Special

DreINT0095000 @ danRer10

Intron Retention

Gene
Description
multiple EGF-like-domains 11 [Source:ZFIN;Acc:ZDB-GENE-060503-252]
Coordinates
chr18:19201815-19218571:-
Coord C1 exon
chr18:19218469-19218571
Coord A exon
chr18:19201962-19218468
Coord C2 exon
chr18:19201815-19201961
Length
16507 bp
Sequences
Splice sites
5' ss Seq
CAGGTGAGT
5' ss Score
10.67
3' ss Seq
ATTTCCTACATTTTTAACAGGCA
3' ss Score
8.94
Exon sequences
Seq C1 exon
GATGGCACATATGAGTTGGAGTGTCGCGAGCGTTGTGACTGTAACCACGCTGATGGATGTGACCATGTGAGTGGATTATGTCGCTGTCTGCCAGGATGGACAG
Seq A exon
GTGAGTGTGAGGCTGCTCATAAAATTGCATTAAAATGTTAAAGTGGGCTTTTATGATGCAACATAAATGCTTTGTGTGAATTACTCACCTCTTGTTCAATAAAAGGCCTTCATGGCATGAGGACACACTAAATTTATGAAAAGTGCCAGTAGACTTTCACAAGGGTACAAAAGATACTGTTCTTTCAAACTTTATAATCATCAAAGATCCATAAAAGTATTGCATCGCAGATTTTTAATGCCCCCAGTGACCCTGAACCACACAACCGTCATCAAGTGTCATTTTTTATTAAATAAAGTCAGGCTAATCGGGCTAATCGGGAGGCCCGGAAGAATTCCCGGTAGGCCGGTCCGTTTTTTGGCCTCGAAGGCCGGTGTCCCTAGCTCCAGAATCTTTTGCTCTTAGCAGTCACACTTTTTAAATTAATTTATTTATTTACTTGCACTATTTACTACAGTCTTCTTATTCATTATTTTACCGCAGCTCTGCTCTTTTTATATATAAAACCAGCCTGCAGGTTAATGATGATATAACTCAGATGAGTCATCTTTTAATATTCAACTATTGTGGTCTAGTGGTTAGCACGTTAGATCACAACGCCGCTGACCTGGGTTTGATCCTCGTCTGAGTATGTTGTTTTATTGTTTCATTTTTATTGTTAAGACATATAATACTGTTAGGGTTGTTTAACATTTAATGTTCTAAAGCAGCTGTTTTCTCAAAAAAAAGACGTGATAGTGTAATTAGCAACTGAATTGGAAATGACCTTATTTTAATATAGTCAGTCGTGAACTGAGGTGGGCCAGTCTGAGGCTTGAAACTCCAGGGCTGAAAAAGAGTCCCACTCCGGCCCTGAATAAAGTTGAATAAATAAGATTTACATTGATGTATGGTTTGTTACGAAAATGCTTTATTTGGTTAAGATAAAATTATTTTAATATCTAGAGTGCGATGGGTTTAAAAAACATCTAAATATTCAGAAAATTGCATTTAAAGGGGTCGTTCACAGAATATTTTTAAGGCTTGATTGTGTTTAAAAGATGCAAGGCAATGTGTGCTCATGCTTCACTTGAAAATCACGTTATTTTTTCAGATATCTAACTTTGATTAAATACAGCTACTATTCATGTAAACAGCCATATCAGTTTGAGCCTGAATCAGACAGAAAATGAAGAGGACAGAGCTGAACCTCATGCCAGCACTAATCTGGAAGAGATTCTGGAATCTCTCCTTTGTCAAATGCTAGCTATATATTTTTTTAATTTTCTGGAACATAATTGAAATTAAATTGTAAGCACTACTTTCTTTGTGTCATGTCCATTGGAAGCCCAGAATAAGCTCTGTGGAAATAGCAGCATTTGGACAGCATTCAGCTTTCTCTGCTAAGATAAAATAAAAAAAACTTATTGACCCCAATCTATATTAACACTTGTGTAAACCCTTTTGTTGATAGCCACACTTAGATGGTTGGATTTTGTTCCAATATAAATTAGATGGTATACAATTTTCAAGATGATCATGTACTAATTATAAGTAGTCTGTTTGCCTCAGGATCTTGTTGTTATGGTTAGAAGAAACCTTTATGAAGGTTCTTTTTGAAGATCTGTTCTGTTATCCTTCATAAGCACTGTTGGTGTGAAATCACATTGAAATCCTGCTGTTAAAGCTGCACTTCAGTGCTCTCTTCAAAAGCTGTGTGAAACAGACTTACTATTACTATTTATACTAGTGCTAATTATTTTAAGTTAACCACTAAGATGTTTTTCGGAAAATAAAAAAAAATCAGGCACAGGCCAATTATTTAATTACATCTTGTTTGTATGTATGTTTTCATACATAATAATATCCAATCAACCAAAAACATGGCTGCTACTCGATTCATTTAAACATGTGGTCAAGAAACTGAAGTACTTACCAAGCATCAGATTGGAGGGTAAATGAGGTATAACTAATTGAATCAAGGTGTGTTCATGGTTGTTGTTGCCAGAAAGCCTGGTTTGAGTATTTCTGAAATTGCTGTGCTGTTGTGAGTTTGCATTCACAACTCTAGAGTTTTCAGTGTATGGAAGAAAAAAAAAAGAAAATGTCAAATGTGAGGCAGTTCTTTGGATGCTAGAGGTCAGGGGAGGATATTTAAACCGATAAAATGGCAAAAGAGTCACAAATAATCACTCGTTGCACCCAAGGTCTTTGAGGAGCATGTCTGAACACACAACAGAAGACATTTTGAAGAATGTAAGATTCTGGAACACATTTGAGTTTCAGTAGGAAAAACAAACACTACTAAAGTCAATGGTTACCGGCTTCCAACATTTTTTTTAAATAACTTCCACATTTTTGACACTTAAATTGGTTTTGGACAAGTGTAGGGGGTGTAAACAATGGCACAATTGTCAGTTTTGGGTGAACTATCTCTTTAAATAGCACCTAGTTTTCATTATAAAACGTCATAATTTGGTTTTGGGGGTCTCCAACAACAGGTTGATATGCATGCAAGGTCGAAAAACACTTTCATTATCTTATAATATATATATATTCGCTCAGCAATTTATTTATTTCCAAACCCCTCCTTAGTGTGATTCTAATGTGCTTATTGGTCCGCTGACCCTGTGATCAGTCGACTGCATTCAGCGTGAGACAGGGAGAAATGTCCACCACCTAAATGAAGTGGCAGAGAGTGTTTGTGAGCCCAATGTAGGAATGGATTAAAGCAATTAATTTAAACACCAGGATATTACTCTACTCTTAACACTAAGCCCAAGTAATAACAACGACACACATTCAATATTAATCCACACCGTGGGAAATGTTGAACTTTTTTGAAAACTGACCACGCCTTGCGTGTGAGTAACAGTTGATGGTGGCTATAGCAAAGACAAAAGGTAGAAGATCGCGAGTTCAGAAACACATTTCAATCAGTAAATGAAGAAGGATGCCTCACATTTTCGATGTGATTTTTGACACAATATGTGAACAGCCCCATACAGATTTAACCTGATAGACACAGTACAAGGACTGATCTATAATAGTTAAATGATTACAAGCCACGCGGGGCGATTACAACTTACAACACACAATTAAATACATATTTTGCACACTAGTAAAAACAAGGCAACAATTTTAATTATACTTACATGTTATGATCTGGAGGAAGAAGAAACTGATCCATATGAACTGTAACAGTTACTGGCAAAGTCCTTGTCAAAGTCTGACTAAGTTCCATACATAATAGTCTCTGCTGCTCCTTCCTTTTATAGCAAACGGGTGACGAGTCCCGCGCTGCAGTGTAGGTTATTGTATCAATTATAAGAAAAATGACAGGAACAAACACAGCACTGGCTGTCTATACTGTGGTGTTGTTGTGAAAATGAGCTTTAACTCTTTATTCCCTGCAGCCAAATCTTCATCTGTCATTGTACATTATCTTCACGTCATGATCAGTCCCGTGATCCTCAGTGCTCTGCTGTCTGAATCAAAAGCGCATTCACATTTTACCGGATCCAGTACTACATATTTGGTGATGTCGTAGATGCGATCAAGCAAAAGATCCGAACCCAACACGATTCATTAATTCGACTTGGTCTTGTTGTAGGTCTTAAATCATTTTAAACAGGTTCTAATTTTCCTATGTCTATGTAAAGCTACTGAGATAATTCAACAATATGTTTATAAATAGAAATACTCTATTTATAGAGTATTTCTATTCATAAACATATTGTTAAATTATCTTCCTTAAAACAACATTTGCTTTTATTGGTCTTTTAATGTTTTTACTGGGCCATTAGAAAAAAATCCTTTGCGTTTAGCCTTGTGTAAGTCTGAAATTTAATTTATAATAGACTTAAAAAGGTCTTAAAAAGTCTTAAATTTGACTTGAAGTCTGTAGAAACCCTGATATATATACACTTTGAAAGTCAACAGTCAATTTTATGTAGTTAACTCAACATTTATTGAAAGTTAATTCTGCTCATTTGAAAAGAGTTTTGGACTGAGTGTTGAAGGTAATGAGTTAATTAAATAAATTAAATTAATCAGCTTCAATAGAGTAAGTTCACAGTAGCTGTATAGATACGTTTTTTGTTTTTTTTTTAACTCAAATGGTTTGTTGCAATCGGTTTCCCTTAAACAGTTTGAGTTGCCTTAAAGGTGCAGTAGGTGATCTTCCACAATGCTAACAGCTTAGCATAAATCTCTGAATCACAATCCCTTCCCTGCCATCTAAAGCCACGCCTCCTTAAACATGAGCACAGCAAAAGAACCTTCTCTCATGTGTTAAAAGCAACTAATGCTTGTCAGGCGGCGTGCAAGCCAAACTGACATGCTATTTTAGAGTGAATATTTAGAGTTGCATGGTAAACAATATAGGGAGAGACTAGGCGGAATAGTGGTATTTGCTAATTAAACTAATTAAAATCTACATTATCGATGCTGTAAAAGGTCCCTTATGAAAATAGTCTTATCAATCTTTCACCGGAAGATTTTAATGGATGAACAACACTTCTGTGAAGATATAACCCATTTGTAACAACAACATCCAACATTACATCAGCTTTGCGTGAAGCTAAGATAGTTTTAAAACAGAACATTACCTGTCTAAGAGAAATCCTTCAGCCATGGTGTCATCCTTTCTCCAGCATGCAAAGGTAACTCCAATATTGATTCAGGTTTTTAAAAAGTTTTGATTCAGCAGGTTTTTACCGATTGCGCATGTGCACTCTCTCTCTCTCTTGTGAACGCGCAGCATGTCTATGCACAAACGGCGGTCAGCGGAGCTGCGTACAAAAGGCTCCGCTGTTGTACAAATCTGCATTTGCTGACAGACAGTTTGGCCTATCGGAATTATGAAAGATGTCGGCCCAACTCTATTTAATTGGTAGAACATTTTTTAGTTTTAAGGATGGGTCAATCAGTAAAACCAGTTGGGTTTAGGGAAGGAGGAGAGGGAGGGTTGGTCGGCCAATTGGCCGGTCAGCCAGTCAGCCAGTCAATCATTTAGTCATTCAGTCAGTCGGACAGACGGTCCCTCGAAAGCGGCCTCCGGCAGCTTTACGCGAGAACAGTGCGGACGCCAACAGTGCTCGGATTCGCGAAAACAAAAACTGCACAAATACGTACCTCCTGGGAAGTATCTTGCGGTCTCCAGAAACGTCCGCGGGACTATGTTTATAGAATGAGCCTGGGTTGAAAAATACTTACATCTATAAATACATTTAGATCATTTTCTTTAATCATTACTATTGGAATGTGAAGAGACTTCACATTTTTTGTTGTGAACCAGCACAACAAAAAATGCCTCTGAAGACAATCACCTACTGCACCTTTAACTTATTATGTTTTAGAGTACTCAGTTGCTTTGAGTTCTCTTCATTTATTGGGCTTTATAGTACTCAAATTGCTTTGTTTACTCCAATGAATTAAGTCCACAGCACTCATTAGGATTAGTTTTTTAACTTAAATGGTTAGTTGCAATCAGTTTCCTCAAAAGATGTTACTTAATCTCCACAATCCATAATGTCCCATAATGGAGCTTAATACATAAATAAACACTTGTGAATCTCAAAGCATGGGAAACCGTTAATAGTTATTTAACATTTTATACAGTGTATATGGCTTTATCGAAAAAAACATTGCAGAATAAATCTTTTAAAGTAATCCAGTCTTAATCTAATTGATGTGTACTCCTAAAAGTATTATTTTTGGTCCAGGGGGAGATGCATGTTTTTTAATAATAATTCTAAACTGTAAGCAGTTGCACATATTTATTTAATCTCCTTGTAATGTGGTACATTTCAATCACTCTATGTGTGTGCGTGCATTCGTCAAATCATTCTATACAGGACCCCCATCCCTCCCAGAGGTACCATCACAGGACTCGCAGCCTGCAGGCAGATTAATATGAAATCTCTCAAAGCATGAAGCATTTATAATAACTGTTGCTAAACATGTTAGCTAATTTGATTGCGCTGACCCATAATGAAGCCGTCGTTCTGCGTCGTGTTTATCCAGCTTTCACACTGCGCTTACACCTTCTGTCGCAGTACAAGAAAGACATTCGACAGACAGCGGACATGCTTGAATATCACAGAAGGGCTGTGTTTACACATTCTCCAGCTTTACAGTAGCACGCAAACACGTTGTACAAAAGAAAGCAGGTATACAGGAGGAAGATGTGGATTTGCCTGGGGGCACCTCCATAACACTCTCCGTTCAGGTCTCCAAACCCTGGCCATGTGTATTGGGAAATGATGTGGCTTTCATTATCTGCAAGAAGCAGCCAGATACGCAGAAATCTCACGCTCTGCATCGTGCCCAGGTCTCCGCCATCTGCCAGGCCTAATGGAGTCACCAGGGTGCAAATAGGCCTCCGAGACTGCGAGCATCTGAACAAAGAGACTATGCAGAGCAGTGATTTATGGAAGCTATGGAGAGAGACGGAGCTAGACGTTCATACGAGTGTGAGAAGAGAGTGTCAGGTCTGAGACTTTAAGAGAACGGGCTACACACAAGGTGGAGAGAGACTGCGGAATAATATGGGAAGGAACCTCACGTGGAGCCGCAAATGTGTTTTTGAGGCTGCTCATTTAAAACGGTTGTGTCATCATCAGATCTTTTGGAACAAGAGTTGTTTGTCTCAAAACTTTTTGTTTTCAGTTTATTGAAACTTTGGCGAAAGTGGATTGTATTGATACCATACTAAATGATAACTGATTAATTGAACAGTAGTATTTCAATTTGAAATTGAATGAAGTTGCACTATAAGTAAAATGATGTTGAATTGTATTACTAAAAAAAGGTAACACTTAAAGCTAATAATAATAACTGCACACTATAAATCATTCATTAAGTACACTACCTGACAAAAGTCATTGTCATCAATCCCAGGTATAAGAGCAACCAATAATATTTTGACTTCTAGTTGATCATTTAGAAAAATGGTTGAATTTTTCCAGTGAATCATCTGTTGAACTGCATACCAATCATCAAAAATACGGCAGAAGACCTATTGGAACCCACATGAACCCAAGATTCTCACAGAAATCAGTCAAGTTTTGTGAAGAAAAAAAAATCATGGTTTGGGGTTACATTCAGTATGGAGGAGATGTGAGAGATCTGCAGAGTGGATGGCAACATCAACAACCTGAGGGATCAAGACATTTGTGCTGCCCATTATATTACAAACCACAGGAGAGGGTTAATTTTACAGCATGATACGCTCCTCATATTACAGTCTTCACTCAAGTTTCTGAAAGCAAAGAAGGTCAAGGTGCTTCAGGATTGGCCAGCCCTTTCACCAGAGATGAACATTATTGAGCATGTCTGGGGTAAGATGAAGGAGGAGGCATTGAAGATGAATCCAAAGAATCTTGATGATCTCTGGGAATCCTGCAAGAACGCTTTCTTTGCCAATCCAGATGACTTTAATAAGTTATATGAGTCATTGCAGAGATTTATGGATGCAGTCCTCCAAGATTATGAGAGTCATACACAATATTAATTCTTCTTCCACTGCATCATGACTTTATATTCTATACTGTACATTATTTCTGTTAAGTGACAAAACTTTTGTCTAAGCAAAGTCAGACCTTACTGTCCTAATTAAATAATTAAAAATCAAGGCATGATCATATTATATTTTGGTAAAATCAGCGTAATCTAGGGGCCTTTGTTTTTCATATAAGCCACTTCTGACACAAAATGATCAACTTAAAGCCAAGTTATTATTTGTTGTTCCTAAAACCTGGATAGTCGACAATACTTTTGTCAGGTAGTGTATTAGGAAGTAGATAATTCATCATTTGTTGAGCATTAACTCTTCAGAGATAGAATACAATAATTTTATTTTAAGATAAGGTTGCAGATTTGTTTTCTATTTGATAAAATTGTACAATTTCATGTTTGTGTCTTAAAATCATTTTTTTTTATTCTGAATCACTCTGTCTTTCATTTACTTTTTTCAGAATATAACTGAGCCTTTATTTGTCATTTGTAAGAGATTTAAATTGTCCTCACTTTAGATAAGCTCACAAAACAAAGTCTATAACACATTTACTAACATACAGAGTATGCAAATATTACTATAGACCGATGAAAAACATGTATACATGTTCATTAGAGTTGTTTATTAATGCATTTACTCATTCCGAATTATCTTTAAAACCACCAACTGCTTTTAATGAACTGTTATAGAAGTAATACAATAATTAAATTAGTATTGAAAATGTAATCATTAACAAAGAGTGAAAACACAATCATTGAGAACATTATTTAAGTCAAGAATACAGTGTTTAAAAACATATTTCTACTCTGCTTACTAATGTATATTAATATAGAGTTAATGCAAAAAAATGAATTAACTATTTGTTATTACTTAATAAATGTTTCAAACTGTGCAGTTATTTTTTAGTGTAAAAAAGTATACTGAACCATGTATGTGAATTGTACATTTTAAACTGAATTAATATTGCATTTCTCCAAATTTGTGTTAGTTAATAGTACATTAAGAGAAAACTGGATTTGCAAATGCTGAAATCAACACAAAGTAACTTTTATCAATGTCTCTATAGTATTTCTAAACTTTATTAATGATACAGCACACTCTCACACTTCATTTGCTTCTGTTTTGGAACATTTGATGATTATGTAATCAAAATAAAATATGTATTGCAGTGATGAAAAACTGAAATCGAATGCATTTCTGATGTGTTTATATGTTACTGTCATCTGCATAAATAAATCAATTCGCTTTCTCATCTTACTAGCTTTAAATATGCATCTTTACTGATTAATGAATGCATAAAGTGACCAGATGGATATAATGCAAATATACAAAAGCCGACCATGACATTAAACATAGTTTTAACCACTTGAGGTTCTAAAAATTATTTTTACATTTTTATTTAATTTAACATTATTTTAAATATTTTAGGATTTCTAATTTAATTGTACATAAATCATATTGGAGACGTGCCAACAATTTAGTCTATGATATTGGTCAGTTTTAAGTCATTATTATTGACTAGAGCAGGGGTGCCAAAACCGGAGAAGGGATGGTGCCCTGCATAGTTTAGCTCCAATTTCCTTCAACACACCTGCCGGGAAGTTTCTAGTATACATAGAAAGAGCTTGATTAGCTGATTCATTTGTGTTTAATTGGGGTTGGAACTAAAGTATGCAGGACACCGGCCCTTCAGGGCCGAGTTTGGGCACCCCTGGACTAAAGCATTTATTAAGTTGTAAACCTAAGAAATACTTGTCAAAGCTAAATGAAATCTGTACAAAATATAGTTTGTCAGACAATTATAATAATTATTATCATTAGTAGTCGTTATAGTAGTAGTATTCATTCATTCCTTTTCTTTATTGGCTTAGTCCGTTTATTAAACTGGGGTCGCCACAGTGAAATGACCCGTCAACTTTTCCTGCATATGTTGTACACAACAAATGCCCTTCCAGCTGCAACCCATCACTGGGAAACATCCATACACACTCATTCACACACATACATTACCTTCAATTAAGCTTACTCAATTCACCTATATGTCTTTGGACTGTGGGGGAAAGCCATGCGAACTTGGGGAGAACATACAAACTCCACACAGAAATGTCAACTGACCCAGCCAAAGCTCGAACCAGTGACCTTTTTGCTGTGAGGCAATTGTTCTACTCGCTGCGTCACTGTGACACCTATTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTGTTATTATTATTATTATTATTATTATTATTATTATTGTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTTTTATTTTTATTGTTATTATTATTTGCTTGTTGAATATTAAATGAATCTATTCTATATCCAGTGTAAATTATTTGGTGATGCAGTAATAGTACAACTTTAATGCATTTTTAAATTTAAAATGTTTAAACTTTTTAAAAGTATGTGCGTGCGTGTGTGCGTGCTTGCATGCGTGCGTGCGTATGTGTGTGTATATAGTAATGCCCATTTTACCGAACAGCTAAAAACATTTAAAAAGTATACTTAAGATACAGGACTAGTTTAAAGTAATACTTGCAAATTGTTTGATTTGTTCTATTGATTAAGTAATTTTCATTAAAACATTAAAATGTTTCACCAATAGAATGATTCATTAGCAAATCTAATTTTCACACATACTTATCCATTTATCACAAACTGGAAAGGTCACCAAAAAAAATGGCCCAAATGTATAATTACAAAAGCATTTATGTAAAGTAAAAGTCCTAAGGCCCAGTAAGATGGTGTATTGGTCTAAGAGTGTGCACTGTCAAAAATATTAGTTAATTAACAGTTTCCATATTTTTGTTCCATTTATATACAGTTGAAGTCAGAGTTGTTAAATCTCCTGAATTATTAGCCCCAATTTTTCTTTAACGGAGAGAAGATTTTTTAAACACATTTCTAAACAAAATAGTTTTAATAACTCATTTCTAATAATTGATTTATTTATCTATGTCATGATGACAGTAAATAATATTTGACTAGATATTCTTCAAGACACTTCTATACAGCTTAAAGTGACATTTAAAAGCTTACCTATGTTAATTAGGTTAACAAGGCAGGTTAAGGTATTTAGGCAAGTTATTGTATAACAATGGTTTGTTCAGTAGACCTTTGAAAAAATATATAGCTTAAAGAGGCTAATAATTTTGACCTTAAATGTTTTTTTTTTAAAAACTAAAAACTGCTTTAATTCTAGCCGAAATTAAACAAATAAGACTTTCTCCAGAAGAAAAAATATTAGCAGACATACTGTAAATAATTTACTTGCTCTTTTTAATATCATTTGGTAAATATTAAAAAAATAATAATAATAAAATTAACTTCAACTGTGTTTATTTGCTCTGTCAAATTTTGATAAAGTGAAATAGTAAAATGTTCCAAGTGGTGCTCGCTGCAGAGCCATTTGAGGAGAGCTGAGCTCCAGCGAGGGGGAGCTTAAGCTTGAGCTCCACCTTTTTTGCACTTCTTCTACGAGTGATGTCACTGGGGGTAGGGTTAGGGGTGGGGTTGGTGTACGCATTAAAAAAGCTTACAGGAGGAGGAGCGACAGCTCATGCTCCCCCTCGCTGGAGCTCAGCTCTCCTCAAATCGCTCTGCAGTGAGCACCCTCTCAAATGTTCTGGCAGCTTATTACAAGGTTTTTGTAGCATAATATACAACACCAACCCAGACAACATATCACTTTAAACTATTAAAAATGTTAATAAAAGTCACCTTTTCCAACTTTCTAAGCTTAAAAGTCATCAGAAAAGAAAAATCAAGGTCTCATAATGCTATTCAAAAGCATAAATAAATAAAATAATAAATAAAAACATGAATCACAAAATACGAAAAACTGCTACCTTAAGGATATTTTCTACATTGTGTATTGAATTAATATAATCACAAATAACATACAGTATGCCCTTTAAATTGTTTTTAAAAAAAAGGAAAACAGTAGTAGTTGCCATATTTTGGTTATAAAAAGAAAAACGGTGACCAAAGATGTAAGGAGTGATCACATATTTCAAGGACAGTCAAGTTGAGAGTGTATTCTCTGAAAAGAAAGAAAGAAATAATAGAACATGTGAGACGGGAATTAAATGGACACTTTCACTAAAACCGTATGTGTGCCTAATGGGGGTTGGAAAGGAAGGAGACTAAGTAACCAAGACAGAGAAAGGATGTGCGATATTAGGAGCTCCAGGGGCTCTAGACTGAAGGATTGTACGTATAACACCAAGTGCCCTAGCATTACACGTGTGCGCCGTGTGTCCACTTAACATGTAAAGTGCACTGGAAAGTGATGGTGTATGATGGTACTCGCTCTTCCTCATTAATTGCCTCCCAGTCCCTCCGGCAAGTTCTCTTCAAGAAAAGTCGCATATGCAGACAGGCAGTCACTTCTCCTCTTTCTTCTGCTCAAAAAGCCCCTCTGTTTGTCACCATTAGGCTTTCAGGGCACTCCTCCATTCTCATTCATTGCTGACAATAAAGGAAGTGCAGGAGATTTTTTTTCTGCCCATCCCAGCAGAAGCTCAAACAGACCTGCCACCCGTTTGAAGTGCAATAGCTGGGCTTGTCTTTATCGTCGCCCCTCGTCCGGCCACTAAGGTGGAGCAGGTATGATGCCTGTCCCCTGAAGTTTAGACCTGGCTTAATTCAAAGCCTTGGGACTGATACTATTTTAATGGGCTGTGCCATGCGCTCAATCTCCGTCAAAGGAAATTGCAAATGAGCTTCCTGAGCCGCAGCTTGAAAGAAAGTGTGAGATTATGTATGTATGGATGCATGTGTGTGCACATTTTTTCTCCTTTCTTTATCAATTATGGGGTGTGAAATGTATAGATGCTAATTTATTGAAGTTATTTTATTAAAGCAGTGAGCCACTTGAGGATAAGCATCATTTACACTGAAGCTAAATGATCTACTTATGGTGTAATGGTGGTCAGATCACTTTAGTGCGTGGAGAAGTGGCTGTTGGCTTTTTGTAATCACTGCAATGATCCTAGTGCTATATGTACTGTATACAGGGGTGTGGGACATTAAAAATTCATTGATTCATTCATTTTCTTTTCGGCTTAGTCCCTTTCTTAATCAGCGGAATGAACCGCCAACTTATCCCAACACTGGTAAACACCCTCTTTCACAAACATACTATGGCCAATTTAGCTTATTCAGTTCACCTATACCACATGTCTTTGAACTGTGGTGGAAACCGGATCACCCAGAGGAAACCCATGAGAAGAACATGCAAACTCCACACAGAAATGCCAACTGACCCAGCTGGGGCTCAAATCAGTGACCCTCTTGCTGTGAGGTGATTGTGCTACCCACTGCGCCACAGTGATGCCCACAATGAAAATTAGACTTAATGAAACACAATAATATGGTGTAGGACCTCCTTTATGCTGCCAATACAGCATCGACTCATCTTTTTAACTGTCAGATAGAAGCCCTGAACAGTAGCTAGACGGCTTTTGAGCCCTTCTTCTTGCAGAATAGTGGCCAGATCAGGTCACTAAAGTACGTGATGCTGGTGGAGGAAAATGTTTTCCGACTTGCTCCTCCAAAATACACCAAAATGGCTCAATAATATTTAGGTTTGGTGACTGTGCAGGCCATGAGAGATGTTCAACTTCACTTTCAAGTTAATCAAACCACTCTGTCACCAGTCTTGCTGTGTGTATTGGTGCATTATCATCCTGATCCACGGCACCGCCTTTAGGACACGATGTTTGAACCATTAAAGGCACCCATTTAGCACAAGTATTGGGCCTAGGGAATGCTATGATATTGCAGCCCAAACCATCACTGATTCACCCAAGTGCATCATTCTGGACATGCAACAGCTTGTGTGGTATGCTTCTTTGGGGCTTCTCCACACCGTAACTCTCCCGGATGTGGGAAAGACAGTGAAGGTGGACTCATCAGAGAACAATACATGTTTCCTTTTGTCCACAGCCCAAGATTTTCGCTGCTGGCACCATTGAAATCGATGTTTGACATTGCCATGAGTGACCAAAGGTTTGGCTGTAGCAGCCCAGCCATGTATATTAACCCCGTAGAGCTCCCAACGAACAGTGCACATTTGATTCTGCAGTGAGATGAGCAGCTGTGGTTTTAGGTTTTTTGGATAAAATCCAAGTTAGCACCCAGACATCCCATTCAGATAGCTTGCTCCTGCGTCCACAGTTGCTCCTGTTGGATGTGGTTCATCCTTTTTGCTGGTATGCTGACATTAGCCGGGACATCTTGGCTCTTCATACATCACCAAGACTTGCTGTCTTAGTCAAAGATGCGCAAGCGACAATTTTTCCTCTTTTGAAGTCTGATATATCACACATAATGTTTTGTACGTTGAAATATTTTAAAGGGCCACGAAAACCCCCCTGTTTCAGCTGGGTGTTTTCACACCTCTAGTTTGTAAAAAGTCAGGAAAGTGGGTGTGTCCGGCTCTGTTTAGGGGGAGTGTCAGAGGAATAAAAAGGCTTAAAAATGGAAGTTTCGGTTTGGGCATATGCTGATTTTCACTGAGGCAAAAAAAAAAACAACACACAGACGCAGGGCAAAATGACAGTGACTGTGTTTACATGGACATTAGTAATCAAATTTTTTGCCAAATTATTAAATGGTGGACTTTAACTGCAGTTTGGCACTTTCATTTAGGAACATTTCATCCATGCCCCTCATGACAAACAAGATATTTGATTTGAGGAATTGCTGGAAGCATGTATTTTTAATGGAATGTTTGATACTGCACGGCGAATGAGTTCTGTAACTTAGATGCACTCGGTAGGTAGTGCCAGAAAGCCATGTGTGTTATTCCTGTCACAAAATAGGGCAAAAATCCTACTCGACGGTAATAGTTTGATCGCAGTGTTTACATGTTTACACTCGGAGAGCAGCTCAGAGAGCACGCTGATTAGTTTGAACCAAGTCTTTCTCATGAATTAATGCTGCACCCTCAGAGATTCAGAGATGTCACGATGCACTCGCAGGTACAGAGAGCCAGTTTCCACGCTGGAATACATGCAAGTATCTAATCAGCATGACGCAGCGTCAAAAATTTGATTAAAAAATTAAAACGAATTTGCTCAAAATAACACAAAATTCTCTTATTTTGTGAAATATATGTGTCCTAATAGTGTTTTTAGCAATGTGGGACACATATATGAATGTCAACAGCTCAGAAAATGGGTTTTGGTGTTTCGTGACCCTTTAAGCCAGGGGTCACCAATCCTGGTCCTGGAGGGCCGGTGTCCCTGCAGGCTTTAGCTCCATCTTGCCTCAACACACCTGCTTGGATGTTTCAAGTATACCTAGTAAGACCTTGATTAGCTTGTTCAGGTGTGTTTGATTCGGGTTGGAGCTAAAAACTACAGGGCACCGGCCCTCCAGGAACAAGTTTGGTGACCACTCCTTTAGGCTGTAAGAATGGGTTTTTACCACAGCGGTTAGAACTGTAGTTCTGCCAAGCGACTAAAAAGTTATCAGTATGATGGTAAAAAACCATACATTTCTAGTCAAACCATTCTTCTGCAATCTCATACCAAAAACGAAAATAAGGGCAGTATTAATAGCAATAAATATGGCAGAGTGTTGATATTATGTGATTGTATTGTATTGCAATATGGAACAATTAAGTGTTGATGTTAAATCAAAAGTAATTCACAAATACTTGAAAATGAAATGATTTAATGATAATAACTTGCTATGGTTACAACTGTATTAATCACAAAATGAGTGTTTAAAATGATAAAATATGAAATGATAAAACATATGATATAAATTGTATCCAGCTTAAATGTAAAAATAAAGTTACCAAAGGTGTAAGGAGATACACAGGGGGAGGGAAAGAGAGACAAAGAGAGCAGGCCCAGAAGTTAGCCTGAGTGCAGTAGAGTCAGAGAAGATACACTCCAGAGGAGGAGAGGAGCAGAGCAGGAGAGCACAGAGACAGAAAAAGTCAGGCCAGGAAAAGAGACAGAGCAGAGTTTTACACCTATTTTGTATCTTTCTTGACCATGTGATCAAAGCCCAAATGCTGAGACATTCAAACTCACCAATCAACATGTGACCACATCATAAAACCCCCAAAGTCCACATACCAGGCCCTGATCGTATCACTGTCTGCCTTTGGAGTCAGTATGGAGCTTCTTTGATGAAAGACATGTTTTTCCATTTAAACAAATGCATATGATAGTTTAGCCTTTTACAAAGCAAACTGTGCTTTCAATATGAATAACTTTAATCTATATCTAATAAAAGTATGTTTGTCAGATTTATTGTTGTGTAATTATAATATATTGGTAATTGATTTAATGTATTTTTGTAAGTGTAGTATTTTAATAACATGCTATAACTTGTAATAACAAATGTATTATTATTATTAGTTTTGTTGTATACATTAATCAGTTTTTCTGCTCTCTGCTTGTTTGTTACTTGTGCACCTTGTTATTTCCCTGTTTATTGTAACCTCAGTATGACCATCTAATGTCATTATATTACACCACTTTGAACAATAGCGTAGTTCTCCTCTGTATATATTTGTGTGTGTACTTGAAGCATGTCCCTGGTGAAACTCCACACACAAACCAGCTGAAAGAGAATGGCAGAGGAGGCTCGAGCACTCAGGGGACTTGGCCCTGTTAATGAACACTCTGCACTGGCAGGGAGGCCCAGTCTGATCAAAAATACATACAGAGCTCTGCTCAGATCGGCCCAGTGCTGCGGCCAAGAGATGCCTGAACCCACACACACACATGCTGCTTCTGAAACCAGGGCTTCTGCTTTCAGAAAACACTGTCCCGCTAGAAAATCTGAGGCTATAGCGTACTATAAAAACAGTGCCCTGAAGGTTTGAAGCATCTCTCTCTTTTCCCCTAAAAAACTGATTTTATTTGTACCTTTTCTGCATCGATTCCCACTTCTGTTTTTCTGCTGTGATTGTTTGGACAACTTACAGTGATATTTCCTACATTTTTAACAG
Seq C2 exon
GCATCCACTGTGACAGCATCTGCCCGCAAGGCTTCTGGGGGTCCAACTGCTCCATGACCTGCTCATGCCAGAACGGAGGTTCCTGCTCTCCTGAAGATGGGACCTGTGTTTGCGCTCCTGGCTACCGAGGGACGTCCTGCAAGAGAA
VastDB Features
Vast-tools module Information
Secondary ID
ENSDARG00000062686:ENSDART00000147902:12
Average complexity
IR
Mappability confidence:
NA
Protein Impact

ORF disruption upon sequence inclusion

No structure available
Features
Disorder rate (Iupred):
  C1=0.000 A=NA C2=0.000
Domain overlap (PFAM):

C1:
PF0005319=Laminin_EGF=PU(50.0=65.7)
A:
NA
C2:
PF126612=hEGF=PD(23.1=6.0),PF0005319=Laminin_EGF=PU(65.4=68.0)


Main Inclusion Isoform:
NA


Main Skipping Isoform:


Other Inclusion Isoforms:
NA


Other Skipping Isoforms:
Associated events
Conservation
Primers PCR
Suggestions for RT-PCR validation
F:
No suggested primer sequences
R:
No suggested primer sequences
Band lengths:
Functional annotations
There are 0 annotated functions for this event


GENOMIC CONTEXT[edit]

INCLUSION PATTERN[edit]