MmuINT0004585 @ mm9
Intron Retention
Gene
ENSMUSG00000026774 | 4931423N10Rik
Description
RIKEN cDNA 4931423N10 gene [Source:MGI Symbol;Acc:MGI:1918231]
Coordinates
chr2:23068180-23082508:+
Coord C1 exon
chr2:23068180-23068353
Coord A exon
chr2:23068354-23082401
Coord C2 exon
chr2:23082402-23082508
Length
14048 bp
Sequences
Splice sites
5' ss Seq
AAAGTAAGG
5' ss Score
6.6
3' ss Seq
TTTATTTTGTTATTTTACAGGAC
3' ss Score
11.38
Exon sequences
Seq C1 exon
GCTGTCCAAAGCTGGGAAGATAAAATCGTGTGTTTTCTGCTAGAGCACCATGCTAACCTGCACATTAAAGACAGCATGGGTAACACTGCTCTGCACTATGCTGTCTATAGCGGGAATTTAGCAACGGCTGCCAGGCTGCTACAGTACGGAGCAGATATTGAGGAAAGGACAAAA
Seq A exon
GTAAGGATCACTCTGCTTAGCAACAGGTGGGATGTATGCAGGGCTAATCACCCATGTTTAGAAGCTCATTTGTTCTCCGAATGAAAATGCTTAGACATTTGGAACGGAAATATTTTAAGTATTAATACTTTCGAAAGTTCAGTTTTCTTCTTTACACAAAAGACAAATGTATGTGAAAACACTGAATTTCTTAAAGGTAAGACTTGTGTTTTATTCAATAATTTATAAACATATTTTGTAAAAAGTAAAAATGACAATAAAACAAGATTAGCCTTGCAAATACACATCATCTTAAAACTCAAGACAATTTTGAATTAAGTGGAATTATTAATGCTGTTGACAAATTCTATCAGTTACTTATTCAGTCATGGTAGTGCTAATGGAAGAATAATGGAAACAAATTGACTAGGAATATTCAAGCCAATTTGGGAATTATGTAATTAAAACAAAATGCCAAGAAGGTTTTGTTAGTTGTTTAGAATTTTTCCAGTTTCTTTGTATGGATAGGACATTCTTTAGTTTCAGATAATTTTGCCTAGTTTGAGAGAAGATGTCACTGAGTTAAAAATATATCAGAGGGCAGCTTTTAGAGCACACAGTTGATGTTACATTAACTTTTCATAGGGAGATATAGTGACTTTCTGTAAGTTTCAGGGTGCTCAAGAGGGACACTGGGGCCGATTCCTGGGGAGTAAGGAGTTTTTAAAATTTTGACTTTAATAAAGCAGGGGGTCTGGGTAAATTAACAATATTAGAGTAAGGACATGGTATCACTTTCACTTGTACCAAAGTGGCACACAGAGAGAAGTTTGAAAACAGAGAGATGTGAGTGTGGGTACATCAACTGCTAAAGGTAGTCTGGGTAGACAGAGTTTTGCTGTAGACTACAGGAACAGTTGTAACCCTCTTATTTGAAAGCCTCTTCCGTATGTACTGAGCTATGACTGAGCAACTGTGGCACGGGGTTGGGGTGGGTGGGGTGGAGGAGAACATTGTGGCTCTTTCCCAAAATATACAATGGCCGAGCAACAGTCCTGGACTAGACATGAAGGCATGTGACTCAGCATGGGATTTTCTTGATTCAGAGATGAACAGGCTCCCAAGGATGTGAAAGACAGGGGCCTATACTGGATATGGAGGCAGCAGCAAGAAAAAGGGGGAGGTCTTTAAAGGGTTATGCATTTCAGTAGAGGATCCGAGTCTCTTATTTTCAAGAGGGCCGGTGTCTCAGCTAGGGTTTCTATTGCTGCAACAAAACGTTATGATCAAAAACAAAATGGGGAGGGAAGGGTTTATTTGGCTTACATTTTCACATCTTTGTTCATCATTGGAGCTAGTATAGGAACTGGAACAGGGCAGGAACCTGGAGGCAGGGGCTGATGCAGAAACCATGGAGGAGTGCTGTTTACAGGCTTGCTCATCATGGGTTACTCAACCTGCTTGCTTATAGAACCCTGGACCACCAATCCAGTGACAGCCCCACTCAGAATAGGCTGGGCCACCCCCCATCAATCACTAATTATGATGGCTGACTCACTGCCCCATCTCTTTTTCTTTTTGTTCTTGTTTTATTTCATTGTTTTATTTCTTATTTTAACATATATAATAAATAAATGTAATAAACCAAATATATGGGCAAAAATACAAAAATCATATGATCATCTCAATGGAAGTAAAAAGAAAAAAGAAAAAAAAGAAAAAGTCTGATAAGATTCAGCATGCATTAATAAAAATTCTAGAATGAGTAGGACTGTAGGAAACATATTCCAACGTAATAAAGATTATGTATGACAAACCCATGGCCAATATCATCCTAAATGAATAAAACTATTAATATGCCCCATTAACATCAGGAATGGGAGAGGACTGCCCACTGTCCCTACTGCTCATCCATAATGTGATTGAAGCCTTTGCTGGAGCAATAAGGCAAGAGAAGGGATACAAATGGGAAAATATTAAGTCAAATTATTTTCAATTGAGGATTATATTCTCTTATACCCATTGTTCCCAAAATTTGACTAGAAAAATTGTAGAAATTATCAATAATTTCAGCAGTGTTATGATACAAAATTGACTTACAACATTTACCAGTCTTAATACATATGACTAACAACATGGACACGCTCCTCTTCCCAGTTTCTCAAATAAAATAAAATCTTTAGCATATACATAACAAAAGAGGTAAAAACTCTGCAATGAAAACTTTAAATATGTGAAGAAAGAGATTAAGAAACATGCTAGAATTTGAAGACCTCCCAAGTGTATAGCTTGGTAGAATATTTTTTCTTTTTTCTTTTTTTTTTAAATTAGATATTTTCTTTATTTACATTTCAAATTTTATCCCCTTTCCTAGTTTCCCCTCCAAAAATCCCCTATCCTCTTCCCACTTCCCCTGCTCCCCAACCCACCTGCTCCTGCTTCCTGGCCCAGGCATTCTCCTATACTGGGGCATAGAACCTTCACAGGACCAAAAGCCTCTCCTCTCATTGATGACCGACTTGGCCATCCTCTGCTACATATACAGCTGGAGCCATGAGTGTCTCCATGTGTTTTTTTTTTTTTTTTGATTGGTGGTTTAGTCTGGGGTTACTGGTTAGTTCATATTGTTGTTCATCCTAGGGGGCTGCAAACCCCTTCAGCTCTTTCGGTACTTTGTCTAGCTCCTTCATTGGGGGTCCTGTGCTCCGTCTAATGGATGACTGTGAACATCCACTTCTGTATTAGTCAGGCACTGGCAGAGCCTCTCAGGAGACAGCCATATCAGGCTCCTGTCAGCAAGCTTTCGTTGGCATCTGCAATAGTGGGTTTGGTAGTTGTTTATGGGATGGATTCCCCAGGTGGGGCAGTTTCTGGATGGTCATTCCTTCAGTCTCTGCTCTGAACTTTGTCTCTGTAACTCCTTCCATGGGTATTTTGTTCCACATTCTAAGAAGGGACAAAGTATCCACACTTTGGTCTTCCTTCTTGAGTTTCATGTGTTTTGCAACTTGTATCTTGGATATTCTAAATTTCTGGGCTAATATCCACTTATCAGTGAGTGCATATCATGTGTGTTCTTTTGTGATTGGGTTACCTCACTCAGGATGATATCCTCCAGATCCATCCATTTACCTAAGAATTTCATAAATTCATTGTTTTTAATAGCTGAGTAGTACTCCATTGTGTAAAGGTACCACATTTTTTGCATCCATTCCTCTGTTGAGGGACATCTGGGTTCTTCCCAGCTTCTTGCTATTATAAATAAGGCTGCTATGAACATAGTGAGGCATGTGTCCTTATTACAAGTTGGAGCATCTTCTGGGTATATGCCCAGGAATGGTGTAGCTGGGTCCTCAGGTCCAATTTTCTGAGGAACCGCCAAACTGATTTCCAGAATGGTTGTACCAGCTTGCAATCCCACCAGCAATGGAGGAGTGTTCCTCTTTCTCCACATCCTTGCCAGCATCTGCTGTCACCTGAGTTTTTGATCTTAGCCATTCTGACTGGTATGAGGTGGAATCTCAGGGTTGTTTTGATTTGCATTTCCCTGATGATTAAGGATGTTGAACATTTTTTCAGGTGCTTCTTGGCCATTCGTTATTCCTCAGTTGAGAATTCTGTTTAGCTCTGTACCCCATTTTTAATAGGGTTATTTGTTTTTCTGGAGTCCAGTTTCTTAAGCTCTTTGTATATATTGGATATTAGCCCCCTATCAGATTTAGGATTGATAAAGATCTTTGCCCAAACTGTTGGTTGCCATTTTGTCTTATTGACAGTGTCCTTTGCCTTACAGAAGCTTTGCAATTTTAAGAGCATTTGTTGCTTCTTGATCTTCAGGACAAGCCATTGCCAGTCTGTTCAGGAACTTTCCCCCTGTGCCCATATCTTCAAGGCTTTCCCCCACTTTCTCCTTTATAAGTTTCAGTGTCTCTAGTTTTATGTGGAGGTCCTTGATCCACTTAGACTTGAGCTTTGTACAAGGAGATAAGAATGGATCAATTTGAATTCTTCTACATGATAACTGCCAGTTGTGCCATTTGTTGAAAATGCTGTCTTTTTTCCACTGGATGGTTTTAGCTCCCTTGTCAAAGATCAAGTGACCATAGGTGTGTGGTTTCATTTCTGGGTCTTCAATTCTATTCCATTGATCTGCCTGTTGTCATTGTACCAGTACTATGCAGTTTTTAATCACAGTTGCTCTTTAGTACAGCTTGAGGTCGGGGATGGTGATTCCACCAGAGGTTCTTTTATTGTTGAGAAGAGTTTTTGCTTTCCTAGATTTTTTAGCTTGGTAGAATTAAGACTGTGAAATAAGACCTTCCTACCAAAACAGTTTACCGATTCAGTGAAATCACAATTAACATCCTCATCTCATTCTTCACATAAATGAAAAGAAAATCCTCAATATGGAACAACAAAAGACCCACAATAGCCAATTAGTCCTAGATACGTGTTTGTTTGTATGCCTTATGCTCAGTTTAAGTGCTGACATGTTTTTTTATGGTATCTTCTTCACCTGAGATCCTCTCTTCTATTTCTTGTATTCTGTTGGTGATGCTTGCATCTATGACTCTCAATCTCTTTCCTAGGTTTTCTAACTCCAGGGCTGGCTCCCTTTGTAATTTCTTTATTGTTTCTATTTCCATTTTTAGATCTTGGATGGTTTTGCTCATTTCTTTCACCTGTTTGATTTTTGTGTTTACTGTAATTCTTTAAGGGATTTTTGTGTTCCGTCTTTAAGTGCTTCTAGCTGTTTACCTATGTTCTCCTGTATTTCTTAGGGGAGTTATTTGTGTCCTTGTTAGAGTCTTCTATTACCATTACGAGAAGTGATTTTTAGATCTGAATCTTGCTTTTCTGTTGTGATGGTGTATTCAGGACTTGCTCTGGTAGGAGAATTGGGTTCTGATGATGCCAAGTAACCTTGGTTTCTGTTGTTTATGTTTTTATGCTTGCCTCTTGCCATCTGGTTATAACTAGTACTACCTGCCCTCACTATATCTGATGCCCTCAATATATCTGACTGGAGCCTGTCCTTCCTGTGATCCTGGTTGTGTCAGAACACCTCAGAGTTCAGCTGTTTCTGGGATCCTGGGATCCTGAGATCATGGGTGTGTCAGAACTCCTGGGAGCAACGTTGCCTCTGAGACCCTGAGATCCTGGTCTGACCAAGCTCCTATGATCCTGTGATCCTGGGCGTATTATAGTGCCTGGGAGTGGTGCTTCCTCTGGTTGTTGTAGGACTGGCTGCAGAGTTTGGGCCCAAGGTCTTCTCAAAGCACTGACCCAGACTGTAAGGAACCCGTGCCACTCATCAGGGTTTCTGCTTTTCTAGATCCCACTAGTCCCAGTTACTCCTGGTGGTGTTGGGACAGATGTATCTTCCACATCTCTGATCCTATGATCCTGGGCACGTTAGAGCGCCTAGGAACGGACCTTCCTGTGGATGTTGTGGGACTGGCTACAGAGTTCAGGCTGAAGGTCTGCTCAGGGCTCTGGGTCACAGCCCCATCTTTTTTTTTATCATTCATAATACATAGTTTTAATGCTATCAAGTAGGGAAATAATTTCATATTCATATGCCTGTACAGATTTACATTCAGCCCCAAAATACAATAAATTCATTCATTTCCACAAATGCATTCATGGTTACTTAGTGAAGATAGGAAACATTATAGCTCATTTCCTAAAGACTTTTTTTTTTTTTTTTGCTTGAAACAGTGCCTATTTTTTTCTTGTATTGAGAATATGTTTTTCTCACGTAACACATACGGATTAAAGTTTCCACACCCTCTCTTTTCTCAGTCTCTCTCCACATATCATTCCATATGGATCTAACTCATTTCTGTCTGTCATTAGAAAGCAAACAGATTTCTAAGAGATAATAGTAAAATAAAATAAGATAAAAGAAAAGCTAATACATAGAATTAGGTAAGACAAGCAGAAAAAAGAGTACAAGGGAAGACACAAAAATAAAGGGACATTGCTATGTAAACACTTTGCATAAAATTAAATAATGTTATTAGAAACAAAGTGGTGCTTCTTTCAGCTTCACAGCCTCATCTTAAGAAGGCATTTTCTCAGCTGAGATTTGCTCCTCTGAGATGACTATAGTTTGTGTCAAGTTGACACTCAGCACAGCAAGAGTTCAGGAGAGATTTCTTAGCATTAATGCCACGGAAGAGAGGAAACTGCTTGACTAGGTGGAGGGCACAGGGATTCAGGGATAGGTCAGGTCCAGCACCAGGGCTTTCTGATTCCCAAGTGTGGAAGGGGATAGGGAGCAGCAAGTGTGGTTACCAATATCCACTGTGATATGAACTCACTTTCTAGATGAAGGAGCCTGGCACTGGGAAGGGCTGTTAGTTCAGGACCTGCAGTTGTAAATACTGAAAGCCTAAGAGTAATAATGGTGATAGGAATCCTTTCTGTAATTTAGCTTTAGCTGTCCTGTGCAAAAAATTATTCACTGGGAGAAATGAATATGTACAAAGTATAAATCATGTGCCAGAAAATGTCAAGACTAGGCAATTTCTATTTTAAATTAAATTTGACACCCGATTATTGCAAACAGAAAATATTTCACATAAGTGGTTTTTAAACAATCATCCATTGGTAAACACACCATCAATAAGGGTATAAACAGTCCACAATTTAACTTTATAATTCTGCAGATACCTAGACTTTGAGGTCTCTTAGAGAATCAAATCTAGTCTTTATGATTTCATCTGACTGATTTGAGCCTAAGCAGAGAACACATCCATTATCTGAGACCTTAGTTTGCTCCAGTCTACAAGGAATCCATTTGAGTATTTCTTTGTGTCATGCAGTTATTCTGTGTTAGTATGTGAATTTACAACCCTTTACTTATGGTATATTGTGATATAAGTTTCTGAGTTTTAAACATTATATTAAGTTGGCATGTTGAAATTTTTCTTGGCCTGGGCTTGAGAGATGGCCTGGCAGATAAGAACCATTGCTGCTCTTCCAGAGGTCCTGAGTTCGCGTCCCAGCACCCTAGTCAGGCAGCTTACCACCATTTGTAACTCCAGCTCCAGGGTATCTGATACCAAGGATCAACCCTCTTCTGGCTTCCACATTGCAGAGTGCTTGCTGAGCATGATCACAACTCTATGTTTCCTTCATCTCCAGCATGGCAAATGTTTCCCTTGTTTATACTATAAATAATGAAACTTCCATTGGAATATCTGCAATCTTTTTTGGTTAATTATATTAACTAGACAGACAAGAGGTATATTACAAACAATATTTTTGTTTTATCTTTCACATTATTCTTTAAATAGTATAAGCTTTGTTATATTATAAATTATATATGTATGTATCTATATCTCTATTGGAATTTCATTGAGAAGTCATTGGATTTTAATTTATGATTAAATGAAATTTAATTTAATTTGACCAAATGAAAAGTAGCTACAAATAGTAATTAAAATAGAGCCATAATAAATGTGAATTAAGAATATTAGATAATCAAGGATAAGTGCACATACCTGTGATTTTAGCACTTAGGAAGCTATAACAGGTGGAACATGAGTTCATGCCACTCTAGGCTACAATTGGGACCATAAACCCCTCAAAAAGATTGTAATACTTGGGTCACACTATTATTATTAATAGTGAGAAGACATTTTGTCCTAAGCTTTCTAATAGCTAAGACAGTCTTCAACTTATAATATCAGAAAAGACACAGAGCACTTAGTCAGAAGCATTTAAAGTCATTTTGAAGATGCTAGATCTAATTACAAGTCAGTTTCTGTAGTGACCCATGTGGAGTTGTAGACTAAGGTTGATTTCTGGGTCCTGTGTTGAAACAGAATACAATGCTCCCAAGGGCCAAACCACAAACCAAAGAGTACACATGGAGGGACCCATGGCTCCAGCTACATATGTAGCAGAGGATTGCCTTATCTGGCATCAATGGAAAGGGGAGGTCCTTGGCCCTGTGAAGGTTCAATGCCCCAGTGTAGGGGAATACTAGGGTGATGAGGCTGGAGTGGTGGGTGTGTGTCAGATCACCCTCATAGAAGCAGGGGCAAGGGAGGATGGGATAGGGAGTTTGTGGAGGGAAAACTGGGAAGTGGGATAACATTTGCAATGTAAATAATTAAAATAACCAATAATAAAAAGAAATAGTTAAGTAAAGATATATTTAAAAAGAGTACAATTCTTACATTAAAGGGAATGAAAGATAATTTATTCTATCTCAAAACATAAATAACCATGGTTCAGGAACACAGATTTAGGTCACCCTAAATTCCTGTCCTGAATGTTCCAAAGTGGGAGCAGTTTCATGAAATGTTTATAGTAATAGAACAAAGACAGCATAAATAAAGATATTTTTCACATTCATTCATAGAAACAGCAAGAGAATGGTTAAAATGAAGTGGGGAGATCTTGCTATAGTCCTCAGATGTTATCTGACGATGCTCTTAGCTTTTTGGTTGGTGTGGGCTAGATGACTGTTTGTAATGGGAATTTACCTAATGATCAAAATATGTCAGGTTACATACAGAGGAGGGAAACACATGTCCATTAAGAGAGATGGAGATGGCCTAAAATAAGTTGGCTCTGAACTGTGACATTCCAATCTCTTTATAATTGTTGAATTTCTAATCAGTTAATCAGCCTTGCAGAAGGTTTAGTGGAAGGCACAGTTTCTGTCTGAGAACTTGCTTTAACATCTGCAAGGTGTCCTCAAGACCTGGATGTAGTGTCTAAGTCAGTAGAAAGGTTTCAAAACTTTCTTCAGCTGACTTGTTCAAATGCTAACTGTTGGCTCAAAATGCATTGCCAAATGAAAATTAAGCAAAAACTAAAGTTGCATAAAATGCATGGTGTTCTCACATATTATAATAGCTGATTGTTGGAACACAGTCCAATATGGAATCATGTGAAAATTCTGACTGCTTGTGAGAAAACTCCAAGAAAACATGTCTTGTGATATCTATTTCTTCAAAACAAAATTGTTCTTGGAATGTATTTTGTGCGTCTCCAAGTGTAACAAATAGGCTTGAATTTTCTTCAGCTGTTGTTATTCATATTCCTCTATGGAAAAACATGATTTTGCCATGTGTAGTTTGTCCTTGCGACTATGAGACTTTAGTCACCTCATTTTTAGCTCTTGCTCTCCCAGGTTCACTCCATAGACTAGAGCAGTAAAATAGCTGATCACAAAGTCTTTCTGTTTTAGCATGATACTTCTGCAATGGGAATAAGTTTTTTGGCTCTAGACATGGTTCATTAATTCAATAAAGCAATGAATACTTTTGTTACTGTGTTTGTGATTGGGTGTTTGAGATACAGATACAGTCTCTGCCCTCAAGAACACTGAGGTTTAGTTGGGAGCAATTACATGACCCTAAGATACTGAGATAAATGCAATAAGGGGAGCAAAATTTTATAGAAGTGAAGTTCTCTCAAAGTGAGTTTTGGAGAGGATGGGGGTTCAAGTCACAGCTGTAGACAGGTGGTGAAATTTCAGAGAATGGGCAGCATACATGAAAGTATAGTAGGGCGAGAAAGGAAGGATAGCTTTTAATGTCCTCTCCTTTATCCCTCATGTCTGGAGGCCTCATCTTCACTTTTTCTCTATCTGCTTCATGTGTTTAATAAAAATTTAAGGAAGAGAAGAAATATGTTTGGTGGATGTGCAGTCAGGTGTCGGGGAAGGGGGTGCTTCTGTGGGCTCATGCTGAAGTATCCCTCCCCCCTGAGGGATCAGCCACATGGACAGTATAGTATAGAATAGAGTTTATTCAGGGCATGGGGAAAAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGGAGAGAAAGGAGATAAGAGGAGTAGAGGCCAGCCGTGAGCATGTGGAGAGAGGAAAGAAGGGAATGTGGAGAGAGAGGGAAGAGGGTAAGGCAGCAAGGGCAAGAGAGAGAGAGAGAGAGGAGGGGGCAAACAGACCCTTTTATAGTGAGTCAGGCACACCTGGCTGTTGCCAGGTAACTGTGGGGCAGAGCCTAGACTAAGGGCCAACATTCCTGTTTTGGTTTAATTAAAAGAGGAAAAAATATAGAAAGAGGTGATGGTGGAGCAGAAATAAGGTTGTCATGATCTTTAGCTACTTCCTGCTGATTTTGGGGTGAAGTGTCTCTTGGGAACCTAGGAAAATGGGTATGGGAATGTTGGTCCAGTGTTAGGAAAGTGGGGTGTTTCCTCACTGTCCAGGGTCTGTGGAACCATCTGTGGATAGATCAGAAGGAACAGGTCCAGTAGAAGCATCTGTGTCTGTGAGAGCATCTGGGGGTTTCTTCTCTGGAGCTGTCCTGGATGCAGTAAACGTGCCTGGACTTAACAAGTTAATGAAACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACATACACACACACACACACACACACACACACATTATAGGTAGAGAATAAAGTTAAGTTAAGCACATATGTTTGGGAGAAATTTTTTCTTAGGGGTATATTTGAAAGGACATTTGAAAGGACATTTGGAACCCTTAGCCCTTGGTGGTTGGAGGAGAGTTGAGTTTCAATCCCAGGAACAGGAGAGAAACCACACCCTCTGGAATAGGTAGGTATACTTATGTGGACGGAGTCTATTGGTCCATGAGAGGTAGATCTGAGTGGGTATCCTGTACATTTGAAACTATTAGGTCTTGGTGGTGGGTTGAGGGAGTCCCAATCCCAGCAACAGGAGAGGAATCCCATCCTCTGGAATAGGTAGTAAGTGGGAACTTTAGGCTATTGATTAGCAGATGTATTTATCTGGATGAAGTCTATTTGGTCCATGAGAGGTAGGTCTCAGTGTGGGTTTCCTGTAGCTTATAAGTTTACAAAAGAGATAAATTTGTTAACAACATGAACAGTCTTTAAGATGAGCTTAGGAAAGACAAAAAACCTTTCTTGGAGCAGAAGGAACAAGAAGGGTTTGTTCCTTCTGTCTAGGAAACAATATACATAATGAGAAACAATTTTAAGTTTGTAATTGAGAGACAAAGGAAACTCAAAACCTTGACATTGTGAACATAATTAATCATATAGTTTAACATGAGAAATATAAAAAACAATCAAAGAAAACTTAAAACTTGAATTTGTGATTATACAATTGGATCATATAGTGGAGTGTTTTATTAGGGTTAGGCAAACTTATATGAACTTGAATAATGTTAAGACAGTGGCATAGGAAGAAGAGGAAATATGAAGCATTTAGTTGCTGGAAACTGAGTTTAGGTAAGGAGGTAACAGGCTAAATTTGTGAAAGCTTACATCTGAACTAGTTGCTGAAAACTGAATTTAGGCAAGGAAGTAACAGGTTACATGTGGAAAGCTTACATCTGAACTTGTGTGTTGTTTGTTGTTAAGCCTGTGAGAAAGAAAAACATGTCTGTCTTTGATAAGAAATCTGGTATTCTTAGCTAGTGAACTAATTTATTAATGGGCAAAAAAGGTGGATTACCTTAGGGTAAGGAGCTAGGTTTGTTTTCTAGCTGTCAAGTTAGCTGTCAGTTACCTTAGCTGTCATTGTAGTCAGAAATCTGGGGAAGAATAAATTATAATCTAGGAGTCATGTATTAATTAAAAATGAGAGTTTCATCTATTGTCCACTACCTAAACAGTTCCCGGGTCCCTGTGGTCTCTATGGCAATTTGGGTAGAGTCAGTCTGGCTTTCAAGCCCAGAAAACAAAAAGCTTTGTCTTTGGGATAGATATGTGTGAAATGAGAAATGACCCACCTTGACTTAGGCAATATGAGACATTTGGCTCTCAGGGAATCCTGTTTATCCACAGTGTAGACCAAGCCCTGGCAGTGGGCACGGCAATGGCAGTGTTTCTCAATGTTTATTATACCACAATCTAGGTAGATTCTTGTTGCTGTGTCCGTATCTACTTGGAGAACTTAGGGAGTGAGGCTTTGGGAGTCTGTCTGTCATAAGACTAAATATTATTGAACTTAGCAGATTTCTGACAAGACTGAGAGCAATATCTATTAAGTATAATCTGAGTTAGACAATAGAGCACCCTATAACTTAATTGCAGTAGCAAAAAACAAACCTATATTTATAAAAGGCAGTGATCTTTAACTTTATATTGTTTAAAAATCATTATTTATCAAGGCAGGATTGAATGAAAACCTTATCTTGTAAGTAACTTTGACAGGTTGCCTTCGCAGAGACAAATGGCAGAGTTTTGTTTAGTGTACACTTGGCTTAGAGTTGATGTGGACCAGAAGAGAAAGAAACTAGAAAGTGGTGTGAGACCATGGTGTTAGGACAGAAAGTGAGTGTGTCTGGACATGTCAGGCCTGTGCCACAGAGCGAGCTGGTGGGGATGTAAGCTGTGGTAATAGCCTGGGGGTGTGGGAGTGCCAGGCAGCCCTGAATCTGGGCTGTGAACTATGGGCAAGCAGCACTGATCCCCTGAGAATGTTCCGTTTCCATCCTGGGCTGGTTCACAGAGCAGGAGACAAGCGCACTCAAGTGCACACAGCCTGAAGCCTGCAGGCCATGAGGAGCCACAACAGGCCAGATGGATGGTGTGCAGGCCTGCTTCTTTCCCTTCCCTCTCCCCGCATCTGCAGTCCTTGCTGTCCTGCAGAGATGGCACAGGGATGTATGTGTGCTTCTCCTGTGCTCATGCCATGAAATGTAGGCCGGCAGGGCAGGGGCAGTGGCAGCAGTTTGGGGGAGAAGTCTCGGGCGGGGGGGGGGGGGAGAGGGAGTGGGTATGCATGCACAAAAGAGAGCAAAGAGGCAGAGGCAGATAGCTGCAGGAAAGCAGGGCAGTGCCTCAGCAAATAGTGTTCCAGGCAGGGCCTAAGGGGTGGGCTGAGACCTGCTTTTTCCAGTGGCTAGCCAGGAGCAGGGTAAGTGAGTTGGCAGGGCAAGAGAGTATATGGGGGAGGGGGAACTCTACAGAGCACTAGTGGGAGAGTTGTTTTAAAAGTGTCCGTTAAATAACCATTTAGAGATATTGCTTGCTGGGTACTGTGAATTAGACCTAGAAATGCCCCAGTAAGTAGGGAGAAGATGGTGAAAACCAACCTGTTGGCTGTGAAAGTTATTTAAAATGTTCCTACCAGCCTCTTGAGAATGAAATTTAATAAAATTCAAATGTGTAGCCAGGTTAGATGTACTGGGTTGTCATGTGGACACTAGGGCTTGTAGAGAGTCTTGGACTCATTTAAGCTTAGGGGTTTTTGTACCGATGCAAGAGCCTGAGGGGAGGGATCATGAAAACTGCTTTTGAGAGGGGGTGGATCACCCAAGGGTTAGAGTTCCTAGAATGAGTGAGGGTCAGTGAAAAAAACAGTCATAAAGAGTAAATGTCTCTGTCTGTCCTCAATGGAAGCACAGGGATGGCTCTGAACTCAAGAACTCTCCCCTGGGAACAGAGGACATTTATGTTGACCAGAGGAGGAAGGGAATTTACCAGTTCTCTGAAATTTGGGCTAGCAAGCAATGTCTCTCCATGTGGCAGCACAGAATGTGGCATCAGGACACTTCTAAATCTGAGTTTTGGCACCAAATGTTGTGTTTTATAAAAAATATAAGGAATGAAGGAGAATGTTTGATTGATATGTAGTCAGGTGTGAAGGAAGGGGGTGTCTCTGCGGGCCCATACATCCCTTGCTCCTTAGGGACCAGCTACATGGTATATATAGTATAGAATAGAGTTTACTCAGGGCATTGGAGGGGGGAGTTGAAAGAAAGGCAGAGAGAGAGAGGGAGGGGAAGGGGGAGGGAGATGGGGAGGGGGAGGGGGAGGGAGGTAGAGGCCAGCCATGAGATTGTGGAGGGGGGGTGGGAGTGGGGAGAAAGAGGTAAGAAGGTAAGGGAGCAAGGGCAAGAGAGAGAGGGGGGCAAGCAGCCCCTTTTATAGTGAGTCAGGCACAACTGGCTGTTGCCAGGTAACTGTGGGGTGGAGCCTAGACTAAATGCCAACATTTATACCTATTGGGTCTTTGCAAAACGTTAAGTTTATTTTGTTATTTTACAG
Seq C2 exon
GACAACCTCACACCACTCTTGCTTGCTCTCAGGGAGAACAGACTGAAGATGGCACAATTCTTAGTAAGGATGGAAGCAAGCGTGCATGCAGTTGACTCACAGAGAAG
VastDB Features
Vast-tools module Information
Secondary ID
ENSMUSG00000026774-4931423N10Rik:NM_027635:3
Average complexity
IR-S
Mappability confidence:
NA
Protein Impact
No protein impact description available
No structure available
Features
Disorder rate (Iupred):
C1=0.000 A=NA C2=0.000
Domain overlap (PFAM):
C1:
PF127962=Ank_2=PD(24.5=39.7),PF127962=Ank_2=PU(52.2=62.1)
A:
NA
C2:
PF127962=Ank_2=PD(44.9=86.1),PF127962=Ank_2=PU(10.3=19.4)
Main Inclusion Isoform:
NA
Other Inclusion Isoforms:
NA
Other Skipping Isoforms:
NA
Associated events
Conservation
Rat
(rn6)
No conservation detected
Fruitfly
(dm6)
No conservation detected
Primers PCR
Suggestions for RT-PCR validation
F:
No suggested primer sequences
R:
No suggested primer sequences
Band lengths:
Functional annotations
There are 0 annotated functions for this event
GENOMIC CONTEXT[edit]
INCLUSION PATTERN[edit]
Other AS DBs: