MmuINT0133068 @ mm9
Intron Retention
Gene
ENSMUSG00000040423 | Rc3h1
Description
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Length
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Sequences
Splice sites
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VastDB Features
Vast-tools module Information
Secondary ID
ENSMUSG00000040423-Rc3h1:NM_001024952:19
Average complexity
IR-S
Mappability confidence:
NA
Protein Impact
Alternative protein isoforms
No structure available
Features
Disorder rate (Iupred):
C1=1.000 A=NA C2=1.000
Domain overlap (PFAM):
C1:
NO
A:
NA
C2:
NO
Main Inclusion Isoform:
NA
Other Inclusion Isoforms:
NA
Associated events
Other assemblies
Conservation
Fruitfly
(dm6)
No conservation detected
Primers PCR
Suggestions for RT-PCR validation
F:
GGGTACAAGCAAGCAAGCAGA
R:
CGGTGCTTTTCCTGGACTTCA
Band lengths:
351-2209
Functional annotations
There are 0 annotated functions for this event
GENOMIC CONTEXT[edit]
INCLUSION PATTERN[edit]
SPECIAL DATASETS
- Pre-implantation embryo development
- Muscular differentiation time course
- Spermatogenesis cell types
- Reprogramming of fibroblasts to iPSCs
- Hematopoietic precursors and cell types
Other AS DBs: