RnoINT0105273 @ rn6
Intron Retention
Gene
ENSRNOG00000017969 | Olfm3
Description
olfactomedin 3 [Source:RGD Symbol;Acc:628672]
Coordinates
chr2:217983344-218000431:+
Coord C1 exon
chr2:217983344-217983563
Coord A exon
chr2:217983564-218000324
Coord C2 exon
chr2:218000325-218000431
Length
16761 bp
Sequences
Splice sites
5' ss Seq
TAAGTGAGT
5' ss Score
6.43
3' ss Seq
TTGTGCTCCTCTAATTTCAGCGT
3' ss Score
8.48
Exon sequences
Seq C1 exon
GAGTTGAAAGAGAAAATGGACGAGCTACTGCCCCTCATCCCAGTGTTGGAGCAGTACAAAACCGACGCAAAGCTCATCACGCAGTTCAAGGAGGAAATCCGGAACCTGTCTTCAGTCCTCACTGGGATTCAGGAGGAAATCGGTGCCTATGACTATGAAGAACTGCACCAACGGGTCCTCAGCTTAGAAACTAGGCTTCGTGACTGCATGAAAAAGCTAA
Seq A exon
GTGAGTCAAGTTCTTTCATTGGCTTAGGTCATGAGTTTCCTTGTCCATGGAGACTGTATTCTTACACAGAAGTCAGAGTAAAGGACTTACTTATAGGGAGTCAATCCTGAATTACAGGGCCAAGTGTCCCTTAGTCACTTGAGCATGGTCACTTCACATTTCTGTGGCTTTAAATAACCAGTGTGCTTGGCTAGGGGGAAAACTTCTTCCATTTTGTTGGTATGTTTGTTTTGTTTTGGTTGGTTGGCTTGTTTAGTTGTTGACAGTAAATAAAGTGATCAGGAATCAAATTCAAAGAAATGTTGTCAAAATAAACATTTTCTGAAATAATTAAAGGGAAGAGGCATGATATACCTGAAATGGATTATTTGCAGCAACCAGTCTGTAGTGGATACGTACAAATTTAAATAAAAACGTGAATGGTTACAAGAAAACATTTTGGATGCCATTTAACATGTACCTCAGATGATTAAACATAAGCCAAACACAAATGTTGTGTTAGGGAGTTACCACAACCACCAAAATACAGAACCAATCAGGGGAGAAATTCTCATATCAGAGGCTCCATTACATTCATTTCAATTTTTACAAAGGAATCACAGAAGATAATTAAAAGGAAATAAAGTGAACAGAAAGTGTGCATGAATGCATAGAAATCTTCAACGCTTTTTTAATTGAAAAATATTTGTTTTCATGCAATATATTCCGATCACAATTTTCTCTCTCTCAACTCCTCCTAAATCGTCTTTATCTCTCTGTATTCCCAGGGCACTGTTTGTGACGAATTCAGTACTCAGATGCATGTACTCCAGCAATCATATCTAACTATCATATCAGACTATAAACATATAAAACAACAGCATCACTATTTATCTTCCTTATTTCATTAGGTGTTTGCTGTTTGCGTTAGCTGGGCGGTAAACACTGAATGTGAAGCAATATCTGTGAGGAACTGGCTCCGGAGTCCTCACAACTACCCAAGTTTACAGTTGGGAAATCCCCTTCTATAGAATAGTGCATAGCTGATGCATTCCTTCCCATATATTTTCTGTAATTTCTAGATTCTTTTAACCAAATGCTGTCCGAATTTAATATAAATATGGCTTGGGCAAAAATGATAAGAAATTAGTCTATACATGCTTTCTACAGATGAAATTGTTTTCCAAACACTTGTCATCCCTGCTTGTTGAAGTTGAAGATGTGAAACTCATGAAAATAAAGAGCAAGCTGTAGTTCTACTCTGTCATGAAGTCTGTCCAATGTCGTTAGTCATTGTCTCCTTGTCACTTATCATAGAGACCAATGTTACAGAAAAATAATGTGACTTTTTGTCTGGAAAAATATGATTTTCTCCTTCCCATCATTTAAATCAATTAGTCACTTAGTGAGCATCTCTAAACAGAGAAATATTAAACAGAGAACCTAAACAATACCAGGAAAGTATATTCAGATGATAGATGATTGATGATAGATAGGTTATAGATAGATATAGATAATAAATGATACATAGATAGATGTAGGTAGATAGATAATAGATAGCTGATGCATAGGTGTACAGATAGATAATGATATATAGATGATAGGTAGATATATAGAAGGACAGATACAGAGAAATAAAGATATAAATAGATGGTAGGAGCATAGGTATGGGTAGAAAATAGATGGATAAATGAATATCATATATATGTAGGGATAAAGAGAGAAACAGAACATGTGGAAGGTAATTCTAAATGTCATTTGCTATTTAATGACTATATTTAATTTTTCACAAGAATAATTCATTGCCAGTATGTTTTGTGATGTGTACTTATTGAAAATAATAGCTGATTTCTGCCATGTGATTTTTCTTTTCTTTTCAACCTATTTATTTAATTGATTGGATTTTTATATAGTCTAGCTATGTATCTCAGGCTGGTTTTAATATTCCATTCAGTTCAGGCTGGTCATGAATTTACATTGATCTTTCTGTCTCATTCTAAGTGCTGAAACTACAAGTGTACACACACACACACATACACACACACACACGACACACACAACACATACACACACACAAAACACACACACACAAAACACACACACACACACACACACACACACACAGNCNCACACACAGTCTCACACCCCAAAGAGAACAAAATAAAAAACCCCAAACAAGCAAACAGAAACATCAAACAATAGGATATTGGAAGAGAGGGAAAAGAATAATTAAGTAACACAAAGGAGAGAGGGAGAAATACCATGACTTCAACATTGCAATGAATCCAAAATCAGCATCCTATAATGCTCAGACACAGAGAGGAGGAAGGGGGAATCGACAGTGCAGTATAGCAAACGAGGAGAAGATTCATCTTTCCTCTGAAAGTGGCATCTTTCCTCTTCACAGAAGCCACTCAACACACAGCTGATAAGCAGAGGGTAGAAATGAACTGGGCATTCAGAATAAAATTGTAACAATTGTGAATACATTTCCCTCAATTTTCTACCCCCAGAGGAGTTAGTTTGAAGTTAAATGTTATAAATCTGAAGATTGAAAATTAAACCAGCCTTCCTGCCTTCAAGTATCACAACCACCATCATCATCACCACCACCACCACCACCACCCCAGCTCCAACCAGCAAACAAGGCCCACAGGGAATCACTAAGGTCTGTTTATGTCTACTAAAGAATTCAAGGGTTGTAGAGATAGAAATTAGAAAAATGCTTCCACAGCGTTGCACCCTGGTGGCTCAGTGAAGAACAATGATGCTTTTTCCAAAGTATTTCATTCTCTCCTCTGAGGGACTGAATAGAATAAAGTCCCCTGTGCTTAATTAAATCGTATCAGATTTCTCAACACACAGAACATAATTGTATGCATGTGAGAATCTGCCCGAGAAAGCGTGGTTAAAACTCTTACACACCCCCTGAGATCACCAATAGATATTTAATGGAGATTATAACCAAGCTTCTCAGTTTGCCGGCCCCCACCCCACCCTATTCCCTTGTGATGCTTCTATTTTTGGGCAATGGTTTGGTGCCCTCTAGTGAAAGAAGGGATGCATCCTTTTACTAAAGGAGCCATTTGAGGTCAAGACCCTCTTACTAGGCTACATGGAGACTTCGTTTCTTAAAATGGAGAATAAATTTCCTAAGTGGCAGTAGCCATGTTTCTATATGCGACGGTTTCTTTTGACTCCATGCTTTGTGCTCGCACTTTGTAAAGGACCATTTCTCTGGGGTAAACAAGTTCATCTTTAAGCAAGCACATAAATAGGTGGTTGCTGCAAGACAGGGTACCTTCTGTTTTGACATGTAGTATGCCAGCTGTTTTACACATTTGTTTTAATCCCTGAAAGAACTCCAAATTAGATGATAGTAGTGGTGATTTAATTAAAACATGGACAAATTAATAAACTTCTATGGACTATAAGGGTTGTAACAACTTTAAGCCCAAGTCTGTTTTAATTGAAAATCAGATTTCTTTCCCACACATGATATCATGATTCCATGATAGTGGTATATCTAGTCTTGAATATACACACAACATAACTCAAACACATTAGGGAAAACCAGTTGCTGCAAAGGCTTGAAGAGAGGATTTTATTTTCAAAATAATTTATTTTCAATTCATATAACAATATGGTGTGTGATATGGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTCTGTCTGTCTGTCTGTCTGTCTGTCTGTCACAAGTCAGAGATCATTTGAGGAAAAGCAGATTATAAAAGCACTGCACTGGTTCTTATCTGTTCGTCTATTGTGTTATTATTGACTTCTTTTCTTTCCACAATGGCAATTTCAGTGTTTCACTGTAAAATACCTAATAGTTTGCTCTATGTAACATTTAAAGAGAAAGACACTAAAATCTCAGAGACTTCAGAAATTTAAGAAAGGTTAAACTCTGGCTCACTGGGGGTAGAAAAGTGAGATTTTAATCAGAAACATAATGTAGAAAAATATAAGAACATGTACTTAGATTAAGTTAAATTAAAGCCTAATAAGTCATTTGAAATCATTTGCCAGAATCTGCCATACACAACCCAAAATATTCCTGCTCCGTGCACCTGAGATTGATTCTTATAGAACTTTTGAACTAAAGTTTTTTTTAGCTAAGGTTTTAAGTAATCAATAAACTTTACTATAAATTGATTATCATTAATCTTTCATATATTTATATGCTCTTAATTTATGACTATATTTAAATCACATATCCTATATTTCCAGATGAAAAGTATAAATTTCTACTTTTTCAGGGATTTCATTACACTATTGTCCATTCAGTTTTAGGTCTAAATGGATTTTATTTTAAGATATATTTCTAACTAAATTTATATTTAAAAGATAAATGGAAGAGTTGAAGTACTTCCTTAAACAATGAAGAAGGTAAAGGTGTGTTTTCTGATAAAAGATGAGTTATTATACACACAGTTAATTGTTCTTATCCTCAGCAGAAGCTCATTGTAGCTACCACAATCATTTCACTTAGCAGCATAATCAACAAGTCTAGACATAAAGATAAAATTTAAATGATATAAGTAGATTTTACAGGGCTCCCAAAGGATGGCTGAAATAGTCTTCTATAAGAATTTTAACAGGTTGTAAAATTAAATCATGTGTATTTCTTACTACATGAGTTCCCCATACCCTTTAAGAAGAAAAACAATTTTCCGTCGATAGAAATAATCCCTGCTCTATCTAAGTTATATGTATGGGTTTGGACTAAGAATCCAAAGCTAGAAGCTCTTCCACTAAACTATAGTAAAACACATTCATATGCTAAAGATATAAGAAAAGAGAATGGGTGTGTTTTATGCATCAATGATTCAACTTCCTCAGGCTGCATCCTAAACTGTACCATTTCCTCAACTAATCATGGGTGATAACTGACAATAGAAAATAAATGCTTAAAATTCATCAGAGAAATAAAATGACTACCTTTTTAAATAATGTTTTCGGTATTTTTTTTTTGCATAGGTAGAATGTTATCAATTCTGACATTTCCATAGGTCTCTCTCTAGGTGGAGGAGAGTGGTAGGGGAAATCATTGACCCAAGACTCCACCTCCCTTCTGTCGTCATGCACCTTCATGGGAACATTTGTCTTCCAGGCATTTGGGGATATTATCTTTCCTGACTAGCTTCCCTTGTCCTCTAGAAAGTAAGAGAAAAGAAAATGATTCATTTGAACAAAAGCTAGCTTGGGAAAGTCATGAAACAAAAATCAGATAAAGTTTTGTTTTCTTTTTCTCAATGTCTCTGTTCCTTTTGCCTATGTTTTCTTGACACCAAAGACCATAAAATTATAACTGGGAAAGCAGCCAGTTTCATAAATTCCTGTAGATTTGTTTCTGCTGACTTTATTTGACAAGATAAAACAATGACCAACTTAAAGGAAGTTTCTCTTGGGAAGTACTCAACACTAAGAGATCCTCAAGTGTTGCTTACTTCCCGAGAATGCCCACCCGACAATAACAGCATGGTGATGACTACCACATGGCCATAGTGGGGACTTGCTATATATCTATGCATCCATCCATCCATCCATCCATCCATCCACCCACCCGCCCGCCTGCCTGCCTGCCCGCCCGCCTGCCCATCCATCCATCCGTCTGTCTGTCTATCTATTGTTGGTTAAATGGGCCATGACCACAGATACCACTTTGTCCTCATCAGCATATAACAGTCTCTTTACCCTGAATCAATTTAATGTCCACTTAGCAGAAAAAAATATGCCAGACTTTAGACAGCCCTTTCTGGAAAGTAAGTGCATTATCTGCAGTATACAATGATTCTGACATGTGACATGTAAGGGGAACCAGACTTAATCCTGTCTACCTTAGCATAAGTCATAGGCAGAATCTTTGTTTCTGTGTCTGATTGTAATTAATACACATACACATTAAAGGGCAAGTGGAGGCATGATTAATTATGAATACTAAGTAAATTCAATTACTATTTAGTTGTGGATTTTGTTTATTTCATTTCGATCTTTTACAATGTTCATTGTTCACTCTCTACCACGTGGCACCTAGATACATACCTGACTTTACTAAATGACAACAGAAAAGTAATTTCGATGAGCACATGCTTCCCTGCCTCTCCCTCCCTCCTTTTTTCTAAAAAGACATGCCTGGCGTTGCCCTTTGGTTTATCATGTTTTTCAAATCAACTCTCATTCAAATTATGATTTGTCACTTTCTGAATGCCTCATGATCACCAGTGACTTCTTTGCAGTACACACCACAGCTATTGCTTTGCAAGGGTCTTGTTAGCCATCAGGATGGGATTCTCCACAAGTCAGTACACAGCCTTCTGAGGAACTGTTTTACTTGGTTCAGTGATGTCTTGTTAAAAAAAAAGATTCTTCCTCTTGGGATAATTTAGACCAAGAGTGAACCCAAATTTAAATTCTTTACTTCTTTCTGTTTGTCCTCCATCTGTTCCAAACAAGGGTCTTTGTACTACATAGCACAGAAAATATGGTACGGGAAGATAATTAAAAATCTCACATTTTAATTTATTTTTAACATTTTATAGGTTATAAACTGTTTATAGGGAAGTCTTTAGTGACCCAGAAAAGCACTCAAAACTGCAAGTAGGTGTTACCAAGCCATATCCACATGTTGCTGTCAAAAATTATGCTTGGTATTTCTTTTCTAGGTTACTCTGACCTTCATAACTGCTTACACAACACATACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACATACACACACACACTTGTAGGCCAGCAGGATGGAGGAGTACAGAATACAATGCTGAAGTGAAAAACACTTAGCTCGGCTTGAAAAACAAAGCAAATGGATTAATGGGAATTTCAAGACAGAGTCAGGTTGTTTATGTGACTTTCTTAAAAATAATTCACACACTAAACACACAGTAGGAAAACAGATTTAATATAGCTTTAAAGCTCTTAAACCATGTTATTAACTCAGCTGTAAGATTAGGCCAAAGCTTAATTTCTAAAGGTAAGAAGTATTTTCAGAAATCTACTCCCAAAGATGCTTCTTCCAGAGCATCTCCGATGGGTCCCTTAAATGCTTATTTGCTGACTTCTGTTGAGGATGTCCTTCTTGGTGTATGCCACTCAGGAAGCTAATCCATCCTCAGACCTTCACTATCATCACGGCACTTACAAATGCCCAAAGTGCTTCTCCCAGGGGCATCTGTTCCCTTCAAGTACAATTTTTCTCACCAGATACTATGTCAAATCATGCACAGTTGAAAACTACCTTCACTGGCGTCTTGACAGTTTTCTTCTTCCTCCTCCCTATCTTTGTAACTCAGTAACTGGCACTATACTCTGCCTAAAGTTGAGCAGTCCATATATTTGCACATTACACTACAACATTATTAAGTTGTTTGGGCCTCCTATCTTCCCATCTAACCCAAAATTGGTTTCTATCAACTTTACCCTTAATATCAGACACCCAAGTATACCGTTTCCTCTGTCTCTATCTCTGCTTTACATCCCTCAGCCAAATAGAGCAACAACTCTCAGAGAATATCCTCCCTACTCTTCTCCCTCTGCAGTTCATTGTCCATAAAGTAGATAGAATTTTCTTTTAAAATTGCAGTTCACGGATCTTTTTATTCCCTAATGTTCCCTTTTAAAACTCTTCTGTAATTTTAGATTATATCTATAAAAACTTACAAACGTTCACATTGATTTTACGACTTTAATTTGATCAGTCTTAGATTCCTAGCAGGAACATATGCAATAGTTAATATTCTAAAGTATCTGACTGTGTACTGAGTGTTATTTTAAATATGTAACTTGTGTTGCTTATTTAATCTTTTTAACTCCATGGTGAATGCTTTTTGATTATCTCTGTTACCCAAGGCACAATAGGAGGTTAGGAAATTCTTCAAGGTCAATAAACCGTAAGGATACCATATAGATCCAAACCCAAGTAGTTCTCTAGACTACAATCACTGACACAACATTTTAAAATACTGCCTTTTCCCAGATAGCCTCCTCAAATGCTAATTAAGCTAAAACTGTATATAAGCAACCCTTCAATTCATGAGCTAATGGATGATTCCTTGTCAATTACAACCCAAATTACATATCAAATTGGAAGTGTAGGAGGTAGAAGTCTTCTCAGCCTTGGAATATTTTAAAATTTTGAATGCATGTGCTTATTTCAGATTAAACTGAACCAGACTTAAAACACATGAAAATTCAGCTGCACTTTATTTCAAATGTGCCTCATGGATTAACAGTACAAAATTAGCTTACAAAAAGAAACATGTCTCCAGATGACAAATGATGGTGGACTGAGGTCAGACAAGGGAAGACAGAGCATTGCATATCGTGAGTCATGGAAAGATGGGAACCACTGAGTGGATGCTGAACATGCAGGTTTAAGAGAAAATAACCTAGAGTGGAACCAGAAGGCAACGGATAAGTTATGTGTCTGTGTTTAGATCCTCCTTGGTCAAAGAATTGATTTGAAATATGTTTGAAGCCTTGTTCATAAATATTCATTTACACATATTGAAGATGATTCAAATATAACCAAAATGTCTAAGAAAACTGACAGTAATAAAAAAATTCAAAATTCATTTAACTTCCTTATGTAACAGCAAATGATATTTTTCTCAGACAATTTATTAAATTGATAAGAGCAGATTCTACGCTTGTGCTTAGCTAAAGGCCAAGAAGTGATCAGACAATATAATTCCCAAATAAAGACATGTACAGTAGTGTATGTATGTACGTAGTAAGAACTCACAAGAAATGTAAGTATTTAAAACATGTGCAAAACCACACTGTGATAACTCATTAGAAGTATAACTCTATTCAGTTTATCTTCTTTACGATTTTCAAATTTTAATTAAAATATAATTGTAGCATTTCTCCCTTTCCCTTTGTTCCTTCCAAACCTTCTCATGTCCATTCCTCCTACCTCTTATGTTATCCTGCTTGCTTCCTCTCAAATTCACAGCTTATTTTTCTTATTTTCATATATATGCATGTGTATTCACATTTCATAAATATATAAATACAACCAGCTAAGTCTATTTAGTGTTGCTTGTTGTAGATGATTTTAGGACAACCCATTAGATATTGCATCTCTAATTAAGACACTCATCCTGGGGAAGACTAATTATGCCTCTCTCAGAAGCTATTAGTTGTCTAGCTGTTTGTTAGAGCCCATAAGATTTCTCTTTCCATATCTATTGGTGTTTGCGTTTTTCCAGTCTTGCTTAGGCAGCCATGTTGATGATGTAAGTGCGAATGTAGCTCTCTTATTCTTTCTAGGAAACACAATCTCATAGCAGACTTCCTGGTCCTCTCACTCTTACAGTCTTCCCATGCCTTTCTCACGATTTTCCCTAAGCACTAGGTGCAGGGAGTTTGTTATAAATGTCTCCACTGGGAGTGGGCACCCCACAACCAGTGGTTCTCTACATTTTAATCGGGTTTATTTTTCTGCAATGGTCTCTTTATGCCACCAATAGATGCTTCCTTGATGAGGTCTGAAAGCTACACATAATCTGTGAATAAATGAAGAAGTACTTTGGAAGCAGTTAGTAATTAAGCTGGTCTTAGTAAAGCAGCAGTAGTAAGATCCACAGTAAAATCTACAGCCTCACTACCCCTGGGTATCGGCTAGGTTTCTGGTACCACACATGTTTTCTCTCTATTGAGTAGGCCTTGCATTGTTTTAAAAACCTTCTAGCTACCAGCAAGATAGCACATTTGGGAATATGTTACCTTGCTAATTACTGTTGTTATTCATATGTATCATGTAGATAGGACAATTGATTGCTTTTCATTGGCAGTTTGCATAGCACTTCTGATACTATAAAAACTGGTCCCCAGGGAAGAGGCTTCCAGGTCATATCTAGCTGAAATATTTCTAATCCTGTGTTCAAACTGCGTGATGTCTCCAGCAATAGAAATCTACCGTCAATCTGGAAGGTGAAAGCAAACAATACCCTGTACGTTTTGGGGAGACTCCTAGACTCCCCTGACAAACAACAGCTCAAAATGTGAATTCTCGTGCCTGATGCTGTGTTTTTGTTAGTTATGGCAGAACTTTATTTGAGCCGTATGTGTATGGATGTACATACATTTATGTGTAGTACACGTAAATTTAGTTAATATGAAATGATGCAATTCCTTAAGGCTTTTGAAGCAATCTTAGTATATTTTTGCCCCTCCCTCTCCTCCAGTATATTCTCGTGTCCCCCTCCTCCTTTTGTATGTTTTCCCTCCCCATTTTTCATCTCTTAAAAAATGATTAAATTGCTTGCTATAGAAAAGATATGGCTAAATGTTACAATTGACAGTATTCTTATTTTATAAGTGTACAGAGGTAGAGTGAGTGAACTTGTTAAGTCAACTGTAAAATGGAGCTGGAAGTTTAAAGCATTCAATTTCAGTCGAAGCCTTGCAGGACTCAAAATATTAAAATGCAGGCTATTCACTGGTTTCCTCTCTTCAGTCTGTGACCCTTTCTCTTTCTATCCACTCCCAGGCTGTGCATGGCACATAAAACCTGAAAATGATTTTCAACAGGCAGTACATAAATGCATTTTCTAACTTTTCAAATTTAGTGGCTCTAATGTTTTTGCACCTACTTTAACATTTTAAAATCACAATTTCAATATACACATGTGGCAAAAATAGTATGCTTAAAGATCTAAAGGGCTTAGAATGGAAACCAACATTCTCTTTGTGCTTTTCTAGTCAGAGTTTAACAAATTTAACAGTTTAATTTTAGGGCTTTAGATTGGTTAAATTAGCATGTTGAATAGTATGTTTATTTCCTACTTTTAAAAATCAATCATAGACATTATTTAATGAGTTCCTATTCTAGTAACTGAAAATTTAGATAACATCTGCTTGAGCTATTTAAAAAATGCATCTCTATTTTGTATGCTTCATGGCAACTCACAGATATTGATTAAAATCAAACTACTTATACTTTTACCACATTGATTTTTTAATCTTTATTTGGAAAAATTTTATAATTTTATTTTGTTGACTTATTTATTTTAAAGCTAAAAGGCAAGTGTTTATTGCTGGCCAGAGGTTGCACTGGGAAGTTTTCTAAATCATGTAATCCTGGCCTCACAGCTTCTTTTGTTTGTTTGTTTGATTTTATATTGTTTTTGGGGGGGGAGGGGAGTGGTTGTTGTTTTGAATTTTGTTTTCTTGTTTTGTTTTTCTTCGATTACATCCCAATCATAGAATCCCCTCTCCTCCCAGTCAACCTTCCTGTCAACCCTCTTACCCAACTACCCCTGGGTATCAACTACCCAGGCACAAATCCCTGCAGGATTAGTCACATCCTCTACCTCTGAAACCAGACAAGGCAGCACAGTTAGGGGAACAGGATCCACAGGCAGGCAGCAGGAACAGTCCTTGCTGCAGTTCTTGGAGGAACCATATGAAGACAAAGAAGCACATCTGCTACATATGTGCAGATGCCTATGTTCAGCCTTCCATACAGAAGCCTAGGTATGCCTTTTGGTTAGTGGTTCAGTATTTGGGAGCCCCCAAGGGTCCATGTTAGTTGACCCTATTGGTCTTCTTGTGGAGTCCCCATCCCTTCCAGGTCCCTCAATCCTTCGCCTAACTCTTCCATAGGACTTCCTAAGCTCTGTACAATATTCCCTGAGTCTCTGCATCTGTTTCCATCAGCTGCTGGGTGAACCCTCTCAGAGGGTAATTATGTTTGCCTCTTGTCTGCAGGCATAACAAAGTACCATTCATTAATAATAGCGTCAGAGATCGGTTCTTAACATTGGATGCGTTTCAAGTTGAGCCAGCTATTAGGTGGCCAATCCCTCAGTCTCTGCTCCTAAAACAAGTCCCTGTACTTCTTCTAGGCAGGACAAATTTTGGGTAGAAAGTTTTGTGTGAGGTTGGTGTCCTATTCCCTCCACTGGGAGGGAATCCTGCTCAACTTCAGGAAGTGGCCATTTTAGGCTTCGTATTCCCAACTGCTAGGAATCTCAGCTAGAGTCACCTCATGAACTGCCTGGGGCCTCCCCAATCCCAGGTCTCTGGCACATCCTAGAGATGCCTGTACCTCCCAGCTGCTGATTTTCTTTTCTTTTTAATTGGTTATTTTATTTATTTACATTTCAAATGTTATCCCACTTCCTCATTTCCTCTCCGCAAACTCCCTACCTTATTCCCGCTGGACCTGCTCCAACGAGGGTGCTACCCCACCCACATGCCCATTCCCCTATGCTAAGGCCTCAAACTTTCACAGGACTAAGGGCCTCCCCTCCCACTGAAGTTTGATAAGGCCATCCTCTGCTAAATATGCAGATGGAGCCATGGGTCCCTCCATATTCTTTGGTTGATGGTTTAGTCATTGGGAGCTCTCAGCGGGGTGGCGGTGTCTGGGTGGTTGATACTTTTGTTCTTCCTGTAGGGGTGGCAAACTCCTTCAGCTCCTTCAGTCCTTTAACTACTCCATTGGTGTCCCCATGCTCAGTCTGATAGTTGGCTGCAAGCCATCTGCATCTGTATTGGTGAGGCTCTAGCAGAGCCTCTCAGGAGACAACTATATCAGGCTCCTGTAAGCAAGCACTTCTTGGCATCAGCCTTAGTATCTGGGTTTGGTGTCTGGATAAGGGATGGTTCCCCAGGTAGGGCAGTCTCTGGATGGCCTTTCCTCAGTCTGTGCTCCACTCCAGCCAGCTGCTGATTTTCATTCACTCTCTAGACCCTCACTCCTGAGCTCTTCTCTACCTGATCCCTAACCATAATCCCCTCCCCATCCCCTCACCCTGACCCCTCCCTTCACCCATCTCCAGTGAATTTTTTATTTCCCCTTCTGAGTGAGAGTCAAGTGTCCTCCACTGGCCTTGCTGTTATTTAGTTTCATAGGATCTGGGATGGTGTGTAGGTATCCTGTACTGCATGGTAATATCCATTTCTTAAGAGAGTACACATCATGCATGTCCTTTTGGACATAGGTAATTTTGTCTTTTCTATAATTAGGCAGTAGTTAGAGAACCAGTCAAGTAATTTGATTATGAGCTGATGACTTTTTACATTTAATGCAAATGGTTATAATATTATGATCATGTTATATTGTTCCCTGGAAACTGCGATGTATAATTCCTTCCTTTCTAAATCTAGAGCCATAATATCTGTACCATTAAATGGAATTATATATATATATTTAACAGTAAGCCAGATGGAATGATACATACTTTTAATCCTAGAAGCATGGGGATCTCAGGACAAGGTCAGCCTGATCTACATAGCAAATTTCAAGCCAGATTGAGCCACGTAGTTAGAGACAGTCTCAAAGAATTAAAAATGAAGTGATATATATATATATGTATGTATGTATATATATATTATATATATATATATCTCATACCCATATCTATAAAATATTTATCATTTTCATGTTGGCTGCTTTTGGGAAACCTTCCTCTTAAAGCTGTTCTCAAAGTCTCCTGCACAGTTCTCATTATAGAGGAAGTCATTGCTTTACTGGTCTCATGTCTGCCTCTGTTCAGTTACTAACTTGTTCACTGGTTTATATCCTCAAGTAGTTTCTTAAGAAAATTATACAGCAAAAATGCTTCTGGAATAGTTGCACATCAGAAAAGATCCTATGTTGTCTGTTTTTGTATTTTTCTTCTTCAATACAAAGGCATAGACCCTTTTTTGCATTCCATTATCCAGCATGGTGATAAAAAGCTGAATTCCAGTCTAATTCTTACTTGCTTATGTGAAACCAGTTTAAATATCTTGAAAATTTCAATCACTTTGATTTTAGCCAACCTATATTTCACAGTCATTCTGTTACAGGTACTTCTCTACATAATGTGGATGATTTCTTCTAGTCTTGTTCTGTCTCTCCTTATTCTAGAAACGTTATTTAAACATTGGAAACAATATTTTCTGTTTCATGCTCCCACCCCTTTTCAATTTTCTGTCTGTTTTTGTAAAGATGCAATCATAGTTTTCATTTCCAAATGAATCTTTCACTGTCCAAATTCACAACTTCAAGTGTCTAAAGGGAAAAGTGTCTCAACTACTTTCTGGATTCTTTTTCATCAGAATTGTTTTTAACCATAGTTTTAAAGTCATCTGTGGTATCCTCTAATTTTACAATTGTGAACAAGAAACTACTTAGCCCCTTTGAGTAATTACATTGAACTTGGGACTTCTGACTATGAGTGACAGGCAGGGGGACCATGTCATTAAGCAGGAGGAGCCTGTGCTGAACCTCCAAAATATACATTCTCCACTTTAAATCTTTTAGGGTAACTAACACATAGTTTTGCAGGTGTGTTGACCTCTTTTTAGAGGCCTACGTCTAGGCAAGAAATGAGACCAAGTAGCCTTAGCGTGCATTAAGTTCTGCCCACGTGCCTAGTTACTGGAATACTCCAGTGTGCTCTCTCTATACAACTTCGCTTCTTCAGTCATCAGTGCTTTAGTACAAGCCAGCACATCTTAGTTTAAATCTTTTGTGAACCCTCTCCATTATCTGTGACTTTGGAAAATTTATTCAACTTCTCTACAAGTGGATCTTTTTATCCTTTTCCTTGTCTTTAGAATTTAAAACATATTTTATTGCTTATTTCTCCACTGTAATGTTATTGAAATCAGAAAAAAATAGAGGAGATAAAAGCAGTTATCAGTCAGTCCACCATTTCCATCAAGAATAATTTTTCATCTTTCACAAAAAATAAACATATATGTTGTTCTGTGGTTTAATTGGAGACAAGGATGTCTTTTCACTTCACTCTATGTACACTGGATGCTTCTATGGTGTTGTCCTCTGTTTACTTAGAAATATTTATGTGGGTCATCATCACTTTTATATGTCTTATGTTTATATCATCTATTCAACTAAATCAACTCAAAATATATTAATGTATCTCTAATCCATATTGATTCTACTTTGCTCATATGTTTTTACATGTTTATAATAACCTGAACTGCCTTATTCCAAATAGGTGTAACACACAAGCTATAGGTAATAGATAGATGGATGGATGGATGGATGGATGGATGGATGCATAAATAATAGATAATAGAATGGAGTCTAATGAACTACTACCCCACTCTTGATAAACTGGGTCTCAAGAATCAGTAAAACAATACAAAGAAATTGTGAAGTATGCAAAGATGTCACCAAATCTTATTCTTTTCAAATAAAATAGAAAATGATTTCAATTCAGGTATCATGAAATATTTTGTATAACAGAATGTGTAGTTACTGTTTCAATAACAGGGAAAAATATGTTCCCATTCATCATCTTCCTAACTATGCATCTTGGTGTTCTGCCAACTACAAATTATTCTTATGAGGAGCATATAGGAAGAAATATGAGCCAAAATAAGCTGCAGGCTAGGGTGCTTTTGTTCATGGTTTGCCTTGAACATTTCTTCTTCCAAACATACAGCAGCCAGCAGCAATGACCTAGACACTTATCAATTTTTACACTAGGCAGAGGAAGATAGAAAAATATGAAATAACATCAAGAGAAAATAGAAAAAATAAAATAAATGGACAGAAATGTTATTTCATTATTTGGATCAAAGGTAAACATTTGTAACAAAATTGCTTTCAAATATACATAAGATAAATTACTTTTGCATTCTGCTTTTTAAAAAATCACAGATGTTGCTTGCCCTTTGGTTTTGGTTCTGGCATTTATGAAATTTTAGCTATTCTTAAGACTTATTTACAGCAATAGTGACTACATATATGTTTAAGTATTATTATATGTATAGAGTATACATACACACATACTTTCTTAATGAAAATAATGATGTTTATTACACATCAGATTCAGAAACTGCCATTATGTGTTCTTTTGGAGTCTTTTGTACCTGAGATTTAAGGTTTTATTCTTTGCATGACCATGACTGTTTGATCATGCCTTTTTATCTGTATAATGGGAACCTCATAACTCTATACCTTTCAGGGAATTTTCAGTACTATGTTATATAAGGATATATTGCAATGGACATGTTTAAACTAAAACTAAAAATCAGGCTTCAGAGTTCTGTCTAGCTTGTATACTTTTCATGACTATAAAATATAAGAAATGGGGCTGGGGATTTAGCTCAGTGGTAGAGCGCTTACCTAGGAAGCGCAAGGCCCTGGGTTCGGTCCCCAGCTCCGAAAAAAAAGAACCAAAAAAAATATAAGAAAAGCAGAAAGATATGGGTAGCTGATCATCAAATATCCAGGACGCTTAACAGTAGGAGAGGCCGTCTCTCTCTCTCTCCTTTACCTGTTCCTGGGATGGTTTTCCTGGATTAACTTGTCCAGCCTAGATATGAAAACTTTTGCTTTGTCTTATTGTATTATGTTTTGTTGTGTTAGGTTGTTGTCTCTTGGAGACCTGCTATTTTCTCAATGGAGACAGAGACAGAGACAGAGACAAAGTATCTGGGGGAGAGGGAGGTTGAAGGAACTGGGAGGAGTAGAAGAAGAGGAAACTGTGCTTGGTTTGTATTGTATAAGAGAAGATCTGTTGTCAGTAAAAAAATTTAATTTTTACTATACTTTACACTTAGAGCATTGAAATTACAAGTCATATCCCCTTTAGGGATAAAATACATTAAAATCAACATGGTACTCATTCATTCAGATAATGTGACATTGATTTCATGGATTTACTTTGCTTTATATCCCTCCCTTTGCTTTTGTCTGAGTTTGTGTATTGGACTCATTGTCTGTGTTCAACCAACATGTTTGTGCTCCTCTAATTTCAG
Seq C2 exon
CGTGTGGCAAACTGATGAAAATCACAGGCCCCATCACAGTCAAGACATCTGGAACTCGATTTGGTGCTTGGATGACTGATCCTTTAGCATCAGAAAAGAATAACAGA
VastDB Features
Vast-tools module Information
Secondary ID
ENSRNOG00000017969:ENSRNOT00000024243:4
Average complexity
IR
Mappability confidence:
NA
Protein Impact
ORF disruption upon sequence inclusion
No structure available
Features
Disorder rate (Iupred):
C1=0.000 A=NA C2=0.000
Domain overlap (PFAM):
C1:
PF123083=Noelin-1=PD(0.1=0.0)
A:
NA
C2:
PF0219111=OLF=PU(12.8=88.9)
Main Inclusion Isoform:
NA
Other Inclusion Isoforms:
NA
Other Skipping Isoforms:
NA
Associated events
Conservation
Fruitfly
(dm6)
No conservation detected
Primers PCR
Suggestions for RT-PCR validation
F:
No suggested primer sequences
R:
No suggested primer sequences
Band lengths:
Functional annotations
There are 0 annotated functions for this event
GENOMIC CONTEXT[edit]
INCLUSION PATTERN[edit]