HsaINT0187919 @ hg38
Intron Retention
Gene
ENSG00000197566 | ZNF624
Description
zinc finger protein 624 [Source:HGNC Symbol;Acc:HGNC:29254]
Coordinates
chr17:16620737-16633957:-
Coord C1 exon
chr17:16633862-16633957
Coord A exon
chr17:16624510-16633861
Coord C2 exon
chr17:16620737-16624509
Length
9352 bp
Sequences
Splice sites
5' ss Seq
CTGGTGAGT
5' ss Score
10.1
3' ss Seq
TTTTCTCTTTTTTGCCCCAGACA
3' ss Score
10.09
Exon sequences
Seq C1 exon
GGCTTGCAGTTTCCAAACCAGACATGATATCTCATTTGGAGAATGGGAAAGGACCATGGGTGACGGTGAGAGAAATTTCAAGAATTCCCTATCCTG
Seq A exon
GTGAGTTAAACAGAACCAAGAAGATGGGATTTATTTGAAGTAACAGACTATAGGGGGATGTTCACCAGAACATCTGAAATAATTTTGAAGATATATTTGTTCAACGCTGTCTCAGAGGAAGAGATCCCCCATCTCACTGCCTGTCCCTCTCACCCCCATCTTCTCTCTCCCTCTCTCTCTGTCCTCCACTTTTGGGAAACATCTCATCCTATTCTGCTTTCCTGGGGACGTGCTTTTCGTAATTATTATTTTATTTCTTCTTCATTCAAACTTGCATAAAATATCCCTTTCAGGTCTGTCTTCTCCAGTTAACTTCATGTTTCTCATTTGTTTCATTATCTGACATTTCTTCCCTCATTTACCTGAAAATGCTTCCATAAGGGTCCCCACTGATTTCTCTTAAGGCAAACTTATTTACTCATTATTTAGTTTTCTTCACCTGCAAGGCTACAGAAACTTTGGAGGAACCCACCACCTCTCCTCCAGGTTTTTAACTAATTGCTAATACAAACAAGGAAGCAGTTGAGAATCAAAATATAGTATTGATGTATTTAATCAATATTATACATCTATATACTGTGAACTGGCTTAGGTACAAGGGCTATAGCAGCTAATAAAATGGACCAGGTCCCTGCCTTCATGAAGATTAAATTTTGAGAAATAGATAATTTGGCAAACAAATAAAAACAAACTAAAATGGTGGTTGCCATACCTCCCAGCTATGAGATAAATTGGAGGATAAGAAAGAGTAACTGGGGTGGGATGAGGACACCTGCTTCAAACAGGGTGGTCAGGGGAGCTTCTGAAGAGGTGACATTTAAGCCGAGACCTGAAGGGTCAGAAGAAGAAAACAGTAAGGGGAAGAGGAAAAGAGAAGTATTCCAGGCTAAGGGAACAACAATGCAAAGGATCTGATACAGCAGAGAATGCCATGTGTTCTGGAAATCAAAAGGAAGCTGCTGTGACTAAAGTGAGGGGAAACTGGTACAGAATAAGATTAGAGATGTAGCAGCCTGCCTGTGCAGGGCTTTGTAGATGATCTAAGTGAGTTCCAAAGCATGGAGAGATTCTACTGCAGGGTTTTTAGAAAATAACCCTGTTTATAGAGATTGAACTTGAGGCATAAAGCAGGCAGTAAGTTAAAAGGTTGTTACAATAGTCTATCCAGGAGATGATAGTAACTTTGATTAGGGTGATGGTAGTGGAGATGGAAAGAAATAGATTCTGGTTCATTTAAGCATTCATTTTATTATGATGCCATGAACAATCCACACATGAATTACGTATTTTTATATATCAGATATTATTTATACTTAAAAGAGTGAGTGAAAAGTAGACATTAGAGATAGTTTTAGATAACTTTTTAGAGAGGGATTTTTTTTCCCCTACGAAGAGGGAAAGAGAAATGGAGCAGTGGCTAAAGGAAAGAATGGAGTCAAGAAAAAATACTTGTTTTATTTTTGAAATGGGAGCTGCTATGACATGTTTGAGTGCTGATAGGATTGCCTTAATGGAGAGAGAGACATTGATGTTGCAAGACAAAGACGAAGGACTAAAGTGTTTGACAGGGTTAAAGGAGATAAAATCTAGAAAGGAAAGGGGGATTTACCTTGAATAGGTACAGAGGTCACCTCCTGTGTTGTAATACTGAGAAAGGTGGAGAAGATGGGTGCACCTGCATGTCAGTTGAGGGCAGGAAGATTGAGGCCACTATTATGATAGCTGCCATAGTTTCTAAAATGTGAGGCAAGATCATTAGCTTATGGTGAGGGAAGAAAAAATTGTGAGAGAGGGAAAGTTATTTTTTATGGTAGTGGAATTCACCAGGGAAGCCATCTTGGCCTGAAGCTTTTATTGGGAAAAGTGTTTAATTATAGCCTCTATGCCTTTAGTACTTAGGACTGTTCATATTTCCTTTTTCTTTTTGTTTCAGTTTAGCAAATTATGTTTAGGGATTGTTCCGTTTAATCTAATTTTAAAATTTATTGGCATACTATCGGTTTATCATTTAAATGTTTGTATGGATCTGAAGTGATGTGCCACTTCTTATTCCTGATACTGGTTTTTTGTGTTTTCTTTATTTTGTCTTACTCAGTCTTGCTAGAGTTTATCAATCTTACTTGACTCTTTTTTTTCTTTGAGACAGGGTCTCATTCTATCACCCAGGCTGGAATGCAGTGGTGTGATCATAGCTCACTGCAGTCTCAAACTCCTGGGCTCAAGTGATCCTCCTGCCTCATCCTCCTACATAGCTGGGAGTAGAGGCACACACCACCACACCTAAGATTTTTATTTTTTGTAGAGGAAGGGGTCTCACTATGTTGACCAAGCTGTTCTCGAACTCCTGGGCTCAAGCTATCCTCCCACCTCGTCCTCCCAAATTGCTGGGATTTCAGGTGTGAGTCACCATGCCTGACATTACTTGGCTTTTAAAAACATTACTGTTTTTAGTCCTTTTTCTTGTATGTTTGAGTTTTATTACTTTCTGTTCTTTATTATTTTATTCCATTCTTAGAGCTTAATTTGTGGATCTTTTCTAACCTCTTGAATTAGGTACTTAGATCGTTGATTTTCAGCTGTTCTTCTTTTCTAATTGTTTAGGGCTATCAGAACTATATCACACTTTTTTATGTAGCATCTTCATAATTTTTGAGTGGAAAATATTTTATAATTTCTATTGTGATATCTTTTATCCTTGGGTTATTTTTAAATGTTTTTCTTAATTTTGTGCCATTTGGGAATTTTCTAGCAATCTTGTTGACTTTAATTCTACTATGGTCAGACAGGATGCTCTGAATTATGTCAGTCTTTGCAGAATTTTGTAAACATTTTGTGCTCTTGAAAAAATGTACAGCCTATAGGTAGGTATTGAGTATTGAGTACAATTTCTAGATGTGTCAGGAGATTAAGTTTGTTAATTATGTTAAAATCTGTATACTTACAGCTTATTCTATCAATTGAGAAAGATTTTTTAAAGTCTGCTAGTGAGACTATACATTTGCTTCCTATTTAGTTCATTTAATTTTTTTCTTTCTGTATTTGAAGCTGTGTTATTATGTAAATACAAAGTTATAATTGTTATCTGTATGGTAAATTGGCTTTTGTCGTTATGAAGTATCTCATTTCTTAAAAGTTTTTGCCTTAAAATCTGTTTTGTCTGATACTAATATTACTACAGCATCTTTCTTTTGGTTGTTATTTGTATAGTATATCTTTTTTCATCTGCTAACTTTCACTTTCTGTGTATTCTTGTACTTTTTGTCTTTATTTTTAAGGTAGTATATTGTTAATTTTTTATTTTTTTGAGACTGAGTTTCACTCTCGTCGCCCAGGCTGGAGTGCAATGGCGTGATCTCGGCTCACTGCAAACTCTGCCTCCCAGGTTCAAGCGATTCTACTCGCTCAGCCTCTTCAGTAGCTGGGATTACAGGCATGCACCACCATGCCCAGCTAATTTTTGTATTTTCAGTAGAGATGGGGTTTCACCATGTTGGCTAGGTTGGTCTGGATCTCTTGATCTCAGGTGATCCACCCACCTCGGCCTCCCAAAGCGCTGGGATTACAAGCAATAGCCACCACGCACAGCCTCTTCTCTTTTTTTTTTCTAAAAATATCTTCATTTGGCCTTCATTTTGGGAGGATATTTTTGGTAAGTTTGAAATTTTAGATTGGCAGTTATATTCTTTCAACATTTCAAAGGTATCATTTATTGTTTTCTGTCTTATGTACAATCTGTGGAGAAGTGAACCATCTGTCTAAACTTTTCTATAAAAGGCAGGGCAGCAATATTTTTGGCTTTGTTGGATCATAAGGACTCTCTGCTGTGACTACTCCACTCTGCCATTGTAGCACCAAGGAATCCATAGGCAACATATTAACCAAGTAATGTGGTTGTGCTCCACTAAAACTTCACTTATGGACTCTGAAATTTGAATTTCATACATTTTTAATGTCTCACATTCTTTTAATATATTTTTCAACCATTTTAAATGTAAAAATTGGCCAGGCGTGGTGACTCATGCTTGTAATCCCAGCACTTTGGTAGGCCAAGGCAGGCACTGGAGGCCAGGAGTTTGAGACCAGCCTGGGCAACATGGTGAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAATTTTAGCTAGGCATGGTGGCACTGGCCTGTAATCCCAGCTACTCGGAAGGCAGAGGCACAAGAATCACTTGAACCCAGGAGGCGGAGGTTGCAATGAGCTGAGATTGCCCACTGCACTCCAGCCTGGGTAACAGAGTGAGACTCGGTCTCAAAATAAGTAAGTAAGTAAGTAAATAAATAAATAAAAATAAATATAAAAATCATTCTTATCTTGCTGGCTATACAGAAACAGATGATGGGCCAAATTGGTTATAATTTGTAACCTCTGATCTAATTGTTGCTCATTAAAGGACATCTATCTGTCTTTGGCCAGGTGTTGGGAGGCTGAGGTGGGTGGATCATTTGGGGTCAGGCGTTCAAGACCAGCATGGGAAACATGGCAAAACCCCATCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGCCGGGCGTTGTGGCACAGACTTGTAATCCAATCCACTGCACTCCAGCCTGGGTGACAGAGCAAGACACTGTTTAAAAAAAAAAAGAGAGAGAGACAGATTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGATGGAGTCTCGCTCTGTCGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGACGTGATCTCGGCTCACTGCAACCTCTGCCTCCTGGTTTCAGGTAATTCTCCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGCGACTACAGGCACCTGCCACCACGCTCAGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGATGGGGTCTCGCCACATTGGCCAGGCTGGTCTCGAACTCTGACCTCAGGGGATCTGCCCATCTTGGCTTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGTGTGAGCCACTGTGCCCTTCCCTGTCTCTCTTTTTTTGGCTGCTTTTAAGAGTTTAGTTTTCAACGGTTTTACTAC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Seq C2 exon
ACATGGAGCCCAAACCTGCAACCAAGAAGGCTACACGAACAAAGGCTATTTCTGAAGATTTATCACAGGAGGCCATACTAGAGAAACTTACAGAGAATGGTCTGTGGGATTCCAGAATGGAAGGGTTATGGAAATGGAATGATAGGATATTGAGATTACAAAATAATCAGGAGAATCATTTGAGTCAAAGAATAATTCCACTCAAGAAGACTCCCACTAGTCAAAGAGGCTTTAGATTTGAATCTATTCTTATTCCAGAACCAGGCATTGCCACAGAAGAGCTTCACAGCAGATGCCAAACACAAGAGGAAAATTTCACAGAGAATTTAAATTTGATTACAGATACCCATTTGGGGAAGATAATTTGCAAGGAGATGAAAGGCAGCAAAGCCATAAGGCAGACTTCAGAACTAACTTTGGGGAAAAAATCCAATAATAAGGAAAAACCCTACAAATGTAGTACATGCGAAAAGGCCTTTCATTATAGATCATTGCTCATTCAACATCAAAGAACTCATACTAAAGAAAAACCTTATGAATGTAATGAATGTGGGAAAACATTCAGCCAGCCTTCATATCTCAGTCAGCACAAAAAAATCCACACTGGAGAAAAACCCTATAAATGTAATGAATGTGGAAAGGCCTTCATTGCTTCTTCATCACTTATGGTACATCAGAGAATTCACACTAAAGAGAAACCTTATCAGTGTAATGTGTGTGGGAAATCTTTTAGCCAGTGTGCCCGTCTTAATCAGCACCAGAGAATTCAAACTGGAGAGAAACCCTATAAATGTAGTGAATGCGGGAAAGCTTTTAGTGATAAATCAAAACTTGCAAGACATCAGGAAACTCACAATGGTGAGAAACCCTACAAATGTGATGATTGTGGGAAAGCCTTTAGGAACAAGTCATATCTTAGTGTACATCAGAAGACCCACACTGAAGAGAAACCATATCAGTGCAACGAGTGTGGGAAGTCTTTTAAGAATACCACAATTTTTAATGTGCATCAGAGGATTCATACTGGAGAGAAACCTTTTAGATGTAACGAATGTGGAAAAGCCTATAGAAGTAATTCAAGCCTTATCGTACATATAAGAACTCACACTGGGGAAAAACCCTATGAATGTAATGAATGTGGGAAAGCATTCAACCGCATCGCAAATTTCACAGAACATCAGCGAATTCACACAGGAGAAAAACCCTATAAATGTAATGAATGTGGGAAAGCATTCATTAATTATTCATGCCTTACTGTACACCACAGAATGCATACAGGAGAGAAACCTTATAAATGTACTGAATGTGGAAAGGCCTTCATGCGTTCTTCTTCTCTAATTATACATCAGCGTATTCATACTGAAGAGAAACCTTATCTGTGCAATGAATGTGGGGAGTCTTTCAGAATAAAATCACACTTAACTGTACATCAGAGAATTCACACTGGAGAGAAACCATATAAATGTACTGACTGCGAGAGGGCATTCACCAAAATGGTAAATCTCAAGGAGCATCAGAAAATTCATACTGGAGTGAAACCCTATAAATGTTATGACTGTGGAAAGTCCTTTAGGACTAAATCATACCTTATTGTACATCAGAGGACCCATACTGGAGAAAAACCATATAAATGTAATGAATGTGAGAAAGCCTTCACTAATACATCACAGCTTACCGTGCACCAACGAAGGCATACTGGAGAGAAGCCCTATAAATGCAATGAATGTGGAAAGGTTTTCACAAGTAACTCAGGCTTTAATACACATCAAAGAACACATACTGGAGAGAAACCATTTAAATGTAATGACTGTGGGAAAGCATTTAGCCAGATGGTACATGTCACAGAACATCAGAAAATCCATAGTGGAGAGAAGCCCTATAAGTGTGATGTCTGTGGAAAAGCCTTCAGGAGGGGTTCTTACCTTACAGTGCATTGGAGAACACACACTGGAGAAAAACCCTACACCTGTAAGGAATGTGGAAAGGGTTGTATTACTCTATCACAGCTAACCCTACATCAGAGAATTCATACTGGGGAGAGGCCCTATAAATGTGAAGAATGTGGAAAAGCCTTCAGAACTAACTCAGACTTTACTGTACACTTGAGGATGCATACTGGAGAAAAACCCTATAAATGTAATGAATGTGGAAAAGCCTTCAGGAGTAGTTCGAGCCTTACTGTACATCAAAGAATACATCAAAGAGAAACTCAGTTAATATAAAGAACAATAAGTCATTCACCTAGATGTCAACTCCACAAGATGAATCTTATAAACTATATTTTATGAATATAGGAAAATCTTCATTAGGAATTTATCAGAAAGTATACAGAGAAACTATAAGCAATTATGTGGGAAATCATTTAATAATATTAAATCTTAGAAGTTATAAGGAAACTCTCACTAGAGGAAAATAATGAACAAATGAAAGTGTTCATCCAGATTTCATACTTTACTCATTTAACAAATTATCTTTAGTTAATTGCCTATATATGTATTTGCCTATTTTTCTATTCATTTATCTGTCTTTTCTTATAAACCTGGAGGTGCTTTTTATATATTTTTGATATTAATCCTTTGTCATTATGTAGCAGATGTTTTTCTTAATCTAGCATTTGTCTTTATACTTTATAGTAATGCACAACATTTTTATAGGAAAATATTTGTATCATTTCCTTTTTAGATTTTTTATTTTACTCATTTTACTTAAAAGAGATCTCCTTAATCCCTAGGTTATACGTAGTATCCTAAATGTGTTTTTAAGATTTTTATGATTTTATTTTTTACACTTAAGTCTTTAATCCCTCTGGACTGGATGGTTCTTCATAGGAGAGCAACTGTAGGTGATCATTATCCTGTGAAAATATTTTGAACCTAAAAAGCACTCAGGGAAATGCAAATTGAAATGCTCAGTGAGATGAAACTTCCCCTTCATGGATCTGGCAAAAATTAAGAGATCTTTTGCTAGCTATTGGGGTTTGGGAAACCATGTACTATTACTTAAAGGTTGTGTAACATACTTCCACCAGCAGTCCAACAATATATGTTTAAAAATTTAAAACATATATACTCTTAGACCCAGCAGTCTCACTTTTGGAATCTGTCCGTTAGAAATAAAAGCAGCATCAATGCATAAGAATGTAAATAAACATGTTTGTTGAAGTACTGTTTGTAGAGGGGGGCAAAGCCCCAACTGCAAACAAAGTGAATGCCCATTAATAGGGAACTGGTTAGATAAATTGTGACATACCCATATTATGGAACAGTGTGAGAGTAATTTTAAAAACGACTTATATCTATGCTAGCTGATTTCAATGTATTTCCACAATGTATTGATAAATAATTGCTTTATAACAAATGTATATATACAATATATCATTTTTGTTAAAATAATCACACCCATTTATTTTGTGTTTATGTGTGTGTGTGTGGTTAGATGCACATGGAGACAGGTATGGAAGAATATACACCAGGCTGTTAATATTGATTACCTTGAGGGGAGTGAGAAAAGGAGAAGTAGAGATAAGGGAAGGGGAGACTGTAAAAACAGAAAAATGTAAATGCTGCCTTTATGGTATAAAACTGTAAATGTAATATTATGTAATTATGTGAACTTTTGAGAGAGATGAAAGGATGGTCTCCAAAAAATTAATGATGGTTATTTCTGTTTTAGTGGTTCATCAATTTTTTGTTTTTTACTTTCTTTTCTGTGTTTTTAAGTTAATTTTTTCCTTGCAATGAACCTGTAATATTTACATTAAAAGGAAAAATATT
VastDB Features
Vast-tools module Information
Secondary ID
ENSG00000197566:ENST00000311331:5
Average complexity
IR
Mappability confidence:
NA
Protein Impact
Alternative protein isoforms
No structure available
Features
Disorder rate (Iupred):
C1=0.093 A=NA C2=0.082
Domain overlap (PFAM):
C1:
PF0135222=KRAB=PD(0.1=0.0)
A:
NA
C2:
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Main Inclusion Isoform:
NA
Other Inclusion Isoforms:
NA
Associated events
Other assemblies
Conservation
Mouse
(mm9)
No conservation detected
Fruitfly
(dm6)
No conservation detected
Primers PCR
Suggestions for RT-PCR validation
F:
No suggested primer sequences
R:
No suggested primer sequences
Band lengths:
Functional annotations
There are 0 annotated functions for this event
GENOMIC CONTEXT[edit]
INCLUSION PATTERN[edit]
SPECIAL DATASETS
- Autistic and control brains