HsaINT0186256 @ hg19
Intron Retention
Gene
ENSG00000163848 | ZNF148
Description
zinc finger protein 148 [Source:HGNC Symbol;Acc:12933]
Coordinates
chr3:125050002-125094198:-
Coord C1 exon
chr3:125093946-125094198
Coord A exon
chr3:125050083-125093945
Coord C2 exon
chr3:125050002-125050082
Length
43863 bp
Sequences
Splice sites
5' ss Seq
GCGGTAAAG
5' ss Score
5.69
3' ss Seq
GTATTTGTGTACTTTTGTAGGAT
3' ss Score
8.96
Exon sequences
Seq C1 exon
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Seq A exon
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Features
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Associated events
Other assemblies
Conservation
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(dm6)
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Suggestions for RT-PCR validation
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No suggested primer sequences
R:
No suggested primer sequences
Band lengths:
Functional annotations
There are 0 annotated functions for this event
GENOMIC CONTEXT[edit]
INCLUSION PATTERN[edit]
SPECIAL DATASETS
- Autistic and control brains
Other AS DBs:
FasterDB (Includes CLIP-seq data)
AS-ALPS (AS-induced ALteration of Protein Structure, links to PINs)
APPRIS (Selection of principal isoform)
DEU primates (Only for human)