DreINT0106967 @ danRer10
Intron Retention
Gene
ENSDARG00000105112 | ntn1a
Description
netrin 1a [Source:ZFIN;Acc:ZDB-GENE-990415-169]
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Length
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Sequences
Splice sites
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VastDB Features
Vast-tools module Information
Secondary ID
ENSDARG00000105112:ENSDART00000157527:5
Average complexity
IR
Mappability confidence:
NA
Protein Impact
Alternative protein isoforms
No structure available
Features
Disorder rate (Iupred):
C1=0.000 A=NA C2=0.028
Domain overlap (PFAM):
C1:
PF0175916=NTR=PU(7.5=30.8)
A:
NA
C2:
PF0175916=NTR=PD(91.6=89.1)
Main Inclusion Isoform:
NA
Other Inclusion Isoforms:
NA
Associated events
Conservation
Fruitfly
(dm6)
No conservation detected
Primers PCR
Suggestions for RT-PCR validation
F:
No suggested primer sequences
R:
No suggested primer sequences
Band lengths:
Functional annotations
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GENOMIC CONTEXT[edit]
INCLUSION PATTERN[edit]