GgaINT0098936 @ galGal3
Intron Retention
Gene
ENSGALG00000013079 | F1NT47_CHICK
Description
NA
Coordinates
chr2:82355676-82367139:+
Coord C1 exon
chr2:82355676-82355784
Coord A exon
chr2:82355785-82367084
Coord C2 exon
chr2:82367085-82367139
Length
11300 bp
Sequences
Splice sites
5' ss Seq
ATGGTAATA
5' ss Score
5.05
3' ss Seq
TTTCATAATTTTTCTTTCAGGAA
3' ss Score
10.84
Exon sequences
Seq C1 exon
GTGTGGTATAACCAAAAAGGTTTCCATTCACTGCCATCCTACCTAAATGAACTCAATAACTTCATTCTGTGGCTGAATTTGCCCCCAACTGTGGATTGGAGACAGTATG
Seq A exon
GTAATATTTCTTTAATTGTCTATTAATATCTGTTGTGGCTTTATGATTTTTGTTATCAGTTTTCCACATCATAACATCATGTAGTGCATTCGTAGTTAAAGAGTTAATTCTGCAGTTCCATGGGTTGTCGATAATTCCGGGTACCTCGTTCTCAGAAGAGAAAGAGTGAACTACGGATCCCGGAAGACTTCACTGTTCTGTTTCTGTTTTCCATTCAAAGGGAAAGACAAAATTGTTTGGGGGTCATTAGACTACCCCTTCTTTTTCCACTCATCTCTGTGGTGTGTGCTCCTTAGCTGTCTCACCTTCAGCATTTGAGTAAGGCCTTCAGTTTTGGATGCTCATTTTATTTACTAGCTTCAGTTCCAACTATATTGTATTATATTGTGTTATCTCTCATTCCACTATCATATGTAGTAAATTAGTTTCCTCTGGTAGCTTGTTGCCACTGTTTTGTTTTTAGTCCCATCTCTCTACCTTTTACGTTTTTCTCCCTTCCCCGTCTCCCGGGGCTTGGGTCTGTGGGTCTCCCTACTCCATTAGTCACAGAACCATGCTGAACCAGGCCAGAACTGTTGACAGTATGTTTTGAAAAAATAATTTTTAAATAAAATAATTTTCAATACGAAGGTTTGATATGGTATCAAATCAGATTCCAGAGTGACAGGCTTTATAGGATATTTTGGAAATGAAATAGCATGTTTATCTGTGTGAAGAATGTTGTGTGCAAGAAGGTAACATTTGAATTGTACTGTCTCATCCATACACATTTTTTATGAAGGACATTCCTATGGGCAAAGTGTACATTGGCTTGCTATGATAGGGATGCTTTTTCTCTGGGAAGATAGGACTTGCTTAAACAGGATGTTTACTGTACAAGAATATGAATTTATAACTTATTTATTACTTTACTCCTTAAGTAAATACTTAGAGTAAACCCAGTATATCCACTAAATTCACACTGCAGTGTAACTTCCTGTAGGATACTGTTGCTCAAGGAGCAGGAGAGGCAGGTATATCTTACTACAGTGCATACCAAAAGAAAGTGTCTCATTTTTCTAATTCTTGTATTCTTGAACTGTACAGACTTAGTTAAAATACAGATTTTACAGCTTAACTTGTTTGGCAGTGACTTCAGACAAAGAATCATCTGTAAACATAGTGAATTCTTAGTACACTGAATTCTGAGTTTGATAGTTCAGGCTAAATACTGTTCATCCTGGTTCCTTTCATTCTCGAGGTTCTGCTAAAGCGGAATTAATTTGAAAAATAGTTTCTGGACACTTTTTAATTGTGTAAATGTGAAATGATGCTCAGAACTTCCATTACTTTTTTCCATTGGTATATTTTACAGTGAAAAAATTCCTAAAGCATCTTTTTTTTTCTTTCTTACTGACGTTTCCTGGAGGAGGCAGTATTTATTTTTCATATACTGCATTCACGTTGATGTCTGTGTTTCCCTTTTCTTATGAAAGCAAGGGAATTTTAATTTTTTATTTTCAATTTGGAGACTTTCAAGTTGGGTTTCTGTCCTTTTTAAGTACAGGAGAAAAGAGGGAGAGGTTGTATCTCAGCGAGATTTTTGTCTTGGTTTGATCTTATGTGCCTTCATGTTTATAATAAATAAAGAAGAGGAAAATTAGTGAAAAAGAAAGGGAATCTTGGTTGATATGAAATAAAAATTCATTAAGAAACGTTTCCAAAATGGCAAGTGGAAAAAAAAATGTTAGCTTTAAAGATGTCTGGAGTTTTATTTTTGTCTAAATGGATTATGAGGTGAAAAAAATTAAAAAAGGCTAATATATTTCTGAAGAAAGTTTAGGTTTAAGTGAAATCAAGCATTTTAATGAGAATTTTTAATAAAAAGTAATTTTTAATCAAGTTATCCTGCACTTGATAAATAATGTTGATACTGACTTGTTTTCTGTAGCACTACACATCCCATTCAGTAACTTAAACATTTACATATACCTTTGTATCTGTTTGTGAAGATTTGGGTATTTACCATCTAGATTAGAATTAAAGAATATCATAGTTATCCTAAGGATTGTGATAGTGTTGTATTTGGATTTGCTGCATGACACAAAAATGTGATAAAATAGTTCCTGAACCATTGGACTGCCAGCAGATTATATGAAGATCAAGAACATTCCCTATGCTTTTCTCATTAAAATGGTTACGTTTAATTATATGTAAATTAGTTGTCAGAAGACTATATACCGTATTTCTAGACTGAGATCTACACAATTAGATTTTTTTCCTCTCTTGAAAAATCTTTTTATATACAATGTTCATTCTACAATATTATTAAAAACTGCTCTGAAGGAGCTTGTTAGGATGCTGCAGATGTGTGGCTTTATAATTCTGACTTGCATTGATGACATATTTTTTCATAGAGTAGCTTCTTCCAGTCAACAGAACCAGTGCTTACTTCTAAATGACATAAAAATTATTTGATCCTTGGAAAGAGAGTTTGAGGTTACAATCTTTCCTTCTTTCAACAAAAAATGTCTTGCTTTGTTGCAAGAATTACTTCAATAGGGTAGAGCATTGCAATGCATGCGGGGAGCAGAAACTGTTGATACTGAAACAACCTTGAAAGAGGTCAACAGCTTACTTTAAAAACTCTTTTAAGTACTGAGAACCACTCCACTTAGCTGTTATTTCCTGAGTATGAACTTAATCTAAGATTTTTCCAAGTCTCCTGGGAGGAGGGAAGTCATCACGGATAGTGTGAGTAGTACTGCCTGCTTTAATTACAGGGGACTTGCAGCCTAGTAATTTACATAAGAGAGCAGAACTAATCCCAGTCTGTGATAGGTTTTAGTGATAAGGAGATTTCCTTCAGTCATGGGGAACACAAGCTTAGGAGCGTTTTGTATGAGACTCTGCAGGAAGAAACTGTATTGTTGTGTTGTGATTTATCATAACTAATGGATTGGTCATCTATTTTGGAGTAGTGTTTTAGAAATAATGCTTATAAGAAAATGTCTCATCTTATGTGCCATGTGGATAGTTATATCTTGCTTTGGAATCATAGAATCCTTAGAATTGGAAGGGACCTTTAAAGGTAATCTAGTCCACCTCCCCTGCAATGAACAGGGACATCCACAGCTAGATCATGTTGCCCAGGGCTCAACCCAACCTTGCCTTGAAAGTCTCCAGGGATGAGGCATCTACCACATCTCTGAGCAACGTGTTCCAGTGCCTCACCACTCTCACTGTAAAAGACTTTTCTTGTATCTAATCTAAATCTGCCATTTTTAAGCTTGAAGCCATTTCCCCTTGTTCTGTCACAACAGACTCTGTTAAAGAGTCTGTCCTCTCCTTTCCTATAGCTCCACCTTACATATCAGGTCATCTCAAAGCCTTCTCTTCTGCAGGGTGAACAACCCAGCTCTCTCAGCATGTCCCTATAGGGGAGATGTTCCATCCCTTGGATCATTTTTGTGGCCCTCCTCTGGACGTGCTCTGACAGGTCAGTGTCTGTGCTGTACTGAGGACTCCACATCTGAATGCAGTACTCCAGGTGAAGCTTCACCAGCACAGAGCAGAGGGGCAGGATCACCTGCCTTTACTTGCTGGCCATGCTTCTTTTGATGCAGTCTCTATTCTGGACCAGTCTTATTGAAAAGGAAATAAAGTACATTTTCTTTTTGAATAATTACGAATTAAGTGACAGAAAATAAAAATGGATGCATTAAGTGGTTAAACAAAAACTACTATAGTTGAGAAAGGGTATTTAACAGAGAAGATAATACTTACTGTTTCTTTGTCAAAACTCATCAGCTCTGGTTGGTCCTTAGGCCTATACATATGATCACAGAATCACAGAATTGTAGGGGCTGGAAGGGACCTCTAGAGATCATTGAGTCCAGCCCCCCTGCAAAGCAGGCCCCCCCACAGCAGGCTGCACAGGTAGGCATCCCAACAGGTCTTGAATATCTCCAGAGAAGGAGAATTCACAACCTCCCTGGGCAGCCTGTTCCAGTACTCTGTCACCATTACTGTGAAGAAGTTCCTTCACTTACTGGTGCAAAACTTCCTATGCTCCAGTTTTTGGCCGTTTCCCCTTGTCCTGCTCCCACAGACCACTGAAAAGAGGTTGACTGTGTCTCTTTGACTCCCATACTTAAGATACTTATAAACATTAATCAGATCCCTTCTGAGTCTTCTTTTCTCAAGTCTGAACAGACCCAGCTTGCCCAGCCTTTCCTCATAGGGGAGGTGCTCCAGGAGATTTATCATGTTTGTGGCCCTCCACTGGACTCTCTCCAGGAGATCCTTGTCTTTCATGTACCAGGGAGCCCAGAACTGGATGCAGTACTCCAGGTGTTGGCCTGACCAGGGCAGAGTAGAGGGGGAGGATCACCTCCCTTGACCTGCTGGCTACGCTCCTTTAAATGCACCCCAGGATCCCACTGGCATTCTTTCCCACCAGGGCATACTGCTGGCTCATTGCCAACCTGTCATCCACCAGTTCCTATGTTGTTACATCTCTTTTGGAAAAGTTGCATTGCTAGAATGAGATAATACAATTGGGAGCAATTAACAAATGAATTGATGAAGTAAGAGGAATAAAAGTTTAAAAGGCAACATACTTGACTTAAACTTGAGATAGACATTCTGATCAAATAGAGATGTTATTTTTCACATTTAATTGTATATTGTTCCCTCAAAATAGGTTAAGCATGTTGGACTACGCAGGGAAGGAATATTATCTACCTCTTAGGGCAAGACTATATTAAGAAAAGATGAGTGGTATTCATCAGTAATGATGTCTGTAAAGTGCAGTGGTTAAAAAAAAGTTCTTACATAATTACTGAAAGAACAGAAATCTATCAGTATAGAATAGTCTTGTCTGATACAGCTGCCCTATCTCCGTACTTCAATAGAAGTCATTGTCATTTGTAAAATACCTTTCATGTTAGGGCTCACTGTAAGGTTCATGTTGCATTTTCATTTATTATAGATTTAGTTCTTCAAAAGAGCTGAAGGGATCAGGAGACCTAATTTCATCTGAATTTCAGTGGAAAGTAACTATACATTCTGGTTCTATTCTCAAATCGTATTTTTAAGCCTCTTTTCAAAAGAACCTGTGAAATGTCATTTAACTTTCTTATACCCGTCTGGTTAGTGGGCCAACCATAAAATTTAAATAATTATTGAGGTGTGGCCTCTGATATTCTCCATAAAATGAAAGTTGTGATTTTCACTATATAGTAATGTTTCATCTTATACAAACAGAAGTTTTATCATGTTTTAAATGTCCGTGAAGGTGAGCTTGTAAAAAACACGTATAGTTTAACTCTGTTTTTTGTGTGTTCGATTTTATTTTATTGTAATTTATTTTTATATACTCTGAACTAAAATTATTGTAATAAGGAAACCTAGGATTAGTTATATAGATCCATACTGATTTATGTGCTCAAGGCTCAGTATGCTGCACCAAATAAGGAGCCATTTTGAAAGGAGTGTCAAGTGACATACTCAGATATACAAAGAACACTACACGGAATTACATATTACTCCTACGATAGCTCTGATTATCCTACAGAGATGATATACAACCTTGAAGACCTTCAAGACTTATTCCCTAGATCTCTTCAGCTTATGCTGAAAAAGTACTTCCTGGTCCATATGTCTGTCCATCTCATTTTTTCTCTTATTGTCTTAGTTTCTGGAACATTCAAAATGAAACGGAAAGTTATGCATTCTACAGCTACACTCTATGTATAGACTATATCTAGACTAGTTCTATTTCCTCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGCTCTAACTAAAGCAAATGTTGTGGAGTCTCCTTCTCTGGAGATATTCAAGACCTGTCTGTACAACCTGCTGTAGGGAACCAGTTTTAGCAGAGGTGTTGGAATCTCTAGAATTCCTTTCCAGCCCTTGCAGTTATGTGATTCTTTGATTCTTACTGTAAAACCACAGATTTCATAATGTGTGATTACCTGGAAAGTTGCACCAAGGCAAGATAGAATGGCCTACCAGTGTCTCATCTTATACCCACTGGAACGAAACATTTCAAGTCTCTAAGATTATTCCAAATTGCATATTGACTTTCTTTACTGACAGGTGATCAGGTGGTTTAGATTTGAAATAGAAGTTCTAGAGATTTGGTTTGCAGTCTGTCAGTAGATATTGATATGAAGAAAAGTGTTGAGTTGTTCAACTCCTGAATGGAAATTGATCAGGATTTTTTCCTACAACAGCTTAGATACTTATCATTTCAAGCATCTGTAATGGATGTGTTTTCCTTTTGCCTGTAAACTGTCCTATCCAAAATAGGAATGAGTTGAATTTTACTCTAGAGAATGTCTTAATACATACAAAATTTAGGACGAATTCAGTTCACCAGCTGAAGGATGCCTTTCAATGTATTAGAGTCTAAAATTAATTTTGAACAGTTTCTCCTGTTACATAACTACTGAAAAAAAACATTTTATTTTGTACTGGTTTCATGATTTATTTTTTTAATTTCAAAATGTTATTTTAAAATTTTCTATTTATTTTAGTTTTTAACCAGTAATATGTCATTTTCCAATCTTTTGGTTGTGGAAAGTAGGAAATATGACAATAAGATAACGACCAGGAGCAAGTCAATGCTTTTTATTGTGAATGGATAGTTTCTAAAAATGTCTCTAGTCTCTTTTGCATGTCTATATAGTATGTTCTATTTAGAAAGCATAGAGAAAAGACTACCAAAGCATTATATGCTTGCCTATTTTTTTGCTATTTTTTTGCTAACTAATGTGATTGAATAACTGATAAAAATGATTATTTTTTTCTCAGTTGTGTAAAGTTAAGTCTTTCACTGAGCAATACAAGAGTTATCTATACATGTAGTTTGTGGTGCACTGGGACTGATAACTTTATTTCTTTTTGGAATTATAAATATATTAGTTTACAAGCATGCAGTCATGTTTCTTACTTCGAGGTGACTTCTATTCCACCTTACTATGGACAAGGAAATAGTGTGTCTCATTTCTCAAGAAATTCCTTTTTATATTAGAGAAGGTTTAAAGGTCTAAAAAAACCCTTTACGTTATGGTGTTTACTTACTCTTTGAATACAGCATTAAAACCCTGGTATAGCTTAAGAATGTCCATGGTCTCATTTTTTTATTGCTTCAATTGCTTATGCAGGGTTTTGGGAAGATTGGAACTAGTAGTTATTGCAGTTTTTAGCTTGTGGCCATGAAGAAACTTAAACTGTTGCTGTAAAAATAATGTGACCAAAGCTGTGCCAAGAACATAGACAAAGGATGTTTTAGGACAATTGAAAAATTTCTGGTTGCAGTTAAGTTAGGAGAGTTTAATGGCAAGCTATCAAAGTGAGAGAAATCATTTTATACTTAGAAATTTATGTAAATATGCAGACAAAACTAGAGCTGAATCATTTCCTTGTTGATACTGACTGTCATGTGTGTTTCCCCAGTGAATACCGTGCTTTTTAAATTTTTAGCCAAAGGCTTAGAAACAAAATCCTTAAAACAAAATACAATCATCATGTAAACATCACATACCTCTGTTCAATAGGAATTTTGTCATTTGGAACTTCTTGATTTATTTGTCTTTTTTATTATTATTATTTTTTAAATTTAAGATCTTGAAGATGATGTTTAGTTTTCAACTTAATGAGCACCATTACAGCAGCTTTACATAATAAGAATGCACGTAAAGGCAAAAAAGCATCAATAAGCACATTCTACATCATGCTAATAGCTATGCTGGAACAGAGAGATATGTAAAGAAAGAGTCTAGGTGGCTAGGAGGGAAATTTAGGAAGAGATGGATTATAAAGGTATACTAAAGTGTTTGTTAGTTTGTTTTTAATAAAGAAATATATAATACATGTGATACCAAATGGCTTAAATGAGAAATGCAGTATTATTTTAGTCTTGAATGATACCATATGATTTTCTCTTCCATAGACTCAAGGTAACTTTTTCGTCTAAGAATTTCAAACTCATTATCTACTTCTAAATGAAGAAGGAGATTTTGTTATACTAAGAAACTTTGCGCTCCAGACTAACTGAAAGTTACAAAATAATGAATGAAAAAACAGTATTATATTTATTTTACAATTTGATAGGATTTGGGATTCTAACAGAACTGACTGCATGTTATAAGAGCATACTCTGGTTAATTGTAATCAGCAACCCTGGTACGTTTCATCTCAGTTGTGTATAAATTTTCAATGCAATCAATTTTTCATCTTCGTGTTTGGAATGGAAATTGACTGTAGAAAATGGTTGCTACTATTAAGAAGAGTAATAACTGTTTTGACTTTTCCATAGAAGGGTATGTAGTGTAGTTTGCTTTTTGGTCAGTATTGTATGAGACAAGCCTGCAAGGAACAATATGTTTGTTTGTTTGTTCCCACCATTTTCTACATCCCAGCAACTATCTCTTTTTCAGTCTCTATTCTGTGGCAGAGAGTTTAGCAGTATGTTTCTAGACATGGGACCTGAGGCAACTGCTGTAGTCTTCTTCATAACAGCGGTGTAGTTGTCTGAAAGTTTTGATAGCTTCACCCTAGTATCTGTATTTAGTAAAAAATACAGACCATGGTGATCTCAGGAGAGAGATTACTTCCTGTCACATTACATATATATGAGCAGAAGCTTTTCTTTGTGAAATATTTGATGTCATTTTGGGGTGTAATTTTGTCCTCATGGAGGAATTCAATTGCACACCTTTGATTCATCTGCACTACCACCTCAGATACCATTTTGTCAAACTGCCCCTCTGCTGCCATCTGTCTTGCATCAGCAAATAGTAATAGAATGTTGGCAGGAAGGTTCAACATTTGCTGCAATACCACTAATATCTGCCTCTGATGTTGCGGGCCAACATAATAAAATAGGAGGCAATACTTTCGTTGTAGCCAGGTCAACATCTGTCAGATCTCAAAATAAGCTCAGACAAGTTTAATTCTGTTTATATGGTAAAATCTGGTTTAATTCTAGTTTTGACTGTTAATTCTTAATCAATAGTAATCCCTACTATATATGAACGAAAGACATTCCTTTAATATGCATACTTTAACCATTGAGAAAGCCTAGAAAAACTTTCTGGGAATGAAGCTCTTTTCTATCATGTGACTTTTCCTTTAAACAAGTGGAATTTCACCTAGTACTTGGTCCAGTGGAAAAAACAGTTTTCTATATCTCTGTCAGGTTTTACATCACAACAAATAGCAGCTATTAGTTAAGAAATCAGTAGTATAAAAGGAAGGAAAATTTTAAACAGTCCCTCCAGGTGAAAGACATGAAAGACATCTGCAGTTAGCACCTGTATTTATTAGAGGTGAACCAAAACTTTATTAGCTCGATTTTGTAAACTGCCTTTGGGCCTCATTGTACAGCTTTTACTTGTATTTGAAAAATCTTTAGCTTGTAGTAGAAGAAATCTGTGAATTAATCATCATCCTATGTTATTTAAACACCACAGTAGCTTAGTGATCTTAAAACTGTGTTGTCTTTAAAATGAGGAATGAAAAGTTAAAGGGGCAAAAAATAAAAGCATTTACTTACTCAATCAGATTGTACCTATTACTGGAACTAAGACAATTTTTATATTTATACAACTGGATGCTAACAAAATATGACAAAGTGTATTCAAATAAGCAGCAGTGCATAGATTTCATCTGAGACAACCACTCATTTACTTCCTTGCCAAAGATATTTGGAAGATTATAGTTATGTTAGGATGGATTTTTTTTTTTTTTTTATAATTGAGAACCAAAATTTATTTAAAGATATCTTCATCCAACATTTTTTAAGAATTTCTGGTTGTATTTATAGTACAGCAGTCTCTTTTGTGGTACAGATCCCACAGCAATACATGACATTTTTGAACCTACTTCTGCAGTTCAGAGTGCAGAAAAGCAACTAGTACTTATGTTTATTTATTAGATCCAGACTCTGGAAATTACTCAACAGGATACAGTATTTGGTTTGGCAGCTTGGTGATTGAGCTCTTTCTGTTGTTAATTAAGTGTTTCTCTTTTTCATTCATTTCCTGTAATGAGATTTTGTAGAGAAAACGGTCCTTTATACGTGCAAATGGTGATCTCTTGCTAATGATGGGAATAAGATGGATGAGGCATTAATTCAGTTCAAAACTAGTAAAAATTTCCCTCGATCTCTCCCCACATTGCTCAATCTGGCACAGACAAGATATGTACAGTCAAATAGAAACTAATATTATAGTTTGTGAACCTGAAATACAACTGAAAAGAGAGCTATTTGATATAATTTAAGAATGTCAAATTTTAACTTATTATCAAGAACCTGGTCAGTTCCCAGCTCTCGTTCAGTTTACTTTTCTTGAGTAAAAATGTTTTAGAAATTCTACCATTTTGCTTTAGAAATGATATTTTGTTTCAACCAGTAGTTGAACTGGAGTACAGAAAAAAAAATACACTTCACAATATTTTGAGACAATTTATTTTAATGTTCTTATATTGAAAATTATCATTTTTGTAGCAAAAAGAAGAAAAGAGAAGCAAATAGATTGTGGTATGATTTCACAGCTGTCCTAAATAGTCAGGTGGTATTTTAGCAGAAAACAGGACAAGGATTAGTGTGGGAGAGCAACTAAGTTTTATGTCAGTCATAATTATGTTGATGTCTTTTCTGGATTAGATACAGCAAGTCTTCAATTTCATTTATAAGCTCAGATTTGTGTTTTAAGCAGTTTAGAATCACATGGAGATGAAAATTCCCACTATCATTGAATGAAGCATAAGAAAAGTATACTTGCAAAATATAATGTCTTTATGTTTTTGTAATTTGCAAATGAAGGAGAGGTAATGTAGAACTGAATCCTGGTTCTGGACAGTGAAATTGTAAGTTGCAGGTCCAGAATCTGTTCAGTTCACTGTGATGGCCAAAGAGAGGTAGCAGAAAATATAGCAAGCAGACTTATGTATGCACTGCTTTGAAGCCACCTTCCTTCCAAGGACAATGAAGATTTTGCAAGGTGAGAGTTTAAATGGAAGATCAACCTCCTTTGCCTGTCAAAGTTCATTCAGTTCTTTGTCCCACTCCTCATTTCATCCTGCTTTGCTTTCTTTTTCTTTCAATGCAGATTTTCGTAAGTTCTGTTTGTACTTTGCATGCTTCACCTGAATTGTTTCAGGACTGATTGTATTCTTGTAAATCAAAAAGGAAATGAACTGTTGTGAATTTCCAAATGCTGTATACTCTAAAACTTAAAGTCTTCATGAAGCATTTACTTTTTCATAATTTTTCTTTCAG
Seq C2 exon
GAATCACACTCTACAGCCAACCATATGGAGGAGCCTTGCTGGATGAGGACAAAAT
VastDB Features
Vast-tools module Information
Secondary ID
ENSGALG00000013079:ENSGALT00000021357:35
Average complexity
IR
Mappability confidence:
NA
Protein Impact
ORF disruption upon sequence inclusion
No structure available
Features
Disorder rate (Iupred):
C1=0.000 A=NA C2=0.000
Domain overlap (PFAM):
C1:
PF126982=ABC2_membrane_3=FE(7.9=100)
A:
NA
C2:
PF126982=ABC2_membrane_3=FE(4.0=100)
Main Inclusion Isoform:
NA
Other Inclusion Isoforms:
NA
Other Skipping Isoforms:
NA
Associated events
Other assemblies
Conservation
Rat
(rn6)
No conservation detected
Zebrafish
(danRer10)
No conservation detected
Fruitfly
(dm6)
No conservation detected
Primers PCR
Suggestions for RT-PCR validation
F:
No suggested primer sequences
R:
No suggested primer sequences
Band lengths:
Functional annotations
There are 0 annotated functions for this event
GENOMIC CONTEXT[edit]
INCLUSION PATTERN[edit]