Special

DreINT0014942 @ danRer10

Intron Retention

Gene
Description
myosin ID [Source:HGNC Symbol;Acc:HGNC:7598]
Coordinates
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Coord C1 exon
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Length
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Sequences
Splice sites
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Seq C2 exon
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VastDB Features
Vast-tools module Information
Secondary ID
ENSDARG00000036863:ENSDART00000067762:11
Average complexity
IR
Mappability confidence:
NA
Protein Impact

ORF disruption upon sequence inclusion

No structure available
Features
Disorder rate (Iupred):
  C1=0.000 A=NA C2=0.000
Domain overlap (PFAM):

C1:
PF0006316=Myosin_head=FE(8.3=100)
A:
NA
C2:
PF0006316=Myosin_head=FE(3.4=100)


Main Inclusion Isoform:
NA


Main Skipping Isoform:


Other Inclusion Isoforms:
NA


Other Skipping Isoforms:
NA
Associated events
Conservation
Chicken
(galGal4)
No conservation detected
Fruitfly
(dm6)
No conservation detected
Primers PCR
Suggestions for RT-PCR validation
F:
No suggested primer sequences
R:
No suggested primer sequences
Band lengths:
Functional annotations
There are 0 annotated functions for this event


GENOMIC CONTEXT[edit]

INCLUSION PATTERN[edit]