HsaINT1047393 @ hg38
Intron Retention
Gene
ENSG00000181315 | ZNF322
Description
zinc finger protein 322 [Source:HGNC Symbol;Acc:HGNC:23640]
Coordinates
chr6:26643659-26658646:-
Coord C1 exon
chr6:26658558-26658646
Coord A exon
chr6:26643729-26658557
Coord C2 exon
chr6:26643659-26643728
Length
14829 bp
Sequences
Splice sites
5' ss Seq
ACGGTAAGT
5' ss Score
11.81
3' ss Seq
CTTGTCTTTGTGTTTTACAGAAT
3' ss Score
11.32
Exon sequences
Seq C1 exon
GAGAGGCAAGAATTGAGTGTTGTGAATAGTTCTGAACTAGAGACCTTTTGAAACCAAAAGGAAGATGGTCTTGAGTCTTTCTTGTTACG
Seq A exon
GTAAGTGGTATACCAGGCTCTGTTTCTGTATAAATGTGGATGGGGGTGTGGGGTGGGGCAGGGTGAAAGACAGGAAAGTATGGGAGAAGATATATGGAAAAAGAGAATGCCCCTTTCTTAGCTCCTAAGATAGCAGAGTGATAAAACTGAGCCCTATCCTACCAACTTAAGGCTATTTTCTACTCCTTTTCAACATGCATGCATATTCACATTAGGCTTGCAGTAATTGCTTTTTGATTGATTTGTAGCACAAAGAGGGTAGTATGCCTAATGCTTAGGCAGGCTCTGGAGTCAGAAGATAGGTATTGAAATCCTGGCTCTGCTGCTTACTATTTGTAAGTTGTTGGGTGATTATCTAACTGCCCTAAGCATCAGGTTTTCCATCTATAAGATCCAAACACTGGTATTAATACCTATTTCATAGGGTCCTTGGGAGGACTAAATGAGATAATCCATGTAATCAATGAAAAATAAATGAGAAATTTCCAAGTCTAAGGCCTATAAACACCATCTAATTTTTAAATAATGCTTTACTAACTTTGTCTCTTGGTCCCATATACCCTTTAAGGATAACCATGAACTCTCAAGTTGTATGAATTAGCCTGTCTGCTTGGACTTTTGTCGTGTTCCAGTTTATTCCTTTCACTTCGACCCTAGGCAGGAAAGAGTACTAGTCTCTTCCTAGGATGGGGCAAGAGAAGCATCCTGAAGGAGGGTACCCTGGAGCTAAGACTTGAAAGATGTATTTGGGCTTGCTAGATGAACCAGCCAGGGCTACTGGTCTAGTCTGTTATACAGCTACTGGGGGTCCAAGGATAATGATTGCCTTTTTGTTCTGGTATTTGTTCACACTTTTCATTTATTCAACAAATGTACTCTAGGTAGTAGGGATATTACAGTAAGCAAAAGACTAAGTCCTAACCCTAATAGAAGTTATATTTTAGTAAAAAGACAAACGAATAAATATAAAATGTATACCATAAAGTTGAATGGTGATAAGTGCTGTGGAGAGAAATAAAATGTGATAAAGCAACACAGGCTATTTTAGATAAGGTAGTCAGGGTATGCTGCTTTTTGAGGAAGTGATCTTCAGGCAGAGACTTGAGTCCAATAAAGGAGTAAGCTGCATGGGGAAGAGCATTCTAGGCAGAAGGAACAAGTGCAAAAGCTCGGAGATGGCCTGTGAGGCTGAAGATAACGCAGAGGTGCCACATTATGTAGAGCAGTAAAAACTTTGGATTTTATTCTGAGTGTGCTAGAAAACAGTATTTTAAATTAGGGAAGTGTCGTGATTTTTTTTTTTTTTTGAGATGGAGTCTTCGCTCTGTCATCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCACAATCTCAGCTCACTGCAAGCTCTGCCTCCCAGGTTCACACCATTCTTCTGCCTCAGCCTTCCAAGTAGCTGGGACTACAGGCGCCCGCCACCACACCTGGCTAATTTTTTTGTACTTTTTAGCAGAGACGGGGTTTCACCGTGTTAGCCAGGATGGTCTCAATCTCCTGACCTTGTGATCCGCCAGCCTCGGCTTCCCGAAGTGCTCGGATTACAGGCATGAGCCACCACGCCCGGCCTTATGATCTGTTTTGAGGTTTGACACCCAGACTTATTTTTTAGGTGTTGACATCTAAAAAAAGCTTGGATATGAATAGGAAAATTATTTCCTTATTTATTCAGTTTTTTTTTTCTTCTTCTTAATGCCCCACACTTCATTGGTTGTTTAGGGCAAATAAGACATCTTGGACTGATAACTTTAGGGAATAATGTAAATGATTTGCCTGGCTGTGACAAAACTAAGAATCCTTTATTTTCACTCTATTCTCCTTTTGAGCTTAACACTAATACAAATTTTAAAAGACAAAACCTTTTATGAACCCCCCATCTTATAACAGCTATTTGTCTGTATCCCGGCATATCTTTACTTAGTTGTGATTCTGAGTTGGAATTCTTCCTTTTCCTTCTAATATTTCTCCATAATTTTTTTCTAGTTTTTGCATAATCTTCATATTAATCATTAACTGGCCAAATTGTTTTATTAGTTATTGCAAGTGGGTTTTGAACAAGGCTTTGCACAAGAATCAGGCATAGAAAATGGGCTTAATACATGTTAGTGGTTTTGTGCATGTGAAGGTAGAATTAAGAAAATAATAGAATCTACCATTTATTAAGCATCTACTGAGACCTAGGCATTGAGCTTAGTACCGGCAGTGTCTTTGTTCTCATAGCAACTCTGTGAGGAAAAAAGAGAATATTGAAGTTGAAGGAAATTAAGTTACTAACCCAAGTTCTCACAGCTACAAAGGAGGAGAGTGGGAATTTGAACCAAAATCTGCATCCAGAGCTTAAACTGTCAGTATTAACCACCAAAATAAACCAATCTTTAGCCACCATGTTTTTTGAAAACCAAAATAAAATACCTTTTAATTTTGAATAAGTACAGATATACAAAAAATTGCAAAATGGTACAAAGAACTCCCATATACCCTTCACTCATATGCTCTAAATGTTAACATTTTACCATGTTTGCTTTATGATTTTGCCTCTGTCTATTAAACAAACGTTTTAGTCTGTTTTGGGCTGCTATAACAGAATACCATAGACTGAGTAATTTATAATGAACAGAAATTTATTGGCTCATGATTCTGGAGATTCGAAAGTCCAAGACGGGGGCTGGCATCTAGTGAGAGCCTTCTTGCTGTGTCATTTCATGGCAAAAGGGCAAAGAGAGGGTGAGAGCAAGCAAGAGTGCTCAGAAAGGGACCAAACTCATCTTTTTGTGAGGAACCGACTCCTGAAATAATGGCATTAGTCTATGAGGGTGGTGCCCCTGTTACCTACATACCTCCCATTAGGATCTGTTTCCCGACATCATTGAATTGGGGATGAAGTTTCCAATGCATTAACTTTGGAGGACACATTCAAAGCATAGCAATACACATATACATATGTATAGATTTTTCCCTGAGCCATTTGAGAATAAATTGTAGACATGTCTCTTCTCAAACAGAGAATCAAGCCATGGAATCCTGCTCTCCTATGCATGTACAGTACTGCTAGCTACATGCCATCCCTAGGAGAACTGAGAAAACAGTCATTCGAATACATTTTCTTTGGGGACTTCTTTTCTAGAACCCTAATTGAGAAAGCCTGTCCTAAATATTCAGTTGTATATTTACTAAAAACAAGGATATTCTCTAGAAATTATCATTACCATTATCGGAGTCAGGAAATTAACATTCATACAATAAGTACTATTATCTAATCTCCAGACCTTATTCAAACTTAGCCAATTGCTCCACTCATGTTGTTTAAGACAAAAAGAAAAAAATGTTTTCTGTGGACCAAGATCTAATTCAGCATCAGTCATTTAATTTAATTATAATGTTGTCCCTATTGTGAACATATCTTCAGACTTTGTCTTTCATACCTTTGACATTTTTTGAATATTTAGGCCATTTATTTGGTAGTTTCCCTCAGTTTGGGTTTTTCTGATGTTCCCTCGTGATCAGATTCAGTTTAGACATTTTTGGCAAGATACCGCAGAAGTGATGTTATGTTTTTCTCTTTGCATCATATTAGGAGGCTCATGATGTTTTATCTCATTACTGGTCATGTTCACTTTAGTTGAGGATACCATTAGGTTAAGGTGGTGTCTTCCAGGTTTCTATACTGTGAAGTTACTCTTTTTATATTTATAATTATTAAATATCTAGTGGGGAGATATTTTCAGATTATGTAAATATCTTGATTCTCATAAAATTTTTCATCCAGTAGATTTTTGCACAGTACTCTTCTTTTGATTGAACATCGTGAAATTTTTAATTCCATCATTTCTTCTATATTTGTTTGCTTTTCTAATGCAAAAAAACTTTCCCTTCTATACACTTTTTTTTAATGAGTACAAATTCATGGATTCTTATTGTGTGACTAATTTATTACTGTTATTACTTATTTCAATGTTCTGCTTGTTCCAGATTTGTACAGTGGCAGTCCTTCCATCCTGAATTGTGGGTCCTTCTGGCATATTGCACCACTTTTTGAGCACTTCCTTACTTTCTGACACATCAGGATGGTCCAGGCTTATCTTATACTTTCCAAACCGTGGAAACAGCCATTTCTCCAAAGAGTCTTGATTCTTTTCAATGTAGAATGGTATTTAGAAACCCATGTCTGAATGCTTGGTATACTCATTACTACTAGGATTTTATTGTTTCCATGACTTCTCAGCAAACATTACTAGGAAAAAAAAATAAACATACGTAATTTCACACATATATACGTTTCTTTATTCTCTATATAAACCTTAAAATCTTGACTTATACTGGTACTTCTAATTCCAGTTAAACACTACAGAGTTCATTCTAGCCTTTCTCTTTTCTGTTTGTAGCCTTCTTCATTGACAATGGGGAATCTAGGTGACATTATCCATAGTATATTTACTTATTTATTCGGTCCTAGGATACACATTAAGTAGTGTACCCTTATCCCAACAGGGGAGAAAATCTGTACTGATTCGAGTTATTTTTATCTTTAGATTGAATATACATAGTCCCAATATTGTGTTAGAGTTATTTTTTTTTCTCTTCTGTGTAGTTGTTATTTATTTGAAACACAGGCGCATTTGTTTTTATGCTTTTCTCTTCCATCTTGACTATTTAGTTCATTAGTTCATTCATGTATTGAATATGTAAAATGTAACATAATTCTAAAAGTAAAAATATGTGTGCTGTGTATTCATATTCTCAGAGAAATGTGACTCTTCTCCTCCACCCAATTCTGTTTTCCTGTGCCATCAATTCCATTTTTATCTGCCTTGTAATGATAACCAATCTCATTAGTTTCTTGTTTTTTGGGGCAAGTGGAGAACTACATATATAATTTTTTATTTTTACTTTCTTACATAAAATACAACATACTTTTTTACACTTTGCTTTTTTAAATTTATAATTTATCCTGGAAATCACTCCACATCAGTTGATAAAG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Seq C2 exon
AATGCTATCTTCTTTGAGAAGTCAAATTGTCAGGATCAGGAATGTATGTTTTCTTCCATCTGGATTCTAG
VastDB Features
Vast-tools module Information
Secondary ID
ENSG00000181315:ENST00000415922:2
Average complexity
IR
Mappability confidence:
NA
Protein Impact
5' UTR
No structure available
Features
Disorder rate (Iupred):
C1=NA A=NA C2=NA
Domain overlap (PFAM):
C1:
NA
A:
NA
C2:
NA
Main Inclusion Isoform:
NA
Main Skipping Isoform:
NA
Other Inclusion Isoforms:
NA
Other Skipping Isoforms:
NA
Associated events
Conservation
Chicken
(galGal4)
No conservation detected
Chicken
(galGal3)
No conservation detected
Zebrafish
(danRer10)
No conservation detected
Fruitfly
(dm6)
No conservation detected
Primers PCR
Suggestions for RT-PCR validation
F:
No suggested primer sequences
R:
No suggested primer sequences
Band lengths:
Functional annotations
There are 0 annotated functions for this event
GENOMIC CONTEXT[edit]
INCLUSION PATTERN[edit]
SPECIAL DATASETS
- Autistic and control brains