HsaINT0177906 @ hg19
Intron Retention
Gene
ENSG00000156687 | UNC5D
Description
unc-5 homolog D (C. elegans) [Source:HGNC Symbol;Acc:18634]
Coordinates
chr8:35631817-35652181:+
Coord C1 exon
chr8:35631817-35631995
Coord A exon
chr8:35631996-35647876
Coord C2 exon
chr8:35647877-35652181
Length
15881 bp
Sequences
Splice sites
5' ss Seq
CAGGTAATT
5' ss Score
8.55
3' ss Seq
GTTTAACTCTCTCCATCTAGGAA
3' ss Score
9.9
Exon sequences
Seq C1 exon
AGTGAACGAGAAACCATCACTTTCTTCGCACAAGAGGACAGCACTTTCCCTGCACAGACTGGCCCCAAAGCCTTCAAAATTCCCTACTCCATCAGACAGCGGATTTGTGCTACATTTGATACCCCCAATGCCAAAGGCAAGGACTGGCAGATGTTAGCACAGAAAAACAGCATCAACAG
Seq A exon
GTAATTGGGGACAGCTTCTGGAAGACGATGTTACTAAGAGAACTTGGAAACATAAAGTGGGCTAAGTGAAACCATGTAGTTTCTGAGCCCTAATATTTTTATGAGTTCCTCTGGCCATATTTCCTGTGTGTTCCCACTAAGTAAGTGGGGAAAGAGCAAGAAAATAACAGTAGGCCAAGCGTGGTGGCTCACGCCTGAAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGCAGGCAAATGGCTTGAGCCTAGAAGTTTGAGACCAGCCTGGGCAACATGGTGAGACCCCATCTCCACAAAAAATAATTAGCTGGGCATGGTGGTGCACGCCTGTAATCCCAGCTGCCTGGGAGGCTGATGTGAGAAGATCACTTGAGCCTGGCAGGTCAAGGCTGCAGTGAGCCAAGATTGCACCACTGCACTCCAGCATGGGCAACAGAGTAAGACCCTCCTCCAAAAAAAAAAAAAAAGACACTCTGTGTGACATTTCCTGCTACCCCATTCTGCCTTTTGCAACATTATAGAAAATCCCTACTTTGGTTCTGGTACCATCTCTAGGTTTGCTAATTGGGTCACCCAAATGGGCGATTAGACTATGTTATCTTGGAGACTGTGAGTGAACAGAGCACTTTCTTAAGCCAGTGATGCAGAAACAAGCAAATTTCTCACGTCTCCCCTCTACTATCGGGTAACCCTAAGCATTCTTTAACCCTTAATGAGGACATGCTCAACCTACAAAATTGATTGCCTGAATAGGAAAAAAAGAAGTTTGAAGATAACTTTTGGGTCTGAAACCAGAGGATGTGAAATAAGCAAAAGCTTGCCTAGGAACTGTGAATGAACATGCTGCTAAAACTGACACTGCTCATTACTGCACTAACATTTGTAGTTGAGAGTAGAATAGAGAGATCCATAATGGACTTTATTACTTTAGGTAAGACAGGCAGGGGTGATGCTCTTCAGGGCAACACTGATGGCCAGGCAGGTTTGGGCTCAGCTTGAGGGATACACAGCATCCCTGCCCTGAAAAATGACATCTCCTCTCCCTGTAAGCCCTCTGCATGCCCCCAGAATGAATAGAAAAGAGAATATATTTTGCCAGAACCATTTTATTTCTCTTTCCTTTGGTACTATTTTTTTTTTTCTTTCAGGCAAAACCTTATTTTCTTACTGTTTGGCTTGCTCTGTCATTTTCATTTTTTGTTCTTTATTTTCACAGACATCCTACCTGACTCTTTCTTCTCTGAAAGGGAGGGTAGATGTCTGCCAAGAAGGGATGGAGTGCTGCTCTCAGTTGCAAAAGGGATCCAGAAGCCAAGAACGAAGGGCTCAACTAGAAATCAGTCAGGCTCAGAGAGGAAAGTCAAGACGGAGGCATTGCTGCAAGAGAAAACTGAATTTACAGAGACAGGCAAGCCCGAAAAGAATAGACATATGTTTGAAAAGGCATATATTGAAAATGAAAGAAACAAAAATGTATGAGTGTACAGGGGAAAAAAATTAGATTGAATATTTCCCAGCAACTCTGACAAAAGATGAGATGTCTTGTCTATGATCAGTGAACACCATGACTGTGTCAATTTCCCTTTCTGATCAACATGGATCCAAAAATGAAAAATGAACCCAGAAAATATAACACGGTTAAAAAAGAACAGTGAACAGGGACTCAGAAGATCTGCATGAGAGCCTTGGTTCTGCTACCAATACCAGTCTGCCTAAATGAGTCACTTACTATCCCTGTGTTTCTTTTTCTAGAAATGCAATTGAATCTAAACTATATTAAGTCTAATTCATGCTGGCTATAAAAGTTTATGATTTTTTAAGTCACCATTTAGAAAAAAATAATTGTCACAAAATACCTGTGTGCCCATAGATGCTGTAATTAATTTGCTGAATAAGCATGTACATGTTCCTACCTTATTACATTTTATTCTCCATTTATAGTACACATAAGAGAACTACAGGGAGTACCTCCAAAGTCATCAGTTTCTGACCTTGCACGGTAGGGAAAATGCATTTCAAACTGGGAGACTTAAGTTTAACAACCTTTTGTATCTGAGCACTAATGAGCAGTCAGTGGCTACCCTGGAGCCAACTGCCCCCTTCTGTGTCTGGGGCCATAAAACCTGAGTGCTCATGTGGCTGATGGTTTACTTGTTTTTGTTTTTCTTTAAGATCCCATCTCCAGGAAAATTTTTTTGACATAATTCATATAACCTATTTCATAGAAAATTTCTAACAGAGAACCCAGAATATGTAGATTCTTAATAAATGCTAGTTTTCCCCCTTGACATTTTCACAATCCATGGCAAATCACAATAGCACAAATATATGGAATCTACTTCTATCCTTAAATCTTATATAGCCCGGCTCACATCTGTAATCCAAGCACTGTAGGAGGCCAAGGTGGAAGTGTCACTTGAGGCCACAAGTTCGAGGCCACAAGTTCAAGACCGGCCTGCACTTAGGGAGAACCCTGTATCTACAAAGAATTAACAAATTAGCCGGGTGCGGTGGCTCATGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCAAGGTGGGCGGATCACGAGGTCAGGAGTTCGAGACCAGCCTGACCAACATGGTGAAACCCTGTCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGCTGGGCATGGTGGCAGGCACCTGTAATCCCATCTACTCTGGAGGCTGAGGCAGGAGAATTGCTTGAACCCAGGAGGCAGAGGTTGCAGTGAGCCGAGATCGCATCACTGCGCTCCAGCCTGGGCAACAGAGCGAGACTCTGTCTCAACAAATTAGCCAGGCATGGTGGTGTATGCCTCTTGCCCCAGCTATTTGGAAGGCTGAGGCAGGAGGATTGCTTGAGCCCAGGAGTTTGAGGCTGCAGTGAGCTATGATTGTGCCACTGCACTCCAGCCTAGGTGACAGAGCAAGACCCTGATTCAAAACAATAATACTAAATAAATGAAAAACCTCATACAGTTAACATATCAATTTCACTGAGTGTCATTCCCTACCTTTCTCTTTAATCTCTAGCTTTACTCTCAAAAAATAGTGAAATCATGGAGTGAAAATGATTTAAACTAAGAGCCAGCAAACTTATTTTTTCTGTAAAGGACCAGACAGGAAAGAGTTTAGGCCATATGGGATCTGTCACAACTACTCGGCAACATTCAACTCTGATGCTGTAACAGGAAAGCAGCCAGAGAGAGTCTGTAAACAAATAGATATGACTGTGTGCCAGTATGCTATATTCACAAAAATAGACAACGACCCCTATTTGGATTATAGTCTGCAGTTTGCTGACCCCTGATTTAAGTGAATTTGCCTTGATTTAGTAAAACTTCCATAGGATGTTATTGGCTCTATCTTAAAGTGAAGGAAGAAGGGAGGAAAAGAAAGAGGGAAGAAGATGAGTACAAGATGCAGAGAACCAGCTTCACAGGCAGACCACTAAGTGTGGTTACCTGGTGACCACGGGCTCTAGGTATTTTCATTCTTGTGTTTGGGGATTTACTATGATCACACTAAACTAAGCTGTCTTTGTTCTGCAGGTTAGAAAACACATTCTAACCTTCAAATAATGGGTGTGAGGCTGCCATTTCCAAAATATCAGCCTTCATGTCCTGTTTTAAGTAGTACTGAAAAAGCTGACAATGTCGGTATGTCTGAATAAGGATGTTTTTATAATTTTAGAAAGTAAAATGAAATATTTTAACAGGGCCTTCTCATTCAGTTCTGTCTTCAGGCTGGTGTGGTTACAGCAGAGCTGGCCACCAAAATACTTGGAGAAGAAGAATAGAAGAAAACTACTCACAGTCACCTTGCACTCTCTTAGCTAATTATATTTTGCAGAAATTGTCAAGTTCCCTTTCTGTTTTTAGTACTGTCCCGAAGACAACAGGGATTTTTTGGATGTAATCTGTCACAACTTCCCATTGTAAAAGCCCCAAACCATTGTCTTTTCTCTCTTATGAGTCCAAATAATGTAGTCTAGAACTAATAGTAAATGTTTTAATACACAGAAATCTAAAATTGTCTCTATGCCAACATTATTGAGTAAGAAAGCTATGCATGGCTGAGGATTTCATCAACCCTGGGATCACAAAAAGGTGATCACAGAGTGCATAGTCATTCTATTCAGGCAGTTCACCTACCTTAATCTTGTGACTGCACTTTCGCCTGACTCTTCCCCTCCATTCAATTCCAAAAAGCGTTTAAAAGCTAGTAAAACTACTGTCCTCAAATCATTAAGGAAAACTTTCAAAACAAGTGGAAGAAAACATTTGCTTTTACTTTATTGCCAGTGAAAATGTTTTCTTACTCTCCTTTTGGTAAATGCAAATGTCACTGATGATAATATGCCTTTTTGCCAATCAAGTTTCTACTTAGATCTGAATAGGAAGGAAAAGACAGGGAATGTAAAGTTAAAAGCTTAGCAGTCGATGAGAATGCGAGAAATGTCAGGAGTGTGTGCTGTACGGCTGGCAACACAGGTGGCCTTGCCGCTTGCCTGGCATATGGATCACGCTAAATAAGCTACACAGCCTAGCAAAGAATGTCATAGATAACAGTTGTAGTTATAGATTCTGTGAGCAAACTTTGACTATTACTCAGAGTTCATACTTGCTGCATTTCAAAGCTGAGATTGCACATTTATTCTGAAAATTCAGCTGTAATAACTCCATTTCAATGCTCTTGGCCACCTGTGATTGGTAGCTGGGTAGAACTGCGAAATAACGAATTGGTCATGTAGCGGGTAGGTGGTGGGGAGCAATGCAGAGGACTTAACAAATTAAATGTTGGAAACTAACTGCTTTACATAGAAGTGTTCCCCCATATCTAAACTTCCATAGTGCTTTGTATTTTTTATGATACTTTTTATTTTTAAATTACAATTAAACATACTGAGAGAGGACTATCTACTTGGGGGTTATTCAATAAATATTTCTCTAATGAACGATATGAACTCTTTCACAGGAGAGTGGCTTTTTTGTTTGCTTGTTTGTTTTGCGATGGAGTCTTTCTCTGTTGCCCACACTGGAGTGCAGTGGCACAATCTCGGCTTACTGCAACCTCCACTTCCTGAGTTCAAGTGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCAGAGTAGCTGGGATTACAAGCATGAAACACCATGCCTGGCTAACTTGTATTTTTGCAGAGATGGGGTTTCACCATGTGGGCCAGGCTGGTCTCAAACTCCTGGCCTCAAGTAATCCGCCTGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGAGATTACAGGCGTGTGCCACCATGCCTAGCCAGGAGAGTGTTCTTGACCCTAAAAACCTGCCTCTTAATAAATAGAATTGATATGAACAAGCATCAGGGGATCTTGAAAATGAGTCTTAAAACAGGCTACATGGCTGATATTTTGGAAGATTCCTGTCTTTTCCCTCAGATCTTAACAGTACCTGAAATTCTATTAGATCATTCTTCTGTGATGCCTCCTAATTTTCATATTCCAGAAACCCTTGTGAAAACACAGCCAGCTTGACCAAGTTGCTATGGGAACAGATTCATGAGATGGGAAGAGATCCATGAGATATGGGCAGATGAGTAGAGGGGAGGCCGCCACAATGGAAGAAAGGATTCCAAAATGGAAAGCAGCAGATAAATGATGTCTTATTAACAGTTTTTCCCAGTGCCCTCCTCAATAGTATATTTGTTTGAACATGTATAAGCACTTGCCAGGGAAAACATATTTCTTATTGGTCTGCTAGTTAAAATGTTTCAAACACACTTCAGATTTGAGAGTTAATGGGTTATGGTGTAAAAACCGTATACGTGAAATTCCTCATATCTCATGCCTGACATGCTGTGCTATAATTTGTTTCCCATGAAATCTTTTAACAGGGCCTTTAATGAGAAACAGAATCTTCTCGCATTGAGGTGCTATCTTTTCATTTCCTCTGTCCATCCTATTAATTGGATGCAAAGGAACAGTGAGATGGCCAGAGGGCCGAGGAAAAGGATGGAGGAAGGCCCCAAGGCAGCTTAGCAATCTGTTTCTGAATAACTGTTGCGAAATCACTTGAGGTAGGAGAGTCCTAGAGCCATGTTCCTTTAAAGTGAAGGAAGAAGGGAGGGGAAAAAAAAGAGGGAAGATGATGAGTACAAGATGCAGACAGAGCACCAGCTTCACAGGCAGACCACTAAGTGTGGTTACTTGGTGACTGTGGGCTCTAGGTATTTTCATTCTTGTGTTTGGGGATTTACTATGATCACACTAAACTAAGCTTTCTTGGTTCTGCAAGTTAGAAAACACATTCTAACCTTCAAATAATGGGTGTGAGGCTGCCATTTCCAAAAAATCAGCCTTCGTGTCCTGTTTTAAGTAGTACTGAGAAAGCTGACAATGTCATTATATCTGAATAAGGATGTTTTTATAATTTGAGAAAGTAAAATCCTAGGAATGATTTATCTAATTTATGAGAGAATATTTTAAGTGATTAACTATTTCCTTTTATTTACGTGTCAAGTTTTATTACCTGGTTCTAGAAACCAGATGACTCTTCTAAGAAGAATGATTGGATAGGGAGATAGTATTATACATCGGTCCTTGTAGTCAAAAATACAATGAAGCCCATATCAGGTTTTTTTGGTTCTGGTCCAGTGTGGATTTATACAGGGTCCAAAATTTAAAAAGCCCTTGCAGTGAAGCCAGAGGGACCCAACACAGCAAAGTGGTAGAGGTTTGGGCTTCATTTTGTCAAAGCCAGTGATTCATGAAACTGCCCGCTAATATGAAGCTGAACATAGACAGCTCTGGGACACGTTTAGCCATGAACAAGCTGTATATGGTTTGTAAGTGGCAGGTGCCCATCCTAAAGGCAATATGGAAAATAAGCTTTTTATGTTCCTCCAAGAGAACTAAAGTTATGCTCCCACTGTGGGCTCCAGGGGATGCTGACAAGGGGTGTCGCATTTCTTCTAGGCAGTGGGTGTGTGTGTGCTAGGTTTTGAAGGAATAGATTTCCTTCCTATAAACTAACGTTTTCAGAAAAGACAGGCATGCCAAAACCCGTTTATAGCCTAAATAGTCCCCTTCACAAGTGCTGTTTCAAATAGTACTGAAAAAAGTTAACAATGTCAGTACATCTGAATAAGGATGTTTACATAATTTGAGACTGTAAAATCCTAGGAATGATTGTATCTAATTTATTAGTGTCCTTCAAGTGATTAACTATTTCTTTTCAATTATTTGTGAAGTTTTATCGTCTTTTCATTTCCCAAATTGAGAAACTGTCATAGGCTTATCCTGTCAGGAATGAAACTGGAGAATTGAAAACAGGGACTATAACCGACTTTGTTCTCATTTGGCAACAGACAGTCCTCAAGGATCCAGGGCTCTCATACATTTCCAAAAAAAGAATTCTTGCTTTTTTCCAAGAACCAGATAATGAAATAGGTAAAAGGATAATGATGAGGGAAATTTTATTGCCAAATTAATTGGCCTGAAATAATTAATGCACCACTTTTAGAACAAGGCAGACTGGAACTCAGCATGTTTTCAGGTGCCCATGTCCTTCCCTTTCGGGTTTTCCATGCCAGCTTCCTCTCACTGGAAGATACTGGGGGACAGCAGGAACTATATAGTGCTCATCTCTTGCTTAGTCTTTAAAAATGCAGCACTGGCTTACTTTATCCTGTAGGCTGCTTTGCTGTTTGTTGACTACCCAGTGAAATTCAAGTTTGGGGATGAAAGCTTGATGAATGGGTCAAATGCTTATGGTGTGTTCAATTACTGCTCTTGAGGATAAATGGCTTTTCTCTTCTATTTGCATTTAAAGAAGCATATGGAGGGTTGGTTTTGGTCACATAAGAGGCCTTCATTAAATTAGACAATTAAAATGATAGCAGAGATATTAATATTTTTCCATTATGACTATGTTTCAATTCCCTATCTGGTGCTATATAGTAGGATTATACACTGTAATGATGTTTTCCAGTTTATTATAGGCAGCTTAACTTTGTTTTTACTTTTTGTACTGACAAACTACTCAAAAATTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGACGGAGTCTCACCCTGTCACCCAGGCTGGAGTGCAATGGCACCATCTAGGCTCACTGCAACCTCCACCTCCTGGGTTCAAGCAATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGATTACAGGCGCCTGCCACCACAGCTGACTAATTCTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGATTTCACCATGTTGGCCAGGCTAGTCTTGAACTCCTGACCTCATGATCCACCCTCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAAGCGTGAGCCACCGCACCTGGCCCAGAAGATCTTTTAAAAATACTCTTTTTAGTAGCTAAATTAAAAACAGTGGCCAGGCATGGTAGCTCACATCTATAGTCCTGGCACTTTAAGAGGCCAAGATGGGACAATCACTTGATCTCAGGGAACTCAAGGTGAGCCCTGGCAACATTGTGAGACCCCATATCTACCAAAAATAATTTTTTAAAAAAATTAGCCGGGCATGGTGATGCTCACCTGTGGTCCTAGCTACTTGAGCGGCTGAGATGGGAGGATCACTTGAGCCTGAGAGGTCAAAGCTGCAGTGAGCTATGATCGCACCACTGCACTCCAGCCTGGGTGACAGAGTGAGACCCTATCTTGGAGAAAGAAAAAAAAAAAAGAGTCATATGTAAGTAATGTAAGTAGCAACATTTTTTAAACAGTTAAACTTGCTGCCCTCACGTCACAGGTACAAGTGTTCCCTTCTATTTGAAAGTGTTGGGCAAAAGCCGAAATTCTGAAATTATTGCATGAACCTGGGTTGAAGTGACTTCTTTGCTAAGAATATGGGGCCGCAACTCAAATGCAATCCCCTAGTATATTTTTATATGAAATTTATTCTCACAAGCAGTCACGGGAAGAGCTTACAGCTTGCAAATAGGTAGACTGTCCTCCTGGTACCATGGTTCTGAGTAACTGAAATAAAAGCTTTGTTATCTGGAATTTTGAATGAAAGTGAGGCCCTTACAGACTCAGAACGCTGAGCTGGGCGGACTCCAGCTGGAAGTGCAAGGTGCCCTTGGTAGCTCTTCAGTGTACCTCCCCAGGGCTAAGACAGAGCCTGAGCCCTGTGCCTTCCTTTCCATTGCTGTTATCTAATCTCTTTGTTAACTGATGGAGGATTTAGATGTGCTAGTCCCTAAAATATTTGCATTTGAATACTCAGGGATTTGGGAAGATCTGAAAGCTTTCACAGTCCTAAAGAAAGGGTGGTATCTCTAGCCACTTTTCCTTTTCATAAAATTAGCCCTGTGTTGCAATAATTTATAAAGACCTATAAGGCAGAATTCTATCATGGTTCCTCAATTCTCTACCCCACCTTTATACCTCCAAAAAAGAAAACAGAAGGCTCAATAACTATTTCCAAAAATCCTCAAATCTAAAGTTTTATTATTTTAACAAGGTTATTAGTTTAAAGATGTATTCTGAAAATTAAGATTCTATAAAAAAATTTGCTTTTTAACTCATATACACCATTGTAAGTTGGCCTATGTCTAGCATAGGCCAACTGAAATTGGTAAGGTCAAGATTCAGAAGTTTCCAGTTCTGCCCTGGCTTCTACATAATGCATGGGCTTTTAATTGAAGCCAAGGGATGGTGATAGAGAAGTCTCTGAAAGATAAAATTAATCATGGTAATAAAACAAATCCCCTGGAACTCAGGTGTATAGAAAGCATTTAAGCTCAAGAAAACAAAATTAAATTTAATAAACCATTAGTACTCAATGAACTTACATAGATGAATGTATTCGGCTGTCTTCTCCTAAGCTTTAATCTGCTTGTCCCTGTATTTTACAGTTTATCTGTGCTCACTCAGAGTTCCAAAGGAAAAGATAAAGTTATTGAGTCTATAGGGCTGGGGAAATGAATTGAAGACAAAATAATGCTAAAGTAAATTCCTAAAATTTAGAGATTAGATTGTTTAGGCCAGGCACGACAGCTGAGACTTGTAAACTCAGCACTTTGTGAGGCAAAGGCGGCTGATTACTGGAGGCCAGGAGTTCGAGACCAGCCTGTGCAACATGGCGAAATCCTGTATCTACTAAAAGTACAAAAATTAGCTGGGCATGGTGGCACACACCTGTAATCCCTGCTACTCGGGAGGCTGAAGCATAAGAATTGCTGAAACCTGGGAGGTGGAGGTTGCAGTCAGCCGAGATCATACTACTGCACTCCAGCCTGGGAGACAGAATGAGACTCTGTCTCAAAAATAAAATAATTAATAAAAAATAGAGAGTAGCTCGTTTACATCTGCATATTATATAACATCTTAATGACACTGCAAAAAATAAATCTTAGTTTTCAGAATTACCTCCATTGATCAGAATTTGAAAAGGCTATAACAAAAGGTTCCCTGGAGTCAATGCATAAAAAAGTTAACAATCTGAAGCATCTAAGATGAGGGTAGTAAGCATTCACTTCCTTAAAAATTTGTCAAAGAAAAAAATAGTTTCATTTTCAGGCATCTGTCTGAATATTCAGGATTACTATTTTTGCTAATGTTCTGGTTCCATTAAAAAAAAAAATCAAACACACTCAGGAAATTGCTTAAAATCAACTATTGCTGTGAATTCTGTTTTGTAGTACTGTATTAACAATGTTCCCTGAATGGTGTGTGCATTTACCTGCCGGTGCCCAAATGCACCAGCATTATGATGAAGAGAAATGGGTCACGTAGATTAGGATCCAAATAATTTCACAAGGAGATGAGATGGATACATGGCAAACCAATTTCATAAAATCATAATGCATTTGCACACATGTAAGCAGCAAAATAATTCAACTATCTTTGAGAAGTAACCTATTGCATTGAGATTTTAGGTATATATATATATTGAGATGAAGTCTTGCTCTGTCGCCCAGGTTGGAGTGCAGTGGCGTGATCTTGACTCACTGCAATCCCTGCCTCCTGTGTTCAAGCGATTCTTGTGCTTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGAGTACAGGCACATGCCACCATGCCTAGCTAATTTTTATATTTTTAGAAGAGATGGGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTCTCAGACTCCTGACCTCAGGTGATCTGCCCACCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATAAGCCACCACGCCGAGCCTATATATTATTCTATTGTAAACAGATAAATGTAGTTTAATAGTGTGAGAAACACACTCACCCGTCCAAACCCAAAGAATAGACTCAGAGGCACAAAGAACAGAGAAAGTAAGACTTTTAATAGCAGTCTTGCAAGATCGGGTGTCTGGTAGGCAGGCATACCCAGGGCAGCTACAGCAGGTAATTTATCTCCTAGTACACAAGTCCCTCCTCCAGTTCCTCATTGGCCAAGTACTATGGGAACAATCTTCCTGGACGTCACCTAAGTTTTATTATCCCCCTTATAAGGTTATACCCTCTCATCTTCCCTGCTTAAGTTTTGATTTCGCAATAATGAAACTTTCTTCCCTGTTACTGGCTGACCCCTCCTCTACATTCTGTTCACTTACTGCGACCTTCTAGGTGCATGAGCTGTGTGGTTTGTTACATTTGTAGTACTTACATTTATAATGCCTTGAAAATGGCATTTAAAATGCCATTTAAATGTTTTCTCACAATAGGATGTCTGTTAACTGCAAAGCTGATTCTACTATTTTTAATAAGGCCAATATATTCTTCTATGTATATATTAAAATTAAATGGAATTTGAGATTTATGTTGTGCTGAATGTGCTTGTGCAAATTCAAAGAATAAATTTAAAATTTGCTTTGGGGAGCACATTTCACTTGCTACAATATGCTCAGAGACCTGTGCCAGGAGAGTTAGGTTTCTGCCTCTTTTGATCATTTAGCTTCGTTTAGCCGTGGGTGCCTATTCCACAAATCAGGACATTTGCAGAACTTTTCAGAACCATGTGACTGGCAGGAGTCATTCTCCAGCCCTTCTCTTTCTTGAGGCAGGTGTACTCACCAATATTTTTAATATTGTGTTGAGACAATGATTCATTAGAAGCCTCAAAACCTAGTTTGTATGCCTCTCTAAAGGTTCTGTTATTGCGTTTTTATGCCCTGGTGTTCCTGTCATGTCTTGAAATGTCAAAGATCCCCAAACATTTACCTAGGATAAAGTTCTCAGAGTGCCTGAGGCAGGACATAGAGCTAGAGATTCAGCAACTTTGGCCATCTAGTTGCTTATTTCAAATGCAGGAAGTTCAGCCTGATCTTCTTTCAAATCACTACTAGCTATGGAAACCTACTTTAGGTTACAAGACAGACAGCAGAGGAGCGAGGTCAGCATGGTGGCCTGCAGGCCACATTTGGCCCACCACCTGCTTGTATACAGCCCATGAGCTAAGGATGGTTTTCGCATTTTTAAATGGTCTGAAAAAAAATCAAAAGAGTAATATTGTGCCACATATGAAATCTGTGTGACAATCAATCAAGTATCAGTGTGCCACATAAAGTTTTATTGGGACACAGCCACGCTCATTCACTTAACATATTGTTTCTGTCTGTTTTTGCAATACCAAGGCAGAGTAGAGTAGCAGCAACACGGACCACATGTGGCCCCGAAAACCAAAAACATTGACTATCTGGTCATTTACAGAGAAAGTTTGTCAACCCCTGGTATAGAATAGAGTGTTAACTTTTAAGGTAGTAGGCTCACAAAGATTCTAGTCATTCCCATAGGGCAAAAGTTCATCGTTGTTTGATAGCAAATACAAAATGTAACTATAAATCCTTAATAAGGAGAAAGTACTGCTGCTTTTTTGTTGTAGCTGTTGTTTTTGAAACAACAATAGAGATCATAAAGAATCATTTACCCATGCTAGAAACAAAAGAATGTCCATGGTCATCATTCTCATGATGGACATAAAAGAAGATTGTCACACAGGTGACCCAGAGTCCACTCAGGCCTCGTCTCTCCATTTGCCTCTCTCCCAGCTGTTCCTTCAGTGTGCCTTCTACCTGGGTTTTGGTGACAGTGTTTATAGGAAGATATTGCAACTTTCCCTACAAACATCTCTACATGACAAGGAACAAGTGCCAATATTCAAAACAAAGTTGTTCGGTTTTTTTGTTTGTTTGTCTTTTTTTGAGACAGGGTCTCACTCTGCTGCCCAGCCTGGAATGCAGTGGTACAATCATAGCTCTCTGCAGCTTTGAACTCCTGGGCTTATGTGATCCTCCTACTGGAACCTCCTGAGTAGCTGGGACTACAGGTGTGCACCACTGCACCCTGGCTAATTTATTTTATTTTTGTGGAGACAGAAGTCTTGCTATGTTTTCCAGGCTGGTCTTGAACTCCTGGCCTCAAGTGATCCTCCCGCCTGGGCCACCACACTCAGCCAAAACAAATTTCTTAAATAAGAGGAACTAAGATCCCTTCAACTACTTAAGCAAGATTTGCTTTGCCATTTCTATTAGTATAGCAATGAATAACCATTAAAGAAAAAAGAAAAGGAGGAAGGAAAGAAAAACAAAAAGAAAAACTAGAGAGAATGTTTTTAAGCCGGCCTTTTCTATTTCACAATTAAAGATGTCTATTAGTGGAACATACTTGTAGTGCTGTTTGGCAACCAACTGACTGTAAACAGGATCTTAAGACCTTTGAATAAAACAGCACTTTATTCACTCAGAATTGCTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGCGTGCATGCATCTGTGGCTCTTATAAATGGCAACGCGTCCTTAAAAGCTTGTCTGTAGTCTGAATGCTCCACTCTACATCAGTCGTCTTTGTGACCATAAGCTGGGTGTGGTAAGGGAAAGTAATACCATCCTCAAAATAGGAAATACTTGGCTGGCTCTGGAAAATCTTTTCAACTCATCAGAATTTTACCAGAGATGACATTTCTATCCTTACTGTAAAAGTCCCTATGAAGAACAGTGACCTGTAATCTTTTGTGTTGTCTTTGTCTTCGTCATAGAAAAGTTACTGTCCTAAAGCTTACCATGCTTTTACTGAAGACAGCATGCCATCTTAAAAAGCACTGTAGGAATCAATTACTTGGCTGAAGAATGTTGAATAAACACCTATCATAGTATTATCATAAGTGCTGTAGCAGTTTCAGAAAATCAGTAGATATGATCCTTACCCTTCAGGTGTTTGTGGTCAAATTGGGAAGGCAGAAAACACACACACGCACACACACACACACACACACGAAATAGATAAGCATCTTATTCACATGAAAGTTAAGTACAAACATAAAAAGAGTTCAGAGAAGACATAAATCATTCTGGGAAAAGAGGAGATGAGAATTGAACCATTGGACACAGCCAAACACCACTGGGATTTCGAACCATTGAGACACACACAAAAAACTGAACCATTTTTTCCCGAGACAAATCTACCCTTGTTCGTTCTTCCTCTTTCTTGCCCCTTGTAGTAGAGAGGTATCAATGAGCATAATTAAACTTGTCTATTTGTGGGTGTGTATGATCTTGATAAAGAGGAGAAAGGGACGAAGTGGACCTTTCTAGTGAACTGAATGGATTAAATTAAAGCAAGAAGCAAAGTGTTACCTAACTCAGGGTCAGTGGCTCAAAGAGCAAAATAAGACTGAGTGGGAGAAAAGACTATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATGAGATAGGGATATCCATATCTAGCTATGGATATTTATATCAATATCCATAGCTAGATCAAGGCCAGACCAAGGAAGTCATTGAAGACAACTAGAGTAGATATTTCATGACTGAGGAACTAGAATGCAGAGTATATTCGAGTTTTGAAAAACTAAAGATTTTGCTGTGATTTAGACCATAAAGTGACAGAGTATAAATTAGGTATAGGTAGTAAACATGGAGAGCAACGGAGAAGCTGATGAGTACGTTAAAAAGAAAAAAAATATAAAAGGAAGAATCAAAAACAAATGGTCTAGTGTGAGAGATTAGAAAGATGGTTATAAATACTGGGATACTTGTTCTAGTTAGAAGAAGGACCAGTTTGGAGGCACGGAGACACCAGTTTCTGATGCATTGCGTTTGTGGAGCTAGAGGCATCTGTAACTGGAACAATCCCAAGGCCATTTAGAGATCTGTAATTAGCTCACATTAACTTAAAGATTGGAGGTATAGATTTACAATACTATCTATGTTGTTTGATAACTACTCCATTTAGCATATAAGCCCACTGAGGAAGGAAAGAACAACAAGAAATCAAAGGTAAAACCTTGAAAGCTCTTATGTTTGCCAAAGTAGAGAGGGGTCAAATATTTTGAAAAAATAGGAATGAGTGAAAGTATGACATAAACTAATGAAATAGAGCATGTCAAGGGGATAGTCAAGAAGAAAACACACACACACACACACACACACACACACACACACAGAGTTCAAGGAAAGTGAGGACCCAAAAGACTTGGGGCCAAACATGGTGTCTCATACTTGTAATCCCAACATTTTGGGAGGCTGAGGCAAGAGGATCACTTAAGCCCAGGAGGTCAAGGCTGCAGTGAGCTGTGACTGTGCCATTGCACTCCAGCCTGGGTGACAGAGCAAGACCCTGTATCTAAAACAAACAAGAAAGACAAAACAAGACTTGGGAGATAAGGTTATTGGTAACATTCCACAGCACAGTTTCAACTGAGTGCTGGGATACAAATTAGACTGCCCCAGACCTGCCTTACTATAGCTTTTTATCCCTACTATAATAACATCTATTAAAATTCATTTTTAATTCTCTTATGGTGATCAGTGTTTATTCCTTTATTTTCATGTTTCGTTTTGTTCTTTGTGTTTAACTCTCTCCATCTAG
Seq C2 exon
GAATTTATCTTATTTCGCTACACAAAGTAGCCCATCTGCTGTCATTTTGAACCTGTGGGAAGCTCGTCATCAGCATGATGGTGATCTTGACTCCCTGGCCTGTGCCCTTGAAGAGATTGGGAGGACACACACGAAACTCTCAAACATTTCAGAATCCCAGCTTGATGAAGCCGACTTCAACTACAGCAGGCAAAATGGACTCTAGTCCACTTCCTCCCATGAGACAGAGTGATGGCCAGCTTGGGGACATTTGCTTTAAATGGGAAAGAGGCCGCTTTCTGCCCAGTGGCGTTGGGGGAATTCAGCCTTCATTTATAATCAGTGAGATTCCCCTGTTGAAGAAACTAAATTTTATATAGGTAAAACATGTTAATAGGGAAGAGTACAAGCTCTCTTACATATAAGAGGGCTCTACTATCTCCTTGGAATCCACATTTGGGTTAACTCCTCAGATTTGGAGTGGCAAGGATAAAAGTGAGGGCAGAAGTAGCTGTGGGAAAAGATGAGCTATGATAATGCTGGGAAGGCAGAGATTGATTAAGTGCATGCTTTGAAATAGGTTTTTAATGATGTGCCCCAAAGGGCCAGCTGATTCTGGTACTAGATTGTCAGAGTTTTCTACCAACTGGCATCTGTGATGTCAGAGATCATTGTAAAAATGGCTTTTAGACGTGAAACAGGGTTGCCAACCCATTTGTATGACTTCAACAACGTCAAGGAGGGCATTTAGAATTTAGAATCTGAGCACATCACACCAGCACCAGCTCCCTGTCTCTTCTAGCCACTTAATGGAGACACAATGGAGAGGTAAGACAGACCACAAACTAGTTCTTATAGTGTACTCCACCTTTTACTTTTTTCCTGAGACAAATCTACCCTTATTCTTTCTTCCTCTTCCTTACCCCTTGCAGTAGGGAGGTATCAAGGAGCATAATTAAACTTGTCAATACGGAAAGTTGTTTTTTCTAACACAACAAAGTGGGACCATCTCTATTCCCATCTAAGCCACTCAAATTGCTGAGTGCTATTAGAACACAGCTTATTACATGGATATGGGGACAGGAGAGATTAAAGCAGGTTCAAAAACACATGAACTGCAGATGCCATAGGCCTCAAATCAGCTGTAATTCTAGGAGACACGTGTTGATCTAGTTATCTAACATTGTTGTTATAAGAAAATGAGTTTACTGCATTTTTCAATCCAGATTCTTGAAATTGTCTAACATGTGGGTACTGTGTCATCACAAAATCTCTCAGTAAGGCTATATGTGATCCTCATTTTGCCTCTTGGGAAATTAGCAGATAGTCTTTGCTCTAAATGATATCTGAGTAAATAGACTTGAGGAATCCTCTACCACAGTGTCCCTGAAACCACATGCATCATTCAGGAAGCCTTCACCCTGTGACTATTCAGCCTCCCTGAATATGCTTTCTCTATAGAACCACTAACATATGGCTATTGCTCTATGATTTTTTTTTTTACATTAGGAGGCAGTGATATTGTGGAAGATTGAAATCCACAGATAATTCATGACCCTCATCTTATCACTTTACTCCATCTTTTTATCCTATTAAATTATTTTTGACAAGATGTCCTGGTAGACTAAAGGTGAACAGATTTGCTCTTGCTCATCTTCTGGTGGATATTTTAACTTGCTATTCACAATCAGGACAACCAAAGTCAAGGACCCAGATGAACCACAAGGCAGCTAGTCAGCTACTTAGAGGTTGGTTACATTCGAATAAAAAGTAGTCAGGGAATGGGGGAGGTGGGGAGTTGGGGAGTACTTGGCAGTTGGGATATGATCCATTTTTTTAAACAAGTTTTTTGTAGATCCCTTGTAAAATAATAATAATAATGTTGTGAATCTCCATGCCAAGTGAAAAAGGCCTAAAGATGAGTTGAATTTGTGATACCATGGGTAAGGCATGGAAGAACTCTTGAATGTGTTGGCCATTTTCTCTAACTAACATGTGGTATGTATGGTCCCCTATATTAGATAGAAGTCTTTGCTACATGTAATTCAAAAGCATCTCGCTTTTCTCAGGAACCAAAGGCTTATGATGTAGGACAAAGAAATCATCTTAGAACTGTCAAGCATATTTTCACAATACCATGTCAAGATCAGGAAAACACCCTTTTGCTAGTGTGCTTAACTTATTTATTTCTTCTAGGAAACAATAGATAAACAGCATGAAAATGTAAATCATCTGGCATCACTGATAGAATTTCTGAAAGAGAAAGAGAAGTAGATGGTCAACCAGTCACTAGTTGGTTGGCATGAGGTGGTGTGCAGAGGAAAGCTGCATTCACTATTGAGTAAAAACTTGTAGAAAGCACATTATAGAGCTTATGTTGGAATCCATCTTGGAGGATTTTTGTTTTAAACTGTCTTTAGCATTTTCCCTCTTCCCTTCTAATGGGCATTATAATTGTTTCATCTACTCTGTGAATCTACATAGGTCTTTTTTTTTAGATGTTTGATACATTTTAAGTATTTTTAAATAGATGAAAATTCTAAATGATTTTCCCTCAAATCTATCTAGATTATTTTAAGATGAGACAAGATTATTGTCAATCCCTGAATGTCTGGAGTTACCTCCCATGGATTTTTTTTTCCTTTGGCCTGGGTTTTATAAACAACTTGAACATCATATCATATAGGATAACAAAGGAGGAAGTTAACTTAATTCACCTCAGACTTCAGCCTAAGATTCAATCAAATTCATCCTTCAGCCTGTCTTGTTTCTTCTTTATGTTTCTTTTACTTATTGCTGCTAGGATCCTACATAGGATTTCTATAGAAATGTATGAAATTCTGTGGTCACTGCATGTCAGGATTGCACAGTATGTTACAATACAATTTCAAAGAGAACCCACATTTGTGAGATTTACAGACCAAGGTGTGGTGGAGGAGGTAGAATTGCAGATCAGATAAAAAGTGAGCTTACACTTGAACTTAGTTATTCACTGTGACCTAAATTTAGTCCTATTGTAATATGTGCCTGTCACAACACAAATACCCCTCTTGAAAGAGATTTACTCATCTATCCAAGCACTTAATTTGGAAATTTTATTGTCCTATTGCAAAATGAAACAAAATTAAAAGTGGCCTCGAGTACTTGGTAAGTTACTTAAAATTTTTACAAAAATATCCCACTCAATGCCAAATCTTTCAGTCCTCAAAGGCATTTAAGTCCAATAGTCATGCTTTAAATATGGCTTTAAATTATGCCACCAAAATGGTGCACTTCACAGATTCACCAGACTGTAGCATCATAAAGTTAATTTACAGTTTTTACAACATTGCTTCTACATTCTTACTGGTTTACATTAAAATCCTTTAAGCCAAAAGGAAGCTTGCTCTATGGATTTAAATGCAAACTTCATTTACCAGTGCAGGAAGTCTCATAAAACTCAGATGTACTCCCACAAAAATTTTATTGGCCTTTTTGTAAGAGATGAAAAAGAATTGACACAGTTCTCTTTAAAGAGAAGAACTTTTTTATTATTATTTTTATCTCCAACTGCAGGTGGTGTCTTTTGCCAAGGTCTCTGTATTTTTCTTTCAGTTGTCTTTGGGAGGGGATGTTAAGTCAAATCACTAAAACAGGGTTCTCTTTGGATTAAAAGTTCTGGATTTATTGCAACTATTTTCCTTGAGAAACATTCTCAGCATCAGGATTGATAAACAAATGTAGATGATTAAAATAGGATAATTGGTTTTAGATAATATCTTCTACTGCCAAACTTCTGGCAAATTTACCTGTGAATTTCAAAATGTTATAAAATCTCTTGATATGCTTTTGTTTTTCCTTTTAGCCATTTTCTCTTCAATTTCTTAGTCCCTCTGCCCTCTGTAAATGTGTTGAGTGATATAGCTATCAGATGTATTGAAGGCAAAGTTCTCGCAGAGGTCTCTGTTCCAGCTCTGTAAAGGTCACAGGAATCGTGAAGGAGCTGAGAAATCTTCCTCTCCGGCCCACTGTCTGTGGCCCATTGTCATTGTTTCCTCATGAAACATTGCAGAGTTTGAATCCTCAGTAACTCTCATTGACTGGATTAGAGGTGATGGCCACAGCAAATGGGAGAGCAAAATGTTGGCCTACAGAGAATGACACAATTTTATTCGCCTTTGGTGTTAGTTGCCATAGTGCTGTATTTGAAAATCGATGCTTTAGCCAAAAGCTGAATGACCACCGTTTCCGTAGTTTCCACTGTTTTGTCTGCATAGAATTTTCCTGAACTACAAGCAAAAATGTATTTTGTCCAATGTCACAAAAGTGAAAATGTTACTAATCTTA
VastDB Features
Vast-tools module Information
Secondary ID
ENSG00000156687-UNC5D:NM_080872:16
Average complexity
IR-S
Mappability confidence:
NA
Protein Impact
Alternative protein isoforms
No structure available
Features
Disorder rate (Iupred):
C1=0.033 A=NA C2=0.029
Domain overlap (PFAM):
C1:
PF0053117=Death=PU(34.6=45.0)
A:
NA
C2:
PF0053117=Death=PD(64.1=72.5)
Main Inclusion Isoform:
NA
Other Inclusion Isoforms:
NA
Other Skipping Isoforms:
Associated events
Other assemblies
Conservation
Fruitfly
(dm6)
No conservation detected
Primers PCR
Suggestions for RT-PCR validation
F:
No suggested primer sequences
R:
No suggested primer sequences
Band lengths:
Functional annotations
There are 0 annotated functions for this event
GENOMIC CONTEXT[edit]
INCLUSION PATTERN[edit]
SPECIAL DATASETS
- Autistic and control brains
Other AS DBs:
FasterDB (Includes CLIP-seq data)
AS-ALPS (AS-induced ALteration of Protein Structure, links to PINs)
APPRIS (Selection of principal isoform)
DEU primates (Only for human)