GgaINT0097887 @ galGal3
Intron Retention
Gene
ENSGALG00000008591 | CACNB2
Description
NA
Coordinates
chr2:19080223-19118982:-
Coord C1 exon
chr2:19118863-19118982
Coord A exon
chr2:19080346-19118862
Coord C2 exon
chr2:19080223-19080345
Length
38517 bp
Sequences
Splice sites
5' ss Seq
AAGGTAAGG
5' ss Score
10.51
3' ss Seq
TTTTTATCTTTTCTTTGCAGACA
3' ss Score
11.76
Exon sequences
Seq C1 exon
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Seq A exon
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Vast-tools module Information
Secondary ID
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Average complexity
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Mappability confidence:
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Protein Impact
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Features
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Main Inclusion Isoform:
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Other Inclusion Isoforms:
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Associated events
Other assemblies
Conservation
Fruitfly
(dm6)
No conservation detected
Primers PCR
Suggestions for RT-PCR validation
F:
No suggested primer sequences
R:
No suggested primer sequences
Band lengths:
Functional annotations
There are 0 annotated functions for this event
GENOMIC CONTEXT[edit]
INCLUSION PATTERN[edit]