HsaINT0037713 @ hg38
Intron Retention
Gene
ENSG00000082438 | COBLL1
Description
cordon-bleu WH2 repeat protein like 1 [Source:HGNC Symbol;Acc:HGNC:23571]
Coordinates
chr2:164704952-164722311:-
Coord C1 exon
chr2:164722075-164722311
Coord A exon
chr2:164705106-164722074
Coord C2 exon
chr2:164704952-164705105
Length
16969 bp
Sequences
Splice sites
5' ss Seq
AAGGTGTGT
5' ss Score
6.64
3' ss Seq
TTGGTCATTTTGTTTTCCAGAGT
3' ss Score
8.27
Exon sequences
Seq C1 exon
ACTGCAAGTGCCCCTGCAACCCCTCTAGTAAATAAGCACCGCCCAACTTTTACAAGGTCCAATACCATTTCCAAACCATATATTTCCAACACCCTGCCGTCGGATGCACCCAAGAAGAGGCGGGCTCCACTGCCCCCGATGCCAGCATCTCAGAGTGTCCCCCAAGACCTTGCACACATCCAGGAGAGGCCTGCTTCTTGTATAGTGAAATCCATGAGCGTGGATGAGACAGATAAG
Seq A exon
GTGTGTAGTTTTGTTTTCTATTTTGTTTTTTTGGATGAGGCAGTGTACCATTTATTTTTCCTCTTACCTAACATCTTTTCTAGGTAGACTAGTAAGAAGTAGTCCTATAACAGTTGGTAATTAGTAACAGTTACTAATATGTAATAAGATGAATAGCTCATTCTAAGATTGGTACTAGGAATAGATCTTCTATGTACATACAGGTCTGTGATGCAGTAAAGGATAAATGTCCATTTTAAGTAACTTTCATATTCAAGCAAAAAAAAATCTGAAAACCTAAAGTCTTGGTTTACTAAGGCCTAACTAGGGGCTCTTGCTAGGTGCATGTAATAGGAATGGAAATACAGTCTTTATTTTTGAATAGTTCTTTTTTATACAGTAACACAGTCTTTGAGTTGTGTTCATGGGTTTCTAACCACACGTATTTTCTTGACCTGACTCAGATTCTCCAGGGAATAGCCTGGTATCTACCTAGTACATAGATACTCCACAGTGAAAAAAGAAAATGAGCCTTTTTATATAGAATATATCACAGTTACCTTTATGCACCCTTATCTTCAAAGCACAGTTCTATGTGTACCTTTTTCTCAAAGTTTCTTACTATTACACACCTTTAATCTCAAATTTTCCCTGAGTTTGCCATTTTGTGGAGATCCATTTGCAAACTACTTTTCATGACTAAACAATCTGCATATTCCTTGCTTTATCCATGTGAAAAATAAATGAATTTTTAGGTATATATGATTGAAGATGAGACTGTATATATTGTTGCTGGTAATCAGAAAGAATGATTTAAGTAACTTTGAGAGCAGATTTTATTTGGAGATAATTGAGACACTGAGAAGTTTTCTTGTGTCTAGTTGAAAGATTTTGTTTCCCCCTTGGGGGCTTAGTAAATGCAATGCTAAAGTAAATTAACTCTTCCCAAGCACCTGGTACACATTTCTGTGCTTCCTTTACTTAAAAAAAATTAACCATAGTTTTAAAATGTAGTTTATAGGCTATCATACATGCAACTCAAAGAGATAGAAATGAATTTTGAAAATGCTTAACCTCAGTACTTGGAAAATTATCTATTAAGTTTCTTATTTCTATGAAGACTTTCTTGTCTAATTTAGTATTTGTGGTATAAAATCTCATCTTATAAAATCTCATCCAATCTCACAAATCAGGAGGATAATGTTTTTGTCAAGTTATAGAGTCACATACTGACAAAGAATTTGCAGGGTAACTGCTTGAGAGTTGGGAGAATCTTCACGGAGAGATGATTCTTGAGTTCACTCTTAAAATATGTGTGGGAGTGCATTAGGCCAAGGAACCCTGTTAAGAGACGCAGGAATGTGAACACGATGGCTTGCCTGGACATGAGCAAGAAACAGAGACTGAAATTAAGCATGGTAAGCAGGGGTCAAGTCAGGGTCCCAAAGACTTTATTTTGTGCTTGTAGCCCTTTTAAATTTATTCACAATAAGAAGTAGCATTTTTAGGGTTGTTGTATCATAGAAGAGTGTAAATTATACTCTTGAGTAGCTACCTTTTTGCATATATTAATATATATAGAAATATACTTTAGCCCATGCTCACAAATCTTTATTCCAGCTGTCCTCATCCAATCTATTTCAGTAAACTTCCTTTGTACTTGGCTCCCCAAGAGGTCTATGTTGTCTTTCTAATAGTCTGTTTCTTAAAATTCTGGGCTGTGCCACCAGTGACCTCACTGAAAGCTATTTCTTTTGATTCTCTCCCTCTGCTCTGTGACCAGTTGCTGCCCCTGTGTTAAGTAATCTTTTTTTTTTTAGTATGTTGCCTTTGGCAAACTACACATCTTTATACAATTTTCTAATTATTTTTTCTTTTGATCTGGACATCTGGATAGTTCTTTGATGTATTGTTCAGTAGGACCCAGACTTATTTGTCTTTCCCTAGAGAAGCTGAAGAACCATTTTTTATTTATTCATTGCAAAAATTCTTAGTGATAAAGCTGTAGTGCACACAAAAATTCATACCTTCCTAGGCATCTCTGCAACTAACTTCTTGATATATTTGATGTGGTTAATTACCCCCTTGGTCTTGATTTGTCTTTTTCTTCCTTGGTCTTGAACCTCTTCTTATATCTCAGCCCTCTTCTATTTTTTTTTTCTTGTCACTGTTTCTTTTATTCATTTTCTAAATTTGGAGGTACTAAATCCATGGTCTTGGTCTATATTTCTGCACTTATTCAGAGAAGACATCTCTTCTTTTTTGAGTTTGTGGGCTGATGGTTCTCAACTGTAGTGGTTTGAATATGTTCCTTGCAAAAGGTATGTCTGAGCTCTAACCCTTCCAAAACCTGTGATTCTGACCTTATTTAGAAATAGAATTTTTGCAGATGTACTTAAGGATCTAGAAATGAACTCATATTGGATTTGAGGTGGGCTCAAATCCAGTGGCAGGTATCCTTATAAGAAGAGGAGACACACAGGCAGAGAGACACAGAGAAGGTCGTGTGAAGACAGGCAGAAATTGGCATTATGCTGCCACAGCGAACCATTACCAGGAGTCAGTGGAAGCTGGAAGAGGCAAGGGAGGGTTCTCCCTAATGCCTTCAAAGGGAGCATGACTCCGCCAACACCTTGATTTCAGATTTCTGTATTTCAGAACTGTGGAAGAATACATTTGTGTTGTTTTTAGCCACCCAGTCACAGTAATTTGTTAGGGCAGCCCTAGGAAACTGTACATCAACTTCGTAATTCCAGTCTCGGTATTCTTCCAGTTGCAATTTGAATTCACAGTTGCTATTGACTCATGACTACCTGGAAGACGTATTTAAGATCCGAATCATTGTTTTTCACCAGACTGAAAAGCTCAAGTTCATCTTTGTTTTTTTTTCTTTTTACATCTAATTAGAGACAAATCCTTCATTCAGTCTCCCTTCATGATGTCTTTTATTCCCTCTGCTGACATCTTTTGTAGAGAAATCCAGGACAGAGTATAAAGAGAAAACCAGTACTTAATGTGTCTTTGAAATTCTCAACGTGGCAAGCTGCTGCATTTGTATTTCTTAATTATCACTTCTCAGTTCAGAAATTTTGCATAGCTTGTTGTCATTTTTCTGGGCATCCAAGATCCTCTACAGAATGATTACAATTTTACTTTTAAACTTTTTAATGCCTCCTCATTGATAGGATAGGATACTTCTATCTCTAACCAGAAGATTTGACTTATTGTTGCTGATGCAAAAATCCTGTGTTCTGTATCTTTTCAGAATGGAATGGCCCCACTTCCATCTTCTTCATTTCTACTTACCCATCCAAAGGATGTCCATTCTTTTATCAGATTCATGGAGAGTTTTCTGAAGATGCCAGCGCAGAATAATCTTTACCTTCTCTGAATTTGTTCCTCTTGTCCCTTTTTATTTTCTCTTAATTTGCATTATGTATAGGTTTTATATGTTATTCTAAAGATAAAAAGAGGAATACAGTAAAAATTCTCCTTCCCTATCCCCCACCAAGTTCTCCTGCCCAGAGGCAACCACTGTTAACAGTTTCTTGTGTGTCTTTCCAGAGATAATGTATGCATATTAAAACCAATATTCATGCTAAATATTTTTTTTCCTCAGGTGGCCATATACTACATGCATGTTATACTTTACTTCTTGGTATGGAATTATTTATTCTGGATATTCTTAGCAGTTCATAAAGGGCTTCCCTTTTCGAAGGATTGAATAATATTAAATTGATGGGTATAACATGACTTACTTACCTCATCCTCTAAAGATAAACTTTAGGGTTGTATTATGGCTTAATGCTTGCAGCATTGTTAAATTTTACCTTTTTCTTTTCCCCACCCAGAAGGCAGGAATTGTGTTCTCCAGCAAAATTCTGTAACATGGTAGGTGTTCAAGAGAATTGATAAGTAAACATTAATCACTGCTTTCATAGCCAGGTATAGTATATACAATGAGAATGTGTCACACTTATATCGTAAAATTTTAGTATGTCATTCATATATCTGGTAAATTTTCAGAAGTACGTGGTTAACTTAAAGATTGCTTACATTTACTTTTATGGTAATTGGACCATGTAATTTTTAGCAATATATTTCTTAAGCTTTTATAGAAAAGCCAGAATTTAGATAAGGTTATATTGAAAACTTAAGGTCCAACTAAACTATACTGTACATTGCATAATGCATATAAATATAATTGATCCTTGAATTAAAATTGTTTATAGCCCAGGCTTGATGGCTCATGCCTATAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGTAGGAGGATCACTTAAAAGCCGGGAGTTCAAGACCAACCTGGGCCACAAAGTAAGACCCCTGCCTCTACAAAAAATAATAAAATAAAATAAATCAGCCAGGCATGTTGGTGTGTGCCTGCAGTCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGTGGGAGGATCACTTGAGCACAGGAATTCAAAGCTGCAATGAGCTGTGATCTCACCACTGCACTCCGGCCTGGGTGACAGGGTGAGACTGTGTCTTTAAAAAATAATAATGAATTTTAAAATAGTAAAAATGTGGTTTATATAGCCAGATGCAAATATTCAGGAAATTCAGCAAAACATATGAACGTACAAGTGAATCATACTTATTTCACTGCTTGCTTGTTTTAAATTTAAAATCAAAGATGGTCATTATCACTATAAACGTTTGTATCTATTTTAACAATTTAGTTTTCAATTTGAAAATGTAAAATATCACTATTTTTAGTGATTGAAAATGATAGCATGTTGAGGAAAACATAACTTGGAAGAAAAATATGTATGACCAAATTGGTTCTAAGTATGTGAATTTTAGACACTTTTATTTAATTTTTATTGTTCAGGATACAAAATAAACCACAAGGGTGCGCTGTTTGACAGAAGTACAGTATTCTAATTTTTCCATTTTTTTTCTCCAAAGCACATTTTAATAAAGCAGAAAGAAAATATTGGAAATAGTTACATTGCATGAGAAGTAGAAAATGCTTATTCATGCGGGTAAATAAAGCTAGAGAGATAAATGTCAGTAACACATGACAAAGGGATTTATAATTAGCAATTTTATTCATTTTGAGTTTTTAATGCATTTTCTTGTTCTTTTAAGAGCCACAGAAACTATGTTTGCCTTAGTCAAGGTTTACTGATGTCAGTAAATCTGTAGCTTAGGAAAAATTTTGTCAACCACATTTATTTTATATTTTTTGGCTGTCTATATTTAATAATTTGCCTCATTCTTCTAAGATATTTCTCAATATTAGCAAATTAAAGTATATGGATGGTGTTTTTTTAGAGCTTATACTGAAAATGCTCACATAAAAGGCTGTTGATTTGCTGAGCTAATTTTGACAAACTAACTGTGCAGTTTCCAAAGACTATTCAAAGTTAGCCGAGATAGCAAAGATCCAAGTTAGCAAATGATTTAACCCAAGCTTTCTTAGAATATTTCTGCATCTAAAATTATTTTTTCCATCTAAAGAATACATTTTGAAGAACACATATTTTACTATTATTGCTGCAGTATCCTTTCAAATCCCTAAATTTCTATGTACCCTCTTTCACATTATTTCAAGTCTCATGTCATTTTTCCTATGAAGGTGAATATATCATCTTCTATGAAAATGTTCATTTGAAAAGAAAACTTTCCCATTAGAAATTTTCTGGCAGTATTTCTTGGTAGTTTTTGAGCATTTTTTAAATATGATTTTTCCTGATGATTTGAAATGCCATTTGTGCAACAAGACATATAATAGATCATGCTTTATTTATATGAACCATATAACATATATTCTTATATAAAATGTACACAGTTATTTACGATAAGATTGTCATTTGTGAAATGGGAAGTCAGAAATTCGATTACATTGACTTAAATTGAAAGTGACTTAGAATTCTCAGATAAATCTAAGTTCAGAAATCTAGTTTCTGCACCGTATCTGCTGACCAAGAGTTTATGAAGAGCACATTTAATAAAATCAATGGCCAAAGGATGTTCTGGTCTTATTGACAAATTAGCCTCATAAGCTGATTTTACATTTGAATAAGTGGAAGAAGAGTCAGGGAAAAGTATTTGGTAATCTTGACCCATAGAATTCACAGAACCTTTTGGAGAATTTTTCATTTGGCACATTTGGTGTGACTGCTGCTTGGAATGATGGATATACAACAGCAATCAATTTTTCTCCTGGCTACGGGGATGGCACATCATTTTCTCTGGGATATTACATTGTGGCTGGAAACACTGTAAGAAATGATCTTCACTGGGCATTTTATTTTATCTCATTTTGCATCCTGCTTCAGACAAACACTCAACTATTGAGAAACGGAAACTCTTTGCCATCTAGTATTATGCAAGTGAAATTTAATACCTAGAGTGTTAGTTTTAAAATAACTGACTTAATTTTTTAAATGTTTTACATTATTCATCTTTTATGCAATTTTATATTCTAATATATATCATGGTTTATAAGCAGATAAGATGATGTATTGTCATATACTTATGAAATGTACAGGTACATATTTTGCTATTTTACTTAATTTTAATCCTAGTTATTTTACATAGAGTATGTAAGGTTGTACCCTCTGTTGTAATAGAGTATGTATTTGCAATGTTTAAGAAACATCCCCCTTTTTAGATTTTTACACAGGTTGTTATATTTTATTTTCCCCTCCATTTTCCTCTTATATTTATTATATAGAAAGTGGACCACCATGCATAATTCTACAATTGCCTAGGAACAGTGGTTACCATGGCATTTGCAGTTTGCTGTACAGAATACAGCTGTCTATACTTCCAAAAATATGACTGGTTTCATTCAGTAGAGAAATGTACCAACACAGTATAATATTTAATCTGCTCCCCTTTTTAAGGCTTTCCTAGATATAATACATACTTTGCCACTGTAGTTTTCATCAGATTTTCAAAGGGTCATAATCACAATAACAAAAGCAATGGTGAATGCTTATATAATGCTTACTAATGTTTCAGACAAGGCTCTAAGAACATTACTTATTTAATCCTTATGACAACCCTCTGGGCCATTACATTTTAGGTTTCTGACAGTTTTAGCCTAAAAGAACTATGAATTATGAGGAATTAATAAGTTGTTAAACTTTAAGGAAAAATATATTATTCAAAGAGCAGTAGGTCATTTGTGGAATTAATATGGATTTCTCATTCTTGTCTATTAGTATGTAAAAAGTCGTACCTCTCTAAAATAACATGCTGAGTTAATAAAATAGTATTGAAAATAATTACTGTTAGGAGGCTTACTTTACCAGTATGAAGTTTACTTAGCCTCTCTATCTCTGTGATGTTTGTGACCTCATGGGAAGATTTGCATTTCTCTGGTAACCAGCATGTGTTAACAGAGGCCAGGGCAGATAGAAGCAGGCCTCTTTTCTGGAGCCACAGTGATAACCTTAAGGTGTCCCTGGGATAAGCCTGCTCCCAGCCTTAATTGCCTTTCTGGATGAACTGAGTTGGCCCCAGTTTGTTTGATTGACTGTAGCTTCACTCTGGTATAGGTCCTAAACTCGGTTAACTTCTAGATTATTCACATTCTCCTACCCTGTGGCTAAAAACACCTCTATCCTCATCACTGTGATCACAGGGAATCATGGTTACCACCATTCCCTGTCTTTTAAACTTGATCCTGAGCTCTGCTTTCTGGTGGTTCATCCTGGTTTTTTTTTTTTTTTTTTTCATCCAAGATGTACCATTGAGCTAGACCCTCATCATTGGGCTTTTACTAAATGCTGTATGCAGAGGATTATCATGAGTAAGACTTAGTTTATATACTTTATCAGAGTATCATAGGGTTGATGAAAGCACGGATTGCCTCAGGAAGACAAATGGAAAAAACTTACAGGGGAATAACATGGGATTTTTTAATGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTTTCTTTCTATTGTGCCTAGACAAGGGCTGGAAAGAAGAAGTCCTGACCTGGCCTGAGAGAGAGACTCCTGAATTCTACTAATAGGTCTATTATCTTCTTCTTTGCCGTTGTCATTTTTTTTCCTTCACCTTTGCTGAACTTCTCTATGACTTAGTTTTCTCCTCTGTAGAATAAGATTGTGTAATTAAATTTCCCAAAGTCTCTTCCAACTCTAGTATTACAAAATTATGCTATTTTGCTATTTTTTAAAATTGGCCTCTAACAGATGAACGTGCTTGTTTTGGTTTGATCAACGTTAACGAGATGACGGTGTCTAATCCTGGCATTACTCCTCTGAGGATTTCAGAAACTTAAAGTACAATAACAAAATAAAACATTGACTGACATCTTTCTTCCCAAACTCCTGACTGTAACACAAAAGTTAACACAATTGCATAGGTATTGCATTACTAAAAAGAGGTAAAAGACTTGATATTTGATGACGACATGCTTAGGTTAATGAGTTTGTTAACCATGGTAACCATGTTACCATTGACTAATAATGAGTTTTAAAGTAGATGACTTTAAGAGAAATCTAGTGGCAAGCTTGGCCACTCAGAATCCCCTGAATGGGTTTAATTTTATTAACCAAAAAGGTACAAGTTACTGTTGGTGGTGGTATTTAGATCACATATAAGTGAACCTAGCTGTAACCTCATTGCTTCCTCTCATAATATTTATTTCAGCAGATTGGTAGGAGCAGCATTAAAATTGTCCACATAGTGATAGCTGGCCTAGTGTAGATGTAAGAGCTCCAGGCCCTGGTACTGCTGACCTATTTCTTCTCTCGTTATTATAGTTGTCTGGGATCTGACATGCCACCTCTATTCCTTATACCCCTTCACTCTGATGTTATATGACTTTTCTTAATCTACAAAACCTAGGCAGGCTAAGATTTTCTATGCCATCAGTGAAGAATCTTAAAACAGGTTTATATAGAGAATAAGAAAATAGAATGCATAAGCCCTAGATTTTCAGGAGTGTGGAGGAAGTGCCATCCAAAGAGGAAAAGGATGTAGCACAGGGAGATACAGGACATCAGAAATAAACTTCCCCCACCCCACCAAAAGATAACATTTTATTTTTACAAATCACAATAATATAACAAAGAAACTGGCAAGTATGCTTTCATACAATACAAGCCAAAATTTGCATGCACGTGTGTGTGTGTATCTATGTGCATCATGTATATACAGGTGTAAAAAGATACACATATAACAGTGGACACCAAAACTTCTATGAGGCGACTTTTATTTGGGATTTAGTGATTTTTTTCCTCATCATTATATACATTATTTGTGTCTTGTGAGATTGAGCTAATTTTATCACATCAACCATAAAACTGATTTAATTGTGATAAAAACTCACAGCTTATTTTGCAAATTCAATACAAGACCTCATTCTTCTAAATTACATTTATTATAGTGTAATAATAATATATATAATAATGACACTTTAAAATTGACTTGCTTGTCTAAGTTGTAAAAATTTTTTAACATTCTTCCATCAAGAGTTAAGAGTTAAAACTTGACCCTCAGATATATGAAAAGTTCAGTTATTGGGACACAATAGCAAATACCATAAATTAATGTCAATTTATAAGATATTTTATACTATTTAATAGTGTTTATTGTGAATGTCCAGGTTGGAGAAGAATAATGTGAGTCTGTCCCTTGAAAAACAAAACATGAGTTTTAAGACAATTTCAAGGGATTGTTTACATTCTCTCCACTAACCCCACCCTTTTCCACCTGTGAAAATCATAAACAGAACCAACAGATTCTATTAGAAACATTTAACATTATTGAAGTTGAGCCTCTATGTTTCTATCCCCTGAGTGTTTTTATTTTCCATATGTATTCTTTCATTTAACTCTTTAATCCAGGATACGTCAATTTCAATGACCCACTTTTTATAATTCAACTATGATTAATAAGTGATCTAATAACTAGTACAGAGCAAGTATTCAGTAAATCTCTTGAATGCCGTTTGATTCTATTTTCTTCAGCTAAATTTAGTTGGATTTTGAATCAGGAAATTCTGATCTGGGTGTGAATTCTGGGGGATTAACAATCTGGCATGGTTTTCAACCTGACCTTGCCACTTTCATTAGTAGATTCTGTTTCTCCTTGTGGTATTTTCCTTTTTACAGACCATAAAATTCAGTGATGTGCATTCCTGTTAGAAGTGCAGTTTTCATTAATGGCAAGCAGACTTATCAGTGACTCTAACTAAAGTAAATAATTGAACATCTCTAATGATTAACCAAAGCAGTTTCCCCTAGTAAGTAGAAACCTCTGTGTTTTCTCATTTTGTAAAGCCTTTAGACTTAATAAATTTTAATCTCTACCACTTTTTAAAATGTAGTCATAATTTGAACAAAGTAAATGTTTGTTGGTAGTAAAAGCTGAAGACAGTTATAAATGGTTCTTTAATTTTTCACATTAAATTTGCTTATGAGACATTTCAAATGTATGTACTATAATACATATCCATGAATTCATCACTGATTCAACAAAGTAGTGTTAAATATTTAACTTTTATTAAAGTCCTTTAAAGTATGTTGAAGAGACCTGAGTTGACTCAAAGGTGGAGATTTTTAGACCCACAATGAATGTTTATACAGTAGACTAAGCATTGGTTCCTGAACATTGGGCACTGTTGAGTTTTAAGGTTAATTATTACTGAGACTGATTCCAATAGGACTCTTACCAACACAGTCACCAGAGAGTACAATCTTAAATACCTCCTTTTACCTATGCTTTTTACTCCAACATCTGTATAACTATAATTCTTATTTTATTTGCAGAACACTTTCATGTACTTTAAAACAGACAAATTGCATGTAATAATATCAGCTGATGGTTATGAAGCATGTATTGTATGCTAGGCACTGTGCTATGTATTTTACATATAATATTTCATTTAAGTATCCCAGCCCCTTTTGACATAGGTGCTAGTACTTTTCCTTTTCATGAATGAGGAGGCCGAAGGTCACAGAGACAATAAATGGCATGTTTCCTGGTTCAACCGCTTGTATTGACTCCAAAACCCATTTCTTTGGGAATCATTGTAGTGGGTCGCCTTCTACCTTGCAAACTCTCTGTAAGCCTCTCTCCAACTAGACAAATTCAGATTCAGAAATAGTGGGTAGTTTAGCTCTGATGAATGCAAGAGCAGAACTATTGGGAGACTCTTTGGAGCATACTCCTAAAGTGCACAGAAGAAAATACAGCTTAAGAATGCTGCTGCTGGCCGGGCACAGTGGCTCACGCGTATAATCTCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGCAGGTGGATCACAAGGTCAGGAGTTCAAGATCAGCCTGGCCAAGATGGTGAAACCCCATCTCTACTAAAAATACAAAAAATTAGCCAGGCATGGTGGTGGCTGCCTGTAATCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGTCAGAGAACTGCTTGAACCCGGGAGGCGGAGGTTGCAGTGAGCTGAGATCGCACCACTGTACTCCAGCCTGGGCAACAGAGCGAAACTCCGTCTCCAAAAAAAAAAAAAAAGAATGCTGCTGCTTAGGGATCAGTGGTCTTCCCAGCCTTTTAATTTAATTTAATTTAATTTTTCAGCATTCTAAATTCATGATGTGTATTACTTAAATATTACTTAAATGCTGTGGCAGTTTAGTAAGGCTGCTTTTAGCATTAGTCATTCCTGGGTTTGGAGCCTCTCCAGTCTTGCATGTTAGATATGTATATTCTCTGTAAATCCCAGTGTATACATGTGCTTTCCTGGCTACAGTCTATTTAGAAATATCGAAGTCTCCTAACTTAAATGTCCCTTCTTTTCCTGCAGACTTTACCGCGCCTCCCCAAGAGAAGGTTTTTTAGTAGATGTAGAACATCTCTTTCTCAAGTCCCAGTTGTTCTTCCATTTTGTGTTAAGAGTGATGTTTTAGTTAACACACAATTTGATTTTTATTTGATTTTTATTATCTTAACTTCCCTTGGCAATTTCTTAAATAATTGAAATTATTTTCCAAGAGTCTTCATAAAACCTCTTGCCTCTGTGTCTTATGACAACAAAAAATATATATATTAAGCTATTTCCTTGAATGTTAATATGAATATTACTCATATTTCAAAAGAAAATTTACATTTCTGTCCTTCATTAATCTGTTGGTTATTATCTAAACTCACTATTCTTATTTCTTCAAAACTCTTGCCTTTGCACGACTTATACCAGTTGTTAAATTTACATTTTGTCCTCAACTTTAATAAGTTTTAACCATTATTAACAGCGTAAGTTCCAGTTATGACAGACCACATAATTGTACGTCGTATCAATTAGTGACAATCATGTTCACTTTCCTCTAATGTCTTTTTATTTTTATTTATTTATTTATTTATTTTGAGATGGAGTTTCACTCTTGTTGCCTAGGCTGGAGTGCAGTGGCGCAATCTTGGCTTACTGCACCTCCACTTCCCGGGTTCAAGCGATTCTTCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGATTACAGGCACACACCACCATACCCGGCTAATTTCTGTATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTCACCATGTTAGTCAGGCTGGTCTCAAATTCCTGTCCTCAGATATTCTACCTATCTTGGCTTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACGGCACCCAGCCAATGTCTTTTTTCTTAGCCTCTTTAATTCAAATTTCAGCTTTAGTAATGCATATCCATTTACCATCATGATACCCATGCACAACATGGTAAGGGTGGTGAATGTCACAGAATAGGGTTGTAAAATAAATGCTTCCCCTGATGTCCATGGCTTTGTGTTTTCAATATGCATTTCCCCCAGTTATCTTCATAAATGCTGTTGAAAAAAATTTAGCATTTATAAAACTGAAATATGTCTGTTTTGACAAATTTTAAATTCTTTATCCATAAAAATATAAATACTCTGTTTTACAAAAAGCTAGCTTATTTTAAGACCTCTAGCCTGAATAATGAAATATATGAGTCTATGGTTATTCTGTCTTTAGTTATGAATAGGCTCATAAAAATTTGTGAGTCTGTGTATATTCCTCCATTTTTATTTCTATACTGTCTGCTTTATTATAACCAAAATATAAGAGCTCTAACTCCCAAGTAGATACTCTCATTGAGAAATTCATGTCATGGCTGCTTTTATCATGGAAAAGACCAGTAAGTGACAAAGATTAGGAATGTGACCTAAAGGTGAACACATTTTTATTATACACCTCATGAAAGCAATCAGTTGAAACAAGGGAAACATGGAACTAGGGAGGAAAATCAAATGCTCTTGTTGCTTCATGCTTTAAGCTACCACTTATTGATCACCTGTTGCATTCTTACTGGTAAACTAGATCTGCCATAGGAGTGGAGCATGGCTTTAATAGGGCTTTACAGAAGTAAATCCGAGAAATAAAATCACATCTTCTACTGCTTTTGATTTGTAGACAATTATTTTTTTAAAGTGAAGGGCCATGTTCTTTTGGGAGAACTTTTGGCCTTTTTTCTGATGTTTCCTAAATGTGTTACTCTTAAGATATCAAGGGAAAGTTTTAGAACAGAAGGGCATTATCAGTAGAAAGATTTCTATTTAACCTTTATATTCTATTCAAAACAATATTTAAATACTGGCAACTCCTTGGTGCACTTCTTTCTTACCTTTTTGTTGCAGCGGGCCCTTGTTTTGAATTATTTCAAACATCCATTGAGAATCCACCCCCATGCCTACCCCAGTCAGGATGATCATAATATTTAGTCAGAATTGACTTCAGTGACTCTGAGACAGAATCTGAGTTTGGGTGGCAGGCTTTAACTCATTTCTTGCTGGATTATAGAGAAATCTGAAGAATTTTGGAGGAGGAATCAGAGTAATGGGATGGGGTTGGAGGCAGCTCTTTACCAACTAGTAGGAGAGAAGTTTAACATTTCAACTGTTGGTAAAATCTCCCTGGTGCCACCTTGTCGCACCCCCCTGTTATGAGGCACAGTTAGTGGGTTTATGAGAGGTTTGTTCAGTGAAGCTCCTGCCACTGTAGACCTAAATGTTTCTCTCCCTGTTGAAGTGACCTGCCTTCCTCTTTAGTACCTAACACAGTTGGCAAAGAGCATGGCTAACTCAAACCCTTTTCTTTGGGGGCAGGCTTCCCTTTCTCTCTGGCAGGTATATTAAAAAATTACAAAATAGTAAATTTGCCAAATTTTTCTTGGTGTGTAGCAAGGCATAAAGACTGAAAAATATCTTATGAATTAGTTCACTTCCCTTAGAGGTACCTACGTTGTCTTGTAAGACTAGAATGCCCCAAGCTTTACACGTGCCCCTGGTCTGAGTATGTCAAGGTCTTTTATTTACAAATGAAGATGGCAGCATATCATTCATTTTTTTATTCATTCAAGGAGTATTTACTTAGAACCCTCTGTGAGCCAGACATGGTTCTGGACATACAGCAGTGAGTGAAATAGTAGGGGAAAAAAATCTCTGCCTCTGTGGTCAACCCCAGTGGGAGCAGACAATGTACAAGGCAAATAAGTCAACTGTATAGTATGTTAGAGAGCAATTAAATGCTCATCATAGAAATAAATCTAGGAAGCAGGGATAAGAAATGTTGGGAGTCAGGGAGGAGTTCATTGAAAAGATGACATTTGACCGGGTATGGTAGCTCATGCCTGTAATCCCATCACTTTGGGAGGCCAAGGCAGGCAGATCACTTGAGGTCAGGAGTTCGAGAGCAGCCTAGCCAACATGGTGAAACCCCATCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGCCAGGTGTCATATTGCATGCCTGAAATCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGCATGAGAATCACTTGAACCTGGAAGGTGGAGGCTGCAGTGAGCCAAGTCACCCACTGCACTCCAACCTAGGTGGAGAGTGAGACTCTGTTTCAAAAAAAAAAATGACTTTTGAGAAATGGCCTGAAGAAAATGAAGGGACACCGAGTTATCAGAAGAAAAAGCATTCCAGGCACAGGGAGCAGTAAGGGTGACCACCCTGTGATGGAGGAACTCTGCCGGCACATTTGAAGAGCAGCAAAGAGGCCAGTGTGGCTGGAGTGGAGTGAGCCATTCCATTACCAAAGGAGAGGCCAGAGAAAGCTAGACACCGGGTTGTTAATGGACTTATAAAGGGAACTATTAGTGGGTTTTGACCAAAGTTACCTAATCTGGCTTACATTTTAATAGGATCCTTTTTTCTGATCTTATTTAAAGATAGCAGATTCTTTTTGCTGCTATGTTGAAGGACTATAGGGAAACAATGTGGAGATGGAGTCTAATTAGGTACTTCCTAATGATGAGTCAGACAACATAGTAGCAGTTAAGCTGGATGTTGGATGTCTTCTAAGGGAAGGGAAAAAAGGGTTGACTCAGTGTGAGATGTGACAGATACAAGATGAGGGTGAATGGAAGGATGACTTGTTCTTTACTAAGACAGGGAAGGCTGTGAGAATAGGATGTGGCAGAGGGATAAAGAGGAATCATCATGATCTCAGTTTTAGACATGCTAAATTGAAGAGGCTTCAGACATTAAGGGGAGATCAGAACAGAGGTCCAAGATAGAGACGTGGATTTGGAATTCATCAGCATGCAAATAATACATAAAGAGAATAGATGAGATCCTCTGGAGAGGGAGCAGAGATACTAAATGGAATGTGTTCACAGACCACACTCTGTGTCACACCAGTGTTGATCAGGAGATGAAGAGAAGCAGACACAGAAAACTGAGTAGCCAGAGAGTACGGATCTATAGAGAGTAAGAAATGTGGTCTCCTGGAAGAAAAATAATGTATTTTAGGAGGGTGGTCAGCTTTGTTTAATGTTGCTAATAGGTCTCATAAGTGAGTTCTGAGAAGTGGCCACAGATTTCTTCATAGTCAAGGTCTTTGGTGACTTTGATAGGAATCCTTTTAATGGATCAAAGGCTGGGAAAAGTATCATTGAAAGGATTCAAGTGGGATAAGAGAAATTGGAGACACAAACTGCAAACAACTCTTTTGTTTATTTATTCATTTTTTCAAGATGGAGTTTCACTCTTGTCGCCCAGGCTCGAGTGCAATGGCGCAATCTTGGCTCACTGCCACCTCCGCCTCTGGGATTCAAGCGATTCTCCTGCCTTAGCCTCCCGAGTAGCTGGGATTACAGGCACATGCCACCACGCCTGGCTAATTTTTTTATTTTTAGTAGAGACGGGCTTTCACTACGTTGGCCAGGCTGGTCTCGAACTCTTTACCTCAGGTGGTCTGCCCACCTTGGCCTTCCAAAGTGTGTGAGCCACACTTTGGAATTACAGGTGTGAGCCACCTGAACAACTCTTTTAAATAGTTATTTATTCGTTCATTCATTCATTCATTCATTCTTGGTAAAGGCAAAGAGCAAAGATGACATGGCATTTGGTCAGGAGGCACTGACCCCTGCTGAAGGAGGATGTCTTAGGGTCTGCTGACAGTCACGGGCTAGGAGTGTGAGCAGTAGCTCTTTGCAGTAGGTGACCTTGAAGGACCTGGCCTCAGGTAGACATATAGATTTTTGCAGTGTTCCTCACTGAAACACTGCAGCTGTAAAGAGGTAGATTTAATCAAGCCAAATACTACTATACAAATAATGTTCCCTTTTTCATCCCTTCCTTTTAATGTCTCCAGATTTTTCTTTAAAAGTTAGGTTTTAACTCTGTTACTTATGAGTCCTCTACATTACAGTTAGTTGTTTGTGTGGCAGTTTCCCATTCTAGCCCAAGTTTCTTGAGAAAGGCCGTATTTTATTTTTCTTTACATATCTATCCCATAGCCCAGCTTCTGTGTGTGGCAGATGCTTCATAAACGTTTTTAAGGAATGACTGTTATGTTCCATTTGGATATATCCTGTGCTTGACGTAAAGTTCAGTGTCTTCCTAAAGTTTGCTACTGATTTCTAAATGTAGGATTTTATTTGGTCATTTTGTTTTCCAG
Seq C2 exon
AGTCCCTGTGAAGCAGGAAGAGTGAGGGCAGGTTCACTGCAGCTCAGCAGCATGTCTGCAGGGAATTCATCTTTGAGAAGGACAAAGCGAAAAGCACCTTCCCCACCCTCCAAAATACCCCCGCATCAAAGTGATGAAAATAGTCGTGTGACTG
VastDB Features
Vast-tools module Information
Secondary ID
ENSG00000082438:ENST00000409184:7
Average complexity
IR
Mappability confidence:
NA
Protein Impact
ORF disruption upon sequence inclusion
No structure available
Features
Disorder rate (Iupred):
C1=0.987 A=NA C2=1.000
Domain overlap (PFAM):
C1:
NO
A:
NA
C2:
NO
Main Inclusion Isoform:
NA
Other Inclusion Isoforms:
NA
Other Skipping Isoforms:
Associated events
Other assemblies
Conservation
Zebrafish
(danRer10)
No conservation detected
Fruitfly
(dm6)
No conservation detected
Primers PCR
Suggestions for RT-PCR validation
F:
No suggested primer sequences
R:
No suggested primer sequences
Band lengths:
Functional annotations
There are 0 annotated functions for this event
GENOMIC CONTEXT[edit]
INCLUSION PATTERN[edit]
SPECIAL DATASETS
- Genotype-Tissue Expression Project (GTEx)
- Autistic and control brains
- Pre-implantation embryo development