DreINT0171894 @ danRer10
Intron Retention
Gene
ENSDARG00000061541 | unc5db
Description
unc-5 homolog Db (C. elegans) [Source:ZFIN;Acc:ZDB-GENE-060531-162]
Coordinates
chr5:26744860-26754979:+
Coord C1 exon
chr5:26744860-26745045
Coord A exon
chr5:26745046-26754622
Coord C2 exon
chr5:26754623-26754979
Length
9577 bp
Sequences
Splice sites
5' ss Seq
AGGGTAAGG
5' ss Score
9.16
3' ss Seq
CTGTCTTTTCATCTCCCCAGGCA
3' ss Score
11.9
Exon sequences
Seq C1 exon
GCATGGAGAACTCAATGGATGTAGCGCTGTACTCTGGTTTGGCTGCGGGTGTGATCGCTGTGGTTGTCCTCATCGTGGCCATTACCCTCTACAGGAAGAGCCAGAGCGAGTATGGAGTGGACGTCATTGACTCATCAGCTCTCGCTGGAGGATTCCAGTCCTTCAACTTCAAAACCACCAGACAGG
Seq A exon
GTAAGGGTTCACTGTTAATGAAGTGGTGCAGTTAAATTTATTGCTTGTGATATTGAAGTCCATGTACGGTTTGTTCACAATAACAAGCTAAGATGCAAAGAATGTTCTTAAAGCTGACTTATCAGCAAACCCCACCCTCCATAGTCACTGTTGCAATTCGAAGAAAAAAAAAAACTGGATAGTTACTTTGTTGCAATGACAAACCTTTCCCAATGGATTTTGAAGAATTCATGTTGGGTTTAAATATGCCACATAGGGATATATTAAAGATAAAATATAAAAAACAAGATTCATTTGAAAGCAGGGGTTTACAGATCACAATGCAATCGGGAGAAACCTCATGTAATGGTTGTCACGATCTCTGATGATAAATATTCAGGATCAATACTGTTTATGTGCAACAGGCTCAGATGAAATGAATTTACATTTACCTTATTTTGCTAGTGGTGATTAACTTTAGCTAACATTAGCTTGAGCTATGTAACATTACTGTCGCTTATCTAACTCAGCTGAGGCAGAGACAGCATTACTACATAATGATTATGATTAAAAAAACTTGTGACAAAGTGATGTTAGCAGATTTCCCAGAGATGGGTTGCGGCTAAGAAGGGTATCCGCTGCGTAAAAACTTGCTGGATAAGTTGGCGGTTCATTCCGCTGTGGCGAACTCCGGATTAATAAAGGGACTAAGCCGACAAGAAAATGAATAAATGAATGAATGATGTTAGCAGAGTTTGCAGAGTAACTGAGAACCAATCTATACATCTTCTGGAAGTTAAATGTCTTGTTTAGGTTTAGCAAATGCAATGAAATAAATTCAGTTTGCCATCCTCTTAAGCTGCCTTTCCACTGCACACAACATTCAGACAGGACTGTTGGAATATGCCCCCTTCTGGCAGTCGCACAAAGTATTCAGTTTTGTCATGCACCATTGGAAGCTGATTCTCATGGTGGTGTTCGGAATAAAAGCGTGCAAAAGCAAGAGCTTCTATTCTCTATGCGTTCACCATACTGTAGTTGAATGAATGAATGAATGAATGAATACTAGAAACTCATCATAGACTGCTAAAAATTTTGGAGGGATTGTGGAGACAAGATTAAAGATAATGCTTTTTATCACTCATTTATGAATAGATTTTTTTTTAATATAGACTTTTTATGATAAAAAATAACGAAAAACTACTATTTCTCATCGCGCATGGTCCTGCTTGGACAACACTGGAATAGGTCATATCAGGTCTGCCAGTCCCATATTGTCAAGTTGCAGGAGTTCAAAAGATTTAACGAATCTGCAGCTCAAATCAGATCTGAATTTTCCACATATGAAGATGATCTTCACGCAGATCCCGAACTATTCTCTATTGGAAATTAATAACTTCCGGTCTGTCGCTTGTCGTTTGTGGAATCAGTGTTAGAAATACTCCAGGCACATCTATTTACTACTTTTGTCAACACATTCAAATCATTTAGAGCTTTGGATATTCCAATGTTTCTCTATGACACTGAAACCTAAAGATGTCTAATTTCTGGTCCCGCTGCAACTGACACTCAACTGACATTGGCTTACATTGGCTTATCTGCTTTCTCCAAATAATAATTGTTCATAAAAGCATACAAATACGCTTGCAAAATGATATGATTTTACACAAACCACCTCCACTGAGCAATCACACATTCTCACACACACAAAAAATTCAAATCCTCTGACAAGTAAATGCATAAAGCATGCCACGTTGACTTCAATTCTACCGTCCTGTCAGCTATGTCGATAACCTCTGTTGATAAGCCACGTCTGTAGTCACATGACCTACATTTGGTTCCGCTACACGTGTCCATATTACCACCACTGACACTTCTGGGTCAGAGAAAGTGATAGCTATCGCCTCACAGGGTAATCAATCCTGGCTGCTTGTGACAGCACAGTGAAAGGCTGTGACTAGCAGCTTGTGTTTACTGTGCTCAAGGCCTGGGATGGCAACACACGCCTTCTGCATGCAACAGGAGAGAGGGGGATCAAGGCTCAGCTGAGCCGCATCTGTCAGGTCATCAATCCTATTTAAAAAGGCTAACTTTCTCCCAGCCTCCCGCAGCGCCTTATTCCAACAGCCAATCCGGTTCACATCAGCCCTCTCAAGGAAGACCTAACCCCTGCGATGTTGAACGTGCATTTAAAGTCACTATGAAATAAAAATTAAAGATTTTTTTTTTTAATGATGTATTGGAGTGGTAATTAAAATTTATTTATTTTTTGACGCACATGCCCTGGTAATCCTTAATCTAAATAAAAATCCCCTCTCACCTGAAATCAAACCTCTCCTTTGATGGGATGTTCACCCATGCAAGGATAGGACAGCCTCTCAGAGATTACATGGATATCAAACCAAAACTGTCCAATTAATTTCCAGTGAACAGTCAAGATAAAAAACTGTAGATTAAACGAGGTATGCCACTCGTGTAGTTTTGAATGCGGCCACTTTAACGAAGATAGCCCCAAATTCTAGTAAAGGAGCCAATCATCACTCATTATAGGAGGAGAGGTTCGTGTTCTTTAAGATGTGGGGGTCAGCCAACGGGCTGTAATCTTAGCGCAGGGGTGTCCAAACTCAGTCCTGGAGGGCCTGTGTCCTGCTGAGTTTAGCTCCAACCTGCTTCAACACACCTGCCAGGAAGTTTTTAGTATATCTAGTAAGAGCTTGATTAGCTGGTTCATGTGTGTTTTATTCGGGTTGGAGCTAAACTCTCCAGGACACTGGTCCTCCAGGAGTGTGGACACTCCTGTCTTAGCGAATACATCCCTCCCAGACATGAAAAACATATCTACATAAAGCTTGAAATCTCCATTTTTAAATTAACCAATCATATGCTAGTTGCGTAATCTGTGTGGAACAAATGTGAGGTACAGTCTTTCCTGTCTGACCTCATTATTTTTAACAAATTCCTGCCTTCCGCCTCAAAGTTGTTGCTGTCATTTTGGGAGAAGCTTTCATGTCTGAAATGTGTTGGAAATTACCTCAAAAGACCAGGCAAACAGTTTTGGCGGATTTGATGTTTTCTTGTTCAGAGTTATAGAAGCTGCACTTGATGCACAAAGATGCAGAGTAAAATGACTTCGTAAGGACTTTGGAAACTGCTAGTCAGTGCAAACATTTAGCACTAATCAACCAATTTAATCAGCAACTCAATGCATTTTGGAGATACATGGTCATGCAGACATGGTCAAGATGATTTGCTGAAATTCAAACCAAGCATCAGAACAGAGATGAAAGATGAACTATGTGACTTTTGAGCATGGCATGGATGTCGGTGCCAGAAAGGCTGTTGTGAGTATTTCAGAAACTACTGATTTACTAGACATTTCAAACATTAGCACAACTCTGATTATATATTGGGTTTACAGAATGGTCAGAATTTTTTTAAGGGTCAGAGAACAATAGTCAGATTGATTCACGCTGATAGAAAGACAGTAAAACAGTTGCTCAAACCATATAGCAGCAAAAAAGTTGCTCAAACCATATAGCAGCAAAGCCCACACTACTAACACTCAGGTCAGCTATAAACATACCCATTTCTGATGTCCACTTCCAGCAGATAATAATGTATCACAAAGAGATCTTAATGTTTTTTTTTTTAAACATGTCAATGAGTTTACAAAACTCAAATGACTTTTAAAGTCATCAGATGTCAGTCCCGTTGAGCATCTTTTTAATGCAATATTACAGGAGATTTGCGATAGATGTGCATCCAACTAATCTGCATAAACTCAGAGTTTATCCTGCCAATATAGATTAAAATCTCTGAGGAATGTTTCCTGCAGCTTCTATATTGATGCACAAAGAATTGATACAGTTTAAAGCTAATGGGGTCTAACTCGTTACTATCAATGTGTACCTAATAAAGTGACCAGTGAGTGTGGATCACAATAGATGTGTACGTCCAGACTATTGAATGTGAAAATGGAAACAATACAGTGCTTTATTTAAAAGTTTCGAATACGAATGCATTTGATGCCATTTTGCTTTGATTTGATTTCTCCCAGGGTAGGTTTTTGTGTTTTTCATTATATCACTTTTCCTTTTACCTCGTATCTCTACGTGATATCCATTGCAGTTTTCTCAGTGTGTAATTATGATAAAGCAGAAGTATTCCAGCTGACTCTCTTAATCACAGGTAACAGTATGAGACTCCAGACCTTTGCCCGTCTGTCTGCTCTTGAAATCTCAGCCACTGAGTCATTTTAATCACGACTCTAATTCCAGATCTTTCCCCGCAAGGTGCCCACTACATGCCTGTTTCATTAACTCCTATCATCCTGCTGTCTCGTCCTTTCATTTTCTTTCGCCGTTTTAAAGATTTCCTGTCCCACAGTGATTATATCCTACTTCTGAAGAAATACGAGAGGCAAAAACCAATTTGTTGTGGGCGAGAATTAAAGAAGTTGAACCATTAAATTTGTCCTAATTCCGTTATATGTCTGGTGTAACTTAAATCTGCTAAGGTTTTCTTGTATAGGTAGTCATTAAAGACAACATTTCACACTAAACACACACACACACAGAAAAGTCATAATTTACTGAACCTTCATGTCATTCCATTACTCTTTTCTGTGGAACACAAAATAAGTTAATTTGAGAAATTGGATGACAGTAGGCTCTAAAAGATGTCACAGATCAATGCATGTGCATGATGAGAAACAACAAACTTTTATTATAGGCTACTATAGTATATAATAATTTGGTCACACTTTGTTTTGAGGCTCCGTTTGTTATTACTACATATTATCACTTCAATTAAAATTAATTTTAGAATTCCCTATGTGTTCTTTTGTTTAGGCTCAAATGCCATTAATATTAATGCATTTAATTTGTAATTTAATTATTTCGTTTCATAGATTTAGTAGGACTAATCAAGGAATGAATTATTCAAATTCCTAACTAATTATTAAGATATAACATTAACTAAAACAAGGAAAGGCATTGGAAGTGAAGTTGCAACTCGAATTC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Seq C2 exon
GCAATCCACTTCTACTGAATTCCTCCATGCAGCCTGATATAACCGTCGGCCAGACCTACAGCAGCCCAATCTGCTTTCAGGACTCCATCGACAAAGAGCTCTTTGACCCCTTGCCCGACAAGGTCAAAGTTCAAAGCTCCTTTATGGTTTCACTAGGTGTGGCAGACCGGGCCGAGTACCATGTAAAAGCTCATCCACAAACCCTCCCTGCAAACCTTCACCCAAACTACAGCATGGTAGAAGGAAAGAAGACGGCCACAATGGCTCCCAATGGACTTCACACCCCCGGGAAGATTCAGCTGAAGACAAGCGCTGTGTTTGGACACCTGGGTGGCCGATTAGTCATTCCAAATGCAG
VastDB Features
Vast-tools module Information
Secondary ID
ENSDARG00000061541:ENSDART00000087857:8
Average complexity
IR
Mappability confidence:
NA
Protein Impact
ORF disruption upon sequence inclusion
No structure available
Features
Disorder rate (Iupred):
C1=0.000 A=NA C2=0.217
Domain overlap (PFAM):
C1:
NO
A:
NA
C2:
PF0079115=ZU5=PU(20.4=17.5)
Main Inclusion Isoform:
NA
Other Inclusion Isoforms:
NA
Other Skipping Isoforms:
NA
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Fruitfly
(dm6)
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INCLUSION PATTERN[edit]