HsaINT0186198 @ hg38
Intron Retention
Gene
ENSG00000125846 | ZNF133
Description
zinc finger protein 133 [Source:HGNC Symbol;Acc:HGNC:12917]
Coordinates
chr20:18306298-18316996:+
Coord C1 exon
chr20:18306298-18306393
Coord A exon
chr20:18306394-18315071
Coord C2 exon
chr20:18315072-18316996
Length
8678 bp
Sequences
Splice sites
5' ss Seq
CAGGTGAGT
5' ss Score
10.67
3' ss Seq
CACTTTTCTCTCTGCAGCAGATC
3' ss Score
6.85
Exon sequences
Seq C1 exon
GAATTTCATTTTCTAAACCAGAACTCATCACCCAGCTGGAGCAAGGGAAAGAGACCTGGAGAGAGGAAAAAAAATGTTCACCGGCAACCTGTCCAG
Seq A exon
GTGAGTGGGAAAACACTGGACAAATGAGACATGAGCTCAGCAGCTCAGAGGACTGGGGGAGAGGAGGCGTTGCTCAGGTGCTGGGGAGGGAAGCTGTTCCCCTGACCTCCTGGGCTGCTGTTTAGATTGCCTGACACGGCCTCCCTTCCAGATCTCCATCTTCATTCGAGTATGGACGGGGCTTTCCTGGTGTCTCGTCTCCTTCCTCCACTAGGAAGCCTTTTTTCCTCCCAGTGGGTTTCTCCTCTCTAGCTCACTCAGTTCTCTTTCATATATATGGGCTTCTTTCTCTTGTTACTGTTTTTTAAAAAGATCATCAAGAATATGGAAACAACTGTGACCTACAGAAAGAAGGCAAGCCCAGTGGGAGGAAGAAATCTAAAAAGCCAATAGAGAAATTGAAATGGAATTCTAAAAAAAACTGTGAGCTATTCAAGAATGGCTTTTACATTTTATAATGTTATATAAATATCTATATAATATCCTTAATTTTGCCTCTTAACCATCAAAGCCTGAACTATTTACTATCTTTAAGAAAAAGTTTGCTGGCCCATGCTCTAAGGGAGTACAATACATAGCCTTAACTTTTTATATTCTATTAATACTTAATCTGGGTAAAATATAAAATGTAAGAGCATTGCAATTACACAGTTCCAATCACCCCCCCTCCCAACATCCTTTGTACTATAATTGTCATTTGTATTATACACTCCTTATTACAATGTTAAAATGTTTGTTTTAAATGTTCATCTGGATTTGTTTTCTACAATGTATTTTTTTAATTAAGAGAAAAAATAGTCTTTAACTTATCCAGATAATTTATCATTTTCTGTTCTTTTTGTTTGTTTGAAAATCCGAGTTTACCTTTGGTATTATTTTTCTTGAACCTTAAGGACTTCATTTGGCATTTCTTATGGTACAGGTGGCAGTGTATTCTCTATTGCTTCTGAAAGTGTCTTTATTTTACCTTCATTCTTGAAGTGTATCTTCGCTCGATGTAGAATTCTACATTGGTTATTTTTTCAGCACGTTAAAGATAGCATTCCATTGTTCTGCCTGCCATTGTTTCTGATGGAGAAGTCACCATGAACATAATTTAGCTTTATTTCCTTTGGCTACTTTTCTCCATACTTTTGGTATTCAGCAGTTTCACTGTGATGTGACTGCCTTAAGTACATTCTTCCTTTACATGTTTTTATCTGCCTGAATCTCTCTGTCCCCTTTTGGGACTATAGGCACATGTATATTAGTCCTTTTTATATAATCCCACAGGTTATAGATCCTTTCCATATTTTTAAATCTTTTTTTTCTCTCTGTTCTTTAGACTGGATGATTTCTGTTGGTCTGTCTTCAAGTTTACTGTCTCATTTGTCATTTCCAATGTGCTAAGCTCTGGCCAGTGAATCCTTCATTTCACTTATTTTTCAGTTCTGCAATTTCCATTCACTTTTACTACACTTTTCTTTGTGGTGAGATTTCCTATCTGTTCACTAATTATAATTAAATTTTACTTTATCTTCTTTAAATCAGACACTAAGTGGATAACTTATTAAGTGAAAAAGTTATAGGATTTTGTATACTATGCAGTTGAGTTTGTTGTTAAACAAAGAGAAGTGTATGAAAGAGTATATATCCATATGTTTATGTGAACATAGAAGTCTGTTGTTATTTACCATTACTAGTGGTTACCTCTGTGGGGATAGAATTGGGGAGGGTTGGACAAGGGGCTGCTGAGAATTTTTCATCCTACTTTGCATTATTTTTAAATGACAGACACATAGATAACTTTAAGAAATTATATATGTGCTTTAATTTTTAAAATTCTTTTGACAGTTTTATAAATGTTTGCACAGAAGTATATATTTTCTTTTTCTGGGTAAGAAATTTTCTCCTCTTGTTTTTATTAAATTGATTAATTCTGTCTTCAAATTGAGGGACCATAGCATACATAATATAAATTGTCGCTGTTTTTCAACTTGCTTGTATCCTTACTGTTCATCTGTTAGAAGGAATCCTAAAGCTCTCCACAGTCGTAATTTATATCAACTTCTCCATTTATTTCTAAGTTTTTGTGTTATATTTCACTTTATTGTTCTATTAGGTATAGAAAGGTTCAGGATATTTTTATCTTACTCATTAATGAAGTTTTTAATGCTGAAATTCTCTTAGTTCCATGAGCTATTGTTTCCTTTAACTTCCTCTTTATTTCTTTTTAGTCTTAGCACTGTACTTTCTGGTGCATCTTTTTGGTATTTTATTGTTCATCCTTTTATTTTAAAATAAAAACATTGTCATTTGGGTGTTTTGCTTTTAAGCAGCAGCATGTAGCTGGTGTTGCATTTGCTGTCAAACCAAGTGGTGTTAACTTTTAATAGTGACTTTACTTAATAACAGATAAATTTCATGAGACTTGCTCAGGGGTTGACTGAGGCAGATGAGTAGGTGTTTTACTACAGCAATAGGAAAGAAGGAAGGTCAGGGCAAAGGAAGTAAAGCATCTGTATTAGTCACCTTGGGCCGCCATGACAAAATACTGTGGACTAGCTGGCTTAAACAACAGAAATTCATTTAGTTATAGTTCTGGAAGCCAGAAGTTCAAGATCAAGTTGTCAGCAGGTTTGGTTGCTCTGAGTCCTCACTCCTGAACTTACAGATGGCCACCTTCCCCCTGTGTCTTCACATGGCCCTTTCTCAATGCTCACACATCTTTGTCGTCTCTTCCTCTTCTTAAAAGGACACCAGCCCCATTGGATTAGGGCCCACCCTTACGACCTTATTTAACCTTAATTACCTCTTTAAAGGCCCTGTCTCCAAATACAGTCACATTAGGGATTACAGCTTCAACATAAGAATTTGGGGGAAACACAACTCAGTCCATAACAGCATCCTTGTGAGAGCACCATAGTGATTTCATAGACTCTCCGCCGAATATATAGTTCCATAAAAGGTCAGTTGGATATGTAAGTCCATTGGATCTCAGTTGTATGAAGGAGTAAAGATGAGGGACTGGTGTATAAGCTGAAAGGTCATGGATTGGAGCCCCAAATAAGGTCAGGAACCAATGTGCCCATGGTGCTTGAGCAAAGTGAGTCAGAAGGTAGAAGAAAAGGCTGTGTCAGAGAAGGGAATGTGCACAGGAGAGAATGTGAAGATTGTGCAGTGTCTGTGAACAGCATTCACAGTGCAGGTGAGGTCAGTGTTGCTGAGAAGTTGGAGTCTTAGCCAGAGGCTCAGCCCTGTGGAGCACCCTGAGAGTGCTGACAGGTATTGGTGTGGAGAGGATGTGAGGCTGGTAGGTGATCAAATATTCAGGGCAGTGTGTGAAACCAGGAGACCTGTGGATGGTCCTAAAAAAAGTATGGTAGGTAATGGTGTGGAAGCCACATTACAAAACAAGGACATTCATCCCACTGTGTAATGCTTGAGATATGAAAGGAAGAAGCTGTCTATCTACTTGAGGGAATCTTACAAAAATCTTCCTCTCAAGGAACAAGAGAGGTGTCTAGCCAAGGACATGGAAGGAATGTTGGACAGAGAAGGAGAGGATGTAGGGGCATTATCTGACCTGTGTGTTCATTCTAGAATTGGCAGGTGGAGGCTGGGAAAATGCTATACACCCTGACCTTTGTACATTTACACAAATATGTGTTTTCTCAACCTGAAAAGTATAGAATTATCAAAACATTTATATTAATAACAAGCAGCTTACCTATCATTGTCTTAAAGCGAAACCTATCTTTTTTGTCTCGTTTTTAATCCTTGTTTTAATTTAAAGAAAAACAGCAGCTCTTACAATGATGTTGAGCACATTAAAAAGAATGCTGTACAATCCAAGGAGCAAGTCATTGTGGTTGCCCAGGAAGCTGTCTTGGAAACCCAAAATATATGTGTAACGGGAGGAAGACTGTTCTAGGTATAAAATACATCTTAACGGTTTCATTATTCTATATTTGGGACTTGGATTTAAGACAGGCAATATCAGAATCCTCAAAATAGGCTAGTTACAAGAAAAGTATTTAATTTTCTCGGCTGTTTCATTAATCAGAATGCTAATTCAATAAATGTAACGGAATCATTTGCAACAACATGGATGAACCTGGAGGATGTTATGTTAAGTGAAATGAGCCAGTCACAGAAAGACAAATACCACACAATCTTACTTATATGTGCAGTCTAAAAAGGTTGGACTCATAGAGAAAGAGAATACAATGGTGGTTACTAGGGGATGGGGGTGGTTGGGGAAGATGTTGGTCAAAGGATTTTCACATAGAAAGAATAAGTTCAAGAGATCTATTGTATAACATGATGACTACAGTTAATAACAATATATTGTATTCTTGAAAATCACTAAGAGTAGATTTTGGGTGTTCTCATCACAAAAAATGATAGGTATGTGAGGTGATGCAATATGTTAATTAGCTCAATTTAGCCATGTCACAATGTATATATATTTCAAAATGTACACAATGAATATATACATTTTTTGTCAATTTAAAAATTAATTAGTTTTTTAAAAGTAACAGGAGTTACCATAATTATGAAGAATTATATGCCCTCCTGAAGTGACTAATCCTTGTTATTTATATTGACTAAGAAGCCTGGTAAGAGGTAACACAGAAGCCTAAGAATGAGAACTAAAGCCAGGTGCTGTGGCTTGCACCTGTATTCCTAGCTACTCAGGAGGCTGAGACCAAGGCAGGAGGATCACTTGAGGCCAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGGCAACATAGCGAGACTCTGTCTCTAAAAAAATTTTTATAATTAGCCAGGGTGAGGTGTTGTGTGCCTGTAGTCCCAGCTACTTAGGAAGCTGAGGAGGGAGGATTGCTCGAGCCCAGGAATTTGGGCTACGTGATCTATGATTGTACCACTGCACTTCAGCCTGGGCCACAGAGTGAGATCCTATCTGTAAGAAATTTAAAAAATAAAGAATGAGAAATTGGATATCTGGTGAGGTAAAAATAGAGCTTTTATTTCTAAGTTG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Seq C2 exon
ATCCAGAGCCAGAGCTCTACCTCGATCCTTTCTGCCCTCCGGGTTTCTCCAGTCAGAAATTCCCCATGCAGCATGTGCTGTGTAATCATCCCCCCTGGATCTTCACATGCTTGTGTGCAGAAGGTAACATCCAGCCTGGGGATCCGGGCCCAGGGGACCAGGAGAAGCAGCAACAAGCCTCTGAGGGGAGACCCTGGAGTGATCAAGCAGAAGGTCCTGAGGGAGAAGGTGCCATGCCTTTGTTTGGAAGAACCAAGAAAAGGACTCTGGGAGCGTTCTCCAGGCCACCCCAGAGGCAGCCAGTCAGCTCTCGGAACGGCCTCAGAGGGGTGGAGTTAGAAGCCAGCCCAGCTCAGTCAGGGAACCCTGAGGAAACAGACAAATTGTTGAAGAGGATAGAAGTCTTAGGATTTGGAACAGTCAACTGTGGAGAGTGTGGACTGAGCTTCAGCAAGATGACAAACCTGCTCAGTCACCAGCGGATACACTCAGGGGAGAAGCCCTACGTGTGTGGGGTATGTGAGAAGGGCTTCAGCCTAAAGAAGAGCCTCGCCAGACACCAGAAGGCACACTCGGGGGAGAAGCCAATTGTGTGCAGGGAGTGTGGACGAGGCTTTAACCGGAAGTCAACGCTAATCATACACGAACGGACACACTCCGGTGAGAAACCTTACATGTGCAGTGAGTGTGGGCGAGGCTTCAGCCAGAAGTCAAACCTCATCATACACCAGAGGACACACTCAGGGGAAAAGCCTTACGTGTGCCGGGAATGTGGCAAAGGCTTCAGCCAGAAGTCAGCTGTCGTGAGACACCAGAGGACACACTTGGAGGAGAAGACCATCGTGTGCAGTGACTGTGGCCTGGGCTTCAGCGACAGGTCAAACCTCATCTCCCACCAGAGGACGCACTCTGGGGAGAAGCCCTACGCCTGCAAGGAGTGTGGGCGATGCTTCAGGCAGAGGACCACCCTTGTCAACCACCAGAGGACACACTCAAAGGAGAAGCCCTATGTGTGCGGGGTGTGTGGGCACAGCTTCAGCCAGAATTCAACCCTCATCTCTCACAGGCGGACACACACTGGGGAGAAGCCGTATGTTTGTGGGGTGTGTGGGCGAGGCTTTAGTCTCAAGTCACACCTCAACAGACACCAGAACATACACTCAGGAGAGAAGCCCATTGTGTGCAAGGACTGTGGCCGGGGCTTCAGCCAGCAATCCAACCTCATCAGACACCAGAGGACGCACTCAGGCGAGAAGCCCATGGTGTGTGGGGAGTGCGGGCGAGGCTTCAGCCAGAAGTCAAACCTTGTTGCACACCAGAGGACGCACTCAGGGGAGAGGCCGTATGTGTGCCGAGAGTGCGGGCGAGGCTTTAGCCACCAGGCCGGTCTCATCAGGCACAAGCGGAAGCACTCGAGGGAGAAGCCCTACATGTGCAGGCAGTGTGGACTGGGCTTTGGCAATAAGTCAGCTCTAATTACACACAAGCGGGCTCACTCGGAAGAGAAGCCTTGTGTGTGCAGAGAGTGTGGCCAAGGCTTTCTCCAAAAGTCACACCTCACCTTACATCAAATGACACATACGGGGGAGAAGCCATATGTGTGCAAGACGTGTGGGCGGGGCTTCAGCCTCAAGTCTCACCTCAGCAGACACAGGAAGACCACGTCTGTCCACCACAGACTGCCAGTGCAGCCCGACCCTGAGCCGTGTGCAGGGCAACCTTCGGATTCCTTATACTCTCTCTGAAGGCAAAGATGGGGACAAGGACTAAGAGTCAGAATGTTGACACTTTGATGAAATGGAGTAGAGAAATGCATTCTGTAAGTGGTCAAAGGACATTTGACTGTTTACTTTCTCCACACTAAGTCTTCTCCATGTTTTGTGGCCTTCGGTTGTAATAAACTTGGCTTCTTTATACATCTGTAA
VastDB Features
Vast-tools module Information
Secondary ID
ENSG00000125846:ENST00000377671:6
Average complexity
IR
Mappability confidence:
NA
Protein Impact
Alternative protein isoforms
No structure available
Features
Disorder rate (Iupred):
C1=0.494 A=NA C2=0.268
Domain overlap (PFAM):
C1:
PF0135222=KRAB=PD(0.1=0.0)
A:
NA
C2:
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Main Inclusion Isoform:
NA

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