATGGTCAGACGCAGGTTTACAGAAAAGAATAGATAAAACATTTAAGAAAAGACTAACAGTACCATTTAAAAACACCCCAAATGACTGAAGAAGAATTAAACATGTCTCAATGAAGAAAAAGTTTAGAGCGTAGGCTTTATTTGATGCATAAGTAAAATGCACACCTATTATTACATTACTTCTTTGATAAAAGCAAATAGACCTATAAACTACTATTTATTGCAATAGTTAGACTGTAGTATGCTAGAAAAAGTTATATTATTAAATAAGTAAAAATATTTATTTATTTTATTAATATTTCCAGCCAGTTTTTAGTGAACTTACAATATTAGCAAAAACACAGAACTTTTTCTTGCTCTTCACTTTTGTCGCCATGATTTGCAGGGTATTTTATCTAATTCGCATACCTCACGGTGCCACTATGAAGAGGCCGATGTGGGAGAATCGCGGAGCTTCCAGGAGAGGCCATACGGTTGAGACACTAGATAGCGGCGATCGCTCTGCTCATCACAGCAGCTCAAAAAGACTGGACATGCACTTGCAACAAAGAGATCATCAGTCATGCCAATAGACTGTTTACACTGTTAAGTGAAATAAAAATATTATATATAAATATTATAATGAATAAACACAAAGTTCAAGCTGTTAAATAGCATTTCATAATCTTTCAATGTAAAATTAAATGAAATGAATTCACAAATAAAAAACAAGTTTACAAACTATATAGAGTTAAGTCATTTATTTGTGATTATTTTAATATTAATAATAAAAAAACATTTAAATAAATTTAATTCAGGGCAACATGGTGACGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGAATTTAAACAGCTTATTATTATATTACTTTATATATAATCTTTTTATTCCACTTAACTAAAAGCTATATTATCTGTCTGTCTATCAGTCCGTCCGTTCGTCCATCCAATTAATTTATTTGTTTGTATCAAATAAATTCCAACAGGCCATTTGATTTCCCTTTCAGCTCTGTCTGTTTGTCTGACCAGCAGACAAAAGCTCTCTCTGCTTTGTCCAGTTATCGACGTGGATGTATTGATTTTGATCATTGTTTTAGAGGACAGTGAGGAAATCTTCTTATCTTCCCAAAAGCTGATTTGCAACGGAGTCCCCGATGGGTCGCTGTGAGGAGGAAACCCCCTCAAAACAAAAGAGGCTTTGATACACCCGCTAAATCTTTGTGTGTGTGTGTCAGCTGCAGGGTGGTGATGGGGTGAAGAAAGGTAAAATCTGAGCTTTTCGGCGTGAAAGTGCACCACGGGGGACCTTAGAAAAACACTTATTCTCTCTCTCTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGAGCAAAGCTAGTGCTGTGGGTTTTAAGTAGGGGGCTGCTGATGTAATTCACTCTTATCATGTGACACCCGGTATCAGTGACAAAGACGCCATAGATTGAATGCATGCCGATCTGTCGGTGAGTGTTTAGCCATTAAAAGCATGATAAACCTCATAACGTCAATCCTGGCCGCGCAGCTTTTGTCGCCCCCCATCTCTCTTGATCCTGGGTGCTTTAGTGAGTAGGTGGGGTCACATTTGCAGGAGGGGGAAGGGAGGATGGCAGATATACGTTGAATTTAAAGGGCCAGGCTTTGTTTTGTTTTTTTTAAAGCATGCATTAGGGCTGCGCAATATTGAAAATATCTGACACTGCGATATTTGGATTATCTGCTATTTATATATTGCAATATCAATACAGTTTCAGCAGATGGCTTGATTAGATCTTTTTGGGAAAAAAAACATTAATTTAGATCGATTGGGATGGCTTTGTAAGGGTGAGAATCATGTGTATTAAAAAATAAACTAACTGCAAGCAGGAATAACTACAATGAAGCAAAGAGTAACGTTTAATAAACAGTGCTTTAGTGTTTTTCTGTAGAGTCAAAATGTGGTAAACTGTTAATTTACAGATATTTTATTATAGTGTAGTTTGTTTAAAGTTATGTCTCAATCTGCCATTTGTCTCCCTGTTTAAGTCTGACCTTCTCCTCGGCTGTTGTGTGGGTCTTTGGCTGTGTGTAGCGTCCTGGTTAAAAGATTATTAAGTCTTCCACTGATGTTCACGATTCATTTATTGGCCACACTTCATAGAATCTGTTCGCATTATTCAATCATGAATCACCGTAAGAACTAGAGAGAAAATAAACAAACAACAAACACAAATAAATCCCAAAAATTAACACTAAGCCAACATCAACAATTAAACAGTAAACAAACCAAATTACCTTATTTTTCCCTCAAATCAGGAGCTATAACTCATGAAGGAGGAATCCGTTAAGCAACCGTATACCTGTGCCCCTTTTACCGTGTTTCACCTAGCGTTCTGTACTTTGTTTTTATTCATTTCTACACGCAATTTATACATCCGGTAAGCTCCGCAATTTTGACGTCATAATTAAAGTCCCCAAACAACGTAATTCATTCAACAAATCAACCCGTATACAAAATACAACAAAACATCAGAAATAAATAAATTAATTCAAAATCATAAACAAAGTAACACATTATTTCAAGTTTCTTTACACTGTGTAAACACATCTTACAATCCTCAACCCAGTTCTTTGTGCAAATGTTGTGCAGTGATGCATTTTTTATATGAAGACGTGCCTTCTGACAGCTGATCCGACATCTGGATTTGGTTTGGTGGTTTTCTTGAAAGACCACAGAAACTCCATTGACGGGTGTTAAATCATCATGTGGTTTGTGGATGTGTGTTTTTGGTGCTGAGGTTTGGTGGCTTGTTGAACACACACTGCTTGTTTTTTTAGGGGTTTAAATATCTCATTCAGGCTTTGATTGTCTGATGATTGTTGATTGTGATTAAATAAAAGGACCCATATAATGACTCTCTTTTAATATTTAATGCTGAACTAAATATAAAACCATTTTAGCACCTAAAATGCATGTTAAATATATCACTAATAGGCTACAGTAAAACTTTTGCTGTGCATGTTTTTGTTCACATCACCCTGTATAGTGCCCAGTAGGATTGTGCCATTTGCTTTTAAGGGTGCTTTCACACCTGCCTTATTTAGTTCGATTGAATCGCACTAGAGTTCGTTTCTCCTTTTGGTGCGGTTCGTTTGGGCAGGTGAGAATGCAGCAATCGTACTCGAGTGCGCACCAAAAGCGGACCAAATAAGCGTACCGAGACCTGCTTGAAGAGGTGGTCTCGGTACGCTTTCAAACGAACCCTGGAGCGGTTCGTTTGTGGTGAGAATATGATTCATACTAAAACAGGTCCAACTGCAAAAAGTACTGCACCTTTTGGACTAATCCAGCTGCCGTAGGCCGATGCGCTGTGCATTATGGGATATGGAGGAAAATATTTGTTGAAACCGCTGTACCAACAGAGAGAGAGAAAGGGGAAAACATTACCCGATGGATCGTTGGTAATATTTCCGCAAGATGACCATGTCGCAGTTTAGCTAAATTAATTCACGCCTCCTCCTGAAGTGACGAGCGATGCATTAAACATTGTTTTCCAGCCGCGGCCGCGCTTCATTTTCGTAATGTATAGTTTGTCTAAAGCAGGGATGCAATCAGTCAGCGCAGTCGTCCCTCCAGAGTAAAAGGTTTTGTTTACCTGCGGGAGTTCACTGGCATTTTCCCGCACGTGAATTCTGACCAATCAATAAGCAGTTTAGGAAAAATGTTCAACAACATCTGGCCAATGAGAGATGTGGATTTTGTCAGATGACTGCATTTTCGTTCGTTTCAACTGATTCCGACCAAAGCCAGCAGTGTGGTGTGAAATTGACCCAAAGACGGCAGAAGATGCAACAATGTATCATTTATTACCCTTGGTCCGGACCAAATGAAGCGAATTACAGATGTGAAGCACCCTAAGATTAGTCCAGGAAATTGCTCGTCACCAATTTAAGTTTGTGAGTCTTGTACATAATATTTTTAGTATTTTATGAAGCCGAATTACTATCGTCAGAATTACAACGCACCATGCTACGTCACTTCAGCATCACACATCTAAGTTACAAGACTCTTTCAGTCTTTTTTGATGAGATTTTAAACTGAATGTTTTCAAGAACGTGGCTGTGAACATGAATAGCCTGTAAAATAAAAAACTCATTTGTTTAATATTATGCCATTTTTGTACAATATTCAAAACAATACAATGCATAAATTCACAATGTTTTAAGAAGGCGAACTGCTGGATATTATTGTTGGAGATTAGACCCCGATTACACTGAATGCATTGTTTTTTTGCAGTTAGAGTTTTGCGTGCTTTTTTTTTATGTGCCTTGCATTTTTATAAAAAAACGTTTGTTTTTTTTACTTGCTGCACTGTAGGCATGCATAGAAAATGCAAGTGTGTTCGAAATGCATCTTCATTTGAAATAACAAGCTTGATCATACAATAGACGCAATATGTAAACAGCCCCTTATTACTTTAAGGCTGGCTTCTCGTGGGATGTGTTATGAAGAGTTGTATATCAGAAAGGAGTTTTTGTGTGAAATTTTTTTTCTCAGAAGCTCAGGACACATAAAGTACATACTTTTTTCCGTGATCTATATTGCCATAATATTGTTAATATAATTTCACAAGTATTTGGAAAGAATTCATAATTTTACAGTGATTGGGATCATTTCTTTAGGAGAGTAAATTTGCATAAAATGTACTACTACTACTACTAATAATAATAATAATATTAAAAATCATAACTGTGTGTGTATATATGTCTATATATGTGTATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATGTGTGTGTGTCTGTGTGTGTCTGTGTGTTCTGTGTGTGTCTGTGTGTGTGTATTAGGGCTGTGCAATTAATCTAAAATCCGATTTTGATTTTGGCTTCTAACGATTATTGAAAAACCATTAATCAAGATGAACGATTATTTCATCACATACCGCCCCTTTTCCAGTTGCACACATTTGCTTTGCAAAGCTCAGTTTCACATGAGAATGACTAAAAGCATGTACTGTAATGTAACTTTTGCAGCACTGGATCTGCATCTTTTATTGATGTACGTTCGAATCAGTCATATTTTTAAAAGTGCAAAAAAAGCGCATGTTTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTTTGTGCGCGCTGCGCTTGGCCTCAGACTCAAGACGAGCGGAGCACACACATCTAACGCCATCTTAATGTGATTTTAATGGTCAAATACTTGCACATTTGTGTCTGAGAGCTGCATTTTTTGTTGCGATTCTGGTCTATTTAATATGAAATAAAACACATCCCAGACCTTAATTCAAGCAAATAACCAAAAACCACTGACTTCAGGATGACAGAAACTGTCATTATCCTTTCCTGCAGCAGTTGACAATTAGCACAATAGACATACTTTTGCACAATTGCTTTTGTATTAAATATTAAAATGCATATTTTATTTTATCTCTGTCTTCCTCTTTCAG
Seq C2 exon
GAGTCAGTCATGCGGAAGTGGCGACTAGAGAGTGTGTCTATTATAACGATAACTGGCGGACGGAGAAAACCAATCAGAGCGGGTTCGAGAGGTGCGAGGGGGAGAAAGATAAGAGGCTTCACTGTTACGCGTCATGGCTGAACTCCACCGGCACCATCCGCCTGGTCAAGAAGGGCTGCTGGCTCGACGACTTCAACTGCTATGACAG
VastDB Features
Vast-tools module Information
Secondary ID
ENSDARG00000103108:ENSDART00000170353:1
Average complexity
IR
Mappability confidence:
NA
Protein Impact
ORF disruption upon sequence inclusion (1st CDS intron)
No structure available
Features
Disorder rate (Iupred):
C1=0.000 A=NA C2=0.000
Domain overlap (PFAM):
C1:
NO
A:
NA
C2:
PF0106418=Activin_recp=PU(65.9=85.7)
Main Inclusion Isoform:
NA
Other Inclusion Isoforms:
NA
Other Skipping Isoforms:
NA
Associated events
Conservation
Chicken
(galGal3)
No conservation detected
Fruitfly
(dm6)
No conservation detected
Primers PCR
Suggestions for RT-PCR validation
F:
No suggested primer sequences
R:
No suggested primer sequences
Band lengths:
Functional annotations
There are 0 annotated functions for this event
GENOMIC CONTEXT[edit]
INCLUSION PATTERN[edit]