HsaINT0084468 @ hg19
Intron Retention
Gene
ENSG00000162989 | KCNJ3
Description
potassium inwardly-rectifying channel, subfamily J, member 3 [Source:HGNC Symbol;Acc:6264]
Coordinates
chr2:155555093-155566331:+
Coord C1 exon
chr2:155555093-155555989
Coord A exon
chr2:155555990-155566114
Coord C2 exon
chr2:155566115-155566331
Length
10125 bp
Sequences
Splice sites
5' ss Seq
AAAGTAAGT
5' ss Score
9.72
3' ss Seq
TTTTCTGTGTGCTTGTCTAGTCT
3' ss Score
7.65
Exon sequences
Seq C1 exon
CTCCGTCCCAGGGGAGAAGGAGAGGCGTCTGCAGGGGGCAGAGACCGCAGCTACCTGCCGGGTGCGCCCCCCACCCAGGAGCGCTCGCTTCGCCCCCTTTCCTCCCCCGCCCCCACCTCCTTATTGGTGCTAGTTTGCAGCGCCCAGCTCCTGCGCCTTCGCTTCGCGTTTGAATCTGGCTCGCCCCTTCGTATTATGTCTGCACTCCGAAGGAAATTTGGGGACGATTATCAGGTAGTGACCACATCGTCCAGCGGCTCGGGCTTGCAGCCCCAGGGGCCAGGCCAGGACCCTCAGCAGCAGCTTGTGCCCAAGAAGAAGCGGCAGCGGTTCGTGGACAAGAACGGCCGGTGCAATGTACAGCACGGCAACCTGGGCAGCGAGACAAGCCGCTACCTCTCGGACCTCTTCACCACGCTGGTGGACCTCAAGTGGCGCTGGAACCTCTTCATCTTCATTCTCACCTACACCGTGGCCTGGCTTTTCATGGCGTCCATGTGGTGGGTGATCGCCTACACTCGGGGCGACCTGAACAAAGCCCACGTCGGTAACTACACGCCTTGCGTGGCCAATGTCTATAACTTCCCTTCTGCCTTCCTCTTCTTCATCGAGACGGAGGCCACCATCGGCTATGGCTACCGATACATCACAGACAAGTGCCCCGAGGGCATCATCCTCTTCCTCTTCCAGTCCATCCTGGGCTCCATCGTGGACGCCTTCCTCATCGGCTGCATGTTCATCAAGATGTCCCAGCCCAAGAAGCGCGCCGAGACCCTCATGTTCAGCGAGCACGCGGTGATCTCCATGAGGGACGGAAAACTCACGCTTATGTTCCGGGTGGGCAACCTGCGCAACAGCCACATGGTCTCCGCGCAGATTCGCTGCAAGCTGCTCAAA
Seq A exon
GTAAGTGCTCCCCGCCCCTTCCCCACCGGGAGACCTGCGTCCCCCAAACCCGCGGAGTAACTCGTCTGAGAACCAGCCCGGGCCCCCTCCCCTGGTTCTACCTATAGCCACAGGTAAACTTCCTTTTGGGGGGTTGGGGGTTGGAGGACTGGGCAAAGAATGCGGTTGACAGTTCTGTTCCTTTTCCACTCACTCTCGTGCTCTTGTTTATATTCGTCATTTCGGATCTGCTTGTATCACTTACTGGACTAGTAACACGTGAGGACTGCTGTTGGCTCCTGGAGCCATGAGGGCAATTAGTGCCCTGTTCGCCTTCCTGTCCCTGTTGCTTCGCTATTCAGAGCGATTTTATTTGTTGTCTACACACTACCCCATTCAATGCGAGGTACTAGAACTCAACTGAACAGCTGTTATTTTGAAGAAATAGGTGCTGAACTTGCCTCAACTTTCACGATGGGCTTTTCTTATTTTTTTCTTTCCTTTTTTTCCCCCTAATAATATTAGGAGGCGGATTACTCCTCTGGACCCAATGACTTTAACTCTATGGTCATCTTTTTAACAAACACACAGATACAAGAAGCAGATAGTAAAGTGGAAGAAACCACACTTGGTTCTTTTAAATTTTTATTTTTACTAAATATTTTCTTGGAGAAGTATTCTTTGAAAGCTTGAGTGCTTTTCCTGTAGAGCCTCTTGTTAATTTTATTCTTAATTGCCTGTTTCTGTGAAGCCTTTGTCAATTACAGATTTCACTTGAAGCTTTCAGCATCCATTAAAGAAGAATTGCTTCCTACCATCAACGGTGTAAATGCTAAAACAAATTGCACATGGAGTGGTTATTAAAGCAAGGTCCGTCTAGTCGTTAGAGGGCACCACCACAAACAAGAGAAGTCCTTCTTAATCACTCATCCAATTAGAGTATGGGAAGGAAGGCTTAAAGCCCAGTTGTTTGTCTCTGTGTGTGATTTACAATTCATTTTTTTCCCTAGAGGGATTTGTCTTAGTAGTTTTCAGATGTCCATAAATTGAAAAAGATGACCTTAAATAAATAGTTCGTACAATGAAAAATATTTATCTGAGGTTGCGTAGAGAACTGAAGCCAGAGTCTGAATTTAGTATTAATAAAATGAAAATCTGATCAATATTTGAGATTTTGCCTTTGAAATTTCAATTTCCAATCCACAAGTATATATTGTTTTACACAGCCCCAACTTAATGTTGTAGTTAAAAGGGATCCAATGTGCTTTTAAAAAGTTTTGCTCTTGTGTCATTTTCATTATTCACTTACAAGATCTTACCATAATTATCCTTGACCAAGTTGCTCAGTAAAGTGTTTAAATTAAAGCAGTTCACTTGTCCTGTCACATCATATCATATGCATATTTACTGTGCTACATACAGTAAATAAACTACATTTTGTACACCACAGTGGAAAATTATCAACCTGGTTCTGATGTAAACGTTCATTAACTATGAATAAATAATTTGGGTAGATCATATTCATATATAATTAATTTCAATGAACTGCATACAATTTTTTAAAATTTAACTTAGTGTATTGTTATTGACCGCTGTTTGAACCAAGCAGTTTGTCAGATCAAGCTGGGCAGTTGTGTTGTAGATATGTTTATTACAATAGTAACTGTATGTGTCTTTAGCTTTGCATAGACCACAATATAGCACCTGCTTCTTTAGGTTAGGCCTACTAGACAGATAGAAATACTTTGTTAGTATAGTGGCAAGGTTTCTGTTCAAGCAATCCATGTTTATGTATCACTTTGAGACTTACTGAAGAGTAGTTTACAATATTAACTGATGTAATGGAAATTGACAATTAGACATTAAAGGTTATTTATAGACATTCTTTAGTTTTTTAAACATTTAAGGTTATTTATTACAGATGTCTTTTCCAGACAACATATTTTTGATGTTTATAGATTTTATTACATTTTATTTCAACAAAGCCAGTCATAATTAGAATTAACCTATATGTTAGTTTTTGTTTATTTTCTTCATACAAAGGTACAATGATTCTGAAGCACTCAGTCTCTACACTGGTGCAGGGTACTGATAATAATTTTTCTGCCTAAGGAAATGTACCACATATACCATAAAGAGTATCCTAGTTAAAAAGATGAAAGATGTATAGTGTCGACAAATTTGGAGCAAGGTGCTATATTAACACAAGGTGATAAAAACATCTAGTTAAAACAATACATATAATATTCTTATAAAGTCTTTTACTTTTGATTTGTTAGGAAGATGTCAGTGCTAGAAGTAAACACGATTTACCTGTGGCATCAATTTATATTTAAACAAAATTATGGTGAAATTCTCCCCATGGCGAAGGGAGAGAGTTGATCTGTGAGTAGCTCTTCAACTAGTCAGTTAGCGTAGCTTGTTCAAAGTTAATCTTTCCTGTAGGCATGGTAATTTAAATGAATTGCTGTAGTTCCTGTTATTCCTTAGACTTCATTAAAAAGGAGTCATGTTTTATTGGGGAAATAATAACATTCAGCAAAATTAGAGGGGAGATTTGCCTTTAATAAGTTGCTCTCATTTTCTCTTAAGAACTGAGATTAAGTGACCTAAAACAGTCAACTGTATTTTTAAATAGAAGCTATACCAAAATCTTGGCATAATAATATGTCCCTATCAGTTTTATACATTATTCTGATTAAATATTACACACAATTTCCCCCTTTTAACCTCCATTTAACAATTTAAATGCAAAATTTATGTGTCTTTAATGCAGAATGTGTAGAATTTTTAAGGCAACAAAATCCAGTATAATATTTAATGCTAGTAACTATAGTGCATGTATTCTTTTCCTACTACCTAATTTAATTTACTAATTTTTCTATTACTGTTTTCTTATTTGCTAAATAAAAGCTTCTTTAGATAAATGTAAAACTTCTATTTAATAATTATAAAGCACTTTTTGATTCTTGGGGAGACAATAAGAACATGGGCATGGCTTTCTAATGCTTTCTGTTATGAAATTTCTCATGTATAATAGTTTTTAAATGCCTAACTTTTGATGGAAGTTTTTTGTAAAACTTATTTGCCTAATTTTTATTATGCTTTTCACTTATTTGAAAGCACATTTTATCTCATCTCTATTCCTGTCTTCCAGCCTTACAAACACTAAAATATCTTTCAGTAGTCAAATATAGATCTTTCAACTTTATGCCTGGAGGGGTCAGTCCTTTTTCTACTCATAAAAAGAGAAAGTAGATTACATAAAAATCAAAGGCTATAGTTTGAAGTTCCTCATTAAAATCTGTGATTGAATTATAAATATAGCTATAGACAGCTCTTTTAAGATGAATATTCTTTCTTCCTCTTCTCCCCATATTGAATTTTTACTTGAATTTTCCATTTATTTTAGTTATCTTCTTTTCTCTTTTTGTTTTACCCAGAAAATAAGGACTAACTAGTATCATGGCTATGCTAAGTTAATATGTCATCCAATCGAAAGTTTTTATAAAAATGCCTGGATTAGGGATTTGAGACCAGTAGTTGTAATGTTGAACCCTATAGTTTAGTGCTGGGTTTAAAGGATTTGGAAGTCTTACTTACCCCTTTCTACCAACCTAATAATAATGGTTGATAGACCTAGGCATACAACTTGTTAGGGCAAGAATTAATTACTATTCTTTGATAACTGTTCGAGAAATTACAAATTTATTATCTCAATGCCATCATATATATGGTTATACTCATCCAGTCAGCACACATTTTTTACATAAAGTAAACATAAAATAAACTATGGTTGCATTCATATTTTGAAACAAAAAGGTAAGGATTAATTTTCTGGAAGCATAATGTTACTTCTTTATAGTTCTATTTATTGCCAATAGGCATCCTCTTTCTTTCCTAAGAGGTCAGCTGTGCAATCCTTAACTTTCACTTGTCAAAAGGTAATAGAGTACATTCCTTTCCTCTTCTAACATCACATATGTTATTTTTGTGCTCACCTTCTTTTATCCTCCATATATATGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTATACATATCCTCCATATATATATCTATATTCCAAATTGGATGTTGTCTTGTTTCTCCATATGACTATTATCAAGTGCAGATGCAATAAAAAAATGGTGGTCTGAAAGACCATATATGTCCTAACATTTTGCTAATCTAACCACAACGATTCCTGAATCACAGGATTCCTGCAGTTTTCTCATATATTTATAGGTTTGCTTTCATTTTATATCTTGCACTGAAATGTGATTATGTTTTTGACTCAGTATGATCTTAATTTTATAACTGACTCTTCACCAATTGACCGTGGCCAATTTGAACTTTATTTTTAATCACGAGACAATTATTTACCTCCCTTTCCAAAAATAAAATCCACAAATGAATGTCTATATTTGTAAAAGCCCTGTTCTGAACATCATCTAAGCCATTAGTAAAAATATTCAAGAGGTCTAAAGCTGAGTACCTCAGAATGCTCAGGAGCTAGGTCCTGTATTGGTTGGTGAGTTCTTCAGGTAGATTCATTTTATCCTTAAAATTAGCACAGTTCCTATTTAGTCTAGTTTTTCTTTCTCTGACACAAGTATACTAATTCTCTAATAAGTATAGAACTTGGCTTCTAAAAATATATAATTATTATTCTTTTTAAAATAGTGGTAATATATTTTGTTTAGTTTTGTTTTTTATTTTTAATATTATTCCTGAAAAGTAAAGGGTGGATTGTGCTCAGGGAATAAAAAGTGAACAGAAATTAGGGGCATAAAGAGCCATAAATAAACAGCAGTAGGTAAGAACAAATGATAAAGCGAAGCAGGAAAAAGCATTTAATAGATTGGAGGGTATTTGGCGAGTAGGAGGAAATGTGCAAGTAGGGTTACGAAGCCTGTCCTCAATTATTATAAATGCCACAAAGGCCCTCAAGGAGTTATAAAGCCGCTCTTTCATTTGAATGGTATGAAAGCCTCACATAATCTATTATAAAATAAATTACATTGCGTTCTGTAAGAAATGTTCTTTTCATAAAATTGAACATATTTTTGTGGGTTAATTGGCTCAGCATTAAAAATCCTTATTTTGGACTTGACATTGGGTCATAGTTTTTCCATCTGAGTATTCATGGAGTTTCAAGCTTAAGGAGTCCAAATAAATGTACAATGTAATTGTAGACAATGCCAATAAAATTCTAGGTCTACATTCCCCTCCACCTGACTACTTAAATTTTGGTCTGGGCACCAAAGCCATTGCCCTAACTGCTTTGGGTCACAAGGTACTTTTGTTCCTGATTCTGGTACCTGCGTTTGGCTCATTTCCCAATGTTAGTTTCCAGATATTACCCTGACCTCATTCCATGTAATTTTTTTTATGACTGCAGCATATATTCAGCATGCACACACACACATAAATGCATATTACACGTGTAAAGAGGATAAGTGAAATTACAGATAAAATGGTGGGGAGGTGGTAAGCAAGAATGGCTTGCTCTCTCCGTCTTAGCCTCCTTTCCTTTCCTTCCCAGACCACTGGCCCTGTGGGCCCTTTTCCAGCAAGGACTTGTGAAAGGTGGTTAGGCATGGATCAAACTTTAGAATATGATAGAGGTAAATCTATAGTGTAGGACAGTAGTGATTTAATGTGCTATTCAGAATTCCTTAAGCCTCACTCCAAGCTAGGAAAGAACGTAGTTACATATTAGAGAGACGGGAGAGAGAGAGGTAGCTAAGATATGGATTGTACTGGATAAATATGTCCTTGACAAATGAATGTGGGCACTTGGCCATATATCCACGAGAAGGAGGGGGGCCAAATGTGGATCCGCTTGTGCCAGGGCAGTGCTAAATGTATATCCTAGGATCATGTATGTATATGTATGTGTGTGTCTGTCTGTCTTTGAATAAGCACTTAACAGTCGCCCTCTGTAATATGAAGACTGTCGGCAAAATACATGACAATGATGATCCCTTCTAGGCACCTGTGACTTTTGATTCTTTTTCCACCTATAGTCAGAATTGTAGTTGATTATCTTATAGGCCTCTTTTGGGGCTCTAAGGAAGTTCAAAGGCCTTTGACTTGAATTGCTTCTTTGAAATTAGTATAAATGACTATAAAATGTGACACAACCCTTAAATTCTACACATAGAGCATTTACATATAAGGAAAATGTGAATAATTGAAATATTATTAAATGACATCTGTATTATAAGTAACTTCAAAATTATTGCCACAACCAAAATTGTACAGAATTATCAAAAAATACCTAATGTTCACGTTATAATTTTTTGGACAGTTAATTTAAACAATTAATTTATTTAAACAAATTTTAAGCTCTAGATTTCTTCAATTTTTATAACTCCCAGAATTTTTTGTAATGCAATCAACAAGATATACTAAAATGGTGGAAAGACCTTTATTTCCTTCCCAAGATTCTATAAAATTGAAAGTAGAAGTTGTATGGAAGTCATTCTCAACCCAAGGATTTTTTCAAATTATCTTCTAAATTTTTAAGAATTAATCATTTTTATTCACTTTCTTTAAACTTCTTTTTTACTTTATTTGTTCCACAATTCTTGTGATTCTAAATAATTTTCTTATAAACTAAAAGTCAAACTTAGTAATCAACTTCTTATAAATTTAAATAATTTACTGCATAAATCTTAACTTTTAGCGATCGCTTTGAATTTGAAAATAATTTCAATTATTGTTGATCTAGACCATATCAATTTATACATTTGTATCTAGAAAACGATCCTGGTTCTATGTTTTCTCGGGAATTAGAAAGTTTATTGAGCTAAAGGAGATAACTGCATCATCAACAAATTGCTCTATCAGTGGAAAGTTTCTTATATCATAATGCTTAACATGACACAATGAAGAAAGGTCAAACTGGTTTTTATCTCAAAATATTCTGCTTATTATCAAATATTTCTGAGTGAAATAGGGTAGTTAATTGCTAAATAATATGAAACTGATGAAATATCAGTGGTGCCAATTTATTATATACTCAAATTACAGAAGAAAATTGATTTTGTAAAGACACATGCATAACTCATCTTTATTTTTCTTTCACTTTCATATACATGTATTTATCACAGTTCCTTGAACAAACATTCAAACTTTCTCTCACTCCTTTTACACAAGTTGAGATTTAAAACTAACTCATAGGCTTTTTTTTTCCTCCTGCAAATCCCCAGAATTGCACCAGAATTAGGACAGCCTAGATTAGAATTATTTAGAAGCCTAAAGTAGAATGTATGTGCTTCTGAAAATGTATTTGGTAAGCATGTATAGGTTTTGAGAGCATCAAAAGCATGTGACTGAACACTGCTAAGATAAGTTCGCTGTAGTCAGAAGCTCAGACTTCAAACAATTGTAGTATTCCAGGCACCTGCCACATTAAAACCACACCCTTCACTTTTGACCTGAGCCAAAGTCTATGGAATTTCAGTGATTAAGAGGCTCCTCACTCTACTACAAAGTCAAAGAAGGAAAAAAAATCAGGGAGGTGAACATATTAATAGTTGAAATATTTGGTGGCCTAATATAAAGGAAGAAGGACCTGGACAATAAAATTGTGAATATGTGTAGCATCTTTGTCATTTAAAGAAAGGTTAAATTATATAGTATCCACTGGATACATACGTAAAGAATTCAATACATATGTAAAGAATTTCACTTATCTGAAAAATATATGAGCATTGAAAGCATGTTTCCCAAAGTGTCGTATAATAGGAAGACCTGGATAGGATATCAAGTATTTGAGGTGGGAGGGTGGGGTAGGGTAATTTTGAGTACAGGTGTAATTTTGAGTGTATAGAGCAAATATTTAAAATCAGAAGGTATATTAAGTCTCAATGGAACAGATATATGCATATTTAAGCCAAAATTACTTATGTCTGAATAAACTACTTTGGTAAAAATAAAGTATTTCTTATTCCAAGTTGTCATCCTCCTGATAGCCTGCCTGTTTCTAGGCCACTTATATCCATGGGTTATTAAATGATTAGGGAATACAAAATTTAATAGCTTACTCTAAAGCCTTTTAGAATGAGGCACAGGTATAAATAACAAATGTATGAAAAAGGAAGACAAATTTTAATATTTGTGTACATATATAATACTTGGGAAAATATATCTTCTTTGGGGAAAATTATTTTAGAATAAATGGGAGATTTAGTTTCTAAAAGAATTATTATTGTCAACAATGCCATGTAGTTCAGGAAAAGCAGAACTTAGAATGGTCAGCAAAAAGACCCAAATTAATTATACACATCAGAATACCACCTTGTGTTTATATAGCACCTGTTTCTTAGTAGGTGAGAGAACAATGACACAAGGTTTTTGTTTTTGTTGCTTTAATTTTGTTTTGTGTCCGGCATTTATTTTGTTGTATTAATCAATACTTGTTATACAACCATGTAGTTGGAAAGATGTTGGTCTCATTTATGTTTTACTAATTTGAGAATAGATTTAGAAATACAGGTCACTCAAGAAAGTTCTTTTGGGAGCTTTTTCATGCTGTCTTGGAAACGCCTAGTTTTCTCCAACATTGGTTGCTAGAGCTGCTGTTTTAATTTTTGCACCATCAGATTTTTCAGTGGGCTCTTTTATTTGTTTGTCAGTAATCATTTTTTTCATAGCCTTCTTTTTTCAGCCACACACAAGTTAGAGAAGAAAAATAGTCTCCCTTTCATTAGGATTTTGTCTACACAAATAATATCCGTGAATATTTCTAACTGCAAAGTAGCCTCTCTAGTTGACTAATTCTCCTGTTGAAACTCTTTGCAACAATTGCTGCCATAATGAAGCACCACCGATTTGGAACCCTTCATTCTGTTTTGCCACAAAGGACATGTTGCTAAGCCACATTTCTCAGTGTTTTCAGACTCACTTACTCCACATAAAAAGCCAATGTATTTTTTTTGGAACTCTGAGAGTAAGAATTTTGTCTTCAAACTATCACTTCATTGGGCAGACCAGTCTTACAGATTGTTTTGTTATTACATTTGTTTTACATGGAATCTGTTAGAATACAATGGATTCATCAGTCCTATTTGACCAGCAGTATGCTCCACCTTCCCCCCATTTTTTTCTGTATTTAATTCCTAACTACCTAGCCCTTATTTTACCCCATAATTACATAAATTAAATGTATATGTTTGCTTGTGCATGATTATTATATGTGACCGATATGGAAAATAAAGATAAAAGGAAATAAGTAATTTTACTCTCATGGTTTGCTAATTTTTAATAGTCATATTAAATTTTCTCATAGAACCCTAGCATGCAAGCAATTTACTTAATTAAGCTTTAGAGTGATTTATACCGAAACTGAATGCCACTACCTTAGAAACCTTTTATTAAACTATGTTTCTCAGGTATAGCTTTTTGAAATTGCATTTTGATTAAAGAAAGTTCAGTTTAGTTCAGTTTTTCACTGTTTTAAAACTCATGAAATGACAGAGAAGCAAATATTTATAATGCAGTTTATTATTAGGAGTTTGAAAACCATTAGCTAACAACATCTGCCATTTATTTTTATTATGTAAGCTCTTGTGTACATAACATAGCTTAATATGGGAACATCTTCACTCTTCTATTCCATTTTATATGTGTTTGTTACTTTTCGAAAGTCTGAAAAATAAATTGTTGTGTTTTGCTTTTTAGTAATCAGTAAATCTCTTTCAAAATGATGGTCAATCTTTGTCAGCTTTAACACACTCCATAAGAATTGCCTACTTATTTATTTGCTGTGTTGAGAAAAAAAATATCTGGCATGCAATGAGTTATCCTGCAGTGATTGCTGTCAAGCAGCAGCACATGCACACTCAGTTCCACAGTTTGTGCTAACAACCATTGTTGGACCAGGCATTTCTCCAAAGCTCATGAGTTAGGGAATGGTAATTATAGCAAGTTGTGTATTATAAATAATGCATGTATGTTCCGCATGAGCTATGTGGGATTTCGGCCCATTTGCTAGAACATAGTTGCATAATGATTTGTTTGGATTTTGTTGCAGATGATTGATAGTGCAGAATGTTGGCAATGATGTAAATTACTGTTGGGCTGCCTTGAAATTTTCAGTACAAGTGGTGATTTCTTCTCTTTTTCTGTGTGCTTGTCTAG
Seq C2 exon
TCTCGGCAGACACCTGAGGGTGAGTTCCTTCCCCTTGACCAACTTGAACTGGATGTAGGTTTTAGTACAGGGGCAGATCAACTTTTTCTTGTGTCCCCCCTCACAATTTGCCACGTGATCGATGCCAAAAGCCCCTTTTATGACCTATCCCAGCGAAGCATGCAAACTGAACAGTTCGAGATTGTCGTCATCCTAGAAGGCATTGTGGAAACAACTG
VastDB Features
Vast-tools module Information
Secondary ID
ENSG00000162989-KCNJ3:NM_002239:1
Average complexity
IR-C
Mappability confidence:
NA
Protein Impact
ORF disruption upon sequence inclusion (1st CDS intron)
No structure available
Features
Disorder rate (Iupred):
C1=0.103 A=NA C2=0.000
Domain overlap (PFAM):
C1:
PF0100715=IRK=PU(55.2=79.9),PF117553=DUF3311=WD(100=15.0)
A:
NA
C2:
PF0100715=IRK=FE(21.2=100)
Main Inclusion Isoform:
NA
Other Inclusion Isoforms:
NA
Other Skipping Isoforms:
NA
Associated events
Other assemblies
Conservation
Fruitfly
(dm6)
No conservation detected
Primers PCR
Suggestions for RT-PCR validation
F:
No suggested primer sequences
R:
No suggested primer sequences
Band lengths:
Functional annotations
There are 0 annotated functions for this event
GENOMIC CONTEXT[edit]
INCLUSION PATTERN[edit]
SPECIAL DATASETS
- Genotype-Tissue Expression Project (GTEx)
- Autistic and control brains
- Pre-implantation embryo development
Other AS DBs:
FasterDB (Includes CLIP-seq data)
AS-ALPS (AS-induced ALteration of Protein Structure, links to PINs)
APPRIS (Selection of principal isoform)
DEU primates (Only for human)