DreINT0096579 @ danRer10
Intron Retention
Gene
ENSDARG00000045401 | mllt10
Description
myeloid/lymphoid or mixed-lineage leukemia (trithorax homolog, Drosophila); translocated to, 10 [Source:ZFIN;Acc:ZDB-GENE-041114-176]
Coordinates
chr24:17003747-17013385:+
Coord C1 exon
chr24:17003747-17003826
Coord A exon
chr24:17003827-17013330
Coord C2 exon
chr24:17013331-17013385
Length
9504 bp
Sequences
Splice sites
5' ss Seq
GTGGTGAGT
5' ss Score
8.95
3' ss Seq
TTTTTCTTTTCTTTTCACAGAGG
3' ss Score
11.06
Exon sequences
Seq C1 exon
CCTGCTATGGAATTGTCCAGGTCCCCACAGGCCCTTGGTTCTGCAGGAAATGTGAATCACAGGAACGTGCTGCCAGGGTG
Seq A exon
GTGAGTTTCCTCATCTTTATACCAAGCTTTCATGCTGTCTGTTTTTCTGAAGTCCACATCTCCTTCCTCTTTTATACATTGCAGTTTCCACTTGACAGATTATTAGTATTATTGATAATATGAACTGGTAACTGTAACTTGTCTTACAAGTTTAATTCTGTGGTAGCCAGGATGAGGGACATATCACAGTAAACATGGTTGAAGGCCAGGCAAAGGACATTGAGGCAGTGTAATTTTTAGTTTTATCCTGTTAGACCAGTGGGTGGTAGTTTAAACTGCTTAGACTAGTTCTGGTAGTTTAGTCATGTAATTATTTCTTCAAGACAGGTCATGCTTTTCTTTAGCAATAGTTACATAAAAAGTTAAATTTGACTAATTTGAATATAAAATCCTTGGACTGTTTTCTTTCAGAGCATTACACAGATTTAATAAAAAGGCTTATAATATAAAGGCACAAGTGATGCAAGATTTTATTTGAATAAAGTTCAGTCTGTGCATGGACAGACTTCACCCTTTATAATGTTTTGTCTGAACTTTTTCTAAAATTCTAAGATTCATTAATTACATGGAATGTTAATGATGTCATATACTCTGTTCTTGTACGGACAATTTTTTGTGCATTTGTACAATTAAGGGGATCGTTCACGCAAAGAATTATAATTAACTTTTTTTTCTGTTCCGCACAAAAAAGATATTTTGAATAAGATATTTTGAAGAAAGGTAAAAACCTGAAACCATTGACCTCTATTGTAGGAAAAAACAAATATTATGAAAGTCAATGGCTGCAGGCTTTCTGTTTTGTTTAAAATATCTCATTTAGCTTTTAACAGAAGAAAGAAACTCATACAGGTTTGAAACCATTAAAGGGTGAGTAAATGATGACAGTTTTATTTTTTTGAGTGAATTATTCCTTAATGTAATAGGATATGATAGGGATTTAAAAAATACTGACTTCTGTATCAATTTATAGTGAAATATATATAACATTTTTTGATTATACCATCATTTCCGGCTTGTATTTTGAGTGCTAATGAGTGGACTTTTGAGCACAGCTGATTGGCTTTTGCCTTCACATGCTCAAAAGATATGACTGTGTCTGCCTCCAATGATCATCAATTGATATTCATCTCAGAGATAACACATACAGTTGACAGGAGCATTTGAAAGTTGTGTCTGTCAGAGGACCTTCTATGAGCTGATAGATGTAGCTCCATTGTTTTTTGTGTTTGGGTTTTACACTGACTATCGAGTGATGCTTGTTGAAGCCAATTACAGTCGTATCTGTTGAGCATATAAACACAATGTGCACAAAACACTTTTTCTTTTTAAAATGTATTGTTATGAAATTTAAAGATTAAATGTCCATGCACACATCATAAGTGAGTTCATGTGAAAATCGTTCAGATGCAGTGATATATGACCAAGTTTTATTACTTGGGAAATTCTGAAGCAATTGCTTATTTTCTATGCCAAAAACATGGATGGAGGAAAACACTACTTTCATTACAGAGCATCTCTCTCTTCCTCCTATAACAGCTATTGACTATTCATAATTAGACTATTAGACTCTTGAATTTCTGTGTGTTAAATATATGTGAACTGACTGATACCCCATTTCTACCAAGATGGTTTAAGTAATGGGTTTAAGCCCAAGTTTATTTTCAAATCTGTTCTTTATCTTACAACACTTAAAGCACAACCTCTGAACAAGGAAAAGGGGTTTTTAAGCAGCACTGAAACATTGCTTGGCTAGAAGTAAGAACCATTGGTCTCAGGGGCAGGGTGTGGAGTTACTAAAACCAAAAAGATGACCAGAAATCGTTTTAAGCATCATATTCGATAAAGCAGCGGAACATATTGCCGAACAGATGATCACTTCTAATCTCTGTGTATTCAACTTACAGCATGCCGCTCGAACATCATCTATACAGTTTATTGCGCACTGAATGCAGTTGTCTGTAATCTCTGTCTATACAAACTATGGTATGCGGCATGAACACATTGGATTTGCGTCTGCTTGGATGCGGATGTAGGTTTGCAAAGTTAGTAATATTCAAAGCAATAAATCATTTATTCTAGCTTTTGTTTAGCTGGGAATGATGAAACTGTGACATCAGACCTGGATCTACTATCCTTACTAGATGGTCGAAAAGTAAAGCAGTTCTTAGAAAGCTCGCTAGACGAATCAGCTCCAAAATGACAATAGCCATGGCTTCACACTAGAATCCAGTATTTGCTCGTGGAAAAGGGGTATTTGTCTTTATCTTAGGGGCAGTACACACAAAGGTGATGCCAAACAACTAGCACTGACGAAACCCAACTGTGTTATTGCCTTGTGTTGTTCATGGTTGGAACCAAAAAGTGCACGTAAACACAGCAAACGGATGAAAGCTGACTGATTCAAGAGTGTGTGTTCTTCAGTATCTGTTTTCTTGTTCAGAACTGCAAAACCGGCAGAAACAAAAACCTTCTGATGCATGCAAAGCACAAACAGCAGTGTTTAGTCCCATTCACCATGAAGGGCATTGCTCCTGAAATTTGTCTATTAATCAAGTTCATCTTGTTTGCAAATATTTTAAGAAATGTAGCAAAATTACGCCGGCCTCTTAGTGTTTCATCTTGTCTTATTTTCTTTACTTGCTACATCACTTTACATCATACTGACTATGTTTACATGGACACCAATAATTTTAATGTGATTAAGACAATACTCTGATTGACAGTCTACCATGTCTAACAGCAATTTTTGATTAATTTTACTATGATTAAGGTTATAATCGAACTAAAGAGGAATCGAATTAAAACATGTGGAGTATGTTGACTGTAGTTGCATTATTGAAGTGCAGCACAGGCATGTAAACACCTTAATGGAACTATTACCGACATGTTTGACTTTTCGCCACTTTTTGCGACAGGTTAGTCCACACACTCACATGCATGGCTGATTGACAGTCTTTTCACCTACCGAGTCAGTGGAAACCACAGACACCTGCATCATGAAATGCAGAGTTTTTTTTTTCTTCTATTCAGCATGCGGTTTAAACTTCCATTAAAACAACACTCTTCCAGCAGTTCATAGTTGCATCTAATATCTCATTTATCACGGGGGGCATGCATGAAATGTTTATGAATGAAAGTGAAAGTGCCAAACTGCAGTTAAAGTCGACAAATTAAAAATGAAAAACCCGAAATTACATGAAACTCTGGAGGAAATGCGGATAGTGTGGTGATGCAATGATTATAATCATATTATGTGCTATAACGTAAAACACAATCTTGAAACTAACACTCAAAAAGAAACTCATGTAAACCTTTTAGTCTTATTATTCTCGTAATTAGATTAAAATAAATAATTAGATTACTGATGTCCATGTAAATGCTGTCACTGACACTCTGATTCATTGCTATATAACCATCCAGAGTTCTCTGTTCAGCCAATTTGACAATCTGATTCAGGCCAACATATCTTGGTAAGGATATTGCAATGGTTTGTAATGAGTGATTTCGTGCAAATGTATTTGTGTGCCTGCCTGCCTTCATTAGCACATGCTCTGAAAGACTTTTCACAGCATCAGGAAATGTCACATCAATGCACACCTCTAAAAATGACCAGGTAACCCATGTTAAAGGGCACCTATGGTGAAAAATCAACTTTTCAAGCTGTTTAGACAGCCATGTGTGTAACTATAGTGTATAGACTGTCATATTGGGGTGTTAAAAACACACAGTCCTTTTTTTCAATTTAACAACATAAAAACGGTGAACCAATTGGAGCGGTTTTCAGAGCGACCGCAACTTGACGTAGGAGTGCAGTCCCCCCGCCAACCAATATTGATTGACTGGCACGTCACTATCCTCAGTTTGTCGTTTCACATCCGCTATTTTCAGTGTGTGAGTCAAAGCGATATTACTAAAGGAACACCCTTGCTTGTTTTTTAAATTTAAGGCTCATTTGGCTCAACACAAGATCAATATACTCCACATTATAGCTCTAATCGGAATTATTGTTTGTACCTTTTGGTTGGTCTGCAAATGTGTACTTTTCATTGCGTCGACCTTAAACTTCAGCCGTTTGCATTTCTTGCAAACGCAGAAGCTCCCTGTAATCTTAGGTGGAGCTGGAAAAGTGCAAGCGCGTTGCCTCATGTGCGCGTCTCTCCATTGGAAATAAAATAACAAACTTGCCTGCAGGTCACACACCAGAAGCGTCCCTCTGCGCGGCAGAGTTCTGGGTGTGGGTTCCTGTCGGGGTGCACGCTGCAAGAGGCTGCCGACTTGGGGCGTCGTTGTGTTTGCCCTGGTGGAGACCTGTGTTTGGTGTTCTGGAATACATGGCGCTGCGTGGCATGACGATTCAGGACACTTCATGTTTCTGCCGCACCACTGAGAGTGTCTGGTGTGCCATGTCGTGGCTTCGAGCGGCACATCCGGTGCCTCAGTCAAAGTTAATTTAGTGTGGGTGGTTATTAGTCTCGGTGTACTAGCTAGGCACTTGAAACTAGCACACAGTTGGTTGTAAAACTACACAGAGATCATTTTGTACTGTCTGCTTGGTCTGTGTCCGAGTCGTACATGTACGGCTGAATGCTGATCCTAGCTTAGCTTCTCTCTGTTTGCCTGTCTGTTGCGTACACAAAGCTTGGTAGCTCTTGGCTCCGCCTCCTTGTTACGTTGGGCGAGAAGCCGAAACTAATTTTCATGTGAAGCAACACACCCCTAAAACAGCGAACTGTGTACACGCCCACAACATAACACTTTTGAACACATTATAATAAAAACATCTGAACTGTGTGTTGAACTGAACCTAAACTGGCACACTCAGAAGAACCTTAATATTAATATTTGGGCTGGCCTATAATTCGATATCGATAATTATCACGATATAACATTTTTCGATAAAACAATAATGATAGTTCGATAATTGCTCAATAATATTTATGCACTCTGCGTAACATTGCGCAAGTATTTTGCTGCCTGCCCTTCCGGATGCCAGAAAAAAAGGTCAGAGTCACAGAAATTGTTGACCAGAAACGTCACTAGACCTCAGTTTTGAGCTGCTTAGTTTTTTGCTATCCGACACAAAACAGCAGCGTGCACTGCAAACTGTGCAAGACGACTTGTGTCATCAAAAGCAGGCAACACCACAAGCTTGTTTCATCATTTAAAACAACACCACCCTTATGAAGATGATAAGAAATTACAGACCCAAACAAGTGCTGGTAAACCAGGACAACTACCCAGCAGAATCTCATGTCACCATTTTTGAAAGCTGTGCCTTACGAGAAAAAACCCCGTAAAGACAGAGGAAAGATATGACAGACAACACAATCTCAAACACAATCCAATGAACACTAGAAGCTTGCTCTACAGGCTGCATTAAGGATATTTACACTACAACATTTACACTAATAAAAAATAATATAATAAAGAGGCAAATTCAAACAAGTATCAAAAAAAAAATTGTTAAACCCAAGTAAGGGGACGATAGTGAAGCCAAACAAAAGAAAGGAATATAACAAAATAATTCTAATTTAAGAATAACCCCTCTCACCTCGCTAAAAACTGATGAAAAGAAAAAAAGTCCTTTAGCGCAGTGTGCCGTATTCTTTCCTATAAAATAAATATAAAGATGACCTTCCCCTATTAACTGATGTCTTTAACAATACATTTTTCTACATTTTTGCAAAATGGAAGTCGTACGACATCTTCCCTATCCACCTTACTCTGAGAAAAGAGTGAACTTGAGGAGATAAAGCTCAAAATTGTTGGGAAAGAGCCGAGCCAAAAAATAACATACAAATAAATCTAAATAAAAATAAACAAAACTCACAAAATTTCTTAAAGTAGGCAAAAGTTACGCAAAATAATTTTACGCAAACGAAAGTTAAGCAAAAACAAGAAAAATCATAATCATGTCAGCAAAATACACCAAAAACGAGATTAAAGGAAAAAGTGCGCTCTCCGCTTTTCATATCCCCGCGCGGCCGCGCCATCTCCACCTCGCCATCTCCACCTCGCCTCCTAAACGCGGTCAGCTGCACACTGCAGCGTATGAGCGTTCGCTTGCACCGCGTGTTTTTGGAATGATTCTCCTCGCAAGGCGTGGAAGTGGCAAGTGGTGGAAATAAGCGATCTTGTTTCTCCCAGGACGATGGCAGATTTTCCTCTGACTCCTCTAACTGAAACTTTGAACAGTAGGCTACTCTTCCCATCTTCCCATTTTGCAAAGCCCACCTTCTACTTTTTCGCTGATCCACTGCCATGTCCCGCTATAGCACCCGCAACCGACCTGCAATTAGCTAATTATAAAGTATTTTTTATTACCTGACCCGCGGTTTATCTGCAGCGCCCGGAGATATAACCGCCATTTACGCATCACGTAAACTGCAATGTATTTTACTAGTCAATATGTCATGTAAAAACACTTTACAAACACAGTATATGTATATTTTATCATATAACAGAAACCAATCTATCTAAATGAAAACTTAAATGAGCATTACTATGCCTGTGTCTGCACAGAGATCAAACTTTTCACCTGTGAGTGTGGACATTATGGTGTTTTTGAAGAAGAACTTAAAACTTAATTAAATATTCCAAATGTCCTTAGAGAGGACAAGCCTGTTTATCTTTCACTCTACACTGCAGTTATTTATTTCATTTTAGTTTACTTAATTAAAATTGCTGCACTAAAGATAATATTTTTTTCTGACTAGTCTATATTGAATTTTATTTAATTGTTGTTGTTTACTCGGGTATCCTTACTGTACTAAAATGTGAAAACTGAAAATTCTGTGACCATTAACTCACCTTTACTTGTTCCAAACCGGGTTTATTATTTTTTTTCTGATGTTGAACAATAATATCCAATAACTTGTATTGTCTTTGGTTGTTGAAAACTTAATCAGTAAATGCTCAATGAAGATTATTCTTTTGTTTATTATTTTATTATTTATATTGTCAGACAGCTAAAACATTTCACTAAATGTGTTAAATTAGCTGCACAAAGCAGTTGGCATACTGAAAATCTTGTAAAATTGATAGATGTAGAGATTTTACGTTTATCGTGATAAATATCGATATCGACTGATATGAAAAAAATTATCGTGATCATTTTTTTTTGCCGTATCGCCCAGCTCTAATTAATATTAAATCATAATAAAGGGGCAAACTATGTGCCTTTTAAAACTGAAAAGGAGTAACTTGTCTCTGTTTTGCTGATTATTCTTGATGTTTGCACATTTATTAAACTGTACCAGAAGATAAAATGGGGTTGTTAAGTTTTTTTTTGTATTGATTTTTGTTTGTTTGCACTTTTTAAAATGTCTGATTTGTTTTCTGCAAATCAAAACGTGGCTGCTCCCTTTCAGGAGTTGTAGTGTTACTTTTCCTGAAATAAACTGATATAAATGTTTGTTCTAACATTTAAAAAATACACATCCTACATATCAAATATAGTGTGTTTAGCATGCTGTCATGTACTGGATTTTTCTTCTGTAAAGCGCAGCCCTGATGGACATTTCAGTACAGAACTCATTTACCAGCACTCGTACAGTGCTTAATCCTAGACTTTTTTTGCTCTTGTGCTCTTGTTTTTTCATCAATTCTCTTAATAGTATTACTCATTTGTGTGTTCATAGGAATTTTATAGTTCAATAATTGGTTTCATGCATCAACACTTTAGAGAATTTCCCTGTTCAGTCTTTAAAAATTATTTTCAGAATTACTTTTTATTTACAAACCAAACAACTATTCACATTCTAGTGCATGGAGGTTTGTTCTGAAGCACTTCACCATAAATTGCATATTTACAAACGTGTGCTGAACAGTAAACGTGGGTTATGTTTATAAAAACAGTATGACTGTTCAAGAACTATTAACCCTGTATGTTTACCACTGTTATCAGACTTAATGTGATGTTAAACTGAAAATGTGTTTACTTGTCTGAATGGTAAGAAGAGTAAGATGTTTGGAATAGTAAAAAAAAGTCTGCTGTCAAGCTTTTCATCTGTTTTTCTCCATCATTAATTTATTGACTCTTTTGGCCCTTTGTAGAGCAGTTTGTGTTATGTAGTAACAGTGATTGCTGGCAAATGAAAACTTGTAAACTTGTCCTGTAATGTTTTAATTATGTTATTGTTGTGGATGGTGCCTTGAATAATGACTTCCTTTCATAAAATATGTATTAGTTTAAAATAAATGTTATTTCTAATTTTAAAACGTAAATCAGTGTTTAAAAAAAATGAAAAATACTGGTTGTTACTGAAATGTTACCAGTAAAAGCAGTTTCTCTGAGAGCTCTTTTGTGACTGCTTTTGTGATGTAATGACTTGTATGAGTTGTCAGGTAAGAATGAGACCTAAGTGACTGTTTAGAGCAGGAGTATAGTGGTTTAGAGGGAGAAACTCGTTACATATTGCATTATCTGGCCAATTTTGTTGAAATATCTAGATTCATGCCAAAACAAGGCATTTGAGTTTAAAGATGTTAATGCCGACTGCTCTTTTTCTGAAAAGAAACAGGAATTTCCTCCCGCCTTTTATCCACAGGTTTGTCATGCATTATCTTTGTGGCAATTGTTCCACATAGAAACCAATCCAAATCCAAAAATTTGTGCAAATCATAGCTTGCCCTATCAGAAAGATTTCTAACAGGGTTTTTTTAGGACCTTTTTTATTCCCAAAGCATAATTATGAAACCAAATTTCTGCATTTGTCCTCATTCCTCCACTTACTAAAAATAAGCCCATTTTTTTTTTCCATTTGTGCCCTGCTCTGCCACTTCATTCCCAAAGATTAAAGGGTGGAGGGGGAGAAAGCCGAGCTGGCAGACCCCTGAAGGAGGAGGACAGTCCACCACCTGTAACAAAGAGGAGGAGGACAGCAGACTGAGCAGAAGTTTAAAAACTTTGAACATAGTGGTATGTGGCAAGTAACGGCATGGTTCCAAGCACAATGTTATGCCCCAATATCTTTCTATCTATCTATCCCTGTTCAAGGCTTTAAAGATGAGTCAAATGTCCTAGTGTTTATGCATGATATGCTATAAAACTGGCCATACGACATGTGGCCATTTCTTTCAACCATCACTATTGTTTTGGTCAAGAGGGATAGTTACTGATCAATCTTATATTCACAGGGCTTTGCTTTTTTTTGGTCTGTCATTTGTTTCAGAAAACGGTTGTCTAAACCTGTTTTTCTCCTGTAGCTGAACACATTTCTATTTTATCCTTGAATACAGAAGCAGCTCCTCAGGGTTGCAGCAGTGGATGTTTTCCAGCTCCAGTCAACTATCAGAGGCTCTTGTCTACAGTTTCATTGATCAGTTTTGCCAAGACACTCTGTTCTTTAGTTTCAAGGAAGAAAATGATGTCTAACCCTTAATCTCTGCTTTAGTTTGATGTCCATGTCAGAAGTAGAGTTCCAGAAAACCCTCAGAGCTGTGTCTGGCTTGCAGATGGTGGGATGGAGTGTGCATTCACGTTTTTTTCTTTTCTTTTCACAG
Seq C2 exon
AGGTGCGAGCTGTGTCCCCAGAAAGACGGAGCACTGAAACGGACAGATAATGGAG
VastDB Features
Vast-tools module Information
Secondary ID
ENSDARG00000045401:ENSDART00000148756:2
Average complexity
IR
Mappability confidence:
NA
Protein Impact
ORF disruption upon sequence inclusion
No structure available
Features
Disorder rate (Iupred):
C1=0.000 A=NA C2=0.000
Domain overlap (PFAM):
C1:
PF138311=PHD_2=PD(48.6=66.7),PF138321=zf-HC5HC2H_2=PU(0.1=0.0)
A:
NA
C2:
PF138321=zf-HC5HC2H_2=FE(15.3=100)
Main Inclusion Isoform:
NA
Associated events
Conservation
Fruitfly
(dm6)
No conservation detected
Primers PCR
Suggestions for RT-PCR validation
F:
No suggested primer sequences
R:
No suggested primer sequences
Band lengths:
Functional annotations
There are 0 annotated functions for this event
GENOMIC CONTEXT[edit]
INCLUSION PATTERN[edit]