Special

MmuINT0147180 @ mm9

Intron Retention

Gene
Description
solute carrier family 4 (anion exchanger), member 4 [Source:MGI Symbol;Acc:MGI:1927555]
Coordinates
chr5:89316285-89363847:+
Coord C1 exon
chr5:89316285-89316349
Coord A exon
chr5:89316350-89363773
Coord C2 exon
chr5:89363774-89363847
Length
47424 bp
Sequences
Splice sites
5' ss Seq
GAGGTGAGT
5' ss Score
10.03
3' ss Seq
TTTCTTTTCTATTACTATAGGAT
3' ss Score
9.78
Exon sequences
Seq C1 exon
GCGGCCGCTGCAGCCTCACACTCGGTCGCCAAGCTGGAGGAGCGACGGAAGCCCGACCCCAGGAG
Seq A exon
GTGAGTGGCCCAAGCGGTGGCAGGGAGGGTCGGCCACGTCCCCATGCCTCGCCCGCGGGGTGGGCACTGGGTGGCAGTCCCGCAGGGCGCGCGGGCGGCCTCGGTGCGTCCAGGGAGGGACGCAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGGTCAGTGGCGGGCCAGGCATCCCCTGGGCTGGGCGCCGGAGAAGTGTGGACACCGCTGCTGTTGCTGCGGAAAAAGTACTTTTTATTCTGTCTAAGCGTTCAGATGACGACTTTGGGTGGTTCTGTTTTCCCCCTACTGCATAGCCGCCTGCACGTAACCGGGCGTTGTTGCCACGACTGTGGGGCCAGTAGACGCCCGGGCTGGGCTCAAGAGCAGTGACACTGTGTTTCCTTGAGCCCGGGTGGTCGCGGTGTGGCTGGGAACCTGCTTGAGGGGGGACACACCTCCAGATCCTTAAGCTCTGGAGGTTGGGGCAATAGTGCCATCGAGGCCGTGGTCCCTACTTCACTGTCCGCTCCAGGACCGGGCACTTGCATCTCTCCCTGGCACGCCGGAGGCGGGGGTGAGTCAGGCAGATTCTCTGCAAGCGGCACACATTTATTTGCAAGGGGGTGGGGGGAGTCAGAGGTTAAACTGGGATTTCTGTGGGCTGGCGACCGTGGAGCTCTCTCTCAGGTACTGGGCAGCATGTGCATCTTGGCAAGGACAGGTGATTCCTTTCTTAAGTGCATTGCCCTCAGCCTTTGCCAGTCTGTTAAGAACAGCCACCGAGCGACAGCAACTAACTGCAGCGGGCTCCACAAAGAGGAAAGTTCTCCGAGAACAAAAGGGGAAAAGAAAACCCCTCAACTTGGGAAACGCCAAGAAAGCATGTCTGCCTTGGCTCTAGCAAGTAGAGCCCTTCTCGGTTCCCTGTAAAGGTGTAGCTTTGCCTTTCTCCACTCCTAGAGGCCCCACCTTCTCAGCAAGATTGCCTGCAGCAAGTTCTTCCAGTCTGAAGTTCAAGTGCTCAAAGCACCTTTCTCTTCCCCTTGCCACTTAACTTCTCTCTCCCTTTTCACTTCAGTGCTAGACAGACTTGCTCTGGGTGAGAACTCCCCGACGCTGGGCTGCAATAACACAGTCTCGAATCCTGGAAAGGCTCTTTCTTAAGGCGCTGCATCGAACTTCCCTTTCTTAATCAGGGACTTAGGGTTGCGATATTATCTGAATGGAAGTGTGTATTGCTCACTAGTGCCTATACTCACTGTGATTTGAAGAGATTCTCTCTGGCAGCCAGTCCTGTGCTCAGCGGCTCAAAGACTTAAAAATAAATGTTTCTAAGAACCCTGGTCCTTGTGTTTGTCACATTAGCGAAATACTTTCCAGTCATTATTGTACCTTAGACTGGGGCTATTTGTACTTCATTCAAAGGAAGCGTGCCTGCTTTGTAAAGCTTTCATAGCAGAGAAAAACTTTTACTTTCATTTTAAAGTTAAATCTAAACAGGATTCTGATCTCTCACATTAAATGGTGAAATTTAATAGTTTTTACCATATCTCCAGGTATAGGTGAGATGGTACAAAACTCCCATACCTAGGTAGGATAGGAAACTTCTGCTATGAATTCTTGAGGTATAGGGCACATATATGGATGGGGTGAGAGACAGAAAATGGGATATTTTGGTAGTGCCAGGTATATTTGAGAAAGCAGAAAGCCTCATCCCTTTCTGTCTTACAGCATGAAAATGTCAGTATCATTATCTGGTTGAGGACTATTTTTGAAGACATGCAAGGCAGGTGCACTTTTCAGGTGGCCAGAAGTATGCTCAATTTGCTGATGTGTTCCGTTTGGTTCACTTTGTCAACATAAGAGAACTCGCAGTGTATGACAACAAGTGCCATCATTTTAAACGAAGACATTTGGATTTATAGAGATACTGTATAAAAGGAAGACAGGCAACTGTAGTGGAAGGAAAAAAAAATAAAAAATGTGTTGGAAGCCAGGCAACCTTTGGGACATCTCCCAGCACACCCTGGTGGTAATCTCATTTTTCACTGAGCTCTGGCAAGTGCAATTTGAAGATTCTGATCTCTTGTTCTGATAACATGCACGATAGTCTCTAGCTCACAACTTAAAGGAAAACAGCACTTAAGGAAGGAAACACACTGGTGAATCACTGTAGGTAATCAGGTTTCCCTGCCTGCCTTTGAGGGCGCTGCAGTCCATGAGGACTGCTATTGTTAGGGGAGCCAGTCCTGGGAGAATGCACTGCTGCAGAAGTGTGGCCAGGATACTCTGTCAGCTTGTTCCCTGATGTTCCTTTTAAACGCTAGGAATAAAGGCTTAAGTCTGGATTTGATGCATAGTCAGGTCTCGGTTGGAATGAACAAGTGGAAGATGATTAAGGTTTCCAAGTTTGTTTGTTTGTTGTTTTTTTCCATTCCAAAATGGAAGAGATCAGGGTACATGACTGATTGGTCCGAGGAAGCTGTAAACAGACCACTTATCTTATTTGATGTTGCTTTTTTTAGGACAACTTGAAGACCCATGAAATTTGTTTTTAATGGAACCCTTTAGCAAAAATGAACAGTTAGAGAAGACCCAGGAACCAAATAGGACTTTACCAAACTAGATACTATGACTCTTGCATATAGGTATTTTAGGGGATAAATTCTGTTTCTTTGATATAAGGTCAGGGGTACGTTGGATACAAATATTTTTTGCTTAACTCCTCACGTTCAGACACTTAGTACATTTTGGTCATAGATGTTTGGGTCCTAACTTGAAGTCATTTCATGTACCCACCACTGCACGAGTTTAGCTATTTTTCCAGCCATAGATGTGGATACTTTTTCACACAGCGCTGTCTAATCTGCATAGTTACACACAAAACCACACAAATTCAGAGGTGGCTCATTTTATTTTATCTTCAGCCACATTGACTACTATCACAATGGCTCCGAGGCTATGCCTTGTACTGCATTTCTCTGGCCTCAGCAGAGAGTGCCAAGACAGTTGGCAAGGCCCCAAAGGAAGATGAGAGTGTGAATGGCCATGCCTTTATTTACCTGCTGTGAGATGGGAGAGGGAAAAATGCTTCCTCTAGTCTTCTACAGGAAGTGCACAGGGGTAGACTCCTTAGTAATAATGTCTTTGTTGCCCCTGAATTAGGAGCTGTATCGAAAACGGATGGCAGTGGAAATAGTAACAACAGTTATGGTGAAACTGTTATTCATGTGTTGTTTGTGGGAGCCAAAACGCAGTCTTCTTCCCTGAAAATCAAGCAGATGGAAGAGGTTTTTATACTTAGCTGGGAGACTCAAAAAACCAAGACAGTGAACTTTTAAAAAAACTCCCTGGGTAGTTATTGGTGGAGGCTAGCATTCACAGTCTATCTGCAGACCACTGCTACATCTTCATTGAAGGACAATGGTGAAGAGGATGGGTGTTATTTCAGTCACACAGGAAGAGGGTAAAACAGATGAAAGTTCATCTCGTTTAATGTGATCTTCATCACCCCTAGGCCGTGCTGCCCATCAGCAGTGCCCACTTGCTTCAGGGCTGAGGTTTGAGATGCTACAGTGCTGAAGGTGTGGCCCTGCTTAATTCTCCGTTTCGGTGTTTTCACCGAACTTCAGTCTTGAGGGCTAAGTTTATTTTCATGCAGAATTCACATAGAAGTCAAGTACATGAAGCTTTGCCTAGGACACCTCCTAATGATTGCTGGGATCTAGTTATATAGTCATCTATTTGGCATGCTCTCCGGAAAGAAAGGCTCCGAGCAGCAGAGAGACGAAGACATATATAGAAGCGGACTCCCGTCACTCAGGAGATCTCTTAGAGTCTTTGTATAGGAAGCACATTTGACATTTGAGTTACGATGGTTGTAAGAGCTCTAATATCACAGTCAACAGTAAACAAGGAAACAGAAGATAGAAATGGACTGAGATTGGTAGGTACATAGCAGATGCTGAGAGGGCTGAGTGGACAGCCTGTTGGTAAAGGAAGAGGAGACCCAAAGGCCATAAACGGAAGTAAAGCATAGAGCTTAAGATTTGATAGTGTCATGTATGGCAGTGCTCCCCTATTCTTCTTTCCTTTTTTCCCTTATTCCTTTCATCAGCCTCACCTATTTAAGTTTTGTTTGAAGTACAATATGTAGTCAGAACATCTCAAATGCCATTATAAAGCATCATCGAACAGCTCAACAATATTTGAGTGAATCCACCTCTGGAACCGGCACTCACATCAGGATGCAGGTCAATGGAAGCCTACAAGGCTCTTGTCCCCTCCACTGTTAGCCACTGTCCCTTCAGCATTACCTTTTCTCCCCTGAGGCTGTAGGTTACTGTACCTGTTGCTCAGTTTTCCATGAGGAGCCGTGCGGCATGTGTGTGGCGATCTGACCTTTCTTGTTGGATGCTATGTTTGGGAGATTCAGTCTGGGTTCACGAGTAGCAAATTTGTTTACTCTCGTTATTCTGAGGTGAATTACTTCTGGGGAATAGCATGATACATTTATCTGTTCCATTCTTGATGGATACTTGGGTTGTTTTCAATATTTGTCTCTTATGAAGTGGGCTGCTATGTATATTCCTGAATATATCTTTTAGTAAGTGTGGAGAGCTTAGTAGTGTGTGTTGAGTTCAGTTGTTAGATTTGGTTTAGTAGTTGGTATCTTCCCTCAAAGTTGGTACAGATTCATCCTTCTACATGCAGTGAATGGAAGTCTTCCACAAACATCTTTATGAACAGTGGGCCTTTTGTGCATTGCACGTTTTACCCAGTCTGTATGTGCATATCACATCATGGATTTAATTTAACTGTCCAGTGTACTCTTTGAAATGTTTACCAGGTATTCCATTAGCTTAGTTATTATTGTCATTTTTTTTTTTTTTTTGCTCCTGAAGTTTCTGTCTAATATATTATCCCAAGAAAGGAAGGCTTTAATACTTGGGAAACTAATTTCATTTGCTTGTTTAGAAAGCACAGCTAGTTGAG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TATCTTATCTGGTTCCTACAAATTTCGTGTAGGAACATTACGATGAATTGGACTTGGTTATTTCAGGGACTTATTTAACCAGCATGAACTGCTGTAGGCTTCTTGGAAAGAGATGCTGAATGGGGTTTGTTCACTGTCCAAAGACACAGTTACTAAAGAGGTTACGCTCAGTGTCGCTCAATTCCATCTGCACCTAACCACCAAGCAAAATAATATGTCCAGGATGATAAGTGAATACATCTTAGTTGGAATTTTGACTCAGTTGTAGATTGGAAGGCATAGCTGAGGAGAAATAGAGAAATTACTTTTGGAGGACAAACCCTACACTTGGCCAGTTTTGCTCCATGTTGATTAGCGCTTTAGAAAACTATAGCATAACTTGTATTTCCACTTCTGGAGTTCAAGGAACTCTTCAGATCTACCCAGTTTTATTCGTCTTCTCCTCTCTCTGTCTGCAGTCTGTATGTTTTTATTATCTGTGTAGATCCATGTTCCTGTCACCATGGAGGATAAGATGCAGAGTTAAGCTGGGACCACATCCATTGCTGTACCACTCATTCATAGCCACCAACACTCCCGTCTCTAATCCCAAGAAACTTCAGGTCGGGTCCTTTATATGGAAAAGCTGTCATTCCAGAAGTGTTATGTAAATGAATTGTACAACATCTGAGTCTTTGTCTTAGCATAAGCCCCTATAGATACATTGTTTTAGTGTGTGAATCAGTGGCTTCTCCTTGCTTACCACTAAGCCATAGTCCATGATATGGATGAACTATAGCTTTTAAACCATAACCATTTGCCTATAGAAAGGTACTTGGGCCAGGTCTAGTTCTTAGCTATTAGGAATAAAGCTACCATGAACACTCACAGACAGGTTTCTGTATGAATGTAAGCTTTCATTTCTCCGGGACAAGTGTCCAAGAGTACAAAGGAACTTGTAAGGCAGTTTGTAAGTCTAGAATTATGTGCAGCATGCTCCTGCTCTGGGTTGCAGTTTTACTTTTACTTTAGCCTAAAATCTGATTTCATGTGGGGCCACGTTTCCCTGGCCCTCGGCCTGTGTCAATGACCAGGCTGATTAGGGAGCTCCTGAGTTGGGAGGGCGGCTTACTCTACATGTGACCTGTTGGTCTGTGGGAGACAAAGCTGTGATCAACCACGTTTGTCAGCTTTGCTGTGCCGATCTCTCTCTTCCTTTTCTTAATATATCTCTCCAGAGCTTCAGCACTGTGCATGGTTAAGCCAGTGACCACCGTTGTTCTTCCTCACTTCCTGTGGGGACACAAGGCCCCCCAGGGACCTCTGTGAACTTGGGAAGGGAATGGTTACAAACTTTCCTTCCTTCTCCTCTTGCCATCCATCGGCTGTAGTGAACACATGTTGCCAAAAGATGGCAGTGCACTTTACAGAGCTGAGATGGCTCTGTCACCCAGGACTCTGACAGCTGTATGTTGCTCTTTATATACACCTCGCAAATACGGACAGCACATTTTACAAAGTAACAAAAGCACCGATAAAAATGCTGTTGGTTAAAAAAAAAACAAAAAAACAAAAAACAAAAGAAAACATCGTGTTTGCAGCGAGCTTATAATAAAGAATGATTCTCTACCTCTTAGAAGTGAGGAGGACAGGGGAACATTGTTTAGGCATTTTTGTGCTGTTCTGGAGTAGAAATCTGTGGTGTGCTATGTTCTATCTTTTATCTGACTTAAGGTCAGCCAAAGAGCCGGGAGAGCCTAGTTTTGAGGTTTGAGCTTTGTGATACCTTTAGACTGTAAGCAAAATTCCCCAGCAACACTGTTCATAATTACCACAACAGCAATGGCTGATATAAAAGTCTTCACTCTCGGTATTTTTCCACGTTTTATACATATCTGTGCCTCAGGGCATGTGAGTGCAGAATTGTTTAGCATATGCTGGGTACAGAAAAGCTTCTATAAATGGAGAGGTGATGGGTTCATTGGATGTCATCAACAAACCAAATGGCGAGGATAGAATATAATGTTTAAATACAAGGTTAACTAATAAAATTGAAGCTGCGTGCACTGATTGAACCAGTGATGTCAAACTCTAGTTTGGACATGCTGACAGCCGGAGTCATTCTGCTCCCTGGTGCCACCTCTGGAAGCAGGCAGAAGTCCCTGACAACAGAGACTGTGGGGGAGATAGGCTGGCTCTGGATACCGCTGGCTGCCAGCTCTAGCACAGCCCCTCTATACTGTGGAGAGCATGCTGAGGTTAAAGTGTTCGTTCCACAAAATAGATGCCACAATCCGAGGACACGCAGCATAACTGTCATTCCCGGGGTGACAGGGAAACAGGTGGCTCCAACTCAGGCAGCAGCCTTTTTGCTAGTGCACCTCTTGGCAAAAGCCCCAGGCTAAGAGAGAACTGTGCTGCATGAAGTTCTAACTCTGAAACCAGATGCTGTTACCATAGAGACGAGTGAACTGCTACCGTGGGAGGCGCGATAGGGAAGCATGGGAGAGGGAGACAGGAGGGCAAGTGAGGCGAATCTAAAGGCTAGCATACCCGTAGACCTTCAACCTTTAACAGCCCTGGGACTAGCAGGCTGGTGCTCTTGAAGCTTGTGCGCTGGCGGCCTGCCACTTGCTGACTGGCTGAGTGGCAGCTGCTTGCGCTGTGAGTACTAGTCTGCGAGCACGTTGGCAGTTGGCAAGGGCTCAGGGGGGGTGGGATCTCAGAGGGCTGGAATGTGGATGGGTGCTCTGGGCCTAGTGGCTGACAGTTTTGCACAAATGTTTCTCGTGCCGGACTTAAGTCACCCTCACAGGCCTGCTCCGTGATTAGGACCGGCTGGTGAGAACCTGCCCATTTGGCAGATGATTTGACATGGGTTCCAGTTAAAGCATTTTGCTATCCCAGAAAAATGGAGATTTAGAACCCCCTCCCCCCACCTTTTCCCCTCACCATGGGTCTGGACTTGTATAGAAGGGGTTTAACTTCTCCAATCAGAGGCCATGTGATATGAAGCTTGCCCTCCCTCACCCCTGAGGCTGGTAAGGAGCTTCCAGAGCCACTCTGCATTTTGCCTCACGCTGGCTATGTGAGCAACAGTATGCTTCCTTCTCTGATTTCAGCAAATGCAGGGCACGTGCGAAGGACATTTTAAAGGACAGATTTGGGGGCCTGATTACGGACTGGATGAGTTAATTTCTTCCTAGTGATTTATAGAGGGAGGGGGGAACTGGTTAGGTCAGCCACTTTACATGGTATCTCTCTCTGTCTTACTAATAATAGCCAGCAACTGCTAAGAAATGTAAGGCTGAATAACTGATATTTGTCATGTAAAGAGGAGGGACTGCCTCTGCCCCGTGCAGAAGGCCAAAGGCATCAGGATGACTTTGCTCTTGAGGAAGAGGAACGCCGCCAGGCTGTGTGCTTTTGCCCTGTTTCACTCGCTCCTTTTTGGCAGAGAAGAGGCCTATTTGTGGGCATTCTGTATGAGCCGTCAGAGAAAACGAGGCTCTGATGACTTGCTATGTATAGTCTTGACGGGAATGTGAAATATGCACCAAAGAGCCAAGGAATGCACCCAGCGTGACCCCCACTCCGTGCTCAGACGGTGGGGTTGGGTTGTTTTCTCAACTTGGCCGGAGGGCTTGGGTGCTGACCTTTTTACCTTCCCTTCCAATCTCTTGGGTTTCTTGCTTCCCTTTTGCTTTACATGTGGCATATAATTTTTGGAACAAGCTTCGATATCTAGGTTTAGAAAATATATCAAGAGACAACAGGATGCTTTAAGATCCTGCCTGATGGATAAGAGGGTCCAAAATGGCGTCTACAGTCGGTTGTGTTGGACTCAGCATGCTGACTGACCTGGGGTTAGTTCTATTTTCCGGAGGGAGGATAAAAAAAAAAGTTAGGGTACATGCAGTGCTCTGGGATTCTGTCGTGCTTCTGAGGAGTTTAGGAAAATGTTCTCATTGCGACGTCCTCCTTATCTGTGTGCACAAATGCTGGGTAGCCGGTGGCTCCTTGCACTTTGGACTGTTCCCTGAGCACCAGAAGATGTCTTCGAGAAGGTAGACGTGGTTTGTGTGTCCCTGGTGTCTGGAAGTATGCAGGGTGCACAGTAGATACTCAGTTAATATTTACTCTCCTCCTCACTGGAGGAAGGTAAAAAACAGAAGAAGGAACAGACGAGCACCCTCTCTGTTCCTCTCTCCCCCAGCACCGAGAGTGGCCTGTTTCAAGGGGGTCTGTAATAGGCACCTGCATCCTCCCTATTGGCCAAATCCAACTTTGGCTTTCCCATCTCCGTCCTTCTCAGTTTTCCGGTGGGCTTGTCTGCTCTCTCTGACTTCCATGTCACCCGTGTCCAGCTTACACTGGTCTCACTGCCTGACTTGGGGATGTTGGTGTGTCTTAGCAGGTAGTCGCAGGTCCGCACCCTGATCCTACTTCTCTTTTCTGCATGCTGGCATCTGGTAACGACTCCAGCACCAGCTTGATGCATGGATTTTGCCGCATTTAGCAACAGCCCTGAGTCTCTAGTACCCGGCTCGGGCAGTTCTGATTGCATCAGCAACTTTTTTTTTTTTTCAGGATTCACATCTCAACCTTAAAAAGTGTCCAGAATGAAGTCTCCATGGCTTCCCAACACCCCGATTTTCACACAGTGCTCTTGGTTTTTGTGGTAGTTTACGAGTTTATCTTGTGCCCTAAGCATCTGTTTTCCACATCGCAGGTAGAGTGACCCTTTGGGAAGGGAAAACAGTTCATGCCGGCCTCCGTCTCACTGTTCTTCAGAGGCTTCCAGATGCCTTCAGCTCTGACTCCTTCTCCTGGCTTGCATGACCTGGCTCCTTCCACTTCCTGGACGGTGCTAAACTTTCCTATCCTAGGGTCTTGGCCCTTGTTTTCCCCTTTGCTTGGAAGGCTGTTGTACATTTTTCACACAGTGACTTTGCCCCTAGTTACGTCACTTCCTCAGAATCCTCACCGCACCACTGAGACAGCCTCTTGTGGGGTTTTACTCTCTGCAAAGCTTCCAGCGCCCTCTGAGATTATCTTGTCCCTCAGTTCGTCATTAGGTTGTTTTTTTTTTTTTTGTTTGTTTGTTTTTGTTTCTGTTTTTGTTTTTTTTTAAGGAACATTTTGTCTTATTTGTAGATTTGTTCCCCTCCCTCTCAAGAATAATAGGAATATAACAAGCTGTAATTAAATATTTGCTGAATCCATGAGTAACAGCTGTATTATTTAACCATCTCAAGAGTCTTAGGCTCAGAGAGATTGGGAAAATGACTTGATTTCTTAGCCTTTAAGGTAGCCCTTTCCCACCCATAATTCTACTGACTGGCCCATATCCTATTTTAATCATTTAGTTTTGAGTGCAGAGAAGAAAAGTATTCTGGCGGGTATCAGGATGAGCCTCGATGTCCAGGCTCTTGTCTGGAAGGAAGACTCTTGTAAGTCTTTCCAAAAGTAGTGAGCTCCTTCTGACCCACGTACTACCTGGGCCTCAATTCTGCTTAGTTTCTGAGATAAGACAAGATTGGAACGCATGGCTGTAGACCAGTAATGAGTTTCTTAATAAAAAGGAAGAAAGAAAAAGAAAAAAAGAAACTTATTAAACTTATTTTGTTTCAACTTATTTTGTTACAAATTACGTTGCAGAATTGCAGAATGCGATTATATGCGGGTGTTCACTCTATCCCCCTCCCCCTCCCGTTTCCCTCCTCCCCTGTGTGTGTGTGGTCAAGCACATGTATACATGCACATATGTGTAGTCAGCTTCTCTCCTTCTACCCTGTGGGTTCCAGGGATCAAACCCAGGTCATCAGGCTTGGAGGCAAGTATCTACCTGCTAAGACACCTCACTGGCCCGAGAAACACATTTACTAAAGTAGTATGTGCTAAGTTTGACCCTTCACTCAAATCTCAAAGAAACCAATGCAGAATTGGTATTATTCTATCAAAGCATTGTGAACTAGATATCATTACTCTAATTTTATACAAGGAAAAAAAAATCCCTGCAACTCAGGAAAGTTAAGTCCTTTGCTGCAGGTGGCATAACTATGAAGTGGTCAGATAGGATTTTTGCTTTTGCTTCTGATCTTTTTATGCAAAGGTGATTGCTTGGTAAGTGAGATATAGTCCTAAAATAGGAAGGGAAAAATGGAATTCAGTGCACCCCTGCCTAGATTGTAGCAAATATCTAAAGCACCAGAGCAAGTTATCAGGCAATATGGAAACAAGTTCAACCACAGCCAGTGCTTGAAGCACTTAACCAGATGTCTAGAATACAGAGTGAACATGTGGGTCTCTGGCAGACCTCATATACGGGATGACACAGAGCAGCTGTCCCCAGAGAAAGTTCTTTGTTACCAGACCCGCGCTACGCAAGCAGCAATTGAGCAGTCCAGGATTTCTTTCTGTTTCCACTATAAATAGAGTTCATGGGATTCTGTCTATGGAAGTTAATGCAACAAGAAGGAGCCGCAGAGTAAGGAATAAAGCCGCACTCATTCTGTAAACTAGAAACATGTTTGGCACCGGGAGGCTGAAAAAAAAAAAAAACCCCGCTGCTGTTCCTTGGATAGATTCTGAGGTCTTATTTAGCATATGAAATTGCAGAGTAGATCCTATTATGTAAGGAGACAGGAGGACAGCAGAACGTGGTTACAAAATGAAGAACTTCGTGCCCTTCAGAAAAGAGTTAACAGCGCGCACACAGCGCGCAGAGGGACCCGTGATAAGGGTGTGGAATGAATGGCCAGGGTGGCATGTATAGGTGCCCATGGCTGAAGCCTGGTGCGGGATAATCCTCAGATGTCAGATTTCCGTAAGGCCAACATGTGACTCAACGCTTGCCACTCAACACAGAATACTGGGCTGGTGTTAAGAGGCTGGCTGCAAGCTAGGCTCCCACTGTGCATTAGCCTAACGCCCTGTCGCTCTGTGTGTGGGTGGGTGTGCATGTGCTCGGAGGAGGGTATACATTTTGTGCAGTGGGTGTTTAAAGAGCTAAGCACAGAAACTGAATTTCCACAAACGACTATCACGAGCACTCCAGACACACCAAACTTCCTCTCTTGGTATTTTTTTTTTCTTCTTTTGTTTTCATCTCTGTTTCTCCCTACTGCAACTCCCCGGAGGGAGCATCCCACCCCCCCTCTACATCCAGCCTACAAGATTGGGATGGTTTTCTGTTCCCTATCCATGTGGCTACCCTCTCAAGGTTAGAACTGAAGCTATGTGGGGCCAGCACATTCTCCAGCACCAGATGAGAAGAACTGCCGTGAAGGAGTGACAGCCACCAAAGGAAGAGGAGAGGGACTCTGCCCTGCTGCAAACATGAACAACAGCTTGCAGGTTAACCTGCCCAGAAGCTGGGCTGCTTCGAGTGGCTCACTTCAGGAGAAGTCTGAGCATTCTTTTTTTCTTTTCTATTACTATAG
Seq C2 exon
GATGGAGGATGAAGCTGTCCTGGACAGAGGGGCTTCCTTCCTTAAACATGTGTGTGATGAAGAAGAAGTAGAAG
VastDB Features
Vast-tools module Information
Secondary ID
ENSMUSG00000060961-Slc4a4:NM_018760:1
Average complexity
IR-S
Mappability confidence:
NA
Protein Impact

5' UTR

No structure available
Features
Disorder rate (Iupred):
  C1=NA A=NA C2=0.127
Domain overlap (PFAM):

C1:
NA
A:
NA
C2:
NO


Main Inclusion Isoform:
NA


Main Skipping Isoform:
NA


Other Inclusion Isoforms:
NA
Associated events
Other assemblies
Conservation
Human
(hg38)
No conservation detected
Rat
(rn6)
No conservation detected
Chicken
(galGal4)
ALTERNATIVE
Zebrafish
(danRer10)
No conservation detected
Fruitfly
(dm6)
No conservation detected
Primers PCR
Suggestions for RT-PCR validation
F:
No suggested primer sequences
R:
No suggested primer sequences
Band lengths:
Functional annotations
There are 0 annotated functions for this event


GENOMIC CONTEXT[edit]

INCLUSION PATTERN[edit]


SPECIAL DATASETS

  • Pre-implantation embryo development
  • Muscular differentiation time course
  • Spermatogenesis cell types
  • Reprogramming of fibroblasts to iPSCs
  • Hematopoietic precursors and cell types