Special

HsaINT0086708 @ hg38

Intron Retention

Gene
ENSG00000164659 | KIAA1324L
Description
KIAA1324 like [Source:HGNC Symbol;Acc:HGNC:21945]
Coordinates
chr7:86897506-86907771:-
Coord C1 exon
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Coord A exon
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Coord C2 exon
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Length
10037 bp
Sequences
Splice sites
5' ss Seq
CAGGTATCC
5' ss Score
7.91
3' ss Seq
GGTTTTGTTTATGATTTTAGCAA
3' ss Score
4.31
Exon sequences
Seq C1 exon
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Seq A exon
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GCCACTTATGTGTTTTTGGTTTTGTTTATGATTTTAG
Seq C2 exon
CAAGTGCCCAGCAGGTACCTGTGATGGGTGTACGTTCTATTTCCTGTGGGAGAGTGCTGAAGCTTGCCCTCTGTGTACGGAGCATGACTTCCATGAGATTGAGGGAGCCTGCAAGAGAGGATTTCAG
VastDB Features
Vast-tools module Information
Secondary ID
ENSG00000164659:ENST00000450689:18
Average complexity
IR
Mappability confidence:
NA
Protein Impact

ORF disruption upon sequence inclusion

No structure available
Features
Disorder rate (Iupred):
  C1=0.000 A=NA C2=0.000
Domain overlap (PFAM):

C1:
NO
A:
NA
C2:
NO


Main Inclusion Isoform:
NA


Main Skipping Isoform:


Other Inclusion Isoforms:
NA


Other Skipping Isoforms:
Associated events
Other assemblies
Primers PCR
Suggestions for RT-PCR validation
F:
No suggested primer sequences
R:
No suggested primer sequences
Band lengths:
Functional annotations
There are 0 annotated functions for this event


GENOMIC CONTEXT[edit]

INCLUSION PATTERN[edit]


SPECIAL DATASETS

  • Autistic and control brains
  • Pre-implantation embryo development