MmuINT0140008 @ mm10
Intron Retention
Gene
ENSMUSG00000016763 | Scube1
Description
signal peptide, CUB domain, EGF-like 1 [Source:MGI Symbol;Acc:MGI:1890616]
Coordinates
chr15:83703418-83721981:-
Coord C1 exon
chr15:83721850-83721981
Coord A exon
chr15:83703547-83721849
Coord C2 exon
chr15:83703418-83703546
Length
18303 bp
Sequences
Splice sites
5' ss Seq
AAGGTGAGT
5' ss Score
10.47
3' ss Seq
TCATGTCTCCACGCTTGCAGACA
3' ss Score
7.26
Exon sequences
Seq C1 exon
GAGCCGTGGACGTGGATGAATGCTCAGAGGGCACAGACGACTGCCACATAGATGCCATCTGCCAGAACACACCCAAGTCTTACAAATGTCTCTGCAAGCCCGGCTATAAGGGGGAAGGAAGGCAGTGTGAAG
Seq A exon
GTGAGTTCCCTCAGCCCTCCCCAAGCCGGGGCCAGAGGGAGGTGGCCGAGGCCTGCCCTGTGGCATAGCAGCAGGCTGATCCTATAGCCCAGCCCTGTGAACATGGGCAGTTCGGGCTTCTGTCAATCCTGCAGGCTTTTCAGGAGACATAGGCTGCTCACCTGGAGGGCAGAAGTTGAATATGTGGGGCACTGGACTCTCACCTAAATTTTAGCTCCCTTTGCCTTGATGATATCAAGGTTGAATGGTTAGTTGTGTGTCTGGCCCTGACTACGTATGAGAATCAGTAAAAGCCCAAGGTGATTCAACTTCTGGGTCCTTAACTTCAGCCTCCAAACCACCATGTGTAGCCTGCAGCTTCTGCAGAAGACCTGCCCACGAGAGGGCTGTGAGGCTGGCTCAGCTGCCTCTCCTCTTTCTAGCCCCAGTCTGTGGTTCAAATCGTTCATCTGTCTGTCTAGCCGCTCGTCCTTCACCTGGGGTGCTGCATTGATGGTTCAGAAACCTGTTCTCCAAGGAAGACATAGTGGCGCATGCCTGAAATCCCAGCATTCAAGAGTCCGTGCCAATCCAGGCATGGTGGTACACACCTCTAATCCCAACACTCAGTAGTAGACAGAGGCAGGTGGATCTCTCTGAGTTTGAAGGTAGCCTGGTCTACAAAAGGAAGTTCCAGGACAACCAAACTTTAAGACAGAAGCCCTGTCTTGAAAAAAAAACCAAAAAATAATTTTTTAAAGATTTATTTATTATTTTATTTATATGAGTACACTGTAGCTGTCTTCAGACAACACCAGAAGAGGTCATCAGATCCCATTACAAATGGCTGTGAGCCACCATGTGGTTGCTGGGAATTGAACTCAGGACCTCTGGAAGAGCAGTCAGTGCTCTTTAACTTCTGAGCCATATTTCCAGCCCCCAAAAATATTTTAAAAAAAGAGAATTTAAAAGATAAAATAGAATAAAAAGAGTTCAAGGCAAGTGGATCTATAGGCTAGACCATCTTAGACACAGTGGGTTTGAGGCTAGCCTGAACTATCTCAAAAGAAAGGAAGGGAGGGAGGGAGGGAGGGAGGGAGGGAGGAAAGGAAGGAAGGAAGGAAGGAAGGAAGGAAGGAAGGAAGGAAGGAAGGAAGGAAGGAAGGAAGGAAGGGTCTCCCCAACAGAGGAATGTGAATCCTCTGTGGTTCTGGGAAGTGGGAGTCTAAGCTACGTCTCATGGTTATTTTGGCCTCATGTGTATTGGGCAGAGCTTAGCTATTGGGGTCTATAAACTGTTCTCCCTGATCACGTACTCCTAACTGAGACCTTCCCTCCCACCATCACTGTACAGAGAAAAATCAAGCATTGATTTCAGTGTCTCCCAAGTTTCACAGCAGCGCAGACAGAACAAAACCCCAGGGTTTCCTATCCTCACTCAGGCTGGTGTTCAGTCTTCAGTGTGGGACTGATAGCCTTGGTCAAGCATTTCGTGAAAACAGGATGATGTCCTGCCTCTTCTGACCAGGCTCTGCAGAGCTGGGGCCTTACAGCTGCCCGGTGCCCCCAGGAATGCAGACCTACCTCACTGACCCATTGCATTGACTCGGCTTCTACAGGCTGAGAGCTGAGCAGATGGCAGCTTCGTGGGTCCTGCTTAGTGTCAGCTTGCTTGGGTCCCCAGGAGCTGCAGGGAGGCAAGCAGATGTGACCCACAGACCTCTGGGAAGTCTGAGCAGGAAGAGAGAGCAGGTCATTTGCAAGGCTGTTTGTTGGCTGGTTCTGGAGGGTAGGTAGCTCCAGTGGTCCAGGTGGTGCAAGTGGAAGCATGTGTGTAATTTCTGACCCTCTCTTTGTCCTTAAGACCCGATGTGCCATGTTTGGCACAACCTTTCTGCTAGCTGAAGCCACTGATCTGGCCTGTCCTTCTCACAGCCCAGCTCCTGCTGTCCATTGCCCTCAGCTGACATCTTCTCCTGCCTGTTTCTCTGAAGCCCTTCAGAGCTCTGCTTAAACTCCCTATTCTGATGGAGTCCTGGGATGAGACGTATTTTGTTCATTTTGAGGAAGAATCTCGTGGAGTCTAGGTTGGCTTTGAACTTGTTACATAATTAAGGCTAGCCTTGAACTTGTTATGTGATTGAGGCTGACCTTGAACTCCTGATCCTCCTGCCTCTATTTCTGTGATTACAGATGATTACAGATGTGTATCATGAAACCTAGTTAGGGGTCAGACCTAGGGCTCCCTGCATGCTAGGTAATCACTCTATATCTGAGCTATGTCCAGCCCAAGAGCCAGGCTTTTGTTCCCAAGCAGTTTGGCCACCTGGCTCTGTGGACCTTTCACCCATCTCTGCCCCAGAAGGAAGTTGGAGTACCCTTCAGGAACACACATGTAAGGCACACGCCTGCATGACATTCACATTATACTCCCAGAAGCTCCTTAGCTGCCCTCCACTGTTGCTTTTCTGACCCTGGGTTCCAATTTCATATCTTGCATCCCCCAACGTTGTTTACTGAGGACTGGGTGTCAAGCCATATACAACTGGCTGTAACCCCAGGAGCTCAGGAGCGCCTCACTTACACAGTCTGTCATTCTGTTCCCAGCTCCTGGGGCAGGGCTGGTGATATCCCTGGTCTGTAGAATATGTTTAGTCTGAGTCATCTCCCCAGCCCTGACTGGAGTTCAGGCGAGCAATTTGTGAGACCCCAGCGAGTGGAAGGTGATGGGAAGCGGGAGCGTGGGAGTTGCTAGGAGGACCTTCTCTGTGATAGTGCCATTTGACCCTGTGTCATGTGAGAGGAAACCAGGGAACAGCTTGGCCTCTGCAAGGCATCTTGGTTGCAGCCCATCTCTGACATAAGCCCTGGGCGATGGTTTGCCCTCAGCAAGTCTCAGTGTCTCCTTCGGCTCTGTTCTCCACTCATTGTGAAGAGCTGAGCCAGGACACAGTGTAGTGTGTGAAGCCCTCCTGCCTGGGTGCCTAGCTCCCAGTATCCAACATGCAGATGAGTGTGTCACCTGCCACCATGTGCTGTTATAGGAGCTACAAGCTGCAGGGGCTTGTGAATGGTAAAGACCTTTCAGAGTCCCTCAGTGCCACACACATTGGAGGTAATGCTCTTGGTTCCGTATGCCCCACCCTTCGGTTGGTGGTGCTTAGGGGCTGAAGTTATGACAATCTTAATGCACAGCAAATGCTGGTTGGCCTGGATTCTGAGGGCCTGGGTAGGCCCAGACTGCTTGTCTTTGGTGTCCTTATTCCTGGAGACTCACAGACGGGCATTGGTTGGCATAAGCACAGCCTGCTGCAATATTAACACAGAGGCCATCAGAAACCCTAAGATGGCTACCCCCAGAAGACCGCAGACACATCTGCAGGGGCTGAGAGGCCACATTCAGGGTGGCCCGAGGGGGTGCAGAGACCACCCAGATGTTCATTTCCTTGTTTAGATGGTCCACAGGAGACCTGAGAGAGAAGGGCCTTCCTTGCCAGCGTTGGGATGAGAGCCCAGGTGTGGTGGGCCCATTGCTGTGTCTGCTGTGGTCACTGCTGTCTGTCACGTTCTGAATGGCCCTTATTCAACTGAGCAGTCATTAAAGAATAGATGTTGAGCCAGATTGCTGGGTTTCACATCCGGCCTGTGTATCTGGGTGAGACACTCAACCTCTGTCTGTACAATGAGCACCATTCCAGCATATACTTTGTAGGAGGCAAAGGTTAAGTGCGCTGATGTATTTAAAGCATGATAGCATAGCCTGGCTTGTAGCATGTAATACACAAGCATTAGCTGCTGTTGCTATGGTGATGGCAGTAGGGCTAACAGGTCAAATGATGTGGTACTTTTTACCTTTATCTGTTTTTTTTGCAGTGCTGAGAACCAAACCCAAGGCCTTGGGCAAGCCACATGAATCATTGTAGATAGACAGATGGATGGATAGATGGATGGATGGATGGACAGATGGATGGACAATGGATGGATGGACAGACAGGCAGATATATTTGGGTTTTTTCTTTTTTGAGACAGAGTTTCTCTGTGCAGTCCTGGCTATCCTGGAACTTGCTCTGTAGACCAGGCTGGCCTCCAACTCACAGAGGTCTGCCTGCCTCTGCCTCCCAAGAGCTGGGACTAAAGGCATTCATCACAACCACCTGCTAAATGAGGTGATATTGACTTAAATGATGGTTATGGGGATGGTAATATTGGTGACATTGGTGAGGGTGGTGATGGTGATGGTGAAGGTGAGGGTAATGATGATATTAATAATGTTAGTCACCGAGAGACTAATGATATGGATTGTGGTGTTGATAACAGTGGTAATGGTGATGAGATGATAGTGATGCTGATGATGGAGATAGTGACTGTGGTACTGATGGTGACTATGGCGATGGGATGCAGATAATGATGAGATGATTGTGATGCTGATGATGGAGAGAGTGACTACAGTGCTGATGGTGACTAGGGTGATGGGATGCAGATGGTGATGTCTGTGATGCTAATGATGGAGAGTGTCTATGGTACTGATGGTGACTATGGCAATGGGATGAAGATGATGATGAGATGTCTGTGATGCTGATGATGGAGAGTGACTATGGTGCTGATGGTGACTATGACAATGGGATGCAGATGATGTTGAGACAGTCTCCATTTCTGTTTAATTATCATCTCATCCTGATGATGTATTAATGCTGGTGGAAGGCATGCTATGGACTGACATGGTGACTGAGGCAAGGGCCTTGCTGGGGACAAATGGGATTGGCTTGGATCACTGATGAGGCTCTGATGAAGCAGAAGAGTTTGCTCTGTGACTTGTGTGTCCCCTGATTGCTCCTCCTGGTGGCCCTTTCCAAACCCATTTATGCATCTATTGTCTGCCCTGCCATACTATATATTCCTGGGATCCTCCTGGACCTACCTTAAGGGCTGCTGGCTGTCACCTGTTTGATTTCCAGGGACGAAGGGCGTGGCTGTGAGGAGAGGGGAGAAATCCCCAGCATCACCTCCTTCAGGAAGTTTTCCCTGATCCCCAAACAGGTGACTTCCACCTGTCTGTCGCCACCCTCCTCAGAGCCTGATGTTCTAGGCTGTGATGTCCCACATCAGTCCTCTGAGGTTGGTCCAAACCTGTTGTCAGAAGGCAGTTACGAGCCCAGGGAAAGTTGGGGAAGGCCTGCCTGAGCCTCGAACACTCAACTTGGAGGAAGCTGAGGCATGTGACTGGCAGGACCAGTGACAACGTTTATCTAGTGAAACTGGGTTCAGAGAGCTCAATCTTCAGCCAGGTGATCCAGCAGAGACTGCCTCTAGCCATCAGCCATGGGGTCCCAAGTGTCTGTCTGAAGACTGTGAGGGGAGAGGGTTCCTGAGTTCCCTCGCTGTGGAATGATAAAAGAGACCATACTGTTCTCTGTAGCTGTTCCCTAGAGACGGGTTTATGTCTGTGACCCACTAGGATCATGTCCCATGGAATAAATGGGAGCCCCTCCCCTTGGACGTCATCCACGGAGCCCCACCCCCTTGGGCATCATTCATAGAGCCCCTCCCCTTGGGCTCACCCCTGTCTCTGCCTAATCACTTTGAGCTACGTTTTTTTGTTTGTTTTTTTGTTTGTGTTTGTTTTTTAAATCCTTCCCTCCTTTATCTCACCCTAGCTACCTTAATTTACTCCTCAAAATCCAGCTTCTTTCTACCCCAGGACCTTTGCACACTCTATCTCCCAGTTCCTCTTCCCTTGGCAAAGCGGGTACTACTGCATCTCACAGGAACCTTTGATCATGGGTCTTTTGGAGGCCATGAAGGCCAGCCCTGCACCAGCCAGCCCCCTGTTCTGAATTAACCAGGCCTGTTTGTGCTCCTTCTGCCAGAGGGGCAGGCCGGGGCCAGGAGTGGGCAGCTCATCCCCCCTAAAGACTTCAACTCGTTTAACCTTAATCACCTTGCCTTCATAGACATTTGCAAAGGAAAAGGACCAAATTATAGCTTGAATTGGGTCTTACTAATCTTAATTAAAAGCTCTCATTTATAATCAGGACCAGGCCTCAAACAAGGAGCAAACCACCCTCAAATGGCTTGTTTAAATAACCAAGACCCCACCCCCACCCCCCGCCCCCCTGCTAATGGCTGTTTAGTCTGAACCCACAGCGCACATCGTCCTTCTATGTGTACTTAATTTTTAGACCATTCATTCAAGTGGTTTATTCCTCTCACAAGTTTCAACTCAGGCCCTTTTCAAAATGCTGTAATTAAAACTCTTGGGGGCAATGAGATTTTGTTTTGGCCACAGCATATTAAATATATTACTATTTTCCTTTCGGGTTGTGTGTGTGAAAAGAAAAAAAAAAGACAACCATCAGAGATCACAAACTTAGCATGTATGCAATGAGTGTAAATAATCACTTCCTGGATTTTATGTCCCCAGGGGGTCCCTGTCGATCAGTAAAGTTAAGCAGATTACAGAGCAAGTCATTAAAGGTTTTAACCAAACTCTTAATAACACACCCGGCCTTCATTTAGTTTATCATTAAGGGGGGGGGGAAAAAAAAGAAAAACTAAAACCAATTGGCCTTCGTAGCGAATAACGGCCGTGGTCTTGTTAAGTCATTTCCACCAGATTATAGCATGCTTTAGTGAAACTCCAGGTAGAGTTGTGCTTGAGGCAGGGGAAGGCAGGAAAAACTGGGGGTAGGGAGCTAGCAAGGGGGGACCCTCCCCCTAGGTCTGAAAACATGCAATTATGCTAATGTGTGTGCCCTCCAAGATTAAAGCTAGGATCCAGCCGACCAGCAGGGCAAGAGGACTTGAAGCTCCCAGTTACTTATTCCCGGGGAGCAATTAGGTGGTGGTCTCATTTCTGTTCTGTTCTGTTCTGTGAGAACAGAAATTTTCATCATACTTCCATGAAAAGCAACATGAAGGGAGGGGGGTGGGGGTGGAAGGGTGTGGTTTAGCTTACAGATCCAGGGTACAGTTCATCATTGTGGGACGTCAGGGCAGAAACTCAGGTAGTCATGTCCGGTTCACACTCCAAGAACAGAGAGACAAACGCACGCCTGCTGCCGACTTGCTTAGGGATGAGCGAACCCTCTCCATGCTTACACAGTCTAGGGCCCCAGACTCCTCACAATACACTGGGTCTTCCACAGCCATGCCCATGGGGTCACCTCGATCGAGACAGCCCCTCATTGAGACTCTTTTCTCAGGTGATTCTCAATTCTGACAAGACAACAGTTAAAAGTGACCCGCAGGGATGGGGCAGGGCTGGAGGGATGGCTCAGTGGTTAAGGGTACTTGTTGCTCTTGCAGAGGATCCAGGTTCGATTCTCAGCAACTACTTGGTGGCTCACAGGCTTCTGCGAGTCCAGTTCCGGGGGGGGGATCCAATGGCCTCTTCTGACCTCTGTGGGCAACAGTCACACATACGTACCCACAAGCAAGACACTCATACACATAAAATGAAGAATAAAATAGACCTTAAAAAACAAGCTTTGCCGGGCGTGGTGGCGCACGCCTTTAACCCCAACACTTGGGAGGCAGAGGCAGGCAGATTTCTGAGTTCGAGGCCAGCCTGGTCTACAGAGTGAGTTCCAGGACAGCCAGGGCTACATAGAGAAACCCTGTCTCGAACCCCCCCCCCAAAAAAAAAAAAGAAAATACAAGCCTTACCAGACCAGCACAGGCAGGGTTGCTTGTGACTGGCCCTAGTCAGTGACAGTTTAGGTCACTGGGAGAGTTGTTGGGGCCCTGACTGTCTGTAGCAGGGGACAGTGAAAACCTTGTGTACTTGGTAGGTTTGAATTGAAGACAAGTTCCCTTTCAGGGTGGGTCCTGGCCCCAGAGCATCCAGAATGTTTGCTAAGGGTCTCCTCGCTGTTAGTTAGTGCTGGGCCCAAGTGTTTCCTGGTCATCACTCAGTGGTTAGCAGGAGGTTGCACAAGACAAAATGAGTTAGAAAACCTTCACTAAGACAGAGACAGGACTCAGTGGAGGTAGGGAAGAGAAAATGGATATCTCCCCCTGCCTGTGGTAGGGAAGACATCAGGATGGGGTGGAAGATGTATATGTGTAAGGGGGGGGGGGTTCCTAGGGGAGGTGTCATCCAAGCCTGGCTAGGAGAGTGGAGTAGAACCTGGCCTCTGACATCACCTTCAGCTCTGGGGCTGGTGGTTAAATGGTGGCTCAGAGGGGCTCACTGACACCCACCCCCATCCTGCACGTGATGGGTCGTCTGGACCCCTGGTTTCCTCAGTCCACCTCCCTTGACAGTGGGACCAGCAACACCTGCCTGGGGGTATGCACTTGAGTAGAGGCTGTGGAGCGAGCCTGTGGCAAGGGCAGTGGTTCTCAACCTGTGGGTCACGACCTCCCCCGCCCCCCCCATGAGGGTCACAGAGCAGGTATCCTGCATATCCGATATATTTACATTATGTATTCATAGAAGTAGCAAAATTACAGTTGTGAAGTATCCACGAAATAATTTTATGGTTGGGGGGGTCACCACAGCACGAGCAGCTGTATTAAAGAGTCATAGAGTTAGGAAGGTTGAGAACCACTGCCTTAGGGGTGTTGAAGGCAGTCTGAGATGCTTTGTGTTGGGCTCTTCCCACCTGGCTTCCCACTCCCTGGGTGTCCTGTCCGCCTACCCCTCCTCAGGTGGCAGACCTTCCCAGTGCTGCCTGCAGGCCCTCTCGCCTCCCCTTCCCCTCGGCTGCTTCTTATTACAGTGGCTGTATTTGTGTTTCCATCAGAGGAATGCTAACCAGAAAAAAACCATTATTTCTAAGAAAATAAACTGTGGGCTCGTTGGCCTTTGAGTGCTACTGAGATGGATACTGGCCTTCCCCCGAAGACCATGAGACAAAGAGCGCCGGGGGCTCGTGTATATGGACAAGGTCAGGGGGTCCCAGAGGCTGCCCTGGCTAGGTCCTCCAGATGGATCCAGGCTGCAACCCTGGGAGGGGTGGGTCTGTAGGTTTTAGCTGGCCTCAGCTGGCTCTTAGCAGTCGCCAGGGCTGATCTTTCCCTGTTCTTCTCAGAGTCTCCGAAATGTTCCTTTCGCTCTGAGGACATAGGCCTTCTGCCTAGACCTTCCTTCTTGGTGAAGGGGTATAGAGCTGAGAATGTCCCCATGTCCCCATGTGAGTCTCTGAGGCTTCAGCATCATGGTGCTCCCTACCCTGGAGGAGCTGATGACCATCAACAGAGCTCAACCACCTGCCCCTTCCCATTGCCGCTCCCACAGGCAGACCTGGATCTCACTGGGCTCCTGTTGGTTTCTCCTCAAAGCCAGTCTGGTAGCTCCTTGTGGCCAGGATCCAGGTTGCGAGCAAGAGGCCTGGCATAGGTACAGAATGAGGGCAGGCAGGTATCCTGATCACCAGTAAGTATGATGGGGCATAAATCTCTGGTCAGTTGAGACCTGGGACTGCCCTTGGGCGGCTTCATCTGGATCAAGGGCACCGACTCCAAAGCTAGCCTGCTCGTGTTGGGGTTTTGGCTCTATAGCTCACTTGCCCCGTGGGTAGGGAAGTGGATCCAGATGGTCTACCTAGGCCACAGGGAAGGTTTAGCCAGTTGCCATGAGCGGTGATCTCCTCTGTTACTTCTCTTGTTTTGGGGGGATCACGCCCTACAGGGATCTAGGAAGGAAGATGGGGAGCCCATCCACACAGGTCATTTCAGCTCAGGCTCACAGCCACGGCCACAAGGACTGAAAGCTGAGTGGGGAGTCCTGGGTCTCAGCTGCCATCAGTCCAGGCTTGCTCTCAAGCTAAGTGCTCAAGACCTACGCTGTTACATCCCTATGCCATTCAGGGAACATAGACTAGCTCTCTGCCATTTAGATGAGACCTTTGCTGGCACCTGGGCACCTCTGATGATCTGGGGGTCGGGGTTTGGAGGCCCTGGAGGGTTCTGAGGTCTGTAGCACGCCCCCTTCGGTCTTGCCAAAGGAAGGAGAGAATGGCTGAAAGCTCCTGGGATCCAGTTTGTAGCAAGCAGGAAGGAGCACAGGGATGTCTGAGCCCCACACACCCCCTCACTGCCACACACCCCACCCCACCCCCTGCCAGACACTTCTAAGGCTTGGTTTCCCTTAAGTAGTGTTTCATGAGGTCTTGAAGCCAAAACCTGGAGAAGCGGCCCAAGGAGAGTTTACAGTTGAGGGAGAAGTGTAACAGTTTGCCTATCCTTTTCCTAGTGGCTTGGTAGGGACGCCCTTCTAATCTTGGGAGAACACACCCTACCATGAACCCAGGCTGAGCAGGTGGCCTTGTTTAAAGTGAGCATCCTTGAGCCCAAGGTAGTGGTACACACCTGAGATGCCAATACCTAGGGGGGCAGAGGAAGACGGATATTGGAGGCCACCCTGGGATACGGAGTAAGGATACTTTTTGAAAAACAAACAAAATAGAAAGCACTGTACACCCAAAGTGACCACCCTCACAGCCCCCCTGCATCCAGGCAGGAGAAAAAAAAAGCCAGCTTGCCCCACAGATACGTGCAACAATAACACTGGCTTTCCTTCGATTAAAAAAAAATGATTATTGCATGTTTGTCTGAGGCATGCGGGGCGCGTGCCACCGCGTGCTGTGCCGGAGGACTGAGACGCAGTGGAGGCGGCTCTCTTCTTTGAGTTTTGTGTGGGTTCTGGGAAATCATGGGCTGTGCCCCCAGCCCGCTTTCTCTTTGTTTTCAAGACTGCTTTGTTCACATACTGCATAGCTGACCCATCTGAAGTCTGCAAGCCGGTGCCTTTTAGTGAATCCACAGTTGCTCTCAACACAACCAGTTTAGAGGTGCCATATTTCTTAGCCTACACCCCAAGCCTGAGACCTACAGCCCCTCATAACCACTGGACACCAGTAGTACACATTCTGTCCCTGGGCAGGCCTATTCTGGAGGCACTTTGTGGATAGGATCACCTACTATGTGGCCTTTTGTGGCTGGACGGTGTTAATTTTGAAGTCAGGCAGCCTGGCTCAGTTCCTGGCTCCGTGTGCCTTAGTTTCCCATCAATGGATACCAGGGGTCCTTAACTTGGCATAAAGTTAAGATTCTTGTGCCCACCTCTTGGAGCTATCCTGTGTGCAGGGCCTGCAGTCCTGCCCAGTGCTGTCCCACATAACGCAGGGCCAGGCAGCAGAAGCAACAGCCTAGTCCTTGTTCATTCAGCACGCAGCCACTGCTAACTGCACACATTCGGCTCGCTTCAAAGGCTCAAGCTGCAAGTCCCCATGGACAGGCAGCTCCCGGTGTCACAGTGATGTTGGTGTCTATAGGTGGGGGGAGCTGGAGGAACAGAAGGAGGGAGATAGGCTAAGCTTCAGAGGGGGCCAGGGTGATTAGGAGCCTGGGCTGGGGAAGGTACTCCAAGCATGGAAAACTGCAAAGTGTACTTAATGCTGACCGGAAGCCTCTCCGGGCACTGGAAGAGGTCACAGAATAGCTGTAACCCCATGGTTGTCTCAGATCTCAGAAAGGGGTAGGGAGACCCTCACTGCCTCCGGCTGAGCCGTGGACCTTGTTGGCAGTTAGGAATGAGGACGTATATAGACTGGTGTTGGTTTTGTGTGACCTTTGACCTCTCCCATAATTAACTGCTGGGCCCACTTCTGGCATTGTCTCACTAGAAGGGAGACCTGATCGATGGATGCCAGGGGTCCTCAGAGAGCCTGTCTCATTACTCAGCCATTACAGACCCGGAGCTTAACCCCGCGCCACCGGAGACAGGGGACTTAATCCTTCCTGCGAGGCAGAGAGAAACTACCTTCCCGAGAGCATAATTAGCCAACAAACCGGATTAAGATTTATTCATCAATAAGGACTCAACTTCCTAAGCCATACATCTCTCCCAGAATGGACGTCTATCTAAAGAGTGCACAGTTTTCCTAAAGCCACAGACAAAGGGGGGACAAGCTAGCGCCCAGTCGGGGACTGGGCCTTTGTTAGCAATGGGGCTTCGCATCCGGGAGGAATGTCTACAAAAATGCCAATCAGGGGGAGGTGGGACTTGTCAGTAGTGGCCCCTGAGAGTGAACGTGTGGTTACTTTCAAAACCTTCCTTTTGAGGTTTTCCCGTTAGCTTTGATTTAAAAAGAAAAGAAAAAAAATTTTTTTCCTAAAACAGTATTAAAATACGACGAGAGAGCACTCTGATTCATCAGGAAAGAATCTTCTAGCGCCAAGACACCACAGAATAAATATATATTTTATAAGGCAGTGAGAATCAATTTTGAATTAAATAGGAAAAAAAATGTCCATGCTCTTTGGGGTCCATCCCATCATTGTGGGATGGCATGCAAGCTAACATTTTAGTATAGGAAAAGAAGGACCATGTGACCTTTGGAAAAGCCCAGAATGCACGGCTCCTGTGTTGTTTGTTCTGCTCTATTGGATTCGGAAAACTATCCTCTACTGGAAACTAAGCTTTCATTAAACGAAGGAGGGCAAGATGGCTCACAGAGTGAGGGTGATTGCTGTCAAGCCTGATGACTGGAGCTCGATTCCTGAGACCCCACGTAGTAGAAGAAATTCACAAACTCCTGCAAGTTGTCCTCTGACTCTCATGTGTACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACCAAATGTAATTGAAAATTTTATCACACACACAAAAAGAAGTGAATGTAATGCAAATGTAATCACTAAAAAAAAAATTAATAAAAAACCCAAGCAGAAGGAAGAGCAGAGTAGGCAGTGAGCTGATGGACCTCACCCCTTCAGTGGAAGTTCTCCTTGACCCTCCCCATCACCACCCTGGGGTCTCAAATCAAGGCATCCTGAAGGTAGAATGTTCGTGCTTTTCTCTCAGTGACCTTTCTTCTTAATGGCTTTGTGGAGCAAGACAACCTGTTCTTCTCACCCCTATGTACCCTGATGATGTGACTCTAACAGGAGGGAGAGAAGGAGGAAAAAGGAGGAGAAGGAAGAGGAGGAGGAAGAGGAGGAAGAAGAGGAGGAGGAGGAGGAGGAAGAAAAAGGAAGAAGAGGAAGAAAAAGGAGGAGGAGGAGAGGAGGAGGAGGAGGAGAGGGTGAAGTTGGATGCAGCCACTGCCTGAGGATCTGTAGGGAAGGGCCTGAAACCTCTCCTCATTAAGGGGGGACCAGCACCCATTTCCCAGGTGACAGTGTCACGCAGCTCTGTCTCTGCCATCCCAGGCTGGCTTTCCTCTACATGCCTATATTCCTAGGGTATCTGCTAAAAATCCCAGAAAGAGGCTAGAGAATGGCTCAGTTGGTGCAAGCCTGGGGACCTGAGTTTGATCCCCCAGTCCCCATAAAAGCCAGTCGGAGTAGTGTGTGCCTGGAGTCACAACACTGGGGAGATGAAGACGAGTTCACTGCCTGCATTTCAGCTGAATTAGTGAGCTCCAGGTTCGATGTGAGACCCTGTCTAGAAGAATAAGGTGGAGGGCTAGCAGATGGTCCAGTGGGTATAGGCACTTGCCATACAAGCCTGATGACTGAGTTCAGATCTCTGGACACACAAAAAGCTGGCCACTGTGGTGAGCATCTGTGATCCCAGACTCCGTAGATTGGCATCGACTATGGCTTTCTCTATGGAGAGAGACTCAATGAGAGGGAGGCCTAGAAATCATTTCATTGACTTCCACAGTTGCTTTATTGCATCTTAGACTATGGTGCTGAAACTACTTGTCATCCTGATAGTAAGAGTGTTCTTCTTAATCATTAGACACTGACAACAGGCACCGATTAAACTTAGGCCAGGCCCACTGGGGTGATTCTCCCAGTCAGAAGGAATGTCTCCCTATTTGGAGACCTATGGATGCTCAGGTCTTACCCCCACTGAACAGCTGGTTTAGTTGCGTGTTGTGGACATGGTAACCCTATAAAAGATTGTGTTTCTTTCTCTGTGGGCACCTTGGAAGCTCACCTTGTGTGACTGGGCAGGGATTACGTGCTGTATTACTTAACAGTGTTGCCAGCCCATCTCACTTGTTTTCTCTGTCTTAAACCTTTATTTCTGAAACCCGTGTTGTATTTATTTATTTTTAAGCTGTTTGAAGGAAGTGAGTGATTGAGTAGAGGGAAGATTGGATGGACAGATGGATGCATGTTTGTATGTTAGATATAAGGAGGAATGAGTACGCAGGGTGTGTGTATGTGTGTGTGAGTGTGTGTGTGAGAGTGTGAGTGTGTGTGTGTGCATGTGTGTGCATCTGTGTGTGAGTGTGTATGAGTGTGCACATGTGTGTGAGTGTGAGTATGTGTGCATAAGTGTGACTGTGTGTGCAAGTGTGTATATGTATGCATGTGTGTGAGTGTGAACATGAGTATGAGTGTATGTGCATGTGTGTGCACCTATGTGTGAGTGTGTATGAATGAGTATGTGTGTGCAGGTGTGTGCATGTGTGCATATACATGTGTATTTGGAGGGTGAGTGTTTGCAGCCATGAATCTATGGATGGGTGGTTAAACATTTGTATGGACATATGAGTGACCAGGTGTGTGAATGCATATTTCTAATTTATGGGAGGACAGTGCACAACCAAATATATAGATGGATATATGAATGAATGAAAATGAATATGAATATAAATGAATGTTTGCTTGGGTAAATGGATAGGTTTGTAGGTGACTGGTTAATGGAAAGATAATCCACCAACTCACATTTTAAGGTGAATATGTTTTTGGCATAAATAGATAAATGGGAGAGGTGCTGGGTGGGAACTTAGGGAGCTATGCCATAGAGCGTACAGACACGTGGATAGCAGGAGGAAGATGGGTTTTGGCTGAATGACTGACTGTATGGCTGGCTGGCTAGAGACTGAGCATATGGAAAGGCATGCACATGTGTGTGGATGAAGGAGGAATCCATGCAGGGCAGAGGGGTGCACAGCACTTGGGTGGCCAGGAAACTTTCTCAGTACACAGCAGAAATGCGCTACGGATGGAAGCTTACATGGAGCCTTTGGCCTGTGGCTGGCCTGTGCTAGGCAGTGTGACCTGGAAGGAAGGATGTATGTGTCCTGTCTCCTCCTATGTGACTTTCAGCGGTTCTCTGACCTCTCTGCATTTCAGTTTGATCAGCCGTGAAAAACAGCTCTCCATAGGACTACACTGAGGCCAGGAGGGGCTCTTGTTTCAGGAAGGCTGGCTCCCTGCCCTCTAAGGGGCAGCATGAGAAAGGTTATTCTTGGCACGGAAGTCTATTCCCTCAGTCTGGCTGATCCACAGGCAGATTCTGTTGGGATCAGGCCAGTCACTAGCTTGCGGGGGGGGGGGGGGGGGGGCTGGAGTGGGGAAGCTGGTCGTTTAGTCGGAGGTGATGCCCATGCTGGCAGACAGTGGAAGGAAGCCTATTACTATGTTAAAGAAAAGCCACTTAGGTAAACAACAAAAAAGCCAGATGAACCTGTGCCTGTGTTTCCAGCACTTAAGGGTAATGGTGAGGGAACAGGGTGGGGGTGGGGATAACTGGATCCTTGGAACTGACTGGGGATCCAGTCTGGCTGCCCAATCAGTGAACTCTGGGTTCATCTGAGAGACCCCATCTCAAAAAATAAGACGAGAGTGATACAGAAAGACAGCCAGTGTTGGCCTCTGACCTCTAGATGCTCATTCACACAATGAGCACACTTGAACAGACACACACACGAAACACATACAGACACACACCCACACCACCACCACACACACAGATGCGTGTGTGTGCGCGCTTGAAGAAGGGAAAAGCCATTCTTGTTATCTGCAACATGGAAGGAAAACAATATTGTCTGTGAAGGCGAATCCCAGAGCTGGGCAGCTTGGTGACTTAAAGCCGGGATGTATTGCCTGAGGGATGTAGATTGAAGCCTAAAAGACATGTTTAGAATGATGTGTGCAGGACTCTGAACGACCAGGGCTGCATGCAGAGCCTAAAAGCAATGGTATCCCTAAGTGGGGATAGTGCTCAGCAGGCTTTCCATAAACCTAAAGTCTCGCATCTTGCCTTAATGTTATTTAAACTACTAGGTATATCTAAAGTCGGAGTTAAAGATGATTCAAACATGTTGCGACTCAGTTCTCTTCCCCAGATAGCACAGGTGATCACTGCGAGCAGGGGCAGAGCATCATGACTCCAAGACCTTGGTGGAACCCCTACCTTGTTCTTCCCTCTTCTGGCTGGGTAGTGGGGTGGGCTCGTGCATTGGATCCTTTCAAGGGTTATTGGTTTTGCTCCTTGGGGTGTCTGTGCTATGCTTAAACACTTCCTAGGAGAGTCAGAAGTGAGTGAGCTCCTGGGTTTCCAGGCTAGTGTTCCTATACTAAACTAACCATCAAACGTGCCATGGCTTCTCTGTACACCAGCTGGTGCGAGTGCGGGTCTCTAGGATTTCCCTGCCCCACTTCAGACTTGGGTTCAGGCTCCTTCCACCTTCTCCTAGAGCTTCAACTCAAACTTCTACTCCTGGCAGATAGGGGAGGAAATGCTTCTTCTATCTTGGAAATTTTTCTTCTGTGTCTTGAGATTCACTTTCGGTTCAGCCATGACATGCTCCCTCTGTACAAAGATCACCCTAGAGTCCCTGGAGGTTGGTCTCAGTGTAACTAGAAGGCATTGAGCCTAGGGAGTATTTGCAAGTGGTATAGCCAAAGACCTGTACCAGAGGTGCCAGGCCCCAACCATGGCTGGTGGGGTCATTCTGTGCCTGGAAGCCAGAGTCGTGTTTCGCTTCTTAGGATCCTACTTGCATCCCTTCCAGGTGTGTGGCCTTTGGCATGGTTTTATCTTCCCTGTGCCTTCCTTCAGTGCCCTGTACAAGCGGACTGGGGCTGAGTGCCTGTCTCAGTTAGGGTTGCCATGACCATTACCAAAAGCAAGTTGGGAAGGAAACTCTTCCACATCGTAGTCCATCACTGAAGGAAGTCAGGGCAGGATCTCAAACAGGGTGGGAACCTGGAGGCAAGAGCTGATGCAGCGGCCATGGAGGGTGCTGCTTACTGGCTTGCACCTTATGGCTTGCTTTCTTTTAGAACCCAAAACAACCAGCCCAAGGATGGTCTCACCCACAATGGCCTTAGTGATCTACAGGCTTGCATACAGTCTAATCTTATGGAGGCAGTTTCTTAATTGAGATTCCCTCCTCTCAGATGACTTCAGCTTGTGCCAAGTTGACATAAGTCTGGTCAGCACAGTCCCTGTAAGGACTTTAGAGATAACAGCATACAGTCCAGCCAACCCCTTGGGCTTAGAAGCAGCTCATTGAATGTTAATTAGACATGTTCTTATTCTTCTTTCTGGAACCCCAGAACTTTGACCCCTGCTGGGAAATGTTGAAAAAAGACTTAAAACAGCAAAAAAGAATGACCTTTACAAAAGCTATTGACCATTGTTTATGAGACAGAAGTCTTTGTTATAACAAGGAAGCTGGAGCAGCTGAAGGCCAGGCCTCGGGCCATAGGGAAAGCAGCTACTGGGGTTAGGGGGTAGTAGACATTCTTTCATTCCAGAGATGACACTCCCGGTGATGTACAGAGTTTATTTTACTTGGTCTCCCTGCTTTCAAAAGAGCTAGTTTTCATGGATGTAGAAGCGCCCCATATGTTGGCAGTGTTGGCAAGTCTTTAGAAGGAGCCAGAGCCAGACTTGACTCTTACCTGCTTCGCTGTGGCAGGAACTGGAAGCCCCACCCCCAACACACACATACACCCACACAACGTGACTCTTCTGAAAACTGGTTGTTAGCCTTGCTGCTGAGCCAAGAGTGTGTCCAAATAATTCTTCAAGTGTATTTTATTGACTAGCCGTTGAGCTATTCCCCTGTTCTAATTTCATTTCTGATGTTGTGATTTAAAAAAACAAAAAACCACTGTAACAAAAATCAACTTAAGGGAAAGGGAATGTGGCTCTTGATTACAGCTCCAGGACCCAGTCCACTGTGGTGGGGAAGGCAAGACAGGAACTTTAAACACCTAGTCAGTCCACCCCAGACAAGGGCAGAGAAATGAGTGCATGATGCTTGCTTGCTTGTTTGTTTGTGCTCTGCTTGATTTCTCCGCTCTTGTCCAGCTCAGAACCTCCTGCCTAGGGAATGGTGCCACCCACAGTGGGCTGGGTCTTCCCATATCAATTCCTTAAGCCAATGCCCCCTCAGACATGCCCACAAGCGAACCCAATGCAAATAATCCCTCCTTGAGACTCTCTTCCCAGGTGATTCCAGGTTGAATCAAGTTGACAATTAAAGCAGTCACATCCCCTCGTGAGTCATATCCTAGTGGCTCGCCCTGGTGAGAGAAGGAACCCAAGCTCTTATTCTGATACTTCTCATGTCTCCACGCTTGCAG
Seq C2 exon
ACATTGACGAGTGTGAGAATGACTACTACAACGGGGGCTGTGTCCATGACTGCATCAACATCCCTGGGAACTACAGGTGCACCTGCTTTGATGGCTTCATGCTGGCCCATGATGGACACAACTGCCTGG
VastDB Features
Vast-tools module Information
Secondary ID
ENSMUSG00000016763:ENSMUST00000076060:2
Average complexity
IR
Mappability confidence:
NA
Protein Impact
ORF disruption upon sequence inclusion
No structure available
Features
Disorder rate (Iupred):
C1=0.000 A=NA C2=0.000
Domain overlap (PFAM):
C1:
PF129472=EGF_3=WD(100=80.0)
A:
NA
C2:
PF126622=cEGF=PU(83.3=45.5)
Main Inclusion Isoform:
NA
Other Inclusion Isoforms:
NA
Associated events
Other assemblies
Conservation
Fruitfly
(dm6)
No conservation detected
Primers PCR
Suggestions for RT-PCR validation
F:
No suggested primer sequences
R:
No suggested primer sequences
Band lengths:
Functional annotations
There are 0 annotated functions for this event
GENOMIC CONTEXT[edit]
INCLUSION PATTERN[edit]
SPECIAL DATASETS
- Pre-implantation embryo development
- Ribosome-engaged transcriptomes of neuronal types
- Neural differentiation time course
- Muscular differentiation time course
- Spermatogenesis cell types
- Reprogramming of fibroblasts to iPSCs
- Hematopoietic precursors and cell types