HsaINT0051476 @ hg38
Intron Retention
Gene
ENSG00000101134 | DOK5
Description
docking protein 5 [Source:HGNC Symbol;Acc:HGNC:16173]
Coordinates
chr20:54554933-54588597:+
Coord C1 exon
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Coord A exon
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Coord C2 exon
chr20:54588483-54588597
Length
33442 bp
Sequences
Splice sites
5' ss Seq
AAGGTAAGA
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Exon sequences
Seq C1 exon
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VastDB Features
Vast-tools module Information
Secondary ID
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Mappability confidence:
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Protein Impact
ORF disruption upon sequence inclusion
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Features
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Main Inclusion Isoform:
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Other Inclusion Isoforms:
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Other Skipping Isoforms:
NA
Associated events
Other assemblies
Conservation
Fruitfly
(dm6)
No conservation detected
Primers PCR
Suggestions for RT-PCR validation
F:
No suggested primer sequences
R:
No suggested primer sequences
Band lengths:
Functional annotations
There are 0 annotated functions for this event
GENOMIC CONTEXT[edit]
INCLUSION PATTERN[edit]
SPECIAL DATASETS
- Autistic and control brains
- Pre-implantation embryo development