GgaINT0137473 @ galGal3
Intron Retention
Gene
ENSGALG00000000635 | HIVEP3
Description
NA
Coordinates
chr23:851692-880393:+
Coord C1 exon
chr23:851692-851837
Coord A exon
chr23:851838-880217
Coord C2 exon
chr23:880218-880393
Length
28380 bp
Sequences
Splice sites
5' ss Seq
AGGGTAAGT
5' ss Score
10.45
3' ss Seq
ATGACACCTGTTGCTCATAGGTA
3' ss Score
6.62
Exon sequences
Seq C1 exon
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Seq A exon
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Protein Impact
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Associated events
Other assemblies
Conservation
Fruitfly
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No conservation detected
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Suggestions for RT-PCR validation
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No suggested primer sequences
R:
No suggested primer sequences
Band lengths:
Functional annotations
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GENOMIC CONTEXT[edit]
INCLUSION PATTERN[edit]