HsaINT0108801 @ hg38
Intron Retention
Gene
ENSG00000167306 | MYO5B
Description
myosin VB [Source:HGNC Symbol;Acc:HGNC:7603]
Coordinates
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Coord C1 exon
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Length
17338 bp
Sequences
Splice sites
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Seq C2 exon
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VastDB Features
Vast-tools module Information
Secondary ID
ENSG00000167306:ENST00000285039:17
Average complexity
IR
Mappability confidence:
NA
Protein Impact
ORF disruption upon sequence inclusion
No structure available
Features
Disorder rate (Iupred):
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Domain overlap (PFAM):
C1:
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A:
NA
C2:
PF0006316=Myosin_head=FE(5.4=100)
Main Inclusion Isoform:
NA
Other Inclusion Isoforms:
NA
Other Skipping Isoforms:
NA
Associated events
Other assemblies
Conservation
Chicken
(galGal3)
No conservation detected
Fruitfly
(dm6)
No conservation detected
Primers PCR
Suggestions for RT-PCR validation
F:
No suggested primer sequences
R:
No suggested primer sequences
Band lengths:
Functional annotations
There are 0 annotated functions for this event
GENOMIC CONTEXT[edit]
INCLUSION PATTERN[edit]
SPECIAL DATASETS
- Autistic and control brains
- Pre-implantation embryo development