MmuINT0113083 @ mm10
Intron Retention
Gene
ENSMUSG00000027965 | Olfm3
Description
olfactomedin 3 [Source:MGI Symbol;Acc:MGI:2387329]
Coordinates
chr3:115101804-115121000:+
Coord C1 exon
chr3:115101804-115102023
Coord A exon
chr3:115102024-115120893
Coord C2 exon
chr3:115120894-115121000
Length
18870 bp
Sequences
Splice sites
5' ss Seq
TAAGTGAGT
5' ss Score
6.43
3' ss Seq
TTATGCTCCTCTTATTTCAGCAT
3' ss Score
8.35
Exon sequences
Seq C1 exon
GAGTTGAAAGAGAAAATGGATGAGCTACTGCCCCTGATCCCAGTGTTGGAGCAGTACAAAACCGATGCAAAGCTCATCACACAGTTCAAGGAAGAAATTCGGAACCTGTCTTCAGTCCTCACTGGGATTCAGGAGGAAATTGGTGCCTATGACTATGAAGAACTTCATCAACGGGTCCTCAGCTTAGAGACCAGGCTTCGTGACTGCATGAAAAAGCTAA
Seq A exon
GTGAGTAGAGTTCTTTCATTGGCTTAAGTCATGACCTTCAGTTTCCATAGAGGCTATATTCTTAGAAAGAAAGAAGTTAGGGTAAAGGACCTAGTTATAGAGAGTCAGGCCTGAATTACAGGGCCAAGTGTCTCTTAGTCACGTGAGCATGGCTGAGAACTTTTGTTTAAGTTTCTGCCATCTCAACTCTCTGTGGCTTCCGATACTAGTGCTGTGGCTATAGGCAAGTGTGTTAGCTACAGAACTGGGTGGAGTTTGCCTTTTTCTAAATATGATACAGCCAGCCTTGTTTGGCTGGCAGAGAAAAAGCTTTCTTCTATTTGTTGTTGTTGTTGTGTTTTGGTTTTCTGTTTGTTTGTTTGTTTGGTTGGTTGGTTGGTTGTTTTAGTTTTTTAGATGTTTGTTTGTTTGTTTGTTTAGTAAATTAAATGACCAGGACTCAAACTAAAAGGCAATGTTCTCAGAAATAAATAAAATCTTTTCTGGAATAATTAAAAGATAAGAAGCATAATATACTTAAAATTATTATTTGCAGCAAACCAGGCTTCAGTGGATAAGTGCAAAAGTTTAAAATAAAACATGTGCGGTTACAAAAAAAATTTGGACACCATTTAAAATGTAACTCGGACGATTAAAAATAAGCCAAATATAAAATATTGCTTTAAATGAGTTACCACAACCACCAAAATACAGAACCAATTATGTGAGGAATTCCCACATCAGAGGCTCCACTATAATCATCTCAATTATCCCATAGGAATCACAAAAAATTAATTAAAGGAAATAGGGTGAATAGGAAGGTTTCATGAATGCATAGAAATTTTCAGCTCTTCTGTAACTGAAAAATATTTCTTTTCATGCTACATATTTTGATCCTAATTTTCTCTCTCCCAACTCTTCCTAATCCTCTTTATCTCCCTGTATCAAATTCAGGGTGTTGTGCTGGTTGAATTTAGTACTCTAACACATGTACTTCAGCAATCATATATAACTAACTAACATATCAGACTAAACATATCAAATAATAACATCATTATTCATCTTTCTTATTTAACAAGGTATTTGCTGTTTGCTTTAGCTGAGATGTACCTGTAAACACTGAATCAGGAGCAGTACCTTAGTATCTGTGAGGAACCGTCTCCAGAGCCCTCACAAATACCCAGGTTTACAATTGTGAAATCTTTTTTATATAGAATAGTATATAGCTTATGCATTCCTTCCCATATGCTTTCTGTAATTCCTAGATTCTTTCTAAACCCAATGGTGTCTAAATTTAATATAAACATGGATTAGGTAAAAATGACAAGAAAATTAGTCTATACATGCTTTCTACAGATGAAATTGTTTTCCAAATACTTTTCTTTCCTGCTTGTTTAAGTTGAAGATGTGAAACTCATGAAAATAAGGAGCAGACTGCAATTCTACTCCTTCACAAACTCTTTCCAATGTCAGAAGTCATTCTCTCCTTGATACTCAGTATAGAGACCAATTTTACAGAAAAAAATAATAATCTGACTTTTTGTCTGAAAAAAAAAAAATCCGATTCTGTTCTTTCTGTCACTTAAGTGGATTAGCCACTTAGTGAACATCTCTAAACAGAGAAATTTCAAACAGAAAAATCTACACAATACAGGGAAGGTAAGTTTAGATGATTGATGATATATGGATGATAGATATTATAGATATGCAGATAGATAAGTGACAGATAGATCACAGAGAGAGAGATAAAGATATAGATATATGGTAAAAGCATATGCATGGGTACATAATAGATAGATGGATATATATGTGTGGACAGAGAGAAACAGAACATGTGAAAGATAATTTTAAATATCATTTGCTATGTAATGACTGTGTTTTAATATTGCACAAGAATAATTTATTGCCATTGTGTTTCATGATGTGTACTTAATGAAAATAAAACATGAATTCTGCCATGTGATTTTTCTTTTCTTTTCTTTTAAACTTATTTATTTATTAGGTTGGATTTCTTATATAGTCTTGCTATGTAGCCCAGTCTGGTTTTAAGTTTCCATGCAGTTCAGGCTGGGCATAAGTTTGCAATGATCTTCTTGCCTCGTTCTAAGTATACACACACACAAACATATACACACATACACACACACACCAACAAAACAAACAAAATAGACAAACAAAAACATCAAATCATAGGATATCAGGAGGGAATGAAAACAATAATTAATTAACAATGTGTCCATTAACACAAAGGATAGAGAGTGAATATAATGAGTTCAATATGCCAATGGATCTAAAATCAGCTTACTATAATGCTCAGACACAGAGAGGGGGAGGGGGAGCCAGCAGTGTAGTATAACAGGCAAGAATATTCACTTCATCAATAGCATCTTTCCTCTTCACAAAAGCCACTCAACATACAGCTGGTTAGCAGAGGATAGAAATGAACTAGGCATTCAGAATAAAATTTCAACAATTGTGAATACATTTCCCTCAATTTTCTACCCCCAGAGGAGTTTGTTTGAAATTAAATGTCATGCGTACATCACATAAATCTGAAGACTAAAATCTACACCATCCTCATTTCAATCAAGGATCCACCCAATCAGTAAACAAGGCCCACAGGGAATTACAAGTCCTACAGGCTACAAAGGCACTATTCAGTTTATTTCTACAAAAGAATTAAAGGTTTAGAGAGAATAGAAATTAGACAAATGCTTCCACAGCGATACACCCTCTTGTCCTAGTGAAGTACAATGATATATATTTTTTTCTGAAGGATTTCACTCTTTCCTTCAAGGGACTGAATAGAATAAAGTCCCCTGTGCTTAATTAAATCATATCAGATTTCTCGACACACAGAATATAATTGTATGCATGTGAGAATATGCCCGAGCAAGCGTGGTTAAAAGTCTTACACACCCCTTGAGATCACCAAGAGATATTTAATGGAGATTATAACCAGGCTTTTCAGCCTGCCAGGCCCCCATCCCAAACCATTCCCTTGTGATGTTTTTACTTTAGGGCATGATTTGGTGCCCTCTAGTGAAAGAAGGGATCGATCCTTTTACTAAAGGAGCCATTTAAGGTCAAGGTGTCGATCTCTTACTATGCTATATATGGAGAGTTGTTTTTTACAATGGAAAACAATTTTTCTAAGTGCTAGTAGCCATGTTTATATACTCAGAAGATATTTTTGACTCCAAGATATGTGCTAGCCCTTTATAAGAAACTATCTCTCTGTGTAAACCAGCTCATCTGTAAGCAAGCACATAAGTAGGAGGTTGCAGCAAGACAGAGTACATACTGCTTTGACAAGTAGTATGCCAGATGTTTAATACATTTGTTTTAATCTCTGAAAGAACTCCGGGTTAGGCATTAGTATTGGTGATTTAATTAAAACGTGGACAAATTCATAAACTTCTATAGACTATAAGGTTTATAACAAGTCCACGTCTGTCTTAATTGAAAATTAGATATTGTTCCCACACATGACATCTTTTGTTGTGGTATATCCAGTCTTGGATATACACACAACATATCTCCAACACATTTGGAAAAATCAGTTTCTGCAAAGGTTTGAAGAGAGGATTTTATCATTAAAATAATTTATTTTTAACTCATATGACAATATGGTGTGTGTACATGTGGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTCTATCACAACTCAGAGAGCATTTGAGGAAAGACAAATTATAAAAGCACTATGCTAGTTCTCACCTGTTTTTATATTGCATTATTATTAACTTTTTCTCTTTCCACAATGGGAATTTCAGTATCTCACTGTAAAATACCTAATAGTTTGTTCTATGTAACATTTAAAGGGAAAGACAGCAAAAATCTCAAGAGACTGGGGAAATTTTTAAAAAGTTAAGCTCTAGCTCACTGTGGTAGAAAAGTAAGATTTTAATCAGAAATCTAACATAGAAAAATTTGAGAATATGTCTCTAGATACAGTTGAAATACACCCCAAAAAGTCGTTTGAAATAATTTGCCAGAATCTGTCATATACACCCAAAAATATCCTCATGCCATGCACATGAGATTGATTCTTCCTGAGCTTTTGAACTGAAATAATTTTAGCCAAGGTTTTTAGTAATCAATAAACTTTACTATAAATTGATTATCATTAATCTTTCATATATTTATATACTCTTGTGACTATACTTAAATCACACAACATATATTCCCAGGAGAAAGTACAAATCTCTACATTATCATCGATTTCATTACACTACTGTCTATTCAGTTTTAGGTTTAAATATATTTTTACTTTAAGATATATTTCTAACTGAATTTATATTTGAAAGGTAAATGTATGAGTTAGAGTACTTCCTTAACTAAGAAGGTAAAAGTGTATTTTCTGAGAAAAGTTGAGTTATTATACACACACTTACTTGTTCTTATCCCCAGTGGAAGATCATTATAGCTAGCCCAATCCTTAGCAGCATAATCAGCAAGTCTGGGTACAAAGATCAAATTTAAATGATATAAGTATACATAATAGGTCTCCCAAAGTATGGCTGAAATAAACTTCCTATAAGAATTATAACAGACTGTAAAATTAAATCATGTGTATTTCTTACTACATGAGTTCCCCCATAGCCTTTAAGAAGAAAGAAATAATTTTCTGTCCATAGAAATAGTCCCTGCTCTAAGTTATATGTGTGGGTTTGGCCTAAAGATCCAAAGCTAGAAGCTCTTAGACTAAACTATAGTAAAGCACATTCATATGCTAAAGAAAAAGAAAAGAGAACACGTCAATGATCTAAACAAATTCCTCAGGCTGCGTCCTAAATTGTATCTTTTCCTCAAAGGGTGATAGGTGATAACTGAAATAGCTGCGTCCTAAATTGTATCTTTTCCTCAAAGGGTGATAGGTGATAACTGAAATAGAAAATGAATGCACAAAACTCATCAGAGAAATAAAATGACCACTTTTCTTAATAACTTATTCTATATTTTTTCTGCACATATAGAATATTGTCCATGCTGACATTTCCATAGGTCTCACTATAGACGGGGCGGGGGGTGGGGGGACGGGTGGTGGCAGGGGAAATCAATGAAGCAAGACTCCACCTCCTTCTGTCTTCATCCACCTTTATGTGAACATTTGTCTTCCAGGCACTTTGGGGAAATTATCTTTCCTGACTGGCTTCACTTGTTCTCTAGAAAGTGAGAGTAAAGACAATGATTCATTTGAACAAAAGCTAGCTTGGGAAAGTCATGGAACAAAAATCACTTATTGTTCTGTTTCACTTTTTTCAATGTTCCTTTAGACTGTGAAGATGCCTATATTTTTTTCATATGAAAGCCCATAAAATTATGACTGGGAAAGTAGCCAGTTTCATAAATTCCTGCAGATTTAATTCTACTGACTTTGACAAGATAAATTTCAGCCTCAGAAATCAATGACTTCGATTTCAAAGGAAGTTTCTCTTGGGAAGTAATCAACACTGAGAGATTGTCCAGTGTTGTTTGCTTCCAGGGGATGCCCACCTGAAAGTAACAGTATAGTGATGACTGCCACACGGCCACAGTGGAGACTTGTTATCTATCTACCTGTCTATCTGTCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTAATCTATTGATCTATCTATCTATCTATCTACCTACTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTACCTGTCTATCTACCTATCTACCTGTCTATCTGTCTGTCTCTCTGTCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTACCTGTCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTACTGGTTGGGTGGGCCATGACTACAGACAACACTTTGTCCCCCTTGGCATACAAAAGCTTCTTGGCCTTGACCGGGAATCAATTCAATGCACACTTAGCAGGAAAAACAAAACAAAACAAAACAAAATCACGTCAGACTTTAGACAGTCCTCTCCCGAAAGTGCATTATCGAATTGTATAATGATTCTAGAATGTGACATGTATGGGAAACCAGACTTGATACTGGATACCTTAGCACACCTAAGTACACAGGAAGAATTTTTGTTTCTGTGCCTCATTTTAATTTATACACGTACATATTAAAGGGTAAGTGGAGGCATGGTTACTTACAGATACTAAGTAAATTCAATTATTATCTACTTGTGGATTTTATTTACCTCATTTCAATTTTTAACAACTTTCATTGTTCCCTCTCTACCACATGATTCCTAGATATATACTTGTCTTTAGTAAATGACAGGAGAGACATAATTTCAATGAGCACATGCCTTCCTGCCCCGCCCCATCCCTCCTTATTTTTCCTAAAAAAAGACACGCCTGTTGCTGCCATTTGGTTTATCATTTTTCTTAAATCAACTCTCATTCAAATTATGATTTGTCAATTTCTACATATGTCATGATCACAAAGACTTCTTTGCACTAAAAACTACAGCTATTTTTTTTTTTTTTAGCATGACCCCAGTCAATTCTGAGACTGAAGGCAAATTTTATTTTCCAATCCACTTTTTATACCATTTTAATTACATGCAACTATTTTGGGCAAGCAGTACAATAAGGAACTAACAAAGCTGCAAGCGAAGTCCCTTGATTACTCCCATGACAGGGCTTGTCCTAATGACGGAATACTTGAGCCCACTTCCCCTTCCAAGCCCAAAATTTTGCCTGAGGCCTAGTTCCACCCTAAGACTAAAATTCCTGCCTTACCCTACTTCCCTATTACAGCCTAAAGTTAGAACTTACTTCCTTATTATGCCGTAATGTCTGGCTCCTGCCTGAGCTTACTTCCAAAGTCAGATTGCTGCCTGAAGCCCATTTCCTTATCCTTGGCCAATGTCAGACTCCTGCAAGCGGTACCCCAAAAGGCTTTCCACAGCCAAGTCAATAGATCTCCATCTATAAGGACTGAGACAACTCTCAATTTCTATCTATAAAAATTACCACAACATAAACAGGAGCTGAGACCACACAACTCTTAGAAACCAATATAGGAGAAAATCTTCATAATCTTGAATTTGGCAATAGATTTCTAGATCAGCTATTTTTTGAAAGAGTCTTGTTAACCATCAAGATGGGATGCATCCCAGGTCAGTACACAGTCTTCGGAGGAACTGTTTTACTATATTCAGTGATGCCTTGATAAAGAAACAGATTCTTCCTCTTGGGATAATTTAGACCAAGAGTGAACCCAAATTTAAATTCTTTACTTCTTTCCATTTGCCTTCCATCTGTTCCTAACAAGGGTCTTTGTACTATATAGCAAAGAATGTATGGTATAAGAAAATAATGAGAAATCTCCTGTTTTAATTTATTTTTAACAGTTTATAGCGAAATCTTTACTGATCCAGAAAAGCACTCAAAACTGCAAGTATGTGTTATCATGCCATATCCACATGTTGCCTTTTGATTGATATTTCTTTTTTAGGTTATCCTGAACTTCCCGACTGCTTGCTTTCTTGCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTTTCTCTGCCATGTGTATTTATATATATAGTTTTAAAGATGTCAAAACATGTTATTAACTCAGTTGCAAGGTTATGCCAAAGCTCAATTTCTTACGGTAAAAAGTATTTTCAGAAAGCTACTCCCAAAACTAACAGTCCATAATACTATACAGATTACATATTATTGTAGCTTCTTCCAGAGAATCTCTGTTGGGTCTCTTAGATGCTTATTTGTAGAGTTCTGTTGATGCTGTCTTTCTTGGTGTATGCCACTCATGAAGCTAATGTACCCTCAGACCTTCACTAACATCACAGTACTCACAAATATCCAAAGTGCTTCTTACTGGGGCATCTGTACATACTTTCTCACCAAATACTTTGCCAAATCATGAACAGTTTAAAACTACCTTCACTGGCGTCTTGACATATTTTTCCTCTTCTTCCTCTCTATCTCTTTTTCTGAGTAAATGGCACTTAACTCTGCTCAACTGAGCAATCCACACATTTGCGTATTACACAACCACATCACGTTATTTGGGCTTTCTATCTTTACATCTAAGCCAAACTTGGTTTCTATCAACTTTACCCTTAATAGCAGACACCCAAGTATACAAACTTTCCTCTTTCTCTATCACTGCTTTATATGCCTCACCCAAATAATATGACAATTCATAGAGGACATTTCTCCCTACTCTTCAATCTCTCTACAGTTTATTGTCCATAAAGTCGATAGCATTTTCTTTTAAAATTGTTGTTTGCAGATCTTTTGATTCCCTGATGTTCCATTTTAAAACTCTTTTGTGATTTTAGATTGTATCTACAAAACTTACAAACAATCACATTGGCTTTACAATTTTAATGTTATGGACTGTTCTTTGATCAATTTTAGAATCCTAATAGGAACACATGCAATAGTTAATATATCTAAAGTATCTGTCTGTATACTGAATGCTATTCTAAATATTTAGCGTGTTCCTCATTTAATCTTTTTTACTGCACTATGAAAGCTATTTGATTACCTCTGCTATCCAAGAGAGAATAGGTTAGGAAATCGTTCTAGGTCTATAAAGAGTAACGATATAATCCAGATCCAAACTCAGGTGGTTCTCTTAAACTACAATCAATTACCTACCATTTTAAAGTTCTGCCTTTCCCAGCTGACCTTTTAGTATGCTAATTAAGCTAAAACTGTAAGTAAACATCCCTTCGATTCATAAGCCAATGGATGAGTCCTTATTGATTATATTACAAATTGCATATCAAGCTGAAAGTCTAGAAGTTAGAAGTCTTCCCAACCTTGATGGATTTTACAATTTTGAATGCATGCACTTATTTCAGATTAAAAACCTTAAAAACACATGAAAATTCAGCTATACTTTACTTCAAGTGTGCCTCATAGATTAATGTTACAAAATTAGTTTACTGAAAGAAACGTGTCTCCAGATGACAAATGATGATGGACTAAGGTCAAACAAGGGAAGACAGAGTCAAGCATTGCACATTGTGAGTCATGGAAAGATGGGAAACAGTGAGAGAATGCTGAACATACAGGTCAATAATAAAGGCACAATAACCCAGAGAAAGCAAAGCATAAGTTATATGAGTGTGCATGGATTCTCCTTGGTCAAAGAACTGGTTTGAAATATCTGTTTGAAGCCTTGTTTGTAAATATATTCATTTACACATATTTAAAATTATATATGAATATAACCAAATTATCTAAGAAAACTTACAGAAATAAAGAGTACAAGATTATTTTGCTTTCCTTATGTAACAGCAAATCATGTTTTCTCAAACAGGCAATTTATTAAACTGATAAGAACACATACTACACTTGCACTTAACTAAAGGCCAAGAAGTGATCAAACAGAAAATATAAATCCCAAATAAAGATATGTGCTGTAGCACACAGTGAGAACTCATGAGAAATATAATTATAAAAAAATATGTGCAGGACCACATTGTGGTAACTCATTAGAAGTATAACTATATTCAACTTATCTTCTTTACGATTTTCAAATTTTAATTAAAATATAATTGTGTCATTTCTCCTTTTCCCTTTTCTCCTTCCAAACCCTCTCATTTCCCTTTCTTCCTTCTTCCCTTATGTTACCCCTGTTTACTTCTTCTCAAATTCATACCTCCTTTTTCTTTGGCTATACATATATATATATATATATGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTATGTGTGTATATGTATATATATACACACATACATATATACACATACATGTATACACATACACATATATATATATATATATACACACACACATATATGTGTGTGTGTTCATATACTCATAAATATATAAATAAAACCAGCAAGTCTATTTAGCATTGCTTATTATAGGTGATTTCAGGACAAACCATTTGATATTGCGTATCTAATTAAGATACTCATCCTGGGGAAGGTTAATTATGCCTCTCTAAAAAGCCATTAGTTGTCTGTAGTTATTTGTTGGAACCCATAAGATTTCTCCTTCTATGTCTACTGGTGTGTCATTGTTCAGGTCTTGGTTAGGTAGCCATGTTGATGATGTGAACATGGATATAGCTTTCTTATTCTTTCTAAGAAACACAACCTCACAGCAGACTTCCTGATCCTCTCACGCTTACAGTCTTTCCATGCCTTTCTCATGTTGCTCCCTGAGCACTAGGTGCAGGGATTTTGTTATAAATATTTTCACTGGGAGTGCGCACCCCATAACTAGTGGTTCTCTACACTTTAATCAGTTTTAGTTTTCTTTTTTCTTTTTTTCACTGTAAGTTAATTTTATTTGTACTCCTTAAAAATGTATATATTTGTAAATTATGACGAGTTCAGCATCTATATAAAATTATAAATGTATACTAAGATATTCAAGTTGTTCCAAGGTTCTATATGAAAATGTTTAGCTATCAATTTAAAAAATATAGTAGTCCTATGAAAGTCATTTCTTCTTCAAAGGCTAGGACACAACAAAGAGATTTCAGGAGCTGTAGTTCATGACTTGTGTTGTTTTTTTGTTTTGTTTTTTTAACATTTTTTTAAAATTTAATTTATTCTTTAATCTATTTTTACAGTCCAGTATTTATCCCTGCCCCGGCCTATCCTCCTACTGTTCCACATGCAACCCCGCCCCGTCTCCATGAGGATGTCCCCACGAGGATGTCCCCACCTCTATAGCCCACTAGACCTCCCCACTTCTTGGTGCCCCAATTCTCCCGAGGGTTAGATACATCTTCTCTGACTGAGTCCAGACCTGGCAGTCCTCTGCTCTACATGTGTTGGGGGCCTCATATCAGTTGGTGTATGCTACCTGGTTGGTGGCTCAGTGTATGAGAGATCCCAAGGGTCCAGGTTAGTTGAGACTGTTGGTCTTCCTATAAGGCCGCCCTCCTCCTCAGCTTCTTCTAGCTTTTCCCTAATTCAACCACAGGGGTCACCAGCTTTTGTCAATTGGTTGGGTAGAAATATCTGCATCTGACCCTTTCAGCTGCTTGATGGACCTTTCAGAAGGCAGTCATATATAGGCTCCTGTTTGTAAGCACACCATAGAATTAGTAATGGTGTCAAGCCGTGGGGCTCCCCCTGAGCTGGATTCCTATTTGGGCCTGTCACTGGACCTCCTTTTCCTTATGCTCTTCTCCATTTTTGTTCCTTCCGATCTTTCAGACAGGAACAATTCTGGGTCAGAGTTTTGACTGTGGGATAGAAACCCCATCCTTCCACTGATGCCCTGCCTTTCTACTGGAGGTGGATTCTATAATTTCCCTATCCCCACTGTAGGGCATTTCATCTAAGGTCCCTCCCTTTGAGTCCTGAGAGTCTCTCACCTCCCAGGTCTCTGGTATATTCTATAGAGTCCCCCAACTTCCTATCTCCTGAGCTTGACTGTTTTCATTCTTTCTGCTGGCCCTCAGGGCTTCAGTCCTTGCCCCTCCCCCAACTTCTACAATAACTGATCATGTTCCCATCTTCCTCTCCCTGTTGTCTTTCCCACCCAGGTGGGTTTTCTGTAGTGGTCTCCTTATGCTCCCTATAGATAATAGTGCTTCCTTGATGAGAGGTGAAAGCTATCTTTAACCTGTGAATAAATGTTTTAGTGTTTTAGAAGCAGTTAGTAATTAAGCTGGTCTAGTAAAGCAACAGTATCAATTCTTTAGTAAAATCTTTAGCCTTAGTAGCCCCAGGTATTGGCTAGGTTTCTGGTACCAAGCATACTTTCCCTCCTATTGAGTAGGCCTTGCATGGAGTTAGAGACCTGCTGGTTATCATCAAGATATGGCACATTTGGGAATATGTTACCATGCTAATTACTGTTGATATTCATATGTATCATCTAGATAGGACAATTTATTGCTCCTCTCCATTGGTAGTTTGCATACCACGTCTGATTCTATAAAAACTGGTCCCGGGGGAAGGAGCTTTCAGGTAATACTCAGCTCGGATATTTCCAATCACTGCGTGATATCGCCAGCAATAGAAATCCACCATCAACCTGGAAGAGGAAACCAAAGAAAGCCATAATACCCTGTACTGTTTTGGGAAGCTCCTAGATTTTCATACCTGGTGCTTGGGTTTTGGTTAGGTATCGCAGAACTTTATTTAAGCTGTGTGTGTGTGGATGCACATGCATTTATGTGTATTATATGTAAACTTAGTTAATATAAAATAATACAATCCTTAATACTTTTGAAACAATCTTAATTTATTTATATACCTCCCTCTCCTCCAGTATATTCTCCATCTCCATCTGTGCCTCTCCCCTTCTGCTATACCTCTCCATTTTTTGTCTCTTAAAAAAAAAGATTAAATTTGTTGTTATAGAAAATATATGGATAAATGTTACAATTCACAGTATTCTTATTCCTTGAAGTTTATAGAGGTAAAGTCAGAGAACTTGCTAAGTCAACTGTAAAATGGAGCTGGAAGTTTAAAACATTCAATTTCAGTTTAAGCCTTGCAGGACTCAAAATATTAAAATGCAGGCTATTCACAAGTTTGTTTCTTCAGTCTGTGACCCTTTCTTTCTCTTTCTATCCACTTCCTAGCATTGCATGGCACATAAAACCTAGAAATGGTCTTTCAACAGGCAGTATATAAATGCATTTTTTAACTTTTCAAATTTAGTGTCTATAGCATTTTTGCACCTACTTTAACATTTTAAATGGCAATTTAAATATGCACATGTGGCAAAAATAGTATGCTTAAAAATTTAAAGGGCTTAGCATGGAAACCAACATTCTCTTTGAGCTTTTCTATCCCGAGTTTAGCAAATTTAACAGTTTAATTTTAGGGTTTTAGATTGGTTAAATTAGCATTTTGAATAGTATGTTTATTTTCTACGTTTGAAAATCAATCATAGACATTATTTAATGAGTTCCTGTTCTAGTAACTGAAAATTTAGATAACATCTGCTTGAGCTTTTTAAAAATATATCTCTATCTTGCATGCTTTATGGCAACTCACAGATATTGATTAAAAATCAAAGTACTTATACTTTTAAGACTCAGATGTTTTCATCTTTATTTGGGAAATTTTTATATTTTTATTTATTTATTTTAACAGTGAAAAGCAAGTGCTTGTTGCTGGCTTAGTGGCTGCACCAAGAAGTTGCCCATATCATGTAACCCTGGACCTCACAGCTTGTTTTGTTTGTTTGTTTGTTTGTTTGTTTGTTTGACCTTGTTTTGTTTTTGGTTGTTTGTTTGGATTTTTGTTTTCTTGCTTTGTTTTTCTTCGACTACATTCCAATCATAGCATTCCCTTCTCCTCCCAGTCCCAGCTTCACACAACCAATCCTCCCAACCCTCTTCCCCAACTCCCCCAGGATCCCAACCCACCCAAATATATCAAGTCACTACAGGATTAGACATATCATCTTCCACAGAAGCCAGACAAGACAGCATGGTTAGGGAAACAGGATCCATGGGCAGGTAGCAGAGACAGCCCCTGCTCCAGTTCTTAGGGTACCCGCATGAAGACAAAGCTGCACATTTGCTACATATGTGCAAGGGCCTAGGCCCAACAAATGTATGCTTTTTGGTTGATGGTTCAATCTTTGGGAGCCCCCAAGCATCCAAGTTAGTTGACCCTATTGGTCTTCCTGTGAAGTCCCTATCACCTCCAGGTCCTTTAATCCTTCCCCCAACTCTTCCATAGGATTCCCTGAGCTGTGTCCAATGTTTGCTTTGAGTCTCTGCATCTGTTTCCATCAGCTGCTGGGTGGAGCCTCTCATAGGGTAGTTACGCTAGGCTCCTGTCTGTAAGCGTAACAGAATACCATCCATTAATAGTTTCAGGGATTGGTTCTTATCCTTGGATGGGTTTTACATTGGGCCAGCCATTTAGTGGCCATTCCCTCAGTGTCTGCTCCTACAATAAGTCCCTTCACTTCTTGTAGGCAGGACAAATTTTGGGGAGAAAGTTTTGTGTGATGTTGGTGTCCTTATTCCTCCACTGGAAGGGAGTCCTGCCAGACTACAGGATGTGGCCATTTCTGGCTCCATATCCCCCACTACTAGGAATCTCACCTAGATTTACCCTCATGGACTCCATGTAGCCTCCCCAGTCCCAGGTCTCTGGCATGTCCTAGTGATGCCAATACCTCCCAGCTGCTGATTTTCACCCATTCTGCAGGCCTTCTCTCCCAAGCTCTTTTCTAATTGCTACCCATTCACATGGCCCTCCCCATCTCCTCCTTCACCCAGGTCATTCCCTTCATCCACCTCCAATGATGTTTTTATTTTCCCTTCTAAGTGAAAGTCAAGAGTCTACCACTGGCCCATTTGTTATTTAGCTTCTTTGGGCTTGTGGATTGTAGTGTATGTATTCTATACTTTTTAGCTAATATCCACTTATAAGTGAGTACATCCTTTTGGGTCTGGGTAATTTTGTCTTTTCTATAATTAGAGAATAGTTAAGAGTATCAGTAGAGTAAATTTTTTACATTAAATGTGAATGGTTCCAATATTATGATCACGTTATATTCTTCCCTAGAAGCTGTGCTATATAATTTCTTCCTTTCTAAATCTAGAACCGTAATATCTGTGCTATTAAATGGAATAATCAGTAAGCCCAGATGGGATGGTGCACATCTTTAATCCCAGCCTTGGGGAAAAGAGCCATGGGATCTCTCAGTTCAAGGTCACAGTGAATTCCAAGCCAGACTGAGCTACATATGATGTGATTGTCTTGAGATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATACCCATATCTGTAAAAATATTTTTTCATTTCCATGATGGCTGCATTAACTTATATTTCCACAAAGCTTTTGAGAGACCTTCCTCTTAGAGATGTTTATTTCTCAAAGTCTCCTGCACAGTTCTCATTATGTAAGAAGTCATTGCTTTACTGGTCTCATGTCTGCCTCTGTTGAGTTACTAACTTGTTCCCTGCAATAAATCCTCAAGAAATTTCTTAAGAAAATTGCACAGCAAATATGCTTCTGGAATATTTACACATCAGAAAAGATCCTATGTTGTCTTTTTTTTTTTCTTGTTCAATACAAAGACATAGATGCTTTTTGCATTCCATTATCCAGCATGGTGTTAAAAAGCTTGATTCCAATCTAATTCTTCCTTTTTTACATAAAAGCAGTTTAAATACCTTGGAAATCTTCAGTTTCACTTTGTTTTTAGCCATCCTGTATTTCACAGTAATTCTGTTACATAATACAGATGATTTCTTCTGGTCTTCTGTCGCTTCTTATTCTAAAAACCTTACTTAAACATTGAAATCAATATTTTCTGTTTCACCTCCCTCTTTTTTTTTTTCAATCTTCTGTCTGTTTTTTTAAAATGTAATCATAGTTTTCATTTCCAAATGAATCTCTCACTGTCCAAATTCTAGGCTCAAAGTGTCTAAAGGAAGAAGGGAGACTCATCTGCTTTCTGGATTCTTTTTTTTTTTTTATCAGAATTGTTTTAACCACAATTTTAAAACTATGTGTTATTCTAATTTTACAATTTTGAGCAATAATCTACTTGGCCACTTGGAGTATTTACATAGAGCTTGGGACTTCTTTCTATGAATAACAGGCAGAAAGGCTATGTTATTAAACAGGAGGAGCTTGTGCCAAACCTCCAAAATATACATTATCTACTTTAAACCTTTGAGGGTAACTAGCACACATTTTGCATATGTGGTGACCTGTTTTTAGAGACCACAATCTAGGGAAGAAAATAAGATCAATGAGCCTTAACATGCATTAAGTTCTGCACATGCACTCAGTTTATTAGAACACTCCAATGCTCTCTCTCCATACTGCTGTGAGTCCATAGTTCACTTCTTCAAGGTACTGCCCCTCCTTCTTTAGCCACTGCTGCTTTGTACAAGCTGTCACATCTTAGTCTAAATGTCTCATGACCCCTCTCCATCATCGCTGGCTTTGGGAAATTTATTGAAGCTTTTCACAAGTAGTTAGTTCTTTGTATACTTTTCCTTGTCTTTAGGATTTAAAACATACATTTATTGCTGTTTCTTCACTGTAATTTTACTGAAATCAGAAAATAGAGGAGATAAAAGGAGACATCAGTCCATCATTCTAATCAAGAATAAGTTCTCATCTTTCACATAAAAACCTAAACACATATATTGTGCTTTGGTTTAATTAGAGAGGGGAATGTCTTTTCATTTCAATCTATGTACACTGGAAATTTTTTGGGTATTGTCATCTGTTTATTTATAAATGTTTATGTGTGTCATCATCACTTTCACATACCGTGTATTTATATCATCTACTCAACTCAGTCCATTCAAAATACATTAACGTCTTTCTAATCCAGATGGATTCTATTTTGCTCATATGTTTTCATGTGTTTATAATAAGTTCAACTGCCTTATTTCAACCAGGCTTAATACTCAGGCTATAGGTGACGGACTGATGGATGGATGGATAATAGAGAGGGAGAGAAATGATGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATGATAGATAGATAGATAGATAATGGCAAAGAGTCTATAGAACCACTATCCCAGTCTTGATTGTCTGGGTCTCAGGAATCTGTAAAACAATTCAAAGAAATTTGTAAAGTATGCAAATATGTCACCAAATCTAATTCCTTCCAAGGAAAATTCTTTAAAAAAATTTCAATTCAGGTATCATGAAATAGTTGGGATTCCAGAATGTGTAGTTACTGTTTCAATAACAAAGAAGAACATGTTCTCAGTCACCATCTTCCTGACTATTCAGCTTGATATCCTGCCAATTACAAATTATTTCTGTGAGGAACACATAGGGAGAAATACGAGACAAAATAAGGTGCAATCTAGATTGCTTGTGTTCATGATTTGTCCTGAATATTTCTTCTTTCTCCAAATATACAGGAACCAGCAGTAATGACCTAGACACTTAATTTTATACTAGGCAGAGGAAGATAGAAAAAAATATAACATAAGGCCAAGAGAAAATATAAAGTAAAAAGAATAAATGCACAGGAATGTTATTACCTTGTTTAGATCAAAGGTACACATTTGTAGGCAAATTGTTTTTAAATATACATAAGATAAATGACTTTTTTTAAAAATGTTAAACTCCAGATTTTATTTCTCTCCAGTTTCACTCTCTGACTGTCCCACATCTAGCCCCCCTTTCTCCATGAGCATGTCGCCACTCCCTCACCCCCACCCCACCAGACTTCTAAACTCCCTGGGACCTCCAGTCTCTTGAAGGTTAGGTTCATCTTCTCTTACTAAACCCAGACCCGGCAGTCTTCTGCTGTATATGTGTTGGGGGCCTCATATCAGCAGGTGTATGCTGCCTGGTTGGTGTTTTAGTGTCTGAGAGATCTCAGGGGTCCAAGTTAATTGAGACCTCTGGTCCTCCTACAGGGTTGTCCTCCTCCTCAGCTTCTTACAGCTTTCCCTAATTCAACCATGGGGATTAGCAGCTTCTGTCCATTGGTTGGGTGCAAATTTCTGCATCAGACTCTATCAGCTGCTTGTTGGGTCTTTCTGAGGGTAGTCATGCTAGGTCCCTTTTTTGTGAGTGCTCCATGGCTTCCATAATACTGTCAGGTCTTGGGCCCCCCCTTGAGCTGGATCCTACTTTGGACCTGTCACTGGACCTTCTTTTCCTCAGGCTTCTCTCCATTTGCATCTATGCAGTTCTTTCAAACAGGAACAATTATGGGTCAGAGTTTTGACTGTGGGATGGCAACCCCATCCCTCACTTGATGTGCTGTCTCCACAGAAGTTGCTTACCCTTTGGTTTTGGTTCTGGTATTCATCATCCTTAGCTATTTTAAAGAATTATTTACAGCAAAACTGGTTACATATATGTATAAAATATTATTATGTGTACACACATATATTACATACACACATACTTTCTTAATGAAAATAGTGCTTTTCATTATATGTTGGATTCTGGAAACTTTCATTATGTGTTCTCTTAGAATCTATGGTCCTGAGATTTAAGGTTTTGCTCTATGCATGTTCTTGACTGCTCACTCATGCCCTTATATCTCTATAGTGGTTACCTCATAACTCTATACCTTTCAGTGAACTTTCAGTCCTAATGTTTTGTAAGGATATATTTCAATGGACGTGTTCATTAATCAAACTAACTAAAAATCAGGCTTCATAGTTCTGTCTAGCTTGTATACTTTCCATGATAATAAAATATAAGAGAAGCAAAAAGATGTGGATATCTGATAATCAAATGCACAGGACTCCTATCAATGGGAGTGTCTGTGTGAATCTCCTTTGCCTGCTCCCAGGTCGTTTTTCCTCCCATTGGGTTGCCTTGACCAGCCTTGATATGAGGATTTTTGCTTTGTCTTATTGTATCTCATTTTTTGTGTGTGTGTTTGGTTGTTGTCTCATGGAAGCCTGCTCTTTTCTCAGTGGAAAGAGAGGGGGTGGATCTGGGGAAGAGGGAGGTGGAGAAGCAGAGGGAGAGGAAACTGGTTGGTTTATATTGTATAAGAGAAGAATATATTTTCAGTAAATAATATATTAATTTTTACTACCCTTACACTTAGAGCATTAACATTACAAGCCATGACCCCTTTAGGGATTTTAAATACATTAAAACCAACACAGTGCTCATTCACTCAGAACATGTGTACTGATTTCATTGATTTACTTTGCTTTCTATCCCTCCCCCCTTTGCTTTCGTCTGAGTTTGTGTATTAGACTCATTGGCTGTGTTCAACCAATATGTTTATGCTCCTCTTATTTCAG
Seq C2 exon
CATGTGGCAAATTGATGAAAATCACAGGCCCCATCACAGTCAAGACATCTGGAACTCGATTTGGTGCTTGGATGACGGATCCTTTAGCATCTGAAAAGAATAACAGA
VastDB Features
Vast-tools module Information
Secondary ID
ENSMUSG00000027965:ENSMUST00000081752:4
Average complexity
IR
Mappability confidence:
NA
Protein Impact
ORF disruption upon sequence inclusion
No structure available
Features
Disorder rate (Iupred):
C1=0.000 A=NA C2=0.000
Domain overlap (PFAM):
C1:
PF123083=Noelin-1=PD(0.1=0.0)
A:
NA
C2:
PF0219111=OLF=PU(12.8=88.9)
Main Inclusion Isoform:
NA
Other Inclusion Isoforms:
NA
Associated events
Other assemblies
Conservation
Fruitfly
(dm6)
No conservation detected
Primers PCR
Suggestions for RT-PCR validation
F:
No suggested primer sequences
R:
No suggested primer sequences
Band lengths:
Functional annotations
There are 0 annotated functions for this event
GENOMIC CONTEXT[edit]
INCLUSION PATTERN[edit]
SPECIAL DATASETS
- Pre-implantation embryo development
- Ribosome-engaged transcriptomes of neuronal types
- Neural differentiation time course
- Muscular differentiation time course
- Spermatogenesis cell types
- Reprogramming of fibroblasts to iPSCs
- Hematopoietic precursors and cell types