RnoINT0167790 @ rn6
Intron Retention
Gene
ENSRNOG00000001789 | Zfp148
Description
zinc finger protein 148 [Source:RGD Symbol;Acc:62063]
Coordinates
chr11:70584974-70618347:-
Coord C1 exon
chr11:70618193-70618347
Coord A exon
chr11:70585056-70618192
Coord C2 exon
chr11:70584974-70585055
Length
33137 bp
Sequences
Splice sites
5' ss Seq
GCGGTAAAC
5' ss Score
4.42
3' ss Seq
GTATTTTCATACTTTTGCAGGAT
3' ss Score
10
Exon sequences
Seq C1 exon
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Seq A exon
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Protein Impact
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No structure available
Features
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A:
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Main Skipping Isoform:
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Other Inclusion Isoforms:
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Other Skipping Isoforms:
NA
Associated events
Conservation
Chicken
(galGal4)
No conservation detected
Chicken
(galGal3)
No conservation detected
Zebrafish
(danRer10)
No conservation detected
Fruitfly
(dm6)
No conservation detected
Primers PCR
Suggestions for RT-PCR validation
F:
No suggested primer sequences
R:
No suggested primer sequences
Band lengths:
Functional annotations
There are 0 annotated functions for this event
GENOMIC CONTEXT[edit]
INCLUSION PATTERN[edit]