Special

MmuINT0172073 @ mm9

Intron Retention

Gene
Description
USP6 N-terminal like [Source:MGI Symbol;Acc:MGI:2138893]
Coordinates
chr2:6273782-6312168:+
Coord C1 exon
chr2:6273782-6273910
Coord A exon
chr2:6273911-6312100
Coord C2 exon
chr2:6312101-6312168
Length
38190 bp
Sequences
Splice sites
5' ss Seq
AAGGTAGGA
5' ss Score
9.45
3' ss Seq
TAAATGTGATCTCTCCACAGATT
3' ss Score
9.82
Exon sequences
Seq C1 exon
GAAACCTGTTGCATCGCTAGTGGGAGCAGCTGGAGCCTCTGGCTTGCTAACTAGCAATGATTCAAGTCTTGCAGCTTGTAAAGGAGCTGGTGACACCGTCCAGGCAGAAGGCAGCCACAGCGAAGGAAG
Seq A exon
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No protein impact description available

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Other Skipping Isoforms:
Associated events
Conservation
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Zebrafish
(danRer10)
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Fruitfly
(dm6)
No conservation detected
Primers PCR
Suggestions for RT-PCR validation
F:
No suggested primer sequences
R:
No suggested primer sequences
Band lengths:
Functional annotations
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GENOMIC CONTEXT[edit]

INCLUSION PATTERN[edit]