HsaINT1047663 @ hg38
Intron Retention
Gene
ENSG00000181220 | ZNF746
Description
zinc finger protein 746 [Source:HGNC Symbol;Acc:HGNC:21948]
Coordinates
chr7:149477564-149492972:-
Coord C1 exon
chr7:149492859-149492972
Coord A exon
chr7:149477756-149492858
Coord C2 exon
chr7:149477564-149477755
Length
15103 bp
Sequences
Splice sites
5' ss Seq
CAGGTAAGG
5' ss Score
11.08
3' ss Seq
ACACTCACTCCCTTTCCTAGGCT
3' ss Score
8.47
Exon sequences
Seq C1 exon
ACTACGCCATCTCCAAGCCCGAGGTCCTCTCCCAGATTGAACAAGGGAAGGAGCCCTGCAACTGGCGCCGCCCTGGCCCCAAGATTCCAGATGTTCCTGTGGACCCCAGTCCAG
Seq A exon
GTAAGGGCTGGGAGAAGGCCAGGGAGGCATCAGGTATTGTGCAGGAAACAGAGACGGAAAGGCCAGAAAGGGTGTGATCTTTCCAGAGAGAGTCGAGGAGAAACATGAAACTTACAGGTTTTATGTCTTGAGTTTTTTATAGTTGAGTTTTAATCTCTAACTTAGTCAGCTAATGCTCCAGAAATGAACACTTTCTGTCAGGGAAACAGGTGGCAAACCTAATCTTTTAGGAAGAGACAAAGGCAGGGCACAGGTTGAGGGGAGGGAGAGGAGAACGCTGAGAGGGAAGGCAGGAGCATAGTTGACCCTTAACGCAGGGGCCAGGGGCACCAGCCCCCAGTCCCACGCAGCCAAAAATCTATGTATAACTTTTGACTCTCTAAAAAGTTAACTGCTAGTAGTCTCCTATTAACCAGAAGCCTTATTGATACTATGAACAGTCAATAACACATATTTTGTATGTTCTGTGTGTTACATAGTGATACTTACAATAAGCTAGGGAAAAGAAAATGTTACTAGGAAAATCATAAGGAAGAGAAAATATATTTATTACTCATTAAGTGGAAGTGGAGCATCATAAAGGTCATCCTCCTCATTGTCTTCTTCAGATTGAGTAGGCTGAGGAGAAAGAGGAGTGGTTGGTCTAGCTGTCTCAGGGGTGACAGAAGCAGAAGAAAATCCATTTATAAGTGGGCCTGCATAGTTCAAACCCATGTTGTTCAAGGTCAGCTGTATATTGACAACAAAATTAATCCAAAGCTTTGCAAAGAGTCAGCCTTGCCTCCAAGAACCAACCTTAATTTAAACCAGTAGCAGTTGTAGAGCTACTTTGGTCTACATTGGTCAGCCTTATGGTTTGGTATTATTAGAAGCACACATTTATTTAAGGTGAATCTTGTTACCAGATATCAGCGTCTCAGATTTCCCTGGAGCCAGTCAGCACCTTTGAAAGTTAAGGGAAGGACAGGTGGACACAGGAGAAAAACCAAATTCCTAAAGTGAAGACCTGCTGGGTCATTTGACTAGGGAGACCACATCTCTGCAAGGCTCGACCCCTGATTCCTCCAGAAGACCCGCCCTTGACCGTCCCACCTGCCTTGGTTTTCCCTTTCGTCTGACACTGAGAAAGGTGGTGGTCCGCAGAGGCCCTCCTGTGCGCCACTTGTGTGAAATTAAATGCATCCCCCATGTTCGTCATCTCATCTCAGTCAGATTTGCACTTTCCTAAGGGCAGAAGCATGTTCCGGGCTGGCCGCTTTGCCAGTCGTCATCGGGACATTGACAGTTTAGCTCTACAGATGCATTTTTAAGAATCTTCTAGGCGTCAAGGACAGTGCTGAACACTAGAGGACAGAAAGATGGCTGAGAACAGATACTATTGGGCTGGAAAAGAGGGTTACAACCCGTGCGCGTCCCCAGCTTCCTAGCCTGGGTGGGAGGTTCTGGGTGGGTGGGTTTCGTTGTATTTACACCATGTGTGGAGGCTTCCCTCACTTCCACAGCATCATTCAATGAGAGTAAAGAGGGGCTGGAAATACGCTGGTTGCTGGTAAGACCCTGTAACACTCTCTAGCTGCACCGTATGATGTTCAGCAGCATCCGTGGCCTCTACCCACCAGTAGACAAGATGAGTAGACACAAACTCCACTGTCCATCCTGAGCCTGTTGGCAGGGATCTGTGTGGCGTTTATCCCTGTCCCCTTTGTCTGAGAAGCCAGGACTCCCAGCTCATCCCTTGCCACATTTGGCCTGACCCATCCCCTTGTGAGACCTCACCTCCCCTTCTCCTCACCTCCTGCACATCCCTCCACTGAGCCTTGTGGGACTCAGGGCTCAGCAGACCCGCCAGGTCCTGAGTGTTCCCTGCTCGGACTGAGCTCCAGGGGACTGCAGCCCTCTGAGTGCTTGTCATCCTCTTCCCTGCCTCTGTCTTGAGCCCAGGCCCACTGGGACAGGGTCCTCACCCCTCAGATTGTGCCTCTGCCAGCCTCAATCCCTCTCTAGAGACCTTGCCTTTGGGTCCCAGGCCTTGTCTTTTTGCTACTTCTGCAGACCTTCCCTCTCTTCTCAACACTCTTCCTGCCCTCAGTCTTGGCCATGGCAGCCTCCTTGTTGATTGTCCTGTGCCCCCCCAACCCATCCCACAGCCATCCGTGACTGTGACGACAGTGACTTTACCATACCCACCATCTCCATCTCCAGCACACCACTCCCTGGCCGCCTCCTGCCGTCCCTTCAATTCCGTCTGGTGTCCTGATTCCAGCAGTTTTCCAGTCCTTCAAGACCTGCAAGCCATCGACCCTGCTGCCTTTTCACTGCCCTGACTCATCCTCATTTCCCTCCATGCCCACCATTGTGGTCCCCCCTTACACACACCCTCAGCACTCTTGCCCCTGTTTTGTTCATTGTATCCACTTAGTGAAATCCATCGGTGTTCTGCACCTGCAGCCAAGCAGCTGCACGTGGCTGCAGAGAACCAGGTAAGCTGGCTGCTGGTGTCACGTGACATTCATGACCAGCGACTTCAGTGGGCGCTCTGCCACACAGTCACACCGTGTCTCCTTAGCCCAGGGGCCAGCAAACTGTGGCTGAGGGCCAAACCTAGCTCATCTGTTTCTGTATGGTGCACAGCTGAGAACAGTTTTATATTTTAACCCGTTTTTTAAAAGAGAAACGCACCACTCACACAGCCCTCTCCACGCCATCTGCCTGCACCAGTGCCCCCTTCTCTGCCTTCACTTCTGTGACTGCTAAACTGTCAACCCTCCAGCCAAAGCCCCACTTCGATCTGGCACCAGATCCCACCTCATGCCATCTTCTCAAGGGCAATACAAGCAATCCTGCCTTGACCTCTACCCCGGCAGCCACTGCCCGCTTGTCTGTTCCCCTTTGTGGCAGAGCCCTTGGGGACATCTGCGCTTGCTGTCTCCTGCACCTTCCCCCCCACTCTGTTACCCCTTCCACCAAAACCTCTCCAACCTCGGTTACCAGGGCCCTCCGTGGTCCTGAATGGTCTGTCTTCTTACTTGGCCTTGTCCCCTCTACTCTGCCACGTAGGCCCGTCATCTCCTGCCAGCCCCTCTCCTCCTGCCCTGATCCCCCAGTCTTGCCTCAGCCCAGCAGAGTAATCCCTTTTAGACCCAAGTCCTGGCTTTCCATCTGACCCGCACCGTCAGCTCACCACCTCCACTTTTCTCTCACTCTGCCCAGCTGCAGAGTGCTGTTCCCTGGTGCTGTTCCCTCCGCCCTGTGCCAGGGCCTTCGCAGTGCCCTCTACTGGGAATCCTCCTCAGGCAGGTCCCACCTGCAGGCCTTTCGTGTCATCGGCACTGCAGGCCCTCCCCACCCAGGACTCCAGGCCTACTTTCCTGCTTTGGGTCTTCCGTGTTAGACAGTGTCACATAATATATATGTTTCCTATTTATAGATTCATCGTATGTCAGGTCTCCTCCATTAGAATGTCAATTTCAAAAGTATAAAAATTTTTACCTGTTTAATCATTTTAGGAACCTAGAGTATTGCCTAGTACAGAGTAGGAATTCAATAACTATTTGCTGAATGTATGCTGTTTCAAAATTTAAAACGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGAAATAATGTATTTCTGATAGCATTTAAATTCCTTTTTAGGTCTCCCAGGCCTCCCTAGGAATTTTCTGTTTATTCTTTCTATCCACATTTTAAAACGTCTGCTGTGTACTTTGGTAGCTGTAAACAATATATAATACGGTTTTTTGTGTTCTGAAAAATTACATAGATGTCATTATATTTATCACTCATTATTCTGTATTTCAGACTTATCCATGTTGATACATGTAGATCAAGTTCATTCCTTTTAACAGATGCTTAATATTCCAGAAGCAACTATATTGTAACTTATTTTCCATTCCTCCACTGATTGGCACTTAAGCTTTTTCTGATTGTTCACTCTCACAAGCAATACTGTAGTGAGCGTTCTTGCGCCTGTTTTTTTGTGGCCCTGTGGGGATGCTGCTCCAGGGAGTAGACCCAGCGGTGGCCTCACCACGTCGTAGGCTTGATTTCATCTCTTCCGTTACTGTATGGCCCTCCCCAGGGGTACCCAGTGCCAGCGGGTGCTCCTAGAACTTGCTTCCTAACGTCTGCCCAGTTTCCATAATTACATTTTTGCCGACCTGATGGGGGTGAGATGGCCTCTCGTTTCAACTTGTATTTTCCCCCTTAAGTTGCACGCCCTTTTTATACGATTATTTGGCTGCTTCTCCAGTGAGTTGTCTTCTGTTTTTCTATTGAGATATTCTTCATTTTCTTCTTGATTCAGGGCTTCTTTGTATGTGTTCTAGATACAAATCCTTTGTCTATTATTTGTGTTACAAACATTTTCTCCGTGTCGGTGGCAGGTCTTTAACGTTGTAGTTCTTGTATGGAAGTTTTCACTGTTGAAAGAGTCAAACATGTCAGTCTTTTCCTTTATGATCTGTGCTTTTTCTGTAGTGAGATATCCTTGCTTACCTCACTCAAGGTCAGAAAGATACTCTTCTCTATTTTTTTTATAAATTTTTAAAAGTTTTGCTTTTCAAATTTAAGTCTTTAATTTATCTAGAATTAAAATTTGTGTAGCTTGCAAGGGAGGGTTTCAGTTTTTTCTCCCACAACGATGGTCTCATTTTCCAACAAAGTTTGCTGAATGTGTTAGCTTTTCTCCACTGATTTGTGATGCGATTCTGTCCTGAGCTGGTTTCTGCATGTGCACAAGTCTGTTTCTGGGTGCTTGCTTCTGTGTCATTGGTCTCTTTGTCAGTCTCTGCACCAACAGCTTGCTCTTTTAGCTTCATAATAAGCCTTGATATCTAGTAGACTAATCCTTCTCTGCTTGTTCTTCAAAAAACTGTCTTGGCTATTCTTGGATATTTGTTCTTTTATATGAATTTTGGGATCTGTATGTCAAGTTCCTAAGAAAATCCTGTTGGAAATTTGATTGGAATTG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Seq C2 exon
GCTCGGGGCCCCCAGTTCCCGCCCCAGACCTCTTGATGCAGATCAAGCAGGAGGGTGAGCTCCAGCTCCAGGAGCAGCAGGCCCTGGGCGTGGAGGCGTGGGCAGCCGGGCAGCCAGATATTGGGGAGGAGCCCTGGGGCCTCAGCCAGCTGGATTCCGGAGCAGGAGACATCTCCACGGATGCCACCTCTG
VastDB Features
Vast-tools module Information
Secondary ID
ENSG00000181220:ENST00000340622:4
Average complexity
IR
Mappability confidence:
NA
Protein Impact
ORF disruption upon sequence inclusion
No structure available
Features
Disorder rate (Iupred):
C1=0.615 A=NA C2=0.985
Domain overlap (PFAM):
C1:
PF0135222=KRAB=PD(0.1=0.0)
A:
NA
C2:
NO
Main Inclusion Isoform:
NA
Other Inclusion Isoforms:
NA
Associated events
Conservation
Chicken
(galGal3)
No conservation detected
Zebrafish
(danRer10)
No conservation detected
Fruitfly
(dm6)
No conservation detected
Primers PCR
Suggestions for RT-PCR validation
F:
No suggested primer sequences
R:
No suggested primer sequences
Band lengths:
Functional annotations
There are 0 annotated functions for this event
GENOMIC CONTEXT[edit]
INCLUSION PATTERN[edit]
SPECIAL DATASETS
- Autistic and control brains