GgaINT0132390 @ galGal4
Intron Retention
Gene
ENSGALG00000004029 | PHF12
Description
PHD finger protein 12 [Source:HGNC Symbol;Acc:HGNC:20816]
Coordinates
chr19:5897177-5909448:-
Coord C1 exon
chr19:5909267-5909448
Coord A exon
chr19:5897250-5909266
Coord C2 exon
chr19:5897177-5897249
Length
12017 bp
Sequences
Splice sites
5' ss Seq
CTGGTAAGG
5' ss Score
9.68
3' ss Seq
GCTTTGTGTTTCTCTTGCAGCAA
3' ss Score
11.43
Exon sequences
Seq C1 exon
CAAATCCAGGCCCTGCTGGCTCCCCCTAAGAGCGAAGATGGGGAGAAGAGGAGCAGGAGGCCTGAGAAGGAGCCCAGGAGAAGTGGCAGGGCCACTAACCACGACAGCTGCGATAGCTGCAAGGAAGGAGGGGACCTGCTGTGCTGCGATCACTGCCCCGCCGCTTTCCACCTCCAGTGCTG
Seq A exon
GTAAGGCTCCGCGCTCCCGCCCTCCGGCTCCGCGTCCCTGCGGTTGGGGCCCTCGTTAAGCGCCTGCCTTGGAGCGGGGGAGCTGCTGTGCTCCGTGCCCCCCCCCTCCACTCCCCCTTTAAAAGCCACCGATCCACACCTAAAACCCCATCCGGACGCCTTCACGGCGTGGGCGCGCTGACCCCAGGCCCTCCTTTCTTTCTATGCCCAGAGGCCTAAAGGAGAACCCAGGCTTCGGTCTGCCCTCTGCCTTCCTCCCCGCCTGCGCCCGACTTCCCCTCCTCTCTCCTCCAAACACATCCCCGTCCCCCCCCCCCGCCCCCCCGGTCTCAGCCTCGAGGGGTTTCGCAGTGCCGGCCCTGCGCTGGGCCCGGCCTTCCCGGCGCTTCCGTGCTGCAGCGGCTGCTGGGAATAATGGAGGTTGCTGTCTCTGTGTCTCCCTGCCTCACTGTTTACAATATGGCGACCTTCCTTTAAATTATATTTTTATTCTCAGCGCCATTTTGGCTGCATATGTGACTTCCAAACCCTTGCAACGCTTCCTGAGTATCTCGATTGTGAAAATACCTTCCCTGCAGAGATCCGGGGCTCCGGACTTTTAAAATCGGCTCGGCTTATTTCTTTCCCTCCTTTTTCCTTCCCTCCTGACTCCACAGACGCGCTTATCTCATCCGTGGGGAACGAGCGCTGTGAATTTCGGGGGTAGCCGGGCCCTCTTGCTTGGAGTTGTGCAGCTTGGTTGATAAAAGCAGAGCTTTTTGCATGCAAATCCGGAGCTGGAGGTGCGCGCGGAGGCGGTCACGACGCCGTTCGGTGGAGGCTGCAGCAGGGAGGGCTGTGGGGCCTCACCTCGGCCCTTCCCATGCACGCAGCACAAAGCCAGCCCTCAACTTTCTGCAGCGGAGTTCTCCTCCGTTCTGCACCAGGAGATGCAGTGGGGGCCGCAGCGCCCGTTCTGCTCGCTCAACAGTTGACACAGGCGGAGGGTTTGTGTTAAATGAGCACAGCCAGAGTTGGATAATGGAGTGGAGGAGGGAGCGGGGCGAGTCAAACAGCTGGAGCTCAGGCGTACCGACTATTCTTCCTTAGGGGAGATTTTTTAACCGCATTCCTTTCTCTCTTTCATGCTTTGGAGCTTTTTGTTTGCTACCCCATTACAGCTGTCTCTTTCGGGTTGGTTTTTTTTTTTACCTGTTCCCCCCCCCCCCCCTCTTTGCACGGTGGTTATGCCGCGTTTCTATGCTAATTGCAGGTCTCTGAGCACTTCTTAAACTGATTGCTGATACCGGGAGAGCTGAGCGTGTGGTCGGTCGCAGTTGTGCAGGGAGTGTCCCGTTAGCAGCACACAGCCAGCCCAGCCCAACAATGCTGTAGCAGCCATGACATCATCCCTCCTGCCCCGAGGAAGTGCTGCTGGTGGTTGGGCACATCCTCTGCATTTACTAGAATGACACTGACTTTTTTTTTCCCTCCAACCTTCTCCGCGGGCTGTTATTTAAGGGCTTTTTTCTTACATTAGGTATAGTTGCTTTAAACTCGAGCGTTGGCTTGCAGATGATGTTGAATGCATCCCGAGCCTTCTCTTGCATTGGCTTCACACTTGGGTTTTCAGATGGAAGGGCTGTGACTAACGCTGCAAAGTTTAATTGACTCCGAATCCTGGCTCATCCTAACTGTAAATGGGTCCGCTCTGTGCACGGTGAAATCTGGCTATGATTCATGACTTAATTTGGCAAGATTCTTGTAGCCAGTGGGAAATGGTCATGTAAATCAGCCATCTAGAGAGGTTTGGCTGTACTCAAGTTGGTTACATGATAATTAGAAAGATTCTTTGGCTAACTAGTCACCCTTCAGGACAGAAGCAGAAGGTGCAGCTCTGGCTATTCCTCCTTGCTTTTATTGTTCCCTTCGTTGGGCTGTGTGGGTGAGCACTCAGGAGCAGCAGAAGCCCCGGCCCTGTCGAGGCCTTGGAGCAAACCAGGTTGTCTCGAAGCAACGCTTGGCTTTTATATCCATGTTTTCTTCCCTTCACCTTCTACATCTTGTGTAAAGTAAACTTCCGTTCAGGATATAAACTCAGGCATAAAGGCAGCACTTGAAACTTCCTTTCTGCTTTTTTGTTTTGTTTTAATTATTGTTTTTCTTTAAAGAATAGCAGCTGTAGTGCAATGCTTGCTTAAGTGATTTTGAATAGCAGTTTAGCTATACTGGCTGAATCGTGTTGGCAGCTTAACTGTTCTTTTAATATTTATTGTAAGCTTTCGTGCTAGGTTGCATTTATTATCCATAAAGCAGGGGGAAAAAAAAAAAGAGGGCATTTAATTGGCCAAGGAGTTGTAATCAGTCAGTAAAAGGAGAGATCAAGGTGTGGTCAGCCCAGAGACAACCCCAGCTTAGTGTGCACAGGGCAGTTTCATTTCTGCCTATGTAGAAAGGATGCTCCATGGCACTGTGCTGTGTGAACCCACTTGCTCAGAATCCCACAAACTTCCCAAGTCTGATAGCATCACGCCTCTCTGATGGGAAATACGAGCTGTGTCTGTGCACGGCGGGAATGGCTGCTCTCCTAGAGGTGGAAGGGCCGTCCTGGTTGAGCTGTTGGGGTTTCAGCTCTTCTCACAACACAGAGTCGCTGCTTTGGTGTAGAACTCGAGGTACTGGTGAGAGGGTGCTGCAGACACAGGCCCTGCTGGGAGGGATATTGGGCCCCTTCGGATTCAACACCTTTGGGTTAGTATCACAGACAGGTGATATCGTCTTCAGGTTTTGCATTTCCAAAGTGTTTTTTCCTCCCCTTAAAAAACAATATGTGATTATTTTTTTTTAGCTCTTAAGTCTGGCTTTGGCTGTGCTGTTTGCCTGGAACCTGCTGCTCGGGGCACGGGGCAGTGCCTGCATGTTCATTCTGATGTTGTCTTAACTCAGGCCCCTGTGTTCCATCTTCACGTATTTGAAAAGAAGGTTTTATTTTCCATTACTTCTGTTATTCATCCCCGTCTATATCCTCCTCCTTCTCCTGCGTGTGTGATTGTTCAAGTTCCCCTTATTTTCTTAGGCCTGTTTGCAAAGTGAGTGATGTTGCAAATTCATTACAGCGTCAGCAGAGGATTAGAAAGATCCCTGGGAGAGGAGAAGTTTAGTTAGCAACAGGGGGAGGGGAATAACACAGCCCAGCGTTGTGCTTCTTTTCAAGTCTCACTCTACGGAGGAGCCCTCTTAGAGCCTCTCGCCCAGCTGAGCACCACCGTTCACATCCCTGTTACGACCATGTGCTGCTGTGGAAGCATTGCTAGCATGGCAGAGTGACCTGAGCTGCCCCAACCCCAGCAGCTGCCCATCGCAGGGAGCAGACAGTGCCATGAGGCGATGCTGTCCGGCGGTGGGCTTCTCTTTGCTGCACCTGTGGCTCTTCTGGGAGAAATACGCCTCGTCCCCTCTGGGTCCTGCAAGCCCTTTCTGCAGCACTCGCCTCTTTGTGCTTATATTTGGAGCGTTTGGCTCCCTTTCCTCTCCACTTTGGCAGTCTTCTCCCGAGTGCTGTTGTCGAAGAACTGGAGTAACAGAGCTGCAGAGAGAAGACACGAAGCTCAGCTAGCCTGAGTCGTGCATATTTTCTGTGAGTCACATCAGTTAAACTCTTTGAACGTAGAATGGAAAAAAGTTGTGTTTAACTGTCGGACATTAGTAACTCTTTCCCTCCCTTATTCAAGTCTAAAATGTCCTGCCTTATCCTGGCATCTGGCCTAGCTGCGATTTTGCATAAATATCCATTCTGTGTGAGGGCTGAGGAGGAAAGCATTAGCCTGGCTATTGTCTTTACTATTCACGCCCCTCAGGTGGTGCTTTGGTCACCTCAGGCTTTCAGGTGAAGCTTTGAAAGGCCCAAAGGATCCGCAAGGAGCAGTGGGATGGCCAGAAAGCTGCCCTGCAGGCTGACTTCACCCTAGGAAAAGTGGTGAGCGGGGAAAGCCAACAGCTTATTGTGCATCTCTGCTTGTGGTATTTCGGTACTGTTGGGGCCACTGTAGTCCGGATCCCAAAGCAGAAGGAAGCAGTAGCTCTGGCCTGGTTTCTCTGTGCAGAGGGTCACTGCGCATGTGCCTGCAGATGTGGTAACATGATCGGTCTTGGCAGTTCTCTGAAGCAGAGTTGTACCAATGAAATCTTCTGCTCTCCTTATTTTCGTCCTAAATCTCTCGGTGCAAAACCAGATAAGGTCAAGCTAAATGTGTGACCTTAAGCTGAGGGCACCAGGAAACCACTGATAATAAGAGCTTCGTGAGCTAATCTTCATTATTATTTTTTTTTTGCAACCAGCAAATCACAGTTCTCGCCTGCGTGTGCCCGTGTTAAACCGAGCGTGAGCACATTCTGCAGCGTGGGCAGGAGAGCAGCGCTCCCATCCCATCGTGGGTCACAGCAGAGCGTGGGGATGCTCTCCATATCAACCAGGGGGATGTTTAACTGCTTCGCTTACGCTTTGTCTTCGGGCACAGCCCAGCGCTATGTCGAACATCCGTAATCCAAAGGGCACAGTATGAGGCTTTGAATAAGGAAGGTTCTCCACTGTGTTGTCCTATGGCCTGGGAAGGTGCCACTGTTACATTGGCCGGGACTCACGGAGCTGAGAACTCTTGTTTTCGTGCTGTTTTGGAGTCAGTGTTTGAGTTGCCCTGAAAAAGCTGTGCTGGTGGCAGTGGCTCATTGGGAAGCGGTGCGCGTGGCCTCGTTAGCTGCTCCTCCTGCTATGTCAGACCTGCAGGCATGACTCACGGGAGCGTTTGAAAACATGGAAAGGTCTTCCCAGAGGAATTCCAGCTCCTCTAGGCATTTGCAAAGGAAATTCTTAATTGGATTAGATTCATAATGCTAATCTGCTAATGACTGTTTGTTATGGAGATCTTAGTGCTATCCTGTAAATATATTCACCTTAATTTAGCTCGCCTTGTGCCTTTTTATCGCACGCAAGCTCAATGCTGTTAAGATTATACAGCTGCCTGCAGGTCTTACAGCTGGGAATGGAAGGACCACTGTGCGTGGTACACCAAGTGGTGTAATGCTCTCCTAATTCTCACTGCTCTCCGTTTCACAGAGCTGCTTTAGATAGGGTAGGAAATGGGGATCTGCAGGTGTGGATGTTAAGCTGTGTTGATTCCACGCTGACTCAGTGGTACCCGGCAGGGCCTGGAGCCTTTCCTGTGCTCTGGAGCCCTGTTAGTGGTCAGGTGGGTAGCAAGGAGCTGGAATCCACTGGGAAGAAAGCAGTTACTTACAGGAAAGAGATGTATCTTCCTGAAGGCAAGTGTTGCAAAGTCTGAGCCTTCCGGGAATGCTGCTTGTTGGAATATAAATCACATGTGAGAGCGACTACCTGTTGTGTTGCTTTTTTTTTTTAAGCCACTCAGGAAGTAAGCTTGGACTTCAGAAAATGCTAATGTATCTCAGAATATAACATGGCTTTGTTCTAGGGATATGGAGTGCTGGATTCAATATCTTGCCACGTGGAGTTACTGGCGAACCTTGGGATGTTACAACGTGGTCAGAGGAGCAGGCAGTGCACAGTGCCTGCAGCCCCACAGCAGCTCAGTGCCTGCCCAGCTGTTGGAAGGAAGGCTGCAGTGTCTGTGTAAGCTGAGTAAAAACAGTGTAGCACCTTCCCTTTAATGAAGGAGCTGACGGGTGTCAGTAGTCAGGTGGTTCCATGCCCTCTTAGGGTGTGGAGTAAACGCTTCCTAGAGTCAAAAACGAAGAAGGGAAGGGATGCTATAAATCATTCTTGCAGTCGGTGTGTCAGATCTCCAGCACAAAAAGCGTCTCGGGGCAGCTGGGGGGAACGCAGAGCCAAACCCAGCACTAACCTCTTTCTGCTGACGTCTGCTCTGCACGAGTCACTTGAAGTAAACTAGATGGAGCTGGAGATTACAGACTTTGAACCCCGCAGAAAGCAGTGGCCTGAGGATGCAATTTGGCAGGCTGAAAACCCCATGCTGAATTCCTGGCAAGGGGGAGTGATTGGTGTGAAACACCTGCCTACAGCCACTGACTTGGGGCAGGCATCACGTGAGCTTCCCGGAGATCTGAGGCTAGAATAGCAACAGGAGCAGGATGTGAAGGTGATCAGGAAAGGCAGAAGGGATTTATGCCCCCTCTCAGGGTTTTTTGGGGGGCTGGAAGTGGAGGGATGTCTGTGTTGCTCTTCGTTTCCCTTTCCTCCCCAGCGTTCTTGGGAAAGCCTAGCCCACACGTGGGTGTCGGAATTATACCTCACTTGTGCCTGTGTGAAACTGAATTCATATTTCTGCTTTTATGGTCTGTGTCTCAGCTTCCTCTGATGTGCTGCTTTCTCTGCTCTTGGTCTCTTTGCCACCTTATTGCTTCCGTCCTTTCAGCCCTTCTCCTTTGAACACACTCAGTATCGCTAGGGCTGAATGCGTTCACCTTTCAGGAACCTCAAACCCGTGTTTTCATTTCTGTCAGCAGAGCTGTCTCTTCATTTATTGTTCTTTCGAGACAAAATTGGGTGAACTGGCTCTCACTAGAGCCGTGTTGTTCCTTAGCCCTGTTTCTTTTCCCTGTTGCTTCCCTATGTGTCATCCTGCTTTGAGAAGATGACTTCTAATCTGTTAAGAAGATGGTGCTATAGAGATCTGAACACTTAATGATGAATGTGGCCATTGAATTCAGGCTATTGTTACCATTGTCTGCAGCACAGGCGCGAGGAGTGGTGCATGGGATGGAATCGGGATGTGCAAAATGTCTGAATTTCAGAGTGTGACCCAAATTTTCCAAAGTCAACAAGTCTTCCTATTGACTTCTGAATAGAAATACAAAGCCAGGCAGTTCACTTGCAGGTATGCCCCAGATCACAGAATTCAAAAGCAGCCGAGCTAATTTAGCAACAAAACAACAGCAAACAGAGGCAGATGACTGGAGGGCACGGGTTTCCTTCAATCACATTTATTTCTATTGGATATATACTGTTGGATATGGAAATCCAGTATCTTGAAAACCTCTTCTTCCTTTAACAGTAGGAAAAAGTTAATGAGAGTAATAACTAATGGCTTGCCTGGGGACTGGTCTCTAGGCTGGGTTCTTCCTATGAATAGAAGCAGGCAGTTACATCAGGGGATCACGTGTTTACCTGCAGCTTAACCGCTTTATTGGGCGCTCCTGATTGTCAGGTCTGAGACAGAAAGCTGCACTTCACTGTATGTAGGAGGGAGAAAGAAGTGTGCAATGAATGCTGCATTGGGATGTAGCATACCTGGCGACATAGAGATGTTGGCACACCTTTATCTTCCCTTGCTTGCATCTTGCTTCTCTCTATCTGGCTATATCACGGTGTTTTAATCCTGCCTCTGTTCTCTGTCTGTTGCTCGGCCCTTATTTCTAACTCTGTTTGAAAGGTGTGTGCTGAGCAGAGGCACTGTTGCAGATGATGGGATGATTGGTGTCGTGTGAAACGGCCATTTCTGTTCTCCTCCTTACTGAGTGGCAGCCAAAGTAATCACATGCTGACCTGTCAGAGATGTCCAGCTCTCCCTGCTGGATATCCAAACATCTCCCTGCCTTTATATATGCACGTTCAAGACTTTGACTTCAGAGTAAACAAACCGAACGCTGACTGCTGTTAAGCTTTTTTCCACTCGTTTCCTCTGGGGAGGGGAATCTGTTCTACAGATGAAAGTACAGCAGCTGATGCTCGGCCATTAACGTGGACTGCAGTGCTGGCTGTAAGTGGGTATAGCATATGCAGTACGTGAGCCTACTGGAGTCCAGAAAATTCCAAAACCATCAGTCTGGATGTGATCTGGTCACGCTTAGAGGTCACTGGAGGGCTGTGCTGAGCTTATCTGAAGTTTGGTGGTCCCTGCTTCGGTGCTTGTGTTCATGAGCAGCATCTCTGCTTGTACTTTGAGCATCGGGATGTCCATTTTAATGAGCAGATGGAGTTTGAAGAACTTGCTGTAGAACTTCACTGGTCCATCTGTGCTGAGGAGCCATCCCGGTTACCAGAATGGAGGGGAGAGCTGTCGGCGTTCCTAATAATTACCTTTAGGATAAGTCTTGCTTCCATCTTCACAGAAAATAGTGAGCTCTTTGAGCCAAGGCTTGCAGCAGGAAGGTGAGAGAGTTGCAGCACGGAAGAACCTTCACCAGGCTGCAGCTGCTGCCTGCACTGTGGTTTCTGCCTGCAGCAGAGGCTTCAGGCACCCTGTTCCAGGTGTCCTTCAGCAGGGCTTTGGAGCAGCTGTGAGCAGAAGCGTGTAATTTGGGCTCGGTAACGCTGTTTCAAAGAACTGGATGTGTAAATGATGCAACCTTCTCTGTTTCTCAATGGGTCACTTGTAATGTGCGGACAGTGCAGTTGGTTTCCTGGTTTGTTTTCGTTACGGCTGCCATTGAGGCCCTGCTGTGGGAAGCCAGGGAGCCTTGTTCTTTATGAAGCCAGTGGAACAGCTGTACCTCTATCCATCACTGGGATAAATAGGATCCAACAGCAGAGCCGGATGTTTCTTCCTCTGTCTTACTGGCAAACGTAACTGACATCCTTCCTTGTAAGCCTGTCATTAAGTCCTGGTGAGGTAATTACAAGATTTTTGCTGAAAACAACTGAAATCGAAGAGAATTTACCGAAGAAGGCTCCACCAGACACCAGGTCATCTTCCTGCTGCCATTACCCCAGAGCTGTCAGCTCGCCTGCAGGCGAGATGGCCACCAGGAATGCCACGTGGAAATAGCTCCTGGTTAGCTGCTAACTGCTTCCTTTGAGAGCTGAGCCAGGTTTGTGCTGAAGAAGGTGCCATTCTTTGAGCATTTGTTTACTTATTTATGGAGGTCAGCAAAGTAAAGAGTAATTATGGGGTTTAGGCTAACAACGGGCATCTGATCTATGAGAGCTGCAGAGTGTGAAATTAAAAAGCAGAGTGGCTTCGTGCTATTGTTTGCTGGATTAAAAACTCCCAGTGCGCAGATGACTCCTGAAGATTTTTGATTCCATCGCAGCCATTGAAATGTTATTTGTGAAGCTCTGCATCACAGCGAACCTAAAAGTTCATAAGGGCAAGCCTTGGCAACAGAAACCTGATCTGAATTTTGAGAGATGCCACTTAGCTCTTCCCAAAAAGCCATTAGACTGGTGTTAGGCAGTTGGGTATCGCCGTAGTGCCTTTGGAATCTGTGATGATCAACATCTCCTTTCATTTCCAGAGGCTTTGCAGGAGTTGTTCTTGCAGTTGTTTGCGTGGCTGTTAACTTTGAAAGTCACTCTGTTGTTTTGGAGCTGTCTCTGTGTTAAATTCAGGAGCGCATTTGTACTCTGGGTGGATTTGATTCGGGTCGCACCAAACCCTGCAGGTAAAGGAGCATTGGGCCACAATGACGACAACGACAACAACAACAGGAAGCTTTCCAGAAGGCAGGTTTGGCAGGCTTGTGCAGCAGAGCGATGTGTGCTTCCAGGAGATGTGCTGGAACCGGAGATCACGTTGGTGCTGCACGGCTCAGGTCCTGCTGGCAGCAGGCTGCAGCGGCTGGAGGGCTGCATGCTAATGAACGCCTAAAGGCTGGGGGGAAAGCAGCCCCGTGCTCCTCCTGCCAAAGCACGGCTCCTTACCTTGGTTGTGAAGACCAAATGCCTTGCTGGGATTTAAAAACGACTTTCTCTTAACGCTTACGGTAAGAGGTTGAGGAATGTGGTCATAACTAGTCAATTAAAACGGCATTCTTCAGCGCTTCCTTGGCTTGATGTTAAGACGCAGGAAATGCTCTTTCCGTGCGGAGGGGCCGGCAGTCCGGGTGCAGCATTCATCAGTCTTTGTTAGTGCAGCGAGCTGCCTTGATGAACAGTTCATTAACCAGGAGAAGCAGAATCGCTCTTTTAATGCAGTGCCGTGGCAGTCAGGCCTTGACAGCGAGCACAAAAACTCGGGGGGTGAAGCTGGGAGCTCCAGCCTCGCTGCTGCACTGACGCTCATCTTTCCCAACCCTTTGGGAAGGAGCATTCCCTTAAATGCTGCTTTGTGAGAGCTGTATTTAACATCAGTGTGTACGTAGGATCCCACGGCTGTTGAGCAGATAGCTCAAATGTTAAGAAAACATCCCCGATAGCTTGCACGTTTAGGAAGAAACCCCTCCTAACTCTTCTAGGCACCTCTGGAGGTTTGCTGCGGTATTAATTTGTTTCGTTATAAAATATGTAAGGTGAAGGTAACAGTTAAAACCAATGCCCCGAGGCTCTGGCAGCGCGTGGCTGGCTGGCATGGGGCTGGGACAGGGCAGGCGTGTTCCCAGCCGTCGGGGCACGCTCGGCGGCGGCTTCAGAGGCACAGACCCACCAGGAATAAACCAAAATCTGCGGGTTCCTGGTCCCTGGGGTGCTGGGAGGGAGTGGGCCAGGAGGATCCGTGCTGGCTGTAGTGCAGACCGAAGGGCTCTTTTTTTTGAGCAGGATTAAGCCTGAGCTGTTCCCATGCCCAACTTGGGGCCGAGGCTGCGCTAAGCACCTGGAGATGGTTGGTTCCGCTCCTCCCAACCCCTCTCCTCGCTCCTATCAGCAGAAGATTAGTTTGGGGCAGACATTTGAGGCTTCCCGGGAAGCAGTTGGTAGTCGGGGCTTTGGTGCTGTCGTCTAGAGCCTGCTCTCTTGTTCATCCAAGCCCTCCAGGAAATGAGAAACATAAGCTGCAGGTATGTTGCTGCGTATCCACGGAGCGCTGCCTTTCTGGAGCGCCCAGAACATTGAGGCCTCTGCAACCCTGCTCCTCAAAATGGCTGCCAGATGTGTTGGCTCCGCAGAGCTCCCATGAGCCTGACACCACCGTGCTGAGGTCGTTACCAGCTCCGTCCTGGCGGCGTTCTTCCCTCAGGCCTCCAGCAAAGCACTGCAGGGCTGAGCACACCCCACGGTGGCTGCGGCACCTTTGTTGGAGCAGCGGCGTGCACAGCGTTGGGACTTTGTCTAAACAAAAGAGGCATGTTTGTTTTTTTAGCTCAGGCTTGGAAGCCCAGGCTGAAACACCCTGCGTGATTCCCCTGTGCTAAGGAAGCTGCAAGCTGTCTGCCTGTGCTTGCCTGGCTTCTTAGCAGGGCCGGTCGGTGAGCTCCATGCCCATGCAGCCACGCAGCAATCACCTTGTGACCCAGCTGCAGGGGGGGTTGGACCAGATTGCTTTTAAAAATCCCTTCCAGCTCAAACAATTCAACGATTCCACGTCATTGCTGCTGATGTAGAGAAAGGGAGCAGCCAGGCCCTGCGAGAGTGCATCCGTGTTTGGCACGGGGGGTAAACGTGCTTAGCAGACTTTGTGTCTTTATCTCCAGCATCGATAGGCAGAGCTTTTAGAAGTATATCTTAAAGCCATGCTGCATGGTAACTAGCTGTTTATCTGACAGCGTGGATGTTTCTCTTGCAGCAGTCAGCAGTTTGCTGAAATAACAGAACTTAACGATAAAGAGGTGTTGGAAAGTACTCGAGCTAGTAGGATTTGTAAGGGAAGTGTAGCATCCAACATATGCTGCTCTGCCTTTAAGTGGGGGAAAAAAAAATTCTCAAAACAGTCCTCCTTCATTCAATTTGCTTTGATGAGAATGTCCTTTTGACGTGATGCTGTTTTTATAGTAAGTACAAGTCCATATGAGTAGGATGCATCTTGTGTTTCATGGGCGAGGCAAGCTGTGTGTGGCGACACTTCTGAGAGTATTTGGACTGTCTTAAGGTGAGGGGTGGTTCCCACCATCAAGTTGGTGTGCCCAGGCATGGAGCATGTGAGAAGCATCAAGTTAAAGGAGGCGTTGGGGCTAGGGGGGAGGTGTATGTGTGGCACAGAAATAAGTGTCCATTTCCCTTTGCTCTTCAATACTAAGGCTGAACTTCTGGAGCGTTCTGCACGGTGGAGATGAAATGGATGTCATGGAAGGCAAACGTCACTGGTGACAGAGCTGCCCTGACTCGGGCTACGTGGAGATGAGATGTTCCAGAAATAACAGTAAAGCATTGCTTTGTGTTTCTCTTGCAG
Seq C2 exon
CAACCCTCCGCTCAGCGAGGAAATGCTGCCTCCAGGGGAGTGGATGTGTCACCGCTGCACCGTGCGCCGAAAG
VastDB Features
Vast-tools module Information
Secondary ID
ENSGALG00000004029:ENSGALT00000006417:3
Average complexity
IR
Mappability confidence:
NA
Protein Impact
ORF disruption upon sequence inclusion
No structure available
Features
Disorder rate (Iupred):
C1=0.607 A=NA C2=0.200
Domain overlap (PFAM):
C1:
PF0062824=PHD=PU(52.1=41.0)
A:
NA
C2:
PF0062824=PHD=PD(45.8=88.0)
Main Inclusion Isoform:
NA
Other Inclusion Isoforms:
NA
Other Skipping Isoforms:
NA
Associated events
Other assemblies
Conservation
Fruitfly
(dm6)
No conservation detected
Primers PCR
Suggestions for RT-PCR validation
F:
No suggested primer sequences
R:
No suggested primer sequences
Band lengths:
Functional annotations
There are 0 annotated functions for this event
GENOMIC CONTEXT[edit]
INCLUSION PATTERN[edit]