GgaINT0133374 @ galGal4
Intron Retention
Gene
ENSGALG00000002041 | AGRN
Description
agrin [Source:RefSeq peptide;Acc:NP_990858]
Coordinates
chr21:2754055-2767283:-
Coord C1 exon
chr21:2767022-2767283
Coord A exon
chr21:2754071-2767021
Coord C2 exon
chr21:2754055-2754070
Length
12951 bp
Sequences
Splice sites
5' ss Seq
AAGGTGAGG
5' ss Score
9.16
3' ss Seq
AGAAAGCTGCGCTGCTTCAGAAC
3' ss Score
0.69
Exon sequences
Seq C1 exon
GTGAGAGTGTGGCGTTACCTGAAAGGCAAAGACATCGTCACCCACGAGATCCTCTTGGACGGTGGGAACAAAGTGGTCATCGGTGGCTTCGGGGACCCCTTAATCTGTGACAACCAAGTGTCGACCGGGGACACACGGATATTCTTTGTCAACCCAGCCCCTCAGTACATGTGGCCTGCCCATCGCAACGAGCTGATGCTCAACTCCAGCCTGATGCGGATCACGCTGCGCAACCTGGAGGAGGTGGAGCACTGCGTGGAAG
Seq A exon
GTGAGGCTCTACCGCAGCCCCCAAACGATGGGTCACGGTGCTGCTGGTGGCCACGTGGATGGGCTGTGCTTGTTCTTGTTGAGTCATAGAATCGTTGGGTTGGAAGGGACCCTTAAAGGTCATCGGGTCCAACTCATCGCCTTTGGGGAGGTGCGTAGTGTTGGCCTTGTTGCCAGAAGTGGTGTGGGCAAATGGAGTTGATTCATGTTGCTTTTCTGCCAGGTTGAATGTAGGTTCTCGGTGCCCTTTGCAAAGGGATGTGAGGAGCCAGCTGAGTTCTCCTGGGGCTGAAGCAAGGTCTCCTTGCTGCTCCACAGTGAAGCCAAGTCATGGCCAAGCTGAGCAATCTGGGGTGTGAGCTGTGCTTTGGTATTGTTGCGGTGTGGAATGCCCAACAACATGAAAACACTTCTGCAACATCCCATCTGCTGATTCTCCCTTCCTCCCTTTGTGCTCATCCTGTTCCAGCAATGAGCTCTGGGCTCGGGGGGAACAGAGTGCCCCAAAAGCCCTTTGGGGTCCGAGCACGTCCTGCGAGCAGATGAGTAAACAAGGGAAGGAATGCAGGAATTCTGCACGGACAACAAATAAACACAGGCGGGCTCCCTCCTCCTCTCGGGATGTGCAGAGCAGAGGCCATAACCCCTTCCTCCAGCTGTGAATGCATACAGAGGTGAATGACCGAGATGGGGCTGGGAGGGAGTTGTTTCAGCAGAGGGGCTCCAAGAGGCACCGTCTCAAGTGGCTTTTGCAAGAGGTTGATATGCAAGAGGCGTTCTAGCTAGAGATGTGTTTAGTATTGCACTTGAAAGGCATCGGCTCTAGTGGAAGGAGGGGGAGGAGGAAGAAGAGTGTGTGTGTGTGGTGTGTTGTGTTTTGTTGGCTTTTTTTTTTTTTTTTTGTTAAACCTGAGCAAACTTTCGGAAGAATTCTGCCCTCACCTAGCTGTCTGTGTTCTTTGGCACGCTCTCTTTGCACACATGGCATGCACGCCGTACTGGGCTGGCTGAGCTCAGTGCTTCCCATTTCTGCTGAAGGATGCTGTCCCTTCAGGCCCCTGGGAGATGAATGATCTGATTTCTCCTCTTAGTACTTAATATTCCACGCCAAATTTATCTGGGACTCGTGCCTGCTTCCTCCTTCCGTGGGGGAAGGCTCCGAGTTGCTCTGTGTTGACGTGGTGCTGGTTGCATCCCCATCGTGGAGACACATCCCTCAGCCCTTCTTGTAGGATGTGGGGCTGCCCATTCCCTGCAGCCATGCAGGTGTCCCAGTGCAGGTACTTCAGGCTACGAGCGATGTGTCTGTCTGTAGCACGTCCTGTGATGCAACACCCCGGGAAGAATTTGCTCCGTGACCTGTTGTGCAAGCGAGCTGGAGGTGCCAGAGCTGGGCTTGTTTGAACTTTCTCCTTGCTGTGTGCCGAAATGACCGCTCCATGGCGTGAGAGGTGGGTTTGTTCTTCCTCCCTGTGATGCTGACAGACTGTCCTGATGACAGGCCGAAATTCCTCCTGGGAATCCCCTTCTCTCTCTGAAGATGGCCCGACATTTCATTTCCTTTAATTAAGGATGATGGCTCAGTTGGGATGCTTTGGTAAGCGGATGGGTGAGGGCTGAACCATGGCCTGTGGGCATCTCACCATGCGTGGTGAACCCAGCGTTCCCACCATGGTGGAGATCTGCTCAAAGTGCTGGTGGGAAGGGGCAATCCCAGGGCAGCCTGCAGCTATTGATGGCTCAGGTTGGTCAAGATGGGTCGCATGAGAGGAGAGGCAGCAACTCTTTGTGTTTCAGTGCCTCAGTGAAGCCACCATTCTGGCCATACCCATTCTCCAAGTCTTGGTCATTGCATGGTTGCTAGCAGCTTGGCTGTAGACAGCCTAGGACAGATCAACCCTTGCAAAAACTTGGTTTTCTGCAAGCTGTATCCGAACCTATGATCTCTTTTGGTCTGTGAAAGCTCTTCTTGACTTGATAGGTGCAAAACCAGCCATGAGAACCGGTTCCCATCACCCCGAGAACCATCTCAGAGCTCTCAAGCTGAGGATTTAGCTTCGGGACTTGTTTCCCATCAGCTCCCCACAGGAGGGTTCAAAGCAACGCTGCTCTGAGTCGAAAAAACAAACCTTGGAGTGCTTTTGCAGAAAGAATTGGAGGAATGGCAGCAGCTGAATGGAAAAACACGAATGTTTTGAGAATCTTCATCTCCTGTTGCTCCAGCCTGGAAAAATCCTTGAGATCAAAATCTTTCCTAAAGCCTGAAAAAGGGGAGTTCAAACTGGGGCACCTCTGGGCTGCAGCTCAGGTTGGAGTTAAGGCAGTGCCGTATTGTGTGTTGCTTTGATCGCAGCTCTGCGTTGAGAAAATGAAGATTTGTGTGCATGGTGTGGGAGGGGTGGTGCTGACTCCACGCTGAGCTGTCTGGGTGGAAGGAAGTGCAGATTAAAGCTGTATTAGGGCCCTGGTTAATGAGAACCCAGGGCTGCTTTTAAATAGCGCCTTGCTCGCGGCACGGTTTGCATGAACCTGGGTGCAATTGCCCCAGTGAGGATTGTTTTGTTTGGAGTGCTGGGTGGACCTTGAACCTCCTGGGAAAAGCCATGTGTGACGCAGTGCAGGGTGGAAGCCGATAGCCTTGGGTATGGGGAGCCCACGTGGCTGCAGGAGGACGTCCCATCGGTGGCACAGAGCCCTCGTTCCAGGCAGCACATGGGCAAGAAACTCCTTGCCTTGTGCCTCAGATGTGAGGAAGGGGGCACAAAGTGGGGTTTTGTTGAGCGTTGTGGTTGGGGTGGATCCATCCCTCATGGTGAGGCAACCCATTGGTAATGTTGGGCCTCCCAATGGGAGACATCCCACCGATGGGCAATGTTGGGCCTCCCAATGGGAGACATCCCACCGATGGGCAATGCTGGGCCTCCCAGTGGGAGACATCCCACCGATGGGCAATGCTGGGCCTCCCAGTGGGAGACATCCCATCAATGGGCACTGCTGGCCCTCTCAGTGGGAGACATCCCATCAATGGGCAATGCTGGGCCTCCCAGCGGGAGACATCCCAACCCAACACTGGTGTCCCTCAGCATGTCCCACGTCCCACCTGGGTGTCCCAGTGCTGCTGTGTGGTGTCTCTGGGTGCATCCCTCTGTTTTCCCCCCCATGCAGATGCCTGCAATCACACTAGCTGCTCTGGCACGCGTTCAAGATGCAGTGTGCTGCAGATGCTCCATATGTTTAAAAATGCCACTTAGCTCCTATTAAAATTCTTATTATAGCCAGCCCAGAACTCTCCCGACTTTTCATCTCTGTGGCAACCCCATTAATTACTCTCATGCAAGGATTGCATCCGGCACCCCATCCAACCCAAACCCAACAGTTGCTCCACTTCTCCTCCACTTTATTCTGTGCTCAGAGGTTTCTGCTGGGCTTGGGAGCGGGGCTGCTATGAAAGCCCCTCTCAAAGTGTCGCTGCCCACCCCGTTTCGTCATCTTCCTGCTCGCTCCTATTCTGCCCTGCCTTTCTTTTTTAGCTCTGTGCAGAACTGAGGCGTTTTGTTCTTGTAAAGCAGCCCATGCAAAATTCCCTTTTCAGGCTCCTTCCAGGGGCTGTAAGCAGTGCGCAGTGGGGAACTGCTGGCACAGCTCTGCCTTAGGTGATGCGGGCTGTGGTCACTTCCCATGCTCTGGTCTCATTGCAGCCTTTCCCCACCCTGGTGCCTATTCCTTTTCAATCCATCCCTGGCACTGTTTGTGCGAGGAGGGAGCTGGGAGGCTCGGTGTGTGGGTTTTGTGCTCCTCTCTTCTTGGCTCTGTTTTGAATCGAAGATAATGAGAACAGCATCAACACCTCCGTCTCAGGGCGAGGAAGTTCGCCAACAGCTGTGAGAGTGCAGGAAACAGAGAGGGGAGAACACAGCGCTGCAAAACAGTGGGGCCCCTCCTGTCCCCTCACCCCGGGATGCAGCAAGGGGTCAGCAGGATGGGGGCTGAGTCCTGGTGATGGGAACATACGGAGCACCATGCTGTCCCCATGCTTAAGACCGGGGAGCAGCTCCCCTCCTCTGGCTGAGTGGCAGTAATGCGAAACATCCCTTGGGTTTATGGCAGTAGCCGAGGGAGTCGATTTGTTTAGCGAATTCCTATGGAATTTTAATCTGGTGTGGGAGGCTACTGCTCTGGGAAGGCTCCGGCCCCGCTCCGAGCACGTCCCGCTGCATTGCTCTGCGGGTATCTGGGCAGCAGCACAGCCCGCATCTCCCTTCTGCACTTTGGGCCCTGGCTGCGTGCTCCTGGTGCTGTGCCATGGCTCGGAGTGCTTTGCTGCTCCCTACGGCTGGGAGCAGCCCCTTTGGATCCAGGCAAACCACCCCTTCCTGCACTTCCAGCCCCCTGGAATCGCTTTCTTTGATTAGCAAAGGAAACGGGGCTAGAGTGCTTTCAGTAATTTATACCTAATTCAGCTGATTTCAGCCTGGCTGCAGCACAGCCTACAAAAGCAACTCTTCTGTTTGCTCCTAATTCTTACTCCCCGTGCGTCCTGCAGCTGCCTGGCTCCTGCTCACCCACCTTGCAGACCATGGCAAACCTTACCAGCACGACAGGGTGGGCACAGCCTGGACCTGTTTCCTCTTCCCACCTCTTCTATGCCTCTGTTCTACTTTTTCTCCCCATTTCTCTCCATGGATGTGGAGGCTGGGAGCAAACTCCACTCCCCAGAGGATGCGGTGCTGTCCTGATGGGCTCTGAATGCTCTTTCTCTCTGATGTTGGAGCGCTGCTCTCTGCCTTTTGGGGATGTTAATTAGCTGAAGTGAGCGGAGGGCTGGCTGTGCCACAGCCTGGTTGATTTGTGGGTGATAACCAATTAAAGCAAGGGGATCAGAGGTGCCGAGGAGCTGATCTCTGTCAATCAGAGCATGGCTAGAGTGAGTTCACACCTCCTAGCATCAATCCTGCAGTGCAGCTCATCCCTTCTGGTGCTCAGGTGCAGTACCAGTGGGCCGAGCTGTCCTGCAGCATCCCAGTACTCCCAGCACTCTGCATCCTCAGGCTGCAGAACAGCATCCCTGGGGGTGTGGGTTTAGGCACAGCGCTGCCTGCCAGCTCCATCCTTCTGCCAAGCTGTGATTGCCTTGGCTTTGGCACTGCACTCCGCGGCCAAGAAGCACCCTATCTCCCTCTGTTTCTTAGTAAAAAAAACCCCATGCTCTGGGGTCTTGAGTGCAGGTACCTCTAAAATCAAGGGATGGCTGCTCTACTGGGGAAGCATCGGTGTGTGGGGTGGGATAGAAGAGATCTGGATAGGCGCCCTGGGTCCCTTCCTGCTTGCGCCTCCTTGCCCTGCAGTGGGCTGCTTGCAATCCATTGGGCTGAACCTGCAGGCCACAGTGCAGCCAGTTGATCACAGGCTGCAGGGAGCGTTTCTACCACCCAGTGTTGCCAAAACACTTTCAGAGGTGCACTTTGCAGAAGGTGTCCCAAGATTACCTTTCGGCGTTGGTAACTGTGCTTCCCCAGGTGAGCAATCTCCCCCCCCCATTTAGCAAACAGCCCCAATTTGCATGGCTCAGGGAGCAGCTGGCAGGGATGGGTACAGGCACTGAACCTGAATCGGTGCTCTGGAGCTGCCAGCTTCGTGCTGCCCACGATGGCAAAGCCTGCGAGCTGCCCCAGGGCACTGCAGCATGTGGGGAATGGGTCTTTCTATGCCCCCTTCTTGTGGCATCTCTGTCCCAAAGCTGTCCCCTGGGTGCCTCCCCCCCCCCTTACACCTTTCTGCTCAATAAACCTTAATCCTCTCCCAGCCCCGGGCGGGTGGCCAGGGCTGGCATTCCGCTCATAGCTCAGCCAGGTACGCCCGGATAAGCTGCCGGGTGAGGGGGGAGAAGCATAGGGATGGGGGCTTGGGAGCGTGTGGGGTCACTGCCATGGGCCCGTGGTGCTGGGGGGGCAGTGGCAGCGTAGGGTGGTGGCTGTGGGTCCTCTGCTGGGTCCTTTCAGAGCTCAGTCTTCATGGTGGGGGTCCTGGGGCCAAACCACATCCCCAGCTCTTGGATGCTGGAGGCAAGCTGGTGGCTTGACCCTATAGCGCCTTCCGACGTTATAGGATCAGAACTGGGTTCTTGGTTGTTGCCCGTGCAAATGGTGTCTGTTGGGCTGTAGGAGCAATTTGGGTTTGGCGAGAGGCTGCATTTAGGGCAGCCGTGCTCTCGGGGAGTTATTTCTCTGCTTAATGTATCCATCTCCTGCTTCTCGCAGCCTCCCTTGTAGCGCTGGGCTGCCTGTTTATGCAGCAATAAAATCCCTGAGCAAATTGTTTGAACTGATGCTGTTTATCTAAGAGATAAAGTGGGATCAGCAGCAGCGCCTGGCAGCGGTGCAGGGAGGCTTGGCCCCGGGGAGCAGCTCCAGCCCCATGAAGGTGAGCATCCCGTCCCGCTATTCCCAGCACCGCTGCATTCCTGGGCAATGAGGTTGACTGAAAGCAATGGCATGGGGACACTTTGTCACCCGGTGACGTAGCCCTGGCCAGGGAGAGACCTCTCCCCATAGGTTGCATCGGTCTCTGGGGCGTGTTCCTGTGCCCTTTGGGTAAGTCCCCATCCTGGGTGCCAAATTCCTGCATGGGGGATGCTTGGAGTGGGGGAGGGAAATGTCTGCTTGCTGTATGGGGTCACTGAAATGTGGAGAGCTGGTGTCCAGACCAGGGGGAGGTGTGCTTGTGTTGGAGGCGAGCTCAGCCCTTGTTCAGCTCTGACACTCCTTAAATGTCTGCTGTGGGCAGCAGGATGCGACCTTGGTCTTCCAGCCTCGTTCCCTAATGCTTGCAGAGGGGGAAATTCAGCAGCAGCACCCACATTTGCATGCTCCATGCGTGGCGGGAGGTGGGCACAAAGCTGGCTGCTTGCACCAGAGCTGCAAATTATCCCCATTCTCATCCTTTTGGGATATCCTGGTGTGCAGTGGGGAGTGCAATGGCTGTATGCCCCCCTGTGCCTGCACGCTTCCTCCTTGCAGGGTGAGTGTGTGGCTTCCCCAGCACAGGGCTGGGCAGGCTGCTGTGCTGCACTAACTTGCCCAAGAAGCTGCTTTTTTTTATTATTTATTATTATTATTAATAATATTTTTTCTTCCTTTTCCCCCTTTCAGTTGTGCCCGTGCTGCCTGGTGTCGCTGGCTGTAGGCGCAGTGGTTGGGTAGGGGGAGGCTGGCTGCAAGACCCTTTGTCAAAGCAGATGGAGAGGTGTTGGGAAGCTTCATCCCCGCAGAGGAAATGGGGAGGGAAGGGCCAAATAGCAAACGTGCATCTGTGCCTGGTCTCCTACTTAGCACTGCCAGCCCCGCTCTGCCTCTGCCATTCTGTCCCCCCCCCAGAAGCATGGGCTGTATCTCAAGCTATTGCTTGGTTGCAATACTCCTTTTTGGCCAAGACAGGAGCCACCAACACATGGTGCAGAGCCGGGGATCAGAACCAAACCCCTCACTGCCAGCTGTGGGTTTGCATTCTGCTCGATAGGTGCAGAGTGCCCCAGGGCTGTTGGGTGCTTGGATAGGGGCAGAGCCGTCCTGCCAAGAGAACAAAGCAGAACACAGCAGGAGGATGGCTTGCTTGGACCCCAACCTGAATTGGGGGTGGCAGGGGGTGGGGGGTTGCATGAGGAATGCACCCAGGGCAAGTGCAGCTCCTCCTCCTCCTCCTCTGTGTGCTGTATGCTCTCCATTTTGCAACCTGCCATGGCACGCGCCGTGGTCAGGTGGCTGCCGTGCGGCGGAGTGCTGCCAGGCTGGAATGCCAGCAATGCATCCCTGCGTGCAGCAGGAGCTCTTGGACACCGCCAGAGCACGTCTGGGAGGGTGGGGAAGGGCCACGCAGGCAGCACCTCTCCGTGAGGGTGCGGGGAAGGCTGCTGGGGAGCAGCTGCCCGCCCTGCTGCGCTGCTTGTGGGAACTTGCGCTGGGGTTGCGAAGCGCTCAGGCTTTGCAGTGGGGAAGGGTAGGGGTTCCCAAGCGGGGTTGCAGCAGTGCCATGGAAAATTCAGCTCTTCTGTCCAGATTCTGCTGGTTTAGAGCTCCCGTTCCCTCTCCTTGCGGCTTGCAGTTCCTGATAAGGTTTTCACGTGATAAGGTTTTAATCTCTTCCCAGTGTTGTTTTCCACTGACAGCCGGGTGGGATGGCACCAGGCACAGCGCAGTGCTGCTCCCCAGCTTCCTGCTGAGATGAAACTCCTGATCCCATCCAAAAAAGTGTTTTTCCACTTGAGGCAGTGCTGGACTGCCCTGTGAATCCGTGCTCGCTCCATGCCTGCAGGTTGCTGGCTCCTGTGCAGCATCAGGAGCTAATTCCTGTGATGCGCTCCTGGGCAGCGAAGTTATTCTCAGAGGGCAGATGCTGTGTTAACAACTGGCTTCCTGCAGCCCCATTGCTGGGGTTCCCCAGCACCCCCTGGGCACCGAGGCCCTCAAACAAGCCTTGTGTTGCTCGGGGAAGCAAGCAGTACGGCTGGGTTGTTTTCCCTTGGAGGATGCCAAGGGATGCTCCATGTCCCCGAGGGCATTTCCATGCAAGCAGTGTTCTGCAGCGTGATGCCAGCTCTGCTCACAGCTCGTCCTCTGGGGCTGCACTGCTGGGACTGAATCTTAGAGTTCTGGCAGCTCAGGTGCTCGCCTTGGGGTGGATGCAGTGCTGGTGGTGCCTTCCCTGCGTGCTCCCTGGTTGTTGTGGTTGGTGCTGGAAGATGGAGCCCAGCTTTTTCAGCTCCTGTGCCGGTCTTGTTGTTGCTTCTGCTTCATGGAAACCACGTGATCAGTGGTGCTGGTTTCCAGATGGCATTTTCGAACTGGGGCAGCCTGTCCCACCCATCTGTAATGTGCTGGTGTGGTGCCATAAAGGGCAGTGGTGGAAAACATCATCTGCGTGGTGATTCCATGGACCACATGCGATTCCCCCTCCGTGGAAATGAGATCCTTTCCCTCTTTATCTCCCGGATGTATCCTGTTGTGAAGTTTGTTGGTTTTCTTTTATCTCCCACAGTCCATCTTTGGTGTGGAGCTGCCCAGTGGAACATCAAAGCTTCTCCCACCCGTTTATATGGGGAGGTACACATCAGAGCTGAGCCCAGGGGCTGCACCCATGCATATCATGGCAGGGGCGCCCTGCGCTTGGATGCTGTGCTAGGATGAGCTGCTCCTGCAGTGCTGCTTTGCTGCCAGTGCCATTGGGGCGAGGCTGGGGTGTTCTGTTTAAATAACAGCATTGGGACCTCTCGTTGTGGAAGTGTGTTTGCAGGCTGCCTACGTGCAGCACGGCTCAGCAGCTGGTGGGTAACTGCGGCGCTGGAGGTCTGGTGATGCTCAGAGTGATGCTCAGAGCTCTGGGGCTGCAGTGGGCGCTCACAGCCCCTCTGCCCTGCTCCAAACACCGCCTGCATCCCTCGCTGCTGGCTGACAGTGGCTGATGTGCCTCATGCTCATGAGAAACCTTGCTCGCTGCACTCAGGGCTGCTGGCTGGAACCCAGTTCCCAGGCACTGAAACAGGAGGGAATCTAAAGAAACCCAGGCTGGGATTGTTTTTGTAGACTGATAATTCCTCCCAGACAGTTCTGGTAGACTCCTAGCCAGCTGGACTTGCACTTTCTTTGCTCAAGGGAATCTCTTTTAAGCTGCACAGAGCTGCTGGAGGTGCAGCCGGGTTGCAAGCAGTGCTCCTGCAGACGCCCTGCAGATCTGCACGTTGGTGGCAGGGATGCATTTGGGTGCTCTGATTGCAACATCTGCATTGAGATAGAGAAGGAGCAGGGCAGGATGGTGGGAGAAGCTGTGCCATGCCCAGCCCAGGCGTGGGAACCCTTGGAACAGTCCCCGGAAATCCCATATTCTCCTGCAGGCGGATGACGGGAAGCAGCAGCGTGGGCTGCAGCTCTGCCCTGTGAACCCGAGCAGTGAGTGCAGCCCCTGGGGAGCCCCCAGCCACAATAAGGGAAAGTACTGCTCCGGCCTCCTGCTGTCCTAGCGTGGTCCGGCTCCTTCACGCCTATGCACTCAGATGCTCCCTACCCCATCCTGCATGCTCGGTGACCCCATCACAGCTGATGTTTACAGGAGGACAGGGTTGAAAGGAGCTGGCACTTGCTTGAAGCCTGCCTCAGATTAAAGGCTTTCCCTTCACGCTGAATCTGGCGTGTCTTATGTGTTAGCATGGTGCATTTTTGCTCCGGAGCAGGGTTGGAAACCGGCCATTGGAATGCTGTCCTGTGAGAGGAGCTGTGTCCGTGGACATCACAGGATCATTGAATCTCTGATTAGTGCCATAGAAGCTGTGAGTGTGATGTGATGGGAGATGTGGGCATCTCTTGGTTCCGCAGTGGGGGAGTCTGGGAGCTGCCTGCTGAATGCGTGGGCTCTGCACGGTGCTTAATGACCATAGGGGATGGATAATTGGCTCTGTGAGCCCATTTTGACCGCTTCTTCAACCCGTGGGTGCCTCGCAGGGGGTGGTGGCAGCTTCACACCCATCCTGGTGCCAACTCTGCTGCTGAGCTCACGGCAGCCCCCAGTTCAGACAGATGGTCGGCAACGCGCCGGGGGTGTCAGCACACAGCAGTCATTGTTTGCAGGCAGCGAGCTGCCTACGTGCGAATCGACACCCAAAATTCGCCCGAGTTTGTACAGATGGAGTGCGGGGAATCCATCAGCAGTGCAAGGATGTGCACAGAGGGGATGGCTCGAATGGAGGACCCGGTGGTGCCGAGCCGTGCGGTCCCGCAGCTCTTGGCTTGGCGGGATGCTCCGTGCCTGCAGCTCACCCAGCACGGCGGTGGCCGTGTGCCCTGCCTTGGCCGAGCGGAGCGGGATGCATTCCTCTACCCTGACTTCAAAGCTTGTTGCTGCATATACAGAGCCCAGCCGCCTTGGCAACCCCGGGCGGGTGGCAGCAGCTGCCTGCTGCAGCTCCATTGGGCACTCGCTGCCCTTTTGGCCGTGCCTGTTTCGTCCCCACCATGGCACGCATCCCTCTTCCTGCAGCCTGCTGCCCCAAATCCCTTTGTTTCTACCCACTTGGATGTCTCTCAGCATCCTCAGGCCCGCAGTGCCCCGCTGTGATTTCCCCCCTGGTTTAAGCAGGGTGATCTCAGGGCTGTGTGCTGGAGACCCTGGAGGAGGTGTTGGGATTTTCCAGCCCTGGCTGCTCAGCCCATCCCTTTTTGAGCCATGCAGGTGACTTAACCCCATGCTGGGAGTGGTGCTGCAGCTCAATTAGGAGATTAAAGTGTGCCATTAGGAAATGAGAGTGCTGCAGCATGGGCTGCTTGCTGGCTGCCAGCCCCTCCAGCTGGCAGCGGGGCTGACCCTCCCTTGGATCTCCTGAGATCTCCCACCTCATCCCAGCCCTCAGCGTGGGATTCTTGCCACAGTCATGCTTCTCTCCGTGGGGAATGGTGGGTGCATCCCTTCTGGCAGAGGAGAGAAGGGAGCTGAGCAGAACTGATGCTGTGGGGTTTGCAAAGGAAGAGGAGGGTGGAAAGCATTGCCCTTCAGTCCTGGCAGGGCTCCTGCTGAATACCTCTGGGGGTTTCTTGGGCAAATGAATGCTTCCTTGCCTCTTGCAGCTTCGTGCTGCATCCCGACTGCCTCCCTGCCACCAGATGTGTTGTTTGCATGGGTTGTGGTGGGCATCTCCCTGGGAAATGGGTACAGAAGTGCTCCAGGCTCCCGCCAGCAGCGGGGTTTTGCTTTGCTCTCACCAACTGCTTTTGCTCTGTTTTCTTTTGCATGTGCTGCCCTCTCCCCCGTGGCTTCTGGATTATTCATTACTAGGTAAGAACAGCATTTATCTCTGTTCTTGGACTGAAAGTGGGGCAGGGGAGGCCGGGGCACACAGGGATGCTTTGTGTGATGGTGTGCTTGCAAAAGACGGGTCCCCATGGTTTGCTCCTCCTGGTCTGGGAGGTGGTGGCAGTGGGAGATATCCTCTGGTGCAATGCAGGATGCTATTTCAGCATCTCCATTCAAGTGAGTTTTCTTTAGCCAGAGAGAAGGGAGTTAAATGCTGCGACCGGAGGCAGCTGTGTGTGCTGTCTGCCCGACGTGGGACTCCAGCAATGACAATTCTCCTAAGGGAGAGGGAATGAATTTTAATGACATCTTGAAAGACTTTAAATTTTCATGTTAACTTCAATTATTCAGGACAGTTGGAAGGCGACTTTAAAGCTTCATAAAAAGGAAAGGGGAGGGGGGGGGGAAGCGGCCAGTTTGATGCATAAATATATATTTTTTAGATTAATTGATGGGCGCTTTGTAGTAGAACACGGGCATCTGAAAGGCTGTGCTGTTGGCTATTGCACCTGACAGCAGTGCTGAGGAGGAGGGGTACCAGGATGAATGATGTACTGCCTAGAGCTATAATAACAGCCCAGTGGGGTGCAGTGCTGTGTTTGCAGCCCGTGGGGTATTGCACCTGCTGGGCTGCGTGGGGTGCTGCAAGCTGGCTGCTGCACCAGCAGACTGGGGAGATGGCCCCCACTTGGTGCAATGCCTCTGCTGGCAGCAGGAGGACGGGTGGCACCCAGCAGGCGTCCCTTTGCGTGGGGACATTGGTGCAGATGTCCCCATCTCTGGCTGCTGCCACACGGTGCTGCGCCACAGCCCTAAATCCTGCGCTGGGTGCCCAGAGCATCCCCAGCTCCCGATGCTCTCTTGGCAGGGGATGCTGAGCATCTCCAAGCAAGCAGCTTGGAACAAGCTCTCTGCCCTGCTGCCTTTCTCCCTCTTGCTAAGCCCAGGGCATCTGTCTGCCTTTTCGTGCCTGCTCCCCAGCAGGCTGATGCCTTGCCTCCCTCCCTTTGAGGGTGCCCCACTGGTGCAGAGGGGCTGCGCGGCACAAATGCGCCTTTTATTCCCCGCTGCTGAGAGCTGCCAGCCCTGGCTGCCGGCCCAGAAAGCTGCGCTGCTTCAG
Seq C2 exon
AACATAAGCAGCTATT
VastDB Features
Vast-tools module Information
Secondary ID
ENSGALG00000002041:ENSGALT00000003171:2
Average complexity
IR
Mappability confidence:
NA
Protein Impact
ORF disruption upon sequence inclusion
No structure available
Features
Disorder rate (Iupred):
C1=0.000 A=NA C2=0.000
Domain overlap (PFAM):
C1:
PF0314610=NtA=FE(68.0=100)
A:
NA
C2:
PF0314610=NtA=PD(1.6=33.3)
Main Inclusion Isoform:
NA
Other Inclusion Isoforms:
NA
Other Skipping Isoforms:
NA
Associated events
Other assemblies
Conservation
Zebrafish
(danRer10)
No conservation detected
Fruitfly
(dm6)
No conservation detected
Primers PCR
Suggestions for RT-PCR validation
F:
No suggested primer sequences
R:
No suggested primer sequences
Band lengths:
Functional annotations
There are 0 annotated functions for this event
GENOMIC CONTEXT[edit]
INCLUSION PATTERN[edit]