DreINT0038133 @ danRer10
Intron Retention
Gene
ENSDARG00000100129 | brd3b
Description
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Coord C1 exon
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Length
8969 bp
Sequences
Splice sites
5' ss Seq
CAGGTGAGT
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8.85
Exon sequences
Seq C1 exon
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Seq C2 exon
CTGAAGGCTGTTCATGAACAGCTAGCCGCTCTGTCACAGGGTCCTGTGAGCAAACCAAAGAAAAAGAAAGAGAAGAAGGAAAAAGAGAAGAAGAAAAAGGACAAAGAGAAGGACAAAGACAAGAACAAGGTCAAGGCAGAAGAAGACAAAAAGGCCAAGTCCACGCAACCGAATAAGCAAACACCACAGAAAAAGACCTCGGCGCGAAAACCCAACAGCACATCTACTACGAG
VastDB Features
Vast-tools module Information
Secondary ID
ENSDARG00000100129:ENSDART00000168030:8
Average complexity
IR
Mappability confidence:
NA
Protein Impact
ORF disruption upon sequence inclusion
No structure available
Features
Disorder rate (Iupred):
C1=0.922 A=NA C2=1.000
Domain overlap (PFAM):
C1:
NO
A:
NA
C2:
PF122803=BSMAP=PU(55.6=75.9)
Main Inclusion Isoform:
NA
Associated events
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Fruitfly
(dm6)
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