HsaINT0007969 @ hg19
Intron Retention
Gene
ENSG00000154188 | ANGPT1
Description
angiopoietin 1 [Source:HGNC Symbol;Acc:484]
Coordinates
chr8:108334124-108348499:-
Coord C1 exon
chr8:108348378-108348499
Coord A exon
chr8:108334357-108348377
Coord C2 exon
chr8:108334124-108334356
Length
14021 bp
Sequences
Splice sites
5' ss Seq
CAGGTGAGG
5' ss Score
10.07
3' ss Seq
TTATTTTCACTTCCTTGTAGTTT
3' ss Score
8.21
Exon sequences
Seq C1 exon
GTACTAAATCAAACTTCTCGACTTGAGATACAGCTGCTGGAGAATTCATTATCCACCTACAAGCTAGAGAAGCAACTTCTTCAACAGACAAATGAAATCTTGAAGATCCATGAAAAAAACAG
Seq A exon
GTGAGGATTGCTTTATTCCAAAAATGTTTCTGTGTGTACTTATTTATATCCTTCACCTCTCTGCCAACTCTTAAACAAATAAGGTTGAGGTGGTTTACAAAAATGAAATATAGAGCCAAATTAATATTAATATAAAAATAAAGGAGAGCTTAAGGTAAATTCAGCTAGTATGTCAGGAATAAATTAATATTGTTGCTGATACTCTTGAAATATTTGCTTTATATAACTTTTAGCATTAATTTCTCTAATGGTAGTAGTTCAAATCTCACCATATCTACAAAAATTTGATTCTATGACTAAATAAAGTGACATAAAATATTGACATTTTTCAGCAGAATGAAAACCTATAACAACAGAGAATAGAGCCTCTTAAATTCCTACTCAAACCCCAATTCTTAGGCTTTTACAAAGCTACAGCGTTTTTGAATTCAGAAATATAGCACTAGAGAGAAGGAAAATGTATATTTTTTCTAGAAAATAATTTACCTATAAAGCTGATCAAGGGTTTGGTTTTTTAGTTGTCATTTACAGCCATTTACTTTGGACATAGTAAATTTCTTTGGTTAGCTTTATAGATGTCATCACACCATCTTGTTTTATAAATTATGAATCATTTCAGTTGATTGAATTGGAACTTAGACATCTTGAATGCTGGGACAATGAAAGAGTGTATTATTTTGAAGTCATTAACATTGATGATGAACAATTCAAAACACTGACTTCCTTAGGACAAGTTTCTTGCATTACATTGATTTTTCTTCGGGGTATCTAGATAACTTGAAGAAGGTTCAGTTCCTATGCATAATATTGAGGTGAAGACCATGGTATTGATAGAAACTGGTTAAATGCCATTGAATTGGTGGCACTAGAGTTCCCTTTATATTCCACACCAGGAAGGCACCTAAGAGGACTGCTAGTTCTGTTCTTTACAAGTGAGGGAACAGAGACTCAGTGGAAGGCAGTGACCTGTCCAAGGTCACACAACTTGCTAGTGGCCGAAATTGGAATGTAATTTAGGTGTCAGGATCTTTCCACTATAACACATGGCCTCTTCATATTATCTACAAACTAAAAGAATTTCCCAACTTCATGCTAAAAGTAGAGCATAATGCAACAATTACAATTAAACTTCTGCATGAAAAATACAAACCTGGCTGTTGGTTTAGAATCTGAAAGGGGTCACTCATGCTGTATGACTTGTATTTCTAAGTGTTACATTTATTTATCCTTGTACTGTGACATGGGGTTAGCTGTATAACTACAAATAAACTTGACAGGACTTGACCCTTATTGCATGATTAAATGTTCTAGAACTAACAATCCTGTTGAAATATACCATTTATTCTCCTGCAATTTCACAGTAACCAGACCTATACATGTATGTAATAGGTATGCTTCAACCACCCCTTAATCTAGGGTCACCCCTTTATGGTTTAATTTTGTCACCAAAAGTGAACCACATTTACAGTCATATTTCAAGATGCTATTTGTGAAGGCTTTGCCCAGGAATCATGGATAAGTAAAACGATGACAATTTTCCCTTATTTTTCTGAGTCGTCGTTTGGTTTTATAATTATACAATAGCACGTTTATTATAGCATAAGGACAAAAAAAAACACACAGGAAAATTAAAAACCACAGCTTTATCATACAGAAAGAGCTGCATATTTTGCTGCATTTTATATATAAATATCATTTTCACAAAAAGTTCTGTCATACCTTACACACAGTCTGGAAGTCTGACTTCTTTGGAGATAGATGTCATTTTACATTAATAAAATATTCTCTAATATTCTTAATAACTGCATATTTCATTTTACTGGTATAACCTAAGGTGGTTTGAATCCATCTCTCAGTAGTTATGTTACCACCTGATTTATTTCTGAAAGAGTTGCCAGCATGAATTTACATTCTTTAGTTTTTCCCTACTGATCTGCATATTATATCTTTGTCTGTATCTGACCCTTGAGCTGTCATGATACCATAACATAAACTGGGAGGCCTGAAAAGTCTCCTCCCTAACTGCAAAACAAATGCCATCCTTATGCACCACTTGTACTCAGGTACTCTGTCTCTTTCTCTTTTCTTCCCTCCTTCTCATATTTATCCATCCTTCCTTCCTTCCTTCCTTCCTTCCTTCCTTCCTTCCTTCCCTCCCTCCCTCCCTCCCTCCCTCCTTTCTTTCTTTCTTTTCTTTCTTTCTTTTTCTTTCTTTCTTTCTTTCTTTCTCTTTATTTCTTAAAAATGTATCCTTTCTACCTTAATTCTGGATCATTTCAGATTTTCTTGTCTTCCCATCATGATTTTTATGCAGCATCTGGTATCATTTCCTACTATAGAATTCTCACTATGAAATATTATATTTTAAAGGCAAACTGCTTTAAAGTTGTTCTCTCTGCTCTATCAGTAAAAGTGAGTTAGGGTGCAAGCTCTCAAAAGAGCTCCACTCTGGGTCAGGTAGAAGGGGCTTCCATGCACTTCAGTATCTCAAAGGAATCTGACTTCTGATCCCAAACATATTTGTGCCTTCTGCTGATGAACTTTCCCCTCTCATTAAATTCTAATTTCAACAGAAAACTCAGGTTTTCTTACACGTGTAAATCACATCATTTATTGCTAATGTTAATTTTTTCAGGATTATAGCAATTTCCTTTTCTAGTAATATAGGTATTTCACTACAAATTCAGAGATTTGGGTTTTAATTGGAAATTCATTTCTGTGCTCACACAGACAAAAACCTGCATGCATCTTACACTTCCATTCCACATCTCTTTCTTTTTCGACAGTGGACCCCTCAAGTATGGCATTATCTCACATGTGGTTCTGGGGTATTTTTCTATCAATTTCTATGCCTCCTGGTATTGCTGTATCTCTATAGTTATCTGTCTATCTTCTTGTCTAAGGGCCTAATGTGTGTGATGGAGTATTGGCAGAACATCTGTTCTTAAATTAGACATAGTCTTCCATAAACAACTTAAAAAAAAGAGAAGTGTTTTTCTTTATACAAATAAAAAATACCCATTTGTGATACATAGCATACTTTCCCTATTCTGTTTATTGTTATTGTTTATTTTCATATGTGCAATGGAATTAGGGGAGCTCTGCCAGGCAATTTATATTGCAACAAAGAAATGTGCTCCTCCTATTTAAGTGGAGAGAGGTTCAAAGTCAAGCATGAAGCTGTTTATGTTTTAAAAAAATAGTTTATCGATTACCACTGGTTATTCCTTATATGAATCTTAATCCTCCAAATGCAACAAGAAGCTATTTCTACATTAAGGCATCTCTGAAATGCAGCAACAACATGCCTTTAGTTGGTCAGGTCTGGTTTGGATCAGCTAATACACTTTGCAGGGGGGATTATCTAAATTAAGCTTTGTTTCCTCCCCAAGGAATGTCAGGGGTTGTGTCTGGGTGTGGGACTTACCAGGTTTGAGTAAGATGGGGCTTCAGCCGCCAAGTCAGTGAGCTGGCCCTTAGGAAGGTCCACCACTGCTTTGGCAAAATGAGGAGGAATATTTTATGGTTAGGATTATACTACACAAACATGCTGAGAGGTCCTGCTGATTTACATCCTGACAAATTAAATGCATCACTTGTAGGATTGGAAATGGATTTTTGGCCTCATGAGATTCACTTCTCTATCCCCTACATGGCCAGAAGCACAAAGCAGAAACAGGATTAGCAACGTTTGCTCTGCTGTTTGTTTTCCTAACAGTCCAGAGGGAGTCACTCTAAAAAGCTTCCAGTTTGCTCTCTTTAGGCAATATGTTTTTCTTTTGTTGGATGCTACCCGAAACTTAAAACCTGGTTTTGTTTCTTACCTCAAAGAAACAACACTTGGGAGTAAGGAATCTGTAACTCAACCATATAATTGGAATTACACAACCAAGAACCTAAGTAAATGGGAAACATTAATATTTTACCTTGCCCACAAAGGGAGTGAGATGAACACAAAGTAGGACACAAAATGTAAACTTTCACTAGTTTCCTCCAGTATGTTTCCTACTGCTTTCTAAAACAATGGAATAGAGGTGTACAGGAAATGATGTCCTAATGCAGTTTCCTTCAGTTGAACCAAATATGTGACTGGGTCTGTTAGTCGAAAGGTTTGGTCAACTGGCCAGTTTTCCCAGCACCCGCCCATCTCTGACTTAACCCCAACTTTTTGCAAGGCGGAAGCAAAGCCAGGCTAAAGAATATTCCAGAAGGAGCCCTTCTGTCTCACCAGGGTATACAGGAAGGGAAATCAAAACCCCATGTATACAAAGACGGAGCACACGGGCTTTCTTGATTGTGCTGAGTATGCAGAGTGAAGATTAAGGAAGTCTTCAGTAAGACCGTTCAGAGTGAACTGAAACGAGACATGTGATGGCCATTCCTACATAGTTTGAGCAATACTAGCTGCCGCATAGCTACTAGTACAAGGTAAACATCTGTGCCAGGTGCTTTAACTTACTATTTCCAATCCTCCAACCAATCCTGCAAAGTATGTATTATTATTTCTATTTTACACTTAAAAAAAGCCCTGAGGCTCACAGAAATCAAGTAAGTTGCTTATGACCAAACAGCTAAGGATATGGCAAAATTAGAGTTCAAGTTCATGGTGATTCTCTGCCTTAATTATTATAAAAATATTTTTGCAATGTGATGAGGCCTCAAGTATAATTGATGTAGTTGTCAAGTTATTCTCTTAAAACAAACAAATATTCATTTGAAGAAAGGGGTAGACCAGTTGTTTTTGGCCTGTCACTATATAGGTCATTATTTAGTCCTTCTAATATTAGAGCAGAAGATATAAACTATTTATTTTACCTTGGGAATTCACTGAACTTATTTGACATGCTCATCTATCTTCTAGCTGGAGTTATGGGAAGTTATTAAGTTAATTAATTTTAAGTGATTGAAACATGTGCAACTTCAAGATACCAAATTATGCCTTACTAATTATTGCAATAAAATACAGTATTGATATTTAATGCTTAATATGCCTAAAGAAATGAAAAATGAAATCATAGTCTTTTAAATTAAAGCTATCTTTCATTTGATAAATTATTTACAAAATGCTAAAGTAACTTGCTAACTTCTAACATTAAACTAGGCTGAATTATATTAGTTGTTTATAACAAGGATAAAAAAGGTGACTTTTTGAATTTATATTATTCTAGTCTTTTTCTTGTAAATAGAACACCTACATACTAGAATGTTACCTTTTTTCCCTGTTAATTTTTAAAATAATATTTAATAGCATATAGCATTTTCCTTTTTTTAAATTATAATAACCGTAGTATCTTGGCATGAAATACAATTCTGATCAAATTGGAAATCTAAGGCTCATCTTAATTCTTCTCTTTCCCTAATCCCCCACAACTCACCAGTCACTGTTGATGCTATCAATTCCATCTTCTAAATATTTTTCTAATCCGTCCCATCCTTTCCATTCCCACTGACTATGTCTTAGGTCAAGCTGCCATGAATTCTTGTCTAGGCCACTGCAGTGACCTCTGGGTTTAAGCTATGTGCCACTCCAGTCCTTATCCAGAAGCTGTGCCAAAGTCTTCTTTCTAAAATGCAAGTCAGACTATTTTCCTCTATTAATTCCCTCTCAACCAAATGACAATTCTCTATAACTGATAGAAGAGAGTTCAAGTTCTTTAGCACACAATACAGTCCATGATCACTATAATCTTACTTTTGCAGACTTACTTCCAATAATCTTATTTTTTAGAGGATACACGCTAATAGTTAAGAGCATGAGCTCTGAGGCCAGACTGCCTGGTTTCACTTTTCCTTGATTCCTGGGATAATCGACTAAGTCACATATTATTTGTGTGACTTTGTGCAACTTACATAGACTCTATGTGTTTTGGTTTCCTAATTTGTAACATAACAATGACAATAATTGTACTGTATGAAGTTAAGATGAAGATTGAGTTAATGTGTGTAAATCACTGAGAACAGTGCCTGACATGAGCAGCAGTGTTTAATCATGTTAGTTGTTAGTATGACACTGAACACATGATGTTATTTCAGACATATTTGATGTTTGCCTGACATTCCTTATTCAACTCACAAATTTCTGTTCATCCTTGGAAACTCATTGCATGTGTCAGCTTCTCTAACAGTCCGTCTCTGGCTCTACCAGATAGATTTGCTCATTATGACCTATGTGATAGCCCTGTACCTGTTTCCTCCCCATAATTTCACTTATCTGATCACATTATAATATATGTATGTTTCTGTGTGTGCATGTTTATTTATCTATATCCATACTATTAGGCTGTGACCTTCTAGGACACAGAGAATGTGTTTTATTTTCATTGTCTTCCTGCTCCCGGGCACAATTTTCTACACATAAGCATATTTAGTATTAAATGCATTTTGAATGCTAAATGAATAAGGAACTGGGAAATGTCCCAATAGCTCTAACCCAACAAATGCCATTTATCCATACGACACACAGAGACTCACACACACACAAAGACTCACACACACACACAACTAATAAAAATACTTATAGTGGAAAAAACAAATCATATTGTTTACATTAAATACTGTAAATCCATTTATCGTTTTCAACATGAATAAAATAGAGATCGTGTTTACACCACTATTCTGCATTGTCAAAAGCCCATTGCATGGCACTCAATGTTACTATTGTATACTCTGAGGTTCACTAATTCAGCCCACCTTTAAAATTTCTGGATAGCATTTGCACAGGCCATTCTAGACCTATGACTGTTTCCTCCATTTCTATGATAAATAAAAACAAGTAAGACAAACTTGTTGTATATACATGTATATTAAATTATATACATGCATATACAGTTGTAAGTCAAATTTCCCCTAATTCCACACCCCTACACCATACCACCTGCTAGCAGAGAATCATCATTAAGAGATTAAATTCAGTGCTTACTCTTCCAGATGTTTTCTCTAAACATACTAACATATGTGTATATATAGAGTGTGCATATTTATGTGTGTGTTTACACAGATGTACACTCATATATAATTGCACACATGCACAAGTACTTGTTTATATGATATGTGCATATATGTGTAGATTATTTTATCATTGGGGTTTTTTCTACTATTTATTTCATAATAATTTGTCATACATATATTACACATATAACCATAAACAGATATACCTCATTCATTTTCAAGAATGAGTAGCAATCTATTTTTATAGATGCACTATAATTTATAACCTATTATAAGTATTATTTATGTTAATAGATATATAATTTATCAAAACTATAATTAGTGATGTGATAATTTAAATTTTTTATAGATATTCACAAGTTATCTTCACATTTTACCTTCTCCCTAAGAGTACCTGGGCTTTCAAATTTCCCAAAACTTTGCTAGCCATCTAATTAATCTCGGCTTCTTCAGAAGTTAAGTTGTGCATGTTTTTGTGTGTATTAACCATTTGCATTTCTTCTGTGACTAGATTTCTTTTTCTGTGACTACATACTAGCCTATTTACGTATGTTTAACATTTTTTCTACTATATTGTTTATCCTTTTTTAAATTAACTCATATGAGCTCTTTAATGGATATTAAAACTTTGTAATATATGTTACAAAATTTTCTCTAGTTTATTATTTATTGTCCAACTTATTTTTTAATAGAAACATTACATCTCTGTGTTATGAAATGTATCAATCTTTTTTTTTCTTAGTTGCTGGTTTTTATAATACATTTAGCTTATTCTTCTTTACCCCAAACTTTACATTTATTTGCCAATATTTACTTATAGTATCTATGCTTCTACTCCAAATTTGAATTTCCAAACAAATATGATTTCAGACTTTGAGAGGAAATTTATTGCATTCCAATTAGACACGTAAAGTATAAATTTAACCTGAACTAAATCTGTGTGTATTTAAATGGGGAGAAAAATTACTCTTTACAAACCCATATTTGCAACACATGTTGACACCATACATGTTGAAAATAGTGGAAAATATTGGAACATCTGTAAATAGATTCAGACAGATAAAAATGAGGTTTCTATATTTTCAACATCTTCCTCCTTGTTTGAAGGGCTATATTTATACTCATAGAGCTTAGGCAACTGTCACCACTGTGAATTCATTGGCTGCTATGTTAAGAACTCTATTGTGGGAAACAATTTGAAAGGGATATCCTTTTCTGTGAAAGCTTCAAGATATGTTCAATGATTTGAAATATTTCCAATAAGATGTTGGAGAAGGCAGTGTAAAACAGGGGTATGGAGAAGTCTACCAGAAACTTCAAATAGGACTTGCTGTACACTCATTTAGAACCTTTTACTAAAGTTCGAGGCACAGATTATTTTGTTTATTTTATTCATTAAAGTGCACCTCTGCCTCAAATAGAAGCTAAGTGCCAGAATTCTATGCATGTCTCTTCTCAAAGTGTTTCCAGAAAGACGGGAAACAGGAAGTCCTAAGACTCCTGTGAGAAACTCTCTCCTTGGATTTCTAGCTCAATTTGTATAGATTTAGGTGCATGGTTTCATAAAGTGTTGTTCCATGGAACCCTAATCCTAAAAGAAGCATCTTAATAAAAACTGTTTGTTTAATATAGGCCTCCCTAAATCTTAACAATGAAACTCTTATTTTGCTTCAAAGAACATACTGAATATGCTCTAGGAAACAGTGCACTGGTGTTCAGTAACCATCCAGGTTTTGTGTTTAAAATGCAAACCTAAGCTAAACATGTAGCTGAGACTGTCATCAGGGAAAATCTGACTACTTTGACTATCTAACTTTAGGACACTGGGGCTGCAGTGTTGTCCTTCATATCAACCTCTCTATATAAAGATCCCCATGCTAGCTGAGGTGGCCACTCCCAACGGACCTGGATAACGAAAATAGTAAAGAATCAATGAAAGGCTTCAGGGACAAAATGAAATATGAGCAGTATATTAACAATATAATTAAAATTAACACATAAATTTAATGGAAGAGGTATTAAGACAGGGTAGTATTTAAGAAAATTCTAGTCCAGATGTTAAAAATCGACTTGACAAAGTAATTCTGTTTTTATACGTGGGAAAGATAAACAGGTTCAAATATTGTGAAGGATAAGCTCCCAGAACAACTAAATGGAGAGCAGCAAATATTAAGGATATGTGAAGGCAGTGCCTTGGTTCCTGGTATAACATGATGAATAAAAGGAATAGGAAGAGATTATAGTGTGTTAAGTCAAAGAGATGAGACTATAGGATGTTCATTGACACAGCAGTGGGATGTCTTGAGTAGATTTCCAGTCTAACAACTTAGAAGACATGGCTTTTTATTCCTGGTTCTGACACTTAATATCTGCATGATTTTGAAGAAAACATTTGATTCTTACCTATCCATGAGGGTCTGTAACATCTGCTCATTCTATGTTACTATATTGCTTTAAGAATCAAAGGAGATAAAGGTTTCAAATTGCTATATAACTATAATGGTGTGTTACAAGAATAAGATAATAAGTAGAGATGGTATATGGAGTTTTCTGGCAAGTGAGGTTTGCATTGAAACCATTTTGGAAGTAATGACAAGGAAGGGCTGACTTCCAAAGTAGATACTAGCCAATAAATGGGAGGAATCAAAGAGAAGAGAGCAGTCTTTTGGAAGCCAAATATGAAGAGAAGATGAAAAAAGGGGATGAGTGTAGTCAAAAGAAATGGAAGGGTCAAGAAGAGATCAGTCTTGCCTGAAGAAGTCTAAAAAGTTGTCATTAATATGAAAAATGTCCCTAATAAATAAAGTTGGTAGATAATTACTGAAGTACAAATGTTATTAAGGGCGCTCCAAGTGAAGAAATGTGATGAGAAAATGATGAGAAGAGATAATTAACTGGTAAGACTTGCCATTAGAGAAACAATGTAACATGTTTCCAATTTGCTTGTAGTTGTTATGCATATTACTTGGGTTTCCAAATCCTGTGGAATGTCTGTGCTGTAGAGTAGCCTTCTTAGTTCCATGGACAGTCTCTTTTTCACATTACATGCACTGTCTATTCTAAGATGACAAACTATATGGGTATCTTTTGATACCTGCTAGTAAGGGAGCATTAAAGGTTGTCTGATGAATTATGAAAATTAATGTTCTGTCTAACGTGCTAATGTGCGTTATATTATATATTATACATATTATGTATTCCTTTTACTCAGAAAAGCAGATCTTTTCCACAAGCCAGTGTCCAGAATTGTTTCCTTTAGTACCAGGACTTCTTTGATCTACTTTCCATTCTCAGCTCTTTCCAAGTTATCCTGAAAAACAAAACAAATCAAACAAGCCCACCTTCTTTACTGACATCTCAGATAGCAGCTATCTCTGCGCATATGTCCGCTTGAACAAGGAATACATCAAAAATAAACAGAAAAACACTGATGCAAAAATTTAAAAAAAAAGTATTATGTCTGAAACAGAAGTTTCTTTTAGCTTCTGCATTTTCATTTGAGGTTTTTATTCTCTAAAAATAAACCCTAGAGTAAGAATAGTGTCATTTTATATTTTACAGAATTATTGGCACTTAGCAACTAATAAATACAAATTATAACTATAGCATGATATTTTCCAAACCAGAATGTTACCTACTGATTAGGAAAACTGAAAGGCCAGTGCCCATCTTATTTCAAGTACAAAATGGTAATTCAGAATTTTTATCCAGTATTATATGACTATAACGTTCAAATTTTGATATCTACATGCTTGCCAGTTTAATAGGTAATGCTAAGTTTTCTCACTAGTAGACTATAACGCCTATGAATTTAAAAGGCAATTTTCTTATAAGTTAACAACTCTAAATTATGGGCATCTTGCCTCTGATCATTACCCCAGGACTAGCAAGAAAAGTAAATAAAAAGTAAACAGAGAATAAGCTAAGACACTGGTCGTGGTTAATTCTCAGATCTAAAGGCCAAAAATTAATGGGCACAGAGAAGATCTCCTTTGACGCCTACCCCAGTAGGTGGGATGAAACTTTTAACCAATAAAGATAGTGAAGAAGTTTTTTGTTTTTGTTTGTGTTTTACCACGAACTTCTCCAACAAAAAGTTACTGGCAAAGAAAAATAACATGGTAAAAGAAGATGAATCATACCTACCCCTTACAGATGTTGTTTTTCATCTTACACTGCTTACCTTGCCTAAGTTTTTCATTTCCAAAAGAATTTTTAAAAAATAAGTGATCATCACAGTTTCCCTATATTACTGTACCCAAGCTCTATCTAAATTGGGTTTACTTTATGATCGGTGCAGGGCAGGGCTCCTTTCTCTCTTGGTATTGGTAGAATGAAAGCAATTCAAAACAGAAATGGGACTTCTACTGCAGAAGTCACACAGTTTCTGCTAATGGGTCTCAATGAGAAACTTTCTTATGTGAATGTGTGCACACTACTAAAGGTATTATAAATTAGTAGAGTCTTAGCAGCCTCAGGTATTTTTCAGGCTTGACTTCACAGGCAGCTTTCCTGCCATATTCTTCGAGTACAAGTTTGTTGGCAAAGATTTGGAATGCCCAGGAGTAGTTCTGGCCACACTTCTTTTTCCTCTTCCTCTTCTTCTAAACAATGGAAATGTATTCTCTGAATATTCTGGAGGCTGAAAGTCCCAGATCAAGGATCAAGGTGCCTGCAGGGCTAGGCTCTCTCCGAAGGCCCTAGGGAAGACTCGGTTCCAGGCCTCTCTCCTACCTGCCAGTAGTTCCTTGGCTTGAGGCAGCAGTGCTCCAATCTTTACACAACCTTTTCCCTGTGTGCACATCTGATCTGTCTCTCAACATTTTCCCTTTTTATAAGGACACCAATCATAGTGGATTAGAAGCTCATCCTCCTCCAGGATGACCTCATCTTAACTAATTACATCTGCAACGAATCTGTTTCTAAATAAGGCCACATTCTTGACTTCCTGGAGGTTGGGACTTCACACACACACACACACACACATATATATATACATATATATACATATATACACACACACACATATATATATATACATATTTTTTTTTTTTGGCTGGGGGGCAAGCATGGGCAGGCCATAATTGAACTCGTAACAACCACTTAAAACAGTACCTGACACTGGCCGGGCACAGTGGCTCATGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGCGGGCAGATCACAAGGTCAGGAGATCGAGACCATCCTGGCCAACACGGCAAAACCCCATCTCTACTAAAAATACAAAAAATTAGCTGGGCATGGTGGCAGGCGCCTGTAGTCCCAACTACTCGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATGGCGTGAACCCAGGAGGCGGAACTTGCAGTGAGTAGAGATTGAGCCAAGATCACGCCACTGTGCTCCAGCCTGGGCGACAGAGCAAGACTCTGTCTTAAAACAAACAAACAACAACAACAAAAAGCAAAACAAAAAAACAGTACCTGACACATAGCAACCATGTCATAAATGAGAGGTATCATGACTAGTATGATTGACATCATCATCACCATCTACCATGCTGATCCATCCACAAGGTTTCTGGCATCTACCAGGATGGCACAGCTTCTGCCACATGGACTTCTCTCGATTCCCTCACAGTCTTTTATGCCATTTAAGCCTTGGACCCACACTTCTTAATCTGTGTAAAAGACAATCAGATGTTACACTTTGTCCCCCAGTACCTGGTGTTGGAAGATTTGGCTCTTCAAACATGCTCTATTTTATAATTTAAGTATTGAATCTAAAACACTCCCTAGTGTCCCCTTTTTGAAAGGAATGATTCAGTGCTGTATTTCTCCAAGGTAAATTAAGTGCCCATTCTGGTATGTGGCATTTTAATAACACCTTGTAAACTAAGGACGGGTTGAACCTTCTGAAAACAGAACTGAGAAAACCGAGTAAGCCTTTCCCCGGAGGAAAACTAGTATATTAGACACTCCATAAAATGTTAATGCTTTTTATTTCCAGTCAGTTGGTAGGCTCCAAAAATGCTTCTGCTTTCTCTATCATTTTTAATGTGCAATATACAAGGGGAATATCCTATAAAGAGCTCAGGGAGAAGGAAGGGCCTCAGTTAAAGATTTCAACACTCTGAGCAAAGCATCCCAACTCCTTTCAGAAGACCATACCATCAGCCAAAGGGAGTCTTCCTTTTGTTACCATTTATACAGTGACTTGGGAACTTGTAGTGTCATTAAGCCTCATCCTGAAGCTTGAGTTGAGAAATAAAGGAAGCTAGTGGTTATGATACAGGACCAGTTATCAAAAATCACAAGAATTCATTGTGACTTTAGATAGATCACTTTTGGCTCCTGTGGTTTCTGTGTCAATATAGTTTTCTTTTTGTATGTGTGTGTGATTGAGAATGTATATTGCTGTTTTTTCTTTTTTCACCTAACATATTTTGAGCATTTTCTAATATCCTTAAAATGATTAAAAATATTTTCAACAGTTTCAAAATAAGAGATTTTTTTCTTTCTTAATGTCATTGTACATAAACCTTTGTGTTTCTGATTATTTCATATTTTTCTCTTTATTTCTGATTTTGCAGATGGTCAATATACTATTCTTGATCCCACAGAACTATCGTGAAATTTAGTCAATGTTAACGTTTTGAAAACCCCAAATAAATGAAGCAAAGTGAATAAAAAGTAGTTTCTACGTGTTGTTTGTTTTTTTCCTGAACTATTCTGTTTCCTCTTAGGCCCATTTCTTTAGTGAAAGTTATACTATAACTTCTTTAGAGTGTAGCTATTTGGGTGTAAGTTAGCTACCTTGGATATAAGATACACCCAAGGAAACCAAGAAACTAAATCATAGTTAAAAGCAAACATTACTCTGACAATATCTGGTTTACTTATTTTTTATTTGACATGTTATATGTGTAACTCCTATTCTGAAGAATACATATTCTTAAGTCTCTCACTTAAAAATATTTTTACAGTGAAATGTAAAATTTCTCATCTTAAATAAATTCAGGAACCAATTGAATTATAAGGGTTTTTTTGTATAACATTTTTTCAAATCTAAGTTTTATTTTCACTTCCTTGTAG
Seq C2 exon
TTTATTAGAACATAAAATCTTAGAAATGGAAGGAAAACACAAGGAAGAGTTGGACACCTTAAAGGAAGAGAAAGAGAACCTTCAAGGCTTGGTTACTCGTCAAACATATATAATCCAGGAGCTGGAAAAGCAATTAAACAGAGCTACCACCAACAACAGTGTCCTTCAGAAGCAGCAACTGGAGCTGATGGACACAGTCCACAACCTTGTCAATCTTTGCACTAAAGAAGGTG
VastDB Features
Vast-tools module Information
Secondary ID
ENSG00000154188-ANGPT1:NM_001146:3
Average complexity
IR-S
Mappability confidence:
NA
Protein Impact
ORF disruption upon sequence inclusion
No structure available
Features
Disorder rate (Iupred):
C1=0.000 A=NA C2=0.214
Domain overlap (PFAM):
C1:
NO
A:
NA
C2:
PF097384=DUF2051=PU(66.0=94.3),PF089195=F_actin_bind=WD(100=70.0)
Main Inclusion Isoform:
NA
Other Inclusion Isoforms:
NA
Associated events
Other assemblies
Conservation
Fruitfly
(dm6)
No conservation detected
Primers PCR
Suggestions for RT-PCR validation
F:
No suggested primer sequences
R:
No suggested primer sequences
Band lengths:
Functional annotations
There are 0 annotated functions for this event
GENOMIC CONTEXT[edit]
INCLUSION PATTERN[edit]
SPECIAL DATASETS
- Autistic and control brains
- Pre-implantation embryo development
Other AS DBs:
FasterDB (Includes CLIP-seq data)
AS-ALPS (AS-induced ALteration of Protein Structure, links to PINs)
APPRIS (Selection of principal isoform)
DEU primates (Only for human)