HsaINT1047687 @ hg38
Intron Retention
Gene
ENSG00000102984 | ZNF821
Description
zinc finger protein 821 [Source:HGNC Symbol;Acc:HGNC:28043]
Coordinates
chr16:71864903-71880023:-
Coord C1 exon
chr16:71879907-71880023
Coord A exon
chr16:71865049-71879906
Coord C2 exon
chr16:71864903-71865048
Length
14858 bp
Sequences
Splice sites
5' ss Seq
ACTGTGAGT
5' ss Score
7.94
3' ss Seq
GACCAGTTTGTGTGTTCCAGGTG
3' ss Score
8.71
Exon sequences
Seq C1 exon
GTTAGCATCTTGCAAGGAGGTAGTAACATATCCAGTCGTGAAACTGGGAAAGACCAGAGCTCTTGCATCAGGGAAACATGTCCCGTCGGAAACAGACAAATCCAAATAAAGTTCACT
Seq A exon
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Seq C2 exon
GTGACAGTGAGGGTGATGAAGAGGAGACGACACAAGATGAAGTCTCTTCCCACACATCAGAGGAAGATGGAGGGGTGGTCAAAGTGGAGAAAGAGTTAGAAAATACAGAACAGCCTGTTGGTGGGAACGAAGTGGTAGAGCACGAG
VastDB Features
Vast-tools module Information
Secondary ID
ENSG00000102984:ENST00000446827:2
Average complexity
IR
Mappability confidence:
NA
Protein Impact
ORF disruption upon sequence inclusion (1st CDS intron)
No structure available
Features
Disorder rate (Iupred):
C1=1.000 A=NA C2=0.992
Domain overlap (PFAM):
C1:
NO
A:
NA
C2:
NO
Main Inclusion Isoform:
NA

Other Inclusion Isoforms:
Associated events
Conservation
Zebrafish
(danRer10)
No conservation detected
Fruitfly
(dm6)
No conservation detected
Primers PCR
Suggestions for RT-PCR validation
F:
No suggested primer sequences
R:
No suggested primer sequences
Band lengths:
Functional annotations
There are 0 annotated functions for this event
GENOMIC CONTEXT[edit]
INCLUSION PATTERN[edit]
SPECIAL DATASETS
- Autistic and control brains