HsaINT0187005 @ hg19
Intron Retention
Gene
ENSG00000178338 | ZNF354B
Description
zinc finger protein 354B [Source:HGNC Symbol;Acc:17197]
Coordinates
chr5:178293977-178311424:+
Coord C1 exon
chr5:178293977-178294072
Coord A exon
chr5:178294073-178309709
Coord C2 exon
chr5:178309710-178311424
Length
15637 bp
Sequences
Splice sites
5' ss Seq
TAGGTAAGT
5' ss Score
9.66
3' ss Seq
TTCTTTTTTTCTTTTTTCAGGAT
3' ss Score
12.88
Exon sequences
Seq C1 exon
GACTCTCATTTACCAAACCAAAAGTCATCTCCCTGTTGCAGCAAGGAGAAGATCCCTGGGAGGTGGAGAAAGACAGTTCTGGTGTCTCCTCTCTAG
Seq A exon
GTAAGTGGGTGGCCCGAGGTGCTCGGGAATGGCCGCAGACAATGGTCTGGTTAATGAGAGGAGGTAGGAACATTGGTTGGGAAACTCCCTTGAGAATTCTCAGGCCTCAAGAAGTGGTGGGGAAGCGGAAGCCCAGGCTCTTAGGCAGGATTAGTCACTTGTAATCACTTCCCCATGAATCTCTCAGCATCTCTTTTCTTACTCTTTCCTGTTGTTTTAGAATAGGGCTGTATTTGCATGTATTCATTCAGCAAACATAGTATATTTAAGGAACTTCAAATAATCACTCTGGCTGAAGCTCAGGGTGTATTTGGGAAAGGAGGAGGTGAGGAAGGAAATAGCCTAGAAAGCTAGGGAAGGGCCGCGTAGTAAGTGCTTGGGCACAGTTGTAAGAGGTGGAAACTGTCCCATGGAGCACTGGAAATAATGGAAGGATTTGGGCAGGAATCATATGGTCCTTGGTATCTTAGAAAAGTTGGTGTGAATCAGAAACAGCTGAGTCTCCATCCGTGTAAGAACAGCTAAGGGACCTGTGGCGTGTCCTTACTCTGGTGAGCATCACCACCCTGAAAACAAGAGTCCAGGGACGTGGACAGAGCTCCCAAAAAGTTACAGAGCATTGTTGGGACGCCACCATTTATGTCTAATGAAAATTACATGTATGTGTAATGTGCACATAAGCAGAGAGAAAGGTTAGGAGGACACACCTTAGCTGGTGACATTAGTTACACTTGGAATGGGATTGAGAATGGGTCCATGGAAGGGGATGTTATTTACATGTAACATTTTAATTTTTCACAAAGAGAATATATTCATGACGTTGCTATGTGATTCGAATTTAATACAGATGGTCACTTTGGGAGTATCGTGATTGAAAGTGAGGCAAAACTAGAGGCAGGAAGCCTTGCAGAGCAATTGCAATCATGGAGGGAGGCAGGAGGTGGAAGGGCCTGGATGAAGGCACTTGCCGTGAGTTCGTGAGGGAGGAGGTGGCGCCCACGTGATCAGGGTACAGGAGCAGTTGGGTGTGGGATGGATTTCACTTGAGATGTGAGTGAAGTCGTCAGGTGGGGAACCCTGGTGGGCAGGTGTGTAAGTGACAGGGCCGAGACTCAAGGGAGGTCAGGGAGCCCATCAGCATGACGGGCATTAGAAGCTTGGAGCTGGCCAGGTGAGGGGGCCAAGTGGAGGCCCGAATTTCAGGAAACAGCATTTGCGAGGTGCTTAAGCAGGAGGAATCTGACAGAGCCCGAGAAGTAATCAGAGGAGAGAAACGGGGAGGGGCCATCGTGGCAGTGGGGGACTGAGAGTGGTTGAACTGGGGGGGCTCTGGCTCTGGGGGATCAAGGTTGAACCCTCGCCCACAGCTTTGTATAGCATTGGGCAGAAAGGGACACAGGTCTCCTGCTTCTGGAGTGCACGATCTAGTGGGGGACAAGGTGAACACACTCATTGCACACAAGGCACAGAAGGACACATTCCAGTGAGGACCACGTGGGAAAGACACTCGGTGCTGTGAGAGTGCAGAGCAGGCAGGTGGCATCAGCAAAGGCTTCCCTGTGGAAGGGCCTGGGATCAAAGGACTGAAGAATTGCTCAGGCCTAAAGAATGGTGTTTGTGGCCGGGCACAGTGGCTCACGCCTGTAATCCGAGCACTTTGGGAGGCCGAGGCGGGCAGATCACGAGGTCAGGAGATCGAGACCATCCTGGCTAACATGGTGAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAAATTAGCCGGGCATGGTGGCGGGCGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGACTGAGGCAGGAGAATGGCGTGAACCCGGGAGGTGGAACTTGCAGCGAGCCGAGATCGCGCCACTGCACTCCAGCCTTAGTGACAGAGCAAGACTCCAACTCAAAAAAAAAAAAAAAAGAATGGTGTTCGTGAAGGTCCAAAGAAGTAAAGCCAGTGAGGAGAAGGTAGAGCCAGGCACCGAAGAGAGCCGCGGGCCTTGTCATAGAGTTTGGTTGGTGCTTGAGAGCTAAGCATAGGCTCTGAGGAGCCATAAGTAGCCCAGGGCAGGCCCAGGCTGCATTCTGCAGCTGCCAGCGCATGTGAGGAACCTGACCGCCACAGTGCAGGGCTTGTCAAGTCCAGAGGGCTCAGTGATGGCCCCTTGTGCCACGGGCCCAGCGAGGAGCTGCACGGCAGGCAGCTTTGGTCCCCATAGCCCCTGTGCTGGGGAGAGCTTTCTCGTGATGATAGCTTGAACTTTTTTTTTTAAAAAGGGGAACCACACTTGTGTTTTTAATCTCCTTTGGTAGAAATACACTAATTTTATATTAAATTAAAATTTAATGAACTGCCAGAGACCACCACAAAGTAAGCCGAATGCAAGCAGCAGGGAACCAGGTGAGATTTAAGAGGGGCGTCAGTCTGGCCATTATGTGTGGGCCGAATCTTGTGTGGAAGAGCAGGAAGAAAGAAAGAGTTGTTCCCTTTCCCTTTAACTAGGGAGCACCTGATGGCTGAGTAAGTCTCCCCTCTAGAGAGAAGTATTAACAGGCTGAAAATATGACGAGTGCAGAGTTGTCCAGAGGGATGCCGGGCACCTGATAGTGTTGTCAGTCAGTCCCTTTTCAGATTGGGGAGGATGGCCCTGCGGGAAAACCCTGAGCAGTTGATTGAGTAAGAAAGGACGTCAGAGCTGTTTCCTGCCCGATTGCTCTTGGTGGGATGACCTTCGTCCTCCTTTTGTCAGATGGAAGTCAGATGGCATTCCTAGGGTGCTGACGTGCTTGCATCTCTGCTGCACCCCTGGTGGGGCTCCTGTCTGCCTGGACTAAGATTGCCCCAGGACAGCTTCCTTTTCCCATGAGTGCTCACTTCATTGAGAGCGTGGTTGAAGGACTGGGATGTTCCTGGAATTATCTCAGATTATTAACTCTAGCTCGAACCAAAAACTCAACCTGTAGGCTGGGTGAGGTGGGTCACGCCTGTGATTCCAGCACTTTGGGAGGCCAAGGTGGGAGGATCACTTGAGCCCAGGGGTTCGAGACCAACCTCGGTAACATAGACCCTGTCTGTGTTTATATAACTTTAAAAAAGAAAAAAAATATTTTAGACAAAAACCTACCCTTTGAACAGCCAGTGATAGAAAAACTTATGCTCCCCATGATAGGACTCTCTCGAACCTCCAGTAGCCTCAAAATATACTTGTACAAAGTTATTTTCTTTTGAGATGGACTCTTGCTCTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCATTGGCGTGATTCTCAGCTCACTGCAGTGCCCTCCTCCCAGGTTTAAGCGATTCTTGTGCTTCAGCCTCTCCGGTAGCTGGGATCACAGGCACACGCCACCATGCCGGGCTAATTTTTGGCATTTTTTTAGTAGAGACCGCGTTTTGCCATGTTGGCCAGGCTGGTCTCGAACTTCTGACCTGAAATGATCTGTCCCCCTCAGCCTCCCAAAAGGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACCACACCCGGCCTGCTTTGTTTTCTTACTGCAAGAAGCCATCTTGGGTAGGCTGAATGGTGCAGGGTGGTGAACGGAGGGGTTGCTCAGCAAGGTTTGCTGAAGCAGCAACTGCACACAGGGAGGACTGTCTTTTCCTGATTTGCACAGGATGCTGTGGGGCTTAGCAACAGCCCTGATGACATGGCCTGGAATGTTTTAAAAAGTGACTGCTTACAAGATGGAAGTGTGGCCACAATGCCCTGTAGCCCTATTGCATTTTACTTGTTTTTGTAGAGATGGAGGTCTTGCTATGCTGCCCAGGCTGTTCTTTGAACTCTTGGCCTCAAGCAATCCTCCCATGTCAGCCTCCCAAAATGCTGGGATTATAGGCCTGAACCACCGCACCTACCCAGTATAGTCCGGTTTAATTTGTATGAGTTAGTCTTTTTCTTGTTTGCCAGCAAAGACTCGTACATATGCCCTGCCCCTCCCCTCCTACCAACATCTCTTCTCTTCATAACTTCCAGAATTATCTATTTAAAGAGTAAATCAACCATATTGCTTCTGTGCTCAAAATCTCCGTTGGTTTCCATCCCATACAGTATAGCCCAAAGTCCCCATCATGGCCTTCAGAGACCTACATGGTCTGGCCCTGGCTACCTCTTCACCCTTAGCTCCTTCCACTCTGCCCTTCATTCAAGGCCTCTGATCACCCTTGGCCGCCCTGCTGTTTGTCAGGGGGGCCAAGCAGGCCCCCACTCAGGGCCTCTGCCCTGCTTTTTTCTGTCTGGGACTGTTCTTCGTGGCAGTCATGCGTCCATGTGGCTCACTCACTTCCTTGTGCTGCACTGGCTTCGGCTCACACAGGCACAGATCATCTGACACGCAGCCCTGCAGCCCCCACGCCATCTCCTCACCGTGCTTTATTTTCCCTCTCCATGCTTAGCGCTGTGTAATAGACCTGTTTCTTCATGATCTGTCTCTGCCTCTGCATTGTAAGCTGCTGTAGGAGGGGTTGCCTCATTCATTCACTCCTGTTTTCCAAGAACCTAAAACAGTCCCTGGCCAGGGTAGGCGTCCAGTTGTATAATGAATGCACGAGTGACTTGGACTAGGTTAGTGGTGTTGGAGACAGAAAGAAGTGAACCAGTCCCAGAGATGTCCAGGAGATACAGCCAGCAGGACTTGGATTCGATGTGGAAGATAAACGAGATAGGGTTGTCAGGGATGCTTGTTTTGTTTCTGGTTTGTTCTGGGATGGCCGGTGTCATTCAATGAGATACTACCACTGGAAGGAGATTAGATTTGGAGGATGGTATGAGTTTGATATTTTTACTTTGCAGGGGAATTTTACTTTTTTTAGAAAATTTTTTATTTTAAGATAATAGTAGATTTATATGCAGTTGTGAGAAGTAGTATAGAAAGATTCTATGTCCCTTATACTCATTTCCAAAACCATAGTATAATACCACAACCAAGATACTGACATTGATACAGTGAAGATACAGAAAAATCCCTTCAGTCAGCACAGAGATCCCTCCTGGTATCCGTTTTTACACACACCTGTTTCCCTCTTGTTCACTGCCCCTGTTCCCTGCCTCTTTTCCTGAAGTCCTGATAATCACTAATGTGTTCTCCGTTCTATAATTTTATCATTTCAAGAATGTCATATACATGGAATAATAAAATGTGTACAACGTTATGGGATTTTTTTTTTTGCCCCACTTAACATAAATCTCTGGAAATTCATCTGTGTAGTTGTATACATCAGTACTTCATTTCTTTTAATTGCTGAGTCGTGTTCCATAGAGTATATCATAGTTTGTATAGCCATTCCCTTGTTGGACATCTGGATTATTTACAGTTTTTGGCATTTAAGTATAATGCTGTTATAAACATTCATGTGCAGGTTTTTGTGCAAAAATTAGTTTTTATTTCTGTGTGATAAATGCCCAGGAGTGGAATTGCTGAGTCATGGGGTAGTTGTAGGTTTAGTTTTTGAAGACATAGCCAAGTTGTTTTCCAGAGTGGCTGTGCCATTTTACATTTCACCAGTAGCATGTGAATGATCCAATGTTGTTACATCCTTGCCAATATTTTGCCTTGGTACTACTATTTATTTTAACCATTCTGGTAGGTGTATGGTGAAATACATTGTGATTTTAATTTGTGTGTTGCTAACATCTGTTGATGTTTGACATAGTTCATGTGCTTATTTGCCATTTGTATTTCCTTTTTTTTATTTTTTATTTTTTGGAGACAGAGTCTTGCTCTGTCACCCAGGCTGGAGTACAGCGGTGCGATCTCAGCTCATTGCAATGTCTGACTCCTGGGTTCAAGCAATTCTCATACCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGATTACAGGTGCATGCCACCACACCCAGCTAATTTTTGGCATTTTTAGTAGAGACAGGGTTTCACCTTATTGGCCAGGCTGGTCTCAAACTCCTGACCTCAAGTGATTCGCCTACCTCGGCCTCCCAGAGTGCTGGGCTTACAGGCGTGAGTCACCACACCTGGCCTGTGTTTCTTATTTAATAAAATGTCTGGGTATTTTGTTCATTTTCTAGTTGAGTTATTTTGGAGTTTTTTACTGTTGAGTTTTGAAAGATCTTTATATATGCTGGATAGTAGTTGCCGGATATGTGGTTCACAAATGCTTTCTCTTACTCTGTAGTTTGTCTTTTTATCGTTTTTACTGGTTCTTTTGAAGAACACAATTTTTAATTTTACTGAGGTCCAGTTGATCAGTGTTTCCTTTTATGGATTGTGCTTTTGGTGTCAAATGTAAGAATTCTGCCTGTACTTAGATCATGAAGATTTTCTGCCATGTTCTTCTAGAAGTGCTGTAGTTTTACATTTTACATTTATATTCATGACACTTTTTGAGTTAATTTTTGTGTTAGATGCGAGGTTCATTTTTTTGCATGCGAATCTTCAGTTGCTCCATCATTATTTGTTGAAGTCGTCTTTCCTCTGCGGAGTTCTTTGGTGCCTTTGTCAAAAGTCACTTGGGCGTGTTGGGTTGTTTCTGGGTTTTCTTTTCTGTTCCATTGTTCTGTGTTTCTGTTCCTCTGCCAATACCACACAGTGTTGATTGCTGTATATATACAGGCTTTAATGTTGGGTAAAGTGATTACTTCTTGTTGTTTTTTAGAAAGTTTTATCTACTGTAGTTCTTTGTATGAATTTTAGAATAATCATCAATCTCTACAAAAAGAATCTTGCTGAGATTTTGATAGGAATTGCAGTAAACCTGTATATCAATTTTCTGTGTTTAGTCTTCCAATCTGTGAACATGATATGTCGTTCTATTTATTGAGGTCTTTTTTATTTTCTTCCATCAGTGTTTGTAGTTTTCATCATATGAGTCCTCTGTTTTTTTTTTCTTTTTTTTTTTTTGAGATGGAGTCTCACACACTCTGCTGTCCGGCAGGCTGGAGTGCAGTGGTGCGATCTCTGCTCACTGCAACCTCCACTTCCTGGGCTCAAGCAATTCTCCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGAGATTACAGGTGTGCACCACTATGCCCAGCTGATTTTTGTATTTTTAGCAGAAACAGCGTTTCACCATTTTGGCCAGGCTGGTCTCGAACTCCTGGCCTCAAGTGATCCACCTGCCTCGACCTTTCAGATTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACCATGCCTGGCCCATTTCCTGCATTTGAATATTGGCCTCTCAAGCAAGGTTGGGTAAGTTTTCATGGACAATAGTATCCTGAAATGTGCTTTCCAAGTTACTTGCCTTCTCCCCACTTCTTTCAGGGATGGCAATGAGTCGTAGATTTTGTCTCTTTACATAATCCCTTATTTCTCAGGTTTTGTTCATTGGTTTTTATTCTTTTTCTTTATTTTTATCTGTCTATCTGGCTGAGTTCAGAGAGCCAGACTTTGAGCTCTGAGATTTTTTCCTCAGCTTGGTCTGTTCTGCATTTCAGTTGCATTATGAAATTCTTGTAGTATGTTTTTGAGCTCTATTAGATCAGTTTGGTTCTTTCTTATCATGGCCATTTTGTCTATCACCTCCTCTATTATTTTACTGTAATCCTTACATTCCTTGGATTGGGTTTCAACTTTCTCTTGAATCTTTATGATCTTTGTTCCTGTCCATGTTCTGAGTTCTGTTTCTGTCATTTCAGCCGCTTAGGAGCCCTTGCTGAGAAACTAGTGCAGTCTTTTGGAGGAAAGAAGACACCCTGGGTTTTTGATTTGCCAGAGTTCTCATGATGGTTCTTTTTCATCTGTGTGAGCTTAATGTTTCATTAACTGTGATGTAATTTGAGTATAGTCAGTTGACTTCTTTTTGAATGTTTTCAGAGGGCCAGTGTTTTATGCAGGGTGTTTATTTGTAGCTGAATTCTTGTCCTAGTTTCACAGAGGGGTATATTAGCAAAGTAATTTTGGTGTTAAAGTTTGGGCTGTGGTCTGGTAGATGGGCTTAAGTGTTATGGCCAGTAGGTAGGCTCTTACTCAGCTATGTGACTCCTCTGTATTTCCTCAAGATTGCAGCCGTGCCCCTCAGTGCTCTGAAAATGTGGGCTCCTCTCCCACTCGAGTGCTGGCTGCACATCTCAGCTTAGCATTGCCAGGCTGCCCACCATAGCTCTGGGGTGATCTTGGTTTATGTTCGCTTCCTAGCTTGGAGGCAACAGGGGAAGGGACTCCGGTTGGTGGTAGTTGTGGCAGAGAGCCTTTCACTTGTCTATGGGCCTCTACCCTAAAGAGATGCAGAACCACTGTCAATCAGTGCAGTCGGCCCAGGGTGGGTGACTGCCCTGTGCCCAAGATGGGGAAGGAGGCCCTGCCTGGTGAGGAGCAGGAGGAGCTGGCAGGGGAAGGGAGGTCACCAGCGAGACAGACTGACTGCTGCTTATGGCAACTGCAGCTTCCTGGAGGTACAGCTGAAGTACTCAGGGTTTTTGTTCCTTCCTCTGTCCAAGGGTAGCAAGGGCAATACCACTGCAGTGGCAGTGACAGAGGGACTTTCGGTTGCCTCTGTCAGCTCCACCTCAGAAACATGGAGCCACTGCTACTGGGAATCTTCAGCCGAGGGGCGAGGTGGCTACCCTGCTGGCCTGAGGTGGGGGATCTACTTGGTGAAGAGTCAGGGATTGGTTCTCACAGGGAGAAGAGACTGGGCTCCTGTCCATATGGTGACTGTGGCATGCTAGAAGCCCAGATGAAGGCTTCACTGTTTCTTCCCCAGACTGAGGGCAGCAGGTGTAGGACTGCTGCTGTGGCAGTGGCATAGGGGCTATCAGTTGCCTCTGGGAGTCCTTCCTCAGGGAAGACAGAGCCACTACCAGTGGGAATGCTCAGCCAGGGGAGGGACGGCTGTTCTGCTGTCCAAAGCCAGGGTCCCTGCCTGGTGAAGAGTTGGCTATGGGAGCTCACAAGGTAGAGAGACTGGGCTCATCTCCATATGGTGGCTGTAGTGTACTAGAGGTACCAGTGTAGCGACCGGGCCCTGTGTTCCTTCCCAACCCAAGGGTGGATAGTGTGGTACCATTTTAGCTATAGTGGTGGAGGGGCTATGGGTTCTCTCTCAGATTTCCTCCTCAGAGAAATGCAGAGCCACCTCCAACTGAAGCATTCAGGTAGGCTTGATGGTTGTGCTGGAGTCCCAGGTCGGGAGGCCCTGTCCAGTGAGGAGAAGTGGAAATGGGGACCCGTGTGGGGAACAGTCTGGCCGCGTTTTGTGAGGCAGCTGTGCACTTCCTGGAGTTCTGTTCCAGTCCCTAATCACTGTGCCCCCTCCAGAGCCTGAGGGCAACAGCAGTGAGGGCTGTGGCACAGCAAAAATAGCAGCCTGCCTCTCCCTTCGGGAGCTCTGACCTAGGGAAGTACAGAGCTGCTACTGGCCCGAGAGCCTAGGCAGGGCTGGTGTGACCATGCGAGGGTCCCAGGACGATGCATATTTCGGCCTGCTTGATGGCATCCTACATGGCCCTTAAGTTCTGTTCACTTTTTAAGTATTTTCTACTTTTTCTTCCTTAGACTCAAGGAATTTTAATTTTCCTATCTTAAACTTTGTTGATTTTTCCTATGGCCCGCTTAAACCTTTTGAATTTCCCTAGTGAAATTTTCATTTCAGTTATTATGCTTTCAACTCCTAGAATTTCCTCTTGGTTTCTTTTTGTTTTCTTTTTATTGATACTTCGATTTGTTCATTATTTTCATGAGTCATTCATATTTCCCTCTAGCTCTGAGCATCTTTATGATAGTTGTCTTTGTGTAGCATGCCACCATCTGGTCTTCTCCATAGATGTTTTCTATTTATTTTTTTCCATTGACTGAACCATACTTTCCTATTTTTTTATGCCTTTTTTTTTTTTTGTCTTACAGTGTTGCAACTCGGGATCAGATTTTCCCACTTCTGTAAGATTTGCTGGGTTTTGTTTTGTTTTGGTTTTTGTTTTCTTATTGCTGTAGGGTGGCACTAGTCCAGGAATTAGCCTGAAGTATAACCTGTAGGTCTTCTCACATTTTTTTCTGAGCCCACGTCTTTCCCTGGCCTTGTGCAGTGACTTTCTAAATTCCCCATGTGTGCAGTTGTTCTTTGTTTTGTTTTGTTTTGTTTTTGAGATGGAGTCTTACTCTGTCACCCAGGCTGGAGTTGCAGGGGTGTGATCTCAGCTCACTGCAACCTCCACCTTTTGGGTTTAAGCGATTCTTCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGATTACAGGCACCCACCACCACACCTGGCTAATTTTTATGTTTTTAGTAGAGACAGGATTTCCCCATTGGCCAGGCTGGTCTCGGAACTCCTGACCTCAAGTGATCCGCCCACCTCAGCCTTCCAAAGTGCTGGGATTACAGGTGTGAGCCACCAGGCCAAATGTCCTTATCCTTAATGTCTGATTCCCCAAAGCAGAAAAAGAGGGGAACAGAAGGGGAAAAAAGTAGGCACTGTTCCTTAAATCCTCTGGAAGCCACATCAGGTCAGTGGGGATTGCAAAAATGGCAGCCTGCATTTGTGTTTGCACCTCCGTGATTCAAAGCAGTAATTTGCAGTCAGAACCCAGATCCCCATTATTTGGAGAACAAGGTCTTTATTGCCACTTTGGCCACCAAAGGCCACGCTAGGGATGCTAGTACGGCTTCAAGCCATGAGATGAGGAGATTGGAGATGGGTAGCTGCTGCCAACTAATATTAATTTCACTTGACTGGCCAGGCCTTCCCCTAGAAGCTACAAGCCTTCATATAGTTTCCAGAGTTTCAAAATAGTTGTATCAGACAGATTCTGACACCTCAGTTGTCTAGGTGGATAGATAGAACCTTGGTGCTTCCTACTCTACCATCTTCCCTGACATCTACTTTTTCTTTTACCTTACATTTATTTTGCACTTTTGGCATTTTCTGTCTTTAAGTATGTAAGTAGTATGCCACCATCTGGAGTTCTGATGGGGAGGTGCTACTGATGTCTATTGGGTAGTATGCTGAGGGTGAGGTCTTGCATAAAAGTCACAGTTAGGCCGGGCGTGGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGCGGGCGGATCACGAGGTCAGGAGATCGAGACCATCCTGGCTAACATGGTGAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAAATTAGCCAGGCGTAGTGGCGGGCGCCTGTAGTCTCAGCTACTTGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATGGCGTGAACCCGGGAGGCGGAGCTTGCAGTGAGCCGAGATTATGCCACTGTGCTCCAGCCTGGGCAACAGAGCGAGACTCCGTCTCAAAAAAAAAAAAAAAAGTTACAGTTATGAAGTTAATTCTTATCATTTGGGGAAGAGATTTTGATAGGTTGCTTGTCACACATCCATCATTATCTTCAGCTACCCAGAAGGCTTTGTTTGATATTTACTCTTTAAATGTACATTTTATGGCACTTAACCTCGGTGCCCATTTAGGTCTCTTCCAAGTATACTTTCCTTTCTTTCCTGTTCTAAAGCCTTTTAAAATAAACTTCCACTCTTGCTCTGAAAAGAAATAAACATACATTTTGTCATTTGATAAATGTTTAAATTTTCCACTTGGAGGTTTTTTTGTTTGTTTTGTTTTGTTTTGTTTTTTTGAGATGGAGTTTTGCTCTTGTTACCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCACAATCTCGGCTCACTGCAACCTTTGCCTCTTGGGTTCAAGTTATTCTCTGCCTTAGCCTCCCAAGTAGCTGGGATTATAGGCATGCACCACCACACCTGGCTAATTTTGTGTATTTAGTAGAGACGGGGTTTCACCATATTGGTCAGGCTGGTCTCGAACTCCTGACTTCAAATGATGCACCCGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACGGGTGTGAGCCACCACACCCGGCTGAAAGTATGTTTTTAAAGTATATATTTTTTAGGACCTTGTTGTTTGTGTGTGCTGCTTTTTTTTTTGAACTGGAGTCTCACTCTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAATGGTGCCATCTCGGCTCACTTCAGCCTCTGCCTCCCAGCTTCAAGCGATTCTCCTGCATCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGATTACAGGCATGTGCCACCACACCCAGCTAATTTTTGTGTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACCATGTTGGTTAGGCTGGTCTCAAACTCCTGACCTTAAGAGATCTCCCTGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTAGGATTACAGACGGGAGCCGCTGTGCCCAGCCTGTGTGCTGATTTCTTTGCAGAAACCAGAGTTGTTTTTGTTTTTGTTTTTTGAGATGGAGTCTTGCTCAGCTGCCCAGGCTGGAGTGCAGAGGCCCAATCTCGGCTCACTGCAATCAACGTTTCCTGGGTTCAAGCCATTCTCCCGTCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGATTACAGGCACCCGCCATCATGCCCAGCTAATTTTTGTATTTTAGAAGAGAGGGGGTTTCACCATGTTGATCAGGATGGTCTTGAACTCCTGACCTCCTGTGATCTGCCCGTCTCAGCCTCCCAAAGTGCTAGGATTACAGGTGTGAGCCGCCGTGCCTGGCCCAGAAACCAGAGTTTTTAAATTGCAGCTTTCTTAGTAGGCATGGGCTATAAAAGGAAAAAGATTAACCCACTCACTCCTGTTACAAGGAAGGACAGAAAGTGGAAGAAAACTTCATTTTTAGTTTTGTTATGGAAAAGTTCGAGTATATATAAAAGTAGAGAGAATAGGCTGGGCGTGGTGGCTCAAGCCTGTAATCCCAGCACTTTGAGAGGCCAAGGTGGGTGGATCACGAGGTCAGGAGATTGAGACCATCCTGGCTAACACGGCAAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGCTGGGCGTGGTGGCATGTGCCTGTAGTCCCAGCTACTTGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATGGTGTGAACCCAGGAGGTGGAGGTTGCAGTGAGCTGAGATCACGTCACCGCACTTCAGCCTGGGCGACAGAGCGAGACTCCGTCTCAAAATAAATAAACAAAAAAGTAGAATAATATAATGACTTCCCATGTATTCGTCATCCAATTTCTTTTTTTCCTTTTCTTTCTTTTTTTTTTTTTAGACGGGGTCTCACTCTGTTGCCAGGCTTGAGTGCAGTGGCACGATCTTGGCTCACTGCAACCTCTGCCTCTTGGGTTCAAGTGATTCTCCTGCCTCAGCCTCTTGAATAGCTGGGAGTGTAGGGGCACGCCACCACACCCAGCTAACTTTTGTATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACTGTGTTGGCCAGGATGGTCTCGATCTCCTGACCTTGTGATCTGCCCACCTCAGCCTCCCAAAGTTTTGGGATTACAGGTGTGAGCCACTGCACCCGGCCTCCTCTTTTTTTTTTTTTTTTAAAGACAGGGTCTCTTTGTCACCCTGGCTGGAGTGGAATTAGATAATCATGGCTTATTGTAGCCTCCTGGGCTCAAGTGATCCTCCTGCCTCAGCCTTTTATGTAGCCAGGACTGCAGATGAGTGCCACTATGCCCAGCTAATTTATTTTGTTTGTTTTAGAGATGGGATCTTACTGTATTGCCCAGGCTGATCTCGAACTCCTAGGCTCAAGGGATCCTCTTGGCCTCCCAAATTGCTGAGATTAAAGGAAGGAGCCACTGTACCTGTACCCAGCCCATCACCCAATTTCAGTAGTTGTCAACTCATGGTCATTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGATGGAGTTGCACTCTTGTTGCCCAGGCTGGACTGCAGTGGTGTGATCTTGGCTCACTGCAACCTCTGCCCCCAGGGTTCAAGTGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCTAGTCACTAGCATTACAGGCGCCCGCCACCAAGTCCAGCTAATTTTTGTTATTTTTAGTAGAGACAGGGTTTCGCCATGTTGGCCAGGCTGGTCTCAAACTCCTGACCTCAGGTGATCCACCTGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGGTTACAGGTGTGAGCCAGCACGCTTGGCCAACTCAAGATCATTTTTGTTTCATCTGTTCCAGTGATTATCTACCAGGACTGATTCTGTCATTTGTCAATGTCTTGAAAGATTTTTGCTTGTCGCAAGCCTGGAGGGAGGAATTGTGAGGGGCAGGTGCTATGATGTCTGTTGGGTGGAGATCAAAAGTATGCTGCTAAACATTCCACAATGCACAGGGCAGCCCACCCTATCCACACAACTAAAAAATCAGCCCAAAATGTCATCTGAGGTTGAGAAATCCTTATCTGTATCTTGTCTTAATGCACTGACATTTGTATAATGTTATTACATCCAAGAATAGGAGAGGTGATTATTTGTTCAGATATACTTTAATGTCATTCATCTGATATACTTTAATGTCATTCAAGACTGGTATAAAATTTCCCTTATATAGATTTTTCATATTACTTGTAAATTTACTGTGATTCTTAGTATAAATGAAGGCTATTGATTTTAATATGTCAATTTTATATCCAGCTACTTCAGTGAGTTTTATCATTCATTCTCTGGACTGTTTTTTTGAGATGGAGTCTCGCTCTGTCACCCAGGCGCAATCTCGGCTCACTGCAGCCTCCACCTCCCAGGTTCAAGCAATTCTCCTGCCTCTGCCTCCCGAGTAGCTAGGATTACAGGCGTGCGCCACAATGCCCAGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACTGTGTTGGCCAGGATGGTCTCAATCCATTCTCTGGACTTTTTAATATTATCTGCAAATAGAGGTAGTTTTACTTTCTCTTTACTCATATCTAATTGATTTATATTGCCTGATTGCATTGGTTAATATGTCTAGTACAGTGTTAAATTGTAGGGAAAATAATGGGTGTCTTTGCCTTGTTCTTCAGCATAGCAGAAATAGCTCTAGTGTATTTAATAGATACTAGCTTTAGGACAAAGGTCTATGTATTCTATTATGTTGAGGAAGTATCCCTCAGTTCATTTTTGCTTGAGTGTGTTTATTGTCTGTGGTGCTGAATTTTGCTGAACATTTTCTCAGCATCTCTAGATGTGTATTATTCCTTACTTAAATGCATTTAATGTACTATAATAAGTGCTATAATAAGGGGAGTGAGTTGTTGGAACTCAAAGTTAGGAAAAGGTACACAGAGGAGTTAACATTTGAACTGAGTCTGAAGGATACAAAGGAGTTCAGAATGTAGGAAAAGGAGGGAAGACATTCAGGAGTATAAATAATTACAGGAATGGGGTAATTTATGAGTCCATCATAGGCTTTGGGTACTAGATTATATTTCCTAAATTCATATGCCTCCTCCTCCTCTGATCCTTCTGCTCCATTCTCTTGGTCACTCTTACACACTCACCCGCCTTAACTGAGTTTGTTTTATTCATTTGTTCACTTATCAGTTCAGCTGTCATCCATTATTTTATATAGTGTTTTTTAGAATTTTATCCTCTTTTAGTCATATAGCAAACCCTTACTGAGATACAATTAATCCCTTCTACACATTTAGTCTCAGCCAATCACATGAATCATGGGCTGTTGCTTTCTTTTTTTCTTTTTTCAG
Seq C2 exon
GATGTAAGAGCACACCTAAAATGACAAAGTCAACTCAAACTCAGGATTCATTTCAGGAGCAGATAAGGAAAAGATTGAAAAGGGATGAACCCTGGAACTTCATATCAGAAAGATCCTGCATATATGAAGAGAAATTAAAGAAACAGCAGGACAAAAATGAAAATTTACAAATAATTTCAGTTGCCCATACAAAAATCCTTACTGTAGATAGAAGCCATAAAAATGTTGAATTTGGCCAAAACTTCTACCTGAAATCAGTCTTCATTAAGCAACAGAGATTTGCTAAAGAAAAAACTCCATCAAAATGTGAAATACAAAGAAATAGTTTCAAGCAGAATTCAAATTTACTTAACCAATCAAAAATCAAAACAGCAGAGAAACGCTATAAATGCAGTACATGTGAAAAAGCCTTCATTCACAATTCATCCCTTCGTAAACATCAGAAAAACCACACTGGAGAAAAATTATTTAAATGTAAAGAATGTTTAAAAGCTTTCAGCCAAAGTTCTGCTCTTATTCAACATCAAAGAACTCATACAGGAGAGAAACCCTATATATGTAAAGAATGTGGGAAAGCCTTCAGCCATAGTGCATCCCTTTGTAAGCATTTAAGGACCCATACTGTGGAGAAATGCTATAGATGTAAAGAATGTGGTAAATCCTTCAGTCGAAGGTCTGGGCTTTTTATACATCAAAAAATCCATGCTCAAGAAAATCCCCATAAATACAATCCAGGCAGGAAGGCATCCAGTTACAGCACTTCCCTTTCTGGAAGTCAGAAAATTCATCTCAGAAAGAAGTCCTACTTATGTAATGAATGTGGCAACACCTTTAAGTCTAGCTCATCCCTTCGTTATCATCAGAGAATTCACACTGGAGAGAAGCCTTTTAAATGTAGTGAATGTGGGAGAGCCTTCAGCCAGAGTGCCTCTCTTATTCAACATGAAAGAATTCACACCGGAGAAAAGCCCTATAGATGCAATGAATGTGGGAAAGGCTTTACTTCTATTTCACGACTTAATAGACACCGAATAATTCATACTGGAGAGAAATTGTATAATTGTAATGAATGTGGTAAAGCCTTAAGCTCCCACTCAACACTTATTATTCATGAGCGAATTCATACTGGAGAAAAACCATGTAAATGTAAAGTATGTGGAAAAGCCTTCAGACAGAGTTCCGCTCTCATTCAACATCAGAGAATGCATACTGGAGAAAGACCCTATAAGTGTAACGAATGTGACAAAACATTCAGGTGTAACTCATCGCTTAGTAATCACCAGAGAATTCATACTGGAGAGAAACCATATCGATGTTTAGAATGTGGGATGTCTTTTGGCCAAAGTGCAGCTCTTATACAACATCAGAGGATTCATACAGGAGAAAAACCCTTTAAATGTAATACATGTGGAAAAACTTTTAGACAAAGCTCATCACTTATTGCACATCAAAGAATTCATACTGGAGAGAAACCCTATGAATGTAATGCATGTGGGAAACTCTTTAGCCAGAGGTCATCCCTTACTAATCATTATAAAATTCACATTGAAGAGGACTCCTTAAAAGCCGATTTGCATGTGTGAAAGCCTTAAACCAAAACTCATCAGAGAATACATGCTTGAGAGTGATTTATTAAATATAATGAATATGAGAAAACTCTTAGTTCTCATCAGATACTAAGTTTTAAGAATAAACTTTAGCTATGTAATAACTTA
VastDB Features
Vast-tools module Information
Secondary ID
ENSG00000178338-ZNF354B:NM_058230:4
Average complexity
IR-S
Mappability confidence:
NA
Protein Impact
Alternative protein isoforms
No structure available
Features
Disorder rate (Iupred):
C1=0.091 A=NA C2=0.116
Domain overlap (PFAM):
C1:
PF0135222=KRAB=PD(0.1=0.0)
A:
NA
C2:
PF134651=zf-H2C2_2=WD(100=4.9),PF134651=zf-H2C2_2=WD(100=4.9),PF0009621=zf-C2H2=WD(100=4.4),PF134651=zf-H2C2_2=WD(100=4.9),PF134651=zf-H2C2_2=WD(100=4.9),PF134651=zf-H2C2_2=WD(100=4.9),PF134651=zf-H2C2_2=WD(100=4.9),PF134651=zf-H2C2_2=WD(100=4.9),PF134651=zf-H2C2_2=WD(100=4.9),PF134651=zf-H2C2_2=WD(100=4.9),PF134651=zf-H2C2_2=WD(100=4.9)
Main Inclusion Isoform:
NA
Other Inclusion Isoforms:
NA
Associated events
Other assemblies
Conservation
Fruitfly
(dm6)
No conservation detected
Primers PCR
Suggestions for RT-PCR validation
F:
No suggested primer sequences
R:
No suggested primer sequences
Band lengths:
Functional annotations
There are 0 annotated functions for this event
GENOMIC CONTEXT[edit]
INCLUSION PATTERN[edit]
SPECIAL DATASETS
- Autistic and control brains
Other AS DBs:
FasterDB (Includes CLIP-seq data)
AS-ALPS (AS-induced ALteration of Protein Structure, links to PINs)
APPRIS (Selection of principal isoform)
DEU primates (Only for human)