GgaINT0037818 @ galGal3
Intron Retention
Gene
ENSGALG00000002182 | F1NVB5_CHICK
Description
NA
Coordinates
chr8:1633659-1667589:-
Coord C1 exon
chr8:1666943-1667589
Coord A exon
chr8:1633779-1666942
Coord C2 exon
chr8:1633659-1633778
Length
33164 bp
Sequences
Splice sites
5' ss Seq
AAGGTAGGT
5' ss Score
10.29
3' ss Seq
CACCACTGTCTGCTTTACAGGTT
3' ss Score
9.24
Exon sequences
Seq C1 exon
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Seq A exon
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Vast-tools module Information
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Associated events
Other assemblies
Conservation
Fruitfly
(dm6)
No conservation detected
Primers PCR
Suggestions for RT-PCR validation
F:
No suggested primer sequences
R:
No suggested primer sequences
Band lengths:
Functional annotations
There are 0 annotated functions for this event
GENOMIC CONTEXT[edit]
INCLUSION PATTERN[edit]