HsaINT0042489 @ hg19
Intron Retention
Gene
ENSG00000178662 | CSRNP3
Description
cysteine-serine-rich nuclear protein 3 [Source:HGNC Symbol;Acc:30729]
Coordinates
chr2:166532822-166545917:+
Coord C1 exon
chr2:166532822-166533118
Coord A exon
chr2:166533119-166535210
Coord C2 exon
chr2:166535211-166545917
Length
2092 bp
Sequences
Splice sites
5' ss Seq
CAGGTAAGG
5' ss Score
11.08
3' ss Seq
TCTGTGTTCTTCCTTCCAAGGTG
3' ss Score
10.5
Exon sequences
Seq C1 exon
ATGACTAAGAATGGCACAGTAGAATCAGAAGAAGCCAGCACTCTTACACTGGATGACATTTCTGATGATGACATTGACCTGGACAACACAGAGGTAGATGAGTACTTCTTCCTACAACCTTTGCCAACAAAAAAACGAAGAGCTCTGCTGCGTGCCTCTGGAGTGAAAAAGATTGACGTGGAAGAAAAGCACGAACTCCGAGCCATCCGCCTCTCACGAGAGGACTGTGGCTGTGACTGCCGAGTGTTCTGTGATCCAGACACGTGCACCTGCAGCCTGGCTGGCATTAAGTGCCAG
Seq A exon
GTAAGGGTTGGGAATTCAGGGCATCCAAAGACAAGACATTGTCTACCACCCCCTAAGGAGGCAGTCATGGTACCTATAATGAAGCTTCCCACATGTAAAAGAAAATTTTTTGGCAAGGCAAGACATGTAATTCAGGAAGAAAGACATAATTCAGGAAGAGAGAAAGACTAATTTAAGGCCATTCATGGGAATACATAAAATGCTTATACATATAACATATAATCTGAAAGACAACCCAAGTAGCAGCTGAGTTAATTAAAATTATTTTATCTTGGATTCTTGTATTATATCACCTTATTTCAGCTTTTTACCAATGTTGAAGGAGATCATGACATCCCTAACACTGGAGTGTGTATTTTCTGATCCATCCATGGGATATAAAATGATGATTGATTAAAGGTGGTTGGATTAGTGGAAAAATTACTAGATTGAGACTGCAGAAAATGAAATTGTACTTCCATCTTTGCTGTTTGCCAACTATATGAAATTGGCAAGTCAGGCCCACTGGGTTACTTTCTTTATCTCTAAAATGAAGGAACCGAACTAGGTCAGGGGTTGGCACCCTATAAGTTCACAGGCCAAATCCGACCTTGCCACATGATTTTGTAAATAAAGTTTTATTGGATCACAGCCACATTTTTTTCTTTACATATTGCCTATGACTGCTTTCTTGCTCCTACAGCAGAATTGAGTATTGTGGTTGCCACAGAGCCCATATGGCCCACAAAGCATAAAATATTGACTCCTTTGACCTCTGCAAATAAAAAGTTTACCAACCCCTGATGACTGGCAATCAGATAATTTCCTGGTCCCCCTTCATTTATAATGTCATTGGTGCGCTATGATTAGTGTCACTATTTTATGCAGAAACTTGGCTTTTTCAATAAGGAAAGCAACTCAGGTAGTCAAAAGAAGAGGGCAGTGCCTATCTGCTGAACAGTTGCTTAAGATGGGTTCACAGAAAGATTCATGAGTAAAAAAAAAAAAAAAATACAGATACAAATTCTGGCTCTAATATCTGCTATACTTTTTACTGGGGCCAAGATGATTGTATTAGAATAGTCTGCCTTCTCTTCTTTAGCATAGGAAATTCCATGGCTGGATAAGGTGACAAGCAGAGCAAGTTTTTTTCTCTTGCCTATACTCTGGTCTGCATACAGATTAATCTGTGGAATCTGAGACAATTGGTAAATCTCTCATGAATACCCTTGGATTGTCCAGAACCCCACCTCTCACCTGAGTGAAGAGGTCAGTCCAACACTTGTTGAACCCAAACACTCTATCTTCGGTATCCAATCACCAAAATAGTTTTGGAATATTGATGAAACGTACATGCCCTTCCTTCAAGAAGATTGTATCTAATGGAATGGAGAGGGAAGGGGGGACTCAGGACCTAAACACATGAGTCCCCCAGTCATAGTCATGAATGTGCATATCCATTGCAGCGCTCCAGTACAGTACACACACATGCACCCATGTACCAAGCACCCCAAACAATAAGAAGGTAAGCAAATGAGAGCAAATTGTGAGGTTGCATGATGCTAAGTTGTGTAAGTCCATTTTATAATAAGCAAAGGGAAAAGCACCTTTATAATAAGCAAAAGCAAAAGGAAAAGTTAACATGGGGTACATCATATATGTTAGATTAATAGCATGTGGAGAGGAGTACAGTAAGTTTGCTTGTTTAAAATCAGGCACAAGAGCTGGGGTGCAGCAGAAAGAAAAGGAACTTGGGGGAAAGACAGGAGCATTCAAAACATGGGAGCAAAATTAAAGAAGTGGAGGGAAGGGAAAGTAGGGAATACAGAAAAAAGGGTAGAAAGCCATGGAGTGGGTCAGTGAACTGAAAATACACACTTATGCCCATAACCCATTTTTATTTTGAATATAGGTATAAAAAGCAGTTAACTCTTATGTTTTAAGCCCTCACTTTCCCCTTTTCATTTCTATTTGAAGTTTGGTTGTCATTTGCTCTGGCATATGTGGAATTAAGTGGATGGATTACTTAATTCAAAGAAGTTACTGAAAAGTTCTGGGCGTTTATTTGGTTTGTAATAGTTCCATGGTGCTAATCTGTGTTCTTCCTTCCAAG
Seq C2 exon
GTGGATCGTATGTCTTTCCCATGCGGCTGCACTAAAGAAGGATGTAGTAACACAGCAGGTAGAATTGAATTTAATCCTATCCGTGTTCGGACTCACTTTTTGCACACAATAATGAAACTTGAACTGGAGAAAAACCGAGAGCAGCAAATCCCCACGCTGAATGGCTGCCACAGTGAGATAAGTGCTCACAGTAGTTCTATGGGCCCTGTCGCTCACTCCGTAGAATATTCAATCGCAGACAGTTTTGAGATTGAAACTGAGCCCCAGGCTGCAGTGCTGCACCTGCAGTCGGCTGAAGAATTAGATTGCCAAGGAGAGGAGGAGGAAGAAGAGGAGGATGGGAGCAGCTTTTGCAGCGGAGTCACAGATTCTAGCACGCAAAGCTTGGCACCTAGTGAGTCAGACGAGGAGGAGGAGGAAGAAGAAGAGGAAGAGGAGGAGGAGGATGACGATGATGACAAAGGAGATGGCTTCGTGGAAGGTTTGGGCACCCATGCCGAAGTTGTCCCTCTTCCTTCAGTTCTTTGTTATTCTGATGGCACCGCCGTTCACGAAAGCCATGCAAAGAATGCTTCTTTTTATGCCAACTCTTCAACTCTGTATTACCAAATAGATAGCCACATTCCAGGAACTCCAAATCAGATCTCTGAGAACTATTCTGAAAGAGACACTGTCAAAAATGGTACCCTTTCGCTGGTGCCTTACACCATGACCCCGGAGCAATTCGTTGACTATGCCCGACAAGCAGAAGAGGCCTATGGTGCCTCCCACTACCCAGCTGCCAACCCCTCTGTAATCGTTTGCTGCTCCTCTTCCGAAAATGATAGCGGTGTGCCCTGCAATAGTTTATATCCTGAACACAGGTCCAATCACCCTCAAGTGGAATTTCACTCATACTTGAAAGGCCCCTCCCAAGAAGGGTTTGTCTCTGCATTGAATGGTGACAGTCACATTTCAGAGCATCCTGCTGAAAATTCTTTGAGCCTTGCAGAAAAGAGCATATTGCATGAAGAGTGCATCAAATCACCCGTGGTTGAGACAGTCCCTGTTTAGTAGCTTAAATTATTCTAGGACCAACTCTTCTCTTATTTAAGGCACTGTATTTAATTGGATTTCCTGGGCTCATCATTGTTTAAACTGAAGACCAAGAAAACTTGGACGGTGGTTAATCTTCCAGACTGTATTTTGTTTTTTCCTTTCTAGCCACATGACTGTGGCATTGCACAAATACAGTCTCTGTAGGGATTTTAAAAGATTTCAGACTGTTTTGATAGAAAAAGCTAAATTTTAAAATGCATATCTCACAGTTGCCTACCTGTCAAACTGTGTGAAACCTGCCAATCTGTGTAGATCAGAGCTCCAAATTTTGGATTATCGGGCCTGTGCAAGATTGTTAACTAAGGCTGGGAAATAATAAGATTTAGAGTCCTAATTTTCAATATATCTGAAGATAATGATGACTTTTTAATGTAAAAGTAATTATTGTAAGAAAAAGATTTAATTGTTCCATGTGTATTTTATTTATGGTAGTTTAGAAGACATGTTTTGATGAAAATGAACAGCCGCATGTTCATTCAAGCTGAAGATGCATAGCTAGTTCCACAGAGCATGCCCACATGGATTGCATCTGGAATCCATTCACATTTTTATGATCATGACTGATCAGATTTGCAAATTCTTAAGGGTGAAATAGGCCTATTTTTGCTATTTTGGACAAATAAATGATTCTATATGTGCAGGTCCTTACACAGTTTTCTCTAAAGTTAAGAGTTAGGACAATCCTCTGGGGAGAGTCTAGTTCACTGCCCTCCCTCAGCTGACTCCAGAGATGGAGGTAGAAGGAATTGCCTTTCTTTTTTAAACAGCATCATCTTGATTCTTAGCTTGGACAGCACCTTTAAGCTCTACCCCCTACATCAAAATGCACTTTAGTGCCCCTTCACGGTACCTCGTGTGGGGTGGGGACTGAGAACTCTTTGAGATGAAAAAATTTAAAAAAAAATTAAAAAGATCTTTAACTATTATAAGGTTCATATAATTAATATAGAGGAATCATCCAATGATACTTATGAAGGGAAAATGACCTATTTTCCTTCACCACTCTGAGGACCTAACTCAGTAAATGCAGAGGAGGCTGAGGAAACATGGAAGAGACACGACCTCAGCAACCAGCCTTTTCTCCAGCGTGATCAATCCATCTCTACAAAATCAGTGTATAATGAGATTTCCACTTAGTGACTAGCTGATTGAAGGGGGGCCTCTACCCAAATACTCAACTAGGCCTTTCTTTTCTGAAGCATTTTGATTTGTCTTGCCTGGGACAACTAGCAGAACAGTCCAGAATGCATTGCATACTTTCTAATTACCTCACATTCTCTTATTAAAGAGAACAGATAGAAATAAAACATGCACTCCCCACCTTTAGATTACCTGCACTTGGTTCGTCGGAGGACTTCTAGGATCCCGTTTCCCTGTAAATTAATTTAGGTAACTAAATAGTGTAATTCTGCCTTTTTTTTTCCAATGCAATATGACTATGCTAAACCTGTTTCATATTTTTGACCTTCTATTGTTATATCACTTCACATGTTTTATAACTATTTGAAATGCGGACATGACTTGCTATTCAGTGACTGCATCGCTACTTATTTTTTATGTCTTTTAGACTTGGGTGTTTAGAATTATGGATATAAATATATTGTAGATCTCAATTTCTAAAAAAAATATTTTATTTAATTGAACTTAAAAATGCTTGATCTAGAGAAAGTCCTCCAGTGGAAAAGTTTCTACTAAACTTTGTTTTGGGGAAAAAATGTTTACTTGGCAGCTCTTCCACTGTGCAGTTGGTTTCTGCCCCTTCTCTTCCCCCCTACATTGGGCCAAATTTATAACTCTTAATATTAACATTAAAAGAGCTTTGGGTTTGTCTTTATGTAGGTTGCAGTAATGAGAGCAGGGTTGTTCCTTTTGAATGATTGGCCCTTTGGGCTAATCAGAATGAGGATTTGTTGAAATCTCAAATATACATATATATATATATATATATATATATATATATATACACACACACACACACATACACATATATATACACATATATGTATGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTATATATATATATCCCATGTTGTCTGCAAAGTGACAGTTTTTAGTGCTTAATCTCCAAAATTTTCCCCCTACTGATACAATCTAAAGAGCACAGGCCCAAAGAGAAAATGACAAGAGGCTATTGTTCCTTCATTCAAGCACATGAAAGGATCATGTGTACTGTATTTGCTGGACCATTACAAGCTCTTGAAGGATCTGCTTGTGAAGTACTCTGAGGTTATTCTTGGAACACAGAGTGTGGGAGAGTGGGGAAGAGCCAGCTCCAGCCTGAGCAAAGCTGAAGGGTAGAATGACAGTCCAGTTTCTGAAAAGAGATATTTTAATTTTAGTTCAGCTTTATTTTCCTAAGACGATATGAAGCCTACTTTTTTATTTTTGGCTAGGTCTTTGTTTTCTAGCTTTGTTTCCAAAAGGATGCTTAAGAAAACAGAGTTTTTTTCCCCTATCCATTTATCTAGGGTAGAAAGTCACTGCCCTGTGAGAAGAATTACCCTTCCAATCATGACAGCTTCTATTCCAACTTTTCATATACCTGACTAACCTGTAAACATATCCCACAAACCACATACACAGGCTACCTATTAAAACTCTCCCATATACCTAACACATACACATGCACACACATACAAAATATATACATATCACACACTTAGAGAATGACAGATTTCAGGCAATGGCCAATAGTCAGTATTGAGTTTTTCTAACCCCAGAATCTGGTTGGGCTTTATGATCTAAAAAAATGTGGTTTAGAAAAGAGGATAATTGGTAGAGCTGTAGTTTGAAAATATCAGGTCAAAGTTGCAAACATACTTATGATGGAATCATTTCATTTTTAGTTCCTTTCCCAGAAAAGCTGAGAGAGCACACTGTTCCAGCTGACTTTTTTTTCCATTAATAGCCGTTCTATTCAACAAAGAGCTGCCCACATGCCAGGAAAGTGCTACAGTCCTTCTAAGCTTTTAAAAATGGGGATCAAGCTACATGCAGCCAGTTGGAATACTTAAGATCTTTATGCCAAGACACAATAACCTGACCTGCAGCTGTTGTATTGCCTCCATAGTATATCTAGCCAAACTGTAGTCTTTGACACACAACTTTTTAGTCATTCACTATCAATTGCAAAGCTTCATGCTCCAGCCCTGGCTATTCTAGTACCAGTCCTATACCTTTAAATGGGACTTAATTCCCAGTTATAATCCTGGCCGAATTGATTTGAAAGTCAAGTGGCTGAAGCAGCTTGCATCTCCTTTGTCATTCCCAATTTCCTTTGGGAGAAGTCAATGAAAGAGATTTACTTAAGTTTTTCCTCCTTATCTCTTGATCATTAATTATTAAGACATGGGTAAAATTCATTTGTCTCATGTCTTTTGGTTGATTGAATAATATAGTTACTTTTTGAAAGCCCATCATTTCTTTGTGATAAAACCATTTTCTCAATGTGACAGCCACATGTAAAATGTGAAACTAATGTTTCTTAGTATGTTTAAAATCTTCACAATCATATATGGCCCTGCAATACTCCCTGAATTCCTTCCCTCCAAAAAAAAACTATGAGTTGCAAAAACACTAGTTACGAATTAATCAAGAAGCAAAGAGAGTATGTTAAGTGGCTATGTTCTTTAAAATTTTACATTCTAATAGATGACTTCTAGGCAAAATTTTGGTATGATTACCATTAAACAGGAAAACATACCATGATTTACTTTCTATAACTTGCTAATCACTGTTTCTTTTATTTCAATTTTTGATATTGTTGCACAAGTTTATGACTCTTTGGTCTTTATATTCAAAATTTATTAAGTATCAATTCTTTCTTTCAACAAATATGTACTGAACACATGCTGTGTTAGAACAACTGTCTTGGGTAGTAAAAAGAGGGGAACACTACAAATTATAATGGATAATATTAATGAAGGGTGGCATGAAATAATCAAGCTTTCTCAAATCCTCTTAATATGTGATTTTATCAAGTGACATTAGAAAAACTGACATCAGTTCTTGTCTAATTATATGTGAGCTGCAACTAAAAGATGCTTCCTTTACCTAAATTATAGAACTCACTGGATCGCCCTTCATCTCTCTCCCTCCATCTGAAATGTATGAATTAAATCAGGACTCAGCTAGGACTGAATCAAATGAAAAAGAAATTTTCGATTAATTGCTTCTTCAATGTTAGACCTATATAAGTGATGCTAAATTTACACCAGCAAACTCCTATCAGACAGTTTCAAGGAGGATTTGACTCATGCATAACCCAGGAAACATTTCAGGAAACTTTTAAGACAACAGTGTGGAACACAATCACTCTTACTTCTATTTATAAAAAGCCTATCAAAACAGCAAAATCCTGTTGCAAATTCCAAAGACATCACTTTGCAGCAGGTGGAAAACAGAGAGGTTGTTAGACTCCATCACTTTCAGCTGGAGTTACAAACCATCAAATTAGCAGGTGGAAAATTTATATTCTCAGAAGCCAACAGGAGACTGCCTTTTTAAAAGGTGTCATGAAGCCTTCTATTTCTCCAAACAACTCAATATTTCTCTTTAAAATGGCATCTCTGTTCCTTATTCTCTTGATGACAGTTTGCAGTGCCATTATAGCCAGTGTATTAAATACCAGGCTTTAATGGGAAGCACCTTTGTGCTTTCAAAGGCAAGACTTGTCTGTAATTTTAAATTAGAACTGTTGGTTGTATTCTTACCACAACCAAAACCCAAAGTTTAAAGGCTTGATTACTCTATATTAGGTCTAATATGAATTTTCACCTTCTGATTGCATTACTTTTTCTGAAATCTGCTAACTAGTGCTGGAATAACAAAAATGCCTAAGCCAAAATGCTGTAGCTCTGCACCAACAGCACAGCTCATCAGATGTTTTCTATAGTAGTAAAGAATTTGATTGACTTAATTGAATATCAGCAATTTTAATACCCACTAGAATTATGGAAGTATCAGAGTGGAAGTGAGGACGCAATAAAAGCTTAATAAGTGGTGGTGTCTTCTAGGAATTATGAAAAAAAAAGCTCAGCAGAGCTAAGCCAGATCTTATTACATCATAAAGACTAGAGTTACAAATGGCAGCCCCAAACCTAGAAGGGGCAGTTACAATGTGGACACCCTTTCAGCCCAGTTGGTGCTCACATCTGCTGACCAACATTCATATCAATTACATTTTTACAGTCTGTAAGTCATTTGATGCTTTAGAAAATAAAAACACACACCTACAGCATTCTAAAGAAACTATTTTGTTAAAAAATTTAAACACATTTTATATTAAAATAAGTGATCAATGACTTTCATGATTGTCAAAAGTAAAAAGTGCAGACATTTAAAAAAGCTCTTCTTTCACATTTTACCTACCAAATCTAGATATTCAACGTGAGTCCTTAAAACAGTCACTTCTAAATTTTATTTTGACTCCTTTCTTGGCTTTTTCAAACTGGACCATGAGACCCCCTTCCTAAACAATGCAGTTGTTTTGTTTTATTCTTTTTTTCCAGAAATTCAAGCTGAAACATTTGATATGACCTGTGTTTTACCTGGTGATCAGTTCTCAGGCTAGTCTAAGTCTGTGCTGTCTTGGCATGCCTTGGGTTTCCTATCCTGAGAGTGGTAATGCCAGTAGAATGATGGGAACCAGGAGAGTGAATACGACCAGATTCAAAGCCTAAAACAATATGTTTCAGTTTACTTTTATATGTAGATTTTTTAAATATTCACATCTAGCCTGGAATTTTAGTAAATACAGATACTTGTTGTATCCATGGGAAATGAGGTCATTTCAAAGATGTAAGTCACGTTGGTGACTACTTTCTTTTACTTGTGATAAATATATCACTATACAGGGTAATTGCTTTTATAAATTTGATCCTTTGCATTGGCTTATAATTCAAGAAATGTCAACTTCACTGTGTCACTTTATGTCATCTCTCATAAAAGTTTCTGGCAGGACTAAAGTTTCAAAGGAATGTGATAGAATTTATTTTGGATAACATTTGTATTCAGCATGCTAATGATGTAACTCCTCTCTTTATCATTACCACGGTGATAGTTAAGTTCATTCGTTAACTCATTTTAGTGACATGTGAGGCCATTTAAATATTTTTAAGATAATGTATATTGATTAGAAAGGGTTAGAAGGAGACAAATTTATGGTAGAAATTAGCCTTGCCATTGTCTAAGTTAATTTATGTGACCTGATTGAACAGTTTTAGTTGTAACTTTAGAGTAGCTTCTTTGTTAGAGGATCTCTTTCCTTTCTCTTTTGGTTTTCTCCCAATATTTTTATCTGTCTTGGGATTATCTTAAAAGGTATTTATTAATGAGTATTTGGAAGAAAATTGACCTAGAAAATGTCTCTTTTAAATTTATCTAGGTACTTGTATCACCAGAGACCTTCATCAAGTCCTACTGCCACACTGGATAAGGCCACTACCCCCGACCCTTCTTGTCAGGGACATGGCTTCCTAATAATGGTTTTGCTGTTGTCTCTACATAGGGGACCTATGGAAAAGGAGTTTGAAATTTCTACCTTTGTAGTACATTGTATCCAATTTTGTTTTGCTCCTCCTTTTCATGTGGTCACCAAGCTTTTTTCCTTAGCCATTAAAAAAGCCACCCCTCTTTAAAACAAATTTAAAGATCTATATACATTTTTGCAACTTTATTTAATAAAAAAGAGAAGAAAAAATAAAATCTAAATCTCAATTACCCTAAAGTGGAAAAACCTAAGTATCTAACCTAGGAACTTGTTGCCTGGTGGTGGTTGTTGTTGTTGTTGTTTTTTAATTTATTTAGTGTTGATCCTTGAGTTATTTAATGGTATCCAAATGATATCTGAAAGTGATTGATTTTAAGATGTAATAGTTGGCAAAGTCATTTCATTTGTGTCTCAAACAAATAAAGCCCACTGCCATGGGTTACCATCTGAACCCTGATTCATTAGGCACTAGTCATGCCAAATGGGGATCTCAGAATAGTTTAATCTTTTCAAAGATACTCACAATGGCCAACTGTGTGTGAATACTGGAAAGTTTGAGATTCTTCTATATTCTTCAAATTTATGGTCCTGAGACTAGGAGGGATCTCCAGAGGTCATATGGCTCATCGATCTACCACCAGGGAAGACTGTCACTTAGGCATGCCCAACAGGAGAGATCGCCATCTATTCTTAACATCTCTAGGGAAGGCAGTTTCCTTGGCAACACAATTCAGCTCTCTTAGGTTTTCTCACAATAAGAAAATATCTTGGCCAGTCTTTGAGGGTTAGGCACCTGGCAACAGTTGTGGTGATTTGGGCCATTGTACTAGGGGATTCAAGGGAAGTTGGGTTTCCCCCTACATTTGGTGATTATTACATTAATATATGATCATTCCATAAGTCTCCTAAGAAATCAGATTTTTAAAGAAAGACACGGATTCAGAGACAATGGTCTGTAACATGACCAACTTTTGACAAATATGGCTGTACTAGGTTTTCATTTTTGCTGTTGTTGTTGTTTGTTTTTGTGATTGCTCTTATGTCGGTAGGTAATGTCAGGAAAAGTGACTGTTTCAGATCCCCAGTACAAACATCAGAACTAGGATCAAATGACTTGACTTTTAAGCTGTTCCATTTTCTAAGAAGTTACAATTACAAAAAGTAAGCATTTTCTACATTCTTACTTCTAAGTAATGACCTTCTCATTAATCTTTCCTTGGCTTAAAATGACAAATAAGAATCCAAAGTTTTTCCACTCCTCCTGTGGGAGATAGGAATAGTTGTGAAGAGTCTGATGGAATAAAATGACTCCAGAGATTTACACAGCCACCATTTGATCCCAGCCTTTGTCCTTGTGTTATTTAAACAATGGCTTCCTGCTTTCTCAGGGGTCAGGAAAATGATTTAAAAATTTGTCTTCTTGACAAGGCCTGAAAACGAAGGGAGGTGTCGTGGAGAAATGGTGATTTTTCTGGTTACATCACTTGATTCAAGCACTCCCTGGAGCTTTCAAAGCCTTTTTTATCTGCTCAGAGTTGACACCCAACTCAGAGTCAGAACTCACCAGAAGATGAGGAACACCCCCGAAATCAATGTTTCCTTTCTCCATGGGATTTTTTTCAATCTTGGTACAGCTGCATATCTCCCAAACTCGGATGCTCTTGTGAAATGACAGCCACATCAGTGTGGTTACTCCCCACAAATAACACTAGGGGGAAATGACCTTTTTTATTTAAAAAAAAAAAAAAGGCTAATGCTATAGAATGATCATGTAAAGAATGTTGAATAAAATTTGGCCCATGTTTTAATTGACTCTAGGCACCTCTATTGAAATAAGTCTGAGGCATAGTTTGTGAAACATGTTTCAAAAGTGTTTGATGTATAATAAATGCTAGAAATTTACAGTACAGAAATAGTAAAAAAATAAAATAAAAATAAACCTGTAGATTACAGCTCTGTTCCTAAGAACCTCAGCCTTTATTGTGTCTTAGTAAAGTTGATCTGCTTTATTTTTAGTTTATTGAATTTCTGGTGTACTAGCCTCTTAAGATAGAACTTTTAATACATATGTACTGGTTAATGCCTGTTTACGCAGAAAATGGCACTTTGTTCTTTCAGTGTGTTTCCCTCAGTGTCACAGGGTATATCAATTTGATAGATCATTTGACATTTGTCAAAAATACGTTTCCCATTTTAAAAATATGTATAATTGGTTGCATAGACATATGTCACTTTTTGCAGTGTCTTCATCTTGATCATAGTTTTAGACATCAACTATGTCTCACTTTCCAACTGCCATAGAAATTTGGTACATTTGCAAATTCTGGTGGAATCTAGTGAGCTGAATGTATTGGTAGATCAAATGATCCAAAGGACTTGGGTGTTATCCTT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VastDB Features
Vast-tools module Information
Secondary ID
ENSG00000178662-CSRNP3:NM_001172173:6
Average complexity
IR-S
Mappability confidence:
NA
Protein Impact
ORF disruption upon sequence inclusion
No structure available
Features
Disorder rate (Iupred):
C1=0.078 A=NA C2=0.526
Domain overlap (PFAM):
C1:
NO
A:
NA
C2:
NO
Main Inclusion Isoform:
NA
Other Inclusion Isoforms:
NA
Associated events
Other assemblies
Conservation
Fruitfly
(dm6)
No conservation detected
Primers PCR
Suggestions for RT-PCR validation
F:
No suggested primer sequences
R:
No suggested primer sequences
Band lengths:
Functional annotations
There are 0 annotated functions for this event
GENOMIC CONTEXT[edit]
INCLUSION PATTERN[edit]
SPECIAL DATASETS
- Genotype-Tissue Expression Project (GTEx)
- Autistic and control brains
- Pre-implantation embryo development
Other AS DBs:
FasterDB (Includes CLIP-seq data)
AS-ALPS (AS-induced ALteration of Protein Structure, links to PINs)
APPRIS (Selection of principal isoform)
DEU primates (Only for human)